期刊文献+
共找到2,230篇文章
< 1 2 112 >
每页显示 20 50 100
基于BSA-seq和RNA-seq挖掘西瓜抗蔓枯病候选基因
1
作者 张曼 陈一帆 +4 位作者 刘金秋 娄丽娜 徐建 朱凌丽 徐锦华 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第1期178-191,共14页
蔓枯病是危害西瓜生产的主要病害之一,发掘和利用抗蔓枯病基因对西瓜抗病种质创新及品种选育具有重要意义。本研究以蔓枯病抗病材料PI189225和感病材料K3为亲本构建的重组自交系(RIL)群体为材料,采用混池分组分析法(BSA,bulked segregan... 蔓枯病是危害西瓜生产的主要病害之一,发掘和利用抗蔓枯病基因对西瓜抗病种质创新及品种选育具有重要意义。本研究以蔓枯病抗病材料PI189225和感病材料K3为亲本构建的重组自交系(RIL)群体为材料,采用混池分组分析法(BSA,bulked segregant analysis)对亲本和抗感混池进行全基因组重测序,开展西瓜蔓枯病抗性基因定位研究,鉴定抗病基因的候选区域,同时结合转录组测序(RNA-seq)数据,挖掘西瓜抗蔓枯病候选基因。结果显示,基于BSA-seq分析在西瓜5号染色体和10号染色体上鉴定到与西瓜蔓枯病抗性显著关联的基因组区域,总长度为8.18 Mb,包含681个基因。功能分析显示这些基因主要参与植物-病原体互作和苯丙烷类生物合成等代谢通路。进一步利用InDel标记和重组单株分析,将西瓜蔓枯病抗性区间缩小到10号染色体Chr10_30103333和Chr10_32554279标记之间,该区间大小为2.45 Mb。结合西瓜响应蔓枯病菌侵染的差异表达基因,在10号染色体上鉴定到6个候选基因。qRT-PCR结果表明,6个候选基因的表达均受到蔓枯病菌的诱导,Cla97C10G200140和Cla97C10G202140在感病材料中高表达,Cla97C10G200100、Cla97C10G201690、Cla97C10G202570和Cla97C10G201940在抗病材料中高表达。本研究结果为西瓜抗蔓枯病分子标记辅助选择及抗病品种选育提供重要的理论依据和基因资源。 展开更多
关键词 西瓜 蔓枯病 BSA-seq RNA-seq 候选基因
原文传递
基于SLAF-seq技术划分糯质玉米自交系杂种优势群
2
作者 张垚 孔亮亮 +3 位作者 刘俊峰 宋俏姮 董绍伦 崔阳 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第2期294-303,I0002-I0008,共17页
为明确糯玉米种质资源的杂种优势群划分,提升糯玉米育种效率,利用SLAF-seq技术对127份糯质玉米自交系进行进化树、主成分和群体遗传结构分析,并结合同来源姊妹系和审定品种进行深入的相互验证分析。结果表明,共获得SLAF标签1129131个和... 为明确糯玉米种质资源的杂种优势群划分,提升糯玉米育种效率,利用SLAF-seq技术对127份糯质玉米自交系进行进化树、主成分和群体遗传结构分析,并结合同来源姊妹系和审定品种进行深入的相互验证分析。结果表明,共获得SLAF标签1129131个和多态性SLAF标签761467个;鉴定出有效SNP标记60968个;最小等位基因频率平均值为0.18,变化范围在0.05~0.50;多态性信息含量平均值为0.26,变化范围在0.09~0.38;自交系间遗传相似系数平均值为0.7783,变化范围在0.7310~0.9638。结合进化树、群体遗传结构分析,将127份自交系划分为温、热两大杂种优势群,温群含4个亚群,热群含3个亚群;33对姊妹系中,30对姊妹系间遗传相似系数大于75%群体自交系间遗传相似系数;12个审定品种中,9个品种的双亲分别位于温、热优势群,3个品种的双亲分别位于热群中不同亚群。本研究中温、热群间具有较强杂种优势,热群亚群间具有一定的杂种优势。研究结果可为自交系间组配和高效育种提供理论依据。 展开更多
关键词 SLAF-seq 糯玉米 自交系 SNP标记 类群划分 杂种优势群
原文传递
基于BSA-Seq和蛋白组学筛选辣椒核雄性不育基因
3
作者 裴红霞 汪露瑶 +2 位作者 蒋雅苹 李生梅 高晶霞 《中国农业科学》 北大核心 2026年第3期637-654,共18页
【目的】辣椒雄性不育系是实现辣椒杂种优势和开展辣椒遗传育种的主要方式之一,研究辣椒核雄性不育基因的精确定位,为后续基因克隆、功能验证、分子机制解析和新种质创制提供相关基因资源,为创制辣椒雄性不育系奠定基础。【方法】以田... 【目的】辣椒雄性不育系是实现辣椒杂种优势和开展辣椒遗传育种的主要方式之一,研究辣椒核雄性不育基因的精确定位,为后续基因克隆、功能验证、分子机制解析和新种质创制提供相关基因资源,为创制辣椒雄性不育系奠定基础。【方法】以田间发现的自然雄性不育突变体pby-1与野生型PBY-1为亲本进行杂交,获得F1后代,并自交至F2代,选取F2群体中表现不育与正常个体各30株,构建2个极端池。通过混池测序(bulked segregant analysis sequencing,BSA-Seq)分析,鉴定雄性不育候选区间,挖掘区间内候选基因,并进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。进一步将候选基因与亲本pby-1和PBY-1不同发育时期的差异表达蛋白进行联合分析,缩小辣椒核雄性不育相关候选基因的范围。运用实时荧光定量PCR技术检测候选基因在辣椒花器官中的表达水平,验证候选基因调控辣椒雄性不育的潜力。【结果】通过BSA-Seq测序分析,在Chr.07染色体上鉴定到12个与雄性不育相关联的区域,总长度约70.02 Mb,包含343个候选基因,与已知msc-1、msc-2、msc-3不育基因区间无重叠。GO富集和KEGG富集分析结果表明,碳水化合物代谢、脂质运输代谢和植物激素信号传导等途径与辣椒雄性不育性密切相关。结合蛋白组学数据综合分析,筛选到12个候选基因(Capana07g000676、Capana07g000956、Capana07g000979、Capana07g000993、Capana07g001228、Capana07g001239、Capana07g001241、Capana07g001254、Capana07g001294、Capana07g001295、Capana07g001312和Capana07g001315),经qRT-PCR检测,Capana07g000676、Capana07g000979、Capana07g000993、Capana07g001228、Capana07g001241和Capana07g001294为雄性不育关键候选基因。【结论】结合BSA-Seq与蛋白质组学,在辣椒第7染色体上定位到核雄性不育功能区段,并筛选出6个核心候选基因。 展开更多
关键词 辣椒 核雄性不育 BSA-seq 蛋白组学 多组学联合分析
在线阅读 下载PDF
ATAC-seq技术及其在家禽重要性状中的研究进展
4
作者 李劭明 柯文涛 +6 位作者 梁豪 董天舒 方春 田光明 皮劲松 游蕾 吴艳 《中国畜牧杂志》 北大核心 2026年第2期23-27,共5页
家禽作为全球畜牧业的重要经济物种,表观遗传调控对其生长、繁殖、抗病能力具有关键影响。近年来,染色质转座酶可及性测序(Assay for Transposase Accessible Chromatin With High-Throughput Sequencing,ATAC-seq)技术的兴起,为解析家... 家禽作为全球畜牧业的重要经济物种,表观遗传调控对其生长、繁殖、抗病能力具有关键影响。近年来,染色质转座酶可及性测序(Assay for Transposase Accessible Chromatin With High-Throughput Sequencing,ATAC-seq)技术的兴起,为解析家禽表观遗传的调控机制提供了关键技术支撑。本文综述了ATAC-seq技术在家禽生长发育、繁殖性状及疾病研究中的进展,旨在为染色质可及性及基因表达调控的相关研究提供参考资料。 展开更多
关键词 家禽 ATAC-seq 染色质可及性 生长发育 繁殖性状 家禽疾病
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq的高粱开花时间基因定位及候选基因预测
5
作者 王尚封 程斌 +6 位作者 王若若 丁延庆 徐建霞 曹宁 高旭 李文贞 张立异 《生物技术通报》 北大核心 2026年第2期197-206,共10页
【目的】开花时间作为高粱品种选育过程中的关键目标性状之一,对其生态适应性和高产潜力具有重要影响。【方法】以晚开花品种红缨子与早开花品种SAP001杂交构建的F2群体为材料进行开花时间遗传定位分析。【结果】表型调查显示,F2群体中... 【目的】开花时间作为高粱品种选育过程中的关键目标性状之一,对其生态适应性和高产潜力具有重要影响。【方法】以晚开花品种红缨子与早开花品种SAP001杂交构建的F2群体为材料进行开花时间遗传定位分析。【结果】表型调查显示,F2群体中晚花和早花单株的分离比符合3:1(χ^(2)=0.225,P>0.05),表明该性状受到一对主效基因的控制。通过对极端早花和晚花株系的BSA-Seq分析,在第3染色体59.73-60.44 Mb区间检测到一个与开花时间显著关联的遗传位点。结合双亲重测序和转录组数据,鉴定到一个编码光系统Ⅱ叶绿素结合蛋白的关键候选基因(SbiHYZ.03G218800)。该基因启动子区存在Myb/SANT、TATA结合蛋白(TBP)结合位点突变,在亲本间表达差异显著,可能为高粱中调控开花时间的新基因。基于该候选区段中的SNP和InDel变异,开发了一个可有效区分早花与晚花植株连锁分子标记。【结论】揭示了中国酒用高粱开花时间的遗传基础,为开展高粱生育期分子育种提供了重要基因资源和分子标记。 展开更多
关键词 高粱 开花时间 BSA-seq 转录组测序 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于注意力机制的Seq2Seq微服务容器负载预测
6
作者 何京涛 胡晓鹏 《计算机应用与软件》 北大核心 2026年第1期193-201,共9页
微服务的按需伸缩对提高集群的资源利用率至关重要,而按需伸缩的前提是集群能够对资源需求进行精准预测。当前基于规则响应式的资源管理策略仍是产业界的主流方式,学术界结合机器学习的资源负载预测方法仍存在预测不够精准等问题。因此... 微服务的按需伸缩对提高集群的资源利用率至关重要,而按需伸缩的前提是集群能够对资源需求进行精准预测。当前基于规则响应式的资源管理策略仍是产业界的主流方式,学术界结合机器学习的资源负载预测方法仍存在预测不够精准等问题。因此,提出一种基于微服务依赖程度的负载预测模型。通过基于DTW(Dynamic Time Warping)改进的容器依赖程度检测算法,对容器进行依赖程度评估。分析存在强依赖关系的容器之间指标的相关性,选择相关性较高的指标作为模型的输入特征变量。预测模型采用Seq2Seq(Sequence to Sequence)编解码模型,并结合注意力机制和残差LSTM来提升模型预测的精准性和稳定性。实验表明,该模型预测效果显著,误差评价指标MAE、RMSE、MAPE相较于另外两个深度学习模型平均降低了48%、35%、51%,能够有效预测出存在强依赖关系容器的短时负载。 展开更多
关键词 容器负载预测 微服务依赖关系 seq2seq 注意力机制 残差LSTM
在线阅读 下载PDF
基于改进Seq2Seq的船舶轨迹预测算法
7
作者 曹建鑫 史岳橙 高睿 《舰船科学技术》 北大核心 2026年第4期141-147,共7页
为解决以往船舶轨迹预测模型在训练过程中未能合理应对多步预测任务间关联性的问题,构建了一种融合频域分析方法和Seq2Seq模型的船舶轨迹预测算法(Time-Frequency based Seqence to Seqence Model,TF-Seq2Seq)。基于自动识别系统数据特... 为解决以往船舶轨迹预测模型在训练过程中未能合理应对多步预测任务间关联性的问题,构建了一种融合频域分析方法和Seq2Seq模型的船舶轨迹预测算法(Time-Frequency based Seqence to Seqence Model,TF-Seq2Seq)。基于自动识别系统数据特点设计了系列预处理操作;用融合频域分析方法和Seq2Seq模型的改进算法捕获船舶轨迹序列的关联性。基于真实数据进行实例分析,结果表明基于长短时记忆单元的Seq2Seq改进算法多种指标上表现最优,均方误差较原算法降低了12.9%。算法改进能更好地发挥模型优势,提高船舶轨迹预测精度。 展开更多
关键词 自动识别系统 傅里叶变换 船舶轨迹预测 seq2seq模型
在线阅读 下载PDF
利用BSA-seq技术挖掘油菜耐铝毒基因
8
作者 张美薇 陈明 +8 位作者 韩德鹏 李亚贞 肖小军 熊文 黄天宝 程业伟 张晨 周莺 郑伟 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期30-38,共9页
近年来,我国南方地区农田土壤酸化现象日益严重,导致土壤中铝离子活性增强,对作物生长产生明显毒害作用,为挖掘油菜耐铝毒相关性状基因位点,以耐铝毒品种R248与铝毒敏感品种S120杂交得到的F 2群体为试验材料,通过表型鉴定构建铝毒耐受... 近年来,我国南方地区农田土壤酸化现象日益严重,导致土壤中铝离子活性增强,对作物生长产生明显毒害作用,为挖掘油菜耐铝毒相关性状基因位点,以耐铝毒品种R248与铝毒敏感品种S120杂交得到的F 2群体为试验材料,通过表型鉴定构建铝毒耐受性极端混池,并采用BSA-seq法进行QTL定位分析。表型鉴定结果表明,F 2群体的铝毒耐受性呈连续性正态分布;通过基因组测序、变异位点筛选及性状关联研究,在A07、C02、C03和C084条染色体上鉴定出4个显著影响铝毒耐受性的遗传区域,区间总长度为0.73 Mb,含98个基因;根据富集分析结果和基因注释信息,预测BnaA07g35600D、BnaA07g35660D、BnaA07g35700D、BnaA07g35710D和BnaC03g39670D参与油菜耐铝毒激素的合成与运输;BnaC03g39840D参与细胞壁果胶甲酯酶合成;BnaC03g39750D和BnaC08g20580D为含MYB结构的转录因子;BnaC03g39850D和BnaC03g39980D参与氨基酸代谢,这些基因与油菜铝毒耐受性的相关性较大,为后续开展耐铝毒相关基因的分离鉴定及其分子机制解析提供了重要依据。 展开更多
关键词 油菜 铝毒 BSA-seq 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术定位玉米籽粒花青素关联基因
9
作者 张超 郭欢 +2 位作者 李忠玲 岳淑宁 赵娜 《作物学报》 北大核心 2026年第3期780-789,共10页
花青素作为鲜食玉米的表型之一,使其具有更高的营养价值和经济价值。为了研究玉米籽粒中花青素的关联基因,本研究利用连续自交多代的黑糯和白糯玉米作为亲本材料构建获得F2代分离群体。于F2:3统计玉米籽粒颜色表明,黑白粒占比表现为极... 花青素作为鲜食玉米的表型之一,使其具有更高的营养价值和经济价值。为了研究玉米籽粒中花青素的关联基因,本研究利用连续自交多代的黑糯和白糯玉米作为亲本材料构建获得F2代分离群体。于F2:3统计玉米籽粒颜色表明,黑白粒占比表现为极显著差异。利用BSA-seq技术对黑粒和白粒的表型混池样本进行基因组测序,挖掘花青素积累的关联基因。通过表型和基因测序联合分析,玉米籽粒中花青素合成的关联基因片段主要位于6号染色体的107.9~113.2 Mb区域内。候选区域内共注释到116个基因,其中包括53个非同义突变基因, 17个移码突变基因。通过基因注释信息分析,推测出花青素结构基因Zm00001eb276450(ANR)、转录因子基因Zm00001eb276870(WD40)和Zm00001eb276640(MYB)可能为玉米籽粒中花青素关联的候选基因。该研究结果为进一步完善玉米籽粒花青素关联基因的功能解析奠定了重要基础,也为快速筛选花青素鲜食玉米新品种提供了参考基因。 展开更多
关键词 鲜食玉米 花青素 BSA-seq 表型-基因型关联分析 序列差异
在线阅读 下载PDF
Shape-Aware Seq2Seq Model for Accurate Multistep Wind Speed Forecasting
10
作者 PANG Junheng DONG Sheng 《Journal of Ocean University of China》 2026年第1期55-73,共19页
Wind speed is a crucial parameter affecting wind energy utilization.However,its volatility leads to time-varying power output.Herein,a novel Seq2Seq model integrating deep learning,data denoising,and a shape-aware los... Wind speed is a crucial parameter affecting wind energy utilization.However,its volatility leads to time-varying power output.Herein,a novel Seq2Seq model integrating deep learning,data denoising,and a shape-aware loss function is proposed for accurate multistep wind speed forecasting.In this model,the wind speed data is first denoised using the maximal overlap discrete wavelet transform.Next,an encoder-decoder network based on a temporal convolutional network,bidirectional gated recurrent unit,and multihead self-attention is employed for forecasting.Additionally,to enhance the ability of the model to identify temporal dynamics,a shape-aware loss function,ITILDE-Q,is employed in the model.To verify the effectiveness of the proposed model,a comparative experiment and an ablation experiment were conducted using three datasets of measured wind speeds.Three error metrics and a similarity metric were adopted for comprehensive evaluation.The experimental results showed that the proposed model consistently outperforms benchmark models in all tested forecasting scenarios,with particularly pronounced differences in performance over longer forecast horizons.Furthermore,the synergistic interaction of the three key components contributes to the extraordinary performance of the proposed model. 展开更多
关键词 wind speed forecasting multistep forecasting deep learning time series seq2seq
在线阅读 下载PDF
Utilizing Single-cell and Spatial RNA-seq databasE for Alzheimer’s Disease(ssREAD)in hypothesis-driven queries
11
作者 Diana Acosta Cankun Wang +1 位作者 Qin Ma Hongjun Fu 《Neural Regeneration Research》 2026年第2期677-678,共2页
Alzheimer’s disease(AD)is the most common form of dementia.In addition to the lack of effective treatments,there are limitations in diagnostic capabilities.The complexity of AD itself,together with a variety of other... Alzheimer’s disease(AD)is the most common form of dementia.In addition to the lack of effective treatments,there are limitations in diagnostic capabilities.The complexity of AD itself,together with a variety of other diseases often observed in a patient’s history in addition to their AD diagnosis,make deciphering the molecular mechanisms that underlie AD,even more important.Large datasets of single-cell RNA sequencing,single-nucleus RNA-sequencing(snRNA-seq),and spatial transcriptomics(ST)have become essential in guiding and supporting new investigations into the cellular and regional susceptibility of AD.However,with unique technology,software,and larger databases emerging;a lack of integration of these data can contribute to ineffective use of valuable knowledge.Importantly,there was no specialized database that concentrates on ST in AD that offers comprehensive differential analyses under various conditions,such as sex-specific,region-specific,and comparisons between AD and control groups until the new Single-cell and Spatial RNA-seq databasE for Alzheimer’s Disease(ssREAD)database(Wang et al.,2024)was introduced to meet the scientific community’s growing demand for comprehensive,integrated,and accessible data analysis. 展开更多
关键词 sex specific alzheimer s disease ad deciphering molecular mechanisms spatial transcriptomics ssread spatial transcriptomics st Alzheimers disease single cell RNA seq
暂未订购
幽门螺杆菌感染早期的细胞表型特征及RNA-seq转录谱分析
12
作者 王辉 张一诺 +6 位作者 邢静 冯明珠 陈术 杨静 季晓飞 封建凯 赵慧琳 《滨州医学院学报》 2026年第2期127-133,共7页
目的 探究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)感染早期的细胞表型变化并检测感染细胞转录组,分析Hp感染相关的差异表达基因及信号通路,为揭示其致病机制提供参考。方法 以感染复数MOI=50∶1分别构建Hp感染胃腺癌AGS细胞和胃上皮GES-1... 目的 探究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)感染早期的细胞表型变化并检测感染细胞转录组,分析Hp感染相关的差异表达基因及信号通路,为揭示其致病机制提供参考。方法 以感染复数MOI=50∶1分别构建Hp感染胃腺癌AGS细胞和胃上皮GES-1细胞,CCK-8方法检测细胞活力,Transwell实验测定细胞迁移和侵袭能力,ELISA检测炎性因子;提取感染6 h后细胞的总RNA进行转录组测序,筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)并进行GO和KEGG富集分析,利用RT-qPCR验证差异基因的表达水平,通过TNMplot数据库分析基因在胃癌中的表达。结果 Hp感染6 h能够促进细胞的活力、迁移与侵袭,以及细胞炎性因子(IL-8、IL-1β、TNF-α)的分泌。以|log2(foldchange)|>1、P<0.05为条件筛选感染细胞的DEGs,在AGS细胞感染组筛选到141个DEGs,在GES-1细胞感染组筛选到138个DEGs。GO功能富集分析显示差异基因主要涉及免疫应答、炎症反应等;KEGG富集分析结果主要与TNF、NF-κB、MAPK、Toll样受体信号通路等有关。RT-qPCR验证了转录组中显著差异表达基因CXCL8、IER2、PTGS2、UBD在Hp感染时上调表达,TNMplot数据库分析发现这些基因在胃癌中高表达。结论 Hp感染早期能够增强细胞活力,促进细胞迁移、侵袭及细胞炎性因子分泌,转录组分析发现其感染激活了宿主细胞炎症反应、免疫应答等信号通路。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 RNA-seq 差异表达基因 信号通路
暂未订购
基于BSA-seq和RNA-seq的西瓜裂刻叶候选基因挖掘
13
作者 王志强 杜慧莹 +3 位作者 李程 郭松 田梅 于蓉 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第11期67-84,共18页
裂刻叶是植物适应环境的重要特征,挖掘西瓜裂刻叶相关基因对西瓜育种、遗传改良及叶缘形态发育的分子调控机制研究具有重要意义。首先以西瓜裂刻叶自交系SW246(P_(1))与全缘叶自交系SW247(P_(2))为亲本,通过杂交构建六世代遗传群体(P_(1... 裂刻叶是植物适应环境的重要特征,挖掘西瓜裂刻叶相关基因对西瓜育种、遗传改良及叶缘形态发育的分子调控机制研究具有重要意义。首先以西瓜裂刻叶自交系SW246(P_(1))与全缘叶自交系SW247(P_(2))为亲本,通过杂交构建六世代遗传群体(P_(1)、P_(2)、F_(1)、F_(2)、BC_(1)P_(1)、BC_(1)P_(2));后采用BSA-seq进行基因定位,并结合转录组测序RNAseq数据进行关联分析,从而挖掘叶片裂刻关键调控基因。遗传分析结果表明:在后代群体中,F_(1)、BC_(1)P_(1)群体西瓜叶片均为裂刻叶,F_(2)群体裂刻叶和全缘叶的分离比符合3∶1的孟德尔分离比例,BC_(1)P_(2)群体裂刻叶和全缘叶分离比符合1∶1的理论比,说明裂刻叶和全缘叶性状符合单基因显性遗传模式,裂刻叶对全缘叶为显性。BSA-seq分析发现SNP和InDels关联交集位于4号染色体23164320—24976967 bp内,长度1.81 Mb,包含171个候选基因。其中在此区间亲本间存在非同义突变的SNP共22个,混池间存在非同义突变的SNP共16个;亲本间存在移码突变的InDel共3个,混池间存在移码突变的InDel共4个。联合BSA-seq与RNA-seq分析发现共有26个基因显著相关。此外,通过对BSA-seq和RNA-seq联合分析得到的4个候选基因及26个显著相关基因进行生物信息学分析、转录因子预测和基因注释,推测结果发现:1个编码PPR蛋白的基因(Cla97C04G076940),与HD-Zip、TCP、LOB、E2FDP、TIFY等转录因子相关;另有1个与IAA-氨基酸水解和E3泛素连接酶相关的基因,该基因可能在叶缘性状的调控过程中发挥关键作用。本研究可为进一步精细定位西瓜裂刻叶调控基因奠定基础。 展开更多
关键词 西瓜 裂刻叶 BSA-seq RNA-seq 候选基因
原文传递
基于Seq2Seq双向模型的水锤压力预测 被引量:2
14
作者 吴罗长 刘振兴 +4 位作者 雷洁 颜建国 郭鹏程 孙帅辉 马晋阳 《振动与冲击》 北大核心 2025年第3期99-106,共8页
水锤计算对保障长距离输水工程管网系统安全稳定运行具有重要意义,但传统水锤数值方法存在模型复杂、计算量大的问题。为此,在自主开发的瞬态流试验平台上,通过支路快速关阀产生水锤,获取了不同流量和压力条件下的瞬态水锤压力。试验参... 水锤计算对保障长距离输水工程管网系统安全稳定运行具有重要意义,但传统水锤数值方法存在模型复杂、计算量大的问题。为此,在自主开发的瞬态流试验平台上,通过支路快速关阀产生水锤,获取了不同流量和压力条件下的瞬态水锤压力。试验参数范围为:体积流量15~55 m^(3)/h,压力150~450 kPa。采用集合经验模态分解方法对水锤信号进行滤波,并对水锤压力的变化规律进行了深入的研究分析。基于双向门控循环单元,建立了用于水锤压力预测的序列到序列(sequence-to-sequence,Seq2Seq)双向预测模型。结果表明,Seq2Seq双向预测模型能有效预测支路水锤,其预测数据决定系数在0.8以上,水锤特征参数预测准确率超过98%。该研究成果为水锤压力预测提供了一种新方法。 展开更多
关键词 水锤 瞬变流 seq2seq 经验模态分解
在线阅读 下载PDF
基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL定位分析及SSR分子标记开发 被引量:2
15
作者 李怡斐 段敏杰 +3 位作者 黄任中 黄启中 王春萍 张世才 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期633-642,共10页
【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析,开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标记,为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为亲本构建F2代群体,并采用SL... 【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析,开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标记,为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为亲本构建F2代群体,并采用SLAF-Seq技术进行分子标记开发,构建高密图遗传连锁图谱。结合表型数据,利用复合区间作图法(CIM)对辣椒果实转色期的炭疽病抗性进行QTL分析。利用Microsatellite(MISA)在定位区间识别SSR位点。【结果】从亲本和子代样品共获得423351627条Reads,其中,来自PPTC26-3-1-1-1-1-1和1287分别为8130516和6621396条,F2代群体120个子代样品的平均Reads数量为34049987个。构建包含4671个SNP分子标记、分布于12个连锁群、总图距为1567.53 cM、平均图距为0.34 cM的辣椒高密度遗传图谱,检测到1个炭疽病抗性相关的QTL(CaR10.1),位于10号连锁群上187930592~189766111 bp物理区间内。共有23个基因定位在关联区域内,根据基因功能注释,其中1个基因编码假定晚疫病抗性蛋白同源物R1B-23异构体X2,1个基因编码PPR蛋白,可能与辣椒果实转色期炭疽病抗性相关。在关联到的QTL区间内开发出SSR分子标记T482,在F2代群体中的验证结果显示,T482引物在F2代群体单株中扩增结果与表型鉴定结果一致。F2代群体抗病和中抗单株中有53株具有抗病亲本的条带,有25株同时具有抗病亲本和感病亲本的条带;F2代群体感病单株中,有42株具有感病亲本的条带。【结论】构建高密度遗传连锁图谱,将辣椒果实转色期炭疽病抗性定位于10号连锁群,在关联区间开发出SSR分子标记T482,可初步鉴别辣椒果实转色期炭疽病抗性,同时结合针刺接种法鉴定,可提高鉴定的准确率。 展开更多
关键词 辣椒 SLAF-seq 遗传图谱 炭疽病 QTL SSR分子标记
在线阅读 下载PDF
基于RNA-seq探讨维生素D_(3)改善代谢相关脂肪性肝病大鼠肝脏损伤的可能机制
16
作者 赵钥莹 吴小蓉 +3 位作者 张晶晶 杜庭婉 周勇 马玲 《西南医科大学学报》 2026年第1期20-25,共6页
目的探讨维生素D_(3)对代谢相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease,MASLD)大鼠肝脏病理学状态及基因表达特征的影响。方法将大鼠随机分为对照组(CON组,n=12)和高脂饮食组(HFD组,n=18)。经过7周的普... 目的探讨维生素D_(3)对代谢相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease,MASLD)大鼠肝脏病理学状态及基因表达特征的影响。方法将大鼠随机分为对照组(CON组,n=12)和高脂饮食组(HFD组,n=18)。经过7周的普通饲料与高脂饲料喂养后,每组处死6只以确认造模成功。随后将HFD组大鼠随机分入HFD组(n=6)与维生素D干预组(HFD+VD组,n=6),其中HFD+VD组给予维生素D_(3)干预。干预结束后,所有大鼠均被处死,取肝脏组织进行分析。采用HE染色、油红O染色及马松染色评估肝脏病理变化、脂质蓄积及纤维化程度;利用转录组测序技术分析肝脏组织基因表达谱,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并利用KEGG富集分析、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)以及构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行生物信息学分析;通过免疫组化(immunohistochemistry,IHC)检测肝脏巨噬细胞标志物Cd86和Cd163的表达变化。组间比较采用方差分析。结果HDF+VD组MASLD大鼠肝脏病理损伤、脂滴面积和相对胶原面积均显著低于HDF组(P<0.05)。转录组分析结果显示,维生素D_(3)干预使转录组差异基因在炎症相关信号通路中显著富集(如Toll样受体信号通路)。PPI网络分析显示,HFD+VD组筛选出的枢纽基因与免疫调节和信号转导相关。免疫组化结果显示,HDF组M1型巨噬细胞标志物Cd86蛋白表达水平显著高于CON组(P<0.05),HDF+VD组则显著低于HDF组(P<0.05);三组间Cd163蛋白表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论维生素D_(3)可能通过调控如Toll样受体信号通路等炎症相关的信号通路,抑制巨噬细胞向M1型极化,从而减轻MASLD大鼠的肝脏损伤。 展开更多
关键词 维生素D_(3) 代谢相关脂肪性肝病 RNA测序 巨噬细胞
暂未订购
综合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq技术建立与肝癌CD8^(+)T细胞相关的预后模型 被引量:1
17
作者 刘洋 池晴佳 田菲菲 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期169-177,共9页
目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8^(+)T细胞相关的生物标志物并建立预后模型。方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组间CD8^(+)T细胞的差异表... 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8^(+)T细胞相关的生物标志物并建立预后模型。方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组间CD8^(+)T细胞的差异表达基因。从TCGA数据库中下载肝癌的基因表达谱数据及临床数据,使用CIBERSORT算法、WGCNA技术筛选出与CD8^(+)T细胞具有相关性的模块基因。将差异基因与模块基因取交集基因并进行GO、KEGG分析,应用单因素COX回归分析和LASSO算法建立预后模型。通过K-M曲线和ROC曲线对模型在内、外部数据集中的预测效果进行验证。根据风险评分的中位值划分高低风险组,对高低风险组间的浸润性免疫细胞分布情况和肿瘤突变情况进行分析。结果 构建出具有9个基因的预后模型,K-M曲线及ROC曲线表明模型在内、外部数据集中均具有良好的预测能力,在高低风险组中,浸润性免疫细胞的分布情况和基因突变情况均存在显著差异。结论 本研究结合scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq技术利用生物信息学方法开发出了一种基于CD8^(+)T细胞的新型预后模型,为肝癌患者的预后改善和生存预测提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 肝癌 单细胞测序(scRNA-seq) Bulk转录组测序(Bulk RNA-seq) CD8^(+)T细胞 预后模型
在线阅读 下载PDF
基于Conv-Seq2Seq模型的含弹性资源电力系统日前调度方法 被引量:1
18
作者 谭琦 孙晨皓 +2 位作者 唐昊 王正风 方道宏 《控制与决策》 北大核心 2025年第5期1651-1659,共9页
针对新能源大规模并网带来的消纳问题,提出一种考虑源荷双侧弹性资源的日前调度方法.首先,对深度调峰机组、可平移负荷和可削减负荷的弹性调节能力进行分析,建立含弹性资源的电力系统调度模型;然后,提出一种基于Conv-Seq2Seq (convoluti... 针对新能源大规模并网带来的消纳问题,提出一种考虑源荷双侧弹性资源的日前调度方法.首先,对深度调峰机组、可平移负荷和可削减负荷的弹性调节能力进行分析,建立含弹性资源的电力系统调度模型;然后,提出一种基于Conv-Seq2Seq (convolutional sequence to sequence)模型的日前调度方法,使用多层卷积神经网络作为编码器对负荷预测数据等信息进行提取,改进深度学习网络信息提取的能力和速度,并使用门控循环单元作为解码器对编码器提取的信息进行解码,以输出调度计划;最后,通过辅助决策修正来确保调度计划的安全性.基于改进的IEEE39节点算例验证所提出方法的有效性和正确性. 展开更多
关键词 新能源消纳 深度调峰 柔性负荷 日前调度 深度学习 seq2seq
原文传递
融合Seq2Seq与时序注意力机制的工艺质量预测 被引量:1
19
作者 阴艳超 施成娟 +1 位作者 邹朝普 刘孝保 《机械科学与技术》 北大核心 2025年第3期453-464,共12页
针对流程工业生产过程整体工序繁多,工序间耦合严重,多维工艺数据间时序关系及其复杂等问题,提出一种融合Seq2Seq与时序注意力机制的高维多尺度工艺过程质量预测方法。在分析多工序工艺数据特点,以及运用Seq2Seq模型进行编码解码过程面... 针对流程工业生产过程整体工序繁多,工序间耦合严重,多维工艺数据间时序关系及其复杂等问题,提出一种融合Seq2Seq与时序注意力机制的高维多尺度工艺过程质量预测方法。在分析多工序工艺数据特点,以及运用Seq2Seq模型进行编码解码过程面临的难题的基础上,引入时序注意力机制来构造长距离变化的时域信息矩阵。设计卷积神经网络和BiLSTM作为编码组件,学习工艺过程时序数据的工艺参数关联性和双向时序关系等潜在深度特征,并结合时序注意力机制抽取关键信息,实现对工艺质量相关的工艺参数时序数据的非线性相关特征和时序依赖性的自适应地学习。最后,通过对制丝生产工艺过程质量的单输出和多输出预测实验,验证了所提算法的实用性和有效性,为多工序耦合的流程制造过程质量的精准预测提供了方法和实现途径。 展开更多
关键词 多工序时序耦合 工艺质量预测 seq2seq 时序注意力机制 自适应学习
在线阅读 下载PDF
基于RNA-seq和PER-seq联合分析探究ZmHDZ6表达调控网络
20
作者 方应浩 周波 +2 位作者 陈茹梅 杨文竹 秦慧民 《作物学报》 北大核心 2025年第4期958-968,共11页
玉米是需水量较大的作物,而干旱是制约玉米生产的主要因素。结合前期研究基础和相关研究进展,发现ZmHDZ6受干旱诱导强烈,且过表达植株表现出优良的抗旱性能。为探究玉米转录因子ZmHDZ6的下游调控机制,通过对ZmHDZ6过表达转基因玉米株系... 玉米是需水量较大的作物,而干旱是制约玉米生产的主要因素。结合前期研究基础和相关研究进展,发现ZmHDZ6受干旱诱导强烈,且过表达植株表现出优良的抗旱性能。为探究玉米转录因子ZmHDZ6的下游调控机制,通过对ZmHDZ6过表达转基因玉米株系进行RNA-seq测序,对自交系B73原生质体进行PER-seq(protoplast transient expression-based RNA-sequencing)测序,并进行联合分析。结果显示,2种测序策略得到的差异表达基因(DEGs)呈现一致性,功能主要集中在参与氧化还原反应等GO富集分析条目。KEGG分析显示功能都富集在苯并噁唑嗪酮类化合物代谢途径上。此外,基于RNA-seq的DEGs在氨基酸和核苷酸代谢途径富集,而基于PER-seq的DEGs还富集在核糖体生物发生代谢途径。因此,推测ZmHDZ6可能通过调控与氧化还原相关基因和苯并噁唑嗪酮类化合物的代谢进而增强玉米抗旱性。通过进一步在129个Co-DEGs(Common DEGs)的启动子序列扫描HDZIP I家族的DNA结合基序(motif),将潜在靶基因缩减至16个,其中8个基因的功能与玉米抗逆紧密相关。本研究利用转录组学数据分析了ZmHDZ6基因的下游表达调控网络,为进一步解析抗旱机制提供了参考。 展开更多
关键词 RNA-seq PER-seq 转录因子 ZmHDZ6 靶基因 MOTIF
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 112 下一页 到第
使用帮助 返回顶部