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禾谷镰孢磷脂酰肌醇转运蛋白FgSec14对磷脂分子转运的结构模型分析
1
作者 尹延宗 赵雨薇 +4 位作者 陈紫阳 李佳琪 郑爽 刘颖超 赵斌 《河北农业大学学报》 北大核心 2026年第1期38-45,共8页
禾谷镰孢引起小麦赤霉病和玉米穗腐病等谷物病害,并产生真菌毒素威胁国家粮食安全。磷脂酰肌醇转运蛋白(Sec14)在生命过程中执行重要功能,但其在禾谷镰孢中的功能尚不清晰,本研究将获得FgSec14与磷脂分子的转运模型。利用ProtParam、Pro... 禾谷镰孢引起小麦赤霉病和玉米穗腐病等谷物病害,并产生真菌毒素威胁国家粮食安全。磷脂酰肌醇转运蛋白(Sec14)在生命过程中执行重要功能,但其在禾谷镰孢中的功能尚不清晰,本研究将获得FgSec14与磷脂分子的转运模型。利用ProtParam、ProtScale、WoLF PSORT和Clustal X等在线工具对FgSec14的生理生化特征及同源性进行了分析;通过原核表达和亲和镍柱层析方法获得了目的蛋白,利用荧光滴定技术检测了其与磷脂分子的结合情况,并通过Docking技术进行验证。结果表明,FgSec14为亲水性蛋白,其蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,并在镰孢菌中高度保守,具有典型的Sec14和CRAL结构域;其主要通过与PA、PI、PS、PC和PE等分子的结合行驶磷脂转运功能,其中Arg^(50)、Arg^(206)、Arg^(58)为主要结合位点。研究结果将为靶向镰孢菌Sec14的新型杀菌剂开发提供了理论基础。 展开更多
关键词 禾谷镰孢 sec14 生物信息学分析 原核表达
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SEC14L1P1对口腔鳞状细胞癌细胞增殖和迁移的影响
2
作者 郑文甜 公慧 +3 位作者 张馨月 郝嘉仪 王亚杰 蒋英英 《中国癌症杂志》 北大核心 2025年第3期309-319,共11页
背景与目的:SEC14L1P1是SEC14家族的一种假基因,已被发现与多种肿瘤的发生、发展密切相关,但其在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的作用尚未明确。本研究旨在深入了解SEC14L1P1在OSCC细胞内的表达特征和亚细胞定位... 背景与目的:SEC14L1P1是SEC14家族的一种假基因,已被发现与多种肿瘤的发生、发展密切相关,但其在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的作用尚未明确。本研究旨在深入了解SEC14L1P1在OSCC细胞内的表达特征和亚细胞定位,以及其对OSCC细胞增殖和迁移的影响。方法:通过ENCORI数据库对SEC14L1P1在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达进行分析;利用GDC和UCSC Xena数据库进一步分析SEC14L1P1在HNSCC中的表达及其与患者预后之间的关系。利用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测SEC14L1P1在OSCC细胞系中的表达;采用RNA核质分离实验确定SEC14L1P1在OSCC细胞中的定位。对CAL-27细胞建立SEC14L1P1敲减(SS-SEC14L1P1)组和敲减对照(SS-NC)组,对HN30细胞建立SEC14L1P1过表达(SEC14L1P1)组和过表达对照(Vector)组。通过细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)和transwell迁移实验评估SEC14L1P1表达变化对各组细胞增殖、迁移能力的影响。采用RTFQ-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测SEC14L1P1表达改变对上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关基因表达水平的影响。采用裸鼠皮下移植瘤模型观察SEC14L1P1在体内对OSCC细胞增殖的影响,将12只4周龄BALB/c裸鼠随机分为反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)-NC组和ASO-SEC14L1P1组,每组6只,每只裸鼠均做标记。进一步的机制研究通过RNAInter数据库分析与SEC14L1P1交互的分子,通过ENCORI数据库查询SEC14L1P1与DHX9的表达相关性。采用Western blot检测SEC14L1P1表达改变对磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)通路的影响。结果:数据库分析显示,SEC14L1P1在HNSCC组织中的表达高于正常组织,且与患者的不良预后密切相关。RTFQ-PCR结果表明,SEC14L1P1在6种OSCC细胞系中均高表达;RNA核质分离实验结果显示,在CAL-27和HN30细胞中SEC14L1P1主要定位于细胞核内。与SS-NC组相比,SS-SEC14L1P1组中的相对表达水平明显降低,且能显著抑制细胞增殖和迁移能力;与Vector组相比,SEC14L1P1组中的相对表达水平明显升高,细胞增殖和迁移能力也明显升高。SEC14L1P1的下调伴随E-钙粘蛋白(E-cadherin)的mRNA表达和蛋白水平升高,N-钙粘蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(vimentin)的mRNA表达和蛋白水平降低,SEC14L1P1过表达后的结果则相反。裸鼠皮下移植瘤模型实验显示,与ASO-NC组比较,ASO-SEC14L1P1组皮下移植瘤体积和重量均减小。进一步的机制研究发现SEC14L1P1与DHX9表达呈正相关性,且已有研究表明DHX9能激活PI3K/AKT信号通路;敲减SEC14L1P1导致磷酸化PI3K(phosphorylated-PI3K,p-PI3K)和磷酸化AKT(phosphorylated-AKT,p-AKT)的蛋白表达减少,过表达SEC14L1P1则显示p-PI3K和p-AKT的蛋白表达增加。结论:SEC14L1P1在OSCC细胞和组织中呈现出较高的表达水平,并且能促进OSCC细胞增殖及迁移,这一现象可能与SEC14L1P1调控PI3K/AKT信号通路,进而促进EMT有关。 展开更多
关键词 sec14L1P1 口腔鳞状细胞癌 细胞增殖 细胞迁移 上皮-间充质转化
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甘蔗磷脂酰肌醇转运蛋白基因ScSEC14响应干旱和盐胁迫 被引量：7
3
作者 毛花英 刘峰 +8 位作者 苏炜华 黄宁 凌辉 张旭 王文举 李聪娜 汤翰臣 苏亚春 阙友雄 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期824-835,共12页
Sec14-like磷脂酰肌醇转运蛋白(Sec14-like phosphatidylinositol transfer proteins,PITPs),广泛存在于真核生物细胞中,参与肌醇磷酸代谢、膜运输、极性生长、信号转导、逆境胁迫等多种重要的生命过程。甘蔗中响应干旱和盐胁迫的Sec14-... Sec14-like磷脂酰肌醇转运蛋白(Sec14-like phosphatidylinositol transfer proteins,PITPs),广泛存在于真核生物细胞中,参与肌醇磷酸代谢、膜运输、极性生长、信号转导、逆境胁迫等多种重要的生命过程。甘蔗中响应干旱和盐胁迫的Sec14-like基因尚未见报道。本研究从甘蔗受黑穗病胁迫的转录组数据库中获得一条SEC14基因序列,并利用RT-PCR技术克隆得到甘蔗SEC14基因c DNA全长序列,命名为Sc SEC14(Gen Bank登录号为MG571103)。生物信息学分析显示,Sc SEC14基因全长1617 bp,包含一个1008 bp的完整开放阅读框,编码335个氨基酸;Sc SEC14为不稳定的亲水性蛋白,不存在信号肽;蛋白二级结构元件多为α-螺旋,具有典型的SEC14结构域和CRAL_TRIO_N结构域。此外,系统进化树分析揭示,该蛋白属于Sec14-like蛋白家族的SSH(soybean Sec14 homolog group)亚家族。亚细胞定位结果表明,Sc SEC14蛋白主要定位于细胞膜。实时荧光定量PCR分析发现,Sc SEC14基因在甘蔗中组成型表达,在蔗皮中的表达量最低,蔗叶中的表达量最高,约为蔗皮的4.9倍;该基因在PEG、Na Cl、CaCl_2和水杨酸(SA)胁迫下的表达量均上调。因此,甘蔗Sc SEC14基因可能参与Ca^(2+)和SA介导的抗逆信号通路,积极响应逆境胁迫,尤其调节了干旱和高盐环境下的抗逆性。 展开更多
关键词 甘蔗 sec14-like磷脂酰肌醇转运蛋白 Scsec14 干旱 盐胁迫
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麻杏石甘汤对哮喘大鼠肺组织中Sec14l3表达的影响 被引量：4
4
作者 高尚泽 杨林伟 +4 位作者 王小莹 崔广智 朱庆华 许妍妍 单丽华 《天津中医药》 CAS 2013年第12期745-748,共4页
[目的]研究麻杏石甘汤及其主要成分对哮喘模型大鼠肺组织中Sec14l3表达的影响。[方法]70只大鼠随机分为空白组、模型组、地塞米松组、麻杏石甘汤组、麻黄组、杏仁组、甘草组,每组10只,第0、7天腹腔注射卵蛋白致敏,第14天开始雾化并给予... [目的]研究麻杏石甘汤及其主要成分对哮喘模型大鼠肺组织中Sec14l3表达的影响。[方法]70只大鼠随机分为空白组、模型组、地塞米松组、麻杏石甘汤组、麻黄组、杏仁组、甘草组,每组10只,第0、7天腹腔注射卵蛋白致敏,第14天开始雾化并给予药物,连续两周。最后一次雾化24 h后测肺泡灌洗液(BALF)中炎症细胞数、病理观察气道炎症变化、实时定量聚合酶链反应(PCR)检测大鼠肺组织中Sec14l3 mRNA的水平。[结果]与正常组相比,模型组BALF中白细胞总数、嗜酸细胞、中性粒细胞数明显升高,肺组织中可见大量炎性细胞浸润及气道上皮细胞损伤,Sec14l3 mRNA表达量明显减少,有统计学意义差异;与模型组相比,麻杏石甘汤组、地塞米松组、甘草组BALF中白细胞总数、嗜酸细胞、中性粒细胞数目明显减少,肺组织中未见大量炎性细胞浸润及上皮细胞损伤,Sec14l3 mRNA量明显增加,差异有统计学意义,而麻黄组、杏仁组的上述各项指标与模型组相比无统计学意义差异。[结论]麻杏石甘汤及甘草能够有效减轻哮喘大鼠气道炎症的程度,其机制可能与调控Sec14l3在肺组织的表达水平,增强气道保护作用有关。 展开更多
关键词 麻杏石甘汤 哮喘 sec14l3 气道炎症 气道上皮细胞
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气道炎症的新标志物——SEC14L3 被引量：1
5
作者 高尚泽 单丽华 《药物评价研究》 CAS 2013年第2期142-145,共4页
气道炎症是许多呼吸系统疾病共同的病理特征,气道炎症程度是判断病情严重程度和指导临床治疗的基础。SEC14L3是一个来源于气道上皮的分泌蛋白,选择性地分布在呼吸器官的气道上皮细胞,其表达量随着气道炎症的加重而显著减少,与气道炎症... 气道炎症是许多呼吸系统疾病共同的病理特征,气道炎症程度是判断病情严重程度和指导临床治疗的基础。SEC14L3是一个来源于气道上皮的分泌蛋白,选择性地分布在呼吸器官的气道上皮细胞,其表达量随着气道炎症的加重而显著减少,与气道炎症程度成高度负相关。这表明SEC14L3很可能成为气道炎症的新标志物及气道炎症治疗的新靶点。通过监测SEC14L3表达量的变化,为呼吸系统疾病的诊断和治疗提供重要的参考价值。 展开更多
关键词 sec14L3 气道上皮细胞 炎症 标志物
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青少年牙周炎相关基因SEC14L5的生物信息学分析 被引量：1
6
作者 马忠石 杨克 +3 位作者 孟丽蕊 郑旭 张东 张杰 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第3期105-110,共6页
用基因芯片技术来检测青少年牙周炎患者白细胞中表达异常的基因,检测中发现了一个未知基因表现为显著下调,其名称是SEC14L5,并推测该基因与白细胞的功能异常有着重要的作用。因此,利用生物信息学的方法对SEC14L5基因及其蛋白产物进行各... 用基因芯片技术来检测青少年牙周炎患者白细胞中表达异常的基因,检测中发现了一个未知基因表现为显著下调,其名称是SEC14L5,并推测该基因与白细胞的功能异常有着重要的作用。因此,利用生物信息学的方法对SEC14L5基因及其蛋白产物进行各种分析,在分析中我们发现SEC14L5编码的蛋白与SPF蛋白具有很大的相似性。 展开更多
关键词 青少年牙周炎 基因芯片技术 sec14L5 生物信息学
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基于转录组学探究GIMAP8和SEC14L5对肺纤维化发展的影响 被引量：1
7
作者 梁小乔 方朱雨冰 +2 位作者 杨颖 何州烊 宁丽 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期503-512,共10页
目的 基于转录组学测序技术,观察肺纤维化进程中GIMAP8和SEC14L5在尘肺患者和矽肺小鼠模型中的表达变化,为阐明肺纤维化的发生和发展提供理论依据。方法 将雄性C57BL/6小鼠随机分为PBS组(磷酸缓冲盐溶液)和Silica组(二氧化硅悬液),通过... 目的 基于转录组学测序技术,观察肺纤维化进程中GIMAP8和SEC14L5在尘肺患者和矽肺小鼠模型中的表达变化,为阐明肺纤维化的发生和发展提供理论依据。方法 将雄性C57BL/6小鼠随机分为PBS组(磷酸缓冲盐溶液)和Silica组(二氧化硅悬液),通过非暴露式气管插管方式在第0、14天向Silica组小鼠灌注100 mg/mL二氧化硅悬液50μL,PBS组灌注等量磷酸缓冲盐溶液。第28天时评估小鼠肺功能并处死所有小鼠,进行肺组织形态观察、纤维化评价以及mRNA水平的检测。结果 与健康对照者相比,尘肺患者筛选出有显著表达差异的mRNA共584种,其中242种mRNA显著上调,342种mRNA显著下调。富集分析显示,这些差异表达的mRNA主要参与了P53、NF-κB、TNF、AMPK等信号通路。PBS组小鼠肺结构正常,而Silica组小鼠呈现肺泡结构破坏,胶原纤维沉积和纤维团块。肺组织中GIMAP8表达上调,SEC14L5表达下调。Silica组小鼠肺功能有所下降。结论 在尘肺患者及矽肺小鼠模型中,GIMAP8和SEC14L5可能参与肺纤维化的发生和发展,这可能为预防和治疗这些疾病提供分子理论基础。 展开更多
关键词 肺纤维化 GIMAP8 sec14L5
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申克孢子丝菌Sec14基因相关功能和药物靶点分析
8
作者 吴晓雁 张静 +4 位作者 高文超 李玉哲 吴榕 陈三妹 黄怀球 《热带医学杂志》 CAS 2020年第4期436-440,F0002,共6页
目的初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征及功能位点。方法生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征。结果申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224~274 bp... 目的初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征及功能位点。方法生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征。结果申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224~274 bp处,包含转录起始位点-265 bp,该基因无内含子;Sec14 mRNA含有丰富转录调节元件,并含有microRNA结合位点;Sec14p样蛋白由351个氨基酸残基构成,分子量为39×10^3Mr,理论等电点为5.25,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成,Sec14p样蛋白的三级结构呈现典型的球状结构,包裹一个疏水性口袋,该区域含有磷脂分子结合区域,蛋白还分布着丰富的磷酸化位点及2个二分裂核定位信号。吡啶酰胺小分子化合物在磷脂分子结合区域与蛋白相作用,结合能为-6.5 kcal/mol,蛋白还具有丰富的抗原表位。Sec14p样蛋白序列在大部分真菌中一致性较好,同源性高。结论申克孢子丝菌Sec14基因具有典型真菌基因组基因特征,mRNA可变性高,其编码蛋白的磷脂分子结合位点可作为新型小分子的药物靶点。 展开更多
关键词 申克孢子丝菌 生物信息学分析 sec14基因 吡啶酰胺
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甜菜磷脂酰肌醇转运蛋白基因SbSEC14的克隆及低温胁迫下的表达分析 被引量：1
9
作者 邹锋康 贾海伦 +1 位作者 丁广洲 陈丽 《中国农学通报》 2020年第32期39-48,共10页
磷脂酰肌醇转运蛋白(PITPs)广泛存在于真核生物细胞中,能够在体外膜脂质双层之间调控磷脂酰肌醇(PtdIns)或者磷脂酰胆碱(PtdCho)单体的独立转运。参与磷酸肌醇代谢、膜运输、极性生长、信号转导、逆境胁迫、胞浆运动和细胞周期调节等多... 磷脂酰肌醇转运蛋白(PITPs)广泛存在于真核生物细胞中,能够在体外膜脂质双层之间调控磷脂酰肌醇(PtdIns)或者磷脂酰胆碱(PtdCho)单体的独立转运。参与磷酸肌醇代谢、膜运输、极性生长、信号转导、逆境胁迫、胞浆运动和细胞周期调节等多种重要的生命过程,在植物的逆境响应以及发育调节中具有重要的作用。为了研究甜菜磷脂酰肌醇转运蛋白基因及其在低温胁迫下的表达情况。本研究以甜菜基因组数据库中一条预测的磷脂酰肌醇转运蛋白基因CRS1为模板,用基因克隆的方法得到一条全长765 bp,开放阅读框596 bp,编码198个氨基酸的甜菜SEC14基因,命名为SbSEC14。理化性质分析表明,该蛋白质为不稳定亲水蛋白;蛋白质二、三级结构分析表明,该蛋白质α-螺旋所占的比例最高,为47.47%,β-转角所占比例最低,为5.56%;蛋白质保守结构分析表明,该蛋白质有典型的SEC14结构域;蛋白质系统进化树分析表明,甜菜SbSEC14基因与菠菜、藜麦的磷脂酰肌醇运转蛋白基因亲缘关系最近;实时荧光定量结果表明,SbSEC14基因在甜菜中组成型表达,在甜菜叶中的表达量最高,在甜菜根中的表达量最低,在叶中表达量约为根中的2.5倍。甜菜幼苗4℃处理0、2、6、12、24 h,该基因在植株处理0~2 h时表达量呈上升趋势,在植株处理2~6 h时表达量呈下降趋势,在植株处理6~24 h时表达量趋于平稳状态。因此,预测该基因与甜菜抗低温胁迫相关。 展开更多
关键词 甜菜 磷脂酰肌醇运转蛋白 sec14 低温 非生物胁迫
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高粱PITPs家族全基因组鉴定和表征及对盐碱胁迫的响应
10
作者 牛江帅 吴荣 +6 位作者 李小韦 孔令鑫 牛庭莉 程欣然 李学影 李志江 戴凌燕 《分子植物育种》 北大核心 2025年第24期8108-8116,共9页
磷脂酰肌醇转移蛋白(PITPs)通过转运磷脂酰肌醇(PI)或磷脂酰胆碱(PC),在信号转导和囊泡转运过程中起到关键作用。利用生物信息学技术,本研究通过搜索高粱全基因组,并从中挖掘PITPs家族成员,进一步分析该家族进化关系、染色体定位、共线... 磷脂酰肌醇转移蛋白(PITPs)通过转运磷脂酰肌醇(PI)或磷脂酰胆碱(PC),在信号转导和囊泡转运过程中起到关键作用。利用生物信息学技术,本研究通过搜索高粱全基因组,并从中挖掘PITPs家族成员,进一步分析该家族进化关系、染色体定位、共线性、基因结构、启动子顺式作用元件、基因功能注释(GO)及盐碱胁迫下基因差异表达谱。结果表明:高粱基因组上共鉴定了32个PITPs家族成员,根据基因结构和功能域种类划分为4大类。染色体定位及共线性分析表明,PITPs家族成员分布在9条染色体上,并包含4对PITPs串联重复基因。顺式作用元件分析显示,该家族成员具有多种应激响应顺式作用元件。GO分析显示,PITPs家族成员大多存在细胞质中,主要在脂质转运和结合、定位及细胞组分形成过程中起作用。基于RNA-seq数据的转录谱分析表明,许多PITPs家族基因在受到盐碱胁迫后差异表达。研究结果为进一步分析高粱PITPs家族的分子功能提供了较全面的信息。 展开更多
关键词 高粱 磷脂酰肌醇转移蛋白 sec14结构域 生物信息学 盐碱胁迫
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