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真核翻译延伸因子1A蛋白家族功能位点的进化踪迹分析 被引量:5
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作者 周峰 刘燕 +1 位作者 马永贵 黄原 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期773-782,共10页
真核翻译延伸因子1A(eEF1A)是真核生物蛋白质翻译过程中能将氨酰tRNA运送到核糖体A位点参与多肽延伸反应的多功能蛋白质.本文主要利用多种生物信息学分析工具进行地中海涡虫翻译延伸因子1A(SmEF1A)蛋白序列的查找与eEF1A直系同源蛋白的... 真核翻译延伸因子1A(eEF1A)是真核生物蛋白质翻译过程中能将氨酰tRNA运送到核糖体A位点参与多肽延伸反应的多功能蛋白质.本文主要利用多种生物信息学分析工具进行地中海涡虫翻译延伸因子1A(SmEF1A)蛋白序列的查找与eEF1A直系同源蛋白的搜索,并基于90条直系同源蛋白进行eEF1A蛋白家族的进化踪迹分析和SmEF1A蛋白功能位点的比较研究.结果表明,在eEF1A蛋白家族中共识别到338个踪迹残基位点和20个踪迹残基富集区域,SmEF1A蛋白的功能位点与踪迹残基位点密切相关,与GTP/Mg2+结合相关的S21、T72、D91、G94等重要位点均为全家族保守的踪迹残基,N-糖基化、磷酸化等蛋白修饰位点中踪迹残基位点往往是被修饰的部位或修饰功能发挥的关键辅助位点,而位于分子表面的配基结合口袋则与20个踪迹残基富集区域在分子表面形成的踪迹残基簇关系密切.eEF1A蛋白家族的进化踪迹分析为eEF1A蛋白重要功能区域关键残基的确定和未知功能位点的预测提供了重要信息. 展开更多
关键词 真核翻译延伸因子1A(eEF1A) 地中海涡虫 进化踪迹分析 功能位点
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Neoblast-enriched zinc finger protein FIR1 triggers local proliferation during planarian regeneration 被引量:1
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作者 Xiao-Shuai Han Chen Wang +4 位作者 Fang-hao Guo Shuang Huang Yong-Wen Qin Xian-Xian Zhao Qing Jing 《Protein & Cell》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期43-59,共17页
Regeneration,relying mainly on resident adult stem cells,is widespread.However,the mechanism by which stem cells initiate proliferation during this process in vivo is unclear.Using planarian as a model,we screened 46 ... Regeneration,relying mainly on resident adult stem cells,is widespread.However,the mechanism by which stem cells initiate proliferation during this process in vivo is unclear.Using planarian as a model,we screened 46 transcripts showing potential function in the regulation of local stem cell proliferation following 48 h regeneration.By analyzing the regeneration defects and the mitotic activity of animals under administration of RNA interference(RNAi),we identified factor for initiating regeneration 1(Fir1)required for local proliferation.Our findings reveal that Fir1,enriched in neoblasts,promotes planarian regeneration in any tissue-missing context.Further,we demonstrate that DIS3 like 3-5'exoribonuclease 2(Dis3l2)is required for Fir1 phenotype.Besides,RNAi knockdown of Fir1 causes a decrease of neoblast wound response genes following amputation.These findings suggest that Fir1 recognizes regenerative signals and promotes DIS3L2 proteins to trigger neoblast proliferation following amputation and provide a mechanism critical for stem cell response to injury. 展开更多
关键词 LOCAL PROLIFERATION adult stem cells Dis3l2 wound recognition PLANARIANS schmidtea mediterranea
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