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题名高粱SbSBP15基因的克隆及分析
被引量：1
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作者
冯明
杨睿
张正
张彦琴
常建忠
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机构
长治职业技术学院生物工程系
山西农业大学山西有机旱作农业研究院
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第18期5929-5936,共8页
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基金
山西省农业科学院优势课题组自选项目(YYS1705)资助。
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文摘
SBP-box (squamosa promoter binding protein, SBP)基因编码一类绿色植物特有的转录因子,它与器官大小的控制、株型、激素和逆境响应等植物重要发育过程密切相关。本研究克隆了高粱SbSBP15基因,对其进行了序列分析、系统进化分析及表达分析。SbSBP15基因编码一个由409个氨基酸组成的蛋白质,含有3个外显子和2个内含子,其SBP结构域位于96~165 aa区域;系统进化显示19个SBP15蛋白可分为4组(Ⅰ~Ⅳ),其中第Ⅰ~Ⅲ组内仅有单子叶植物蛋白,而第Ⅳ组中同时包含有单子叶植物蛋白和双子叶植物蛋白。Sb SBP15与玉米Ub2和Ub3关系最近;启动子序列分析表明,SbSBP15启动子的顺式作用元件包含逆境响应、组织特异性表达以及植物生长发育等相关元件;SbSBP15基因在花后10 d的种子中表达量最高,是苗期根部表达量的18倍;但是随着高粱种子不断发育,SbSBP15表达量逐渐降低,表明SbSBP15可能参与高粱种子发育的过程。本研究为进一步探索SbSBP15的生物学功能奠定了基础。
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关键词
SBP-box
sbsbp15
种子
表达分析
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Keywords
SBP-box
sbsbp15
Seed
Expression analysis
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分类号
S514
[农业科学—作物学]
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题名高粱SbSBP17基因的克隆及表达分析
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作者
常建忠
董春林
张正
杨睿
张彦琴
闫凤霞
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机构
山西省农业科学院旱地农业研究中心
农业部黄土高原作物基因资源和种质创制重点实验室
山西省农业科学院高粱研究所
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期1181-1187,共7页
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基金
山西省农业科学院优势课题组自选项目(YYS1705)
有机旱作山西省重点实验室(201805D111015)
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文摘
SBP-box(Squamosa promoter Binding Protein box)蛋白是绿色植物中特有的一类转录因子,其功能涉及植物叶片发育、胚胎发生、间隔期长度、营养到生殖生长的更替、育性维持等生长发育的重要过程。该研究以高粱材料BTx623花序总RNA为模板进行RT-PCR,克隆了高粱 SbSBP 17基因,并对其进行了系统进化及半定量PCR表达分析,为进一步研究 SbSBP 17基因的生物学功能奠定基础。结果表明: SbSBP 17含有2个内含子和3个外显子,编码1个444氨基酸的蛋白质,在其195~269 aa区域含有一个典型的SBP-box结构域;系统进化分析表明,18个SBP17蛋白可分为三组,第Ⅰ和Ⅱ组只有单子叶植物基因,而第Ⅲ组只有双子叶植物基因,SbSBP17与玉米PWZ17260.1亲缘关系最近;启动子顺式作用元件分析显示, SbSBP 17启动子含有细胞周期调控元件MSA-like、分生组织发育调控相关元件CAT-box和组织特异性表达元件RY-element等。基因表达分析显示, SbSBP 17是花序特异性表达基因,随着花序发育(长度增加), SbSBP 17基因表达量逐渐增高,当花序长至10 cm时基因表达量达到峰值,约是花序长度最小点(≤2 cm)时的40倍,随后表达量逐渐降低,并于花序长度20 cm时显著降低50%以上。研究推测,随着高粱花序进一步发育, SbSBP 17基因的表达量可能逐渐降低,最终消失。
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关键词
高粱
SBP-box
sbsbp
17
花序
表达分析
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Keywords
Sorghum bicolor
SBP-box
sbsbp17
inflorescence
expression analysis
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分类号
Q785
[生物学—分子生物学]
Q786
[生物学—分子生物学]
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