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基于线粒体基因组特征揭示南海长足螺系统进化关系
1
作者
毛明光
唐向诚
+3 位作者
耿小明
王亚茹
秦传新
蒋洁兰
《水生生物学报》
北大核心
2026年第3期29-42,共14页
本研究通过解析南海长足螺(Oxynoe nanhaiensis sp.nov.)线粒体基因组特征并构建系统发育树,旨在确定其分类学地位,以丰富我国囊舌目物种多样性的记录。通过二代基因测序技术获得该物种线粒体全基因组,并对其序列进行了结构分析,分别利...
本研究通过解析南海长足螺(Oxynoe nanhaiensis sp.nov.)线粒体基因组特征并构建系统发育树,旨在确定其分类学地位,以丰富我国囊舌目物种多样性的记录。通过二代基因测序技术获得该物种线粒体全基因组,并对其序列进行了结构分析,分别利用近缘物种的线粒体基因组和cox1基因构建系统发育树,确定其进化地位;利用植物叶绿体基因保守片段序列设计引物,通过PCR技术扩增该物种体内叶绿体基因,分析其是否存在“盗食质体”现象。该物种线粒体基因组全长16189 bp,包含13个蛋白编码基因、22个转运RNA(tRNA);2个核糖体RNA(rRNA)基因及2个非编码区;碱基组成表现出高A+T、低G+C含量的偏向性;在蛋白质编码基因中共有4种起始密码子(AUG、GUG、UUG、AUA)、3种终止密码子(TAG、TAA和T––);碱基组成存在明显的AT偏向和弱AT负偏斜现象;tRNA二级结构预测中有8个能形成典型的三叶草结构,其余14个三叶草图缺失DHU臂或TΨC臂等关键元件;与序列比对相似度较高、大小相接近的物种以最大似然法(ML)构建线粒体基因组系统发育树,但由于其相近种线粒体基因组信息缺少,结果显示该物种与Ascobulla fragilis聚为一支。选取非囊舌目物种南海小叶海蛞蝓(Phyllidiella nanhaiensis)及囊舌目无壳类物种绒毛海天牛(Elysia tomentosa)作为外群,采用ML法构建cox1进化树,结果显示,该物种与长足螺属(Oxynoe)物种归为一支,其与三个长足螺属物种O.kylie、O.jordani、O.viridis的cox1基因遗传距离分别为5.00、3.93和5.15。结合形态特征与分子鉴定结果表明,该物种为长足螺属新种,将之命名为南海长足螺。与PCR扩增所获该物种体内叶绿体基因片段序列经比对后,发现其与多种藻类相似度都高达94%以上,疑似存在“盗食质体”现象,这与部分囊舌目物种的特征相符。本研究解析了一种长足螺属新物种——南海长足螺的线粒体基因组序列及其结构特征,并通过系统发育分析了南海长足螺的分类地位,结果为囊舌目的物种多样性、系统发育与演化研究提供科学数据。
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关键词
囊舌目
线粒体基因组
系统发育
盗食质体
南海长足螺
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职称材料
中国近海背楯目、囊舌目(软体动物)区系的研究
被引量:
1
2
作者
尤仲杰
林光宇
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2006年第1期40-43,共4页
中国近海共有背楯目、囊舌目软体动物30种,隶属于7科15属,主要分布在浙江以南的热带、亚热带海区,有些种类向北可以分布到达黄、渤海,部分种类仅分布于黄、渤海.区系性质属于印度—西太平洋区的中国—日本亚区.
关键词
软体动物
腹足纲
后鳃亚纲
囊舌目
背楣目
区系
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职称材料
中国近海三种囊舌目(异鳃亚纲,腹足纲)软体动物的分类学修订
3
作者
魏靖乘
孔令锋
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1134-1148,共15页
由于部分囊舌目物种存在较大程度的种内变异,我国早期基于形态学的囊舌目研究存在种名鉴定错误、同物异名等现象。为解决我国沿海囊舌目物种种名使用混乱的问题,结合比较形态学和分子系统学技术手段,对采自山东青岛、浙江舟山、海南陵...
由于部分囊舌目物种存在较大程度的种内变异,我国早期基于形态学的囊舌目研究存在种名鉴定错误、同物异名等现象。为解决我国沿海囊舌目物种种名使用混乱的问题,结合比较形态学和分子系统学技术手段,对采自山东青岛、浙江舟山、海南陵水的囊舌目样品进行了外部形态和齿舌扫描电镜的检视,并基于COI基因进行系统发育树和遗传距离分析,对国内记录的深绿海天牛Elysia atroviridis Baba,1955重新进行了分类学描述;发现华丽海天牛Elysia ornata(Swainson,1840)应暂定为三边海天牛Elysia marginata(Pease,1871);指状棍螺Placida dendritica(Alder&Hancock1843)是马场棍螺Placida babai Ev.Marcus,1982的误定。回顾了以上几种囊舌目物种及其相似物种的分类学研究历程,对E.atroviridis、E.marginata和P.babai进行了分子系统学和形态学研究,并为解决这三种囊舌目物种的分类存疑问题提供了新的材料和方法。
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关键词
囊舌目
物种界定
Elysia
atroviridis
Elysia
marginata
Placida
babai
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职称材料
题名
基于线粒体基因组特征揭示南海长足螺系统进化关系
1
作者
毛明光
唐向诚
耿小明
王亚茹
秦传新
蒋洁兰
机构
海南热带海洋学院崖州湾创新研究院
海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室
海南热带海洋学院海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室
三亚热带水产研究院
出处
《水生生物学报》
北大核心
2026年第3期29-42,共14页
基金
国家重点研发计划(2024YFD2401803)
三亚崖州湾科技城“崖州湾”菁英人才项目(SCKJ-JYRC-2024-52)
+1 种基金
国家自然科学基金(32360923)
海南热带海洋学院引进人才科研启动项目(RHDRC202206)资助。
文摘
本研究通过解析南海长足螺(Oxynoe nanhaiensis sp.nov.)线粒体基因组特征并构建系统发育树,旨在确定其分类学地位,以丰富我国囊舌目物种多样性的记录。通过二代基因测序技术获得该物种线粒体全基因组,并对其序列进行了结构分析,分别利用近缘物种的线粒体基因组和cox1基因构建系统发育树,确定其进化地位;利用植物叶绿体基因保守片段序列设计引物,通过PCR技术扩增该物种体内叶绿体基因,分析其是否存在“盗食质体”现象。该物种线粒体基因组全长16189 bp,包含13个蛋白编码基因、22个转运RNA(tRNA);2个核糖体RNA(rRNA)基因及2个非编码区;碱基组成表现出高A+T、低G+C含量的偏向性;在蛋白质编码基因中共有4种起始密码子(AUG、GUG、UUG、AUA)、3种终止密码子(TAG、TAA和T––);碱基组成存在明显的AT偏向和弱AT负偏斜现象;tRNA二级结构预测中有8个能形成典型的三叶草结构,其余14个三叶草图缺失DHU臂或TΨC臂等关键元件;与序列比对相似度较高、大小相接近的物种以最大似然法(ML)构建线粒体基因组系统发育树,但由于其相近种线粒体基因组信息缺少,结果显示该物种与Ascobulla fragilis聚为一支。选取非囊舌目物种南海小叶海蛞蝓(Phyllidiella nanhaiensis)及囊舌目无壳类物种绒毛海天牛(Elysia tomentosa)作为外群,采用ML法构建cox1进化树,结果显示,该物种与长足螺属(Oxynoe)物种归为一支,其与三个长足螺属物种O.kylie、O.jordani、O.viridis的cox1基因遗传距离分别为5.00、3.93和5.15。结合形态特征与分子鉴定结果表明,该物种为长足螺属新种,将之命名为南海长足螺。与PCR扩增所获该物种体内叶绿体基因片段序列经比对后,发现其与多种藻类相似度都高达94%以上,疑似存在“盗食质体”现象,这与部分囊舌目物种的特征相符。本研究解析了一种长足螺属新物种——南海长足螺的线粒体基因组序列及其结构特征,并通过系统发育分析了南海长足螺的分类地位,结果为囊舌目的物种多样性、系统发育与演化研究提供科学数据。
关键词
囊舌目
线粒体基因组
系统发育
盗食质体
南海长足螺
Keywords
sacoglossa
Mitochondrial genome
Phylogeny
Kleptoplast
Oxynoe nanhaiensis sp.nov.
分类号
Q951 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
中国近海背楯目、囊舌目(软体动物)区系的研究
被引量:
1
2
作者
尤仲杰
林光宇
机构
宁波市海洋与渔业研究院
中国科学院海洋研究所
出处
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2006年第1期40-43,共4页
文摘
中国近海共有背楯目、囊舌目软体动物30种,隶属于7科15属,主要分布在浙江以南的热带、亚热带海区,有些种类向北可以分布到达黄、渤海,部分种类仅分布于黄、渤海.区系性质属于印度—西太平洋区的中国—日本亚区.
关键词
软体动物
腹足纲
后鳃亚纲
囊舌目
背楣目
区系
Keywords
mollusca
gastropoda
opisthobranchia
nudibranchia
nolaspidea
sacoglossa
fauna
分类号
Q959.21 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
中国近海三种囊舌目(异鳃亚纲,腹足纲)软体动物的分类学修订
3
作者
魏靖乘
孔令锋
机构
中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
中国海洋大学三亚海洋研究院
崂山实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1134-1148,共15页
基金
海南省科技计划三亚崖州湾科技城联合项目,320LH019号
国家自然科学基金项目,31772414号
中央高校基本科研业务费项目,201964001号。
文摘
由于部分囊舌目物种存在较大程度的种内变异,我国早期基于形态学的囊舌目研究存在种名鉴定错误、同物异名等现象。为解决我国沿海囊舌目物种种名使用混乱的问题,结合比较形态学和分子系统学技术手段,对采自山东青岛、浙江舟山、海南陵水的囊舌目样品进行了外部形态和齿舌扫描电镜的检视,并基于COI基因进行系统发育树和遗传距离分析,对国内记录的深绿海天牛Elysia atroviridis Baba,1955重新进行了分类学描述;发现华丽海天牛Elysia ornata(Swainson,1840)应暂定为三边海天牛Elysia marginata(Pease,1871);指状棍螺Placida dendritica(Alder&Hancock1843)是马场棍螺Placida babai Ev.Marcus,1982的误定。回顾了以上几种囊舌目物种及其相似物种的分类学研究历程,对E.atroviridis、E.marginata和P.babai进行了分子系统学和形态学研究,并为解决这三种囊舌目物种的分类存疑问题提供了新的材料和方法。
关键词
囊舌目
物种界定
Elysia
atroviridis
Elysia
marginata
Placida
babai
Keywords
sacoglossa
species delimitation
Elysia atroviridis
Elysia marginata
Placida babai
分类号
Q959.212 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体基因组特征揭示南海长足螺系统进化关系
毛明光
唐向诚
耿小明
王亚茹
秦传新
蒋洁兰
《水生生物学报》
北大核心
2026
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
中国近海背楯目、囊舌目(软体动物)区系的研究
尤仲杰
林光宇
《宁波大学学报(理工版)》
CAS
2006
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
中国近海三种囊舌目(异鳃亚纲,腹足纲)软体动物的分类学修订
魏靖乘
孔令锋
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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