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SV40PolyA顺式活化基因元件中不完整茎环结构的发现和序列研究 被引量:1
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作者 王红钢 马欢 +4 位作者 李珠 张彬 景向阳 张媛 吕占军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期337-346,共10页
研究室的前期工作发现,Alu串连序列插入pEGFP-C1质粒的GFP基因下游,瞬时转染HeLa细胞抑制GFP基因表达,2F2R(来自SV40PolyA反序5′端的第2个60 bp)插入GFP和Alu串连序列之间可以解除Alu序列对GFP基因的抑制作用。文章通过删减2F2R发现,45... 研究室的前期工作发现,Alu串连序列插入pEGFP-C1质粒的GFP基因下游,瞬时转染HeLa细胞抑制GFP基因表达,2F2R(来自SV40PolyA反序5′端的第2个60 bp)插入GFP和Alu串连序列之间可以解除Alu序列对GFP基因的抑制作用。文章通过删减2F2R发现,45R(2F2R 5′端的45 bp)、30R和22R可以活化基因,且二串连体活化基因作用高于单体。Secloop(2F2R近中部的22 bp)和Poly4(2F2R 3′端的30 bp)不能活化基因。30R与Poly4用9碱基连接形成30R-Poly4,其活化基因作用低于2F2R,两个22R之间连接碱基数对活化GFP基因作用没有明显的影响。22R(5′-GTGAAAAAAATGCTTTATTTGT-3′)含有不完整的回文序列,可以形成不完整的茎环结构,包括一个3碱基loop、3 bp第一茎、2碱基泡和3 bp第二茎。改变22R茎环结构的碱基突变明显影响其活化GFP基因的作用,过多互补和过少互补的茎环结构均不利于活化基因,提示适当的不完整茎环结构与活化基因有关。 展开更多
关键词 非编码序列 GFP 茎环结构 ALU sv40polya
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SV40PolyA片段串联拷贝数目影响GFP报告基因表达 被引量:1
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作者 尹康 马欢 +4 位作者 王秀芳 谢英 冯晶晶 杨钦清 吕占军 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2011年第3期187-194,共8页
Alu元件(约280bp)是人类基因组中的重要重复序列,串联Alu呈长度依赖性下调GFP报告基因表达,在Alu串联序列上游正向或反向插入SV40PolyA(简称PolyA,240bp),解除Alu串联序列对GFP基因的抑制作用.PCR法扩增PolyA反序(PolyAas)不同位置的60b... Alu元件(约280bp)是人类基因组中的重要重复序列,串联Alu呈长度依赖性下调GFP报告基因表达,在Alu串联序列上游正向或反向插入SV40PolyA(简称PolyA,240bp),解除Alu串联序列对GFP基因的抑制作用.PCR法扩增PolyA反序(PolyAas)不同位置的60bp片段,插入pAlu14质粒(14个Alu正向串联插入pEGFP-C1)的GFP基因和Alu14之间,瞬时转染HeLa细胞,通过荧光显微镜观察和Northern检测,1F1R(PolyAas5′端第1个60bp片段)和4F4R(自PolyAas5′端计算第4个60bp片段)不能活化基因;2F2R和3F3R(PolyAas中间的2段)可以解除Alu14对GFP基因的抑制作用.将2F2R和3F3R各自反复首尾串联,分别插入pAlu14质粒GFP基因和Alu串联序列之间,瞬时转染HeLa细胞,用插入4个2F2R的pAlu28,插入4个3F3R的pAlu18,插入4个3F3R的pAlu28作长度对照,以排除由于插入片段长度增加可能对结果造成的干扰,发现2~4个拷贝的2F2R和3F3R活化基因作用高于一个拷贝的同样片段,但是多于8拷贝以后,活化GFP基因作用减弱.本实验证明,SV40 PolyAas至少含有两段活化基因序列,活化基因序列(2F2R,3F3R)的最适活化基因条件需要合适的拷贝数. 展开更多
关键词 拷贝数 sv40polya 重复序列 GFP ALU
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Impact of copy number of distinct SV40PolyA segments on expression of a GFP reporter gene 被引量:3
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作者 YIN Kang,WANG XiuFang,MA Huan,XIE Ying,FENG JingJing,YANG QinQing & Lü ZhanJun Hebei Key Lab of Laboratory Animal,Department of Genetics,Hebei Medical University,Shijiazhuang 050017,China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2010年第5期606-612,共7页
The presence of Alu repeats downregulates the expression of the green fluorescent protein(GFP) gene.We found that SV40PolyA(PolyA,240 bp),in either orientation,eliminated the inhibition of GFP gene expression induced ... The presence of Alu repeats downregulates the expression of the green fluorescent protein(GFP) gene.We found that SV40PolyA(PolyA,240 bp),in either orientation,eliminated the inhibition of GFP gene expression induced by Alu repeats when it was placed between the GFP gene and the Alu repeats.In this study,4 different segments(each 60 bp) were amplified from antisense PolyA(PolyAas) by PCR,and inserted upstream of Alu14 in pAlu14 plasmid(14 Alu repeats inserted downstream of the GFP gene in vector pEGFP-C1 in a head-tail tandem manner).Segments 1F1R(the first 60 bp segment at the 5' end of PolyAas) and 4F4R(the fourth 60 bp segment from the 5' end of PolyAas) did not activate GFP gene expression,whereas 2F2R and 3F3R(the middle two segments) did(as detected by Northern blot analysis and fluorescent microscopy).Different copy numbers of 2F2R and 3F3R segments,in a head and tail tandem manner,were inserted downstream of the GFP gene in pAlu14.p2F2R*4-Alu28,p3F3R*4-Alu18 and p3F3R*4-Alu28 were used as length controls to verify that the decrease in the expression of GFP was not due to the increased length of the inserted segment in the expression vectors.We found that 2 and 4 copies of 2F2R or 3F3R activated the GFP gene more strongly than one copy of them.However,more than 8 copies of 2F2R or 3F3R reduced the activation of the GFP gene.We concluded that SV40PolyAas contained at least two gene-activating elements(2F2R and 3F3R) and 2-4 copies of 2F2R or 3F3R were optimal for the expression of the GFP gene. 展开更多
关键词 COPY number sv40polya REPEAT sequence GFP ALU
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22R序列loop和泡突变对GFP报告基因表达的作用
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作者 王红钢 王予东 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2011年第4期255-259,共5页
目的:我们研究室的前期工作在猴空泡病毒40(SV40)早期mRNA PolyA序列(SV40PolyA)中发现1个活化基因的原件22R(5′-GTGAAAAAAATGCTTTATTTGT-3′),该片段可以解除Alu串连序列(或Line-1重复序列)对GFP报告基因的抑制作用。我们研究22R突变... 目的:我们研究室的前期工作在猴空泡病毒40(SV40)早期mRNA PolyA序列(SV40PolyA)中发现1个活化基因的原件22R(5′-GTGAAAAAAATGCTTTATTTGT-3′),该片段可以解除Alu串连序列(或Line-1重复序列)对GFP报告基因的抑制作用。我们研究22R突变对GFP报告基因表达的作用。方法:将22R及其突变片段插入pEGFP-C1质粒,构建表达载体,瞬时转染HeLa细胞,荧光显微镜下计数观察GFP荧光阳性细胞数。结果:AAG、AGA、TGT、TTG和TGC(22R,野生型)5个质粒促进基因表达作用比较明显。VECT、VEGT、VETA、VETC、VETG和VETT明显促进GFP基因表达。结论:22Rloop和泡的突变对其活化GFP报告基因作用有重要影响。 展开更多
关键词 sv40polya 22R GFP 茎环结构 转染
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