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基于HRM技术开发水稻抗条纹叶枯病基因STV11功能标记
1
作者
王婵
吴莹莹
+4 位作者
李文奇
李霞
王芳权
周彤
杨杰
《作物学报》
北大核心
2025年第9期2547-2556,共10页
水稻条纹叶枯病是一种由灰飞虱传播的重要病害,对水稻(Oryza sativa L.)生产造成威胁,其病原为水稻条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)。为了加快水稻条纹叶枯病抗性品种选育进程,本研究旨在开发可以快速准确鉴定水稻条纹叶枯病抗性...
水稻条纹叶枯病是一种由灰飞虱传播的重要病害,对水稻(Oryza sativa L.)生产造成威胁,其病原为水稻条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)。为了加快水稻条纹叶枯病抗性品种选育进程,本研究旨在开发可以快速准确鉴定水稻条纹叶枯病抗性基因的功能标记,有助于提高水稻种质改良的效率。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因。根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11KAS的6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,通过NCBI查找克隆序列(登录号:LOC_Os11g30910),针对其第773~779位核苷酸在抗感品种上的差异序列,设计基于高分辨率熔解曲线(high-resolution melting curve,HRM)的功能性分子标记stvHRM-3。进一步,对所检测品种的目标片段的PCR产物进行测序分析以验证鉴定结果,并对部分江苏省试验品种进行抗条纹叶枯病表型和基因型的分析。通过HRM-PCR检测结合测序分析,筛选了STV11基因1个功能区域的功能标记stvHRM-3。利用stvHRM-3对包括江苏省晚粳组区试、迟熟中粳预试材料以及育种中间材料、部分品种资源等在内的520份粳稻材料的STV11基因型进行检测。结果发现,217份水稻材料为抗病基因型;294份材料为感病基因型;9份材料为抗感杂合基因型。基于功能标记鉴定为抗病基因型的材料均表现出高抗或抗病表型特征。基于HRM-PCR技术开发的基因功能标记stvHRM-3可以快速高通量鉴定水稻STV11不同基因型,具有潜在的育种应用价值。
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关键词
水稻
条纹叶枯病
stv11
基因
功能标记
HRM-PCR技术
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职称材料
抗条纹叶枯病基因STV11的功能性分子标记建立及粳型抗源筛选
被引量:
1
2
作者
毛艇
李旭
+2 位作者
张战
付立东
李振宇
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期661-667,共7页
条纹叶枯病是水稻(Oryza sativa L.)上最严重的病害之一。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因,根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11 KAS6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,设计基于PCR的功能性分子标记qstv11。利用此标记...
条纹叶枯病是水稻(Oryza sativa L.)上最严重的病害之一。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因,根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11 KAS6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,设计基于PCR的功能性分子标记qstv11。利用此标记对299份试验材料[5份抗病品种、5份感病品种、41份辽宁省育种材料、17份日本粳型材料、142份秋光/七山占重组自交系(群体A)、85份笹锦/Habataki//笹锦回交重组自交系(群体B)、群体亲本4份]进行基因型分析并进行抗病性鉴定。结果表明,qstv11能够较好区分抗感基因型,而且在测试材料中与条纹叶枯抗性整体呈现共分离。41份辽宁材料中鉴定出含有STV11-R(抗)材料1份;日本粳型材料该位点均为STV11-S(感);群体A和B中分别筛选出粳稻背景STV11-R型材料24份和6份。
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关键词
水稻
条纹叶枯病
stv11
功能性标记
粳型材料
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职称材料
题名
基于HRM技术开发水稻抗条纹叶枯病基因STV11功能标记
1
作者
王婵
吴莹莹
李文奇
李霞
王芳权
周彤
杨杰
机构
江苏大学
江苏省农业科学院粮食作物研究所/农业农村部淮河下游种质创制重点实验室(南京)
江苏省农业科学院植物保护研究所
出处
《作物学报》
北大核心
2025年第9期2547-2556,共10页
基金
生物育种钟山实验室项目(BM2022008-03)资助。
文摘
水稻条纹叶枯病是一种由灰飞虱传播的重要病害,对水稻(Oryza sativa L.)生产造成威胁,其病原为水稻条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)。为了加快水稻条纹叶枯病抗性品种选育进程,本研究旨在开发可以快速准确鉴定水稻条纹叶枯病抗性基因的功能标记,有助于提高水稻种质改良的效率。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因。根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11KAS的6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,通过NCBI查找克隆序列(登录号:LOC_Os11g30910),针对其第773~779位核苷酸在抗感品种上的差异序列,设计基于高分辨率熔解曲线(high-resolution melting curve,HRM)的功能性分子标记stvHRM-3。进一步,对所检测品种的目标片段的PCR产物进行测序分析以验证鉴定结果,并对部分江苏省试验品种进行抗条纹叶枯病表型和基因型的分析。通过HRM-PCR检测结合测序分析,筛选了STV11基因1个功能区域的功能标记stvHRM-3。利用stvHRM-3对包括江苏省晚粳组区试、迟熟中粳预试材料以及育种中间材料、部分品种资源等在内的520份粳稻材料的STV11基因型进行检测。结果发现,217份水稻材料为抗病基因型;294份材料为感病基因型;9份材料为抗感杂合基因型。基于功能标记鉴定为抗病基因型的材料均表现出高抗或抗病表型特征。基于HRM-PCR技术开发的基因功能标记stvHRM-3可以快速高通量鉴定水稻STV11不同基因型,具有潜在的育种应用价值。
关键词
水稻
条纹叶枯病
stv11
基因
功能标记
HRM-PCR技术
Keywords
rice
rice stripe disease
stv11
functional marker
HRM-PCR technology
分类号
S435.111 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
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职称材料
题名
抗条纹叶枯病基因STV11的功能性分子标记建立及粳型抗源筛选
被引量:
1
2
作者
毛艇
李旭
张战
付立东
李振宇
机构
辽宁省盐碱地利用研究所
出处
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期661-667,共7页
基金
辽宁省农业领域青年科技创新人才培养计划资助项目(2015035
2015036)
文摘
条纹叶枯病是水稻(Oryza sativa L.)上最严重的病害之一。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因,根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11 KAS6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,设计基于PCR的功能性分子标记qstv11。利用此标记对299份试验材料[5份抗病品种、5份感病品种、41份辽宁省育种材料、17份日本粳型材料、142份秋光/七山占重组自交系(群体A)、85份笹锦/Habataki//笹锦回交重组自交系(群体B)、群体亲本4份]进行基因型分析并进行抗病性鉴定。结果表明,qstv11能够较好区分抗感基因型,而且在测试材料中与条纹叶枯抗性整体呈现共分离。41份辽宁材料中鉴定出含有STV11-R(抗)材料1份;日本粳型材料该位点均为STV11-S(感);群体A和B中分别筛选出粳稻背景STV11-R型材料24份和6份。
关键词
水稻
条纹叶枯病
stv11
功能性标记
粳型材料
Keywords
rice
rice stripe virus
stv11
functional marker
japonica type
分类号
S435.111.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于HRM技术开发水稻抗条纹叶枯病基因STV11功能标记
王婵
吴莹莹
李文奇
李霞
王芳权
周彤
杨杰
《作物学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
抗条纹叶枯病基因STV11的功能性分子标记建立及粳型抗源筛选
毛艇
李旭
张战
付立东
李振宇
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
在线阅读
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职称材料
已选择
0
条
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