MFSTR-tree:面向Argo海洋浮标的时空数据索引

1

作者 杨明远 刘海砚 +1 位作者 朱新铭 苏晨琛 《地球信息科学学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期665-673,共9页

针对Argo海洋浮标数据的准实时性、海量性、时空异变性等特点和多种查询应用需求,分析了当前时空索引方法的优势与不足,提出了一种多频率STR-tree索引与格网索引的混合索引结构MFSTR-tree。该方法在首先轨迹束层利用动态轨迹束作为叶节... 针对Argo海洋浮标数据的准实时性、海量性、时空异变性等特点和多种查询应用需求,分析了当前时空索引方法的优势与不足,提出了一种多频率STR-tree索引与格网索引的混合索引结构MFSTR-tree。该方法在首先轨迹束层利用动态轨迹束作为叶节点生成STR-tree结构,将STR-tree索引结构灵活、数据冗余少的优势进一步扩大;接着通过轨迹束的多种频率在采样点层构建格网索引,实现在查询效率上的提升;同时给出了该结构插入算法和查询算法的具体描述。本文以中国Argo实时资料中心提供的2015年海洋浮标数据为例,将该方法与HR-tree和STR-tree方法进行了构建效率和查询效率的对比实验,结果表明该方法在保证了构建存储效率和时间效率的同时,有效改善了原有STR-tree应用于Argo数据中的查询效率问题。 展开更多

关键词 海洋浮标 时空索引 str-tree 查询效率 动态轨迹束

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基于单调链和STR树的简单要素模型多边形叠置分析算法 被引量：14

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作者 陈占龙 吴信才 吴亮 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第1期102-108,共7页

针对简单要素类叠置分析的特点,利用STR(sort-tile-recursive)树索引改进算法能够将尽量多的多边形节点存储在STR树的叶节点中,减少在空间数据库中检索多边形时的磁盘读取次数。算法对多边形边界进行关于坐标轴的单调链分割,并在多边形... 针对简单要素类叠置分析的特点,利用STR(sort-tile-recursive)树索引改进算法能够将尽量多的多边形节点存储在STR树的叶节点中,减少在空间数据库中检索多边形时的磁盘读取次数。算法对多边形边界进行关于坐标轴的单调链分割,并在多边形求交过程中引入平面图的概念,利用平面图元素与各个多边形的拓扑关系来组织叠加后的多边形。该算法能有效减少求交点的时间,在线段求交中加入对连续出入点特殊数据的处理。同时该算法使用单调链减少多边形求交过程的比较次数,与其他使用双链表或单链表的算法相比具有占用空间少及处理速度快的特点。 展开更多

关键词 简单要素模型 单调链 STR树 平面图 空间叠置

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基于Hilbert曲线的STR索引改进算法 被引量：5

3

作者 戴晶 吴明光 +3 位作者 郑培蓓 王蕾 崔登吉 陈泰生 《武汉大学学报（信息科学版）》 EI CSCD 北大核心 2014年第7期777-781,共5页

递归网格排序算法(sort-tile-recursive,STR)是一种性能优良的静态变体,其构建效率高效,查询性能较为优良,但是没有很好的兼顾到数据本身的聚集特性。Hilbert曲线具有较好的数据聚集特性,但是存在一定信息的丢失。本文利用Hilbert曲线... 递归网格排序算法(sort-tile-recursive,STR)是一种性能优良的静态变体,其构建效率高效,查询性能较为优良,但是没有很好的兼顾到数据本身的聚集特性。Hilbert曲线具有较好的数据聚集特性,但是存在一定信息的丢失。本文利用Hilbert曲线的聚集性来提高STR-树的数据聚集性能,提出了一种基于Hilbert编码的STR索引改进算法,并在改进中弥补信息丢失的问题。算法首先按照MBR的Hilbert值进行排序,根据节点容量生成子节点,形成各聚类中心,针对Hilbert异常值采用距离约束条件进行处理;迭代以上过程,生成Hilbert STR-树。研究结果表明,该算法的查询效率优于STR-树和R树。 展开更多

关键词 空间索引 HILBERT曲线 STR-树 聚类 R-树

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27个群体7个Y-STR基因座多态性的聚类分析 被引量：3

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作者 朱永生 霍正浩 +5 位作者 赖江华 李生斌 党洁 金彩霞 彭亮 梁青 《现代生物医学进展》 CAS 2009年第2期234-236,共3页

目的:选择具有高度多态性与稳定性的7个Y-STR位点,分析27个群体遗传关系。方法:应用Y-STR复合扩增方法,获得150名宁夏回族个体DYS19、DYS389I、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS3937个基因座等位基因频率。收集国内外26个群体这7... 目的:选择具有高度多态性与稳定性的7个Y-STR位点,分析27个群体遗传关系。方法:应用Y-STR复合扩增方法,获得150名宁夏回族个体DYS19、DYS389I、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS3937个基因座等位基因频率。收集国内外26个群体这7个基因座基因频率的数据。结果:应用这7个Y染色体STR的多态性研究结果显示:国内群体与朝鲜、韩国、日本的遗传关系较近,与几内亚、莫桑比克的遗传关系较远。结论:27个不同群体这7个Y-STR基因座多态性有明显的种族与地域差异,与三大人种的分类基本一致。 展开更多

关键词 Y-STR 复合扩增 聚类分析 群体

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国内34个人群19个常染色体STR基因座的遗传关系 被引量：1

5

作者 王亚丽 宋振祥 +8 位作者 杨子豪 白志美 杨越 白慧茹 顾捷 贾富全 周圆圆 张佳怡 陈丽琴 《中国热带医学》 CAS 2020年第2期106-111,共6页

目的研究国内不同地区不同民族34个群体19个常染色体STR基因座的遗传关系,进而应用于群体遗传学、民族和种族研究。方法收集国内不同地区的34个群体19个常染色体STR基因座(D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317... 目的研究国内不同地区不同民族34个群体19个常染色体STR基因座的遗传关系,进而应用于群体遗传学、民族和种族研究。方法收集国内不同地区的34个群体19个常染色体STR基因座(D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、Penta E、TH01、D12S391、D2S1338、FGA)的基因频率信息,通过统计群体间的遗传距离,进而构建系统发育树,并进行多维尺度分析。结果经统计遗传距离,发现呼和浩特汉族与湖南沅陵土家族遗传距离最大(0.027)。经构建系统发育树,发现国内34个群体共分为四大支,新疆维吾尔族、新疆哈萨克族、宁夏回族和甘肃回族为一支;湖南沅陵土家族为一支;宁波汉族、海南汉族、福建汉族、福建漳州汉族、重庆汉族、贵州汉族、云南汉族、湖南汉族和南京汉族聚为一支;剩余群体为一支。经多维尺度分析,湖南沅陵土家族与其余的33个国内人群遗传距离相对较大。结论以19个STR遗传标记的等位基因频率为基础得到的遗传距离、系统发育树和MDS分析,能够适用于群体遗传学、民族和种群研究。 展开更多

关键词 法医遗传学 短串联重复序列 系统发育树 群体遗传关系

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广西地区15个不同民族人群的群体遗传学关系 被引量：2

6

作者 金天博 高雅 +2 位作者 陈腾 阎春霞 李生斌 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期422-424,429,共4页

目的　选择具有高度遗传多态性与稳定性的STR位点进行中国广西地区 15个不同民族人群与我国其他地区 6个民族之间的群体遗传关系分析。方法　收集各个民族血液样本 ,使用ABI377全自动测序仪进行 9个位点的STR分型 ;统计学分析处理 2 1... 目的　选择具有高度遗传多态性与稳定性的STR位点进行中国广西地区 15个不同民族人群与我国其他地区 6个民族之间的群体遗传关系分析。方法　收集各个民族血液样本 ,使用ABI377全自动测序仪进行 9个位点的STR分型 ;统计学分析处理 2 1个不同人群的STR群体遗传学资料。结果　应用 6个常染色体STR的多态性研究结果显示广西地区的京族与苗族之间的关系较近 ,而瑶族、仡佬族、仫佬族与其他民族的关系较远。结论　广西地区 15个不同民族人群之间存在一定的基因交流 ,个别民族相对独立。 展开更多

关键词 广西少数民族 民族起源 STR 遗传距离 进化树

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中国毛南族和仫佬族群体STR的遗传差异性分析 被引量：2

7

作者 邓琼英 徐林 +4 位作者 罗国容 龚继春 腾少康 李松峰 周丽宁 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期689-693,共5页

目的研究中国毛南族和仫佬族6个短串联重复序列基因座（STR）：D2S1338、D8S1179、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11的遗传多态性以及他们与其他5个少数民族群体的遗传进化关系，丰富这两个群体的遗传学数据库。方法采用聚合酶链反应... 目的研究中国毛南族和仫佬族6个短串联重复序列基因座（STR）：D2S1338、D8S1179、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11的遗传多态性以及他们与其他5个少数民族群体的遗传进化关系，丰富这两个群体的遗传学数据库。方法采用聚合酶链反应一短串联重复序列（PCR-STR）技术及ABI3100测序仪，研究中国毛南族（200例）和仫佬族（183例）无关个体6个STR位点的基因频率的分布特点。结果毛南族和仫佬族的6个STR位点分别共检出61和65种等位基因，其频率分布在0．0025，0．3200和0．0027～0．2842之间；共检出216和218种基因型．其频率分布在0．0050～0．1500和0．0055～0．1585之间；两者的平均H〉0．8，PIC〉0．8；累积DP达0．99999998，累积EP达0．9983以上。遗传距离和进化树结果显示：毛南族与仫佬族关系最近，彝族与水族关系最远；7个民族在进化树上被分为2类，彝族自成一类，其余6个民族聚为一类。结论毛南族和仫佬族的6个STR基因座具有高度遗传多态性的特点，实用价值较高，故以上数据可用于人类群体遗传学、法医学个体识别和亲子鉴定等研究；广西7个民族STR的遗传差异性与他们的历史文化和地理分布基本一致。 展开更多

关键词 遗传多态性 遗传距离 遗传进化树 聚合酶链反应-短串联重复序列 毛南族 仫佬族

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中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系研究 被引量：5

8

作者 龙友国 邱祥智 +2 位作者 龙思方 余跃生 戎聚全 《右江民族医学院学报》 2007年第3期336-338,共3页

目的探讨中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系。方法收集中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,计算他们间的遗传距离,构建系统发生树。结果江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳汉族聚为一大类,泉... 目的探讨中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系。方法收集中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料,计算他们间的遗传距离,构建系统发生树。结果江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳汉族聚为一大类,泉州、广东、福建、潮汕汉族为一类,荆州、成都、湖南、西安和贵州汉族为一类,而广西汉族单独为一类。结论研究结果与遗传学和民族学研究结果一致,并提示17个汉族人群STR基因频率分布与地理距离呈平行关系。 展开更多

关键词 STR 遗传距离 系统发生树 群体遗传学 汉族 中国

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西藏藏族和珞巴族X-STR基因多态性分析 被引量：1

9

作者 刘丽军 余兵 +3 位作者 马利锋 贺学 康龙丽 李生斌 《国外医学（医学地理分册）》 CAS 2010年第1期12-14,43,共4页

目的研究我国西藏地区藏族、珞巴族和其他民族的遗传学关系。方法选择6个具有遗传稳定性的X-STR位点(DXS6799、DXS8378、DXS7424、DXS7132、DXS7133和DXS7423)作为分子遗传标记,收集中国西藏珞巴族、藏族血液样本,应用PCR和变性聚丙烯... 目的研究我国西藏地区藏族、珞巴族和其他民族的遗传学关系。方法选择6个具有遗传稳定性的X-STR位点(DXS6799、DXS8378、DXS7424、DXS7132、DXS7133和DXS7423)作为分子遗传标记,收集中国西藏珞巴族、藏族血液样本,应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测进行基因分型,并结合本实验室已检测的汉族、回族、蒙古族和维吾尔族的X-STR位点群体遗传学资料,进行Hardy Weinberg平衡检验,计算H、PIC、DP和PPE,采用Nei's法计算各人群间的遗传距离,采用组间平均连锁法进行聚类分析,用UPGMA法绘制系统发生树。结果 6个人群的6个STR位点基因型分布均符合Hardy Weinberg平衡定律(P>0.05);西藏藏族和珞巴族间遗传距离最近,其次是蒙古族、汉族和回族,西藏民族和维吾族之间的遗传距离最远。结论研究结果与各人群地理分布基本一致。且在对种族、民族间的遗传关系进行分析时,只有选择相同的、具有高度遗传多态性的DNA遗传标记,才可以相互比较、分析。 展开更多

关键词 西藏少数民族 短串联重复序列(STR) 遗传距离 系统发生树

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基于改进SVM算法的电力工程异常数据检测方法设计 被引量：6

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作者 王楠 周鑫 +2 位作者 周云浩 苏世凯 王增亮 《电子设计工程》 2024年第4期162-166,共5页

针对传统电力工程数据异常检测过程中存在准确度差且主观性较强的问题,文中提出了一种基于改进支持向量机的电力工程数据异常检测模型。其在传统支持向量机的基础上加入了二叉树多分类算法,从而使模型具备多特征分类能力。同时通过引入A... 针对传统电力工程数据异常检测过程中存在准确度差且主观性较强的问题,文中提出了一种基于改进支持向量机的电力工程数据异常检测模型。其在传统支持向量机的基础上加入了二叉树多分类算法,从而使模型具备多特征分类能力。同时通过引入AdaBoost分类器,来改善支持向量机弱特征分类能力较差的不足。为进一步提高准确度,还使用鲸鱼算法对模型惩罚项、核函数及迭代次数进行优化。在实验测试中,所提算法的检测准确度相较其他三种对比算法分别提升了5.35%、2.17%和5.35%,说明该算法具备更为理想的性能,并可有效提升电力工程数据检测的准确度,故能为电力基建工程验收与管理提供数据支撑。 展开更多

关键词 支持向量机 ADABOOST算法 鲸鱼优化算法 二叉树结构 异常数据分析

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群体遗传学研究中STR数据的统计方法应用 被引量：4

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作者 桂宏胜 杨丽 李生斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1443-1448,共6页

STR作为遗传多态性较高的标记,被广泛地运用于群体遗传学的研究。对于STR分型产生的基因型频率及等位基因频率数据,文章总结了各种参数指标的计算及分析方法。其中参数指标包括杂合度、多态信息量、连锁不平衡系数、近交系数、遗传距离... STR作为遗传多态性较高的标记,被广泛地运用于群体遗传学的研究。对于STR分型产生的基因型频率及等位基因频率数据,文章总结了各种参数指标的计算及分析方法。其中参数指标包括杂合度、多态信息量、连锁不平衡系数、近交系数、遗传距离以及固定指数等;分析方法包括主成分分析、系统发生树、分子方差分析、R矩阵、地理信息系统以及空间自相关分析。通过这些参数指标及分析方法的使用,可以既直观又科学地揭示群体遗传结构、群体间遗传分化以及人类起源与进化等群体遗传学中研究的关键问题。 展开更多

关键词 STR 群体遗传学 主成分分析 系统发生树 AMOVA R矩阵 GIS 空间自相关

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广西毛南族STR的人类群体遗传学调查

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作者 邓琼英 徐林 +2 位作者 李松峰 周丽宁 龚继春 《广西医科大学学报》 CAS 北大核心 2006年第2期176-179,共4页

目的：研究广西毛南族短串联重复序列（STR）的遗传多态性及毛南族等四个不同民族群体之间的遗传进化关系。方法：采用PCR—STR技术及ABI3100全自动测序仪，研究毛南族无关个体3个STR位点（D5S818、D7S820、D13S317）的基因频率分布情... 目的：研究广西毛南族短串联重复序列（STR）的遗传多态性及毛南族等四个不同民族群体之间的遗传进化关系。方法：采用PCR—STR技术及ABI3100全自动测序仪，研究毛南族无关个体3个STR位点（D5S818、D7S820、D13S317）的基因频率分布情况；计算10个民族的遗传距离，构建系统进化树。结果：毛南族3个STR位点共检出21种等位基因，其频率分布在0．0025～0．4623之间；杂合度为0．7136～0．7789，多态信息总量为0．6851～0．75l6，累积个体识别力达0．99907，非父排除率达0．9052；遗传距离和进化树结果显示：广西毛南组等10个民族被聚为两大类，汉、侗、壮、水、京族和毛南族关系较近，聚为一类，而回、瑶、苗族和仫佬族聚为另一类。结论：毛南族的3个STR位点具有高度遗传多态性的特点，实用价值较高，数据可用于群体遗传学、法医学个体识别和亲子鉴定等研究；广西毛南族等10个民族STR的遗传关系与他们的历史文化和地理分布基本一致。 展开更多

关键词 PCR—STR 毛南族 遗传距离 系统进化树

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一种面向矢量瓦片高效构建的空间索引方法 被引量：11

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作者 俞丽君 张丰 +1 位作者 刘仁义 杜震洪 《武汉大学学报（信息科学版）》 EI CSCD 北大核心 2020年第10期1633-1641,共9页

针对矢量瓦片在构建过程中对原始矢量数据源检索性能的不足,提出了一种基于改进网格与递归网格排序(sort-tile-recursive,STR)R-树的混合索引结构,用于提升对数据源的空间查询效率。该混合索引通过瓦片金字塔上下文信息改进了一级网格... 针对矢量瓦片在构建过程中对原始矢量数据源检索性能的不足,提出了一种基于改进网格与递归网格排序(sort-tile-recursive,STR)R-树的混合索引结构,用于提升对数据源的空间查询效率。该混合索引通过瓦片金字塔上下文信息改进了一级网格索引的查询方式,减少了查询过程中的空间比较。同时,使用STR R-树作为二级索引,有效减轻了因矢量数据空间分布不均衡所带来的影响,实现了二级查询优化。实验表明,对比数据库常用空间索引(如网格索引、四叉树索引、R-树/R*树索引),该混合索引对不同空间分布的矢量数据适应良好,能显著提高对矢量数据源的查询性能,加速瓦片的构建。 展开更多

关键词 矢量瓦片 空间查询 网格索引 STR R-树索引

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赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多样性及系统进化分析

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作者 张建 白雪 +5 位作者 张译文 张成 王郗 莫晓婷 叶健 李生斌 《激光生物学报》 CAS 2021年第5期413-421,共9页

研究赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多态性以及与国内多个民族群体的遗传关系,探讨其在群体遗传学和法医学中的实际应用价值。采用DNATyperTM Y29试剂盒对1532例赣南地区健康男性无关个体进行Y-STR基因座扩增,3730型遗传分析仪... 研究赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多态性以及与国内多个民族群体的遗传关系,探讨其在群体遗传学和法医学中的实际应用价值。采用DNATyperTM Y29试剂盒对1532例赣南地区健康男性无关个体进行Y-STR基因座扩增,3730型遗传分析仪进行毛细管电泳检测,运用GeneMapper IDX1.4软件对数据结果进行Y-STR分型,计算29个Y-STR基因座的等位基因频率及单倍型频率等遗传学参数。应用Mega-X软件对选取的群体构建进化树,用YHRD在线工具软件的分子方差分析(AMOVA),计算群体间遗传距离,同时构建多维尺度图(MDS)。经分析,29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中的基因多样性(GD)值范围为0.3815~0.8766,除了DYS508、DYS437、DYS391和DYS438基因座外,其余25个基因座GD值均高于0.5,且单倍型多样性为0.999924,表明29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中有较高的遗传多态性。与其他地区汉族人群比较,赣南汉族与福建汉族遗传距离最近(遗传距离Rst值是0.0002),与黑龙江汉族遗传距离最远(Rst值是0.0249);与其他地区少数民族人群比较,赣南汉族与云南白族遗传距离最近(Rst值是0.0059),与甘孜藏族遗传距离最远(Rst值是0.4689)。研究表明,这29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中具有较好的遗传多态性分布,能够满足家系排查及法医学检案的要求,所得的数据可为该地区的群体遗传学和法医学研究与应用提供基础数据支持。 展开更多

关键词 Y-STR基因座 遗传多样性 系统进化 赣南地区 赣南地区汉族人群

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基于极端随机树的闪电河流域土壤水分反演 被引量：15

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作者 程渊 李玉霞 +1 位作者 李凡 何磊 《遥感学报》 EI CSCD 北大核心 2021年第4期941-951,共11页

土壤水分在地表动植物生存、大气—地表间的能量和物质循环中承担着重要的角色,对水循环、气候变化、农业监测、生态环境、地质灾害等应用指标的大面积监测具有重要意义。但由于土壤类型、土壤结构条件、地形特征、植被环境以及人类活... 土壤水分在地表动植物生存、大气—地表间的能量和物质循环中承担着重要的角色,对水循环、气候变化、农业监测、生态环境、地质灾害等应用指标的大面积监测具有重要意义。但由于土壤类型、土壤结构条件、地形特征、植被环境以及人类活动等因素的影响,土壤含水量的分布存在空间异质性特点,对较大区域(例如流域尺度)的土壤水分分布进行监测仍然十分困难。本文以闪电河流域为例,利用中分辨率成像光谱仪(MODIS)反射率数据反演得到植被指数,并以相关植被指数VIs(Vegetation Indices)、地表温度LST(Land Surface Temperature)数据为输入参数,实测土壤水分数据为期望输出参数,发展了一种基于极端随机树的土壤水分反演方法。考虑到地表温度的不易测量性以及对区域土壤湿度监测的需求,本文使用短波红外转换反射率STR(Shortwave Infrared Transformed Reflectance)代替LST建立极端随机树模型,反演了覆盖闪电河流域的2°×2°区域的土壤湿度图。实验结果表明:(1)输入参数使用LST时,基于极端随机树的土壤湿度反演模型表现较好,其均方根误差为0.054 m^(3)m^(-3),相关系数为0.69,预测精度优于其他模型(支持向量机、随机森林);(2)输入参数使用STR时,预测结果的均方根误差为0.060 m^(3)m^(-3),相关系数为0.66,使用STR代替LST进行大面积土壤湿度预测具有可行性,土壤水分的空间分布与实际情况基本一致,能够满足一般的应用需求。 展开更多

关键词 土壤含水量 闪电河流域 极端随机树 MODIS 短波红外转换反射率(STR)

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新疆维吾尔族人群16个X-STR基因座的遗传多态性 被引量：1

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作者 袁春艳 夏若成 +8 位作者 张素华 陈丽琴 王亚丽 屈轶龄 杨光远 董新宇 柴思雨 李成涛 陶瑞旸 《法医学杂志》 CAS CSCD 2022年第4期500-506,共7页

目的研究新疆维吾尔族人群16个X-STR基因座的遗传多态性和群体遗传学参数。方法应用Goldeneye®DNA身份鉴定系统17X对502例(女性251例,男性251例)新疆维吾尔族无关个体进行16个X-STR基因座的复合扩增,应用3130xl基因分析仪对扩增产... 目的研究新疆维吾尔族人群16个X-STR基因座的遗传多态性和群体遗传学参数。方法应用Goldeneye®DNA身份鉴定系统17X对502例(女性251例,男性251例)新疆维吾尔族无关个体进行16个X-STR基因座的复合扩增,应用3130xl基因分析仪对扩增产物进行检测,并统计等位基因频率及群体遗传学参数,计算维吾尔族与其他8个人群间的遗传距离,并根据遗传距离进行多维尺度分析以及系统发育树的构建。结果在502例新疆维吾尔族无关个体中,所检测的16个X-STR基因座共观察到67个等位基因,等位基因频率为0.0013~0.5724,PIC为0.5688~0.8553,女性CDP为0.999999999999999,男性CDP为0.999999999743071,三联体累积平均非父排除率为0.999999997791859,二联体累积平均非父排除率为0.999998989000730。维吾尔族人群与哈萨克族人群遗传距离较近,与汉族人群遗传距离较远。结论该16个X-STR基因座在维吾尔族人群中具有高度的多态性和较好的鉴别能力,可为该人群的法医学个体识别、亲权鉴定和群体遗传学研究提供有力的补充。 展开更多

关键词 法医遗传学 多态现象 遗传 X染色体 短串联重复序列 遗传距离 系统发育树 维吾尔族 新疆

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利用Y-STR单倍型推断样品间亲缘关系 被引量：1

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作者 李为哲 李钊 +2 位作者 党钦 王磊 曾昭书 《中国法医学杂志》 CSCD 2020年第3期305-308,共4页

目的通过对Y-STR单倍型的分析,推测不同样品间的亲缘关系远近。方法对郑州地区某单一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus试剂盒进行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析单倍型多态性;以Network软件构建各样品间关系网络;以SPSS软件构建各... 目的通过对Y-STR单倍型的分析,推测不同样品间的亲缘关系远近。方法对郑州地区某单一姓氏男性182人取外周血,以Yfiler Plus试剂盒进行Y-STR基因座分型;以Arlequin分析单倍型多态性;以Network软件构建各样品间关系网络;以SPSS软件构建各样品间远近关系树状结构。结果单倍型分析发现,182例样品中共存在164种单倍型;Network软件分析显示,大部分样品间的网络距离呈均匀分布,但少部分样品距离较近;SPSS软件聚类分析发现,164个单倍型呈现出多个层级,大部分在短期内就发生了第一次聚集,再往根部又发生7次较大的汇集,最终全部汇集到两个分支上。结论即使在同姓男子中,Yfiler Plus试剂盒所包含的Y-STR基因座仍然有较高的基因差异度;以Y-STR检测结果进行Network分析及进化树分析,有助于揭示群体内个体间近代亲缘关系和遗传层级关系。该思路有望在法医学法医个体识别、亲权鉴定及族群迁徙等研究中发挥作用。 展开更多

关键词 Y染色体 STR基因组 单倍型 近代亲缘关系 系统进化树

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提高空中交通管制GIS数据查询速度的方案研究

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作者 张觅 时宏伟 赵薇 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2010年第18期4105-4107,4111,共4页

为了提高现有空中交通管制(ATC)地理信息系统(GIS)数据查询的速度,提出了一种基于STR packed R树索引的空管GIS数据查询方案。该方案主要是利用建立STR packed R树索引来执行数据查询,取代现有系统遍历整个模型的方法。为进一步提高R树... 为了提高现有空中交通管制(ATC)地理信息系统(GIS)数据查询的速度,提出了一种基于STR packed R树索引的空管GIS数据查询方案。该方案主要是利用建立STR packed R树索引来执行数据查询,取代现有系统遍历整个模型的方法。为进一步提高R树索引的查询性能,采用图元细分和分层索引两种方式降低R树结点间的交叠面积,并且分析并选择了合适的R树结点分支因子。在空管GIS上的实验结果表明,该方案有效提高了数据查询的速度。 展开更多

关键词 空中交通管制 地理信息系统 STR packed R树 交叠面积 分支因子

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云南玉溪汉族15个STR基因座多态性及遗传关系分析

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作者 曾于宝 刘建兴 +3 位作者 李文富 王志 杨忠宝 许冰莹 《中国法医学杂志》 CSCD 2013年第1期52-55,共4页

目的调查玉溪汉族人群15个STR基因座的遗传多态性,并分析与国内部分地区汉族群体的遗传关系。方法采用AmpFLSTR Identifiler试剂盒,复合扩增15个STR基因座,计算基因频率及法医学参数;收集国内其他10个群体的遗传学资料进行遗传距离和聚... 目的调查玉溪汉族人群15个STR基因座的遗传多态性,并分析与国内部分地区汉族群体的遗传关系。方法采用AmpFLSTR Identifiler试剂盒,复合扩增15个STR基因座,计算基因频率及法医学参数;收集国内其他10个群体的遗传学资料进行遗传距离和聚类分析。结果玉溪汉族群体15个STR基因座等位基因及基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,PD值在0.790 6～0.968 1之间,PE值在0.315 9～0.733 5之间,PIC值在0.554 6～0.856 4之间,15个基因座累积个体识别力为0.999 999 999 999 999 99,累积非父排除率为0.999 998。不同地区汉族群体间遗传距离分析提示,玉溪汉族与成都汉族遗传距离最近(0.004 0),其次是河南(0.004 5)和潮汕(0.004 7);内蒙古最远(0.036 1)。结论云南玉溪汉族15个STR基因座具有较高的遗传多态性,适于该群体的法医学应用,遗传关系分析结果可为该群体的起源、迁徙及与其他群体的遗传关系分析提供参考。 展开更多

关键词 法医物证学 短串联重复序列 遗传多态性 遗传进化树 玉溪汉族

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中国22个人群3个Y-STR基因座的群体遗传学研究

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作者 刘义波 龙思方 +2 位作者 龙友国 陆玉炯 余跃生 《黔南民族医专学报》 2007年第4期193-196,共4页

目的:用Y-STR基因座的基因频率探讨中国22个人群的群体遗传关系。方法:收集中国22个人群DYS390、DYS391和DYS393基因座的基因频率资料,采用Phylip3.66统计软件包计算出Nei′s遗传距离,再用MEGA3.1输出系统发生树。结果:天津、安徽、浙... 目的:用Y-STR基因座的基因频率探讨中国22个人群的群体遗传关系。方法:收集中国22个人群DYS390、DYS391和DYS393基因座的基因频率资料,采用Phylip3.66统计软件包计算出Nei′s遗传距离,再用MEGA3.1输出系统发生树。结果:天津、安徽、浙江、福建、北京、云南、潮汕、湖南、成都汉族聚为Ⅰ簇;辽宁满族、新疆维吾尔族、陕西汉族、云南藏族、云南蒙古族、新疆柯尔克孜族和甘肃回族为Ⅱ簇;海南黎族和广西壮族、贵州水族和广州汉族为Ⅲ簇;云南普米族和纳西族为Ⅳ簇。结论:汉族人群间群体遗传关系较近,而少数民族群体间遗传关系较远。同时提示Y-STR基因座的基因频率分布与民族起源和地域有相关性。 展开更多

关键词 Y-STR 遗传距离 系统发育树 民族群体

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