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秦川牛及其利秦杂种牛IGFBP3基因PCR-SSCP多态性研究 被引量：2
1
作者 刘波 陈宏 +2 位作者 蓝贤勇 雷初朝 张争锋 《中国农学通报》 CSCD 2005年第9期10-11,共2页
以IGFBP3基因作为侯选基因,对秦川牛及其利秦杂种牛群体共计114头个体IGFBP3位点进行多样性分析。结果发现,秦川牛(Q)及其利秦牛(LQ)群体IGFBP3基因座的等位基因A/B频率分别为:0.6667/0.3333和0.6829/0.3171;从位点间杂合度(He)来看,LQ&... 以IGFBP3基因作为侯选基因,对秦川牛及其利秦杂种牛群体共计114头个体IGFBP3位点进行多样性分析。结果发现,秦川牛(Q)及其利秦牛(LQ)群体IGFBP3基因座的等位基因A/B频率分别为:0.6667/0.3333和0.6829/0.3171;从位点间杂合度(He)来看,LQ>QQ;位点间有效等位基因数(Ne):QQ>LQ位点间Shannon信息熵SQQ>LQ位点间多态信息含量PICQQ> 展开更多
关键词 秦川牛 利木赞牛 IGFBP3基因 PCR—sscp IGFBP3 侯选基因 杂种牛 多态性研究 sscp Shannon信息熵
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载脂蛋白E基因PCR-SSCP突变分析方法的建立
2
作者 何江 周常文 +4 位作者 张宇红 桂俊豪 仇东辉 徐江涛 宋永斌 《中国优生与遗传杂志》 2004年第5期27-28,共2页
目的　建立一种快速、简便、敏感检测载脂蛋白E(ApoE)基因突变的PCR -SSCP方法。方法　提取人全血基因组DNA ,采用聚合酶链式反应 (PCR)扩增ApoE基因目的片段 ,用甲酰胺变性液进行变性后行 8%聚丙烯酰胺凝胶电泳后 ,对凝胶进行银染 ,然... 目的　建立一种快速、简便、敏感检测载脂蛋白E(ApoE)基因突变的PCR -SSCP方法。方法　提取人全血基因组DNA ,采用聚合酶链式反应 (PCR)扩增ApoE基因目的片段 ,用甲酰胺变性液进行变性后行 8%聚丙烯酰胺凝胶电泳后 ,对凝胶进行银染 ,然后进行SSCP分析。结果　PCR -SSCP银染图谱显示对ApoE基因双链有很好的分离 ,可观察到对应于不同基因型的不同带型。结论　建立了一种灵敏。 展开更多
关键词 APOE基因 载脂蛋白E基因 PCR—sscp 突变分析 PCR-sscp 全血 银染 双链 PCR 带型
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浓香型大曲真核微生物群落的PCR-SSCP解析 被引量：22
3
作者 罗惠波 黄治国 +2 位作者 李浩 张强 沈才萍 《中国酿造》 CAS 北大核心 2009年第8期42-45,共4页
通过PCR-SSCP分析了浓香型大曲发酵过程中7个曲样中真核微生物群落的变化情况,结果表明:在大曲发酵过程中,微生物群落结构复杂,变化多样,不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应,并与外界因素相互作用,共同对大曲发酵过程产生影... 通过PCR-SSCP分析了浓香型大曲发酵过程中7个曲样中真核微生物群落的变化情况,结果表明:在大曲发酵过程中,微生物群落结构复杂,变化多样,不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应,并与外界因素相互作用,共同对大曲发酵过程产生影响。大曲发酵过程中温度的升高,对真核微生物多样性的影响较大。 展开更多
关键词 浓香型大曲 PCR—sscp 18S RDNA 微生物群落
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两种龟类Sox基因的PCR扩增及SSCP分析的研究 被引量：17
4
作者 聂刘旺 单祥年 +2 位作者 郭超文 汪鸣 鲁晓萱 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 1999年第4期378-381,共4页
采用ＰＣＲ技术，扩增了平胸龟、黄缘盒龟的Ｓｏｘ基因，扩增产物与人ｐＹ５３．３ＳＲＹ基因探针进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交，证实了扩增产物是人ＳＲＹ基因的同源片段；采用ＳＣＰ分析技术，显示龟类该基因片段的序列与人有较大差异... 采用ＰＣＲ技术，扩增了平胸龟、黄缘盒龟的Ｓｏｘ基因，扩增产物与人ｐＹ５３．３ＳＲＹ基因探针进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交，证实了扩增产物是人ＳＲＹ基因的同源片段；采用ＳＣＰ分析技术，显示龟类该基因片段的序列与人有较大差异，而龟类种间差异则较小，种内雌雄个体间则无差异．本文结果支持Ｓｏｘ基因在系统演化上十分保守的结论． 展开更多
关键词 SOX基因 龟类 PCR sscp
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民猪PRLR基因PCR-SSCP多态性与产仔数关联分析 被引量：14
5
作者 黄贺 狄生伟 +3 位作者 田亚光 王希彪 李和平 张贵学 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2341-2346,共6页
【目的】研究民猪促乳素受体基因PRLR的多态性与母猪产仔数的相关性。【方法】采用PCR-SSCP技术检测民猪PRLR基因多态性,最小二乘法分析其多态性对母猪产仔数影响的遗传效应。【结果】PRLR基因在民猪中存在多态性,B等位基因为优势等位基... 【目的】研究民猪促乳素受体基因PRLR的多态性与母猪产仔数的相关性。【方法】采用PCR-SSCP技术检测民猪PRLR基因多态性,最小二乘法分析其多态性对母猪产仔数影响的遗传效应。【结果】PRLR基因在民猪中存在多态性,B等位基因为优势等位基因;在PRLR-1座位,对于初产母猪,BB基因型母猪的TNB和NBA比AA基因型母猪分别多0.93头和0.78头(P<0.05);对于经产母猪,BB基因型母猪的TNB和NBA比AA基因型母猪分别多0.62头和0.74头(P<0.05)。在PRLR-2座位,对于初产和经产母猪,3种基因型个体的TNB之间和NBA之间差异不显著(P>0.05)。在民猪群中这两个座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态。【结论】PRLR基因B等位基因对民猪产仔数性状有显著影响。 展开更多
关键词 PRLR基因 多态性 繁殖性能 民猪 sscp
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基于ITS2条形码SNPs的人参和西洋参PCR-SSCP分子鉴别研究 被引量：21
6
作者 詹鑫婕 田程 +1 位作者 张媛 刘春生 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第24期3748-3751,共4页
目的:依据人参和西洋参ITS2条形码的专属性SNP鉴别位点,建立利用PCR-SSCP技术鉴别人参和西洋参的方法。方法:查找GenBank上已收录的人参和西洋参ITS2序列,进行比对分析,筛选人参和西洋参ITS2序列的专属性SNP鉴别位点,据此设计引物,采用... 目的:依据人参和西洋参ITS2条形码的专属性SNP鉴别位点,建立利用PCR-SSCP技术鉴别人参和西洋参的方法。方法:查找GenBank上已收录的人参和西洋参ITS2序列,进行比对分析,筛选人参和西洋参ITS2序列的专属性SNP鉴别位点,据此设计引物,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对11个人参样品和10个西洋参样品进行分析,对PCR产物进行测序验证。结果:人参和西洋参样品的PCR-SSCP谱带与各自的对照药材谱带一致,人参和西洋参的PCR-SSCP谱带有显著差异;PCR-SSCP鉴别结果和经测序鉴别结果一致。结论:和测序法相比,PCR-SSCP方法快速、准确,可用于人参和西洋参药材的鉴定。 展开更多
关键词 人参 西洋参 ITS序列 PCR—sscp
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猪食道口线虫ITS-1和ITS-2rDNA的PCR-SSCP分析 被引量：13
7
作者 林瑞庆 张新高 +4 位作者 胡友兰 李国清 翁亚彪 宋慧群 朱兴全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期323-326,331,共5页
以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,... 以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,另一种为未定种食道口线虫带型。代表性样品的测序结果表明,未定种食道口线虫带型的样品为四棘食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪四棘食道口线虫的ITS序列,并建立了区分有齿食道口线虫和四棘食道口线虫的PCR-SSCP方法,从而为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 食道口线虫 ITS-1 ITS-2 单链构象多态性(sscp) 猪
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采用通用引物PCR配合SSCP和RFLP技术检测鱼病病原菌 被引量：18
8
作者 彭宣宪 高华 +1 位作者 王三英 郑文竹 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期345-348,共4页
采用通用引物PCR(UPPCR)、PCR RFLP、PCR SSCP技术 ,研究快速鉴别鱼病病原菌的分子生物学诊断技术。结果发现 ,采用细菌 16SrRNA基因保守区特异性引物 ,以嗜水气单胞菌、鲁克氏耶尔森菌、鳗弧菌、柱状曲挠杆菌、乙型链球菌、荧光假单胞... 采用通用引物PCR(UPPCR)、PCR RFLP、PCR SSCP技术 ,研究快速鉴别鱼病病原菌的分子生物学诊断技术。结果发现 ,采用细菌 16SrRNA基因保守区特异性引物 ,以嗜水气单胞菌、鲁克氏耶尔森菌、鳗弧菌、柱状曲挠杆菌、乙型链球菌、荧光假单胞菌等部分常见鱼病病原菌为对象 ,可以建立一种UPPCR技术。该技术能在保证实验条件不变的基础上 ,检出上述所有细菌 ,并还可检出大肠杆菌和双歧杆菌等非鱼病病原菌。并且认为 ,该法与SSCP配合即采用UPPCR SSCP技术能较好地鉴别被检菌而用于鱼病病原菌的快速诊断。 展开更多
关键词 鱼病 病原菌 通用引物 PCR sscp RFLP检测
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五指山猪近交系群体中DRA和DRB基因的SSCP检测 被引量：16
9
作者 孙俊丽 牟玉莲 +2 位作者 顾茂松 刘小林 冯书堂 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2005年第8期1458-1461,共4页
为确定五指山猪(WZSP)近交系群体SLA!ⅡDRA、DRB基因的等位基因数及其特性,利用PCR扩增SLA!ⅡDRA、DRB基因的第2外显子序列,经单链构象多态性即SSCP检测其等位基因数,选择纯合子个体的PCR产物直接测序。对所获得的序列与Genbank中所有... 为确定五指山猪(WZSP)近交系群体SLA!ⅡDRA、DRB基因的等位基因数及其特性,利用PCR扩增SLA!ⅡDRA、DRB基因的第2外显子序列,经单链构象多态性即SSCP检测其等位基因数,选择纯合子个体的PCR产物直接测序。对所获得的序列与Genbank中所有相应的序列进行比对和聚类分析,特别是SLA!DRB!C、SLA!DRB!D、HLA!DRB*09012、HLA!DRB*1201、HLA!DRA*0101等位基因。结果表明:在WZSP近交系群体中,DRA、DRB各有2个等位基因且发现1个DRB新等位基因。DRA第2外显子有很强的保守性,而DRB基因呈现出高度的多态性,在核苷酸水平同源性为85%以上,氨基酸水平同源性为70%以上。该试验成功地检测了WZSP近交系SLA!DRA、DRB基因的等位基因及其特性,为建立WZSPSLA!DR基因抗原的分子分型及特异单倍型猪的培育研究奠定基础。 展开更多
关键词 五指山猪 SLA-Ⅱ DRA DRB sscp 新等位基因
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浓香型大曲原核微生物群落的PCR-SSCP解析 被引量：46
10
作者 罗惠波 黄治国 +2 位作者 李浩 张强 卫春会 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1363-1367,共5页
采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术对浓香型大曲发酵过程中原核微生物群落结构的变化情况进行了研究,结果表明:(1)发酵各时期曲样的群落结构相似,同时也具有多态性;(2)不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应;(3)各时期曲样微生... 采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术对浓香型大曲发酵过程中原核微生物群落结构的变化情况进行了研究,结果表明:(1)发酵各时期曲样的群落结构相似,同时也具有多态性;(2)不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应;(3)各时期曲样微生物多样性指数均在1.69～2.01之间,群落结构相对较稳定;(4)各曲样微生物群落相似性位于0.67～1.00之间,邻近时期样品间的相似性程度较高。 展开更多
关键词 大曲 PCR-sscp 16S RDNA 微生物群落
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绵羊线粒体DNA控制区5’端序列PCR-SSCP与序列分析 被引量：32
11
作者 赵兴波 储明星 +2 位作者 李宁 龚国春 吴常信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第3期225-228,共4页
通过绵羊线粒体ＤＮＡ控制区左功能域（５’端序列）ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和序列分析，发现小尾寒 羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与小尾寒羊杂交家系共２０２只绵羊 可归纳为两种类型：突变型和野生型，提示现代... 通过绵羊线粒体ＤＮＡ控制区左功能域（５’端序列）ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和序列分析，发现小尾寒 羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与小尾寒羊杂交家系共２０２只绵羊 可归纳为两种类型：突变型和野生型，提示现代绵羊品种在起源上存在两种主要的进化途径。 展开更多
关键词 绵羊 线粒体DNA PCR-sscp 序列分析
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五指山、二花脸和皮特兰猪的SLA-DRB基因外显子2PCR-RFLP及PCR-SSCP多态性分析 被引量：20
12
作者 谈永松 周波 王林云 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第2期163-169,共7页
采用PCR RFLP法和PCR SSCP法对 1 7头五指山猪、2 8头二花脸猪以及 2 8头皮特兰猪SLA DRB外显子 2进行分型。采用PCR RFLP技术分型 ,结果显示 :限制酶MspⅠ酶切可分出 1种RFLP带 ,即M :1 4 3bp/ 1 0 2bp ;限制酶RsaⅠ酶切可分出 4种RFLP... 采用PCR RFLP法和PCR SSCP法对 1 7头五指山猪、2 8头二花脸猪以及 2 8头皮特兰猪SLA DRB外显子 2进行分型。采用PCR RFLP技术分型 ,结果显示 :限制酶MspⅠ酶切可分出 1种RFLP带 ,即M :1 4 3bp/ 1 0 2bp ;限制酶RsaⅠ酶切可分出 4种RFLP带 ,分别为A :1 4 1bp/ 93bp/ 1 1bp ,B :1 1 1bp/ 6 9bp/ 5 4bp/ 1 1bp ,C :1 80bp/ 5 4bp/ 1 1bp以及D :93bp/ 4 8bp/ 39bp/ 5 4bp/ 1 1bp。检测发现 ,五指山猪有 2种RFLP带型 :AA和BB ,二花脸猪有 3种RFLP带型 :AA、BB和AB ,皮特兰猪有 3种RFLP带型 :AA、CC和BD。比较五指山猪、二花脸猪与皮特兰猪 ,发现 3个品种都是以A带为主 ,分别占到 0 6 9、0 73和 0 82 ,品种之间差别不显著。采用PCR SSCP技术共分出 7种标记带型 ,分别为αα、αδ、ββ、γγ、αγ、δδ、βε ,其中五指山猪有 3种带型 ,分别为αα、αδ和 ββ ,二花脸猪有 3种带型 ,分别为αα、γγ和αγ ,而皮特兰则出现 5种带型 ,分别为αα、δδ、αδ、βε和 ββ。在 3个品种猪中均存在α带 ,且其频率在各自品种中均最高 ,在五指山猪和皮特兰猪中δ带出现的频率次之 ,相应的在这两个猪种中杂合型αδ带型出现的频率则最高。Hardy Weinberg平衡分析表明 ,二花脸猪SLA DRB基因外显子 展开更多
关键词 五指山猪 二花脸猪 皮特兰猪 SLA—Ⅱ类基因 PCR—RFLP PCR—sscp
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小麦SSCP分子标记体系的优化 被引量：11
13
作者 余桂红 唐克轩 +4 位作者 马鸿翔 周淼平 张旭 任丽娟 陆维忠 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期333-338,共6页
SSCP技术易受上样缓冲液、变性的时间及温度、电泳条件等诸多因素的影响。本研究对上样缓冲液、变性的时间及温度、电泳条件等影响因素进行了研究,结果显示:上样缓冲液中不添加甘油、用量为PCR产物体积的1.5～3倍、变性温度98℃、变性时... SSCP技术易受上样缓冲液、变性的时间及温度、电泳条件等诸多因素的影响。本研究对上样缓冲液、变性的时间及温度、电泳条件等影响因素进行了研究,结果显示:上样缓冲液中不添加甘油、用量为PCR产物体积的1.5～3倍、变性温度98℃、变性时间10～15min、电泳缓冲液为0.5×TBE,常温下恒功率80W(2.67W/cm)电泳2 h左右,单链DNA条带清晰,易于识别。 展开更多
关键词 小麦 sscp 优化
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秦川牛和中国荷斯坦奶牛FSHβ基因SSCP多态性分析 被引量：13
14
作者 梁宏伟 昝林森 +2 位作者 孟彦 方平 田万强 《中国农学通报》 CSCD 2005年第5期81-83,共3页
利用SSCP分子标记对秦川牛和中国荷斯坦奶牛的FSHβ基因5’侧翼区进行了多态性分析。结果表明:在秦川牛中检测的FSHβ基因5’侧翼区有AA型、BB型和AB型三种基因型,在中国荷斯坦奶牛中只有AA型。秦川牛中AA基因型的频率为0.395,BB基因型... 利用SSCP分子标记对秦川牛和中国荷斯坦奶牛的FSHβ基因5’侧翼区进行了多态性分析。结果表明:在秦川牛中检测的FSHβ基因5’侧翼区有AA型、BB型和AB型三种基因型,在中国荷斯坦奶牛中只有AA型。秦川牛中AA基因型的频率为0.395,BB基因型的频率为0.026,AB基因型的频率为0.579,中国荷斯坦奶牛的AA型的频率为1。秦川牛中A的基因频率为0.6842,B的基因频率为0.3158,中国荷斯坦奶牛A的基因频率为1.0。秦川牛群体中多态信息含量为0.3389,多态性高,遗传变异大。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 FSHΒ基因 多态性分析 sscp 秦川牛 基因频率 多态信息含量 基因型 AA型 分子标记 遗传变异 AB型 BB型
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绵羊GnRHR基因部分序列PCR-SSCP分析 被引量：10
15
作者 刘忠慧 储明星 +2 位作者 陈国宏 方丽 叶素成 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期318-321,共4页
采用PCR-SSCP技术,用两对引物分析了GnRHR基因外显子2和外显子1部分序列在小尾寒羊、多赛特羊2个绵羊品种中的多态性。结果表明,对于引物1扩增片段,2个绵羊品种均只检测到AA基因型。对于引物2扩增片段,2个绵羊品种均检测到AA、AB基因型... 采用PCR-SSCP技术,用两对引物分析了GnRHR基因外显子2和外显子1部分序列在小尾寒羊、多赛特羊2个绵羊品种中的多态性。结果表明,对于引物1扩增片段,2个绵羊品种均只检测到AA基因型。对于引物2扩增片段,2个绵羊品种均检测到AA、AB基因型;小尾寒羊AA、AB基因型频率分别为0.83和0.17,多赛特羊AA、AB基因型频率分别为0.60和0.40。引物2的多态片段测序分析表明,位于GnRHR基因cDNA第230处发生了碱基的改变(G→C),该突变导致了氨基酸的改变(甘氨酸→半胱氨酸)。 展开更多
关键词 绵羊 促性腺激素释放激素受体基因 PCR—sscp
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奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区PCR-SSCP多态性分析 被引量：10
16
作者 李国华 张沅 +1 位作者 孙东晓 李宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期827-830,共4页
采用PCR SSCP技术 ,对奶牛乳铁蛋白基因 5′侧翼区 112 2bp序列进行多态性分析。在该区所划分的 5个亚片段上 ,发现Blf5′ 1(2 2 7bp) ,Blf 5′ 3(175bp)和Blf5′ 5 (2 93bp) 3个DNA片段存在多态。进一步对这 3个片段进行测序分析 ,在Bl... 采用PCR SSCP技术 ,对奶牛乳铁蛋白基因 5′侧翼区 112 2bp序列进行多态性分析。在该区所划分的 5个亚片段上 ,发现Blf5′ 1(2 2 7bp) ,Blf 5′ 3(175bp)和Blf5′ 5 (2 93bp) 3个DNA片段存在多态。进一步对这 3个片段进行测序分析 ,在Blf 5′ 1序列中 ,发现位于转录起始位点上游 - 92 6和 - 915位分别有G→A及T→G点突变 ;在Blf5′ 3片段中 ,- 4 78位存在G的插入 ;Blf 5′ 5位点上 ,发生 - 2 8位的C颠换为A和 +33位的G颠换为C两处突变。利用TFSEARCH (ver.1 3)软件对乳铁蛋白基因 5′侧翼区潜在调控元件及蛋白质结合位点进行了预测 ,结果显示 展开更多
关键词 乳铁蛋白基因 PCR—sscp 牛 调控因子
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鸡AMPD1基因PCR-SSCP分析与相关性状的研究 被引量：14
17
作者 罗桂芬 陈继兰 +3 位作者 孙世铎 文杰 赵桂萍 孙志杰 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2005年第4期8-10,共3页
5′-磷酸腺苷脱氨酶1(AMPD1)是嘌呤代谢中的一种重要酶类,它的功能是催化AMP(一磷酸腺苷)脱氨,生成肌苷酸(IMP),从而影响肉质风味。试验采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术,以隐性白羽肉鸡、白来航蛋鸡和两个地方品种(北京油鸡、三黄胡须... 5′-磷酸腺苷脱氨酶1(AMPD1)是嘌呤代谢中的一种重要酶类,它的功能是催化AMP(一磷酸腺苷)脱氨,生成肌苷酸(IMP),从而影响肉质风味。试验采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术,以隐性白羽肉鸡、白来航蛋鸡和两个地方品种(北京油鸡、三黄胡须鸡)纯系鸡为试验材料,对AMPD1基因进行SNPs检测和基因类型判别。卡方检验结果表明: 除三黄胡须鸡和隐性白羽肉鸡、北京油鸡和白来航鸡间差异不显著(P>0.05)外,其他各品种间差异极显著(P<0.01)。AMPD1基因多态性与北京油鸡生产和屠体性状(活重、胸肌率、肌苷酸含量等)相关分析结果表明:肌苷酸含量在三种基因型间差异显著(P<0.05)。初步推断AMPD1可能为影响鸡肉中肌苷酸生成的主效基因或与主效基因相连锁。 展开更多
关键词 AMPD1基因 PCR—sscp 肌苷酸 鸡 5’-磷酸腺苷脱氨酶1 肉质风味
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聚合酶链式反应偶联单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术用于鹿鞭线粒体DNA指纹的研究 被引量：11
18
作者 孙景昱 张丽华 +2 位作者 傅桂莲 李明成 刘洋 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期721-725,共5页
目的建立一种快速、简便、准确的分子生物学方法,用来鉴别鹿鞭真伪及品种。方法应用柱色谱法提取梅花鹿鞭、马鹿鞭、牛鞭以及市售鹿鞭线粒体DNA;根据GenBank中鹿类动物线粒体细胞色素b基因序列,设计一对引物用于线粒体DNA的聚合酶链式反... 目的建立一种快速、简便、准确的分子生物学方法,用来鉴别鹿鞭真伪及品种。方法应用柱色谱法提取梅花鹿鞭、马鹿鞭、牛鞭以及市售鹿鞭线粒体DNA;根据GenBank中鹿类动物线粒体细胞色素b基因序列,设计一对引物用于线粒体DNA的聚合酶链式反应(PCR)特异性扩增;应用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对聚合酶链式反应产物进行单链构象多态分析(single strand conformation polymorphism,SSCP)。结果梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭可显示清晰且迁移率不同的片段;对照组伪品鹿鞭及部分市售鹿鞭无特异性显示。结论柱色谱法提取线粒体DNA所需时间短,DNA纯度高,DNA分子的破坏性较小,为特异性聚合酶链式反应扩增提供一级结构保证;单链构象多态分析法可以清晰显示正品梅花鹿鞭、马鹿鞭以及部分市售鹿鞭单链片段,其一级结构中的碱基差别为正品梅花鹿鞭、马鹿鞭的不同迁移率提供依据,也为药源市场鹿鞭的鉴别提供一种可以直接进行亚种间鉴别的快速、简便、准确的可行性方法。 展开更多
关键词 鹿鞭 单链构象多态分析(sscp) 聚合酶链式反应(PCR) DNA
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赤霉病主效抗性QTL区域SSCP标记的发掘与验证 被引量：12
19
作者 杜军凯 余桂红 +1 位作者 王秀娥 马鸿翔 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期829-834,共6页
为开发简便、高效的小麦抗赤霉病辅助育种的DNA标记,将一个基于ABI DNA序列分析仪、与3BS上赤霉病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记转化为简便的SSCP(DNA单链构象多态性标记,SingleStrand Conformational Polymorphism marker)标记并进行... 为开发简便、高效的小麦抗赤霉病辅助育种的DNA标记,将一个基于ABI DNA序列分析仪、与3BS上赤霉病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记转化为简便的SSCP(DNA单链构象多态性标记,SingleStrand Conformational Polymorphism marker)标记并进行了验证。该SSCP标记可有效区分抗感品种之间的差异。对36个小麦品种进行了基因分型和赤霉病抗性鉴定,在5个已知有3BS抗性QTL的抗赤霉病品种和4个感病的品种中,抗性鉴定结果与标记的带型完全一致。在36个品种中,R带型表现为抗病的比率为100%;S带型表现为感病的比率为65.2%。表明该SSCP标记可应用于小麦抗赤霉病分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 小麦 赤霉病 sscp标记 辅助育种
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新疆细毛羊和陕北细毛羊羊毛细度候选基因的PCR-SSCP分析 被引量：14
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作者 姚毅 雷承志 +2 位作者 尹君亮 刘福元 陈玉林 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2006年第12期6-10,共5页
选取60只新疆细毛羊和48只陕北细毛羊,利用PCR-SSCP分子标记对其羊毛细度候选基因的5个位点(S1,S2,S3,S4,S5)进行了多态性分析。结果表明,2个绵羊品种在5个位点上A等位基因的频率均高于B等位基因。在S1,S5位点上,新疆细毛羊和陕北细毛... 选取60只新疆细毛羊和48只陕北细毛羊,利用PCR-SSCP分子标记对其羊毛细度候选基因的5个位点(S1,S2,S3,S4,S5)进行了多态性分析。结果表明,2个绵羊品种在5个位点上A等位基因的频率均高于B等位基因。在S1,S5位点上,新疆细毛羊和陕北细毛羊均检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S2位点上,新疆细毛羊检测到AA,BB,CC,DD 4种基因型,陕北细毛羊检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S3位点上,新疆细毛羊检测到AA,AB 2种基因型,陕北细毛羊检测到AA,AB,BB 3种基因型;在S4位点上,新疆细毛羊和陕北细毛羊均检测到AA,BB 2种基因型。新疆细毛羊和陕北细毛羊的平均杂合度分别为0.445 0和0.399 7。新疆细毛羊P IC平均值为0.366 6,S1,S3,S4和S5位点均处于中度多态,而S2(P IC=0.555 1)处于高度多态;陕北细毛羊P IC平均值为0.318 9,5个位点均处于中度多态。以上结果表明,S1,S2,S3,S4和S55个位点可以作为有效的遗传标记用于优质细毛羊的遗传多样性分析,2个绵羊品种群体内的遗传变异程度高,遗传多样性丰富,选择潜力大。 展开更多
关键词 细毛羊 羊毛细度 PCR—sscp
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