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题名亚氨基酸编码方法及其应用
被引量：1
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作者
吴艳
仇建邺
朱平
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机构
江南大学理学院
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出处
《生物数学学报》
2013年第4期725-737,共13页
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基金
国家自然基金(11271163)资助
中央高校基本科研业务费专项资金(JUSRP21117)资助
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文摘
赋予氨基酸编码方法下除终止子之外的密码子突变为终止子时每一位发生的变化权值,利用矩阵来表示所有的突变方式和难易程度,综合亲水性与疏水性理化性质,提出亚氨基酸编码方法,并给出该编码方法下同义密码子的相对使用度(Subtypes Relative Synonymous Codon Usage,SRSCU).然后选取15条H5N1序列,使用MEGA4.0分析它们的同源性,并分别在氨基酸编码、拟氨基酸编码、亚氨基酸编码这三种环境下研究所选序列使用密码子的偏好性,对比结果验证,亚氨基酸编码方法具有相应的优越性.
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关键词
氨基酸编码
偏好性
srscu
RSCU
QRSCU
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Keywords
Amino acids coding
Bias
srscu
RSCU
QRSCU
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分类号
Q517
[生物学—生物化学]
R73
[医药卫生—肿瘤]
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