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烟草SRS基因家族鉴定与非生物胁迫诱导表达分析
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作者 杨亚仑 邓智超 +4 位作者 董若男 潘晓璐 吴荣荣 刘涛 高晓明 《中国烟草科学》 北大核心 2025年第2期83-92,112,共11页
短节间相关序列(SHI-related sequence,SRS)基因家族编码一类植物特有的锌指蛋白转录因子,在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中发挥重要作用。为探究烟草SRS基因家族功能,本研究从烟草基因组数据库中鉴定了18个NtSRS基因,命名为NtSRS1~N... 短节间相关序列(SHI-related sequence,SRS)基因家族编码一类植物特有的锌指蛋白转录因子,在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中发挥重要作用。为探究烟草SRS基因家族功能,本研究从烟草基因组数据库中鉴定了18个NtSRS基因,命名为NtSRS1~NtSRS18。利用生物信息学方法,分析了该家族基因的蛋白质特征、亚细胞定位、系统进化关系、基因结构、启动子结构及其组织表达模式和对干旱、盐、低温胁迫的响应模式。结果表明:NtSRS蛋白都含有DUF702保守结构域,大部分NtSRS蛋白定位于细胞核上。NtSRS基因家族聚类为5个亚家族,且同一亚家族成员的基因和蛋白质结构均具有较高的保守性;启动子结构分析表明,NtSRS基因家族成员的启动子区存在大量激素和逆境响应元件。NtSRS基因在不同组织器官中的表达量存在较大差异,大多数基因主要在花芽和茎中表达。NtSRS3和NtSRS16基因对干旱、盐和低温胁迫都有响应。本研究为烟草SRS基因家族的生物学功能研究奠定了基础,为烟草种质资源改良提供了理论依据。 展开更多
关键词 烟草 srS基因家族 非生物胁迫 表达模式分析
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黄土的连续提取实验及Rb/Sr值意义 被引量:21
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作者 刘连文 陈骏 +1 位作者 陈旸 季峻峰 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期65-70,共6页
通过连续提取实验 ,将黄土和古土壤中元素的赋存状态分成六种形态 :水可溶态、可交换态、碳酸盐结合态、铁锰氧化物结合态、有机物结合态和残留态。结果表明 ,K和Rb等元素 ,主要赋存于残留态中 ,而Ca、Sr等元素主要赋存于碳酸盐结合态... 通过连续提取实验 ,将黄土和古土壤中元素的赋存状态分成六种形态 :水可溶态、可交换态、碳酸盐结合态、铁锰氧化物结合态、有机物结合态和残留态。结果表明 ,K和Rb等元素 ,主要赋存于残留态中 ,而Ca、Sr等元素主要赋存于碳酸盐结合态和残留态中。Sr在黄土和古土壤中的赋存状态明显与Ca的分布有关。在风化成壤作用中 ,碳酸盐的淋溶和含Ca硅酸盐矿物的分解 ,引起Sr的淋失 ,而Rb保持稳定。因此 ,Rb Sr值指示了黄土和古土壤遭受的淋溶程度 ,反映了黄土高原的降雨量 。 展开更多
关键词 连续提取 黄土 古土壤 Rb/sr 赋存状态
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青少年特发性脊柱侧凸严重程度和弯型与SRS-22问卷评分的相关性分析 被引量:8
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作者 伍伟飞 朱泽章 +5 位作者 邱勇 刘臻 钱邦平 孙旭 杨宗 闫煌 《中国脊柱脊髓杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期909-913,共5页
目的:探讨青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)不同弯型及不同Cobb角与SRS-22问卷各维度评分的相关性。方法:对2010年6月~2011年7月在我科就诊且填写SRS-22简体中文版问卷的272例未经任何治疗的女性AIS患... 目的:探讨青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)不同弯型及不同Cobb角与SRS-22问卷各维度评分的相关性。方法:对2010年6月~2011年7月在我科就诊且填写SRS-22简体中文版问卷的272例未经任何治疗的女性AIS患者进行回顾性分析。根据冠状面Cobb角将所有患者分为小Cobb角(20°~39°)和大Cobb角(40°~75°)两组,并根据弯型特征将每组患者分为单胸弯、单胸腰弯/腰弯、双胸弯、胸腰双弯四个亚组。对同一Cobb角组内不同弯型亚组间和不同Cobb角组间同一弯型患者的SRS-22问卷各维度评分差异均采用Kruskal-Wallis检验。结果:小Cobb角组单胸弯和单胸腰弯/腰弯患者的功能活动、自我形象、精神健康评分明显高于大Cobb角组的患者(P〈0.05),双胸弯患者的功能活动评分和总分均显著优于大Cobb角组的患者(P〈0.05)。在小Cobb角组中,单胸弯患者的功能活动评分显著高于单胸腰弯/腰弯和胸腰双弯患者(P〈0.05);自我形象评分双胸弯患者明显低于单胸弯患者和单胸腰弯/腰弯患者(P〈0.05)。在大Cobb角组中,胸腰双弯患者的疼痛评分明显低于单胸弯患者(P〈0.05);自我形象评分双胸弯患者明显低于其他三种弯型患者(P〈0.05)。结论:在轻中度女性AIS中,Cobb角大小及弯型特征对患者的SRS-22问卷评分会造成一定程度的影响, 其中双胸弯对患者的自我形象评分的影响尤为明显。 展开更多
关键词 青少年特发性脊柱侧凸 srS-22问卷 弯型 侧凸严重度
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玉米苗期SR蛋白基因家族的干旱胁迫应答 被引量:2
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作者 李娇 郭予琦 +2 位作者 崔伟玲 许爱华 田曾元 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期697-706,共10页
基因表达的选择性剪接(Alternative splicing,AS)调控与植物对逆境胁迫应答密切相关,SR蛋白(Serine/arginine-rich proteins)是其中关键的调节因子。文章对玉米B73参考基因组进行分析显示:多数SR蛋白家族基因成员启动子区域含有3~8种... 基因表达的选择性剪接(Alternative splicing,AS)调控与植物对逆境胁迫应答密切相关,SR蛋白(Serine/arginine-rich proteins)是其中关键的调节因子。文章对玉米B73参考基因组进行分析显示:多数SR蛋白家族基因成员启动子区域含有3~8种与发育或胁迫相关的顺式调控元件;27个基因成员编码碱性蛋白,其中23个成员的编码蛋白依照其N′端的首个RRM(RNA recognition motif)结构域特征大体上可划分为5个亚组。利用双向分级聚类方法,对三叶期干旱胁迫下玉米杂交种郑单958及其亲本郑58和昌7-2的SR蛋白基因家族的分析显示,该基因家族的表达模式具有明显的组织表达特异性和基因型依赖性特征;其中在干旱胁迫下地下组织以下调表达模式为主,而地上组织中以上调表达模式为主。在重度干旱胁迫后的3个不同时段复水过程中,地上和地下组织中SR蛋白基因家族的表达皆以下调表达模式为主。另外,尽管不同基因成员的表达模式在干旱胁迫及其后的复水过程中存在明显差异,但普遍存在自身选择性剪接现象。SR蛋白基因家族在玉米干旱胁迫的应答规律,为从AS-network视角解析玉米的抗逆分子机制提供了新思路。 展开更多
关键词 玉米干旱胁迫 sr蛋白基因 表达模式 选择性剪接
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白山堂铜矿床两期有关岩体的Rb-Sr等时线年龄及其稀土配分特征 被引量:12
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作者 王伏泉 《矿物岩石地球化学通报》 CAS CSCD 1996年第3期187-190,共4页
白山堂铜矿床两期有关岩体的Rb-Sr等时线年龄及其稀土配分特征王伏泉(中国科学院长沙大地构造研究所,长沙410013)关键词铷-锶年龄,白山堂铜矿床,稀土配分甘肃省金塔县白山堂1矿带已探明为中型铜矿床并交付开采。但对... 白山堂铜矿床两期有关岩体的Rb-Sr等时线年龄及其稀土配分特征王伏泉(中国科学院长沙大地构造研究所,长沙410013)关键词铷-锶年龄,白山堂铜矿床,稀土配分甘肃省金塔县白山堂1矿带已探明为中型铜矿床并交付开采。但对其成因、找矿方向和扩大远景等问题,... 展开更多
关键词 铷-锶年龄 白山堂铜矿床 稀土配分
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猪SR-BⅠ基因的克隆及其组织差异表达规律研究
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作者 堵斌 孙超 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第4期7-12,共6页
【目的】扩增猪各组织清道夫受体B族Ⅰ型(SR-BⅠ)基因片段,并对其进行生物信息学分析,研究SR-BⅠ在猪中的表达规律。【方法】采取不同月龄和不同猪种猪的内脏脂肪、皮下脂肪、肝脏、脾脏、肌肉、肾脏、肺脏、心脏等组织,提取其RNA,根据G... 【目的】扩增猪各组织清道夫受体B族Ⅰ型(SR-BⅠ)基因片段,并对其进行生物信息学分析,研究SR-BⅠ在猪中的表达规律。【方法】采取不同月龄和不同猪种猪的内脏脂肪、皮下脂肪、肝脏、脾脏、肌肉、肾脏、肺脏、心脏等组织,提取其RNA,根据GenBank已发表的人、小鼠及大鼠SR-BⅠ基因序列,设计并合成1对引物,用RT-PCR法扩增猪SR-BⅠ基因cDNA片段,检测该基因在猪各组织中的分布及其在不同月龄、不同部位、不同猪种脂肪组织中的转录表达规律。【结果】成功克隆了猪SR-BⅠcDNA片段,长度为192 bp(EU366320);该基因与牛、人、中国仓鼠、大鼠、小鼠在氨基酸序列上分别有84.1%,78.6%,77.5%,67.0%和66.6%的同源性;SR-BⅠ基因mRNA在瘦肉型猪种上的表达量显著高于脂肪型猪种,随月龄的增加其表达量逐渐上升,且其在皮下脂肪的表达量较内脏脂肪高。【结论】SR-BⅠmRNA的表达与猪肥胖程度、年龄以及脂肪沉积部位密切相关。 展开更多
关键词 sr-BⅠ 脂肪组织 表达规律
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棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析 被引量:2
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作者 张雪 孙瑞斌 +4 位作者 马聪聪 马丹 张晓睿 刘志红 刘传亮 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2022年第2期107-119,共13页
【目的】短链相关序列(SHI-related sequence,SRS)家族是一类植物特有的转录因子,在调节植物生长发育和逆境胁迫反应中发挥重要作用。鉴定和分析棉花SRS基因家族成员。【方法】结合拟南芥相关信息,以陆地棉和海岛棉为主要研究对象,对棉... 【目的】短链相关序列(SHI-related sequence,SRS)家族是一类植物特有的转录因子,在调节植物生长发育和逆境胁迫反应中发挥重要作用。鉴定和分析棉花SRS基因家族成员。【方法】结合拟南芥相关信息,以陆地棉和海岛棉为主要研究对象,对棉花SRS基因进行全基因组鉴定和系统进化研究,并分析其在不同器官、不同发育时期的胚珠和纤维、以及在非生物胁迫下棉苗中的表达模式。【结果】在陆地棉和海岛棉中分别鉴定出27个和26个SRS基因,系统进化分析将棉花SRS基因家族成员划分为3个分支,不同分支都具有相似的保守基序。每个分支都存在多对同源基因。一些SRS基因在胚珠发育时期表达量较高,并响应多种非生物胁迫。【结论】分析预测了棉花SRS基因的家族成员进化关系与潜在功能,为棉花SRS基因的功能研究提供初步的理论基础。 展开更多
关键词 棉花 srS 系统进化 表达模式 基因家族
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辽宁西部中生代火山岩的基本特征 被引量:34
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作者 郭洪中 张招崇 《岩石矿物学杂志》 CAS CSCD 1992年第3期195-204,共10页
辽西中生代火山岩主要分布于燕辽台褶带,由兴隆沟、兰旗和义县旋回构成。火山岩的岩石化学特征为SiO_2平均60.2%、富Na_2O、介于钙碱性和弱碱性系列之间。稀土总量低,铕的负异常弱,Isr在0.70546—0.70653之间。其特征与源区基底太古代... 辽西中生代火山岩主要分布于燕辽台褶带,由兴隆沟、兰旗和义县旋回构成。火山岩的岩石化学特征为SiO_2平均60.2%、富Na_2O、介于钙碱性和弱碱性系列之间。稀土总量低,铕的负异常弱,Isr在0.70546—0.70653之间。其特征与源区基底太古代建平群变质岩十分相似,反映了它们之间的成因联系。将太古代建平群变质岩和亏损地幔作为端员组分,由G.Faure二元混合模拟公式求得辽西中生代火山岩由65.8%—82.1%的源区物质——建平群变质岩和34.2%—7.9%的亏损地幔混合组成,表明辽西中生代火山岩主要是由源区物质——晚太古代建平群变质岩经部分熔融后形成的,成因上属于典型的不成熟地壳重熔类型。 展开更多
关键词 火山岩 基本特征 中生代 辽宁
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山东碳酸岩磷灰石的特征及其研究意义 被引量:9
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作者 储同庆 《矿物岩石》 CAS CSCD 1992年第3期5-12,共8页
鲁中隆起的北缘分布着100多个燕山期的碳酸岩体。本文详细研究了岩体中磷灰石的一些重要特征,包括晶体形态、物理性质、光学常数、晶胞参数、化学成分、包裹体及钕锶同位素组成等。并据所得资料对岩体的成因,成岩物质来源等问题进行探讨。
关键词 磷灰石 碳酸岩 同位素
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“丝绸之路”型与东亚—太平洋型遥相关的低频特征及其对江淮流域夏季降水的影响 被引量:1
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作者 郭紫薇 王黎娟 刘丹玲 《地球科学与环境学报》 CAS 北大核心 2023年第6期1341-1354,共14页
江淮流域夏季洪涝灾害主要归因于大气环流异常的稳定维持。不同大气遥相关的低频振荡及其协同变化对江淮流域夏季降水的影响机理是大气科学领域热点问题之一。利用ERA5逐日再分析资料和中国气象局提供的逐日站点降水资料,揭示了“丝绸... 江淮流域夏季洪涝灾害主要归因于大气环流异常的稳定维持。不同大气遥相关的低频振荡及其协同变化对江淮流域夏季降水的影响机理是大气科学领域热点问题之一。利用ERA5逐日再分析资料和中国气象局提供的逐日站点降水资料,揭示了“丝绸之路”(SR)型和东亚—太平洋(EAP)型遥相关的低频特征及其对江淮流域夏季降水的影响机理。结果表明:SR型和EAP型遥相关的10~30 d低频周期与江淮流域夏季降水关系密切,SR型和EAP型遥相关各低频系统都经历了正负位相转换并逐渐达到峰值(谷值)。其主要表现为:①10~30 d低频200 hPa等压面经向风沿西风急流呈偏北风与偏南风的交替分布,当SR型达到负位相峰值时,江淮流域为偏北风控制,中纬度低频气旋加强,加速西风急流;②10~30 d低频西太平洋副热带高压西伸东退、南亚高压东移西撤,二者相向而行,在峰值位相重叠于对江淮流域降水有利的位置;③由东亚沿岸向西北移动的向外长波辐射异常波列亦表现出显著的10~30 d低频振荡特征,处于峰值位相时,向外长波辐射在江淮流域为负异常,有利于江淮流域降水;④10~30 d低频低层正涡度、高层负涡度的配置有利于低层辐合、高层辐散,导致上升运动增强,进而触发江淮流域低频降水。 展开更多
关键词 大气遥相关 夏季降水 低频滤波 “丝绸之路”型 东亚—太平洋型 西太平洋副热带高压 江淮流域
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一种适用于大规模特征集的快速匹配算法 被引量:1
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作者 李雪 薛一波 王春露 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第34期168-170,212,共4页
提出了一种适用于大规模特征集的快速匹配算法——SRS算法,该算法性能优异,在特征集达到100000条时,匹配速度比经典算法快10倍以上。该算法适用于内容过滤、防病毒、反垃圾邮件、短信过滤、网络入侵检测和防御等众多领域。
关键词 字符串匹配 大规模特征匹配 srS算法
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江西广丰杨村超大型滑石矿床成因探讨 被引量:7
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作者 雷焕玲 蒋少涌 +3 位作者 孙岩 罗平 李艳红 马振兴 《矿床地质》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期241-254,共14页
江西广丰杨村滑石矿储量达上亿吨,是世界上超大型滑石矿床之一。矿石主要由鲕粒状滑石组成,含少量石英和碳酸盐矿物及浸染状有机质,具有典型的沉积鲕粒状结构;赋矿围岩白云岩硅化较强烈。研究结果表明,白云岩与滑石矿页岩标准化稀土元... 江西广丰杨村滑石矿储量达上亿吨,是世界上超大型滑石矿床之一。矿石主要由鲕粒状滑石组成,含少量石英和碳酸盐矿物及浸染状有机质,具有典型的沉积鲕粒状结构;赋矿围岩白云岩硅化较强烈。研究结果表明,白云岩与滑石矿页岩标准化稀土元素分配模式基本一致,重稀土元素相对轻稀土元素弱富集,稀土元素总量低,弱负铈异常,并且它们具有相同的87Sr/86Sr比值(0.7092~0.7101),白云岩的δ13CV-PDB值变化范围在-4.9‰^+0.7‰之间,与同期海水大体一致。这些地球化学特征暗示了滑石矿和白云岩具有相同的物质来源,滑石成矿所需的镁可能来源于海水。部分样品显示正铕异常,且白云岩中δ18OV-SMOW值(+14.5‰^+19.7‰)较同期海水偏低,87Sr/86Sr比值比同期海水稍高,暗示成矿物质并非由海水单一提供,可能还有高87Sr/86Sr比值、富硅的热液提供了成矿所需的硅。综合滑石和白云岩岩相学和地球化学特征,认为江西广丰杨村滑石矿为同生热水沉积成因,滑石中镁来源于富镁海水,硅来源于海水下渗淋滤古老硅铝质地层形成的富硅、高87Sr/86Sr比值的热液,海水中镁与热液中硅结合形成滑石。滑石矿在经历了同生沉积-热液期之后,又受到了后期强烈的变质变形作用的叠加,形成了具片理构造的滑石片岩。 展开更多
关键词 地质学 鲕粒滑石 稀土元素配分模式 C-O-sr同位素 同生热水沉积 江西杨村
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青海湖裸鲤耳石轮纹O-Sr同位素组成及对其洄游行为的指示 被引量:5
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作者 周玲 金章东 +1 位作者 WILLIAMS Ian S 张飞 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第6期668-675,共8页
以溯河洄游为特征的青海湖裸鲤是青海湖鱼类的优势种,但其洄游行为还知之甚少.利用高分辨率SHRIMPⅡ离子探针和激光剥蚀高分辨多接收电感耦合等离子体质谱仪(LA-MC-ICP-MS)分别测定了青海湖裸鲤微耳石轮纹中的氧和锶(O-Sr)同位素组成.... 以溯河洄游为特征的青海湖裸鲤是青海湖鱼类的优势种,但其洄游行为还知之甚少.利用高分辨率SHRIMPⅡ离子探针和激光剥蚀高分辨多接收电感耦合等离子体质谱仪(LA-MC-ICP-MS)分别测定了青海湖裸鲤微耳石轮纹中的氧和锶(O-Sr)同位素组成.结果表明,微耳石成长带中较低的δ^(18)O记录了青海湖裸鲤春夏时期所洄游的河水化学信息;将δ^(18)O与^(87)Sr/^(86)Sr同位素组成相结合,微耳石轮纹的同位素组成明确指示了多数个体可能更倾向于固定的河流洄游产卵.这一结果对于认识青海湖裸鲤的洄游习性以及鱼类保护和管理有重要的意义. 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 微耳石 轮纹 稳定同位素 洄游习性
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A prototype scalable readout system for micro-pattern gas detectors
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作者 郑其斌 刘树彬 +3 位作者 田静 李诚 封常青 安琪 《Chinese Physics C》 SCIE CAS CSCD 2016年第8期96-102,共7页
A scalable readout system (SRS) is designed to provide a general solution for different micro-pattern gas detectors in various applications. The system mainly consists of three kinds of modules: the ASIC card, the ... A scalable readout system (SRS) is designed to provide a general solution for different micro-pattern gas detectors in various applications. The system mainly consists of three kinds of modules: the ASIC card, the adapter card and the front-end card (FEC). The ASIC cards, mounted with particular ASIC chips, are designed for receiving detector signals. The adapter card is in charge of digitizing the output signals from several ASIC cards. The FEC, edged-mounted with the adapter, has field-programmable gate array (FPGA)-based reconfigurable logic and I/O interfaces, allowing users to choose different ASIC cards and adapters for different experiments, which expands the system to various applications. The FEC transfers data through Gigabit Ethernet protocol realized by a TCP processor (SiTCP) IP core in FPGA. By assembling a flexible number of FECs in parallel through Gigabit Ethernet, the readout system can be tailored to specific sizes to adapt to the experiment scales and readout requirements. In this paper, two kinds of multi-channel ASIC chip, VA140 and AGET, are applied to verify the scalability of this SRS architecture. Based on this VA140 or AGET SRS, one FEC covers 8 ASIC (VA140) cards handling 512 detector channels, or 4 ASIC (AGET) cards handling 256 detector channels, respectively. More FECs can be assembled in crates to handle thousands of detector channels. 展开更多
关键词 scalable readout system srS) micro-pattern gas detectors (MPGD) charge measurement front-endelectronics VA140 AGET
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