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人SNW1基因的克隆、表达及其调控IFN-β表达的初步研究
1
作者
张聪
万伦
吕桂阳
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期491-495,共5页
目的克隆人SNW1基因并构建其真核表达载体,验证SNW1基因的表达和细胞定位,探索SNW1基因对IFN-β转录的调控作用。方法以来自293T细胞的c DNA为模板PCR扩增人SNW1基因并克隆至真核表达载体p CMV-N-Flag上,对重组质粒进行酶切鉴定和测序;...
目的克隆人SNW1基因并构建其真核表达载体,验证SNW1基因的表达和细胞定位,探索SNW1基因对IFN-β转录的调控作用。方法以来自293T细胞的c DNA为模板PCR扩增人SNW1基因并克隆至真核表达载体p CMV-N-Flag上,对重组质粒进行酶切鉴定和测序;通过瞬时转染和免疫印迹验证SNW1在细胞中的表达;通过免疫荧光确定SNW1在细胞内的定位;利用IFNB启动子荧光素酶双报告系统和仙台病毒(Se V)初步检测SNW1对IFN-β转录的调控作用。结果 PCR扩增出约1.6 kb的条带,大小与预期相符;酶切结果表明SNW1成功克隆至PCMV-N-Flag,进一步测序验证SNW1序列正确;Flag-SNW1蛋白大小约Mr70 000,主要定位于细胞核中;在Se V感染条件下过量表达SNW1可以显著增强IFN-β的表达,而过量表达的SNW1对IFN-β的本底表达有一定的抑制作用。结论成功克隆并构建了SNW1真核表达载体,初步显示SNW1对IFN-β的转录具有较强的调控作用。
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关键词
snw1
克隆
表达
转录调控
IFN-Β
原文传递
含SNW结构域蛋白1在肝细胞癌中的临床意义及生物学功能研究
2
作者
张丹
邵阳
+3 位作者
李琳琳
陈凯
郭攀
张皓
《临床肿瘤学杂志》
2024年第12期1217-1224,共8页
目的 旨在通过生物信息学手段鉴定含SNW结构域蛋白1(SNW1)在肝细胞癌中的潜在生物标记物价值,并结合细胞实验探索SNW1对肝细胞癌细胞增殖和迁移侵袭能力的影响。方法 通过孟德尔随机化结合生物统计方法鉴定与肝细胞癌具有因果关系的特...
目的 旨在通过生物信息学手段鉴定含SNW结构域蛋白1(SNW1)在肝细胞癌中的潜在生物标记物价值,并结合细胞实验探索SNW1对肝细胞癌细胞增殖和迁移侵袭能力的影响。方法 通过孟德尔随机化结合生物统计方法鉴定与肝细胞癌具有因果关系的特征基因,采用转录组差异表达和生存分析探索特征基因在肝细胞癌中的表达情况及与预后不良的相关性,确定SNW1可作为潜在生物标记物的潜能并进行基因集富集和免疫细胞浸润的相关性分析。使用实时荧光定量聚合酶链反应检测人肝细胞癌细胞HepG2和Hep3B中SNW1的表达水平。通过转染敲低肝细胞癌细胞中SNW1的表达后,采用细胞计数试剂盒-8、细胞划痕和Transwell实验检测肝细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结果 SNW1是肝细胞癌的风险基因,在肝细胞癌患者中显著高表达且与患者预后显著相关(P<0.05)。与SNW1显著正相关的通路主要涉及RNA剪接、病毒性癌变与Epstein-Barr病毒感染等生物学过程。SNW1与静止树突细胞和嗜酸性粒细胞呈显著正相关,与调节T细胞和激活自然杀伤细胞呈显著负相关。细胞实验表明敲低SNW1能抑制肝细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结论 SNW1有潜力成为新的肝细胞癌生物标记物与治疗靶点。
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关键词
肝细胞癌
含SNW结构域蛋白1
孟德尔随机化
临床意义
暂未订购
题名
人SNW1基因的克隆、表达及其调控IFN-β表达的初步研究
1
作者
张聪
万伦
吕桂阳
机构
湖北省疾病预防控制中心
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期491-495,共5页
文摘
目的克隆人SNW1基因并构建其真核表达载体,验证SNW1基因的表达和细胞定位,探索SNW1基因对IFN-β转录的调控作用。方法以来自293T细胞的c DNA为模板PCR扩增人SNW1基因并克隆至真核表达载体p CMV-N-Flag上,对重组质粒进行酶切鉴定和测序;通过瞬时转染和免疫印迹验证SNW1在细胞中的表达;通过免疫荧光确定SNW1在细胞内的定位;利用IFNB启动子荧光素酶双报告系统和仙台病毒(Se V)初步检测SNW1对IFN-β转录的调控作用。结果 PCR扩增出约1.6 kb的条带,大小与预期相符;酶切结果表明SNW1成功克隆至PCMV-N-Flag,进一步测序验证SNW1序列正确;Flag-SNW1蛋白大小约Mr70 000,主要定位于细胞核中;在Se V感染条件下过量表达SNW1可以显著增强IFN-β的表达,而过量表达的SNW1对IFN-β的本底表达有一定的抑制作用。结论成功克隆并构建了SNW1真核表达载体,初步显示SNW1对IFN-β的转录具有较强的调控作用。
关键词
snw1
克隆
表达
转录调控
IFN-Β
Keywords
snw1
Clone
Expression
Transcription regulation
IFN-β
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
原文传递
题名
含SNW结构域蛋白1在肝细胞癌中的临床意义及生物学功能研究
2
作者
张丹
邵阳
李琳琳
陈凯
郭攀
张皓
机构
内江市第二人民医院检验科
出处
《临床肿瘤学杂志》
2024年第12期1217-1224,共8页
基金
内江市第二人民医院院级科研课题(KY2024QN004)。
文摘
目的 旨在通过生物信息学手段鉴定含SNW结构域蛋白1(SNW1)在肝细胞癌中的潜在生物标记物价值,并结合细胞实验探索SNW1对肝细胞癌细胞增殖和迁移侵袭能力的影响。方法 通过孟德尔随机化结合生物统计方法鉴定与肝细胞癌具有因果关系的特征基因,采用转录组差异表达和生存分析探索特征基因在肝细胞癌中的表达情况及与预后不良的相关性,确定SNW1可作为潜在生物标记物的潜能并进行基因集富集和免疫细胞浸润的相关性分析。使用实时荧光定量聚合酶链反应检测人肝细胞癌细胞HepG2和Hep3B中SNW1的表达水平。通过转染敲低肝细胞癌细胞中SNW1的表达后,采用细胞计数试剂盒-8、细胞划痕和Transwell实验检测肝细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结果 SNW1是肝细胞癌的风险基因,在肝细胞癌患者中显著高表达且与患者预后显著相关(P<0.05)。与SNW1显著正相关的通路主要涉及RNA剪接、病毒性癌变与Epstein-Barr病毒感染等生物学过程。SNW1与静止树突细胞和嗜酸性粒细胞呈显著正相关,与调节T细胞和激活自然杀伤细胞呈显著负相关。细胞实验表明敲低SNW1能抑制肝细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。结论 SNW1有潜力成为新的肝细胞癌生物标记物与治疗靶点。
关键词
肝细胞癌
含SNW结构域蛋白1
孟德尔随机化
临床意义
Keywords
Hepatocellular carcinoma
SNW domain containing 1
Mendelian randomization
Clinical significance
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人SNW1基因的克隆、表达及其调控IFN-β表达的初步研究
张聪
万伦
吕桂阳
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
原文传递
2
含SNW结构域蛋白1在肝细胞癌中的临床意义及生物学功能研究
张丹
邵阳
李琳琳
陈凯
郭攀
张皓
《临床肿瘤学杂志》
2024
0
暂未订购
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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