目的为开发黄芩特异性分子标记,进行遗传多样性分析和分子标记辅助育种。方法对黄芩花和根转录组中的单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失多态性标记(insertion and deletion,InDel)进行分析。结果在18...目的为开发黄芩特异性分子标记,进行遗传多样性分析和分子标记辅助育种。方法对黄芩花和根转录组中的单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失多态性标记(insertion and deletion,InDel)进行分析。结果在18个黄芩花和根转录组中发现平均每个样品含有216067个SNP位点,转换与颠换比值为1.42~1.61,且分布在外显子区的位点最多,发生错义突变的位点数量最多。InDel位点数平均每个样品包含22864个,插入型位点数大于缺失型,在基因内分布最多,发生移码插入的位点最多。结论黄芩花和根转录组中具备丰富的SNP和InDel位点,并且具有较高的多态性。该研究为后续黄芩开展特异性分子标记开发提供数据支持。展开更多
文摘目的为开发黄芩特异性分子标记,进行遗传多样性分析和分子标记辅助育种。方法对黄芩花和根转录组中的单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入缺失多态性标记(insertion and deletion,InDel)进行分析。结果在18个黄芩花和根转录组中发现平均每个样品含有216067个SNP位点,转换与颠换比值为1.42~1.61,且分布在外显子区的位点最多,发生错义突变的位点数量最多。InDel位点数平均每个样品包含22864个,插入型位点数大于缺失型,在基因内分布最多,发生移码插入的位点最多。结论黄芩花和根转录组中具备丰富的SNP和InDel位点,并且具有较高的多态性。该研究为后续黄芩开展特异性分子标记开发提供数据支持。
