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半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)克隆及其组织分布和时序表达分析
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作者 吴茵茵 温思怡 +1 位作者 韩卓然 孙敬锋 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期231-238,共8页
为了分析半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)的分子生物学特征、组织分布特点以及感染海藻希瓦氏菌后的时序表达规律,通过RT-PCR、生物信息学网站、qRT-PCR技术对半滑舌鳎SNAP29基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明,... 为了分析半滑舌鳎突触体相关蛋白29基因(SNAP29)的分子生物学特征、组织分布特点以及感染海藻希瓦氏菌后的时序表达规律,通过RT-PCR、生物信息学网站、qRT-PCR技术对半滑舌鳎SNAP29基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明,半滑舌鳎SNAP29基因CDS区长度为789 bp,编码262个氨基酸,理论等电点(pI)为5.39,分子质量为29.71781 ku,有2个典型的SNARE结构域;二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成,二级结构和三级结构基本一致;多序列比对结果显示,半滑舌鳎与欧洲鲈鱼SNAP29基因相似性最高;SNAP29基因在健康半滑舌鳎所测的各组织中均有表达,在鳃组织中表达最高,在脑组织中表达量最低;利用海藻希瓦氏菌人工感染半滑舌鳎后,SNAP29基因在肠道组织、心脏组织和脑组织中表达量主要呈现上调趋势,在肝脏、头肾、脾脏组织中主要呈现下调表达,SNAP29基因在健康半滑舌鳎组织中均有表达;海藻希瓦氏菌感染半滑舌鳎的肠道、脑、心脏、肝脏、头肾、脾脏组织中SNAP29基因呈现差异表达。综上,SNAP29可能参与机体免疫应答过程或病理生理过程。 展开更多
关键词 半滑舌鳎 snap29 基因克隆 QRT-PCR 海藻希瓦氏菌
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SNAP29调节胃癌细胞顺铂耐药性的研究 被引量:2
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作者 张佳佳 喻鑫 +1 位作者 周波 刘弋 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2020年第8期1189-1193,共5页
目的检测SNAP29对胃癌细胞顺铂耐药性的影响,比较SNAP29在胃癌组织和正常胃组织中的表达差异,分析胃癌患者中SNAP29的病理学意义。方法Western blot实验检测细胞SNAP29蛋白表达,MTT实验和细胞软琼脂克隆形成实验分别检测细胞活力和细胞... 目的检测SNAP29对胃癌细胞顺铂耐药性的影响,比较SNAP29在胃癌组织和正常胃组织中的表达差异,分析胃癌患者中SNAP29的病理学意义。方法Western blot实验检测细胞SNAP29蛋白表达,MTT实验和细胞软琼脂克隆形成实验分别检测细胞活力和细胞克隆形成能力,评价SNAP29过表达对胃癌细胞顺铂敏感性的影响;免疫组织化学实验检测胃癌组织和正常胃组织中SNAP29蛋白表达,分析SNAP29蛋白表达与胃癌患者病理学参数的相关性。结果MTT实验和细胞软琼脂克隆形成实验表明SNAP29过表达促进胃癌细胞MKN-45和AGS对顺铂的耐受;SNAP29在胃癌组织和正常胃组织中的蛋白表达水平无显著差异;胃癌组织中SNAP29的表达水平与患者的淋巴结转移和肿瘤分期有相关性,而与患者的年龄、性别、肿瘤大小和肿瘤分级无相关性。结论SNAP29过表达促进胃癌细胞对顺铂的耐受,SNAP29阳性表达与胃癌患者淋巴结转移和肿瘤分期具有相关性,SNAP29检测在胃癌的诊断和治疗中具有一定意义。 展开更多
关键词 胃癌 snap29 顺铂 耐药
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LncRNA-GAS5对鲍曼不动杆菌降解HeLa细胞中SNAP29的调控作用
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作者 丁文一 安志远 《微生物与感染》 CAS 2022年第4期220-226,共7页
本文旨在构建LncRNA-GAS5(长链非编码RNA-生长抑制特异性转录本5,long non-coding RNAgrowth arrest-specific transcript 5)的真核过表达载体及敲减载体,研究鲍曼不动杆菌对突触体相关蛋白29(synaptosomal-associated protein 29,SNAP... 本文旨在构建LncRNA-GAS5(长链非编码RNA-生长抑制特异性转录本5,long non-coding RNAgrowth arrest-specific transcript 5)的真核过表达载体及敲减载体,研究鲍曼不动杆菌对突触体相关蛋白29(synaptosomal-associated protein 29,SNAP29)表达的影响及LncRNA-GAS5在其中发挥的调控作用。采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增LncRNA-GAS5基因,将其克隆至pcDNA3.1(+)真核表达载体中,形成pcDNA3.1-GAS5真核表达载体;通过RNA干扰技术,设计敲减GAS5的寡核苷酸序列,将其构建至pRNAT-U6.1/Neo载体中,形成pRNAT-U6.1-GAS5敲减载体;采用实时荧光定量PCR法检测GAS5的表达,以确定是否成功过表达和敲减;采用蛋白免疫印迹法检测过表达或敲减GAS5后HeLa细胞中SNAP29表达的变化,并检测鲍曼不动杆菌感染HeLa细胞后不同时间点SNAP29的表达,以及敲减或过表达GAS5后再感染鲍曼不动杆菌的HeLa细胞中SNAP29的表达。结果显示:pcDNA3.1-GAS5和pRNAT-U6.1-GAS5构建成功;pcDNA3.1-GAS5可使LncRNA-GAS5在HeLa细胞中大量表达,而pRNAT-U6.1-GAS5可使HeLa细胞中GAS5表达明显减少;过表达LncRNA-GAS5可使HeLa细胞中SNAP29表达减少,而敲减LncRNA-GAS5可使SNAP29表达增加;随着鲍曼不动杆菌感染时间延长,HeLa细胞中SNAP29的表达减少,敲减LncRNA-GAS5可使SNAP29表达回复,而过表达LncRNA-GAS5可增强SNAP29的降解。结果提示,本研究成功构建了LncRNA-GAS5的过表达和敲减载体,并发现其对SNAP29表达具有负向调控作用,表明鲍曼不动杆菌对SNAP29的降解依赖LncRNA-GAS5,为进一步探讨鲍曼不动杆菌引起细胞自噬降解障碍的深层机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 LncRNA-GAS5 snap29 HELA细胞
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Tumor Necrosis Factor a Reduces SNAP29 Dependent Autolysosome Formation to Increase Prion Protein Level and Promote Tumor Cell Migration
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作者 Huan Li Ren Wang +9 位作者 Ze Yu Run Shi Jie Zhang Shanshan Gao Ming Shao Shuzhong Cui Zhenxing Gao Jiang Xu Man-Sun Sy Chaoyang Li 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2021年第3期458-475,共18页
Tumor Necrosis Factor α(TNFα) is best known as a mediator of inflammation and immunity, and also plays important roles in tumor biology. However, the role of TNFα in tumor biology is complex and not completely unde... Tumor Necrosis Factor α(TNFα) is best known as a mediator of inflammation and immunity, and also plays important roles in tumor biology. However, the role of TNFα in tumor biology is complex and not completely understood. In a human melanoma cell line, M2, and a lung carcinoma cell line, A549, TNFα up-regulates prion protein(PrP) level, and promotes tumor cell migration in a PrP dependent manner. Silencing PRNP abrogates TNFα induced tumor cell migration;this phenotype is reversed when PRNP is re-introduced. Treatment with TNFα activates nuclear factor kappa B(NF-κB)signaling, which then mitigates autophagy by reducing the expression of Forkhead Box P3(FOXP3). Down regulation of FOXP3 reduces the transcription of synaptosome associated protein 29(SNAP29), which is essential in the fusion of autophagosome and lysosome creating autolysosome. FOXP3 being a bona fide transcription factor for SNAP29 is confirmed in a promoter binding assay. Accordingly, silencing SNAP29 in these cell lines also up-regulates PrP, and promotes tumor cell migration without TNFα treatment. But, when SNAP29 or FOXP3 is silenced in these cells, they are no longer respond to TNFα. Thus, a reduction in autophagy is the underlying mechanism by which expression of PrP is up-regulated,and tumor cell migration is enhanced upon TNFα treatment. Disrupting the TNFα-NF-κB-FOXP3-SNAP29 signaling axis may provide a therapeutic approach to mitigate tumor cell migration. 展开更多
关键词 Tumor necrosis factorα(TNFα) Prion protein Synaptosome associated protein 29(snap29) Autophagy Nuclear factor kappa B(NF-κB) Forkhead box P3(FOXP3)
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SNAP29基因新变异致CEDNIK综合征临床表型与基因型特征分析
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作者 李玛丽 邱世超 +1 位作者 高飞飞 汪治华 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期699-705,共7页
目的探讨1例CEDNIK综合征患儿的临床表型及遗传学特征,提高临床医生对该病的认识。方法收集2020年6月就诊于西安市儿童医院内分泌遗传代谢科的1例CEDNIK综合征患儿的临床资料,应用全外显子组测序分析患儿的致病基因,确定可疑变异位点后... 目的探讨1例CEDNIK综合征患儿的临床表型及遗传学特征,提高临床医生对该病的认识。方法收集2020年6月就诊于西安市儿童医院内分泌遗传代谢科的1例CEDNIK综合征患儿的临床资料,应用全外显子组测序分析患儿的致病基因,确定可疑变异位点后对家系成员行Sanger测序验证,分析其临床表型及基因突变特点。结合已报道的CEDNIK综合征病例进行文献复习。结果患儿男性,1岁4个月,临床表现为精神运动发育落后、小头畸形、喂养困难、重度营养不良、反复呼吸道感染、双眼内斜视、感音神经性耳聋、皮肤鱼鳞病及角化病、左侧隐睾。头颅磁共振成像提示先天发育异常。全外显子组测序发现患儿SNAP29基因存在c.383dupT(p.E129Rfs*5)纯合变异,Sanger测序证实其父母均携带上述杂合变异,符合常染色体隐性遗传规律,根据美国医学遗传学与基因组学学会指南评级为致病性变异。文献检索发现目前共报道了29例CEDNIK综合征患者,包含8种SNAP29基因突变类型,目前尚无中国病例报道。本例患儿携带的c.383dupT(p.E129Rfs*5)变异为未报道的新变异。结论本例患儿的临床表型符合CEDNIK综合征,SNAP29基因c.383dupT(p.E129Rfs*5)新变异是该患儿的遗传学病因。 展开更多
关键词 CEDNIK综合征 snap29基因 精神运动发育落后 基因变异
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SNAP25蛋白亚家族在细胞自噬中的作用 被引量:2
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作者 姚建作 吴远博 +8 位作者 赵钢军 周王鑫 葛震 方绅哲 沈一鸣 姚晓敏 吴静怡 贾姝 李宏 《生命的化学》 CAS 2021年第8期1796-1802,共7页
细胞自噬是将细胞内受损、变性、衰老的蛋白质或细胞器清除的过程,是细胞本身的代谢需要,也是某些细胞器的更新。自噬过程涉及膜融合。可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感的融合蛋白附着蛋白受体(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor at... 细胞自噬是将细胞内受损、变性、衰老的蛋白质或细胞器清除的过程,是细胞本身的代谢需要,也是某些细胞器的更新。自噬过程涉及膜融合。可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感的融合蛋白附着蛋白受体(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor,SNARE)之间相互作用形成SNARE复合体参与膜融合。突触样相关蛋白25(synaptosomal-associated protein of 25 kDa,SNAP25)亚家族成员包括SNAP25、SNAP23、SNAP47和SNAP29,可与其他SNARE相互作用形成SNARE复合体从而参与自噬。本文着重对SNAP25亚家族中各成员如何参与自噬,以及在自噬中所起的作用进行综述,进而为SNAP25亚家族作为疾病治疗的新靶点提供策略。 展开更多
关键词 SNAP25 SNAP23 SNAP47 snap29 细胞自噬
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GPNMB disrupts SNARE complex assembly to maintain bacterial proliferation within macrophages 被引量:1
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作者 Zhenzhen Yan Jinghong Han +6 位作者 Zihao Mi Zhenzhen Wang Yixuan Fu Chuan Wang Ningning Dang Hong Liu Furen Zhang 《Cellular & Molecular Immunology》 2025年第5期512-526,共15页
Xenophagy plays a crucial role in restraining the growth of intracellular bacteria in macrophages.However,the machinery governing autophagosome‒lysosome fusion during bacterial infection remains incompletely understoo... Xenophagy plays a crucial role in restraining the growth of intracellular bacteria in macrophages.However,the machinery governing autophagosome‒lysosome fusion during bacterial infection remains incompletely understood.Here,we utilize leprosy,an ideal model for exploring the interactions between host defense mechanisms and bacterial infection.We highlight the glycoprotein nonmetastatic melanoma protein B(GPNMB),which is highly expressed in macrophages from lepromatous leprosy(L-Lep)patients and interferes with xenophagy during bacterial infection.Upon infection,GPNMB interacts with autophagosomal-localized STX17,leading to a reduced N-glycosylation level at N296 of GPNMB.This modification promotes the degradation of SNAP29,thus preventing the assembly of the STX17-SNAP29-VAMP8 SNARE complex.Consequently,the fusion of autophagosomes with lysosomes is disrupted,resulting in inhibited cellular autophagic flux.In addition to Mycobacterium leprae,GPNMB deficiency impairs the proliferation of various intracellular bacteria in human macrophages,suggesting a universal role of GPNMB in intracellular bacterial infection.Furthermore,compared with their counterparts,Gpnmb^(fl/fl) Lyz2-Cre mice presented decreased Mycobacterium marinum amplification.Overall,our study reveals a previously unrecognized role of GPNMB in host antibacterial defense and provides insights into its regulatory mechanism in SNARE complex assembly. 展开更多
关键词 Intracellular bacterial infection LEPROSY Xenophagy SNARE complex GPNMB snap29
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泌尿生殖系统畸形的遗传学分析 被引量:3
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作者 张静淑 傅煜 +4 位作者 赵艳辉 李斐 钱爱丽 吴斌 李岭 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期134-138,共5页
目的 系统分析22q11.2区基因在胚肾中的表达规律,并在患者中筛查候选基因的潜在突变。方法 用逆转录-聚合酶链反应测定33个人类基因的同源体在不同胚龄以及成年小鼠肾脏中的表达水平,选取其中具有特异性表达者,在44例泌尿生殖系统... 目的 系统分析22q11.2区基因在胚肾中的表达规律,并在患者中筛查候选基因的潜在突变。方法 用逆转录-聚合酶链反应测定33个人类基因的同源体在不同胚龄以及成年小鼠肾脏中的表达水平,选取其中具有特异性表达者,在44例泌尿生殖系统畸形以及220名正常对照中进行突变筛查或排除,并对疑似突变者进行测序验证。为了减少误差,基因表达检测以及测序验证均重复两次。结果 Kmeans聚类分析提示,9个基因在胚肾发育全程均无表达;18个基因自发育初期或稍晚开始持续表达、强度仅呈微弱波动;6个基因在胚肾发育中呈短暂的一过性表达。结合文献研究,从后者中选择SNAP29基因进行全编码区突变筛查。聚合酶链反应-单链构象多态性及测序分析提示,在上述病例中,1例(隐睾)具有SNAP29基因第2外显子内的错义突变(GAG→AAG),2例(分别为隐睾和尿道下裂)在第3外显子中存在错义突变(AGC→GGC),对照组则未见相同突变。结论 初步阐明了22q11.2区基因在小鼠胚肾发育期的表达规律,并证实多名泌尿生殖系统畸形患者具有候选基因SNAP29的错义突变,提示后者可能在泌尿生殖系统的发育中扮演关键角色。 展开更多
关键词 snap29基因 泌尿生殖系统畸形 胚胎发育 突变
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