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基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型 被引量:1
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作者 黄润棋 强光亮 +1 位作者 刘益飞 史加海 《中国胸心血管外科临床杂志》 北大核心 2025年第1期67-72,共6页
目的 探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法 回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)标本。... 目的 探讨基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型的准确性。方法 回顾性分析2021年1月—2023年1月在南通大学附属医院接受肺部肿瘤切除手术患者的石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)标本。根据肿瘤的病理学分类,将患者分为3组:良性肿瘤/原位腺癌(benign tumor/adenocarcinoma in situ,BT/AIS)组、微浸润腺癌(minimally invasive adenocarcinoma,MIA)组和浸润性腺癌(invasive adenocarcinoma,IA)组。使用LungMe试剂盒通过甲基化特异性PCR(MS-PCR)测量FFPE标本的SHOX2和RASSF1A甲基化水平。以SHOX2和RASSF1A的甲基化水平为预测变量,采用机器学习算法(包括逻辑回归、XGBoost、随机森林、朴素贝叶斯)预测不同的肺腺癌病理类型,并构建网络服务器供临床使用。结果 共纳入272例患者,BT/AIS组、MIA组和IA组患者的平均年龄分别为57.97岁、61.31岁和63.84岁;女性患者占比分别为55.38%、61.11%和61.36%。基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平建立的早期肺腺癌预测模型中,随机森林与XGBoost模型在预测各病理类型时表现良好。随机森林模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.71、0.72和0.78。XGBoost模型的C统计量在BT/AIS组、MIA组和IA组分别为0.70、0.75和0.77。朴素贝叶斯模型仅在IA组表现较为稳健,C统计量为0.73,具有一定的预测能力。逻辑回归模型在各组中的表现最差,对各组均无预测能力。通过决策曲线分析,随机森林模型在BT/AIS和MIA病理类型的预测中展示了较高的净收益,表明其在临床应用中具有潜在价值。结论 基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的机器学习算法预测早期肺腺癌病理类型具有较高的准确性。 展开更多
关键词 肺腺癌 shox2 RASSF1A 甲基化 侵袭性
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肺小结节中医易患体质与SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化的相关性研究 被引量:1
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作者 曹仁爽 王彬 +2 位作者 来薛 李珊 高峰 《中国中医药信息杂志》 2025年第8期146-152,共7页
目的探讨肺小结节患者的中医易患体质与SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化水平阳性风险相关的影响因素。方法采用横断面研究方法,纳入2024年5-12月中国中医科学院望京医院呼吸科165例肺小结节患者,对患者的一般病史、结节影像报告、肺癌... 目的探讨肺小结节患者的中医易患体质与SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化水平阳性风险相关的影响因素。方法采用横断面研究方法,纳入2024年5-12月中国中医科学院望京医院呼吸科165例肺小结节患者,对患者的一般病史、结节影像报告、肺癌基因甲基化水平和中医体质判定等临床资料进行整理和统计。在单因素相关分析探讨各变量与肺癌基因甲基化阳性风险相关性基础上,采用二元Logistic回归模型进行独立危险因素分析。结果单因素相关性分析显示,年龄、性别、中医易患体质分数、肺小结节直径、右肺上叶与SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化阳性相关(P=0.03、P=0.02、P=0.01、P<0.01、P=0.03);二元Logistic回归分析显示,阳虚质、气虚质、气郁质和痰湿质4种肺小结节易患体质评分与SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化阳性风险呈显著正相关,相较阳虚质,痰湿质和气郁质肺小结节患者基因甲基化阳性风险更高(P=0.04、P=0.02)。结论高龄、男性及中医易患体质与肺癌基因甲基化阳性风险具有相关性,其中痰湿质和气郁质是独立危险因素。 展开更多
关键词 肺小结节 shox2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化水平 中医易患体质 独立危险因素分析 前瞻性横断面研究
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良性肺部疾病患者SHOX2和RASSF1A基因甲基化的意义
3
作者 张亚靖 李昱立 +4 位作者 邱丽 郑可 张桂萍 廖殿英 唐源 《西部医学》 2025年第1期10-14,共5页
目的分析良性肺部疾病患者石蜡样本中SHOX2和RASSF1A甲基化状态并探讨其临床意义。方法研究选取了本院2018—2019年确诊为良性肺部疾病的44例患者存档样本,其中包括31例石蜡组织样本和13例细胞块样本。通过实时荧光PCR检测SHOX2和RASSF1... 目的分析良性肺部疾病患者石蜡样本中SHOX2和RASSF1A甲基化状态并探讨其临床意义。方法研究选取了本院2018—2019年确诊为良性肺部疾病的44例患者存档样本,其中包括31例石蜡组织样本和13例细胞块样本。通过实时荧光PCR检测SHOX2和RASSF1A基因的甲基化情况,并对阳性结果进行电话随访,随访时间为3年,随访终点为临床确诊肺癌。结果所选样本中SHOX2甲基化阳性率(29.27%)显著高于RASSF1A甲基化阳性率(4.88%),差异具有统计学意义(P<0.05)。组织样本中SHOX2甲基化阳性率(32.26%)显著高于RASSF1A甲基化阳性率(3.23%),差异具有统计学意义(P<0.05)。比较组织样本与细胞块样本中甲基化阳性率,发现前者甲基化阳性率(35.48%)略高于后者(20.00%)。组织样本中未出现两基因同时阳性结果,细胞块样本中则有1例为两基因同时阳性。SHOX2和RASSF1A甲基化结果与病理类型差异均无统计学意义(P>0.05)。对11例甲基化阳性患者进行电话随访,其中1例患者后经临床确诊为肺癌。结论在良性肺部疾病患者中有SHOX2和RASSF1A甲基化阳性的情况存在,且随访后发现有患者发展成肺癌。因此良性肺部疾病患者DNA甲基化检测结果为阳性时,结合临床特征,需进行随访,有利于对可能存在的肿瘤进展早发现、早治疗。 展开更多
关键词 甲基化 shox2 RASSF1 良性肺部疾病 肺癌
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肺部结节或肿块患者肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化在肺癌诊断中的价值 被引量:3
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作者 朱东平 李海峰 +2 位作者 冯俊飞 汤秋恒 冷静 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第3期106-111,共6页
目的通过肺组织活检或手术后病检结果来验证两基因甲基化指标检验肺部良、恶性结节诊断效能。方法进行前瞻性研究,收集2019年3月至2020年3月在云南省第三人民医院99例诊断为肺部结节、肿块的患者,行支气管镜检查收集支气管肺泡灌洗液(BA... 目的通过肺组织活检或手术后病检结果来验证两基因甲基化指标检验肺部良、恶性结节诊断效能。方法进行前瞻性研究,收集2019年3月至2020年3月在云南省第三人民医院99例诊断为肺部结节、肿块的患者,行支气管镜检查收集支气管肺泡灌洗液(BALF)样本后,进行定期随访、肺穿刺活检、手术后病检。结果收集的99例肺部结节、肿块患者,经病理诊断后分为肺癌组(n=50)和良性肺疾病组(n=49)。肺癌组年龄(62.64±9.71)岁,良性肺疾病组年龄(60.48±13.69)岁,2组指标差异具有统计学意义(P=0.032);在肺癌的诊断过程中,发现SHOX2和RASSF1A基因任一阳性诊断肺癌的灵敏度分别为72%和58%,特异度分别为92.3%和95.9%。而这2个基因的联合检测在肺癌的诊断中表现出了更高的灵敏度,为0.84,远高于良性疾病组的0.102(P<0.001)。ROC曲线分析显示2个基因甲基化联合时灵敏度可提高至84%。结论肺泡灌洗液SHOX2和RASS1A基因甲基化检验对存在肺部结节或肿块影像表现的肺癌患者诊断具有良好的预测价值,在影像学和组织学诊断不明时,SHOX2和RASSF1A联合检验可以作为肺癌早期诊断的一个重要补充工具。 展开更多
关键词 DNA甲基化 shox2 RASSF1A 肺泡灌洗液
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电子支气管镜联合SHOX2和RASSF1A甲基化检测对早期肺癌的诊断价值
5
作者 林亚聪 崔清云 《吉林医学》 CAS 2024年第7期1591-1593,共3页
目的:浅析早期肺癌采取电子支气管镜联合SHOX2和RASSF1A甲基化检测的临床效果,以便为日后临床制定检测方案提供参考。方法:抽取2022年11月~2023年4月茂名市人民医院28例早期肺癌患者行电子支气管镜细胞学及病理活检检查,同时对患者的血... 目的:浅析早期肺癌采取电子支气管镜联合SHOX2和RASSF1A甲基化检测的临床效果,以便为日后临床制定检测方案提供参考。方法:抽取2022年11月~2023年4月茂名市人民医院28例早期肺癌患者行电子支气管镜细胞学及病理活检检查,同时对患者的血浆、痰液及支气管肺泡灌洗液三种标本采用甲基化特异性方式检测SHOX2和RASSF1A甲基化表达。结果:电子支气管镜确诊阳性检出率为67.86%,SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测灌洗液检出阳性率较高,分别为71.43%、60.71%;电子支气管镜+SHOX2、RASSFIA甲基化联合检查,准确度、阳性预测、阴性预测、敏感度及特异性均高于其他检测方式。结论:电子支气管镜检查联合血浆、痰液及支气管肺泡灌洗液HOX2和RASSF1A甲基化检测能提高早期肺癌的检出率,对肺癌的早期诊断有临床应用价值。 展开更多
关键词 早期肺癌 shox2 RASSF1A 电子支气管镜 诊断
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血浆SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化检测对肺结节的诊断价值
6
作者 段维婷 张平 严桥路 《临床医学进展》 2024年第4期750-758,共9页
【目的】探究血浆SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化检测对肺结节性质判定及诊断的价值。【方法】抽取静脉血8~10 ml进行血浆分离,分离后的血浆进行DNA的提取与制备,其中包括裂解、结合、洗涤、亚硫酸盐转化、脱洗等步骤。进行PCR检测,分... 【目的】探究血浆SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化检测对肺结节性质判定及诊断的价值。【方法】抽取静脉血8~10 ml进行血浆分离,分离后的血浆进行DNA的提取与制备,其中包括裂解、结合、洗涤、亚硫酸盐转化、脱洗等步骤。进行PCR检测,分别设置SHOX2、RASSF1A、PTGER4甲基化的阈值,检测游离DNA中基因甲基化状态。采用首创的P值(阳性指数,Positive Index)计算公式法分析样本检测数据,依据阳性判断值判定样本阳阴性。【结果】84例胸部CT提示肺结节的患者,进行血浆游离DNA甲基化检测,其中阳性和阴性分别有18例和66例,阳性与阴性结果与患者的性别、吸烟、结节大小、多发与否无关;与年龄、结节的密度及病理类型有关,差异有统计学意义(P < 0.05)。通过金标准病理诊断肺癌有8例,其中6例甲基化检测为阳性,阳性率为75%;恶性结节与良性结节的甲基化阳性指数数值分别为2.00 ± 1.38和1.10 ± 0.92,差异有统计学意义(P < 0.05)。SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化诊断肺癌的曲线下面积(AUC)、灵敏度和特异度分别为0.754、75%和84.2%。SHOX2/RASSF1A/PTGER甲基化与病理诊断评定结果存在一致性,Kappa = 0.842。【结论】SHOX2/RASSF1A/PTGER4基因甲基化检测可以成为肺结节性质早期判断的一种可靠且灵敏的新型生物学标志物,为肺癌的早期诊治提供依据。 展开更多
关键词 肺结节 shox2/RASSF1A/PTGER4 甲基化 血浆 肺癌
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SHOX2基因甲基化辅助诊断肺癌的临床转化现状 被引量:10
7
作者 宋乐乐 李月敏 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期550-554,共5页
肺癌是中国发病率首位的癌症,虽然组织学活检和细胞学检测可以确诊肺癌,但其检出时病情多已处于较晚期,且检出率并不理想。SHOX2基因甲基化检测为解决这个问题提供了一个较为有效的选项,多项临床试验证明其与组织学或细胞学检测联合使... 肺癌是中国发病率首位的癌症,虽然组织学活检和细胞学检测可以确诊肺癌,但其检出时病情多已处于较晚期,且检出率并不理想。SHOX2基因甲基化检测为解决这个问题提供了一个较为有效的选项,多项临床试验证明其与组织学或细胞学检测联合使用提高了确诊率,是辅助确诊肺癌的有效工具。本文回顾了此检测在辅助确诊肺癌方面所进行的临床试验的结果,并对未来的使用方法和研究方向提出建议。 展开更多
关键词 肺癌 小细胞肺癌 非小细胞肺癌 甲基化 shox shox2
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支气管肺泡灌洗液中SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测对肺癌的诊断价值 被引量:21
8
作者 陈瑞英 刘雅 +2 位作者 孙婷 刘峰辉 马小花 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第5期732-736,共5页
目的:对疑诊肺癌患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2、RASSF1A基因甲基化分析,评估两指标联合检测区分肺癌与肺良性疾病的诊断效能及联合细胞学使用对肺癌的诊断价值。方法:收集276例肺部疾病患者(肺癌组131例,肺部良性疾病组145例)的B... 目的:对疑诊肺癌患者支气管肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2、RASSF1A基因甲基化分析,评估两指标联合检测区分肺癌与肺良性疾病的诊断效能及联合细胞学使用对肺癌的诊断价值。方法:收集276例肺部疾病患者(肺癌组131例,肺部良性疾病组145例)的BALF样本,应用PCR法检测BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化,并将检测结果和Sanger测序法结果比较。结果:PCR和Sanger测序法一致性分析显示两种方法在检测SHOX2和RASSF1A基因甲基化具有良好的一致性(Kappa=0.978,95%CI=0.954~1.000)。SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测在肺癌组的诊断灵敏度为0.840,高于良性疾病组(0.193)(P<0.001);肺癌组BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在小细胞肺癌和肺鳞癌中分别是100%和90.9%,高于肺腺癌(66.0%);SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测阳性率在晚期肺癌高达89.3%,明显高于早期肺癌阳性检出率。ROC曲线分析显示当SHOX2、RASSF1A基因甲基化、细胞学三指标联合使用时进一步将诊断灵敏度提高至0.931。结论:对BALF中SHOX2、RASSF1A基因甲基化PCR检测在肺癌诊断中有良好的灵敏度;SHOX2、RASSF1A甲基化PCR检测与细胞学联合使用可显著提高肺癌诊断灵敏度,是肺癌病理学诊断的有效补充工具。 展开更多
关键词 肺癌 DNA甲基化 shox2 RASSF1A
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支气管肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测在临床肺癌早期诊断中的应用 被引量:9
9
作者 田祺 赵靖 +4 位作者 刘菲菲 罗坤 尹小波 王晓杰 徐淑凤 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2020年第17期3629-3632,共4页
目的综合评价支气管肺泡灌洗液(BALF)中基因矮小同源盒基因(SHOX)2、基因RAS类联域家族(RASSF)1A甲基化和4种血浆肿瘤标志物对早期肺癌的诊断价值。方法选取病理确诊的134例患者,其中67例早期肺癌纳入肺癌组,67例良性病变者纳入对照组... 目的综合评价支气管肺泡灌洗液(BALF)中基因矮小同源盒基因(SHOX)2、基因RAS类联域家族(RASSF)1A甲基化和4种血浆肿瘤标志物对早期肺癌的诊断价值。方法选取病理确诊的134例患者,其中67例早期肺癌纳入肺癌组,67例良性病变者纳入对照组。所有患者采用实时荧光PCR(RT-PCR)法检测BALF中基因SHOX2和RASSF1A甲基化情况,并收集癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段(Cyfra21-1)、鳞状细胞癌抗原(SCCAg)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)血浆肿瘤标志物结果。统计BALF基因SHOX2、RASSF1A及肿瘤标志物诊断肺癌的灵敏度和特异度。通过Logistic回归分析评价各指标对肺癌组织的影响。构建受试者工作特征(ROC)曲线,计算各指标曲线下面积(AUC)值,以评估其在早期肺癌诊断中的性能。结果基因SHOX2及RASSF1A甲基化诊断灵敏度分别为80.6%、79.1%,特异度为82.1%、85.1%。Logistic回归分析显示,Cyfra21-1、NSE、SHOX2ΔΔCT及RASSF1AΔΔCT值是肺癌的影响因素。以基因SHOX2ΔΔCT值联合基因RASSF1AΔΔCT值为检验变量,绘制ROC曲线,诊断肺癌的AUC值为0.935,显著高于单独进行SHOX2和RASSF1A、NSE和Cyfra21-1诊断肺癌的ROC曲线(P<0.05)。结论BALF的基因SHOX2及基因RASSF1A甲基化,对早期肺癌的诊断有较高的敏感性和特异性,对肺癌的早期诊断具有高效的诊断能力,联合SHOX2、RASSF1FΔΔCT值诊断效率显著升高,在早期肺癌诊断中可以作为细胞学的辅助工具。 展开更多
关键词 早期诊断 肺癌 RASSF1A shox2 肿瘤标志物
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肺泡灌洗液中SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测对肺癌的诊断价值 被引量:15
10
作者 张毅敏 王明丽 +4 位作者 吴杰 单绿虎 张剑英 熊娟 徐笑红 《肿瘤学杂志》 CAS 2016年第12期1032-1036,共5页
[目的]评估肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测(任意阳性)在肺癌诊断中的临床价值。[方法]收集经病理确诊的580例患者,其中肺癌261例,良性肺部疾病293例,非肺部的恶性肿瘤26例。将良性肺部疾病和非肺部的恶性肿瘤患者... [目的]评估肺泡灌洗液(BALF)中SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测(任意阳性)在肺癌诊断中的临床价值。[方法]收集经病理确诊的580例患者,其中肺癌261例,良性肺部疾病293例,非肺部的恶性肿瘤26例。将良性肺部疾病和非肺部的恶性肿瘤患者共319例作为对照组。对全部580例患者的BLAF样本,采用实时荧光PCR(RT-PCR)与测序法检测BALF中SHOX2和RASSF1A两种基因甲基化情况,比较两种检测方法的一致性。以病理诊断为金标准,对277例具有细胞学结果的患者(肺癌组130例,对照组147例),比较采用RT-PCR法SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测与细胞学检测对肺癌诊断的敏感性和特异性。[结果]RT-PCR法与测序法两种方法检测580例患者BLAF样本SHOX2基因和RASSF1A基因甲基化结果的一致率分别是97.5%和98.0%。580例BLAF样本采用RT-PCR法检测SHOX2和RASSF1A基因甲基化任意阳性对肺癌诊断的敏感性和特异性分别是74.3%和87.1%。在277例有细胞学结果的患者中,RT-PCR法SHOX2和RASSF1A基因甲基化检测任意阳性对肺癌诊断的敏感性和特异性分别为83.2%和92.5%,与细胞学检测(44.6%和98.6%)相比,敏感性显著提高,但特异性有所降低,差异均有统计学意义(P<0.01,P<0.05)。基因甲基化联合检测(任意阳性)阳性率在细胞学发现癌细胞组为98.2%(57/58),结果未明组为100.0%(35/35),未发现癌细胞组为37.8%(14/37)。[结论]采用RT-PCR法进行BALF中SHOX2和RASSF1A基因甲基化联合检测,可以作为肺癌细胞学检查的补充,特别是在细胞学检测结果未明或阴性时。 展开更多
关键词 shox2 RASSF1A 基因甲基化 肺泡灌洗液 肺肿瘤
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西南矮马矮小性状基因SHOX的克隆测序和多态性研究 被引量:2
11
作者 乌尼尔夫 塔娜 +1 位作者 孙玉江 芒来 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1337-1340,共4页
本研究首次克隆出西南马矮小性状基因完整第二外显子序列,GenBank登录号为EU556739;通过PCR-SSCP方法对8个品种150匹马的该序列做了多态性分析,在P2位点上268处有1个G→A的突变,和431处有1个T→G的突变导致了等位基因B变为等位基因A。... 本研究首次克隆出西南马矮小性状基因完整第二外显子序列,GenBank登录号为EU556739;通过PCR-SSCP方法对8个品种150匹马的该序列做了多态性分析,在P2位点上268处有1个G→A的突变,和431处有1个T→G的突变导致了等位基因B变为等位基因A。该位点除云南文山马(WS)的优势基因型和优势等位基因分别为AB型和B外,其余类群马均为BB型和B。云南丘北马(QB)、云南文山马(WS)、云南大理马(DL)、建昌马(JC)和设特兰马(ST)在P2位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态。 展开更多
关键词 中国矮马 矮小性状基因shox 序列分析 遗传多样性
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miR-375靶向SHOX2调控人食管鳞癌细胞侵袭迁移的初步研究? 被引量:5
12
作者 金立 易俊 宋海珠 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2016年第3期193-198,共6页
目的探讨miR-375/SHOX2轴对食管鳞癌细胞侵袭迁移能力的影响,为食管鳞癌的靶向治疗寻找潜在新靶点。方法选取对数生长期的人食管鳞癌细胞(kyse-70、kyse-30),分别过表达以及干扰miR-375和SHOX2基因,采用克隆形成、MTT、划痕、Transwell... 目的探讨miR-375/SHOX2轴对食管鳞癌细胞侵袭迁移能力的影响,为食管鳞癌的靶向治疗寻找潜在新靶点。方法选取对数生长期的人食管鳞癌细胞(kyse-70、kyse-30),分别过表达以及干扰miR-375和SHOX2基因,采用克隆形成、MTT、划痕、Transwell等体外细胞功能学实验检测miR-375、SHOX2对食管鳞癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,通过拯救实验验证miR-375对SHOX2的靶向调控作用。结果与对照组的kyse-70、kyse-30细胞相比,过表达miR-375或干扰SHOX2基因后的细胞增殖率、克隆形成率和Transwell细胞穿透数均降低,差异均有统计学意义(P<0.01);与对照组的kyse-70、kyse-30细胞相比,干扰miR-375或过表达SHOX2后的细胞增殖率、克隆形成率和Transwell细胞穿透数均升高,差异均有统计学意义(P<0.01);miR-375过表达后的食管鳞癌细胞SHOX2基因表达减少,而抑制miR-375后SHOX2基因表达增强。拯救实验结果显示,共转染miR-375和SHOX2后细胞增殖和侵袭能力较对照组又有所增强。结论 miR-375抑制食管鳞癌细胞增殖和侵袭;SHOX2促进食管鳞癌细胞增殖和侵袭。miR-375靶向负调控SHOX2表达,对食管鳞癌细胞的增殖和侵袭起调控作用。 展开更多
关键词 食管鳞癌 miR-375 shox2 靶向调节
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特发性矮小患者SHOX基因突变及人体测量学特征的分析 被引量:1
13
作者 周斌 杨玉 +2 位作者 周红平 杨利 谢理玲 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2013年第3期25-28,35,共5页
目的分析特发性矮小(idiopathic short stature,ISS)患者的人体测量学特征及SHOX基因的突变。方法对70例特发性矮小患者进行身高、指距、坐高的测量及骨龄评分:对骨龄延迟时间与身高标准差积分(height SDS,Ht SDS)、四肢长/坐高比值与... 目的分析特发性矮小(idiopathic short stature,ISS)患者的人体测量学特征及SHOX基因的突变。方法对70例特发性矮小患者进行身高、指距、坐高的测量及骨龄评分:对骨龄延迟时间与身高标准差积分(height SDS,Ht SDS)、四肢长/坐高比值与靶身高进行Pearson相关分析;选取下肢长/坐高比值较低患者40例,提取DNA,对其SHOX基因的外显子进行测序分析。结果 ISS患儿骨龄延迟与HtSDS呈正相关(r=0.427,P=0.000),下肢长度/坐高比值与靶身高呈正相关(r=0.251,P=0.039),提示ISS患儿可能存在下肢骨生长潜能的减低。下肢长/身高比值较低的40例患者中未发现SHOX基因突变。结论特发性矮小患者可能存在下肢骨生长潜能的减低。SHOX基因突变可能不是江西地区ISS患儿下肢骨生长潜能减低的遗传学因素之一。 展开更多
关键词 shox基因 特发性矮小 人体测量学 靶身高 突变
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人SHOX2基因的生物学作用及与疾病关系的研究 被引量:7
14
作者 张玉娟 崔巍 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第9期2212-2214,共3页
人矮小同源盒基因SHOX2(Short Stature Homobox2)是同源盒基因家族的一员,其基因表达调控与器官发育密切相关。研究发现,SHOX2基因在胚胎时期表达于中胚层和外胚层,对骨骼、心脏和神经系统的发育起到重要作用,另外,SHOX2基因甲基化与... 人矮小同源盒基因SHOX2(Short Stature Homobox2)是同源盒基因家族的一员,其基因表达调控与器官发育密切相关。研究发现,SHOX2基因在胚胎时期表达于中胚层和外胚层,对骨骼、心脏和神经系统的发育起到重要作用,另外,SHOX2基因甲基化与肺癌有关,其是否有望成为肿瘤的诊断监测指标备受关注。本文就SHOX2基因及蛋白的生物学作用以及其与疾病关系的最新研究进展作一综述。 展开更多
关键词 shox2 甲基化 肺癌
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转录因子Tbx18、Tbx3、Shox2在生物起搏方面的研究进展 被引量:4
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作者 张格格 黄从新 《疑难病杂志》 CAS 2016年第4期428-431,共4页
近年来,一些转录因子在生物起搏方面的作用受到了极大关注,无论是离体的细胞实验还是在体直接注射,都产生了令人瞩目的成果。文章就转录因子Tbx18、Tbx3、Shox2在生物起搏方面的研究进展做一综述,希望为其今后在临床上的应用提供依据。
关键词 转录因子 生物起搏 Tbx18 Tbx3 shox2
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SHOX基因缺陷与身材矮小症研究进展 被引量:5
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作者 卢洪涌 崔英霞 《中国优生与遗传杂志》 2008年第3期7-8,14,共3页
位于X和Y染色体拟常染色体区域的SHOX基因与软骨发育相关。近年来发现该基因的缺陷是特发性身材矮小、Turner综合征、Le′ri-Weill软骨发育异常和Langer肢中骨发育不良等多种疾病发生的一个重要因素。本文综述了与SHOX基因缺陷相关软骨... 位于X和Y染色体拟常染色体区域的SHOX基因与软骨发育相关。近年来发现该基因的缺陷是特发性身材矮小、Turner综合征、Le′ri-Weill软骨发育异常和Langer肢中骨发育不良等多种疾病发生的一个重要因素。本文综述了与SHOX基因缺陷相关软骨发育异常的临床表现。 展开更多
关键词 shox基因 身材矮小症 TURNER综合征 LMD LWD
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shox基因杂合性缺失致胎儿骨骼发育异常的产前诊断 被引量:2
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作者 田琪 陈亚琼 +1 位作者 侯红瑛 章钧 《心血管外科杂志(电子版)》 2018年第1期43-44,共2页
目的探讨shox(矮小同源盒)基因杂合性缺失致胎儿骨骼发育异常的产前诊断价值。方法选取2016年1月-2018年1月来我院行产前检查的372例孕妇,全部孕妇均行超声检查,超声诊断胎儿骨骼发育异常12例,12例孕妇接受SNP-array(单核苷酸多态性微... 目的探讨shox(矮小同源盒)基因杂合性缺失致胎儿骨骼发育异常的产前诊断价值。方法选取2016年1月-2018年1月来我院行产前检查的372例孕妇,全部孕妇均行超声检查,超声诊断胎儿骨骼发育异常12例,12例孕妇接受SNP-array(单核苷酸多态性微阵列芯片)检查,分析检测结果。结果超声诊断胎儿骨骼发育异常者占比3.26%,shox基因杂合性缺失率0.27%;NP-array检测结果提示胎儿X或Y染色体短壁末端局部存在1.063 Mb的杂合性缺失,缺失片段包含shox基因。结论产前SNParray联合超声检查可有效检出shox基因杂合性缺失致胎儿骨骼发育异常病例,为优生优育创造有利条件。 展开更多
关键词 胎儿骨骼发育异常 shox基因杂合性缺失 超声 产前诊断
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胸水中SHOX2基因甲基化程度与肺癌的关系 被引量:4
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作者 栗少飞 聂立功 《医药与保健》 2014年第2期3-5,2,共4页
目的 本研究的目的是检测胸水中SHOX2基因甲基化作为良恶性胸腔积液鉴别方法的临床价值.方法 运用实时荧光定量PCR的方法分析亚硫酸氢盐转化后的胸腔积液中SHOX2基因是否存在甲基化.结果 共60例患者,其中恶性胸腔积液组28例,良性胸腔积... 目的 本研究的目的是检测胸水中SHOX2基因甲基化作为良恶性胸腔积液鉴别方法的临床价值.方法 运用实时荧光定量PCR的方法分析亚硫酸氢盐转化后的胸腔积液中SHOX2基因是否存在甲基化.结果 共60例患者,其中恶性胸腔积液组28例,良性胸腔积液组19例,非肺部恶性肿瘤伴胸腔积液组13例,恶性胸腔积液组中35.7%(10/28)出现甲基化阳性,良性胸腔积液组发现甲基化为0%(0/19).肺部恶性肿瘤组与良性组相比具有统计学差异(P<0.05).SHOX2基因甲基化诊断肺癌的敏感性为35.7%,特异性为100%.结论 胸腔积液中沉渣细胞SHOX2基因甲基化状态是一种有潜力的鉴别胸腔积液良恶性的辅助诊断方法. 展开更多
关键词 shox2基因 胸腔积液 PCR 甲基化 肺癌
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贵州矮马SHOX基因的鉴定及其多态性研究
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作者 冉雪琴 赵星艳 +4 位作者 岑永秀 徐倩 王嘉福 李升 阮涌 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第23期6-11,共6页
矮小同源盒基因(SHOX)突变是儿童身材矮小的重要原因。贵州矮马的体高和前膊长较小,但不清楚马基因组中是否有SHOX基因。本研究采用PCR和RT-PCR方法 ,从贵州矮马血液和心脏中克隆SHOX基因F1和F2片段;经测序研究贵州矮马SHOX基因的多态... 矮小同源盒基因(SHOX)突变是儿童身材矮小的重要原因。贵州矮马的体高和前膊长较小,但不清楚马基因组中是否有SHOX基因。本研究采用PCR和RT-PCR方法 ,从贵州矮马血液和心脏中克隆SHOX基因F1和F2片段;经测序研究贵州矮马SHOX基因的多态性。结果表明:从贵州矮马基因组中克隆到F1片段279 bp,从心脏总RNA逆转录得到F2片段216 bp,分别对应于人SHOX基因外显子2和外显子3区域;片段F2编码72个氨基酸,其中Ser16为磷酸化位点,且含有DNA结合结构域N端的45个氨基酸;片段F1对应于马参考基因组未定位的Scaffold 118中,推测马SHOX基因可能位于X染色体的短臂末端;从SHOX基因2个片段的序列中找到6个变异位点,但贵州矮马群体中各SNP位点的分布频率与伊犁马之间没有明显差异;矮马个体中存在SHOX基因的单核苷酸变异,可能参与骨的发育调节。本研究结果表明,马基因组中存在SHOX基因,且有转录活性,SHOX基因外显子2和3的序列保守,基因的变异可能参与个体的骨发育调节。 展开更多
关键词 贵州矮马 shox基因 多态性 体高 伊犁马
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