期刊文献+
共找到5篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于生物信息学分析SGOL1在肺腺癌中的表达及预后价值 被引量:1
1
作者 刘西尧 李昂 +2 位作者 仵红娇 郭力雯 张雪梅 《中国现代医生》 2024年第15期1-8,共8页
目的通过生物信息学方法分析Shugoshin-1(SGOL1)在肺腺癌中的表达及预后价值。方法从癌症基因组图谱数据库中下载肺腺癌组织和正常组织的表达谱数据和临床资料,并对SGOL1进行表达差异分析和临床相关性分析。使用R包“pROC”绘制受试者... 目的通过生物信息学方法分析Shugoshin-1(SGOL1)在肺腺癌中的表达及预后价值。方法从癌症基因组图谱数据库中下载肺腺癌组织和正常组织的表达谱数据和临床资料,并对SGOL1进行表达差异分析和临床相关性分析。使用R包“pROC”绘制受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)评估SGOL1表达对肺腺癌患者临床诊断预测的准确性;利用R包“survival”“survminer”和单因素及多因素Cox回归分析评估SGOL1表达对肺腺癌患者预后的影响;通过检索肿瘤免疫单细胞中心和TIMER2.0数据库,分析肺腺癌中SGOL1的表达分布及与免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库对SGOL1及其共表达进行功能富集分析;利用交互作用基因/蛋白质检索工具构建SGOL1的蛋白质–蛋白质相互作用网络。结果与正常组织比较,肿瘤组织的SGOL1表达量显著上调(P<0.001);与癌旁组织比较,肿瘤组织的SGOL1表达量显著上调(P<0.001)。在肺腺癌的不同临床病理分期中,与Ⅰ期比较,Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期的SGOL1显著高表达(P<0.05)。ROC曲线显示,SGOL1对肺腺癌患者具有良好的诊断效能,曲线下面积为0.959(95%CI:0.942~0.975)。SGOL1高表达组患者的总生存期、疾病特异生存期、无病生存期和无瘤间期均较SGOL1低表达组显著缩短(P<0.05)。单因素及多因素Cox回归分析结果表明,临床分期(HR=1.629,P<0.001)和SGOL1表达水平(HR=1.447,P=0.002)与肺腺癌患者的预后较差相关,可作为肺腺癌患者预后的独立危险因素。SGOL1表达水平与B细胞、CD4^(+)T细胞和树突状细胞的浸润水平呈显著负相关(P<0.05),与巨噬细胞、CD8^(+)T细胞和中性粒细胞的浸润水平呈显著正相关(P<0.05)。富集分析显示,SGOL1可能在有丝分裂、细胞周期、p53信号通路和氨基酸代谢等途径中发挥作用。蛋白质-蛋白质相互作用网络分析提示SGOL1与CBX1、PPP2CA、PPP2R5C、CDCA8、ESPL1、PPP2R1A、BUB1、PPP2R5A、SGO2、CDC20等多个分子关系密切。结论SGOL1在肺腺癌组织中高表达,且与肺腺癌患者的预后较差相关。SGOL1可作为预测肺腺癌患者预后的生物标志物之一。 展开更多
关键词 肺腺癌 sgol1 预后 免疫浸润 生物标志物
暂未订购
胃癌中长链非编码RNA SGOL1-AS1的表达变化及临床意义
2
作者 唐翎瀚 马骤 +2 位作者 何洲 谭令 肖江卫 《四川医学》 CAS 2020年第9期932-937,共6页
目的探究长链非编码RNA(SGOL1-AS1)在胃癌中表达情况和相关临床意义。方法实时荧光定量PCR检测65例胃癌组织及癌旁组织、3株胃癌细胞系及正常胃黏膜细胞系的SGOL1-AS1表达水平,同时使用star Base在线数据库评估胃癌中SGOL1-AS1表达水平... 目的探究长链非编码RNA(SGOL1-AS1)在胃癌中表达情况和相关临床意义。方法实时荧光定量PCR检测65例胃癌组织及癌旁组织、3株胃癌细胞系及正常胃黏膜细胞系的SGOL1-AS1表达水平,同时使用star Base在线数据库评估胃癌中SGOL1-AS1表达水平。结合临床资料分析SGOL1-AS1表达差异与临床病理特征关系,构建受试者工作曲线评估SGOL1-AS1对胃癌诊断效能,采用Kaplan-Meier法分析SGOL1-AS1表达水平与胃癌患者生存预后关系。结果SGOL1-AS1在胃癌组织中表达水平明显高于癌旁组织,胃癌细胞中SGOL1-AS1的表达水平高于胃黏膜正常细胞,与starBase在线数据库评估结果相同。SGOL1-AS1高表达与患者肿瘤浸润深度(χ^2=4.986,P=0.026)、TNM分期(χ^2=7.963,P=0.005)、肿瘤大体分型(χ^2=5.015,P=0.025)、脉管浸润(Fisher,P=0.048)均显著相关,而其与年龄、性别、吸烟、饮酒、肿瘤最大直径、淋巴结转移、远处转移、组织分化程度等均无明显相关(均P>0.05)。SGOL1-AS1检测胃癌的ROC曲线下面积为0.612(95%CI 0.514~0.710,P=0.028),灵敏度为87.70%,特异度为40.00%。SGOL1-AS1高表达组患者预后更差(Log-rank,P=0.010)。结论长链非编码RNA SGOL1-AS1在胃癌中表达明显上调,并可能调控着胃癌的发生发展过程,影响胃癌患者预后,有潜力为胃癌的诊疗开辟新的方向。 展开更多
关键词 长链非编码RNA sgol1-AS1 胃癌 诊断 预后
暂未订购
SGOL1通过调节PKM2促进肺癌细胞增殖和侵袭
3
作者 邓博云 傅文凡 +3 位作者 江泽勇 戴路 钟圣鹏 赵健 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1394-1400,共7页
Shugoshin-1(SGOL1)是酵母Shugoshin的人类同源物之一,位于着丝粒区域,能够通过阻止着丝粒内聚复合物早熟分裂维持染色体稳定。近年来,SGOL1在肿瘤中的作用受到关注,但它在肺癌中的功能尚不清楚。本研究基于TCGA数据库分析发现,SGOL1在... Shugoshin-1(SGOL1)是酵母Shugoshin的人类同源物之一,位于着丝粒区域,能够通过阻止着丝粒内聚复合物早熟分裂维持染色体稳定。近年来,SGOL1在肿瘤中的作用受到关注,但它在肺癌中的功能尚不清楚。本研究基于TCGA数据库分析发现,SGOL1在肺癌组织中高表达(n=529,P<0.00001),并与患者的不良预后呈正相关(P=0.0049)。qRT-PCR和Western印迹结果证实:SGOL1在肺癌细胞系表达水平均较正常肺上皮细胞的升高。在肺癌A549和NCI-H2405细胞系中,敲低SGOL1表达水平后,Cell Counting Kit-8(CCK8)实验、平板克隆实验、划痕愈合实验、Transwell实验结果分别提示,细胞的增殖、克隆形成、迁移、侵袭能力下降(P<0.05)。同时本研究发现,在TCGA数据中,丙酮酸激酶肌肉同工酶2(PKM2)和SGOL1的表达呈正相关性(r=0.38,P=0)。Western印迹检测显示,在肺癌细胞A549和NCI-H2405中,敲低SGOL1能下调PKM2的表达水平。此外,功能回补实验证实,过表达PKM2能部分逆转敲低SGOL1对肺癌细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力的抑制作用。因此,本研究表明,SGOL1可能通过调节PKM2促进肺癌细胞的增殖和侵袭。本研究为SGOL1在肺癌中的作用机制提供理论依据。 展开更多
关键词 Shugoshin-1 丙酮酸激酶肌肉同工酶2 肺癌
原文传递
基于TCGA数据库的乳腺癌进程关键基因系统筛选和鉴定 被引量:3
4
作者 冯旭 赵丽敏 +1 位作者 柯浩 张洪磊 《郑州大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2017年第4期93-99,共7页
利用TCGA数据库收集的乳腺癌转录组数据和病人临床信息,分析基因表达与乳腺癌临床病理学参数的相关性及其对预后的影响,同时结合表达差异分析筛选出与乳腺癌进程密切相关的7个候选基因(UBE2T、RRM2、SGOL1、ERCC6L、CCNE1、HMGB3和SPDY... 利用TCGA数据库收集的乳腺癌转录组数据和病人临床信息,分析基因表达与乳腺癌临床病理学参数的相关性及其对预后的影响,同时结合表达差异分析筛选出与乳腺癌进程密切相关的7个候选基因(UBE2T、RRM2、SGOL1、ERCC6L、CCNE1、HMGB3和SPDYC).通过基因功能注释检索确定SGOL1作为实验验证的候选基因.实验结果表明在乳腺癌细胞系MDA-MB-231中敲降SGOL1能显著抑制细胞生长,细胞周期被阻滞在G2/M期.上述结果表明SGOL1在乳腺癌进程中具有重要作用,同时也说明该生物信息结合实验的筛选方法可以加速肿瘤关键基因的筛选和鉴定. 展开更多
关键词 转录组 TCGA数据库 sgol1
暂未订购
长链非编码RNA SGO1-AS1与潜在靶基因在宣威肺癌患者中的表达水平及临床特征
5
作者 尹春琼 陈冉 +4 位作者 杨若彤 王宁 包艳 耿娅萍 王玉明 《实用检验医师杂志》 2023年第1期13-17,共5页
目的 分析肺癌患者的长链非编码RNA(LncRNA)表达水平,探讨云南省宣威地区肺癌(宣威肺癌)的发病机制。方法 选择2018年1月—2019年5月曲靖市第二人民医院心胸外科收治的20例宣威地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者... 目的 分析肺癌患者的长链非编码RNA(LncRNA)表达水平,探讨云南省宣威地区肺癌(宣威肺癌)的发病机制。方法 选择2018年1月—2019年5月曲靖市第二人民医院心胸外科收治的20例宣威地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者作为研究对象,先后行外科手术切除癌组织和癌旁组织(距离癌灶边缘≥5 cm)。采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测宣威肺癌患者癌组织和癌旁组织中的LncRNA SGOL1-AS1表达,采用Starbase v3.0软件预测靶基因后,验证其表达水平。结果 宣威肺癌患者癌组织中LncRNA SGOL1-AS1表达水平明显高于癌旁组织[1.34(1.28,1.39)比1.17(1.16,1.23),P<0.05]。定量PCR结果表明,癌组织中靶基因DOK2相对表达量明显高于癌旁组织,AK1的相对表达量明显低于癌旁组织[DOK2:0.97(0.95,0.99)比0.91(0.89,0.94),AK1:0.87±0.03比0.93±0.02,均P<0.05],血浆中DOK2、AK1的相对表达量均明显低于正常对照组[DOK2:0.89(0.91,0.94)比0.93(0.87,0.90),AK1:1.02±0.06比1.04±0.04,均P<0.05]。结论 宣威肺癌的发病与癌组织和血浆中LncRNA SGOL1-AS1高表达有关,LncRNA SGOL1-AS1可成为宣威肺癌的临床早期诊断指标和治疗靶点。 展开更多
关键词 云南宣威 肺癌 长链非编码RNA sgol1-AS1
暂未订购
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部