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马尾松体细胞胚胎发生相关基因PmSERK1的克隆与表达分析 被引量:9
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作者 高燕 席梦利 +2 位作者 王桂凤 杨立伟 施季森 《分子植物育种》 CAS CSCD 2010年第1期53-58,共6页
体细胞胚胎发生不仅是植物微繁、种质保存的有效手段,同时也是研究高等植物胚胎发育和遗传转化的模式系统之一。本研究从马尾松未成熟合子胚诱导的胚性细胞团中成功克隆了体胚发生受体激酶基因PmSERK1。该基因全长2303bp,包含完整的开... 体细胞胚胎发生不仅是植物微繁、种质保存的有效手段,同时也是研究高等植物胚胎发育和遗传转化的模式系统之一。本研究从马尾松未成熟合子胚诱导的胚性细胞团中成功克隆了体胚发生受体激酶基因PmSERK1。该基因全长2303bp,包含完整的开放阅读框,编码626个氨基酸,其蛋白分子量约为69kD。序列分析发现PmSERK1与其它植物的SERK基因高度同源。系统进化树重建表明,PmSERK1与已知参与体胚发生的关键SERK基因聚为一类,如MtSERK1、CuSERK1、AtSERK1和DcSERK。表达分析显示:PmSERK1在主要的组织器官(根、茎、针叶等)略有表达;但在诱导培养的非胚性愈伤中没有检测到表达,而在经继代培养的胚性愈伤中表达很高且逐渐增加,且在培养20d时达到最高。另外,在再生的子叶胚中,PmSERK1的表达量也很高。综上所述表明,PmSERK1是与体胚发生相关的关键SERK基因的直系同源基因,可以作为愈伤组织胚性的标记基因。 展开更多
关键词 马尾松 serk 体胚发生 表达模式
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铁皮石斛体细胞胚胎发生类受体激酶基因DoSERK的克隆和表达分析 被引量:6
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作者 王晓娟 张建霞 +3 位作者 何春梅 曾宋君 吴坤林 段俊 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期518-526,共9页
为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)中的体细胞胚胎发生类受体激酶基因Do SERK的功能,在转录组测序数据的基础上克隆了Do SERK的全长c DNA。结果表明,Do SERK与其他植物的SERK高度同源,编码633个氨基酸。生物信息学分析表明,Do SER... 为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)中的体细胞胚胎发生类受体激酶基因Do SERK的功能,在转录组测序数据的基础上克隆了Do SERK的全长c DNA。结果表明,Do SERK与其他植物的SERK高度同源,编码633个氨基酸。生物信息学分析表明,Do SERK蛋白为亲水蛋白并定位于质膜,具有1个信号肽、1个富脯氨酸区域、1个跨膜区、5个富亮氨酸重复序列以及1个保守的蛋白激酶活性结构域,属于SERK蛋白家族成员。系统进化树分析表明,Do SERK与同为兰科植物的文心兰(Cyrtochilum loxense)以及卡特兰(Cattleya maxima)的SERK亲缘关系最近。组织表达分析表明,Do SERK在铁皮石斛中广泛表达,以幼嫩小苗根部的表达量最高。这些说明Do SERK除了可能参与铁皮石斛体胚发生过程以外,还参与其他生长发育过程。 展开更多
关键词 铁皮石斛 体细胞胚胎 serk 基因表达
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大麦SERK基因家族cDNA克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 杨沙沙 李颖波 +5 位作者 谭何新 郭桂梅 何婷 陈志伟 刘成洪 黄剑华 《上海农业学报》 CSCD 2016年第3期5-13,共9页
通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK(Somatic embryogenesis receptor-like kinases)基因家族进行注释和基因克隆,得到3条大麦序列,即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3,其中基因HvSERK3与相应已有参考序列(Accession:AK374641)相比,... 通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK(Somatic embryogenesis receptor-like kinases)基因家族进行注释和基因克隆,得到3条大麦序列,即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3,其中基因HvSERK3与相应已有参考序列(Accession:AK374641)相比,编码氨基酸有所改变。生物信息学分析表明:3条大麦SERK基因都具有1 870 bp左右的开放阅读框,620 aa左右的氨基酸残基数,69 kD左右的相对分子质量大小,平均理论等电点5.5,说明SERK为酸性蛋白;大麦SERK蛋白具有强烈的亲水性,且存在N端信号肽和跨膜螺旋区,二级结构组件主要是环(loop)。本研究为进一步探讨大麦中SERK基因家族的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 大麦 serk 注释 克隆 生物信息学分析
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SERK基因片段在平邑甜茶和四倍性后代花期前后的表达特性研究 被引量:2
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作者 甄睿 张丽杰 +2 位作者 梁敏 高书燕 董文轩 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第15期239-244,共6页
为了探索SERK基因在苹果属植物无融合生殖习性上的功能与作用,阐明该基因在胚胎发育早期在子房或胚珠组织的表达特性,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代28#和33#花期前后的子房中段为试材提取总RNA;利用通过平邑甜茶叶... 为了探索SERK基因在苹果属植物无融合生殖习性上的功能与作用,阐明该基因在胚胎发育早期在子房或胚珠组织的表达特性,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代28#和33#花期前后的子房中段为试材提取总RNA;利用通过平邑甜茶叶片中扩增并测序的SERK基因片段设计的特异引物,在以18S rRNA为内参基础上,采用RT-PCR技术分析了已得SERK基因片段在3份试材花期前后的表达情况。半定量RT-PCR分析结果表明,再次获得的SERK基因片段在3份试材胚胎发育的不同阶段均有表达,但表达强度有所不同。文中讨论了SERK基因片段的表达特性与胚胎发育和无融合生殖特征的关系。 展开更多
关键词 无融合生殖 serk基因 半定量RT-PCR 平邑甜茶
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体细胞胚胎发生相关类受体蛋白激酶基因(SERK)的研究进展 被引量:6
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作者 陈小飞 萧浪涛 +1 位作者 鲁旭东 刘素纯 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2005年第5期570-576,共7页
植物体内存在一个编码富亮氨酸重复受体蛋白激酶、与体细胞胚胎发生相关的类受体蛋白激酶基因(SERK)大家族,其在早期胚胎、小孢子、成熟胚珠和维管组织中表达。文章从SERK的结构、编码的蛋白、基因表达、功能以及信号转导介绍了SERK的... 植物体内存在一个编码富亮氨酸重复受体蛋白激酶、与体细胞胚胎发生相关的类受体蛋白激酶基因(SERK)大家族,其在早期胚胎、小孢子、成熟胚珠和维管组织中表达。文章从SERK的结构、编码的蛋白、基因表达、功能以及信号转导介绍了SERK的研究进展。 展开更多
关键词 类受体蛋白激酶基因(serk) 结构功能 表达 信号转导 体细胞胚胎发生 蛋白激酶基因 受体蛋白激酶 富亮氨酸重复 早期胚胎 维管组织
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金花茶体细胞胚胎Cn-SERK基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 翁浩 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第9期1699-1707,共9页
以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,... 以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,定位于内质网的可能性最高。二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在1个蛋白激酶位点。此蛋白可能发生磷酸化的位点有25个。内含子分析结果表明,CnSERK基因由11个外显子和10个内含子组成,内含子的剪切位点符合真核生物GT-AG规则。系统进化树分析结果表明,金花茶Cn-SERK蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)的SERK亲缘关系较近。 展开更多
关键词 金花茶 体细胞胚胎 Cn—serk 基因克隆 生物信息学
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桃SERK2的克隆及其在不同状态愈伤组织中的表达分析 被引量:1
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作者 谭彬 陈谭星 +5 位作者 韩亚萍 张亚如 郑先波 程钧 王伟 冯建灿 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期882-892,共11页
【目的】分离克隆桃(Prunus persica L.)体细胞胚胎发生相关类受体蛋白激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)基因SERK2,检测其在不同状态桃愈伤组织中的表达差异,分析SERK2与胚性愈伤组织发生的关系,为揭示组织培... 【目的】分离克隆桃(Prunus persica L.)体细胞胚胎发生相关类受体蛋白激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)基因SERK2,检测其在不同状态桃愈伤组织中的表达差异,分析SERK2与胚性愈伤组织发生的关系,为揭示组织培养困难树种桃胚性愈伤组织产生的分子机理奠定基础。【方法】采用同源克隆法获得PpSERK2的cDNA全长序列,运用TMPred、DNAMAN和MEGA 5.0等生物信息学软件对序列进行分析;以‘秋蜜红’花药为外植体,接种至添加2.0 mg·L^(-1) 6-BA和1.0 mg·L^(-1) 2,4-D的NN69培养基诱导愈伤组织;将获得的不同状态愈伤组织制作石蜡切片并进行组织细胞学观察;通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PpSERK2在4种不同状态愈伤组织中的表达进行分析。【结果】克隆获得‘秋蜜红’PpSERK2的cDNA全长序列1 881 bp,编码626个氨基酸,其蛋白质理论分子量为68.99 kD,理论等电点为5.38,具有完整的SERK蛋白的保守结构域,与牡丹(Paeonia suffruticosa)等物种的同源性为67.88%—92.71%,且与秘鲁番茄(Solanum peruvianu)和温州蜜柑(Citrus unshiu)的相似性最高。在与其他物种的SERK蛋白构建的系统进化树中,PpSERK2与SpSERK1、CitSERK1和PsSERK2等聚在一起,与同源性比对结果一致。以‘秋蜜红’花药为外植体诱导获得4种不同状态的愈伤组织,组织细胞学观察发现黄色疏松状(球形胚出现)、绿色紧实状(心形胚出现)和浅黄色透明状(尚未完全形成的鱼雷形胚结构出现)的3种状态的愈伤组织细胞小、排列紧密;而黄白色水渍状愈伤组织细胞体积大、排列不规则,细胞质稀且染色浅。根据形态学和组织学的鉴定结果,可知黄色疏松状、绿色紧实状和浅黄色透明状的3种状态的愈伤组织均为胚性愈伤组织,而黄白色水渍状愈伤组织为非胚性愈伤组织。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,PpSERK2在‘秋蜜红’3种状态的胚性愈伤组织中的表达量显著高于非胚性愈伤组织,且在3种胚性愈伤组织中的表达量有差异,其中在黄色疏松状愈伤组织中表达量最高,绿色紧实状次之,浅黄色透明状中最低。【结论】克隆获得PpSERK2的cDNA全长序列,其在3种状态的胚性愈伤组织中的表达量明显高于非胚性愈伤组织,且在黄色疏松状胚性愈伤组织中的表达量最高,PpSERK2在桃体细胞胚发育的早期发挥作用。 展开更多
关键词 体细胞胚发生 serk2 胚性愈伤组织
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苹果属无融合生殖SERK1基因的克隆与生物信息学分析 被引量:1
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作者 张丽杰 Mohamed hamad +2 位作者 董文轩 郭苏漫 孟庆娇 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2016年第1期67-73,共7页
[目的]为探讨苹果属植物无融合生殖分子机制。[方法]以苹果属平邑甜茶及杂种后代33#为试材,以苹果基因组CDS序列设计引物,通过PCR扩增技术克隆出SERK同源基因的c DNA全长序列,命名为Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登录号JQ231273和JQ23127... [目的]为探讨苹果属植物无融合生殖分子机制。[方法]以苹果属平邑甜茶及杂种后代33#为试材,以苹果基因组CDS序列设计引物,通过PCR扩增技术克隆出SERK同源基因的c DNA全长序列,命名为Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登录号JQ231273和JQ231272),利用实时定量RTq PCR的方法检测了这两个基因在平邑甜茶和杂种后代各组织和器官中的表达模式。[结果]序列分析显示Mh SERK1和Mhd SERK1编码区序列全长为1 899 bp和1 881 bp,分别编码632和626个氨基酸,其氨基酸序列与其他植物的SERK1同源基因所编码的氨基酸同源性都在80%以上,特别是与葡萄科龙眼品种同源性最高,高达92.56%,与模式植物拟南芥、烟草等植物的SERK同源基因都具有很高的同源性。实时定量PCR结果表明,在平邑甜茶和杂种后代不同组织、花器官中SERK1基因的表达量存在差异,其中在子房中的表达量最高,在营养生长的组织中表达量很低,在平邑甜茶花蕾期的子房中表达量最高。[结论]推测该基因在平邑甜茶和杂种后代的生殖发育过程中可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 苹果属 serk 同源基因 生物信息学分析
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苹果属无融合生殖SERKs基因家族的克隆和表达分析 被引量:1
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作者 张丽杰 郭苏漫 董文轩 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1033-1039,共7页
本研究利用同源克隆法以苹果属平邑甜茶和杂种后代叶片为试验材料,克隆得到4个SERK基因家族片段,并分析了SERKs家族基因在平邑甜茶和杂种后代不同器官和组织中的表达情况。研究结果表明:分离获得的4个SERK基因家族片段的氨基酸序列与模... 本研究利用同源克隆法以苹果属平邑甜茶和杂种后代叶片为试验材料,克隆得到4个SERK基因家族片段,并分析了SERKs家族基因在平邑甜茶和杂种后代不同器官和组织中的表达情况。研究结果表明:分离获得的4个SERK基因家族片段的氨基酸序列与模式植物拟南芥、烟草等植物的同源性均在84%以上,同时与其他物种的氨基酸序列进行Blast比对都具有较高的同源性;RT-PCR定量分析结果表明SERK1、SERK2、SERK3、SERK4基因主要在生殖器官中表达。因此,推测SERKs基因在平邑甜茶和杂种后代生殖发育过程中起着重要的调控作用。本研究结果为进一步揭示无融合生殖的发生机理奠定了基础。 展开更多
关键词 平邑甜茶和杂种后代 serks 基因克隆 RT-PCR
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巴西橡胶树HbSERK1启动子的克隆及功能鉴定
10
作者 王颖 贾瑞 +4 位作者 李辉亮 郭冬 朱家红 陈雄庭 彭世清 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期295-301,共7页
利用Genome Walker方法从巴西橡胶树中克隆了Hb SERK1起始密码子上游1 395 bp的5′调控序列,序列分析表明,该序列A/T含量高达66.2%,符合真核生物启动子序列的特征。Hb SERK1启动子序列中含有多个典型的真核生物启动子基本元件,如:TATA-b... 利用Genome Walker方法从巴西橡胶树中克隆了Hb SERK1起始密码子上游1 395 bp的5′调控序列,序列分析表明,该序列A/T含量高达66.2%,符合真核生物启动子序列的特征。Hb SERK1启动子序列中含有多个典型的真核生物启动子基本元件,如:TATA-box,CAAT-box等,同时存在其它应答元件,如:CAT-box、02-site、ERE、ARE、TCA-element、GCN4-motif、ACA-motif等。将Hb SERK1启动子进行5′缺失,并构建了5个植物缺失表达载体。利用真空渗透法和农杆菌介导法将植物缺失表达载体转化烟草,对烟草转化植株进行GUS活性定量分析结果表明,除了SP5外,其它缺失表达载体均可以驱动GUS蛋白的表达,说明在Hb SERK1启动子-1 395^-252 bp区域可以驱动GUS的表达,表明Hb SERK1启动子是具有生物活性的启动子。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 HB serk1启动子 功能鉴定
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铁皮石斛SERK基因的鉴定与表达分析
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作者 梁易 李良建 +3 位作者 马凌晖 刘楚琪 李畅 王万军 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期11-16,共6页
体细胞胚发生相关类受体蛋白激酶(Somatic embryogenesis receptor-like kinase, SERK)广泛存在于植物界中,具有多重功能。通过同源比对方法从铁皮石斛scaffold数据中鉴定出2个SERK基因,命名为DoSERK1和DoSERK2。其中DoSERK2的CDS长为18... 体细胞胚发生相关类受体蛋白激酶(Somatic embryogenesis receptor-like kinase, SERK)广泛存在于植物界中,具有多重功能。通过同源比对方法从铁皮石斛scaffold数据中鉴定出2个SERK基因,命名为DoSERK1和DoSERK2。其中DoSERK2的CDS长为1877 bp,编码628个氨基酸,具有典型的SERK蛋白结构。Conserved domains预测发现DoSERK2胞内激酶活性位点在其三维结构凹陷区。定量表达分析显示DoSERK2在原球茎发育各个时期均有表达,在原球茎发育的第一阶段表达量最高;组织表达分析显示DoSERK2在花中表达量最高,在其他组织器官也有表达,表明该基因可能在早期胚胎发育和生殖过程有重要作用。 展开更多
关键词 铁皮石斛 serk 原球茎发育 表达分析
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苹果属无融合生殖相关基因SERK1遗传转化的研究
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作者 张丽杰 郭苏曼 董文轩 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1283-1288,共6页
本研究以p BI121为植物表达载体,在已构建的无融合生殖基因表达载体p BI121-Mh SERK1和p BI121-Mhd SERK1的基础上,利用根癌农杆菌介导法,将苹果属无融合生殖相关基因SERK1转入受体植株烟草中。研究结果表明:烟草叶片浸染后,经共培养和... 本研究以p BI121为植物表达载体,在已构建的无融合生殖基因表达载体p BI121-Mh SERK1和p BI121-Mhd SERK1的基础上,利用根癌农杆菌介导法,将苹果属无融合生殖相关基因SERK1转入受体植株烟草中。研究结果表明:烟草叶片浸染后,经共培养和选择培养形成再生芽,分别获得7株p BI121-Mh SERK1和6株p BI121-Mhd SERK1转烟草抗性植株,PCR检测证明已成功获得Mh SERK1和Mhd SERK1烟草转化株系。本研究可为下一步无融合生殖相关基因功能验证研究奠定基础。 展开更多
关键词 serk1基因 无融合生殖相关基因 烟草 遗传转化
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人参组培过程中SERK和WUS基因的表达特性
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作者 齐海军 孙云轩 +3 位作者 李昂 陈双越 高慧 金东淳 《延边大学农学学报》 2017年第1期16-22,共7页
为研究人参叶片、愈伤组织以及从愈伤组织诱导出来的芽中与体细胞胚发生相关的基因的表达特性,在已报道的与植物愈伤组织诱导及体细胞胚发育密切相关的2个标志基因SERK和WUS,以actin为内参基因,采用RT-PCR方法分析这2个基因在人参叶片... 为研究人参叶片、愈伤组织以及从愈伤组织诱导出来的芽中与体细胞胚发生相关的基因的表达特性,在已报道的与植物愈伤组织诱导及体细胞胚发育密切相关的2个标志基因SERK和WUS,以actin为内参基因,采用RT-PCR方法分析这2个基因在人参叶片、愈伤组织及从愈伤组织长出来的芽中的表达特性。结果表明:虽然SERK和WUS在所有样品中均有表达,但在叶片和愈伤组织中的表达量无明显差异,而愈伤组织中分化出来的芽当中的表达量明显高于叶片和愈伤组织。 展开更多
关键词 人参 愈伤组织 serk WUS 半定量RT—PCR 基因表达差异
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日本落叶松体细胞胚胎发生相关基因LaSERK1的克隆与表达分析 被引量:5
14
作者 李龙 张立峰 +1 位作者 齐力旺 韩素英 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2013年第6期673-680,共8页
本研究克隆了日本落叶松体细胞胚胎发生相关受体类蛋白激酶基因LaSERK1,并检测了在不同培养条件下LaSERK1的表达情况,发现LaSERK1与已发现的其他物种SERK1基因有高度相似性,qRT-PCR结果显示:LaSERK1在体胚发生早期高表达。结果表明:LaSE... 本研究克隆了日本落叶松体细胞胚胎发生相关受体类蛋白激酶基因LaSERK1,并检测了在不同培养条件下LaSERK1的表达情况,发现LaSERK1与已发现的其他物种SERK1基因有高度相似性,qRT-PCR结果显示:LaSERK1在体胚发生早期高表达。结果表明:LaSERK1可能在落叶松体胚发育早期起重要作用,LaSERK1也可能成为早期胚性细胞的标记基因。 展开更多
关键词 日本落叶松 体细胞胚胎发生 serk1 表达分析
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百脉根LjSERKs基因家族在根瘤共生中的功能鉴定 被引量:7
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作者 汪涛 冯勇 张忠明 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期9-15,共7页
为探索百脉根中的体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶基因(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)家族在根瘤共生过程中的功能和作用机制,根据拟南芥AtSERKs基因序列,从百脉根基因组中鉴定到8个同源基因(LjSERKs)。利用CRISPR-... 为探索百脉根中的体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶基因(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)家族在根瘤共生过程中的功能和作用机制,根据拟南芥AtSERKs基因序列,从百脉根基因组中鉴定到8个同源基因(LjSERKs)。利用CRISPR-Cas9基因组编辑和毛根转化技术,分别敲除LjSERKs家族不同基因,观察并分析其对共生结瘤表型的影响。结果显示:敲除LjSERK2、LjSERK3、LjSERK6和LjSERK7后,其植株结瘤数与对照植株相比均无明显差异;敲除LjSERK8后,植株结瘤数显著减少。这些结果表明LjSERK8参与根瘤共生过程,而该家族其他基因间可能存在功能冗余现象。 展开更多
关键词 百脉根 serks基因家族 CRISPR-Cas9技术 共生结瘤
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甘蓝型油菜SERK基因家族的鉴定与系统进化分析 被引量:4
16
作者 顾巧美 赵云燕 +6 位作者 彭澳怡 程风杰 罗丁钒 汤建涛 吴伟娇 徐兆师 危文亮 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期783-794,共12页
体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinase,SERK)与植物体细胞胚发生,尤其是与植物非生物逆境胁迫响应有关。为鉴定甘蓝型油菜中BnaSERK基因家族成员、揭示其进化关系及其与油菜盐/旱胁迫的响应,利用生物... 体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinase,SERK)与植物体细胞胚发生,尤其是与植物非生物逆境胁迫响应有关。为鉴定甘蓝型油菜中BnaSERK基因家族成员、揭示其进化关系及其与油菜盐/旱胁迫的响应,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜品种中双11的SERK家族成员、基因结构、进化关系、选择压力等进行系统分析,并初步分析了部分BnaSERK基因在盐/旱胁迫下的表达响应模式。结果表明:在甘蓝型油菜基因组共鉴定到24个BnaSERK基因,它们不均等地分布在15条染色体上,可分为3个亚族,具有相对保守的基因结构和保守基序,且含多种与激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件。共线性分析表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝分别有14对、44对和32对基因表现出共线性。基于比较基因组学研究,甘蓝型油菜BnaSERK基因在经历多倍体化之后,出现了不同程度的丢失现象。分析表明,BnaSERK基因家族在芸薹属物种间的进化相对保守。盐/旱胁迫下的5个BnaSERK基因在叶片中的表达模式分析结果显示,BnaA07g29610D、BnaC01g43240D、BnaCnng07810D基因在盐胁迫下表达量上调,而BnaA01g23070D、BnaA07g23390D基因则表现为下调;Bn⁃aA07g23390D、BnaA07g29610D基因在干旱胁迫下表现为上调表达,而BnaC01g43240D、BnaCnng07810D、Bn⁃aA01g23070D基因呈下调趋势。表明BnaSERK基因可能在油菜响应盐/旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 serk基因家族 系统进化 非生物逆境胁迫
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SERK基因家族的研究进展 被引量:11
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作者 林庆光 崔百明 彭明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期681-687,共7页
体细胞胚发生相关类受体蛋白激酶(SERK)基因相继地在胡萝卜、拟南芥、水稻等多种植物中克隆和表达,并被证实是植物界中广泛存在的结构保守基因家族。SERK基因不仅在胚性组织中表达,还在非胚性组织中表达,参与了植物胚胎发育、雄性发育... 体细胞胚发生相关类受体蛋白激酶(SERK)基因相继地在胡萝卜、拟南芥、水稻等多种植物中克隆和表达,并被证实是植物界中广泛存在的结构保守基因家族。SERK基因不仅在胚性组织中表达,还在非胚性组织中表达,参与了植物胚胎发育、雄性发育、病害防御和信号传导等活动。 展开更多
关键词 serk 结构功能 信号传导
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8个大豆SERK基因干旱胁迫表达分析 被引量:1
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作者 关鑫宇 林阳 +3 位作者 陈炯辛 马洪宇 张勇 翟莹 《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》 2024年第4期75-80,共6页
对大豆中的8个GmSERK基因及其启动子序列进行生物信息学分析,通过实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)对基因在干旱胁迫下的表达量进行检测。结果显示,8个GmSERK基因分别来自大豆基因组的5条染色体,它们编码的蛋白含有596~624个氨基酸。8个GmS... 对大豆中的8个GmSERK基因及其启动子序列进行生物信息学分析,通过实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)对基因在干旱胁迫下的表达量进行检测。结果显示,8个GmSERK基因分别来自大豆基因组的5条染色体,它们编码的蛋白含有596~624个氨基酸。8个GmSERK蛋白均含有1个信号肽序列和多个亮氨酸富集重复序列(LRR)。除GmSERK10蛋白不具有跨膜结构域外,其他GmSERK蛋白均含有1个跨膜结构域和1个激酶结构域。除GmSERK7外,其余7个GmSERK基因在干旱胁迫下的表达量均发生变化,表明大豆SERK基因家族中的部分基因能够响应干旱胁迫。8个GmSERK启动子中共含有5种激素响应相关元件(ABRE、CGTCA-motif、P-box、TATC-box和TCA-element)和3种胁迫响应相关元件(ARE、MBS和TC-rich repeats),但不同启动子中含有的元件种类和数量各不相同。 展开更多
关键词 大豆 serk 生物信息学分析 干旱胁迫 启动子
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马铃薯SERKs家族基因的分离及其在植物免疫信号中的功能
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作者 张金龙 吴玉俊 +9 位作者 肖成斌 方显明 王桠楠 成宏斌 郑晟 杨宁 杜捷 高坤 武国凡 吴旺泽 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期88-99,共12页
【目的】对马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)基因进行克隆,通过序列分析和表达分析,初步探究马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶是否能够作为共受体在植物免疫防御应答中发挥功能.【方... 【目的】对马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERKs)基因进行克隆,通过序列分析和表达分析,初步探究马铃薯体细胞胚胎发生类受体激酶是否能够作为共受体在植物免疫防御应答中发挥功能.【方法】以拟南芥SERKs家族基因氨基酸序列同源比对马铃薯基因组数据库,找到了3个马铃薯SERKs家族基因.利用高效的Gateway技术,从马铃薯中克隆了StSERK1,StSERK3A和StSERK3B 3个马铃薯SERKs家族基因;以拟南芥免疫激活型突变体bak1-3 bkk1-1为背景,通过遗传学、分子生物学及生理生化的方法对3个马铃薯SERKs基因在植物免疫调控中的作用进行基因功能研究.【结果】结构域分析和遗传进化树结果证实,StSERK1、StSERK3A和StSERK3B均具有体细胞胚胎发生类受体激酶结构域特征.组织表达分析显示,马铃薯3个SERKs基因均能在植物中表达.遗传数据证实,3个马铃薯SERKs基因均能不同程度抑制bak1-3 bkk1-1免疫激活的表型.【结论】马铃薯StSERKs基因具有SERKs家族基因的典型保守结构域特征,能够参与植物先天性免疫应答. 展开更多
关键词 马铃薯 植物体细胞胚胎受体激酶 先天性免疫 BAK1 拟南芥
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大豆SERK基因家族生物信息学及盐胁迫下的表达分析 被引量:5
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作者 何福林 刘询 张斌 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1708-1717,共10页
体细胞胚胎发生类受体激酶(Somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERK)属于富含亮氨酸重复序列类受体激酶(Leucine-rich repeat sequence receptor-like kinase,LRR-RLK)家族的第二亚家族,在进化上高度保守。SERK基因除了参与... 体细胞胚胎发生类受体激酶(Somatic embryogenesis receptor-like kinases,SERK)属于富含亮氨酸重复序列类受体激酶(Leucine-rich repeat sequence receptor-like kinase,LRR-RLK)家族的第二亚家族,在进化上高度保守。SERK基因除了参与体细胞胚胎形成过程外,在植物的整个生长周期发挥多种生物学功能,如参与植物对病原菌和真菌的防御反应、响应非生物胁迫以及调控植物衰老过程。为了探究大豆SERK家族基因在盐胁迫中的功能,利用生物信息学手段对大豆SERK家族基因的染色体定位、进化关系、基因结构等进行分析,并对基因在不同组织和盐胁迫下的表达模式进行分析。结果表明:大豆SERK家族相对保守,具有类似的基因结构且同时具有相同的保守基序,此外,GmSERK1/3、GmSERK4、GmSERK16基因的表达水平在盐处理后上调。说明大豆SERK家族基因可参与植物对盐胁迫的响应过程,为进一步研究SERK基因在大豆生长发育和环境适应性过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 大豆 serk 基因表达 盐胁迫
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