丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目...丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目前尚无文献报道SERINC2与泛癌及肿瘤免疫的关系。因此,基于SERINC2预测PAAD的预后,可为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定基础。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)和人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库中SERINC2在正常和肿瘤组织中的表达水平数据,证实SERINC2在多种癌症中异常高表达,且与临床病理分期显著相关(P<0.05)。通过基因组稳定性相关癌症分析(Genomic Stability Associated Cancer Analysis,GSCA)数据库分析拷贝数变异和甲基化对SERINC2表达的影响,发现拷贝数变异与SERINC2表达呈正相关,而甲基化水平则呈负相关(P<0.05)。使用TCGA数据库进一步分析SERINC2表达水平与免疫细胞浸润和肿瘤微环境评分的相关性,发现SERINC2表达与免疫检查点基因、免疫治疗、免疫浸润显著相关,并与肿瘤微环境评分在多数癌种中负相关(P<0.05)。使用“limma”包筛选出25个差异基因,构建的PAAD预后模型可有效区分高危/低危患者的生存预后。通过54例PAAD患者的免疫组化(immunohistochemical,IHC)验证SERINC2高表达与PAAD不良预后显著相关(中位总体生存期:19.67 vs 50.52个月,P=0.029)。上述结果表明,本研究为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定了基础。展开更多
文摘丝氨酸整合因子(serine incorporator,SERINC)是一种与脂质合成有关的跨膜蛋白,其中SERINC2与癌症发生进展中的多种生物学过程相关。胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)作为一种高度恶性的肿瘤,预后极差且缺乏有效的生物标志物,目前尚无文献报道SERINC2与泛癌及肿瘤免疫的关系。因此,基于SERINC2预测PAAD的预后,可为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定基础。本研究基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)和人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库中SERINC2在正常和肿瘤组织中的表达水平数据,证实SERINC2在多种癌症中异常高表达,且与临床病理分期显著相关(P<0.05)。通过基因组稳定性相关癌症分析(Genomic Stability Associated Cancer Analysis,GSCA)数据库分析拷贝数变异和甲基化对SERINC2表达的影响,发现拷贝数变异与SERINC2表达呈正相关,而甲基化水平则呈负相关(P<0.05)。使用TCGA数据库进一步分析SERINC2表达水平与免疫细胞浸润和肿瘤微环境评分的相关性,发现SERINC2表达与免疫检查点基因、免疫治疗、免疫浸润显著相关,并与肿瘤微环境评分在多数癌种中负相关(P<0.05)。使用“limma”包筛选出25个差异基因,构建的PAAD预后模型可有效区分高危/低危患者的生存预后。通过54例PAAD患者的免疫组化(immunohistochemical,IHC)验证SERINC2高表达与PAAD不良预后显著相关(中位总体生存期:19.67 vs 50.52个月,P=0.029)。上述结果表明,本研究为开发以SERINC2为核心的肿瘤诊断标志物及免疫治疗策略奠定了基础。
