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棉花SEC1复合体组分的鉴定与GhSCY1基因功能验证
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作者 冯小康 梁倩 +2 位作者 王学峰 孙杰 薛飞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期112-122,共11页
【目的】SEC1复合体是位于类囊体上的蛋白质转运系统,由SCY1、SECE1和SECA1共同组成。SEC1系统参与类囊体蛋白的转运和整合,对维持叶绿体结构的稳定起着非常重要的作用。利用生物信息学从陆地棉全基因组中鉴定SEC1复合体基因,旨在为光... 【目的】SEC1复合体是位于类囊体上的蛋白质转运系统,由SCY1、SECE1和SECA1共同组成。SEC1系统参与类囊体蛋白的转运和整合,对维持叶绿体结构的稳定起着非常重要的作用。利用生物信息学从陆地棉全基因组中鉴定SEC1复合体基因,旨在为光合机制研究和棉花高产抗逆育种提供新的基因资源。【方法】基于拟南芥SEC1系统组分基因蛋白序列,从陆地棉基因组中鉴定棉花SEC1系统组分,分析该系统组分各基因的理化性质、跨膜结构、蛋白互作、启动子元件及表达模式。利用VIGS和透射电镜技术,研究叶绿体主要通道蛋白组分GhSCY1对叶绿素合成、叶绿体结构和形态的影响。【结果】在陆地棉中鉴定出了SEC1转运系统的组分,GhSCY1A/D、GhSECE1A/D和GhSECA1A/D。GhSCY1A/D含有1个SecY保守结构域,7个跨膜结构域,GhSECE1D只含有1个跨膜结构域。预测GhSCY1A/D与GhSECE1D在SEC1转运系统中共同形成叶绿体跨膜通道蛋白。GhSECA1A/D拥有1个SecA结构域,不含跨膜结构域,主要为蛋白转运过程提供能量。SEC1系统各基因在叶片中的表达量较高,且能够参与温度胁迫的响应。沉默GhSCY1基因(GhSCY1A和GhSCY1D)后,棉花叶片出现斑驳的淡黄色表型,叶绿素含量明显下降,叶片叶绿体结构和形态异常,没有淀粉粒累积。【结论】棉花SEC1系统分别由GhSCY1A/D、GhSECE1A/D和GhSECA1A/D构成,其中GhSCY1A/D基因在维持叶绿体结构和形态及叶绿素生物合成方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 棉花 sec1系统 GhSCY1 叶色 叶绿体结构 温度胁迫 叶绿体蛋白转运
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SEC14L1P1对口腔鳞状细胞癌细胞增殖和迁移的影响
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作者 郑文甜 公慧 +3 位作者 张馨月 郝嘉仪 王亚杰 蒋英英 《中国癌症杂志》 北大核心 2025年第3期309-319,共11页
背景与目的:SEC14L1P1是SEC14家族的一种假基因,已被发现与多种肿瘤的发生、发展密切相关,但其在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的作用尚未明确。本研究旨在深入了解SEC14L1P1在OSCC细胞内的表达特征和亚细胞定位... 背景与目的:SEC14L1P1是SEC14家族的一种假基因,已被发现与多种肿瘤的发生、发展密切相关,但其在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的作用尚未明确。本研究旨在深入了解SEC14L1P1在OSCC细胞内的表达特征和亚细胞定位,以及其对OSCC细胞增殖和迁移的影响。方法:通过ENCORI数据库对SEC14L1P1在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达进行分析;利用GDC和UCSC Xena数据库进一步分析SEC14L1P1在HNSCC中的表达及其与患者预后之间的关系。利用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测SEC14L1P1在OSCC细胞系中的表达;采用RNA核质分离实验确定SEC14L1P1在OSCC细胞中的定位。对CAL-27细胞建立SEC14L1P1敲减(SS-SEC14L1P1)组和敲减对照(SS-NC)组,对HN30细胞建立SEC14L1P1过表达(SEC14L1P1)组和过表达对照(Vector)组。通过细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)和transwell迁移实验评估SEC14L1P1表达变化对各组细胞增殖、迁移能力的影响。采用RTFQ-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测SEC14L1P1表达改变对上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关基因表达水平的影响。采用裸鼠皮下移植瘤模型观察SEC14L1P1在体内对OSCC细胞增殖的影响,将12只4周龄BALB/c裸鼠随机分为反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)-NC组和ASO-SEC14L1P1组,每组6只,每只裸鼠均做标记。进一步的机制研究通过RNAInter数据库分析与SEC14L1P1交互的分子,通过ENCORI数据库查询SEC14L1P1与DHX9的表达相关性。采用Western blot检测SEC14L1P1表达改变对磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)通路的影响。结果:数据库分析显示,SEC14L1P1在HNSCC组织中的表达高于正常组织,且与患者的不良预后密切相关。RTFQ-PCR结果表明,SEC14L1P1在6种OSCC细胞系中均高表达;RNA核质分离实验结果显示,在CAL-27和HN30细胞中SEC14L1P1主要定位于细胞核内。与SS-NC组相比,SS-SEC14L1P1组中的相对表达水平明显降低,且能显著抑制细胞增殖和迁移能力;与Vector组相比,SEC14L1P1组中的相对表达水平明显升高,细胞增殖和迁移能力也明显升高。SEC14L1P1的下调伴随E-钙粘蛋白(E-cadherin)的mRNA表达和蛋白水平升高,N-钙粘蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(vimentin)的mRNA表达和蛋白水平降低,SEC14L1P1过表达后的结果则相反。裸鼠皮下移植瘤模型实验显示,与ASO-NC组比较,ASO-SEC14L1P1组皮下移植瘤体积和重量均减小。进一步的机制研究发现SEC14L1P1与DHX9表达呈正相关性,且已有研究表明DHX9能激活PI3K/AKT信号通路;敲减SEC14L1P1导致磷酸化PI3K(phosphorylated-PI3K,p-PI3K)和磷酸化AKT(phosphorylated-AKT,p-AKT)的蛋白表达减少,过表达SEC14L1P1则显示p-PI3K和p-AKT的蛋白表达增加。结论:SEC14L1P1在OSCC细胞和组织中呈现出较高的表达水平,并且能促进OSCC细胞增殖及迁移,这一现象可能与SEC14L1P1调控PI3K/AKT信号通路,进而促进EMT有关。 展开更多
关键词 sec14L1P1 口腔鳞状细胞癌 细胞增殖 细胞迁移 上皮-间充质转化
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Sec1/Munc18蛋白的研究进展 被引量:2
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作者 董永明 《现代生物医学进展》 CAS 2008年第1期174-176,183,共4页
大多数细胞包含许多种转运到不同目的地的囊泡。尽管存在许多特定的转运途径,根本的分子原则非常相似并在进化中保守。有充足的证据表明,膜融合除需要SNARE蛋白家族的参与外,也需要Secl/Munc18(SM)蛋白;但是与SNARE蛋白功能的一致清楚相... 大多数细胞包含许多种转运到不同目的地的囊泡。尽管存在许多特定的转运途径,根本的分子原则非常相似并在进化中保守。有充足的证据表明,膜融合除需要SNARE蛋白家族的参与外,也需要Secl/Munc18(SM)蛋白;但是与SNARE蛋白功能的一致清楚相反,不同的实验系统得到的不同研究数据,使人们对于不同的SM蛋白的确切作用、作用位点和它们与SNARE蛋白的作用方式持不同观点。不同的SM蛋白与SNARE蛋白存在三种不同的作用模式。最近的研究确定,Munc18-1直接促进融合,并且它可能以所有三种模式与SNARE蛋白相互作用。本文综述了该领域的最新研究进展。 展开更多
关键词 sec1/Munc18蛋白 膜融合 分泌
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SEC1基因敲除对实验性结肠炎小鼠严重程度和肠道菌群的影响
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作者 胡定元 徐拓宇 +4 位作者 徐缘 朱浩奇 李盛村 蒋益 吴昊 《医学研究杂志》 2022年第11期52-56,61,共6页
目的探讨一种小鼠α-(1,2)-岩藻糖基转移酶SEC1基因敲除(SEC1^(-/-))对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的结肠炎小鼠中结肠炎症和肠道菌群的影响。方法采用CRISPR/Cas9技术构建SEC1^(-/-)C57BL/6小鼠,通过连续口服3%葡... 目的探讨一种小鼠α-(1,2)-岩藻糖基转移酶SEC1基因敲除(SEC1^(-/-))对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的结肠炎小鼠中结肠炎症和肠道菌群的影响。方法采用CRISPR/Cas9技术构建SEC1^(-/-)C57BL/6小鼠,通过连续口服3%葡聚糖硫酸钠5天构建实验性结肠炎模型,设置SEC1^(-/-)结肠炎组(14只)、野生型结肠炎组(15只)和野生型对照组(6只)共3组。通过疾病活动度评分和体质量变化评估结肠炎严重程度,收集小鼠升结肠内粪便样本,采用高通量16s-rDNA测序技术检测粪便菌群组分,通过生物信息分析比较肠道菌群组分的差异。组间比较采用方差分析、独立样本t检验或秩和检验。结果饮用DSS第7天,与野生型结肠炎组比较,SEC1^(-/-)结肠炎小鼠体质量显著下降(77.9%±4.7%vs 87.0%±6.2%,P<0.05),而疾病活动指数显著升高(7.3±2.8 vs 9.4±2.6,P<0.05)。野生型结肠炎小鼠Simpson指数显著低于对照组小鼠(0.83 vs 0.91,P<0.05),但两组小鼠肠道菌群OTU个数、Shannon和chao1指数比较,差异均无统计学意义(P均>0.05)。与野生型结肠炎组比较,SEC1^(-/-)结肠炎组肠道菌群的OTU个数显著增多(305 vs 194,P<0.05),Shannon和chao1指数均显著增加(4.71 vs 4.09;332 vs 207;P均<0.05),乳酸杆菌属(28.95 vs 2.23)、梭菌属(0.13 vs 0.01)和糖单胞菌属(1.82 vs 0.09)的丰度均显著增多(P均<0.05)。结论SEC1基因敲除使葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎小鼠模型严重程度加重,并影响结肠炎小鼠的肠道菌群组成。 展开更多
关键词 sec1 岩藻糖基转移酶 结肠炎 肠道菌群
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SEC1酶免疫电极免疫反应的AFM和电化学方法研究
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作者 董飒英 王洪仁 《电化学》 CAS CSCD 2002年第4期388-396,共9页
将一种肠毒素抗体共价耦联于自组装的金电极表面 ,利用原子力显微镜识别抗原抗体在多种实验条件下的形貌并通过统计数据进行定量分析 .用作控制实验的是非特异性牛血清白蛋白(BSA)抗原以及低浓度的SEC1抗原 .另外 ,酸性溶液可以打破抗... 将一种肠毒素抗体共价耦联于自组装的金电极表面 ,利用原子力显微镜识别抗原抗体在多种实验条件下的形貌并通过统计数据进行定量分析 .用作控制实验的是非特异性牛血清白蛋白(BSA)抗原以及低浓度的SEC1抗原 .另外 ,酸性溶液可以打破抗原与抗体之间的结合从而使得生物电极可以被重复使用 . 展开更多
关键词 sec1 酶免疫电极 免疫反应 AFM 电化学方法 原子力显微镜 自组装 抗体 肠毒素 金电极 解离剂
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IQSEC1通过病毒蛋白PB1调控甲型流感病毒的增殖
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作者 章洁 郭秋萍 《解剖学研究》 CAS 2020年第2期146-149,共4页
目的探讨IQSEC1是否通过病毒蛋白PB1调控甲型流感病毒的增殖。方法首先克隆甲型流感病毒[A/Shanghai/02/2013(H7N9)]的8个基因;其次,通过免疫共沉淀检测IQ模体Sec7结构域蛋白1(IQSEC1)与聚合酶PB1(PB1)存在相互作用;此外,通过过表达或... 目的探讨IQSEC1是否通过病毒蛋白PB1调控甲型流感病毒的增殖。方法首先克隆甲型流感病毒[A/Shanghai/02/2013(H7N9)]的8个基因;其次,通过免疫共沉淀检测IQ模体Sec7结构域蛋白1(IQSEC1)与聚合酶PB1(PB1)存在相互作用;此外,通过过表达或者敲低IQSEC1的方法检测IQSEC1对PB1核定位的影响;最后,过表达或者敲低IQSEC1后检测Influenza A virus[A/Shanghai/02/2013(H7N9)]。结果病毒感染条件下,外源IQSEC1和PB1存在相互作用。当过表达IQSEC1时,细胞中IQSEC1的表达量上升,相应的PB1在细胞核中的定位减少;当用敲低IQSEC1时,细胞中IQSEC1的表达量下降,相应的PB1在细胞核中的定位上升。过表达IQSEC1后,甲型流感病毒的增殖水平下降(P<0.05)。敲低IQSEC1后,甲型流感病毒的增殖水平上升(P<0.05)。结论IQSEC1通过减少甲型流感病毒蛋白PB1的核定位抑制甲型流感病毒的增殖。 展开更多
关键词 IQ模体Sec7结构域蛋白1 聚合酶PB1 甲型流感病毒
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SEC1A and SEC6 synergistically regulate pollen tube polar growth 被引量:1
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作者 Tingting Fan Yuemin Fan +4 位作者 Yang Yang Dong Qian Yue Niu Lizhe An Yun Xiang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2023年第7期1717-1733,共17页
Pollen tube polar growth is a key physiological activity for angiosperms to complete double fertilization, which is highly dependent on the transport of polar substances mediated by secretory vesicles.The exocyst and ... Pollen tube polar growth is a key physiological activity for angiosperms to complete double fertilization, which is highly dependent on the transport of polar substances mediated by secretory vesicles.The exocyst and Sec1/Munc18(SM) proteins are involved in the regulation of the tethering and fusion of vesicles and plasma membranes, but the molecular mechanism by which they regulate pollen tube polar growth is still unclear. In this study, we found that loss of function of SEC1A, a member of the SM protein family in Arabidopsis thaliana, resulted in reducing pollen tube growth and a significant increase in pollen tube width. SEC1A was diffusely distributed in the pollen tube cytoplasm, and was more concentrated at the tip of the pollen tube. Through coimmunoprecipitation-mass spectrometry screening,protein interaction analysis and in vivo microscopy,we found that SEC1A interacted with the exocyst subunit SEC6, and they mutually affected the distribution and secretion rate at the tip of the pollen tube. Meanwhile, the functional loss of SEC1A and SEC6 significantly affected the distribution of the SNARE(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor) complex member SYP125 at the tip of the pollen tube, and led to the disorder of pollen tube cell wall components. Genetic analysis revealed that the pollen tube-related phenotype of the sec1a sec6 double mutant was significantly enhanced compared with their respective single mutants. Therefore, we speculated that SEC1A and SEC6 cooperatively regulate the fusion of secretory vesicles and plasma membranes in pollen tubes, thereby affecting the length and the width of pollen tubes. 展开更多
关键词 pollen tube sec1A SEC6 SYP125 vesicle secretory
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抗B型葡萄球菌肠毒素(SEB)单克隆抗体的研制及其初步鉴定(简报) 被引量:1
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作者 李恩善 肖毅 +1 位作者 董邦权 赵宁 《单克隆抗体通讯》 CSCD 1989年第3期55-56,共2页
葡萄球菌肠毒素是一组分子量为24,000—34,000的单肽链蛋白质。已知有SEA、SEB、SECs(包括SEC1,SEC2及SEC8),SED及SEE等血清型。都能引起食物中毒。并证实SEA和SEB还具有强烈的有丝分裂原效应。对机体可产生广泛地免疫调节作用。因... 葡萄球菌肠毒素是一组分子量为24,000—34,000的单肽链蛋白质。已知有SEA、SEB、SECs(包括SEC1,SEC2及SEC8),SED及SEE等血清型。都能引起食物中毒。并证实SEA和SEB还具有强烈的有丝分裂原效应。对机体可产生广泛地免疫调节作用。因此,建立抗SEB单抗的杂交癌细胞系具有重要的实际意义。 展开更多
关键词 葡萄球菌肠毒素 单克隆抗体 初步鉴定 简报 研制 B型 免疫调节作用 有丝分裂原 SEB sec1 食物中毒 癌细胞系 SEA 分子量 蛋白质 血清型 SEE SED
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分泌抗金黄色葡萄球菌C1型肠毒素杂交瘤细胞系的建立及初步应用 被引量:4
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作者 杨琨 董邦权 +3 位作者 赵宁 刘雪松 金伯泉 李恩善 《单克隆抗体通讯》 CSCD 1995年第3期26-29,共4页
应用常规方法建立了3株稳定分泌抗金黄色葡萄球菌C1型肠毒素(SEC1)单克隆抗体(McAb)的小鼠杂交瘤细胞系B3、C4和G8。其中B3和C4均为IgG1(k),G8为IgG2a(k)。B3和G8与SEA、SEB及S... 应用常规方法建立了3株稳定分泌抗金黄色葡萄球菌C1型肠毒素(SEC1)单克隆抗体(McAb)的小鼠杂交瘤细胞系B3、C4和G8。其中B3和C4均为IgG1(k),G8为IgG2a(k)。B3和G8与SEA、SEB及SED均无交叉反应;C4虽与SEA和SED无交叉反应,但与SEB有交叉反应。间接ELISA测定小鼠腹水效价为10-5~10-8。应用识别不同表位的McAb建立了双McAb夹心ELISA法检测SEC1,敏感性可达1ng/ml。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 肠毒素C1 单克隆抗体 无性素
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Yeast two-hybrid方法筛选VISA相互作用蛋白
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作者 王丹丹 陈恬 许亮国 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期63-69,共7页
病原微生物感染对人类健康构成巨大威胁,先天免疫系统是生物体在长期进化过程中建立起来的天然保护系统。VISA(MAVS,CARDIF,IPS-1[1-3])是连接胞浆dsRNA受体RIG-I与下游信号转导通路的一个接头蛋白,研究结果表明VISA无论在TLR3非依赖的... 病原微生物感染对人类健康构成巨大威胁,先天免疫系统是生物体在长期进化过程中建立起来的天然保护系统。VISA(MAVS,CARDIF,IPS-1[1-3])是连接胞浆dsRNA受体RIG-I与下游信号转导通路的一个接头蛋白,研究结果表明VISA无论在TLR3非依赖的或者TLR3介导的抗病毒IFN信号途径中都具有关键作用,但目前对VISA信号转导的详细机制还不十分清楚。更多VISA相互作用蛋白的发现以及它们之间的作用机制的研究能完善我们对VISA参与的信号转导机制的认识。利用酵母双杂交系统,用VISA蛋白的全长做诱饵(Bait)筛选293 T细胞c DNA表达文库,并结合免疫共沉淀实验,双荧光素酶报告基因系统验证筛选到的阳性克隆和VISA作用的真实性。通过酵母双杂交系统成功筛选到Sec13L1候选基因并验证了其与VISA的全长蛋白相互作用,在293 T细胞中过表达该基因,研究结果显示Sec13L1过表达能促进VISA对IFNβ的诱导,并存在剂量效应。 展开更多
关键词 酵母双杂交系统 先天免疫 VISA sec13L1
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参与膜泡运输的蛋白家族及其运行机制的研究进展
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作者 卫军霞 李琳琳 +1 位作者 司履生 王一理 《国外医学(生理病理科学与临床分册)》 2002年第4期404-406,共3页
细胞的生长和分化最终体现在蛋白质的差异上 ,蛋白质在胞浆中的核糖体合成后 ,便被运送到特定的细胞器、细胞膜或者分泌到细胞外。细胞在其生长、发育、衰老、死亡等过程中 ,都伴随着特定蛋白的定位及运输。膜泡运输对于完成细胞器及细... 细胞的生长和分化最终体现在蛋白质的差异上 ,蛋白质在胞浆中的核糖体合成后 ,便被运送到特定的细胞器、细胞膜或者分泌到细胞外。细胞在其生长、发育、衰老、死亡等过程中 ,都伴随着特定蛋白的定位及运输。膜泡运输对于完成细胞器及细胞膜之间的蛋白运输功能至关重要 ,目前已发现了参与这一过程的 4个蛋白家族 ,并对其基本的运行机制有了一定的了解。 展开更多
关键词 膜泡运输 被膜蛋白复合体 RAB SNARES sec1/munc18
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弥漫性大B细胞淋巴瘤预后相关lncRNA分子筛选
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作者 王庆卓 李莉娟 张连生 《生物技术》 CAS 2023年第3期305-311,共7页
[目的]用生信技术挖掘弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关的长链非编码RNA(lncRNA),探究其靶基因潜在的生物功能及核心靶基因。[方法]使用TCGA数据库中弥漫大B细胞淋巴瘤患者的基因表达矩阵和临床数据,以及GTEx中正常组织的表达矩阵,利... [目的]用生信技术挖掘弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关的长链非编码RNA(lncRNA),探究其靶基因潜在的生物功能及核心靶基因。[方法]使用TCGA数据库中弥漫大B细胞淋巴瘤患者的基因表达矩阵和临床数据,以及GTEx中正常组织的表达矩阵,利用Cox回归筛选弥漫性大B细胞淋巴瘤预后相关的lncRNA。在筛选表达及预后差异显著的lncRNA后,使用LncSEA数据库预测其靶基因,并通过R包clusterProfiler进行GO和KEGG富集分析。最后,用STRING构建靶基因蛋白互作网络(PPI),并使用cytoscape筛选核心互作蛋白。[结果]得到了30个与弥漫大B细胞淋巴瘤预后显著的风险因子,其中LINC01473和SEC24B-AS1在DLBCL的表达显著高于正常对照组且预后显著;LINC01473和SEC24B-AS1的靶基因GO主要富集于转录调节复合物、DNA结合转录因子结合等生物过程;Cytoscape筛选出LINC01473和SEC24B-AS1的10个关键靶基因,包括EP300、MYC、TP53、JUN、HDAC1、SMAD4、ESR1、FOS、CEBPA和AR。[结论]LINC01473和SEC24B-AS1是弥漫性大B细胞淋巴瘤中高表达且预后显著的lncRNA,其靶基因调控通路及核心关键靶基因揭示了该疾病的生物学过程,为早期诊断治疗提供了生物标志物。 展开更多
关键词 弥漫性大B细胞淋巴瘤 长链非编码RNA LINC01473 SEC24B-AS1 预后 蛋白互作网络
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