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海洋来源真菌Aspergillus sp.SCSIO 41501中含氮化合物 被引量:5
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作者 马宣 农旭华 +3 位作者 黄钟辉 梁潇 王洁 漆淑华 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1136-1140,共5页
通过多种色谱柱层析(包括凝胶Sephadex LH-20、正相硅胶、中压液相色谱和高效液相色谱)分离手段,从来源于南海柳珊瑚Melitodessquamata的一株共附生真菌Aspergillus sp.SCSIO 41501的发酵液中分离纯化了11个含氮化合物,它们的化学结构... 通过多种色谱柱层析(包括凝胶Sephadex LH-20、正相硅胶、中压液相色谱和高效液相色谱)分离手段,从来源于南海柳珊瑚Melitodessquamata的一株共附生真菌Aspergillus sp.SCSIO 41501的发酵液中分离纯化了11个含氮化合物,它们的化学结构通过核磁共振和质谱等技术分别鉴定为13-(S)-赭曲霉素A(1)、13-(S)-甲酯化赭曲霉素A(2)、13-(R)-赭曲霉素A(3)、4-(R)-OH-赭曲霉素A(4)、18-OH-赭曲霉素A(5)、transtorine(6)、quinolactacin C1(7)、marinamide(8)、methyl marinamide(9)、aspergilliamide(10)、anoectochine(11)。所有化合物进行了抗菌实验,其中化合物2对大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌具有较强的活性,其MIC值分别为31.25、7.8、15.6μg/m L,化合物3显示中等抗菌活性,其MIC值分别为62.5、31.25、62.5μg/m L。 展开更多
关键词 海洋真菌 ASPERGILLUS sp.scsio 41501 含氮化合物
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海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428中吩嗪生物碱类抗生素的分离鉴定 被引量:4
2
作者 吴正超 郑六眷 +5 位作者 陈耀龙 李洁 陈玉婵 章卫民 张长生 李苏梅 《中国海洋药物》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期45-52,共8页
目的对从广西北海斜阳岛海域沉积物中分离的1株海洋源放线茵Streptomyces sp.SCSIO 10428进行次级代谢产物及活性研究。方法对海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的发酵产物进行有机溶剂萃取,利用硅胶、凝胶柱层析等手段纯化... 目的对从广西北海斜阳岛海域沉积物中分离的1株海洋源放线茵Streptomyces sp.SCSIO 10428进行次级代谢产物及活性研究。方法对海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428的发酵产物进行有机溶剂萃取,利用硅胶、凝胶柱层析等手段纯化次级代谢产物,通过波谱数据分析及文献比较对化合物进行结构鉴定,对化合物进行了抗菌、卤虫致死以及抗氧化活性评价。结果从海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428发酵产物中分离得到3个生物碱类化合物,其结构分别鉴定为1-甲氧基吩嗪(1),1-羟基吩嗪(2),吩嗪-1-羧酸(3);活性结果显示化合物1~3对白色念珠菌和苏云金芽孢杆菌具有较强的抑制作用,化合物2具有较强的卤虫致死活性和微弱的抗氧化活性。结论发现了1株能够产生3个不同吩嗪生物碱类抗生素的海洋源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 10428。 展开更多
关键词 海洋源放线菌 链霉菌属 scsio 10428 吩嗪 生物碱 生物活性
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海洋链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 1666活性代谢产物替达霉素A和B的发酵优化及分离鉴定 被引量:7
3
作者 段传人 姚月良 +4 位作者 汪中文 田新朋 张偲 张长生 鞠建华 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2010年第6期12-20,共9页
目的对南海海洋沉积物中分离的海洋放线菌进行体外抗肿瘤细胞和抗菌模型筛选,选取生物活性强的海洋链霉菌菌株Streptomyces sp.SCSIO1666进行发酵条件优化和活性产物的分离及结构鉴定。方法用针对6种NCI肿瘤细胞株A549、DU145、H1299、H... 目的对南海海洋沉积物中分离的海洋放线菌进行体外抗肿瘤细胞和抗菌模型筛选,选取生物活性强的海洋链霉菌菌株Streptomyces sp.SCSIO1666进行发酵条件优化和活性产物的分离及结构鉴定。方法用针对6种NCI肿瘤细胞株A549、DU145、H1299、HCT15、HEP3B和SF268的体外抗肿瘤模型及其抑菌模型对提取物进行筛选,进一步优化发酵条件,采用HPLC-UV和枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)抑菌活性追踪,利用有机溶剂萃取、正相硅胶和反相硅胶等各种色谱层析分离,通过理化性质和波谱数据分析进行结构鉴定。结果与结论从一株海洋链霉菌菌株Streptomyces sp.SCSIO 1666发酵产物中分离得到替达霉素A和B(TirandamycinsA and B),替达霉素A和B的生产对海盐的依赖程度较高,在不加盐的条件下产量极低,加3%粗海盐时,其发酵产量提高250倍以上,说明盐胁迫是海洋链霉菌菌株SCSIO1666产生活性物质的重要条件。替达霉素B是终产物,加入2%大孔吸附树脂发酵时,替达霉素A的产量得到明显提高。 展开更多
关键词 海洋放线菌 STREPTOMYCES sp.scsio 1666 替达霉素A和B 发酵优化 抗肿瘤 抗菌
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深海来源链霉菌StreptomycesgriseorubensSCSIOZY0206多酚蒽酮类代谢产物的研究 被引量:3
4
作者 周潇 张云 +4 位作者 黄洪波 宋永相 李洁 华燕 鞠建华 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期7-11,共5页
从中国南海北部3563 m深的沉积物中分离获得放线菌SCSIO ZY0206,经16S分子生物学鉴定为Strep-tomyces griseorubens。其发酵产物具有抗菌活性,进而以抗菌活性为指导,采用硅胶柱层析及半制备高效液相色谱法对其代谢产物进行追踪分离,得到... 从中国南海北部3563 m深的沉积物中分离获得放线菌SCSIO ZY0206,经16S分子生物学鉴定为Strep-tomyces griseorubens。其发酵产物具有抗菌活性,进而以抗菌活性为指导,采用硅胶柱层析及半制备高效液相色谱法对其代谢产物进行追踪分离,得到4个多酚蒽酮类化合物,经HR-ESI-MS、ESI-MS、1H及13C NMR和HMBC谱鉴定为resistoflavine(1)、resistomycin(2)、1-hydroxy-1-norresistomycin(3)和tetracenomycin D(4)。 展开更多
关键词 深海放线菌 STREPTOMYCES griseorubens scsio ZY0206 多酚蒽酮 抗菌活性
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深海链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 04777中肠道菌素的分离鉴定 被引量:1
5
作者 刘静 罗明和 +4 位作者 唐桂岭 宋永相 田新朋 卢来春 鞠建华 《中国海洋药物》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期7-13,共7页
目的对从印度洋深海沉积物中分离的1株深海放线菌Streptomyces sp.SCSIO 04777进行鉴定并对其抗菌活性次级代谢产物进行研究。方法通过16SrDNA序列分析并构建系统发育进化树来鉴定菌株,利用有机溶剂萃取、正相和反相硅胶层析等分离手段... 目的对从印度洋深海沉积物中分离的1株深海放线菌Streptomyces sp.SCSIO 04777进行鉴定并对其抗菌活性次级代谢产物进行研究。方法通过16SrDNA序列分析并构建系统发育进化树来鉴定菌株,利用有机溶剂萃取、正相和反相硅胶层析等分离手段对海洋放线菌SCSIO 04777的发酵产物进行分离纯化,通过波谱数据分析并参阅文献对化合物进行结构鉴定。结果该放线菌被鉴定为Streptomyces sp.SCSIO04777,并从其发酵产物中分离鉴定了芳香聚酮类化合物-肠道菌素。结论首次筛选得到了1株产生肠道菌素的深海链霉菌,为肠道菌素的开发利用提供了新的菌株资源。 展开更多
关键词 海洋放线菌 STREPTOMYCES SP scsio 04777 肠道菌素 芳香聚酮类化合物
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海洋放线菌S.erythraea SCSIO 07745中红霉素衍生物及其生物合成基因簇的分析
6
作者 张善文 桂春 +2 位作者 秦湘静 田新朋 鞠建华 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2018年第5期1-12,共12页
目的对从中国南海沉积物样品中分离的放线菌Saccharopolyspora erythraea SCSIO 07745中抑菌活性次级代谢产物进行研究,并对相应产物的生物合成基因簇进行分析。方法提取菌株SCSIO 07745基因组DNA,利用Illumina Hiseq和PacBio SMRT技术... 目的对从中国南海沉积物样品中分离的放线菌Saccharopolyspora erythraea SCSIO 07745中抑菌活性次级代谢产物进行研究,并对相应产物的生物合成基因簇进行分析。方法提取菌株SCSIO 07745基因组DNA,利用Illumina Hiseq和PacBio SMRT技术进行基因组测序;通过对16S rDNA序列进行分析构建系统发育进化树以鉴定菌种;以有机溶剂萃取得到发酵产物并利用正相、反相柱层析等色谱手段进行分离纯化;通过波谱数据分析对化合物进行结构鉴定。利用生物信息学技术对基因组进行注释并对合成该化合物的基因簇进行定位分析,推导其生物合成途径。结果该放线菌被鉴定为糖多孢红霉菌Saccharopolyspora erythraea,从其发酵产物中分离鉴定了2个大环内酯类化合物sporeamicin A(1)和erythromycin A enol ether(2)。全基因组序列测序发现该菌株基因组DNA为线状,含有31个次级代谢产物生物合成基因簇,其中基因簇3可能负责红霉素衍生物的生物合成,并对其生物合成途径进行了推导。结论筛选得到了1株产生红霉素类化合物的海洋糖多孢红霉菌S.erythraea SCSIO 07745,为红霉素类抗生素的开发提供了新的菌株资源。同时,该菌株的全基因组序列为其蕴藏的次级代谢产物的挖掘奠定了基础。 展开更多
关键词 scsio 07745 大环内酯类抗生素 红霉素衍生物 基因组序列分析 生物合成基因簇
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GC-MS法分析海洋放线菌Pseudonocardia sp.SCSIO 01299低极性代谢产物
7
作者 何莎 邱细敏 《中南药学》 CAS 2015年第3期250-253,共4页
目的分析新种海洋放线菌株Pseudonocardia sp.SCSIO 01299发酵代谢产物中的低极性组分,为充分利用海洋菌株资源提供依据。方法采用GC-MS法对菌株发酵液、菌丝体提取物分别进行分析。用面积归一化法确定各组分相对含量,根据质谱数据鉴定... 目的分析新种海洋放线菌株Pseudonocardia sp.SCSIO 01299发酵代谢产物中的低极性组分,为充分利用海洋菌株资源提供依据。方法采用GC-MS法对菌株发酵液、菌丝体提取物分别进行分析。用面积归一化法确定各组分相对含量,根据质谱数据鉴定色谱峰对应化合物的结构。结果经GC-MS分析,发酵液中共检出39个成分,其中25个是发酵后产生的化合物(含烃类9个,酯类9个,脂肪酸3个,醇类、酮类、醛类和芳香类各1个);菌丝体提取物中共检出41个化合物(含空白培养基中未检出的化合物23个,酯类、烃类、脂肪酸、酮类、醛类分别为11、7、2、2、1个)。该新菌株所产生的低极性组分中含量较高的物质有:角鲨烯(8.86%)、双(2-乙基己基)邻苯二甲酸二酯(8.55%)、二十烷(8.07%)、3,7,11,15-四甲基-2-十六碳烯(8.01%)、五十四烷(5.28%)、三十二烷(4.86%)、9Z-十八烯酸(2.55%)等,均为首次从该菌中检出。结论该菌能产生结构丰富的化合物,有很大的研究价值。 展开更多
关键词 GC-MS法 海洋放线菌 PSEUDONOCARDIA sp.scsio 01299 低极性代谢产物
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深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652遗传操作系统的建立 被引量:5
8
作者 李军 朱清华 +5 位作者 张云 马俊英 田新朋 李文均 张长生 鞠建华 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期105-111,共7页
目的建立深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652菌株的遗传操作系统,通过基因阻断研究次级代谢产物的生物合成途径。方法在对该菌株的全基因组进行测序的基础上,以基因组序列中编码非核糖体肽合成酶(Non-ribosomal pep... 目的建立深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652菌株的遗传操作系统,通过基因阻断研究次级代谢产物的生物合成途径。方法在对该菌株的全基因组进行测序的基础上,以基因组序列中编码非核糖体肽合成酶(Non-ribosomal peptide synthetase,NRPSs)的基因s102-A和s63-A为目标基因,利用PCR-targeting介导的基因置换技术构建了重组质粒,在加有3%海盐的培养基上,通过ET12567/pUZ8002属间接合转移导入SCSIO 00652野生菌。结果接合子通过一代、二代松弛培养都无法得到双交换突变菌株,松弛培养四代后经抗性筛选,双交换率明显提高,PCR分析结果显示s102-A基因和s63-A基因均被成功阻断,HPLC分析结果显示突变株的发酵产物与野生型菌株有一定的差异。结论成功建立了深海放线菌M.thermotolerans SCSIO 00652的遗传操作系统,为对其它基因进行遗传学操作奠定了基础。 展开更多
关键词 M thermotolerans scsio 00652 NRPSs s102-A s63-A PCR-Targeting 接合转移 松弛培养
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叶状蔷薇珊瑚来源真菌Parengyodontium album SCSIO 40430次级代谢产物研究 被引量:3
9
作者 黄艳冰 蒋晓东 +5 位作者 刘威 黄春帅 张丽萍 诸晗宁 张长生 张文军 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1881-1888,共8页
【背景】海洋来源真菌次级代谢产物由于具有化学结构新颖和生物活性多样的特点,是药物发现新的源泉之一。【目的】研究Parengyodontium album SCSIO 40430次级代谢产物及其抑菌活性。【方法】利用常压柱色谱、半制备HPLC等色谱学方法对P... 【背景】海洋来源真菌次级代谢产物由于具有化学结构新颖和生物活性多样的特点,是药物发现新的源泉之一。【目的】研究Parengyodontium album SCSIO 40430次级代谢产物及其抑菌活性。【方法】利用常压柱色谱、半制备HPLC等色谱学方法对P.albumSCSIO40430发酵液粗提物进行分离纯化;通过HR-ESI-MS、1H、13CNMR等光谱学方法,并结合文献数据,确定其产生的化合物结构;对分离得到的化合物进行抑菌活性测试。【结果】分离到3个苯并二氢吡喃酮类化合物,结构确定为Deoxyphomalone(1)、2-Ethyl-3,5-dihydroxy-11-methylchroman-9-one (2)、2-Ethyl-3-hydroxy-5-methoxy-11-methylchroman-9-one (3)。【结论】获得3个苯并二氢吡喃酮类化合物;活性测定结果显示化合物2对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSAATCC43300)、苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensisSCSIOBT01)有较好的生长抑制活性(MIC 16μg/mL)。 展开更多
关键词 Parengyodontium ALBUM scsio 40430 二氢吡喃酮 抗MRSA活性
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海洋链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 1667中吲哚咔唑生物碱类成分的研究 被引量:8
10
作者 周俊勇 黄洪波 +5 位作者 汪中文 杨民和 田新朋 张偲 张长生 鞠建华 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2011年第3期415-419,共5页
运用大孔树脂柱及硅胶柱层析对南海海洋链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 1667的代谢产物进行了研究,从SCSIO 1667菌株的发酵产物中分离得到两个indolocarbazole生物碱类化合物,经质谱,1D、2D NMR波谱数据分析鉴定为星形孢菌素(staurosporin... 运用大孔树脂柱及硅胶柱层析对南海海洋链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 1667的代谢产物进行了研究,从SCSIO 1667菌株的发酵产物中分离得到两个indolocarbazole生物碱类化合物,经质谱,1D、2D NMR波谱数据分析鉴定为星形孢菌素(staurosporine,1)和K-252d(2)。 展开更多
关键词 海洋放线菌 STREPTOMYCES sp.scsio 1667 STAUROSPORINE K-252d
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海洋放线菌Streptomyces costaricanus SCSIO ZS0073中fungichromin生物合成基因簇的分析鉴定 被引量:1
11
作者 贾艳玺 谢运昌 +3 位作者 李青连 马俊英 黄洪波 鞠建华 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2017年第6期1-10,共10页
目的对分离自中国广西红沙红树林湿地公园的放线菌菌株Streptomycescostaricanus SCSIO ZS0073进行基因组测序分析,并对其生产的制霉色基素(fungichromin)的生物合成基因簇进行分析鉴定。方法对S.costaricanus SCSIO ZS0073菌株进行基... 目的对分离自中国广西红沙红树林湿地公园的放线菌菌株Streptomycescostaricanus SCSIO ZS0073进行基因组测序分析,并对其生产的制霉色基素(fungichromin)的生物合成基因簇进行分析鉴定。方法对S.costaricanus SCSIO ZS0073菌株进行基因组总DNA提取,利用Highseq4000和PacBio SMRT技术相结合的手段对该菌株进行了基因组完成图测序;利用生物信息学方法对基因组进行注释并寻找fungichromin的生物合成基因簇,对fungichromin生物合成骨架基因fgmJ1进行置换突变,确定fungichromin生物合成基因簇,结合fungichromin结构特征和其基因簇内遗传信息及聚酮化合物的生物合成原理,对其生物合成途径进行推导。结果全基因组测序发现S.costaricanus SCSIO ZS0073菌株基因组含有1条线性染色体和1个环形质粒,基因组含有36个次级代谢产物生物合成基因簇。利用基因敲除手段对fungichromin的生物合成基因簇进行了确认并进行了生物合成途径推导。结论fungichromin生物合成基因簇的确定和生物合成途径的推导为该化合物的基因工程改造研究奠定了分子基础。 展开更多
关键词 STREPTOMYCES costaricanus scsio ZS0073 fungichromin 生物合成基因簇 基因组分析
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中国南海来源海洋链霉菌SCSIO 11863中Enterocins的分离鉴定(英文) 被引量:1
12
作者 Kumar Saurav 张庆波 +4 位作者 李苏梅 张文军 田新朋 李慧贤 张海波 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1216-1220,共5页
从南海底泥样品中分离到一株具有较强抗菌活性的放线菌株SCSIO 11863。表型和进化系统分析数据表明该菌属于链霉菌属并命名为Streptomyces sp.SCSIO 11863(KC904267)。16S rDNA序列分析表明它与白浅灰链霉菌Streptomyces albogriseolus ... 从南海底泥样品中分离到一株具有较强抗菌活性的放线菌株SCSIO 11863。表型和进化系统分析数据表明该菌属于链霉菌属并命名为Streptomyces sp.SCSIO 11863(KC904267)。16S rDNA序列分析表明它与白浅灰链霉菌Streptomyces albogriseolus strain ABRIINW EA1145(GQ925802)有99%的相似性。对该菌发酵液乙酸乙酯萃取物进行活性追踪分离得到了两个结构类似化合物,分别为Enterocin(1)和5-deoxyenterocin(2)。 展开更多
关键词 南海沉积物 海洋放线菌 STREPTOMYCES SP scsio 11863 ENTEROCINS
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海洋链霉菌Streptomyces parvus SCSIO Mla-L010中大环内酰胺类抗生素vicenistatin的糖基定向改造 被引量:1
13
作者 梁智铖 李骏 +5 位作者 凌春耀 许润 谭彬 黄洪波 鞠建华 李青连 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2021年第6期1-12,共12页
目的利用海洋链霉菌Streptomyces parvus SCSIO Mla-L010中糖基转移酶的底物宽泛性对vicenistatin进行糖基定向化改造。方法采用组合生物合成技术分别将其他糖苷类天然产物生物合成途径中的糖基合成基因导入到SCSIO Mla-L010菌株中,构... 目的利用海洋链霉菌Streptomyces parvus SCSIO Mla-L010中糖基转移酶的底物宽泛性对vicenistatin进行糖基定向化改造。方法采用组合生物合成技术分别将其他糖苷类天然产物生物合成途径中的糖基合成基因导入到SCSIO Mla-L010菌株中,构建糖基合成基因异源表达重组菌株;以有机溶剂萃取重组菌株发酵产物并利用现代色谱分离技术进行化合物纯化,进一步使用质谱、核磁共振光谱技术鉴定所获化合物的结构。结果将streptolydigin、grincamycin和lobophorin生物合成途径中合成d-olivose、L-rhodinose、d-kijanose和L-digitoxose糖基的基因导入到SCSIO Mla-L010菌株中,构建了3株异源糖基合成基因重组菌株,并从中分离得到4个含有不同糖基的新vicenistatin类天然产物。结论不仅丰富了糖苷类天然产物结构库,为海洋药物的研发提供化学实体,还为利用糖基转移酶的底物宽泛性对其他天然产物进行糖基定向改造提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 scsio Mla-L010 大环内酰胺类抗生素 vicenistatin衍生物 组合生物合成 糖基定向改造
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白腐真菌Hypocrea lixii SCSIO 41520次级代谢产物及抗菌活性研究 被引量:2
14
作者 王雪花 徐新亚 +4 位作者 李易 姚飞华 程霞 漆淑华 陶曙红 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1522-1528,共7页
对来源于深圳大亚湾近海水域软珊瑚中分离得到的白腐真菌Hypocrea lixii SCSIO 41520的次级代谢产物及抗菌活性进行研究。采用硅胶柱层析、凝胶Sephadex LH-20柱层析、半制备HPLC等色谱技术对其进行分离纯化,通过1H NMR、13C NMR、MS等... 对来源于深圳大亚湾近海水域软珊瑚中分离得到的白腐真菌Hypocrea lixii SCSIO 41520的次级代谢产物及抗菌活性进行研究。采用硅胶柱层析、凝胶Sephadex LH-20柱层析、半制备HPLC等色谱技术对其进行分离纯化,通过1H NMR、13C NMR、MS等波谱技术鉴定化合物结构。共分离鉴定了8个化合物,分别为4-(5,7-dimethoxy-4-oxo-4H-chromen-2-yl)heptanoic acid methyl ester(1)、5-methoxy eugenin(2)、rugulosin(3)、大黄素(4)、3-(5,7-dimethoxy-4-oxo-4H-chromen-2-yl)propanoic acid(5)、comazaphilone C(6)、kasanosin C(7)、comazaphilone E(8),其中化合物1是新化合物。纸片扩散法抗菌实验结果显示,该真菌发酵产物的乙酸乙酯粗提物及各分离组分均有一定的抗菌活性,单体化合物中,化合物3在25μg/disc的浓度下对金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、大肠杆菌有显著抑制作用,抑菌圈直径分别为16、15、9 mm。 展开更多
关键词 Hypocrea lixii scsio 41520 真菌 代谢产物 抗菌活性
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深海来源真菌Aspergillus sp.SCSIO Ind09F01代谢产物的研究 被引量:3
15
作者 田永奇 林圣楠 +1 位作者 周洪 刘永宏 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1512-1516,1528,共6页
利用硅胶柱色谱、凝胶柱、反向柱色谱和高效液相等手段对深海来源的真菌Aspergillus sp.SCSIO Ind09 F01的代谢产物进行分离纯化,从中分离得到了13个化合物。通过理化性质、波谱分析方法结合文献对照,鉴定了化合物的结构分别为:sydowini... 利用硅胶柱色谱、凝胶柱、反向柱色谱和高效液相等手段对深海来源的真菌Aspergillus sp.SCSIO Ind09 F01的代谢产物进行分离纯化,从中分离得到了13个化合物。通过理化性质、波谱分析方法结合文献对照,鉴定了化合物的结构分别为:sydowinin B(1)、pinselin(2)、1,6-dihydroxy-3-methyl-8-carbom ethoxyxanthone(3)、MT-1(4)、1-hydroxy-6,8-dimethoxy-3-methyl-9,10-anthraquin one(5)、methyl orsellinate(6)、orcinol(7)、mrlactone1(8)、Janthinone(9)、cyclo-(L-trptophyl-L-phenylalanyl)(10)、13-O-acetylsydowinin B(11)、7-Hydroxy-2,5-dimethylchromone(12)、Acremolin(13)。 展开更多
关键词 深海真菌 ASPERGILLUS sp.scsio Ind09F01 波谱分析 次生代谢产物
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深海链霉菌SCSIO 03032芳酰胺类代谢产物的研究 被引量:1
16
作者 聂方玲 陈玉婵 +4 位作者 张庆波 田新朋 章卫民 张长生 张文军 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2015年第4期49-55,共7页
目的对从印度洋深海沉积物中分离到的1株深海来源的放线菌Streptomyces sp.SCSIO 03032进行次级代谢产物分析及其活性研究。方法对深海来源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 03032的发酵产物进行有机溶剂萃取,利用正、反向硅胶层析、硅胶柱... 目的对从印度洋深海沉积物中分离到的1株深海来源的放线菌Streptomyces sp.SCSIO 03032进行次级代谢产物分析及其活性研究。方法对深海来源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 03032的发酵产物进行有机溶剂萃取,利用正、反向硅胶层析、硅胶柱层析、凝胶柱层析、薄层层析等分离手段进行纯化,通过ESIMS、1 H NMR、13 C NMR分析及文献查阅鉴定化合物结构,并对化合物进行抗菌及抗氧化活性研究。结果从深海来源放线菌Streptomyces sp.SCSIO 03032的发酵产物中分离得到3个芳酰胺类化合物,其结构分别鉴定为4-甲基苯-1,3-二氨基甲酸甲酯(1)、2-甲基苯-1,3-二氨基甲酸甲酯(2)、羰基亚氨基4-甲基-3,1-亚苯基双[氨基甲酸]甲酯(3);活性结果显示3个化合物均无明显的抑菌活性或抗氧化活性。结论得到了1株能够产生3个不同芳酰胺类化合物的深海链霉菌SCSIO 03032。 展开更多
关键词 深海来源放线菌 STREPTOMYCES sp.scsio 03032 芳酰胺类化合物
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1株海洋来源Streptomyces sp.SCSIO 1682中那西肽(nosiheptide)的分离鉴定及其生物合成基因簇分析 被引量:1
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作者 程伟鸽 桂春 +1 位作者 鞠建华 李青连 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2016年第6期7-14,共8页
目的对1株海洋来源的菌株SCSIO 1682进行16SrDNA分子生物学鉴定,对发酵产物中的抑菌活性化合物进行分离鉴定,并对抑菌活性化合物的生物合成基因簇进行分析。方法通过构建基于16SrDNA序列的系统发育树来进行菌株鉴定;通过有机溶剂萃取、... 目的对1株海洋来源的菌株SCSIO 1682进行16SrDNA分子生物学鉴定,对发酵产物中的抑菌活性化合物进行分离鉴定,并对抑菌活性化合物的生物合成基因簇进行分析。方法通过构建基于16SrDNA序列的系统发育树来进行菌株鉴定;通过有机溶剂萃取、正相和反相硅胶层析等化学分离手段对菌株SCSIO1682的次级代谢产物进行活性追踪分离纯化;运用HR-ESI-MS,1 H和13 C NMR等波谱手段对所得化合物进行结构解析;通过对菌株SCSIO 1682进行全基因组扫描测序鉴定所得化合物的生物合成基因簇。结果该菌株被鉴定为链霉菌,命名为Streptomyces sp.SCSIO 1682,所得抑菌活性化合物为那西肽(nosihetide),鉴定了那西肽的生物合成基因簇并进行生物信息学分析。结论从海洋链霉菌Streptomyces sp.SCSIO 1682中分离鉴定了那西肽,那西肽生物合成基因簇的鉴定为利用组合生物合成和合成生物学技术对那西肽进行结构改造提供了新的基因资源。 展开更多
关键词 海洋放线菌 STREPTOMYCES sp.scsio 1682 那西肽 生物合成基因簇
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海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05中skyllamycins的发现及其生物合成分析 被引量:1
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作者 李艳青 凌春耀 +3 位作者 易湘茜 高程海 鞠建华 马俊英 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2021年第3期1-14,共14页
目的挖掘海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05生产含肉桂酰独特结构单元的skyllamycins类环肽的潜能,并深入分析skyllamycins生物合成基因簇的新特征。方法利用Illumina Hiseq和Pacbio SMRT测序平台对S.pratensis SCSIO L... 目的挖掘海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05生产含肉桂酰独特结构单元的skyllamycins类环肽的潜能,并深入分析skyllamycins生物合成基因簇的新特征。方法利用Illumina Hiseq和Pacbio SMRT测序平台对S.pratensis SCSIO LCY05基因组DNA进行全基因组测序,通过生物信息学手段对菌株基因组的生物合成基因簇进行预测和基因功能注释,采用OSMAC(one strain many compounds)策略对S.pratensis SCSIO LCY05菌株进行发酵优化,结合萃取法、色谱学和波谱学等方法对该菌株的次级代谢产物进行分离和结构鉴定,并对得到的化合物的生物合成途径进行推导及对新颖的合成特征进行挖掘。结果全基因组测序结果表明,S.pratensis SCSIO LCY05菌株的基因组全长为8.42 Mbp,共含有35个生物合成基因簇,该基因组上的基因簇20与skyllamycins生物合成基因簇的相似度为95%。在OSMAC策略的优化基础上,发现S.pratensis SCSIO LCY05菌株在SCAS培养基中出现了2个具有典型吸收特征的峰,经鉴定为skyllamycin A和skyllamycin B环肽化合物,并推导了其生物合成途径。进一步的聚类分析发现skyllamycins装配线上的C_(11)结构域可能是具有缩合和异构化双重功能的结构域,负责skyllamycins中第11个氨基酸的组装和异构化。结论本研究不仅发现海鞘来源放线菌S.pratensis SCSIO LCY05经OSMAC策略的优化后可产生skyllamycins类环肽化合物,并揭示了skyllamycins生物合成过程中的新特征,同时也为skyllamycins类化合物生物合成机制的深入阐释及其进一步的开发利用提供了新的菌株资源。 展开更多
关键词 S.pratensis scsio LCY05 肉桂酰结构单元 skyllamycins 生物合成基因簇 缩合/异构化结构域
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海洋放线菌Streptomyces koyangensis SCSIO 5802中多烯大环内酯类抗生素candicidin生物合成基因簇的分析鉴定 被引量:1
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作者 涂佳佳 鞠建华 +1 位作者 付少彬 李青连 《合肥医学院学报》 2019年第1期35-44,共10页
目的从一株深海放线菌S.koyangensis SCSIO 5802中分析鉴定多烯大环内酯类抗生素candicidin的生物合成基因簇,并推导其生物合成途径。方法①利用PCR-targeting方法对负责abyssomicin类化合物的聚酮合酶abmB1进行同框缺失,并利用HPLC-MS... 目的从一株深海放线菌S.koyangensis SCSIO 5802中分析鉴定多烯大环内酯类抗生素candicidin的生物合成基因簇,并推导其生物合成途径。方法①利用PCR-targeting方法对负责abyssomicin类化合物的聚酮合酶abmB1进行同框缺失,并利用HPLC-MS对获得的突变株SCSIO 5802A代谢产物进行分析以鉴定其它新型化合物;②利用生物信息学方法对S.koyangensis SCSIO 5802的全基因组序列进行注释分析,以寻找candicidin的生物合成基因簇;③结合candicidin结构特征、基因簇内生物合成基因的功能以及I型聚酮化合物的生物合成原理,对其生物合成途径进行推导;④利用阿普拉抗性基因片段对candicidin生物合成基因簇中的聚酮合酶基因canD进行替换突变,以确定基因簇的正确性。结果 abmB1基因的同框缺失突变株SCSIO 5802A不生产abyssomicins类化合物,从该突变株中鉴定了一类之前未发现的多烯大环内酯类化合物candicidins;利用生物信息学鉴定了candicidin生物合成基因簇,并对其生物合成途径进行了推导;对聚酮合酶基因canD进行抗性替换突变获得的突变株SCSIO 5802AC不生产candicidins类化合物,确认了该基因簇的正确性。结论本研究将为利用组合生物合成的方法获得candicidin新结构衍生物以及基于基因组信息的新型天然产物挖掘奠定了基础。 展开更多
关键词 S.koyangensisscsio5802 多烯大环内酯 生物合成 基因簇
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Cloning, Expression and Characterization of a Lipase Gene from Marine Bacterium Pseudoalteromonas lipolytica SCSIO 04301 被引量:1
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作者 SU Hongfei MAI Zhimao ZHANG Si 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2016年第6期1051-1058,共8页
Absract A lipase gene, 1ip1233, isolated from Pseudoalteromonas lipolytica SCSIO 04301, was cloned and expressed in E. coli. The enzyme comprised 810 amino acid residues with a deduced molecular weight of 80kDa. Lip12... Absract A lipase gene, 1ip1233, isolated from Pseudoalteromonas lipolytica SCSIO 04301, was cloned and expressed in E. coli. The enzyme comprised 810 amino acid residues with a deduced molecular weight of 80kDa. Lip1233 was grouped into the lipase family X because it contained a highly conserved motif GHSLG. The recombinant enzyme was purified with Ni-NTA affinity chro- matography. The optimal temperature and pH value of Lip1233 were 45 ℃ and 8.0, respectively. It retained more than 70% of origi- nal activity after being incubated in pH ranging from 6.0 to 9.5 for 30min. It was stable when the temperature was below 45℃, but was unstable when the temperature was above 55℃. Most metal ions tested had no significant effect on the activity of Lip1233. Lip1233 remained more than original activity in some organic solvents at the concentration of 30% (v/v). It retained more than 30% activity after incubated in pure organic solvents for 12 h, while in hexane the activity was nearly 100%. Additionally, Lip 1233 exhib- ited typical halotolerant characteristic as it was active under 4M NaC1. Lip1233 powder could catalyze efficiently the synthesis of fructose esters in hexane at 400C. These characteristics demonstrated that Lip1233 is applicable to elaborate food processing and organic synthesis. 展开更多
关键词 LIPASE organic-solvent-tolerance HALOTOLERANCE fructose ester Pseudoalteromonas lipolytica scsio 04301
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