期刊文献+
共找到435篇文章
< 1 2 22 >
每页显示 20 50 100
基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
1
作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 scot标记 SRAP标记 SSR标记
在线阅读 下载PDF
基于SCoT分子标记的黄精属不同种质遗传多样性研究 被引量:2
2
作者 朱珏 石雨荷 +5 位作者 侯超文 李晓玲 刘泽湘 龚秀娟 刘湘丹 童巧珍 《中草药》 北大核心 2025年第3期966-974,共9页
目的探讨黄精属Polygonatum Mill.6个产区3个种质的遗传多样性及亲缘关系。方法以34份黄精属种质资源为供试材料,采用正交设计方法,优化黄精属目标起始密码子多态性-PCR(start codon targeted polymorphism-PCR,SCo T-PCR)反应体系并筛... 目的探讨黄精属Polygonatum Mill.6个产区3个种质的遗传多样性及亲缘关系。方法以34份黄精属种质资源为供试材料,采用正交设计方法,优化黄精属目标起始密码子多态性-PCR(start codon targeted polymorphism-PCR,SCo T-PCR)反应体系并筛选引物;并基于筛选出的引物对其进行遗传多样性分析、遗传结构以及遗传分化研究。结果得到黄精属SCo T-PCR最佳反应体系,筛选出15条多态性较好的引物,多态性条带比率为94.45%;在物种水平上,3个种质的平均观测等位基因数(observed number of alleles,N_(a))、平均有效等位基因数(effective number of alleles,N_(e))、平均Nei’s基因多样性指数(Nei’s gene diversity index,H)、平均香农指数(Shannon information index,I)分别为1.6783、1.2686、0.1740、0.2786,揭示群体间存在丰富的遗传多样性;聚类分析结果显示,多花黄精与长梗黄精聚成一类,表明亲缘关系较近;卷叶黄精作为单独分枝,其与另外2个种质的亲缘关系也较远;基因多样度(total genetic diversity,H_(t))、基因分化系数(gene diversity within population,H_(s))、遗传分化系数(coefficient of gene differentiation,G_(st))、基因流(gene flow,N_(m))分别为0.2104、0.1740、0.1733、2.3860,表明群体间存在较高水平的基因交流,AMOVA结果显示84%遗传差异来自于群体内,16%遗传差异来自于群体间;群体结构分析表明,当分析群体数(true number of clusters,K)为3时,34份材料可分为3个类群,且与聚类分析结果基本一致。结论SCoT分子标记可有效用于黄精属不同种质之间的亲缘关系及遗传多样性分析,为黄精属植物种质资源的鉴定保护、开发利用提供科学依据。 展开更多
关键词 黄精属 scot标记 遗传多样性 亲缘关系 群体结构
原文传递
基于ISSR-SCoT标记结合欧式距离聚类分析24份黄精种质遗传多样性 被引量:1
3
作者 叶夏雯 曹书禹 +2 位作者 吴延青 陈铌铍 金波 《广东农业科学》 2025年第3期25-34,共10页
【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我... 【目的】联合使用ISSR和SCoT分子标记技术,基于UPGMA和欧式距离法聚类分析,从分子水平综合分析不同产地的24份黄精种质的遗传多样性,为促进黄精属种质资源的保护、开发与利用提供参考。【方法】采用ISSR和SCoT两种分子标记技术,对来自我国11个省份的24份黄精属植物种质进行遗传多样性分析。【结果】分别从ISSR通用引物和SCoT通用引物中筛选出效果较好的15条引物,扩增后分别获得229条和210条清晰条带的标记,平均多态性百分比分别为98.40%和98.10%。与SCoT标记结果相比,ISSR分子标记技术可获得更多的黄精遗传多态性位点。24份黄精Nei's基因分化系数(G_(st))为0.0474,表明95.26%的遗传变异是在种内进行,基因流N_(m)>1表明种内存在明显的基因流动。其中15份P.sibiricum Red.黄精种质的G_(st)为0.0471,表明95.29%的遗传变异在种内进行,N_(m)>1表明种内基因交流较多。对于ISSR、SCoT和ISSR-SCoT组合数据经UPGMA分析表明,三类数据的聚类结果各有异同。进一步将ISSR-SCoT组合数据运用欧式距离算法进行聚类分析,与UPGMA聚类算法结果一致的是,ZJ6和HN4具有最近的遗传距离,并且将24份黄精遗传系数进行聚类热图可视化后的结果与欧式距离算法聚类结果基本一致。【结论】联合使用ISSR和SCoT分子标记,并综合运用UPGMA和欧式距离算法,可以获得更全面的黄精遗传多样性信息。不同产地的24份黄精种质资源具有丰富的遗传多样性,且与地理位置基本相关。 展开更多
关键词 黄精 ISSR scot 遗传多样性 聚类分析 遗传距离
在线阅读 下载PDF
SCoT和CBDP分子标记对沃柑实生苗遗传变异的检测
4
作者 陈思羽 何新华 +4 位作者 陈美燕 万嘉欣 邱发发 黄桂香 罗聪 《分子植物育种》 北大核心 2025年第8期2583-2590,共8页
沃柑是优秀的晚熟柑橘品种,但其易感染溃疡病,黄龙病发生也逐步严重。为了从沃柑实生后代中筛选出变异单株,为耐受溃疡病和黄龙病沃柑新品种的选育奠定资源基础。本研究利用SCoT和CBDP两种分子标记技术对94份沃柑实生单株与2份沃柑单株... 沃柑是优秀的晚熟柑橘品种,但其易感染溃疡病,黄龙病发生也逐步严重。为了从沃柑实生后代中筛选出变异单株,为耐受溃疡病和黄龙病沃柑新品种的选育奠定资源基础。本研究利用SCoT和CBDP两种分子标记技术对94份沃柑实生单株与2份沃柑单株进行遗传变异检测。结果显示,22条SCoT引物共扩增出168条清晰的条带,其中多态性条带90条,平均多态性比率为53.81%;25条CBDP引物,共扩增出156条清晰的条带,其中有多态性条带104条,平均多态性比率为64.46%。CBDP标记的多态性比率显著高于SCoT标记。聚类结果显示SCoT和CBDP均将96份资源分为5组,SCoT和CBDP联合聚类可以分为7组。以相似系数小于0.88为区分实生苗变异的阈值,SCoT分子标记筛选出4份实生资源;CBDP筛选出94份资源,SCoT和CBDP联合标记筛选得到83份。结果表明,CBDP标记更适合用于亲缘关系密切柑橘样品之间的遗传多样性分析,而多种分子标记共同聚类分析可以弥补标记数量的不足,分析结果更加可靠。本研究获得实生变异材料将为下一步耐受溃疡病和黄龙病单株的筛选提供材料。 展开更多
关键词 沃柑 scot CBDP 遗传多样性 亲缘关系
原文传递
基于SCoT标记的黑稻种质资源遗传多样性分析
5
作者 刘柯忻 张晓娟 +3 位作者 张卫平 李新生 吴升华 马秀奇 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第2期260-270,共11页
黑稻种质资源分布广泛,遗传背景较为复杂,揭示黑稻材料的遗传背景、明确材料间的亲缘关系具有重要意义。本研究利用实验室前期筛选的30条SCoT引物对90份水稻材料(包括21份黑叶黑稻、24份紫叶黑稻、30份绿叶黑稻、15份白稻)进行遗传多样... 黑稻种质资源分布广泛,遗传背景较为复杂,揭示黑稻材料的遗传背景、明确材料间的亲缘关系具有重要意义。本研究利用实验室前期筛选的30条SCoT引物对90份水稻材料(包括21份黑叶黑稻、24份紫叶黑稻、30份绿叶黑稻、15份白稻)进行遗传多样性分析。结果显示,SCoT引物共扩增出194个条带,其中多态性条带165条,多态性比例为85%。等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)以及Shannon′s信息指数(I)的平均值分别为1.9216、1.3922、0.2445和0.3836。聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.73处,将90份水稻材料分为4类。群体结构分析与聚类分析结果一致性较好,说明SCoT标记适用于黑稻遗传背景及亲缘关系的研究。供试水稻种质间的遗传相似系数主要分布在0.59~0.79之间,遗传相似度较高,分子方差分析显示,91%遗传变异来源于群体内,群体间的遗传变异为9%,说明供试水稻材料间遗传差异较小,应进一步丰富黑稻种质资源遗传多样性。本研究为黑稻杂交育种中的亲本选择提供参考依据,同时为黑稻品种的遗传改良、新品种培育提供理论依据。 展开更多
关键词 黑稻 scot标记 遗传多样性
原文传递
基于SCoT分子标记的葡萄种质资源遗传多样性分析
6
作者 唐凡 魏一杰 +2 位作者 闫晓伟 王进 梁东 《福建农业学报》 北大核心 2025年第5期433-440,共8页
【目的】葡萄(Vitis vinifera L.)种质资源丰富,品种繁多,解析葡萄主要栽培品种的亲缘关系,可为挖掘优异的种质资源和亲本选配等提供依据。【方法】以77份葡萄种质资源为材料,提取葡萄叶片总DNA进行PCR扩增,采用SCoT分子标记技术进行遗... 【目的】葡萄(Vitis vinifera L.)种质资源丰富,品种繁多,解析葡萄主要栽培品种的亲缘关系,可为挖掘优异的种质资源和亲本选配等提供依据。【方法】以77份葡萄种质资源为材料,提取葡萄叶片总DNA进行PCR扩增,采用SCoT分子标记技术进行遗传多样性分析,并采用Structure2.3.4软件进行群体遗传结构分析。【结果】从36条SCoT引物筛选出10条多态性丰富且扩增稳定的引物,共检测到68个扩增条带,其中65个为多态性条带,总体多态性比率为95.7%;平均6.8条带/引物,引物的条带多态性比率分布在80%~100%;遗传多样性分析所得平均基因遗传多样性指数为0.3882。聚类结果显示,77份葡萄遗传相似系数为0.59~0.97,当遗传相似系数为0.626时,可将群体分为两大类群,Pop1中包含34份种质,大部分为欧美杂种葡萄品种(V.vinifera×V.labrusca L.),Pop2中包含43份种质,大部分为欧亚种葡萄品种(V.vinifera),各类群成员遗传背景较纯。【结论】SCoT分子标记可以对葡萄种质的遗传多样性进行鉴定,本研究结果为四川葡萄种质资源亲缘关系分析、杂交亲本选配、分子标记辅助育种等提供了参考。 展开更多
关键词 葡萄 scot分子标记 遗传多样性 亲缘关系
在线阅读 下载PDF
香蕉SCoT-PCR反应体系优化及遗传多样性分析
7
作者 陈文亮 李雨晴 +4 位作者 王明元 王楚乔 林萍 刘建福 陈科霖 《分子植物育种》 北大核心 2025年第6期1874-1880,共7页
本研究以福建省6个香蕉品种为材料,采用正交试验设计对香蕉SCoT-PCR体系进行优化,筛选适用于香蕉的SCoT多态性引物,同时对18份香蕉种质资源材料进行遗传多样性分析。结果显示:香蕉的SCoT-PCR最佳反应体系(20μL)为:dNTP Mix 0.2 mmol/L... 本研究以福建省6个香蕉品种为材料,采用正交试验设计对香蕉SCoT-PCR体系进行优化,筛选适用于香蕉的SCoT多态性引物,同时对18份香蕉种质资源材料进行遗传多样性分析。结果显示:香蕉的SCoT-PCR最佳反应体系(20μL)为:dNTP Mix 0.2 mmol/L、Taq聚合酶2 U、引物1μmol/L、DNA模板20 ng。同时筛选出条带清晰、多态性丰富的11条SCoT引物及其最适退火温度。共扩增出102个特异性条带,平均多态率为82.50%。UPGMA聚类结果显示18份材料分为了三大类群。SCoT引物的Na、Ne、H、I平均值分别为1.8235、1.4979、0.2934、0.4394,表明具有良好的多态性可用于香蕉的标记。基因差异分化系数Gst=0.8993,说明不同香蕉品种之间发生了较大的变异分化。研究表明SCoT分子标记可以应用于香蕉的遗传多样性分析。 展开更多
关键词 香蕉 体系优化 scot分子标记 遗传多样性分析
原文传递
天然气净化厂SCOT尾气处理装置运行及优化
8
作者 罗威 王敏 +3 位作者 龙德林 丁大林 庞增诚 杨斌 《石油与天然气化工》 北大核心 2025年第4期29-35,共7页
目的中国石油西南油气田公司川中油气矿磨溪天然气净化厂现有两套硫磺回收装置,分别采用MCRC和CPS工艺,硫回收率分别为99.0%和99.2%,需进一步提高装置硫回收率,使排放烟气中SO2质量浓度达到GB 39728—2020《陆上石油天然气开采工业大气... 目的中国石油西南油气田公司川中油气矿磨溪天然气净化厂现有两套硫磺回收装置,分别采用MCRC和CPS工艺,硫回收率分别为99.0%和99.2%,需进一步提高装置硫回收率,使排放烟气中SO2质量浓度达到GB 39728—2020《陆上石油天然气开采工业大气污染物排放标准》的要求。方法在现有硫磺回收装置的基础上新建一套SCOT尾气处理装置,并结合装置试运行的情况,对影响装置操作稳定性、总硫回收率和污染物排放全时段达标的关键问题进行了分析,针对加氢反应器余热锅炉管壳程窜漏、再生塔频繁拦液等问题归纳了所采取的改造和优化措施。结果新建SCOT尾气处理装置性能考核结果表明:装置总硫回收率达到99.96%,加氢催化剂SO2转化率≥99.9%,加氢催化剂有机硫水解率约93.4%,排放烟气中SO2质量浓度平均值为164.2 mg/m^(3),贫液中H_(2)S质量浓度平均值为0.14 g/L,考核结果均优于设计值。结论新建尾气处理装置运行平稳,可为同类装置提供参考。 展开更多
关键词 天然气净化厂 硫磺回收 尾气处理 达标排放 MCRC CPS scot 除硫
在线阅读 下载PDF
SCoT标记分析汉中秦岭地区红豆杉遗传多样性
9
作者 程文娜 魏丽娜 +4 位作者 胡佳 邓茜茜 李丽 钱拴提 蒋景龙 《陕西理工大学学报(自然科学版)》 2025年第5期18-24,72,共8页
以陕西省汉中市5个县的11个群体76份红豆杉样本为对象,基于15条ScoT引物分析红豆杉种质资源遗传多样性和群体结构,以期为汉中秦岭地区红豆杉的区域性保护和种质资源有效开发利用提供理论依据。结果表明:(1)位点水平上红豆杉遗传多样性较... 以陕西省汉中市5个县的11个群体76份红豆杉样本为对象,基于15条ScoT引物分析红豆杉种质资源遗传多样性和群体结构,以期为汉中秦岭地区红豆杉的区域性保护和种质资源有效开发利用提供理论依据。结果表明:(1)位点水平上红豆杉遗传多样性较低(Na=1.96,Ne=1.49,H=0.30,I=0.46);(2)聚类分析将位点水平的红豆杉供试材料分为4组,与群体结构分析结果(K=4)基本一致;(3)11个群体红豆杉遗传多样性较低(Na=1.52,Ne=1.30,H=0.18,I=0.37)且遗传变异主要来自群体内(79%);(4)11个群体聚类为4组,略阳县郭镇(GZ)群体与留坝县4个群体聚为一组,勉县群体与佛坪县2个群体聚集为一组,与主坐标分析(PCoA)结果聚集一致。上述结果表明汉中秦岭地区红豆杉遗传多样性较为狭窄,建议对汉中秦岭地区红豆杉开展就地保护以及构建多资源种质资源库,为红豆杉可持续开发提供科学保障。 展开更多
关键词 红豆杉 遗传多样性 汉中市 scot分子标记 群体结构
在线阅读 下载PDF
巴戟天种质资源SCoT分子标记遗传多样性分析
10
作者 王素娥 张超裕 +3 位作者 黄雪慧 卢雪雪 张淼 田慧 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第11期31-38,共8页
为研究巴戟天种质资源遗传多样性,采用SCoT分子标记对广东、广西、福建及海南4个省份的32个居群共183份样本进行PCR扩增、聚类分析和mantel检验。结果表明,共扩增获得107条清晰条带,其中101条为多态性条带,多态性比率达94.39%。在物种... 为研究巴戟天种质资源遗传多样性,采用SCoT分子标记对广东、广西、福建及海南4个省份的32个居群共183份样本进行PCR扩增、聚类分析和mantel检验。结果表明,共扩增获得107条清晰条带,其中101条为多态性条带,多态性比率达94.39%。在物种水平上,有效等位基因数(Ne)为1.685 3,Nei's基因多样性指数(H)为0.374 2,Shannon's信息指数(I)为0.541 7,巴戟天野生居群的平均遗传多样性指数(0.252 1)大于栽培居群(0.222 3),广东省阳江市、福建省平和县居群的遗传多样性较高。居群总基因多样性(H_t)值为0.372 1,居群内基因多样性(Hs)值为0.234 4,居群间遗传分化系数(Gst)值为0.370 0,基因流Nm值为0.851 2<1。聚类分析结果显示,在遗传相似度为0.79时,32个巴戟天居群聚为2组,5个海岛居群聚为一支,27个内陆居群聚为一支。mantel检验结果显示,遗传距离与地理距离具有显著相关性(P<0.05)。综上,SCoT分析揭示出不同居群巴戟天均具有丰富的遗传多样性,野生种质居群遗传多样性较高,巴戟天居群的遗传变异受产地因素、种质的影响。本研究评估了不同居群与不同种质巴戟天居群间的亲缘关系,为巴戟天良种选育及质量研究提供科学依据。 展开更多
关键词 巴戟天 种质资源 scot 遗传多样性 聚类分析 mantel检验
在线阅读 下载PDF
Properties of ions may explain elemental stoichiometry in late-and early-wood:a case study in Scots pine tree rings
11
作者 Vladimir L.Gavrikov Ruslan A.Sharafutdinov +1 位作者 Alexey I.Fertikov Eugene A.Vaganov 《Journal of Forestry Research》 2025年第1期493-504,共12页
Understanding why elements are distributed in tree xylem in a particular way is a significant challenge in dendrochemistry.This study explored a hypothesis that metal elements in the xylem interact due to differences ... Understanding why elements are distributed in tree xylem in a particular way is a significant challenge in dendrochemistry.This study explored a hypothesis that metal elements in the xylem interact due to differences in physical properties such as ionic radius and ionization potential.Scots pine in an even-aged stand established during the early 1970s in eastern Siberia was the study species.Increment cores were taken from the north and south sides of trees and scanned with an X-ray fluorescent multi scanner.With the help of X-ray scanning,the following elements were analyzed:aluminum(Al),potassium(K),calcium(Ca),titanium(Ti),manganese(Mn),iron(Fe),copper(Cu),strontium(Sr)and zinc(Zn).Scanning data on the elements were split into early-wood and late-wood data for each year of growth.The following ratios were analyzed:Ca/Sr,Fe/Ca,Fe/Sr,Al/Cu,Al/Zn,Ti/Mn,and Mn/K.Among these,ones having a consistent pattern across tree rings,the ratios show a more or less dependable relationship:that an element shows a larger decrease(relative another element)that has a larger ionic radius and lower ionization potential.Hypothetically,this may be due to the advantage of an ion with smaller ionic radius and higher ionization potential under a deficit of accommodation centers in organic molecules.An experiment approach should be applied to clarify the relationships. 展开更多
关键词 Dendrochemistry Tree rings Early-wood Late-wood scots pine
在线阅读 下载PDF
Restoration of natural herbaceous vegetation and spatial variability of forest structure by gradual removal of Scots pine from former plantations
12
作者 Remigiusz Pielech Adrian Wysocki +4 位作者 Kacper Foremnik Marek Malicki Bartłomiej Surmacz Jerzy Szwagrzyk Zbigniew Maciejewski 《Forest Ecosystems》 2025年第2期287-299,共13页
We tested the effectiveness of the gradual removal of Scots pine(Pinus sylvestris L.)in former plantations of this species in Roztocze National Park(SE Poland)to support the restoration of natural herbaceous flora and... We tested the effectiveness of the gradual removal of Scots pine(Pinus sylvestris L.)in former plantations of this species in Roztocze National Park(SE Poland)to support the restoration of natural herbaceous flora and forest structure.We compared 0.5-ha study plots subjected to selective removal of pine trees with control plots excluded from any kind of human intervention for half a century.The observed changes in forest floor vegetation in the converted plots showed naturalization towards habitat-specific species.However,differences in the spatial distribution of trees between the treatment and control plots showed no universal pattern and revealed subtle but positive shifts from regular to random or clustered patterns.The mean tree diameters were higher in plots subjected to Scots pine removal,which resulted from the vigorous growth of tree species,consistent with habitat types.We conclude that forest restoration through the removal of planted trees can support the naturalization of former Scots pine plantations in protected areas.However,the selection of an appropriate method and its intensity are of vital importance.Methods that resemble typical management practices,such as selection thinning,are not always the best approach,as they may preserve or even increase the regular distribution of trees.Therefore,for restoration purposes,we recommend testing other methods that increase spatial heterogeneity,including systematic cutting or emulating natural disturbances.In addition,low-intensity thinning may not be sufficient to support the restoration of natural forest floor vegetation and the variability in forest stand structure. 展开更多
关键词 Forest conversion Forest structure National park Pinus sylvestris Spatial patterns scots pine Herbaceous vegetation RESTORATION
在线阅读 下载PDF
龙眼24个品种的SCoT遗传多样性分析 被引量:76
13
作者 陈虎 何新华 +2 位作者 罗聪 朱建华 李峰 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1651-1654,共4页
利用SCoT标记对24份龙眼品种资源进行了检测。从80条引物中筛选出24条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出211条带,其中181条具有多态性,多态性带比率为85.8%。24个龙眼品种间遗传相似系数在0.65~0.86之间,说明SCoT标记能够... 利用SCoT标记对24份龙眼品种资源进行了检测。从80条引物中筛选出24条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出211条带,其中181条具有多态性,多态性带比率为85.8%。24个龙眼品种间遗传相似系数在0.65~0.86之间,说明SCoT标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将24份龙眼品种完全区分开,并分成两类。 展开更多
关键词 龙眼 scot 遗传多样性
原文传递
41份葡萄种质遗传多样性的ISSR和SCoT对比分析 被引量:19
14
作者 王发明 李洁维 +4 位作者 叶开玉 龚弘娟 莫权辉 蒋桥生 刘平平 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-8,共8页
对收集于广西桂林的17份野生毛葡萄种质和24份栽培葡萄种质,分别使用12条ISSR和12条SCoT引物进行了遗传多样性和亲缘关系检测。结果表明:两种分子标记均能产生较丰富的多态性片段,可有效应用于葡萄的遗传多样性检测,但在聚类分析结果上... 对收集于广西桂林的17份野生毛葡萄种质和24份栽培葡萄种质,分别使用12条ISSR和12条SCoT引物进行了遗传多样性和亲缘关系检测。结果表明:两种分子标记均能产生较丰富的多态性片段,可有效应用于葡萄的遗传多样性检测,但在聚类分析结果上表现出一定的差异性,SCoT分子标记能更好地区分野生种质和栽培品种,说明SCoT分子标记在葡萄遗传多样性检测和系统进化研究上可能更有优势。从SCoT聚类结果上看,广西植物研究所收集的3个野生毛葡萄种质zws1、zws2和zws3相对其它野生种质而言,更偏向于与栽培种质聚为一类,说明这一类野生毛葡萄可能是这些栽培品种的原始亲本来源之一。不同的野生种质聚为多个类群,并表现出明显的地域特性,但遗传距离相对较远,说明桂林野生毛葡萄资源具有丰富的遗传变异。栽培品种没有明显的聚类特点,可能因为所选用的栽培品种的地域代表性并不是很强,也可能是因为栽培品种在不断的人工杂交选育过程中,遗传背景趋向一致,遗传多样性降低。该研究证明SCoT分子标记在葡萄遗传多样性研究上具有一定的优势。该研究结果为桂林毛葡萄资源的保护、利用和品种选育提供了理论依据,也为葡萄的系统进化研究提供了参考。 展开更多
关键词 葡萄 毛葡萄 遗传多样性 ISSR scot
在线阅读 下载PDF
目标起始密码子多态性(SCoT):一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术 被引量:98
15
作者 熊发前 唐荣华 +2 位作者 陈忠良 潘玲华 庄伟建 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第3期635-638,共4页
随着功能基因组学的发展,分子标记领域已开始从传统的随机或匿名性分子标记转向目的基因标记和功能性标记。目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)标记是一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术,具有操作简... 随着功能基因组学的发展,分子标记领域已开始从传统的随机或匿名性分子标记转向目的基因标记和功能性标记。目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)标记是一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术,具有操作简单、重复性好等特点,根据ATG翻译起始位点侧翼保守序列来设计单引物,扩增产生偏向候选功能基因区显性多态性标记,适合不同层次实验室的不同领域的广泛应用,SCoT标记已开始在水稻和花生上得到运用。本文旨在介绍给研究者一种可以作为传统的RAPD、ISSR标记有效补充的目的基因标记新技术,希望其广泛的应用于生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状标记等方面。 展开更多
关键词 scot标记技术 基因目的标记 功能性标记 单引物扩增反应
在线阅读 下载PDF
草莓属植物SCoT分析体系的建立及优化 被引量:36
16
作者 秦国新 何桥 +2 位作者 梁国鲁 雷家军 郭启高 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期393-397,共5页
为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·... 为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(56)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg2+2.0 mmol·L-1、dNTPs 0.3 mmol·L-1、Taq酶0.75 U、引物0.75μmol·L-1、模板DNA 40 ng,并对退火温度进行了优化,对电泳检测方法及草莓属植物DNA提取方法进行了改进。共筛选出22个适于进行草莓属植物SCoT分析的引物。经验证,该反应体系稳定性好、可重复性强、多态性高、扩增效果好,适于草莓属植物的SCoT分析。 展开更多
关键词 草莓属 scot 体系优化
在线阅读 下载PDF
基于SCoT标记的栽培栀子种质资源遗传多样性研究 被引量:17
17
作者 潘媛 陈大霞 +2 位作者 宋旭红 王钰 李隆云 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第14期3376-3381,共6页
目的利用SCoT标记对47份栀子种质资源的亲缘关系及遗传多样性进行了研究。方法采用NTSYS version 2.1软件计算遗传相似性系数,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果从36条引物中筛选出20条多态性丰富的引物对供试材料进行PCR扩增,共获得154... 目的利用SCoT标记对47份栀子种质资源的亲缘关系及遗传多样性进行了研究。方法采用NTSYS version 2.1软件计算遗传相似性系数,利用UPGMA法构建聚类树状图。结果从36条引物中筛选出20条多态性丰富的引物对供试材料进行PCR扩增,共获得154条谱带,其中多态性条带120条,多态性条带所占的比率(PPL)达78.14%,Nei-Li相似系数(GS)在0.655 8~0.980 5,平均值为0.784 1;聚类结果显示栀子遗传多样性丰富且亲缘关系复杂。结论研究表明SCoT标记技术可以很好地应用于栀子种质资源的遗传多样性分析,研究结果可为栀子育种、分类、保存和利用提供可靠的理论依据。 展开更多
关键词 scot 栀子 遗传多样性 PCR扩增 UPGMA法
原文传递
濒危药用植物桃儿七野生居群遗传多样性与遗传结构的SCoT分析 被引量:18
18
作者 陈大霞 赵纪峰 +4 位作者 刘翔 王昌华 张植伟 秦松云 钟国跃 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期278-283,共6页
目的:揭示珍稀濒危药用植物桃儿七的遗传多样性水平及居群遗传结构特点。方法:采用新型分子标记SCoT对来源于我国的6个桃儿七野生居群共45个个体进行遗传多态性检测。运用POPGENE软件计算相关遗传参数,UPGMA方法聚类,结合MEGA5软件生成... 目的:揭示珍稀濒危药用植物桃儿七的遗传多样性水平及居群遗传结构特点。方法:采用新型分子标记SCoT对来源于我国的6个桃儿七野生居群共45个个体进行遗传多态性检测。运用POPGENE软件计算相关遗传参数,UPGMA方法聚类,结合MEGA5软件生成树状图。结果:筛选出的27条引物,共检测到350个位点,其中284个为多态位点,平均每条引物扩增所得多态条带为10.52条。物种水平上,桃儿七6个野生居群的遗传多样性较为丰富,PPB 79.27%,Ne1.332 7,H 0.210 9,Hsp0.328 6。在居群水平上,遗传多样性水平较低:PPB 10.48%(4.00%~23.71%),Ne1.0487(1.020 7~1.1037),H 0.029 7(0.012 9~0.063 1),Hpop0.046 2(0.019 9~0.098 6)。Nei's基因多样性指数计算的居群间遗传分化系数Gst=0.841 1与Shannon's居群分化系数(Hsp-Hpop)/Hsp=0.849 4基本一致,均说明大部分遗传变异存在于居群间。基因流Nm=0.094 4,表明桃儿七居群间基因交流处于低等水平。Nei's遗传一致度(I)范围为0.570 8~0.978 7。聚类分析将供试居群分为2类,相同地理来源或相似生境的材料具有聚为一类的倾向。结论:供试野生桃儿七具有较丰富的遗传多样性,为有效保护和改良种质资源奠定了一定的基础。 展开更多
关键词 桃儿七 scot 遗传多样性 遗传结构
原文传递
SCoT分子标记技术在丝瓜上的应用 被引量:19
19
作者 蒋雅琴 黎炎 +3 位作者 李文嘉 吴永官 王益奎 康德贤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2117-2122,共6页
【目的】采用SCo T分子标记技术分析丝瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为丝瓜种质资源的利用和品种选育提供参考。【方法】采用80条引物和SCo T-PCR对81份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在优化的SCo T-PCR反应... 【目的】采用SCo T分子标记技术分析丝瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为丝瓜种质资源的利用和品种选育提供参考。【方法】采用80条引物和SCo T-PCR对81份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在优化的SCo T-PCR反应体系基础上,从80条引物中筛选获得10条多态性丰富、重复性好的引物,每条引物扩增获得10-17条100-2100 bp的条带;10条引物共扩增获得140条带,其中多态性条带124条,多态性比例87.57%。81份丝瓜种质材料的遗传相似系数在0.5900-0.9200,在0.5900处可将所有供试材料划分为两大类,第Ⅰ类包括46份有棱丝瓜材料,第Ⅱ类包括35份普通丝瓜材料,广西和广东的丝瓜种质材料主要聚在第Ⅰ类。在遗传相似系数0.7200和0.7900处,第Ⅰ、Ⅱ大类丝瓜材料均可划分为5个组,每组丝瓜材料主要来自相同地区。【结论】SCo T分子标记可作为ISSR、SRAP等标记的有效补充,为丝瓜种质资源的研究提供简单、可靠的工具。 展开更多
关键词 丝瓜 种质资源 遗传多样性 亲缘关系 scot分子标记技术
在线阅读 下载PDF
猕猴桃SCoT遗传多样性分析及指纹图谱的构建 被引量:17
20
作者 张安世 张中海 +2 位作者 齐秀娟 刘莹 骆扬 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期259-265,共7页
利用SCoT标记对32个猕猴桃品种进行了遗传多样性分析。从47个SCoT引物中筛选了11个引物进行PCR扩增,共扩增出185个条带,其中多态性条带180个,多态性比率为97.30%。各引物Nei’s基因多样性指数(H)平均为0.238 4,Shannon’s信息指数(I)平... 利用SCoT标记对32个猕猴桃品种进行了遗传多样性分析。从47个SCoT引物中筛选了11个引物进行PCR扩增,共扩增出185个条带,其中多态性条带180个,多态性比率为97.30%。各引物Nei’s基因多样性指数(H)平均为0.238 4,Shannon’s信息指数(I)平均为0.377 8。利用UPGMA构建32份猕猴桃种质资源的聚类树状图。在遗传相似系数为0.78处可将32个猕猴桃品种分为5组,聚类结果与形态学分类基本一致。利用4条引物扩增的16个多态性位点构建了32个猕猴桃品种的DNA指纹图谱,可以将32个猕猴桃品种区分并准确鉴定。 展开更多
关键词 猕猴桃 scot DNA指纹图谱 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 22 下一页 到第
使用帮助 返回顶部