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SBPS对CTX增效减毒作用及其免疫学机制的研究 被引量：3
1
作者 宋高臣 王桂云 +1 位作者 董琦 金秀东 《中国普通外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期279-281,共3页
目的探讨半枝莲多糖(SBPS)对化疗药物环磷酰胺(CTX)的增效减毒作用及其机制。方法采用移植性H22肝癌小鼠,随机分为阴性对照组,CTX处理组,CTX+SBPS联合用药组。连续给药10 d后,测定其抑瘤率、白细胞数、吞噬指数和IL-2活性。结果SBPS能提... 目的探讨半枝莲多糖(SBPS)对化疗药物环磷酰胺(CTX)的增效减毒作用及其机制。方法采用移植性H22肝癌小鼠,随机分为阴性对照组,CTX处理组,CTX+SBPS联合用药组。连续给药10 d后,测定其抑瘤率、白细胞数、吞噬指数和IL-2活性。结果SBPS能提高CTX的抑瘤率,减轻CTX的毒副作用,提高单核吞噬细胞功能和IL-2及TNF-α的活性。结论SBPS对化疗药物CTX具有明显的增效减毒作用,其机制可能是通过增强机体的免疫功能而实现的。 展开更多
关键词 肝肿瘤/药物疗法 sbps 环磷酰胺 增效减毒 免疫功能 IL-2 TNF-α
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糜子SBP基因家族鉴定及在籽粒稃壳色形成中的表达分析 被引量：1
2
作者 郝子义 刘天鹏 +6 位作者 何继红 董孔军 任瑞玉 张磊 韦恒 李亚伟 杨天育 《甘肃农业大学学报》 北大核心 2025年第4期65-77,共13页
【目的】了解糜子SBP基因家族及在其籽粒稃壳色形成中的表达特征。【方法】采用生物信息学方法,全基因组鉴定了含有SBP结构域的SBP基因家族成员,并进一步分析了其染色体分布、蛋白理化性质、系统进化关系、基因结构、保守结构域、启动... 【目的】了解糜子SBP基因家族及在其籽粒稃壳色形成中的表达特征。【方法】采用生物信息学方法,全基因组鉴定了含有SBP结构域的SBP基因家族成员,并进一步分析了其染色体分布、蛋白理化性质、系统进化关系、基因结构、保守结构域、启动子区域的顺式作用元件及在糜子白、黄、褐籽粒稃壳色形成中的表达特征。【结果】糜子含有38个SBP基因,不均匀的分布在18条染色体上,PmSBP蛋白的氨基酸序列长度为122-1109aa,等电点为5.49-10.32,家族成员含有1-11个外显子,亚细胞定位于细胞核、叶绿体中。糜子38个SBP基因的蛋白聚类分析显示,该蛋白家族可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ5个亚家族,亚家族Ⅲ成员具有相对复杂的结构。顺式作用元件分析显示,在糜子SBP家族基因存在共同的顺式作用元件,如光响应、激素响应、分生组织表达和调控种子特异性等。白、黄、褐色籽粒品种晋黍8号、陇糜12号和张778稃壳色形成期转录组及qRT-PCR分析显示,糜子SBP基因家族成员中PmSBP33、PmSBP8、PmSBP17、PmSBP37、PmSBP12、PmSBP14、PmSBP1、PmSBP7、PmSBP23和PmSBP16在3个品种籽粒中的表达量较高,且品种间表达量差异显著。通过与谷子、拟南芥和水稻同源基因比对,推测PmSBP1和PmSBP7与糜子籽粒发育相关。【结论】鉴定出38个糜子SBP基因家族成员,在糜子籽粒稃壳中的表达量差异明显,且PmSBP1和PmSBP7与糜子籽粒形态建成密切相关。 展开更多
关键词 糜子 SBP基因家族 转录因子 生物信息学分析 表达特征
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鼓槌石斛SBP基因家族全基因组鉴定与生物信息学分析
3
作者 董蓉娇 李泽生 +4 位作者 姚志军 贾敏 罗凯 高燕 李桂琳 《西南农业学报》 北大核心 2025年第9期1822-1831,共10页
【目的】鉴定和分析鼓槌石斛全基因组中SBP转录因子家族,为后续深入研究SBP转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法从鼓槌石斛全基因组中筛选鉴定出SBP基因家族成员,并对其蛋白理化特性、亚细胞定位、蛋白质空间结... 【目的】鉴定和分析鼓槌石斛全基因组中SBP转录因子家族,为后续深入研究SBP转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法从鼓槌石斛全基因组中筛选鉴定出SBP基因家族成员,并对其蛋白理化特性、亚细胞定位、蛋白质空间结构、蛋白磷酸化修饰位点、染色体定位、保守结构域与保守基序、系统发育树、启动子顺式作用元件等进行系统分析。【结果】鼓槌石斛基因组中鉴定出15个SBP基因,不均匀分布在10条染色体上,氨基酸数量为219~1086 aa,等电点为5.37~9.63,相对分子质量为24480.53~119978.42 Da,不稳定系数为44.54~74.10,脂肪系数为52.65~81.42,总平均亲水性为-0.787~0.575。亚细胞定位预测结果显示,基因家族成员中3个定位在细胞质上,15个定位在细胞核上;蛋白质二级结构以规则的α-螺旋和松散的无规则卷曲为主要构成,而三级结构整体相似度较低,空间构象更复杂;蛋白磷酸化修饰位点为21~134个;家族成员均具备高度保守的SBP结构域,由2个锌指结构模块和1个核定位信号序列构成;不同SBP基因家族成员之间所含基序(Motif)不同,聚类关系较近基因的基序相似,基序数量为2~7个;鼓槌石斛、拟南芥和水稻51个SBP蛋白被划分为11个亚族,15个鼓槌石斛SBP蛋白分布于8个亚族中;SBP基因启动子区域检测到光响应、激素响应及逆境胁迫响应等22类不同顺式作用元件;SBP基因在鼓槌石斛根和茎中表达量相对较低,在叶片和花中表达量相对较高,同一亚族基因表达模式相似。【结论】SBP基因家族成员理化性质差异较大,划分为8个系统发育亚族,同一亚族结构域和基序保守性极强,启动子区主要包含光响应、激素类响应及逆境胁迫响应等顺式作用元件,SBP基因在不同组织中差异化表达,可能在鼓槌石斛叶片和花器官生长发育方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 鼓槌石斛 SBP 基因家族 生物信息学 保守结构域
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3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析
4
作者 付丽枝 杨涌 +3 位作者 于克妍 于立洋 王旋 张海娥 《山东农业科学》 北大核心 2025年第5期36-45,共10页
SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子。本研究从3种栗属植物中鉴定到58个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析。结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成... SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子。本研究从3种栗属植物中鉴定到58个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析。结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成员在染色体上呈非均匀分布,其中3个SBP基因未被组装到染色体的大片段中。进化树分析发现栗属植物SBP基因家族可以分为7个小组,小组5中发生了基因的丢失和扩增。Motif分析发现所有SBP基因家族成员都包含保守的Motif1或Motif2。共线性基因对的Ka/Ks分析发现,SBP基因家族成员在栗属植物基因组内及组间正在经历纯化选择。转录组数据分析发现CmSBP基因家族在不同时期中国板栗芽与果实中的表达量变化明显。本研究结果可为后续栗属植物SBP基因功能研究提供理论基础。 展开更多
关键词 栗属植物 SBP基因家族 选择压力 生物信息学分析 表达分析
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半枝莲多糖协同环磷酰胺治疗肝癌的作用机制研究 被引量：15
5
作者 宋高臣 徐薇 +2 位作者 张杰 冯克俭 朱旭东 《中医药学报》 CAS 2010年第4期48-50,共3页
目的:探讨半枝莲多糖(SBPS)对化疗药物(CTX)的增效减毒作用及其作用机制。方法:采用移植性H22肝癌小鼠,随机分为阴性对照组、CTX组和联合用药组。连续给药10d后,测定其抑瘤率、WBC数、吞噬指数和IL-2活性。结果:SBPS能提高CTX的抑瘤率,... 目的:探讨半枝莲多糖(SBPS)对化疗药物(CTX)的增效减毒作用及其作用机制。方法:采用移植性H22肝癌小鼠,随机分为阴性对照组、CTX组和联合用药组。连续给药10d后,测定其抑瘤率、WBC数、吞噬指数和IL-2活性。结果:SBPS能提高CTX的抑瘤率,能减轻CTX的毒副作用,并能提高单核吞噬细胞功能和IL-2、TNF-α活性。结论:SBPS对化疗药物CTX具有明显的增效减毒作用,可能是通过增强机体的免疫功能实现的。 展开更多
关键词 sbps 环磷酰胺 增效减毒 免疫功能 IL-2 TNF-Α
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常用缩略语汇总
6
《临床研究》 2025年第6期23-23,共1页
世界卫生组织(WHO)中国医院协会(CHA)美国疾病控制中心(CDC)美国麻醉医师学会(ASA)围手术注册护士协会(AORN)疾病控制中心(CDC)收缩压变异(SPV)脉压变异(PPV)每博量变异(SVV)心输出量(CO)每博输出量(SV)心率(HR)新搏指数(SI)心脏指数(CI... 世界卫生组织(WHO)中国医院协会(CHA)美国疾病控制中心(CDC)美国麻醉医师学会(ASA)围手术注册护士协会(AORN)疾病控制中心(CDC)收缩压变异(SPV)脉压变异(PPV)每博量变异(SVV)心输出量(CO)每博输出量(SV)心率(HR)新搏指数(SI)心脏指数(CI)心电图(ECG)收缩压(SBP)舒张压(DBP)血压(BP)平均动脉压(MAP)中心静脉压(CVP)体质量指数(BMI)左室射血时间(LVRT)左心室射血分数(LVEF)左心室收缩压(LVSP)左心室舒张末压(LVEDP)左心室舒张压(LVDP)肺动脉压(PAP)肺毛细血管楔压(PCWP)。 展开更多
关键词 SPV DBP CDC AORN LVSP SV SBP LVEDP
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葡萄SBP基因家族生物信息学分析 被引量：23
7
作者 曹雪 上官凌飞 +4 位作者 于华平 杨光 王晨 谭洪花 房经贵 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期791-798,共8页
SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分... SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分子生物学研究的重点对象,进行葡萄基因组信息挖掘与分析对于葡萄功能基因组学的发展具有重要意义。本文利用生物信息学方法对葡萄家族45条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显示这45条蛋白序列与拟南芥16个SBP基因蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与葡萄SBP基因间具有较高的保守性;进一步的基因组定位结果发现其分布在14条染色体上,较拟南芥在染色体上的分布更为分散。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而二级结构预测结果发现,41条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,这与拟南芥相似,且45条氨基酸序列三维结构十分相似。本文实验结果均为葡萄SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。 展开更多
关键词 葡萄 拟南芥 SBP基因家族 生物信息学
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高粱SBP-box基因家族全基因组鉴定及表达分析 被引量：21
8
作者 常建忠 闫凤霞 +3 位作者 乔麟轶 郑军 张福耀 柳青山 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期569-580,共12页
SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量、株型、抗逆性等,具有重要的实际应用价值。本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)... SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量、株型、抗逆性等,具有重要的实际应用价值。本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域。系统发育分析表明高粱SBP-box基因家族可分为6个亚家族,其中Sb SBP12、Sb SBP3和Sb SBP15分别与玉米Zm LG1、Zm TGA1和Zm UB2/3直系同源。基于RNA-seq数据的表达分析发现高粱SBP-box基因在花序原基中表达量最高,Sb SBP9和Sb SBP17为花序原基特异表达基因,Sb SBP5、Sb SBP8和Sb SBP18等基因受外源ABA和PEG胁迫上调表达,表明SBP-box基因可能参与高粱对非生物逆境的响应。本研究为高粱SBP-box家族重要基因的克隆提供了参考,相关基因可作为高粱遗传改良的候选基因。 展开更多
关键词 高粱 SBP—box基因家族 系统进化分析 表达分析
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番茄SBP基因家族的全基因组鉴定、结构特征及表达分析 被引量：12
9
作者 万红建 袁伟 +8 位作者 俞锞 刘云飞 李志邈 叶青静 王荣青 阮美颖 周国治 姚祝平 杨悦俭 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期299-306,共8页
SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转录因子家族,分析其结构特征,系统发育关系以及表达模式。结... SBP基因家族是植物中一类特有的转录因子家族,广泛参与植物的生长发育以及各种生理生化反应的信号传导。为了揭示番茄SBP基因家族的功能,本研究利用全基因组信息鉴定番茄SBP转录因子家族,分析其结构特征,系统发育关系以及表达模式。结果表明,番茄全基因组共编码17个SBP转录因子成员,分布在8条染色体上;系统发育关系表明SBP基因家族的结构特征变异发生在番茄、拟南芥和水稻分化之前;且它们在番茄、拟南芥和水稻中按照物种特异性的方式进行了扩张。不同芯片分析发现,SlSBP03基因在番茄叶片、子叶和下胚轴中表达量较高,SlSBP13基因果肉中表达量较高,这两个基因在果皮和根中表达量都较低;在大多数非生物胁迫处理条件下,SlSBP11、SlSBP13和SlSBP16的表达量均较低;而SlSBP01基因在干旱和热处理条件下有较高的表达量。 展开更多
关键词 番茄 SBP基因家族 生物信息学 水稻 拟南芥
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代谢综合征肾脏损害及其相关因素的研究 被引量：10
10
作者 金玉华 祝之明 +1 位作者 周方明 赵志钢 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第19期1768-1770,共3页
目的　研究代谢综合征 (metabolicsyndrome ,MS)患者肾脏损害的特征及其相关因素。方法　 3 3 4例患者分为高血压组 (EH)、糖尿病组 (DM)和MS组 ,比较 3组患者的肾功能指标及相关因素。结果　MS组尿微量蛋白 (mioroalbumin uria ,MA)高... 目的　研究代谢综合征 (metabolicsyndrome ,MS)患者肾脏损害的特征及其相关因素。方法　 3 3 4例患者分为高血压组 (EH)、糖尿病组 (DM)和MS组 ,比较 3组患者的肾功能指标及相关因素。结果　MS组尿微量蛋白 (mioroalbumin uria ,MA)高于EH组和DM组 ,内生肌酐清除率 (ereatinineelearaneerate ,Ccr)低于EH组和DM组 (P <0 .0 5 ) ;相关分析表明 ,MS组中MA与年龄、收缩压 (SBP)、脉压 (PP)、高血压病程、糖尿病病程、尿酸有不同程度的正相关 ,Ccr与年龄、收缩压、脉压、高血压病程、糖尿病病程、血糖有不同程度的负相关 (P <O .0 5 )。EH组MA和Ccr与上述因素无显著相关 ,而DM组仅血糖水平与MA显著相关。结论　多种心血管危险因素聚集对MS患者肾功能损害有显著的影响。 展开更多
关键词 EH 患者 相关因素 肾脏损害 DM MS 代谢综合征 MA SBP 聚集
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动态血压变化与高血压病靶器官损害的关系研究 被引量：12
11
作者 冯缨缨 孙宜萍 +2 位作者 王蓓芸 崔亮 梁瑞廉 《中国全科医学》 CAS CSCD 2004年第21期1605-1606,共2页
目的　研究高血压病患者血压节律变化与心、脑、肾等靶器官损害的关系。方法　 118例高血压病患者分为两组 ,血压节律正常 (勺型组 ) 6 6例 ,血压节律异常 (非勺型组 ) 5 2例 ,对两组的血压均值和心、脑、肾靶器官损害程度进行比较。结... 目的　研究高血压病患者血压节律变化与心、脑、肾等靶器官损害的关系。方法　 118例高血压病患者分为两组 ,血压节律正常 (勺型组 ) 6 6例 ,血压节律异常 (非勺型组 ) 5 2例 ,对两组的血压均值和心、脑、肾靶器官损害程度进行比较。结果　非勺型组的d -DBP、n -SBP、n -DBP、SBP -L、DBP -L与勺型组间差异有显著性意义(P <0 0 5 ) ,而 2 4h-SBP、 2 4h-DBP、d -SBP差异无显著性意义 (P >0 0 5 )。非勺型组的左室重量指数 (LVMI)、左室肥厚 (LVH)发生率、心律失常及心肌劳损检出率、脑血管损害发生率、尿微蛋白阳性率、血尿酸值及血肌酐值与勺型组间差异有显著性意义 (P <0 0 5 )。结论　非勺型高血压患者较勺型有显著的靶器官损害 ,因此 。 展开更多
关键词 靶器官损害 血压节律 高血压病 SBP 动态血压变化 患者 发生率 显著性 结论 意义
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玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析 被引量：11
12
作者 彭华 何秀静 +3 位作者 高健 罗茂 潘光堂 张志明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期201-211,共11页
SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知... SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准从玉米基因组中挖掘SBP转录因子,系统发育分析显示单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近;共鉴定37个SBP基因,分布在9条染色体上;通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且,玉米SBP转录因子可通过参与赤霉素、生长素、脱落酸、水杨酸等多条激素信号调控途径来调节植物的生长发育。 展开更多
关键词 玉米 SBP转录因子家族 生物信息学
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大豆SBP转录因子家族的预测分析 被引量：8
13
作者 朱命喜 刘洋 +4 位作者 吴琼 刘春燕 徐晶 陈庆山 胡国华 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期177-183,共7页
SBP转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性。该研究通过对拟南芥... SBP转录因子基因家族是一个植物的特异转录因子家族,SBP基因都含有一段保守的核苷酸序列即DNA结合结构域,又称为SBP盒(SBP-box),SBP盒编码的蛋白质序列称SBP结构域(SBP-domain),含79个氨基酸残基,并具有高度保守性。该研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与大豆基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准,共得到44条新的大豆SBP转录因子;又通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现这些转录因子参与生长发育、逆境胁迫响应、激素应答、抗霉菌应答、光合作用等调控过程。 展开更多
关键词 SBP家族 转录因子 大豆
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苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆 被引量：5
14
作者 张晓辉 魏小春 +10 位作者 李锡香 孙玉燕 王冠 常兆晶 刘冠群 邱杨 宋江萍 王海平 沈镝 王大江 韩月澎 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期215-226,共12页
从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因。通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果... 从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因。通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变。 展开更多
关键词 苹果 SBP box家族 分子进化 基因克隆
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草莓SBP基因家族生物信息学初步分析 被引量：9
15
作者 葛安静 张春华 +3 位作者 董清华 赵密珍 宋长年 张希 《中国农学通报》 CSCD 2012年第13期215-220,共6页
为了研究草莓SBP基因家族的功能,利用多种生物信息学软件,对SBP蛋白序列的系统发生和基因组定位进行分析,对其氨基酸组成成分、理化性质以及二、三级结构进行分析和预测等。结果表明草莓16条SBP蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起分成... 为了研究草莓SBP基因家族的功能,利用多种生物信息学软件,对SBP蛋白序列的系统发生和基因组定位进行分析,对其氨基酸组成成分、理化性质以及二、三级结构进行分析和预测等。结果表明草莓16条SBP蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与草莓SBP基因间具有较高的保守性。基因组定位发现16个SBP基因分布在6条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,而它们的二级结构主要以随机卷曲为主,三级结构相似。SBP基因家族在植物的生长、发育等多个方面起重要作用,笔者实验结果为草莓SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。 展开更多
关键词 草莓 拟南芥 SBP基因家族 生物信息学
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牛巴贝斯虫巢式PCR检测方法的建立 被引量：6
16
作者 孙明 王锦明 +7 位作者 刘爱红 刘志杰 聂英 魏华 李玉峰 殷宏 关贵全 罗建勋 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期183-189,共7页
为建立一种适用于基层兽医实验室特异、敏感、快速检测牛巴贝斯虫感染的方法,以牛巴贝斯虫球状体蛋白4(SBP4)基因为靶基因设计引物,建立检测牛巴贝斯虫的巢式PCR方法。结果表明,该方法可特异性地检测牛巴贝斯虫感染,与14种动物梨形虫无... 为建立一种适用于基层兽医实验室特异、敏感、快速检测牛巴贝斯虫感染的方法,以牛巴贝斯虫球状体蛋白4(SBP4)基因为靶基因设计引物,建立检测牛巴贝斯虫的巢式PCR方法。结果表明,该方法可特异性地检测牛巴贝斯虫感染,与14种动物梨形虫无交叉反应。该方法能够检测到1 copy的SBP4基因,其敏感性分别是对应的内、外引物普通PCR的10倍和1 000倍。应用该巢式PCR方法,对田间随机采集的136份野外样品进行检测,检出阳性样品9份,显著高于AbouLaila等报道的方法(5份)。这些数据表明,建立的巢式PCR方法可用于基层兽医实验室敏感、准确地检测牛巴贝斯虫感染。 展开更多
关键词 牛巴贝斯虫 巢式PCR SBP4基因
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比索洛尔和美托洛尔治疗原发性高血压的对比研究 被引量：11
17
作者 周淑娴 方昶 伍卫 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第B06期171-173,共3页
[目的]对比观察比索洛尔和美托洛尔治疗轻、中度原发性高血压患者的临床疗效与安全性。[方法]采用随机、 开放、平行对照方法,观察比索洛尔(n=20)每日2.5～7.5 mg或加双氢克尿噻12.5 mg,美托洛尔(n=20)每日50-150 mg 或加双氢克尿噻12.5... [目的]对比观察比索洛尔和美托洛尔治疗轻、中度原发性高血压患者的临床疗效与安全性。[方法]采用随机、 开放、平行对照方法,观察比索洛尔(n=20)每日2.5～7.5 mg或加双氢克尿噻12.5 mg,美托洛尔(n=20)每日50-150 mg 或加双氢克尿噻12.5 mg,治疗6周和8周的有效率及不良反应。[结果]两组治疗第2周开始平均收缩压(SBP)、舒张压 (DBP)和心率(HR)较治疗前均明显降低(P<0.01);在整个治疗期间血压和HR持续平稳下降,治疗后2～8周血压下降值 比索洛尔组为10.8／8.8～23.1／17.2 mmHg,美托洛尔组为10.7／9.3-16.4／14.2 mmHg;HR下降值比索洛尔组为5.5～ 9.6min-1,美托洛尔组为4.6～7.8 min-1,服药第6及8周比索洛尔组降低SBP优于美托洛尔组(P<0.01),DBP及心率的 变化两组间比较无明显差异(P>0.05)。比索洛尔和美托洛尔治疗8周降低血压的总有效率分别为95％和85％(P< 0.05),比索洛尔组提高疗效12％。[结论]比索洛尔是一种安全、有效、高选择性β1受体阻滞的长效降压药,副作用轻微,耐 受性好。 展开更多
关键词 治疗 比索洛尔 美托洛尔 双氢克尿噻 原发性高血压 心率 SBP DBP 高选择性 降低
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黄瓜SBP家族基因鉴定与表达分析 被引量：5
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作者 高东菊 张琴 +3 位作者 许太白 周鹏 成文竞 张微微 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第11期3542-3548,共7页
SQUAMOSA启动子结合蛋白家族(SBP家族)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法从黄瓜基因组中鉴定出15个SBP基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、系统进化以及不同组织中的表达进行了... SQUAMOSA启动子结合蛋白家族(SBP家族)是植物中特有的一类转录因子,在植物生长发育中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法从黄瓜基因组中鉴定出15个SBP基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、系统进化以及不同组织中的表达进行了分析。结果显示黄瓜15个CsSBP基因分布于4条染色体上,分为6个类群,同一个类群中的基因具有相似基因结构和保守基序。表达分析表明。CsSBP9、CsSBP12、CsSBP10、CsSBP3、CsSBP8和CsSBP7在所有组织中都有表达,其余基因在特定组织中表达量比较高,暗示SBP基因在黄瓜生长发育的不同阶段都扮演了重要角色。本研究为进一步鉴定黄瓜SBP基因功能奠定了一定基础。 展开更多
关键词 黄瓜 SBP 基因结构 基因表达
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普通烟草SBP转录因子家族的全基因组鉴定及其进化和表达分析 被引量：10
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作者 刘成 李晓旭 +1 位作者 苏玉龙 郭永峰 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2015年第4期1-11,共11页
SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利用普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,鉴定了普通烟草SBP转录因子家族成员;... SBP转录因子家族作为植物特异性的转录因子具有重要的生物学功能,广泛参与花和果实发育等诸多生命过程。利用普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90基因组数据,通过隐马尔科夫模型检索,SMART和Pfam分析,鉴定了普通烟草SBP转录因子家族成员;通过多序列比对鉴定并分析了普通烟草SBP结构域的结构特征;通过邻接法、极大似然法进行了系统发育分析;分别利用GSDS和MEME对SBP转录因子家族成员的基因结构和蛋白保守结构域进行了分析;利用普通烟草TN90转录组数据分析了SBP转录因子家族成员在不同组织和时期的表达情况,并对鉴定出的SBP转录因子家族成员进行了GO注释分析。结果表明,普通烟草基因组编码32个SBP转录因子家族成员,氨基酸序列长度差异较大;系统发育分析表明,所有的SBP转录因子家族成员可分为8个亚家族。转录组数据显示,SBP基因家族成员在不同组织和时期中表达迥异,但在花器官中均有较高的表达量。GO注释结果表明,该家族成员作为转录因子,在植物的生长发育、逆境响应等过程中发挥作用。本研究为烟草及其他植物中SBP转录因子家族基因的鉴定和功能研究提供了基础。 展开更多
关键词 生物信息学分析 SBP转录因子家族 普通烟草
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苹果SBP基因家族生物信息学分析 被引量：7
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作者 刘更森 慕茜 +2 位作者 戴洪义 上官凌飞 张玉刚 《江西农业学报》 CAS 2011年第12期23-27,共5页
首先利用生物信息学方法对苹果42条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显示着42条蛋白序列与... 首先利用生物信息学方法对苹果42条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显示着42条蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起被分成了7个亚族,拟南芥与苹果SBP基因间具有较高的保守性。基因组定位结果显示42条SBP基因分布在12条染色体上。研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异;二级结构预测分析发现,42条氨基酸序列以随机卷曲和α-螺旋为主要组成部分,而且42条氨基酸序列三维结构相似。 展开更多
关键词 苹果 SBP基因家族 氨基酸序列 生物信息学
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