目的本研究聚焦于组蛋白乙酰化调控因子影响胰腺癌耐药中的机制。方法从癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库获取胰腺癌患者的RNA测序数据和临床病理信息,进行共识聚类分析和基因集富集分析。在胰腺癌细胞系PANC-1中敲减...目的本研究聚焦于组蛋白乙酰化调控因子影响胰腺癌耐药中的机制。方法从癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库获取胰腺癌患者的RNA测序数据和临床病理信息,进行共识聚类分析和基因集富集分析。在胰腺癌细胞系PANC-1中敲减和过表达组蛋白去乙酰化酶5(histone deacetylase 5,HDAC5)和特殊富含AT序列结合蛋白1(special AT rich sequence binding protein 1,SATB1),检测细胞活力和基因表达。构建裸鼠皮下移植瘤模型,观察HDAC5和SATB1表达水平对肿瘤生长和化疗敏感性的影响。结果基于组蛋白乙酰转移酶(histone acetyltransferase,HAT)和HDAC家族基因表达水平,将胰腺癌样本聚类为C1和C2两个亚型,C1亚型预后较差且化疗耐药相关通路显著富集。HDAC5在化疗耐药胰腺癌细胞中低表达,与患者预后差相关,且其表达水平与其启动子区甲基化水平呈负相关。SATB1在胰腺癌中的表达与化疗耐药性相关,主要富集于细胞周期、DNA复制和修复等通路。筛选出TRMU、THOP1、DLGAP1、LIPH、PRR15、KLK11和EHF等HDAC5/SATB1下游基因,其表达水平与胰腺癌患者预后和化疗敏感性密切相关。体内外实验证实,HDAC5低表达增强胰腺癌细胞对化疗药物的耐药性,而SATB1低表达则降低耐药性。结论HDAC5表达与胰腺癌患者预后呈正相关,其低表达与胰腺癌化疗耐药密切相关。HDAC5/SATB1轴在调控胰腺癌化疗耐药中起重要作用,为胰腺癌治疗提供潜在靶点。展开更多
文摘目的本研究聚焦于组蛋白乙酰化调控因子影响胰腺癌耐药中的机制。方法从癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库获取胰腺癌患者的RNA测序数据和临床病理信息,进行共识聚类分析和基因集富集分析。在胰腺癌细胞系PANC-1中敲减和过表达组蛋白去乙酰化酶5(histone deacetylase 5,HDAC5)和特殊富含AT序列结合蛋白1(special AT rich sequence binding protein 1,SATB1),检测细胞活力和基因表达。构建裸鼠皮下移植瘤模型,观察HDAC5和SATB1表达水平对肿瘤生长和化疗敏感性的影响。结果基于组蛋白乙酰转移酶(histone acetyltransferase,HAT)和HDAC家族基因表达水平,将胰腺癌样本聚类为C1和C2两个亚型,C1亚型预后较差且化疗耐药相关通路显著富集。HDAC5在化疗耐药胰腺癌细胞中低表达,与患者预后差相关,且其表达水平与其启动子区甲基化水平呈负相关。SATB1在胰腺癌中的表达与化疗耐药性相关,主要富集于细胞周期、DNA复制和修复等通路。筛选出TRMU、THOP1、DLGAP1、LIPH、PRR15、KLK11和EHF等HDAC5/SATB1下游基因,其表达水平与胰腺癌患者预后和化疗敏感性密切相关。体内外实验证实,HDAC5低表达增强胰腺癌细胞对化疗药物的耐药性,而SATB1低表达则降低耐药性。结论HDAC5表达与胰腺癌患者预后呈正相关,其低表达与胰腺癌化疗耐药密切相关。HDAC5/SATB1轴在调控胰腺癌化疗耐药中起重要作用,为胰腺癌治疗提供潜在靶点。
