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花椒SABATH基因家族鉴定及其在盐胁迫下的表达模式分析 被引量:1
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作者 高卫龙 张雪丽 +4 位作者 姚嘉 王建鑫 王玉辉 孟圆 刘玉林 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期94-102,共9页
SABATH基因家族催化植物激素及其他小分子物质甲基化,在植物的生长发育及逆境胁迫中具有重要作用。本研究从花椒基因组中鉴定出68个SABATH基因。系统发育树和基因结构分析显示,花椒SABATH基因被划分为5个亚家族,这些亚族在进化上是保守... SABATH基因家族催化植物激素及其他小分子物质甲基化,在植物的生长发育及逆境胁迫中具有重要作用。本研究从花椒基因组中鉴定出68个SABATH基因。系统发育树和基因结构分析显示,花椒SABATH基因被划分为5个亚家族,这些亚族在进化上是保守的,46个(68%)基因具有串联重复和片段复制。花椒SABATH基因的启动子序列中包含大量与植物激素、逆境响应和生长发育相关的顺式作用元件。结果表明,基于不同盐胁迫处理时间下的花椒SABATH基因的表达谱,可将表达的39个SABATH基因分为4簇,不同簇具有各自的表达趋势。其中,ZbSABATH55、ZbSABATH58、ZbSABATH14、ZbSABATH22在盐胁迫下的表达水平显著高于其他基因,可能为参与花椒盐胁迫响应的关键基因。本研究为深入解析花椒SABATH基因家族的功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 花椒 sabath基因家族 盐胁迫
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棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析
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作者 赵亮 狄佳春 陈旭升 《江苏农业科学》 2018年第17期38-42,共5页
甲基化作用广泛存在于生物体内,在许多生物进程中发挥着关键的修饰作用,包括基因和代谢的调控。甲基化由甲基转移酶(methyltransferases,简称MTs)依赖S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosine-L-methionine,简称SAM)作为甲基供体催化形成相对应... 甲基化作用广泛存在于生物体内,在许多生物进程中发挥着关键的修饰作用,包括基因和代谢的调控。甲基化由甲基转移酶(methyltransferases,简称MTs)依赖S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosine-L-methionine,简称SAM)作为甲基供体催化形成相对应的甲基化形式产物。SABATH甲基转移酶家族在最初发现鉴定的3个酶的基础上共同命名为SABATH甲基转移酶(SABATH-MTs)。这3个酶分别是水杨酸羧基甲基转移酶(salicylic acid carboxyl methyltransferases,简称SAMT)、苯甲酸羧基甲基转移酶(benzoic acid carboxyl methyltransferases,简称BAMT)和可可碱合酶(theobromine synthase)。为探究该基因家族在棉花基因组中的分布情况,本研究利用生物信息学方法在四倍体陆地棉、二倍体A基因组亚洲棉和二倍体D基因组雷蒙德氏棉中分别预测到37、24、22个基因成员;能够与已知功能的SABATH-MTs成员聚集于同一分支分别为17、8、9个基因成员。在预测到的四倍体陆地棉37个基因成员中,能够在转录组数据库中查找到表达的有20个基因。 展开更多
关键词 棉花 甲基转移酶 sabath 基因家族 次生代谢
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红白忍冬SABATH甲基转移酶基因克隆及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 余晓丹 蒋超 +4 位作者 黄璐琦 秦双双 曾祥梅 陈平 袁媛 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第16期2556-2562,共7页
目的:克隆红白忍冬SABATH甲基转移酶基因(rLjSABATHMT),比较忍冬和红白忍冬SABATH甲基转移酶同源基因表达量和基因内含子序列的差异,为金银花的活性成分形成及调控机制研究提供基础。方法:根据cDNA文库提供的基因片段设计特异性引物,从... 目的:克隆红白忍冬SABATH甲基转移酶基因(rLjSABATHMT),比较忍冬和红白忍冬SABATH甲基转移酶同源基因表达量和基因内含子序列的差异,为金银花的活性成分形成及调控机制研究提供基础。方法:根据cDNA文库提供的基因片段设计特异性引物,从红白忍冬中克隆获得rLjSABATHMT基因cDNA序列及基因组序列。通过生物信息学对该基因蛋白的特征进行分析,使用MEGA 5.0构建SABATH甲基转移酶系统进化树,利用RT-PCR分析SABATHMT同源基因在忍冬与红白忍冬的不同器官、不同花期的表达量,对忍冬和红白忍冬SABATHMT同源基因内含子区序列进行分析和比较。结果:克隆获得的rLjSABATHMT基因cDNA序列全长为1 251 bp,具有完整编码框,编码365个氨基酸。该基因蛋白序列具有保守的SA-BATHMT结构域,系统进化树结果表明它可能是水杨酸/安息酸甲基转移酶。基因表达分析结果表明SABATHMT同源基因主要在花中表达。忍冬和红白忍冬SABATHMT同源基因内含子区序列具有丰富的多态性,且有2个SNP为红白忍冬的特有基因型;内含子区motif元件中碱基变异在2个同源基因间具有显著差异。结论:SABATHMT同源基因内含子区变异可能导致了忍冬和红白忍冬SABATH甲基转移酶表达差异,为金银花活性成分调控机制研究提供了重要研究基础。 展开更多
关键词 金银花 sabath甲基转移酶 全长CDNA 内含子
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植物SABATH甲基转移酶家族生物学功能研究进展 被引量:3
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作者 郑二松 周洁 +8 位作者 徐如梦 郑超 陈新宇 谭晓菁 杨勇 鲍根良 陈剑平 王栩鸣 严成其 《生物技术通讯》 CAS 2020年第2期220-226,共7页
植物SABATH甲基转移酶是甲基转移酶家族中重要的一类,该家族以最先发现的3个家族成员的基因名称缩写命名,是一类能够催化植物激素和小分子化合物的羧基和N原子甲基化的酶,在植物激素及相关信号分子代谢中行使了重要的生物学功能。研究表... 植物SABATH甲基转移酶是甲基转移酶家族中重要的一类,该家族以最先发现的3个家族成员的基因名称缩写命名,是一类能够催化植物激素和小分子化合物的羧基和N原子甲基化的酶,在植物激素及相关信号分子代谢中行使了重要的生物学功能。研究表明,SABATH甲基转移酶不仅直接参与调控植物激素代谢、挥发性化合物的合成,还能通过改变植物次生代谢影响有益和有害昆虫的行为,从而帮助植物完成生命周期,保护植物免受病虫危害。本文简要综述SABATH甲基转移酶的分类及其在植物生长、病虫害防御反应等生物过程中的作用的研究进展。 展开更多
关键词 sabath甲基转移酶 次生代谢 激素 防御反应
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Methylation of phytohormones by the SABATH methyltransferases 被引量:6
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作者 QU LiJia LI Shuang XING ShuFan 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2010年第21期2211-2218,共8页
In plants,one of the most common modifications of secondary metabolites is methylation catalyzed by various methyltransferases. Recently,a new class of methyltransferases,the SABATH family of methyltransferases,was fo... In plants,one of the most common modifications of secondary metabolites is methylation catalyzed by various methyltransferases. Recently,a new class of methyltransferases,the SABATH family of methyltransferases,was found to modify phytohormones and other small molecules.The SABATH methyltransferases share little sequence similarity with other well characterized methyltransferases.Arabidopsis has 24 members of the SABATH methyltransferase genes,and a subset of them has been shown to catalyze the formation of methyl esters with phytohormones and other small molecules.Physiological and genetic analyses show that methylation of phytohormones plays important roles in regulating various biological processes in plants,including stress responses,leaf development,and seed maturation/germination.In this review,we focus on phytohormone methylation by the SABATH family methyltransferases and the implication of these modifications in plant development. 展开更多
关键词 甲基化 甲基转移酶 激素 植物生长发育 次生代谢产物 生理过程 遗传分析 应激反应
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GAMT2 Encodes a Methyltransferase of Gibberellic Acid That is Involved in Seed Maturation and Germination in Arabidopsis 被引量:4
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作者 Shufan Xing Genji Qin +3 位作者 Yan Shi Zhangliang Chen Hongya GU Li-Jia Qu 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第3期368-381,共14页
Salicylic acid methyltransferase (SAMT), benzoic acid methyltransferase (BAMT) and theobromine methyltransferase (TH) (henceforth, SABATH) family proteins belong to a unique class of mehtyltransferase that can... Salicylic acid methyltransferase (SAMT), benzoic acid methyltransferase (BAMT) and theobromine methyltransferase (TH) (henceforth, SABATH) family proteins belong to a unique class of mehtyltransferase that can methylate small molecular compounds Including indole-3-acidic acid (IAA), salicylic acid (SA) and jasmonic acid (JA), in plants. Here we report that the GAMT2 protein, which has 34.2% similarity with IAMT1 in the amino acid sequence, can methylate gibberellic acid (GA). Biolnformatics analysis suggests that GAMT2 may be able to methylate one molecule larger than SA. GAMT2 is predominantly expressed in the developing seed embryo and endosperm in Arabidopsis. During seed germination, the expression of GAMT2 decreases until the cotyledons expand out of the seed coat. Overexpression of GAMT2 in Arabidopsis resulted in multiple phenotypes, including dwarfism, retarded growth, late flowering, and reduced fertility, which are similar to the phenotypes of GA-deficient mutants. Seed germination assay showed that GAMT2 overexpression in plants was hypersensitive to GA biosynthesis inhibitor (ancymidol) and abscisic acid (ABA) treatments, whereas the GAMT2 null mutant (SALK_075450) was slightly Insensitive to such treatments, suggesting that GAMT2 may methylate GA or ABA. Enzyme activity analysis indicated that GAMT2 was able to methylate GA3 into Methyi-GA3 in vitro, but could not methylate ABA. Microarray analysis on GAMT2 overexpression plants suggested that Methyl-GA may be an Inactive form of GA in Arabidopsis. These data suggest that GAMT2 Is Involved in seed maturation and germination by modulating GA activity. 展开更多
关键词 GAMT2 GA-deficient seed germination seed maturation Me-GA methyl acceptors sabath methyltransferase
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