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利用rep-PCR技术研究我国9省柑橘溃疡病菌遗传多样性 被引量：12
1
作者 姚廷山 胡军华 +3 位作者 唐科志 冉春 李中安 周常勇 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期819-822,共4页
采用rep-PCR技术,对从我国9省(区)收集、分离、筛选的18株柑橘溃疡病菌株进行遗传多样性研究,并与A菌系标准菌株进行UPGMA聚类分析和相似性分析。结果表明,使用引物BOXA1R扩增供试菌株,可得到不同的条带31条。以遗传相似距离0.4划分,供... 采用rep-PCR技术,对从我国9省(区)收集、分离、筛选的18株柑橘溃疡病菌株进行遗传多样性研究,并与A菌系标准菌株进行UPGMA聚类分析和相似性分析。结果表明,使用引物BOXA1R扩增供试菌株,可得到不同的条带31条。以遗传相似距离0.4划分,供试菌株可划分为5个簇;以遗传相似距离0.5划分,供试菌株可划分为4个簇;15个菌株与标准A菌株遗传相似距离较近,菌株CJX、CZJ1、CGDN2与标准A菌株遗传相似距离较远;来自同一省的少数溃疡病菌株的遗传相似性也较低,说明我国柑橘溃疡病菌基因组存在丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 柑橘溃疡病菌 rep-pcr 遗传多样性
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Rep-PCR技术对中国水稻条斑病菌的遗传多样性初析 被引量：16
2
作者 姬广海 许志刚 张世珖 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期26-32,共7页
采用 Rep- PCR技术 ,对 30个水稻细菌性条斑病菌株 (Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)进行遗传多样性分析 ,同时对李氏禾条斑病菌等其它 10个参试菌株也进行了比较。 Rep- PCR是利用一些基于细菌的短的重复序列引物 (ERIC和 BOX)的 DN... 采用 Rep- PCR技术 ,对 30个水稻细菌性条斑病菌株 (Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)进行遗传多样性分析 ,同时对李氏禾条斑病菌等其它 10个参试菌株也进行了比较。 Rep- PCR是利用一些基于细菌的短的重复序列引物 (ERIC和 BOX)的 DNA扩增特性 ,2种引物组合的电泳图谱结合并分析 ,以水稻细菌性条斑病菌各自的指纹谱型在相似率 80 %时可分为 6簇 ,初步表明我国水稻细菌性条斑病菌群体的遗传分化明显 ;发现自然界存在的弱或无毒性菌株与毒性菌株的 Rep- PCR指纹图谱差异很大 ;毒性菌株的遗传分簇与其致病性具有一定的相关性。用 ERIC扩增水稻条斑病菌基因组DNA的指纹比 BOX更为多样 ,两者对菌株的分辨率不同。因此 ,Rep- PCR技术可有效地用于监测水稻细菌性条斑病菌的遗传变异 ,还可应用于菌株的鉴定和分类学研究。 展开更多
关键词 水稻 细菌性条斑病菌 遗传多样性 rep-pcr
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布鲁氏菌的Rep-PCR分型研究 被引量：33
3
作者 崔步云 尹继明 +3 位作者 李兰玉 朴冬日 赵鸿雁 尚德秋 《疾病监测》 CAS 2005年第8期397-400,共4页
目的探索对布鲁氏菌属的分子生物学分类方法。方法应用Rep-PCR进行分型研究,以布鲁氏菌属各种型代表菌株为参考,将该方法对国内分离的典型、非典型布鲁氏菌菌株、疫苗菌株进行分类研究。结果使用Rep-PCR方法,不仅在属的水平上可以检测... 目的探索对布鲁氏菌属的分子生物学分类方法。方法应用Rep-PCR进行分型研究,以布鲁氏菌属各种型代表菌株为参考,将该方法对国内分离的典型、非典型布鲁氏菌菌株、疫苗菌株进行分类研究。结果使用Rep-PCR方法,不仅在属的水平上可以检测、鉴定布鲁氏菌属,而且能够将107株国内外布鲁氏菌的参考菌株和地方流行菌株分为8个组。结论使用Rep-PCR方法可以对布鲁氏菌株进行分型,将典型和非典型布鲁氏菌进行鉴定和分型,弥补传统分类方法的不足。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 分型 rep-pcr
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利用rep-PCR研究云南尼泊尔桤木根瘤内Frankia基因多样性 被引量：2
4
作者 熊智 唐晓萌 +3 位作者 代玉梅 张成刚 张忠泽 徐丽华 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期623-627,共5页
利用rep-PCR指纹技术对云南5个地区的尼泊尔桤木根瘤内Frankia菌基因多样性进行研究,实验发现Frankia菌呈现丰富的基因多样性.所有71个样品被分为11种不同的基因类型.除高黎贡山外,不同地域都有某种基因型占优势,显示Frankia菌基因型与... 利用rep-PCR指纹技术对云南5个地区的尼泊尔桤木根瘤内Frankia菌基因多样性进行研究,实验发现Frankia菌呈现丰富的基因多样性.所有71个样品被分为11种不同的基因类型.除高黎贡山外,不同地域都有某种基因型占优势,显示Frankia菌基因型与地域有紧密关系.所观察的5个地区中,高黎贡山Frankia菌基因型种类最多,多样性指数最高,基因多样性最为丰富.结合高黎贡山地理资料及其它生物多样性相关研究,推测与高黎贡山尼泊尔桤木共生的Frankia可能作为种储备库,为其它地区的寄主植物提供了祖先菌株. 展开更多
关键词 FRANKIA rep-pcr 尼泊尔桤木 云南 地域 基因多样性
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用REP-PCR DNA指纹鉴别Frankia菌 被引量：6
5
作者 彭源东 张忠泽 丁鉴 《微生物学杂志》 CAS CSCD 1998年第1期1-5,共5页
用4种方法提取CPI1菌基因组DNA，并进行了REP-PCR扩增，结果表明，提取方法不影响REP-PCR带型。对14株Frankia菌株作REP-PCRDNA指纹分析，并对之进行比较鉴别，证明REP-PCR指纹法能有效地实现菌株间的差异鉴别，其结果与DNA同源相关性... 用4种方法提取CPI1菌基因组DNA，并进行了REP-PCR扩增，结果表明，提取方法不影响REP-PCR带型。对14株Frankia菌株作REP-PCRDNA指纹分析，并对之进行比较鉴别，证明REP-PCR指纹法能有效地实现菌株间的差异鉴别，其结果与DNA同源相关性所得结果具有良好的相关性。 展开更多
关键词 FRANKIA rep-pcr DNA指纹鉴别 分类学
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辽宁省溶藻弧菌REP-PCR和PFGE分子分型、耐药谱的研究 被引量：9
6
作者 李雪 张眉眉 +1 位作者 张铭琰 刘海霞 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期535-540,共6页
目的利用PFGE和REP-PCR两种分型方法对溶藻弧菌进行分子分型和亲缘关系的研究;并将两种分型方法进行对比,并结合对抗生素耐药试验结果对其关联性进行初步探讨。方法应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对辽宁省2017年食品中分离的39株溶藻弧... 目的利用PFGE和REP-PCR两种分型方法对溶藻弧菌进行分子分型和亲缘关系的研究;并将两种分型方法进行对比,并结合对抗生素耐药试验结果对其关联性进行初步探讨。方法应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对辽宁省2017年食品中分离的39株溶藻弧菌进行分型,应用BN(7.6版本)软件分析同源性。以基因外重复回文序列(REP)为引物,对40株溶藻弧菌DNA进行扩增,得到DNA指纹图谱,并利用SPSS 13.0统计软件对DNA扩增图谱进行聚类分析,同时将两种聚类分析结果进行比较,并用肉汤稀释法测定对15种抗生素的耐药性。结果 PFGE和REP-PCR两种方法的聚类分析结果均可分出两种优势带型A型和B型,且包含的菌株一致。PFGE分型方法在一些菌株中出现的DNA条带更多更复杂一些,分辨力指数(DI)为0.974,REP-PCR分型方法的DI为0.936。溶藻弧菌对头孢唑啉耐药率最高达57.5%,其次是氨苄西林(20.0%)和红霉素(12.5%),三重耐药菌比例达12.5%。结论 PFGE和REP-PCR两种方法均可以对溶藻弧菌进行分型,且均具有较好的分型能力,分辨力和再现性都很好,但PFGE分型方法的分辨力更优于REP-PCR分子分型。耐药菌株间带型具有高度同源性,优势带型菌株易耐药。综上所述,PFGE和REP-PCR两种分子分型方法对于评估溶藻弧菌流行及分布规律均是有用的,并且分型结果是一致的,都可以对菌株间亲缘关系进行有效溯源,因此在溶藻弧菌所致疾病爆发流行时,在普遍缺乏昂贵的PFGE专业设备和昂贵的配套BN软件以及专业操作人员的实验室,可以应用REP-PCR方法和SPSS统计软件代替PFGE方法和BN软件对菌株进行快速有效溯源。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 分子分型 rep-pcr PFGE
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水稻白叶枯病菌北方菌株遗传多样性rep-PCR分析 被引量：2
7
作者 阙海勇 陈华民 +1 位作者 吴茂森 何晨阳 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期482-487,共6页
为了揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)北方菌株的遗传结构组成,利用rep-PCR技术对103个从辽宁、吉林、河北、山东稻区采集的Xoo菌株、9个标准小种(R1-R9)代表菌株和13个水稻细菌性条斑病菌(X.oryzae pv.oryzicola,... 为了揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)北方菌株的遗传结构组成,利用rep-PCR技术对103个从辽宁、吉林、河北、山东稻区采集的Xoo菌株、9个标准小种(R1-R9)代表菌株和13个水稻细菌性条斑病菌(X.oryzae pv.oryzicola,Xoc)菌株进行了遗传多样性分析。结果表明,ERIC-PCR和BOX-PCR分析均能较好地揭示出测试菌株的遗传多态性,分别获得了84种和90种分子谱型;在相似系数为70%时,ERIC-PCR将所有测试菌株聚类为17个簇群,其中1个为优势簇群;BOX-PCR将测试菌株聚类为10个簇群,其中2个为优势簇群。在相似系数为50%时,Xoo与Xoc测试菌株分别聚类为2个不同的簇群。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 rep-pcr 分子谱型 簇群
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Rep-PCR技术及其应用现状 被引量：5
8
作者 赵燕梅 张吉明 许庆方 《中国草食动物科学》 CAS 2014年第3期55-57,共3页
文章着重介绍了Rep-PCR技术原理、特点及其在细菌、真菌、环境微生物遗传多样性研究方面的应用。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类,此方法操作方便,可以大样本进行,且Rep-PCR分辨效果好,可重复性强。现在Rep-PCR可自... 文章着重介绍了Rep-PCR技术原理、特点及其在细菌、真菌、环境微生物遗传多样性研究方面的应用。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类,此方法操作方便,可以大样本进行,且Rep-PCR分辨效果好,可重复性强。现在Rep-PCR可自动化分型,并可建立各种细菌REP、ERIC-PCR分型标准数据库。但Rep-PCR也存在一定问题,不同来源的或不同批次的引物和酶,对Rep-PCR结果都有一定的影响。 展开更多
关键词 rep-pcr 细菌 真菌 环境微生物 遗传多样性
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蚕豆茎疫病菌rep-PCR初析 被引量：2
9
作者 黄琼 孙启明 +3 位作者 姬广海 钱君 孙跃先 刘凤权 《西南农业学报》 CSCD 2003年第1期74-77,共4页
对分离自云南省 18个县 (市 )的蚕豆细菌性茎疫病菌 34个菌株进行的rep PCR分析结果表明 ,用引物BOX和ERIC分别扩增出 2 5和 2 4条多态性条带 ,分子量大小从 10 0～ 2 12 2 6bp ,大多数条带主要集中在 5 6 4～ 1375bp。蚕豆茎疫病菌菌... 对分离自云南省 18个县 (市 )的蚕豆细菌性茎疫病菌 34个菌株进行的rep PCR分析结果表明 ,用引物BOX和ERIC分别扩增出 2 5和 2 4条多态性条带 ,分子量大小从 10 0～ 2 12 2 6bp ,大多数条带主要集中在 5 6 4～ 1375bp。蚕豆茎疫病菌菌株具有丰富的DNA多态性和较大的遗传变异。 2 4～ 2 5个菌株在 75 %遗传水平上相似。研究发现来自景东、昭通、玉溪、宣威、弥渡、文山、洱源、保山的菌株具有 75 %的同源性 ,与菌株的地理来源有一定相关关系。 展开更多
关键词 蚕豆茎疫病菌 rep-pcr 蚕豆
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应用rep-PCR微生物源方法追踪夏秋季桂五水库粪便污染来源 被引量：4
10
作者 李伟伟 陈晓东 +2 位作者 顾玲 丁震 汪华 《江苏预防医学》 CAS 2010年第3期6-9,共4页
目的:应用重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)微生物源追踪方法,追踪夏秋季江苏桂五水库的粪便污染来源追踪。方法:采集已知来源的人和动物粪便标本以及夏秋两季水样标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增;用Bionumerics... 目的:应用重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)微生物源追踪方法,追踪夏秋季江苏桂五水库的粪便污染来源追踪。方法:采集已知来源的人和动物粪便标本以及夏秋两季水样标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增;用Bionumerics4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算各源种类的正确归类率。结果:10、5、3和2分类法平均正确归类率分别为68.13%、74.76%、82.36%和86.03%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。水样中主要粪便污染来源为人、鸡和牛。结论:建立的rep-PCR微生物源追踪方法能较好地区分水体中指示菌的不同来源,水体标本监测显示桂五水库粪便污染来源种类多,其中人、鸡和牛相对较多,提示应对桂五水库地区加强人、家禽和家畜动物粪便的无害化管理。 展开更多
关键词 微生物源追踪 rep-pcr BOXA1R 大肠杆菌
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沙门菌REP-PCR分子分型技术的优化及其在耐药菌株中的应用 被引量：1
11
作者 汪川 余倩 +3 位作者 马丽雅 张朝武 裴晓方 刘衡川 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期736-739,共4页
目的优化沙门菌REP-PCR分子分型技术,并在沙门菌耐药菌株分型研究中应用,为构建沙门菌同源性追踪体系提供数据。方法以肠炎沙门菌510041基因组DNA为模板,根据参考文献确定REP引物,PCR扩增其基因组中靶序列。对反应体系模板量、Mg2+浓度... 目的优化沙门菌REP-PCR分子分型技术,并在沙门菌耐药菌株分型研究中应用,为构建沙门菌同源性追踪体系提供数据。方法以肠炎沙门菌510041基因组DNA为模板,根据参考文献确定REP引物,PCR扩增其基因组中靶序列。对反应体系模板量、Mg2+浓度和引物浓度的优化,采用对优化项目设置梯度,其它条件不变的方法进行。以优化的REP-PCR法分析24株沙门菌流行耐药株REP-PCR指纹图谱。根据指纹图谱条带对菌株进行分型,并将分型结果与菌株耐药谱分型结果作比较。结果PCR反应体系DNA模板量100ng/25μl,Mg2+浓度2.0mmol/L,上下游引物浓度各0.4μmol/L时,指纹图谱条带最清晰、明亮;不同血清群和血清型沙门菌株间REP-PCR指纹图谱差异较大,可在0.5kb到2.5kb范围内出现2至6条条带;24株沙门菌流行耐药株用该法可分为15型,根据耐药谱可分为7型。结论建立了优化的沙门菌REP-PCR分子分型技术;REP-PCR指纹图谱分型比耐药谱分型更加敏感。 展开更多
关键词 沙门菌 rep-pcr 耐药谱
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沙尘天气气载耐甲氧西林葡萄球菌监测及其REP-PCR指纹图谱分析 被引量：1
12
作者 邱玉玉 崔南南 +2 位作者 李晓霞 王芳 刘玉可心 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期765-771,共7页
目的了解沙尘天气时空气中葡萄球菌浓度及气载MRSA的遗传多样性,为临床葡萄球菌病的防控提供科学依据。方法用LWC-1型离心式空气微生物采样器采集火车站、学校、公园、广场等场所空气并分离鉴定其中的葡萄球菌,采用REP-PCR扩增不同源MRS... 目的了解沙尘天气时空气中葡萄球菌浓度及气载MRSA的遗传多样性,为临床葡萄球菌病的防控提供科学依据。方法用LWC-1型离心式空气微生物采样器采集火车站、学校、公园、广场等场所空气并分离鉴定其中的葡萄球菌,采用REP-PCR扩增不同源MRSA的基因组DNA形成聚类图谱,分析不同源MRSA的相似性。结果气载金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌浓度沙尘天气时浓度均明显增高,与正常天气时的浓度差异有统计学意义(P<0.05);在火车站中最高,浓度分别为116.7CFU/m^3和162.0CFU/m^3。从空气中共分离得到金黄色葡萄球菌111株,其中MRSA20株;凝固酶阴性葡萄球菌179株,其中MRCNS共11株。20株气载MRSA图谱显示菌株相似性在48%~100%之间;气载MRSA与医院临床MRSA分离株之间的相似性在50%~100%之间;与动物源MRSA之间的相似性在40%~100%之间。结论沙尘天气空气中存在着多种葡萄球菌,而且空气中的部分MRSA株与医院临床分离株及动物源的MRSA有着较高的遗传相似性,应加强空气中葡萄球菌尤其是耐药葡萄球菌的监测及防控。 展开更多
关键词 沙尘天气 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 凝固酶阴性葡萄球菌 基因外重复回文序列PCR(rep-pcr)
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重复序列PCR(rep-PCR)指纹分析技术在病原真菌鉴定和分型中的应用 被引量：4
13
作者 项明洁 刘锦燕 +3 位作者 倪培华 张华 陈华 倪语星 《中国真菌学杂志》 2010年第6期376-380,共5页
随着医学科学的发展及人们对深部真菌感染的重视,越来越多的新技术用于临床真菌的检测和鉴定。重复序列PCR(rep-PCR)指纹分析技术因其高分辨力、快速、简便、经济等优势,已成为分析真菌基因组、明确菌属间克隆来源的重要方法。本文就rep... 随着医学科学的发展及人们对深部真菌感染的重视,越来越多的新技术用于临床真菌的检测和鉴定。重复序列PCR(rep-PCR)指纹分析技术因其高分辨力、快速、简便、经济等优势,已成为分析真菌基因组、明确菌属间克隆来源的重要方法。本文就rep-PCR指纹技术及其自动化DiversiLab System在病原真菌分类鉴定和流行病学研究中的应用加以综述。 展开更多
关键词 重复序列PCR(rep-pcr) 病原真菌 基因分型
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用rep-PCR方法研究细菌遗传多样性的探讨 被引量：6
14
作者 李洁 熊智 《西南林学院学报》 2006年第6期1-3,共3页
对大肠杆菌、枯草杆菌、四联球菌、普通变形杆菌、产气肠杆菌基因组DNA进行rep-PCR扩增,并在模板样品中混入植物DNA作对照实验.结果表明:用rep-PCR方法分析细菌基因多样性,能在较大范围内避免植物基因的干扰.模板量梯度实验结果显示:扩... 对大肠杆菌、枯草杆菌、四联球菌、普通变形杆菌、产气肠杆菌基因组DNA进行rep-PCR扩增,并在模板样品中混入植物DNA作对照实验.结果表明:用rep-PCR方法分析细菌基因多样性,能在较大范围内避免植物基因的干扰.模板量梯度实验结果显示:扩增产物多态性与模板量相关. 展开更多
关键词 rep-pcr 细菌 多态性
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rep-PCR检测产ESBL大肠埃希菌 被引量：1
15
作者 马列婷 杨朵 王亚文 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期110-111,共2页
目的　用重复序列引物聚合酶链反应 (rep- PCR)的方法分析呼吸科住院患者痰标本中分离到的产超广谱β内酰胺酶(ESBL)大肠埃希菌是否同一起源菌株。方法　用双纸片确认法检测超广谱β内酰胺酶 (ESBL)。用K B法测定对抗生素的敏感程度,选... 目的　用重复序列引物聚合酶链反应 (rep- PCR)的方法分析呼吸科住院患者痰标本中分离到的产超广谱β内酰胺酶(ESBL)大肠埃希菌是否同一起源菌株。方法　用双纸片确认法检测超广谱β内酰胺酶 (ESBL)。用K B法测定对抗生素的敏感程度,选用肠道菌广泛存在的基因间重复片段为引物进行扩增,对产ESBL大肠埃希菌进行基因分型。结果　rep -PCR法可将大肠埃希菌扩增出丰富的区带。分离到的 22株产ESBL大肠埃希菌分属 3个基因型。结论　rep- PCR法可用于医院内感染的流行病学调查。 展开更多
关键词 ESBL 大肠埃希菌 扩增 痰标本 K-B法 产超广谱Β内酰胺酶 医院内感染 rep-pcr 重复序列 引物
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副溶血性弧菌REP-PCR分型研究 被引量：3
16
作者 许龙岩 袁慕云 +2 位作者 凌莉 黄华军 邹志飞 《检验检疫学刊》 2011年第5期30-32,8,共4页
[目的]了解食品中分离的副溶血性弧菌REP-PCR分子型别,探讨DiversiLab系统对副溶血性弧菌的分型能力。[方法]采用以REP-PCR为原理的DiversiLab系统对食品中分离的21株副溶血性弧菌进行分子分型,分析菌株之间的相关性,并与PFGE分型结果... [目的]了解食品中分离的副溶血性弧菌REP-PCR分子型别,探讨DiversiLab系统对副溶血性弧菌的分型能力。[方法]采用以REP-PCR为原理的DiversiLab系统对食品中分离的21株副溶血性弧菌进行分子分型,分析菌株之间的相关性,并与PFGE分型结果比较。[结果]DiversiLab将21株副溶血性弧菌分成16个群,菌株之间的相似度64.5%-99.1%,分离自相同食品中的副溶血性弧菌在REP-PCR聚类图中分在同一个群;7株副溶血性弧菌PFGE分型结果产生7种不同的PFGE型别,菌株之间不相关,在REP-PCR聚类图中分在7个不同的群中。[结论]食品中分离的副溶血性弧菌REP-PCR型别分散,未表现出地区特异性;DiversiLab简便、快速、分辨率高,可应用于副溶血性弧菌的快速分型和溯源。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 DiversiLab系统 rep-pcr PFGE 分子分型 食品
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尿路致病性大肠杆菌分离株的耐药性与REP-PCR基因分型
17
作者 张正芳 刘世巍 +9 位作者 徐杰 高光俊 王璐璐 李卓林 王立平 苑锡铜 王玉飞 柯跃华 李竞 陈泽良 《中国医院药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期816-818,共3页
目的:研究尿路致病性大肠杆菌(UPEC)分离株的耐药性和基因分型,为UPEC感染的防治及分子流行病学研究提供实验依据。方法:采用K-B法测定2006—2008年从望京医院病人尿液标本分离的97株UPEC对17种抗生素的敏感性;用基因外重复回文序列PCR(... 目的:研究尿路致病性大肠杆菌(UPEC)分离株的耐药性和基因分型,为UPEC感染的防治及分子流行病学研究提供实验依据。方法:采用K-B法测定2006—2008年从望京医院病人尿液标本分离的97株UPEC对17种抗生素的敏感性;用基因外重复回文序列PCR(REP-PCR)方法对分离株基因分型。将不同基因型的菌株与它们对17种抗生素的耐药性进行比较,了解分离株的基因型和耐药性的关系。结果:分离株对PIP、LVX和GEN的耐药率高(占65%以上),对IMP和MEM敏感。93.81%的细菌表现为多重耐药。菌株分为了4个耐药组,其中A组和B组耐药性强,D组耐药性弱;REP-PCR方法将97株UPEC分离株被分为4个群,被命名为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ。各群在A组的耐药率最高,而I群又在A组中所占比例最高。结论:UPEC分离株广泛耐药,各基因型的菌株在耐药性上有一定规律性变化,提示耐药性在菌株之间的传递。亲缘关系近的菌株,表现出相似的耐药谱。应合理使用抗生素,以防止耐药性的产生和快速传递。 展开更多
关键词 UPEC rep-pcr 耐药性
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环境因素对大肠杆菌REP-PCR指纹图谱稳定性影响研究 被引量：2
18
作者 韩彦垒 梁斌 +3 位作者 李冬梅 苏洁 关道明 王耀兵 《海洋环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期614-617,共4页
大肠杆菌作为粪便污染指示生物,其DNA指纹图谱稳定性是制约微生物污染源识别技术发展的瓶颈之一。本研究采用绿色荧光蛋白基因(GFP)标记后的Escherichia coli K12(K12GFP)为受试菌株,利用REP-PCR方法,对大肠杆菌在不同温度、光照、盐度... 大肠杆菌作为粪便污染指示生物,其DNA指纹图谱稳定性是制约微生物污染源识别技术发展的瓶颈之一。本研究采用绿色荧光蛋白基因(GFP)标记后的Escherichia coli K12(K12GFP)为受试菌株,利用REP-PCR方法,对大肠杆菌在不同温度、光照、盐度条件下其DNA指纹图谱的稳定性进行了研究。结果表明,绿色荧光蛋白基因的标记不影响E.coli K12的REP-PCR指纹图谱;且大肠杆菌在不同温度、光照、盐度条件下REP-PCR指纹图谱具有高度的稳定性。 展开更多
关键词 大肠杆菌 DNA指纹图谱稳定性 rep-pcr 绿色荧光蛋白
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REP-PCR对医护人员鼻腔中鲍曼不动杆菌分离株的溯源分析 被引量：4
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作者 于观留 赵效南 +2 位作者 蔡春梅 蔡玉梅 高静 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第3期234-237,共4页
目的对医护人员鼻腔中的鲍曼不动杆菌进行分离鉴定,对其来源和传播途径进行分析。方法用棉拭子采集10名医护人员和10名非医护人员(大学生)鼻腔样品,分离鉴定非重复鲍曼不动杆菌,采用K-B法检测其对13种常用抗生素的敏感性;利用多重PCR扩... 目的对医护人员鼻腔中的鲍曼不动杆菌进行分离鉴定,对其来源和传播途径进行分析。方法用棉拭子采集10名医护人员和10名非医护人员(大学生)鼻腔样品,分离鉴定非重复鲍曼不动杆菌,采用K-B法检测其对13种常用抗生素的敏感性;利用多重PCR扩增OXA型碳青霉烯酶耐药基因;应用基因外重复回文序列REP-PCR对分离株进行分子多样性分析。结果共分离19株鲍曼不动杆菌,其中分离自医护人员鼻腔12株,分离自非医护人员鼻腔7株。K-B法检测Ab的耐药性,医护人员鼻腔分离株对环丙沙星(CIP)、亚胺硫霉素(IPM)、头孢曲松(CRO)、环磷酰胺(CTX)和新诺明(SXT)耐药率均≥41.7%,非医护人员分离株耐药率均≤3%;耐药基因检测19株菌中都携带OXA-51基因,且医护人员鼻腔分离株携带OXA-23菌株数多于非医护人员鼻腔分离株。另外两种未检出耐药基因(OXA-24和OXA-58)。REP-PCR显示,医护人员鼻腔分离株、非医护人员鼻腔分离株Ab的8种基因型(A-H)中同源性≥90%的有33株菌,占94.29%(33/35)。结论鲍曼不动杆菌不仅能通过直接接触传播,也可能存在气源性传播途径。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 医护人员 OXA碳青霉烯酶耐药基因 rep-pcr
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