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双标准曲线相对定量PCR试验原理与方法 被引量:66
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作者 徐丽华 刘春雷 +4 位作者 常玉梅 梁利群 刘金亮 高国强 韩启霞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期70-75,共6页
实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁... 实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁琐。阐述了一种改进的相对定量方法——双标准曲线法的试验原理和特点,描述了定量PCR体系的优化方式,探讨了试验误差分析方法及试验操作技巧,并就试验数据的处理方法进行讨论。试验证明,双标准曲线法是一种经济、简单而准确的定量方法。 展开更多
关键词 双标准曲线法 相对定量pcr 荧光扩增曲线 试验误差分析 归一化值
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羊口疮病毒SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR的建立及应用 被引量:11
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作者 鲜思美 张素辉 +4 位作者 杨钰 邓诗 吴健 刘嫒 刘宗胜 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第6期104-108,共5页
为羊口疮(Orf)的分子流行病学调查、早期快速诊断及细胞培养物的检测等提供参考,根据GenBank 发表的羊口疮病毒(OrfV)B2L 基因序列设计合成1对引物,以 pMD18-T-B2L 重组质粒为阳性标准品,建立了检测 OrfV 核酸的 SYBR Green Ⅰ... 为羊口疮(Orf)的分子流行病学调查、早期快速诊断及细胞培养物的检测等提供参考,根据GenBank 发表的羊口疮病毒(OrfV)B2L 基因序列设计合成1对引物,以 pMD18-T-B2L 重组质粒为阳性标准品,建立了检测 OrfV 核酸的 SYBR Green Ⅰ实时荧光定量 PCR 方法,并进行了临床应用。结果表明:建立的 SYBR Green Ⅰ实时荧光定量 PCR 的线性关系良好,标准曲线的相关系数达到-1;最低检测限为1.0x10^3 copies/μL,比常规 PCR 方法高100倍,与山羊痘和口蹄疫疫苗毒均不发生交叉反应;组内变异系数为1.061%-2.873%,组间变异系数为0.397%-3.829%。用该方法检测5例 OrfV 感染临床病例和8份不同代次的 OrfV 细胞培养物,阳性率均为100%。SYBR Green Ⅰ实时荧光定量 PCR 方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可以用于 OrfV 的病原检测及定量分析。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 检测方法
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实时荧光定量PCR法检测乙肝病毒DNA的价值分析与研究 被引量:12
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作者 杜锴 《中国现代药物应用》 2017年第1期55-57,共3页
目的探讨选择实时荧光定量PCR法对乙肝病毒DNA实施检测的临床价值。方法 250例乙型肝炎患者作为此次实验对象,临床选择血清学标志物的方法实施疾病检测后最终有效确诊。对所有乙型肝炎患者临床均选择实时荧光定量PCR法实施疾病检测,对... 目的探讨选择实时荧光定量PCR法对乙肝病毒DNA实施检测的临床价值。方法 250例乙型肝炎患者作为此次实验对象,临床选择血清学标志物的方法实施疾病检测后最终有效确诊。对所有乙型肝炎患者临床均选择实时荧光定量PCR法实施疾病检测,对最终检测结果进行分析。结果乙型肝炎患者分别选择荧光PCR法以及血清学标志物方法实施疾病检测,最终获得的检测结果基本表现一致。临床选择实时荧光定量PCR法完成疾病检测后,最终获得的病毒DNA数据更为准确。实时荧光定量PCR法对大三阳临床最终检测阳性率达到了96%;对小三阳,临床最终检测阳性率达到了69%;而对Hbs Ag(-)、乙型肝炎表面抗体(Hbs Ab)(-)以及Hbe Ab(-)以及乙型肝炎E抗原(Hbe Ag)(-)最终检测阳性率只为2.21%。对于大三阳患者以及小三阳患者的血清PCR检测结果进行观察发现,均表现出较高的拷贝数。结论乙型肝炎患者临床选择实时荧光定量PCR法实施疾病检测,针对乙肝病毒以及相关数据完成检测后可以获得准确结果 ,从而证明对乙型肝炎患者在实施疾病检测的过程中,选择实时荧光定量PCR法以及乙肝病毒DNA方法均可以获得较为理想的效果,临床均可以广泛普及应用。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 乙肝病毒 临床价值
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实时荧光定量PCR方法实现羊肉中鸡成分的精确定量 被引量:3
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作者 唐廷廷 陈世界 +5 位作者 张婧 杨苗 安微 王成程 韩国全 林华 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期3967-3976,共10页
近年来,世界各地肉制品掺假情况频繁发生。为维护市场稳定,保障食品安全,迫切需要量化肉制品中所含动物成分的质量百分比。本研究建立了一种实时荧光定量PCR定量检测系统,借助微滴式数字PCR技术(droplet digital,ddPCR),有效实现靶向基... 近年来,世界各地肉制品掺假情况频繁发生。为维护市场稳定,保障食品安全,迫切需要量化肉制品中所含动物成分的质量百分比。本研究建立了一种实时荧光定量PCR定量检测系统,借助微滴式数字PCR技术(droplet digital,ddPCR),有效实现靶向基因拷贝数的绝对定量,利用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative PCR detecting system,q-PCR),将扩增Ct值转化为基因拷贝数,再从基因拷贝数转换为肉的质量,有效实现了Ct值与质量间的转化,从而实现了羊肉中掺假鸡肉的精确定量。实验数据表明,该方法可以很好地应用于掺假羊肉中鸡肉质量百分比的检测,鸡肉的最低定量检测限(LOD)为5%,在5%~80%范围内相对误差小于±9%,相对标准偏差(RSD)小于±20%,定量结果准确、重复性高,可以有效区分生产污染与故意掺假,为肉类掺假的监管工作提供有力的技术参考。 展开更多
关键词 羊肉 精确定量 实时荧光定量pcr
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双重实时荧光定量PCR法检测腹泻中病毒的价值 被引量:3
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作者 樊永慧 《中国卫生标准管理》 2021年第8期82-84,共3页
目的研究腹泻患者粪便中诺如病毒(GⅠ+GⅡ)行双重实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法检测的价值。方法研究2019年1月-2020年3月我市人民医院送检的腹泻患者的粪便标本共400份,均接受双重实时荧光定量PCR法检... 目的研究腹泻患者粪便中诺如病毒(GⅠ+GⅡ)行双重实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法检测的价值。方法研究2019年1月-2020年3月我市人民医院送检的腹泻患者的粪便标本共400份,均接受双重实时荧光定量PCR法检测,GⅠ型诺如病毒特异性采用Taqman探针的5’端标记为FAM,GⅡ型诺如病毒特异性采用Taqman探针的5’端标记为VIC,立于同一反应管中,同时检测、分型诺如病毒,分析最终的病毒检出率。结果GⅠ型诺如病毒感染有15例,检出率是3.75%;GⅡ型诺如病毒感染有59例,检出率是14.75%;GⅠ型、GⅡ型诺如病毒混合感染有6例,检出率是1.50%,诺如病毒的总检出率是20.00%。结论腹泻患者的粪便采用双重实时荧光定量PCR法检测具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 腹泻 粪便 诺如病毒 双重实时荧光定量 pcr 检验价值
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白砂糖DNA提取方法的比较
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作者 齐玲倩 刘秀 +3 位作者 丁梦璇 李静媛 刘远远 尹建军 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期244-248,共5页
为了得到高效的白砂糖DNA提取方法,以5种白砂糖为研究对象,从前处理方法、裂解液成分及DNA纯化方法等方面对传统CTAB法进行改良,并比较了CTAB法和改良CTAB法的提取效果,结果表明:改良CTAB法提取的白砂糖DNA浓度都在2.60μg/m L以上,纯度... 为了得到高效的白砂糖DNA提取方法,以5种白砂糖为研究对象,从前处理方法、裂解液成分及DNA纯化方法等方面对传统CTAB法进行改良,并比较了CTAB法和改良CTAB法的提取效果,结果表明:改良CTAB法提取的白砂糖DNA浓度都在2.60μg/m L以上,纯度在1.8左右,且通过实时荧光定量PCR能扩增出18Sr DNA基因的对应荧光信号。因此,改良CTAB法能够高效地提取白砂糖的DNA,可为后续的分子检测奠定基础。 展开更多
关键词 白砂糖 DNA提取 改良CTAB法 实时荧光定量pcr(real-time fluorescence quantification pcr qpcr)
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HBV DNA超敏定量检测试剂盒的性能验证 被引量:2
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作者 肖圣达 耿帜 +1 位作者 徐远东 陈凤花 《临床血液学杂志》 CAS 2021年第2期81-85,共5页
目的:验证天隆HBV DNA超敏定量检测试剂盒在cobas?Z480全自动荧光定量PCR分析仪上的检测性能,以评估其是否满足临床应用要求。方法:参考CNAS-GL039《分子诊断检验程序性能验证指南》和CNAS-CL02-A009《医学实验室质量和能力认可准则在... 目的:验证天隆HBV DNA超敏定量检测试剂盒在cobas?Z480全自动荧光定量PCR分析仪上的检测性能,以评估其是否满足临床应用要求。方法:参考CNAS-GL039《分子诊断检验程序性能验证指南》和CNAS-CL02-A009《医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》等相关文件,应用临床血清样本和HBV DNA国家标准物质以及WHO国际标准物质,对精密度、正确度、线性范围、定量限、检出限、抗干扰能力、交叉污染、试剂批间差异、核酸室温放置时间等性能进行验证。结果:该系统检测102、103、106 IU/mL混合血清样本的重复性精密度分别为2.60%、2.43%、0.91%,中间精密度分别为4.41%、3.36%、2.48%;HBV DNA国家标准物质GBW(E)090586(200 IU/mL)、GBW(E)090137(1.41×10^(3) IU/mL)和GBW(E)090139(4.60×10^(6) IU/mL)的实测值与靶值差异均在±0.4 Log10IU/mL范围内;该系统在2.32×10^(1)~2.32×10^(9)IU/mL范围内呈线性(线性回归方程为Y=0.993 2X+0.161 2,R2=0.998 9);该系统的定量限为30 IU/mL,检出限为10 IU/mL;干扰物质总胆红素(Tb)浓度≤512μmol/L、血红蛋白(Hb)浓度≤10 g/L、甘油三酯(TG)浓度≤18 mmol/L时,均对检测结果没有明显影响(偏倚<±7.5%);交叉防污染实验中阳性标本检出率为100%,阴性标本检出率为0,全部阴性样本未受污染;不同批次试剂间检测结果差异符合要求(偏倚<±7.5%);磁珠法提取的核酸室温放置2 h,再进行加样扩增,对检测结果没有明显影响(偏倚<±7.5%)。结论:天隆HBV DNA超敏定量检测试剂盒在全自动荧光定量PCR仪cobas?Z480上的检测性能基本符合临床应用要求。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒DNA定量 磁珠法 实时荧光定量pcr 性能验证
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浓缩一步法新型肺炎支原体核酸检测试剂盒的临床应用初步评价 被引量:8
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作者 许爱玲 曲人亮 +2 位作者 艾颖娟 邓中平 赵业华 《标记免疫分析与临床》 CAS 2014年第3期328-332,共5页
目的通过对比实验,对新型肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae,MP)核酸检测试剂(采用浓缩一步法处理样本,以下简称"浓缩一步法")的临床使用进行评价。方法用浓缩一步法试剂与煮沸法试剂对临床收集的样本进行MP DNA检测并对比其... 目的通过对比实验,对新型肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae,MP)核酸检测试剂(采用浓缩一步法处理样本,以下简称"浓缩一步法")的临床使用进行评价。方法用浓缩一步法试剂与煮沸法试剂对临床收集的样本进行MP DNA检测并对比其结果,同时,将两种试剂的检测结果分别与金标准培养法检测结果进行对比。结果新型肺炎支原体核酸检测试剂与煮沸法试剂的阳性一致性百分比为98.36%,阴性一致性百分比为96.80%,总一致性百分比为97.68%;对5例不符样本进行测序复核,并对复核后的结果进行Kappa检验一致性分析,结果 Kappa值=1.000,表明新型试剂的检测结果与煮沸法试剂及复核检测的结果具有很好的一致性。在与金标准培养法检测结果的对比中,两种试剂均表现出较好的准确性。结论新型肺炎支原体核酸检测试剂与已上市的煮沸法试剂检测结果具有很好的一致性,操作简单快速,减少污染环节,并具有内标控制假阴性,结果准确,符合临床检测要求,具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 肺炎支原体 MP DNA 荧光定量pcr 浓缩一步法 煮沸法
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两种HCV RNA荧光定量试剂盒检测丙型肝炎病毒的比较分析 被引量:1
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作者 张桂红 苏猛 《医学综述》 2013年第18期3401-3402,共2页
目的比较分析两种丙型肝炎病毒(HCV)核酸定量检测试剂盒的临床性能。方法随机抽取63例临床血清样本进行平行检测,分别采用HCV磁珠法试剂和对照试剂检测血清中RNA水平。结果对照试剂检测63例临床样本中有22例阳性,41例阴性;磁珠法试剂检... 目的比较分析两种丙型肝炎病毒(HCV)核酸定量检测试剂盒的临床性能。方法随机抽取63例临床血清样本进行平行检测,分别采用HCV磁珠法试剂和对照试剂检测血清中RNA水平。结果对照试剂检测63例临床样本中有22例阳性,41例阴性;磁珠法试剂检测63例样本中有27例阳性,36例阴性,两种试剂的阳性样本具较好的一致性(P=0.000),磁珠法试剂与对照试剂的定量检测结果具有线性相关性(r=0.935,P<0.05)。结论两种试剂都可以应用于HCV临床检测,磁珠法试剂具有更高的灵敏度,是一种比较理想的HCV RNA定量检测试剂。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 荧光定量pcr 磁珠法
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Functional Analysis of Dunaliella salina Calmodulin Kinase Gene
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作者 Zhenyu XING Mingfang WANG +3 位作者 Xiangnan GAO Weiwei XU Yuting CONG Xiaojie CHAI 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2020年第2期10-13,20,共5页
[Objectives] This study was conducted to investigate the function of Dunaliella salina calmodulin kinase(CaM K) gene.[Methods] The sense and antisense gene fragments(223 bp) and spacer sequence(129 bp) of D.salina cal... [Objectives] This study was conducted to investigate the function of Dunaliella salina calmodulin kinase(CaM K) gene.[Methods] The sense and antisense gene fragments(223 bp) and spacer sequence(129 bp) of D.salina calmodulin kinase gene were cloned and inserted into the downstream part of the35 S promoter of the eukaryotic expression vector pM DCMGN-Cat.The siRNA expression system of CaM K gene was successfully constructed.The p CaM K-RNAi expression vector was transformed into D.salina cells by the LiA c/PEG-mediated method,giving transgenic D.salina.The expression of CaM K gene was then analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR.[Results]The expression of CaM K gene in the transgenic D.salina was significantly reduced,by 70% compared with the control group,suggesting that the expression of CaM K gene was significantly inhibited.The examination of the growth status of D.salina showed that D.salina cell division and proliferation were also affected.It is proved that CaM K gene has a positive regulation effect on the division and proliferation of D.salina cells.[Conclusions] The study provides important information for further elucidating the function and action mechanism of D.salina calmodulin kinase gene. 展开更多
关键词 DUNALIELLA SALINA CAMK RNAI LiAc/PEG-mediated method real-time fluorescence quantitative pcr
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一种新型沙眼衣原体核酸检测试剂的临床应用探讨
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作者 张西安 邓中平 刘佳 《标记免疫分析与临床》 CAS 2012年第4期210-213,共4页
目的通过对比实验,对新型沙眼衣原体(CT)核酸检测试剂(以下简称"一步法试剂")的临床使用进行评估。方法用1例CT强阳性样本进行梯度稀释,用新型沙眼衣原体免核酸提取的荧光定量PCR检测试剂和市场上最为稳定的煮沸法试剂分别进... 目的通过对比实验,对新型沙眼衣原体(CT)核酸检测试剂(以下简称"一步法试剂")的临床使用进行评估。方法用1例CT强阳性样本进行梯度稀释,用新型沙眼衣原体免核酸提取的荧光定量PCR检测试剂和市场上最为稳定的煮沸法试剂分别进行检测,考评其精确度与灵敏度。用一步法试剂与煮沸法试剂对345例临床收集的样本进行CT DNA定性检测并对比其结果。结果强阳性样本梯度稀释实验显示,一步法试剂的检测结果重复性好,灵敏度高;一步法试剂与煮沸法试剂的阳性一致性百分比为98.78%,阴性一致性百分比为99.24%,总一致性百分比为99.13%。对此结果进行Kappa检验一致性分析,结果 Kappa值=0.976,表明一步法试剂与煮沸法试剂检测的结果具有很好的一致性。结论一步法试剂与已上市的煮沸法试剂检测结果具有很好的一致性,并且操作简单、结果准确,符合临床检测要求,具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 沙眼衣原体 荧光定量pcr 一步法 煮沸法
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HCV RNA定量检测试剂的临床应用 被引量:4
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作者 徐丹 吴小宁 《晓庄学院学报(医学版)》 2012年第2期83-87,共5页
目的:探讨HCV RNA定量检测试剂的临床应用效果。方法:通过和市场上广泛使用的柱提取试剂比实验,对一种丙型肝炎病毒磁珠法核酸提取荧光定量PCR检测试剂的临床使用进行评估。结果:①浓度在5.00E+03~5.00E+06 IU/mL的样本,两种试剂的定... 目的:探讨HCV RNA定量检测试剂的临床应用效果。方法:通过和市场上广泛使用的柱提取试剂比实验,对一种丙型肝炎病毒磁珠法核酸提取荧光定量PCR检测试剂的临床使用进行评估。结果:①浓度在5.00E+03~5.00E+06 IU/mL的样本,两种试剂的定量结果与理论靶值均具有很好的对应性,具有较好的重复性和精密度;对于1.00E+03IU/mL以下的样本,磁珠法的定量结果重复性好,定量准确;而柱提取法大部分均未能检出。②对于2种方法检测的339例临床样本,中高病毒载量组柱提取法检测>5.00E+02IU/mL有147例,两种试剂定量结果基本一致,相关性r为0.9413。3 339例临床血清样本中5例样本磁珠法检测为阳性,而柱提取法检测为阴性,P<0.01,二者有显著性差异。这5例样本,丙肝肝炎抗体检测均为阳性。结论:①对于中高病毒载量的样本,两种试剂均具有良好的检测效果;②磁珠法对比柱提取法在低病毒载量区域,灵敏度更高,同时操作相对简单,不易出现污染与脱靶,具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 荧光定量pcr 磁珠法 柱提取法
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