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Rab3A相互作用蛋白对胰腺癌预后的预测价值及其介导的侵袭作用机制
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作者 丁时磊 王曙光 +2 位作者 杨坡 何彩玉 杜兴龙 《齐齐哈尔医学院学报》 2025年第7期613-620,共8页
目的 探讨胰腺癌组织Rab3A相互作用蛋白(Rab3IP)表达及其介导的侵袭作用机制。方法 收集2018年5月—2021年6月滁州第一人民医院收治的76例胰腺癌患者组织样本和临床资料,采用免疫组织化学染色检测76例胰腺癌组织和癌旁组织Rab3IP表达,分... 目的 探讨胰腺癌组织Rab3A相互作用蛋白(Rab3IP)表达及其介导的侵袭作用机制。方法 收集2018年5月—2021年6月滁州第一人民医院收治的76例胰腺癌患者组织样本和临床资料,采用免疫组织化学染色检测76例胰腺癌组织和癌旁组织Rab3IP表达,分析Rab3IP表达与胰腺癌临床资料、总体生存率(OS)、无病生存率(DFS)的关系。利用小干扰RNA技术敲低胰腺癌BxPC-3、Capan-1细胞Rab3IP表达,CCK-8检测细胞增殖能力,细胞划痕实验检测细胞迁移活性,Transwell小室检测细胞侵袭活性,Western blot检测细胞内相关蛋白表达。结果 RAB3IP在胰腺癌组织中高表达率为69.7%(53/76),明显高于癌旁组35.5%(27/76),两组比较差异具有统计学意义(χ^(2)=17.839,P<0.001)。Rab3IP表达与胰腺癌患者TNM分期、淋巴结转移、神经侵犯等有关(均P<0.05);Rab3IP表达是胰腺癌总体生存和无病生存的独立预后因素(P均<0.05)。Rab3IP高表达的胰腺癌患者总生存期和无病生存期明显低于RAB3IP低表达患者(P<0.05)。在胰腺癌BxPC-3和Capan-1细胞中,与siNCtrl组比较,siRab3IP组细胞增殖能力、迁移能力和细胞侵袭能力明显减弱,差异具有统计学意义(P<0.05)。siRab3IP组E-cadherin蛋白表达明显高于siNCtrl组,N-cadherin、MMP-2、MMP-9蛋白表达明显低于siNCtrl组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 胰腺癌组织Rab3IP表达上调,Rab3IP可能通过调节上皮间质转化(EMT)参与胰腺癌细胞的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 胰腺癌 rab3a相互作用蛋白 增殖 侵袭 上皮间质转化
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Rab3A通过调控整合素亚单位α3的异常表达参与心肌细胞缺血/再灌注损伤的过程 被引量:1
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作者 罗夏黎 涂艳虹 肖遥 《陕西医学杂志》 CAS 2025年第1期9-13,32,共6页
目的:探究G蛋白Rab3A和整合素亚单位α3(ITGA3)在心肌细胞缺血/再灌注损伤过程中的作用及潜在的可能分子机制。方法:采用缺氧/复氧法构建心肌细胞缺血/再灌注损伤模型,使用实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)检... 目的:探究G蛋白Rab3A和整合素亚单位α3(ITGA3)在心肌细胞缺血/再灌注损伤过程中的作用及潜在的可能分子机制。方法:采用缺氧/复氧法构建心肌细胞缺血/再灌注损伤模型,使用实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)检测Rab3A在心肌细胞中的表达水平。细胞计数试剂盒-8(CCK-8)和细胞凋亡检测试剂盒评估Rab3A对心肌细胞活力和凋亡的影响;使用商用试剂盒检测Rab3A对心肌细胞氧化应激的影响。双荧光素酶实验用于验证Rab3A与ITGA3的结合。结果:缺氧/复氧诱导的心肌细胞中Rab3A mRNA和蛋白表达显著下调(均P<0.05)。过表达Rab3A逆转了缺血/再灌注损伤引起的心肌细胞活力下降和细胞凋亡水平上升(均P<0.05);过表达Rab3A能够抑制缺血/再灌注损伤引起的氧化应激(P<0.05)。Rab3A与ITGA3之间存在靶向结合位点,Rab3A可调控ITGA3的表达。结论:Rab3A可通过调控ITGA3的异常表达影响心肌细胞的增殖、凋亡及氧化应激状态,参与心肌细胞缺血/再灌注损伤过程。 展开更多
关键词 rab3a 整合素亚单位α3 心肌细胞 缺血/再灌注损伤 细胞凋亡 细胞活力 氧化应激
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G蛋白Rab3a cDNA的克隆与表达 被引量:5
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作者 康巧华 陈巧林 +2 位作者 季清洲 任宏伟 茹炳根 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期75-79,共5页
利用PCR法 ,从人胎盘总cDNA中扩增得到Rab3acDNA的全编码区 .序列分析表明 ,扩增得到的Rab3acDNA有 5个核苷酸发生了变异 ,但翻译的氨基酸与发表的完全一致 .将扩增得到的Rab3acDNA克隆于原核融合表达载体pGEX 4T 1中 ,在E .coliBL2 1中... 利用PCR法 ,从人胎盘总cDNA中扩增得到Rab3acDNA的全编码区 .序列分析表明 ,扩增得到的Rab3acDNA有 5个核苷酸发生了变异 ,但翻译的氨基酸与发表的完全一致 .将扩增得到的Rab3acDNA克隆于原核融合表达载体pGEX 4T 1中 ,在E .coliBL2 1中经IPTG诱导表达 .为了进一步鉴定表达产物 ,对纯化后的Rab3a蛋白进行了SDS PAGE、N端氨基酸测序、质谱分子量测定及氨基酸组成分析鉴定 .结果显示 ,表达蛋白的分子量约 2 5kD ,N端氨基酸序列为MASATDSR ,氨基酸组成分析表明 。 展开更多
关键词 G蛋白 rab3a 克隆 表达 谷胱甘肽-Sepharose4B亲和层析
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生长抑制因子(GIF)与G蛋白Rab3a直接相互作用 被引量:4
4
作者 康巧华 陈巧林 +1 位作者 任宏伟 茹炳根 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期880-884,共5页
生长抑制因子 (growthinhibitoryfactor,GIF) ,又称金属硫蛋白 3,为 6 8个氨基酸组成的脑特异性金属硫蛋白 ,具有广泛的生理功能 ;GIF可能与阿尔茨海默氏症 (Alzheimer s)病理相关 ,在Alzheimer s脑提取物存在下 ,还对神经细胞具有特异... 生长抑制因子 (growthinhibitoryfactor,GIF) ,又称金属硫蛋白 3,为 6 8个氨基酸组成的脑特异性金属硫蛋白 ,具有广泛的生理功能 ;GIF可能与阿尔茨海默氏症 (Alzheimer s)病理相关 ,在Alzheimer s脑提取物存在下 ,还对神经细胞具有特异的生长抑制活性 .然而 ,对其发挥生长抑制作用的分子机制并不清楚 .运用酵母双杂交系统从人脑cDNA文库中筛选与GIF相互作用因子 ,从 4 1× 10 6个人脑cDNA文库转化子中 ,首次筛选到Ras家族G蛋白Rab3aC端 ,包含 87个氨基酸的片段能与GIF相互作用 ;用PCR自人胎盘总cDNA中获得包含完整Rab3a编码序列的cDNA ;通过酵母双杂交实验表明 ,全长Rab3a蛋白亦能与GIF相互作用 .免疫共沉淀和蛋白质印迹实验进一步验证了GIF与Rab3a在哺乳动物细胞中可以相互作用 ;而且 ,Rab3a是以GTP结合形式(GTP Rab3a) 展开更多
关键词 生长抑制因子 阿尔茨海默氏症 酵母双杂交系统 rab3a 免疫共沉淀 G蛋白 相互作用 GIF
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年龄对SAMP8小鼠不同脑区Rab3a含量的影响 被引量:1
5
作者 张琼 马汉 陈贵海 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2010年第2期146-148,共3页
目的探讨年龄对小鼠不同脑区Rab3a含量的影响。方法77只SAMP8小鼠分为4个年龄组:5、9、13、15月龄组。在进行行为学特征化后采用免疫印迹技术检测Rab3a蛋白和内参蛋白GAPDH在背海马、腹海马、额叶、顶叶和嗅球中的表达,Rab3a灰度值与GA... 目的探讨年龄对小鼠不同脑区Rab3a含量的影响。方法77只SAMP8小鼠分为4个年龄组:5、9、13、15月龄组。在进行行为学特征化后采用免疫印迹技术检测Rab3a蛋白和内参蛋白GAPDH在背海马、腹海马、额叶、顶叶和嗅球中的表达,Rab3a灰度值与GAPDH灰度值的比值作为Rab3a的相对含量。结果在腹海马中,15月龄SAMP8小鼠Rab3a的相对含量显著低于5、9、13月龄鼠(P值分别为0.014,<0.001及0.001),而背海马、额叶、顶叶和嗅球Rab3a含量在各个年龄段间差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论在生命过程中,SAMP8小鼠脑内Rab3a含量相对恒定,仅高龄小鼠有区域特异性降低。 展开更多
关键词 衰老 认知功能 突触蛋白类 rab3a GTP结合蛋白质类 免疫印迹法 蛋白质 小鼠
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G蛋白Rab3a协同神经生长抑制因子(GIF)抑制神经元的生长
6
作者 陈巧林 康巧华 +2 位作者 任宏伟 王宗元 茹炳根 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期534-539,共6页
为了研究G蛋白Rab3a与神经生长抑制因子 (growthinhibitoryfactor,GIF ,原称金属硫蛋白 3,MT 3)相互作用对神经元细胞生长的影响 ,以嗜铬细胞瘤株 (pheochromocytoma)PC1 2充当神经元模型 .将hMT 3(humanMT 3)和Rab3a基因分别克隆至真... 为了研究G蛋白Rab3a与神经生长抑制因子 (growthinhibitoryfactor,GIF ,原称金属硫蛋白 3,MT 3)相互作用对神经元细胞生长的影响 ,以嗜铬细胞瘤株 (pheochromocytoma)PC1 2充当神经元模型 .将hMT 3(humanMT 3)和Rab3a基因分别克隆至真核表达载体pFlag CMV 2和pSV HA中 ,质粒共同转染PC1 2细胞 ,观察转染后细胞的生长状态 .以共转染pFlag CMV 2 hMT 1和pSV HA Rab3a的细胞组作为对照 ,验证hMT 3与Rab3a相互作用对PC1 2影响的特异性 .结果发现 ,共转染pFlag CMV 2 hMT 3和pSV HA Rab3a的PC1 2细胞生长明显受到抑制 ,细胞生长抑制率与GIF在脑提取物存在F的神经元生长抑制作用接近 ,但转染两基因中的任何单个基因以及共转染pFlag CMV 2 hMT 1和pSV HA Rab3a对PC1 2细胞生长无影响 .进一步构建重组表达质粒pGEX 4T 1 Rab3a和pGEX 4T 1 hMT 3,转化大肠杆菌BL2 1 ,经谷胱甘肽 Sepharose 4B亲和层析、凝血酶酶切和SephacrylS 1 0 0纯化 ,得到纯度 95 %以上的Rab3a和hMT 3蛋白 .体外细胞生物学活性检测表明 ,表达的Rab3a蛋白与重组hMT 3蛋白共培养PC1 2 ,对细胞的生长产生了明显的特异性协同抑制作用 。 展开更多
关键词 rab3a 神经生长抑制因子 神经元 转染 抑制
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人胎盘G-蛋白Rab3a cDNA的克隆
7
作者 康巧华 季清洲 茹炳根 《北京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期271-275,共5页
为了获取全长的小分子G 蛋白Rab3a ,以用于研究Rab3a与其他蛋白相互作用关系 ,本实验以人胎盘总cDNA为模板 ,PCR扩增到人Rab3acDNA全编码区。产物回收后克隆于质粒pYESTrp2的BamHI XhoI位点 ,测序结果表明 ,本实验获得的Rab3acDNA包含... 为了获取全长的小分子G 蛋白Rab3a ,以用于研究Rab3a与其他蛋白相互作用关系 ,本实验以人胎盘总cDNA为模板 ,PCR扩增到人Rab3acDNA全编码区。产物回收后克隆于质粒pYESTrp2的BamHI XhoI位点 ,测序结果表明 ,本实验获得的Rab3acDNA包含了起始和终止密码子。与PCR引物设计的参照Rab3a比较有 5个核苷酸变异 ,与翻译的氨基酸序列完全一致。 展开更多
关键词 G-蛋白 rab3a CDNA PCR法 人胎盘 基因克隆 氨基酸序列 核苷酸变异
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G-蛋白Rab3a对神经生长抑制因子(GIF)抑制神经元细胞生长作用的影响 被引量:2
8
作者 庞立岩 茹炳根 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1069-1074,共6页
为了深入研究Rab3a和神经生长抑制因子(GIF)的相互作用,在大鼠海马神经元细胞原代培养体系中,用MTT还原法定量研究了Rab3a对GIF神经生长活性的影响,发现Rab3a可以替代脑提取物而使GIF发挥神经生长抑制活性.接着又利用多克隆抗体方法研究... 为了深入研究Rab3a和神经生长抑制因子(GIF)的相互作用,在大鼠海马神经元细胞原代培养体系中,用MTT还原法定量研究了Rab3a对GIF神经生长活性的影响,发现Rab3a可以替代脑提取物而使GIF发挥神经生长抑制活性.接着又利用多克隆抗体方法研究了GIF与Rab3a的相互作用,结果说明Rab3a是GIF发挥神经生长抑制活性所必需的蛋白质,并且它们的相互作用受空间位置的因素影响较大.在随后对它们相互作用的机理和可能的生物学意义进行了讨论. 展开更多
关键词 rab3a GIF 相互作用 大鼠海马神经元细胞培养 MTT还原测定法
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神经生长抑制因子(GIF)和小分子G蛋白Rab3a在大鼠脑组织中的定位研究 被引量:1
9
作者 王顺 于龙川 任宏伟 《渤海大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第2期144-146,共3页
神经生长抑制因子(GIF)是金属硫蛋白家族中唯一具有明确生理功能的成员,在Alzheimer's症脑提取物存在下,对神经细胞的生长还具有抑制作用。Rab3a为小分子G蛋白的一种,通常以一种Ca2+依赖形式在调控神经递质释放的过程中起着十分重... 神经生长抑制因子(GIF)是金属硫蛋白家族中唯一具有明确生理功能的成员,在Alzheimer's症脑提取物存在下,对神经细胞的生长还具有抑制作用。Rab3a为小分子G蛋白的一种,通常以一种Ca2+依赖形式在调控神经递质释放的过程中起着十分重要的作用。目的:本文用免疫组织化学的方法验证二者间的相互作用。方法:利用酶标定和荧光标定的免疫组化方法,确定GIF和Rab3a蛋白在大鼠脑中的分布定位及其二者的共定位。结果:用ABCKit进行酶标定测得GIF和Rab3a在鼠大脑中的主要分布区域为脑皮层、海马等部位,用荧光标定的方法确定GIF和Rab3a两蛋白能在脑组织中共定位。结论:GIF和Rab3a广泛分布于脑组织中,且二者有共定位行为,为二者间存在相互作用提供了有力的证据。 展开更多
关键词 神经生长抑制因子(GIF) rab3a 酶标定 荧光双标定
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大鼠急性脊髓损伤早期Rab3a的表达 被引量:3
10
作者 宿献伟 周成福 马晓茹 《黑龙江医药科学》 2012年第4期38-39,共2页
目的:对脊髓损伤大鼠组织中不同时间段的Rab3a表达情况进行观察,研究Rab3a在损伤的脊髓组织中对神经再生的影响。方法:SD大鼠56只,随机分成7组,6组制作成急性脊髓损伤模型,另一组作为对照组。分别于伤后0h、6h、12h、24h、48h、72h,采... 目的:对脊髓损伤大鼠组织中不同时间段的Rab3a表达情况进行观察,研究Rab3a在损伤的脊髓组织中对神经再生的影响。方法:SD大鼠56只,随机分成7组,6组制作成急性脊髓损伤模型,另一组作为对照组。分别于伤后0h、6h、12h、24h、48h、72h,采用免疫组化法检测损伤脊髓组织中Rab3a的表达。结果:免疫组化法显示Rab3a在脊髓损伤后6h表达下降到最低,之后有所升高,1d表达最高,后再次降低。结论:Rab3a在脊髓损伤后6h表达不明显,之后随着时间的延长表达逐渐增加,1d后再次降低,表明脊髓损伤后Rab3a表达随时间先降低而后升高,之后再次降低的变化,对脊髓损伤动物神经功能的恢复有重要作用。 展开更多
关键词 脊髓损伤 rab3a 神经再生
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GIF和Rab3a的表达纯化及其在AD病人脑提取液中的含量
11
作者 王顺 赵伟 任宏伟 《锦州医学院学报》 2004年第4期36-39,共4页
目的 验证AD病人脑中存在GIF和Rab3a蛋白。方法 采用GST表达系统在E coli中把构建好的质粒 pGEX - 4T -GIF、pGEX - 4T -Rab3a ,经转化、诱导表达、亲和层析、凝血酶切和进一步纯化 ,得到GIF和Rab3a目的蛋白。利用已纯化好的目的蛋白... 目的 验证AD病人脑中存在GIF和Rab3a蛋白。方法 采用GST表达系统在E coli中把构建好的质粒 pGEX - 4T -GIF、pGEX - 4T -Rab3a ,经转化、诱导表达、亲和层析、凝血酶切和进一步纯化 ,得到GIF和Rab3a目的蛋白。利用已纯化好的目的蛋白做标准品 ,用直接型酶联免疫吸附测试 (ELISA)方法初步测定AD病人脑提取物中GIF和Rab3a的蛋白含量。结果 通过电泳表明 ,成功表达纯化得到了G蛋白Rab3a和GIF蛋白 ,利用Rab3a和GIF多克隆抗体用ELISA方法对AD症病人脑提取物中两蛋白的含量进行初步测定 ,结果表明在AD症病人的脑提取物中GIF的含量应为 98 89ng/ml左右、Rab3a的含量为 2 6 6 7ng/ml左右。 结论 在AD病人脑中存在GIF和Rab3a这两种物质。 展开更多
关键词 神经生长抑制因子(GIF) rab3a 酶联免疫吸附测试(ELISA)
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Alteration of the Expression Levels of Rab3A Affects the Extent of Transcytosis of HRP-Labeled Marker Proteins in Rat CNS Neurons
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作者 Yoshiki Takeuchi Yoshiki Matsumoto +5 位作者 Takanori Miki Katsuhiko Warita Zhi-Yu Wang Kuldip S. Bedi Tomiko Yakura Jun-Qian Liu 《Neuroscience & Medicine》 2011年第3期282-287,共6页
It has been hypothesized that Rab3A, a small GTPase, may be closely involved in the process of dense core vesicle exocytosis in various cell types. This possibility was investigated by disrupting the expression levels... It has been hypothesized that Rab3A, a small GTPase, may be closely involved in the process of dense core vesicle exocytosis in various cell types. This possibility was investigated by disrupting the expression levels of Rab3A-mRNA using a small interfering RNA of the Rab3A GTPase (Rab3A-siRNA) and examining the effect of this on transcytosis of wheat germ agglutinin conjugated with horseradish peroxidase (WGA-HRP). Rab3A-siRNA and WGA-HRP were injected into the right vagus nerves of adult rats which were killed 12, 24 or 48 hours later. In some animals, portions of the brain stem containing the nucleus of solitary tract (NST) were prepared for electron microscopy. In other animals, the nodose ganglion of the vagus nerve was used to determine the levels of expression of Rab3A-mRNA using RT-PCR techniques. It was found that the expression of Rab3A-mRNA was markedly depressed in animals at 12 h after the Rab3A-siRNA injection. In the NST, there was an accumulation of HRP-reaction product (RP), recognized as electron dense lysosomal-like structures, in both axons and terminals in the NST 12 h after injection. Some HRP-RP was found in membrane bound vesicles in close proximity to cell membranes and appeared to be in the process of transcytosis. This neuronal transcytosis of HRP-RP appeared to occur at random locations over the axodendritic membranes. These findings indicate that inhibiting the expression of Rab3A-mRNA using Rab3A-siRNA can modulate the level of transcytosis of proteins across neuronal membranes confirming the potentially important role of this GTPase in the process of transcytosis. 展开更多
关键词 rab3a-siRNA WGA-HRP TRANSCYTOSIS Synapse VAGUS Nerve Nucleus of SOLITARY Tract VESICLE Docking Quantitative Real Time RT-PCR
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记忆基因(Rab3A)的系统发育分析
13
作者 乔战龙 杨静芬 +1 位作者 魏志伟 刘涛 《生物过程》 2018年第1期1-10,共10页
Rab3A是动物大脑中丰度最高的Rab蛋白,而Rab蛋白通过胞吞和胞吐的方式在囊泡运输中起重要作用,由此可见,Rab3A基因对于调控动物的记忆有很重要的作用。从NCBI数据库下载原始核苷酸序列,运用Blast+同源性比对、共线性分析软件ColinearSca... Rab3A是动物大脑中丰度最高的Rab蛋白,而Rab蛋白通过胞吞和胞吐的方式在囊泡运输中起重要作用,由此可见,Rab3A基因对于调控动物的记忆有很重要的作用。从NCBI数据库下载原始核苷酸序列,运用Blast+同源性比对、共线性分析软件ColinearScan、MCscanX进行共线性分析,用MEGA7.0软件中Maximum Likelihood法,Neighbor-joining法分别构建进化树,由于从原始数据进行同源性、共线性分析比对,所以得到了一致性的系统发育树。Rab3A基因的系统发育树与物种发育树一致,由此说明该基因的进化是随着物种的分歧一同发生的,是一种相对古老的基因。 展开更多
关键词 rab3a 系统进化发育 基因 动物
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GTP-bound Rab3A exhibits consecutive positive and negative roles during human sperm dense-core granule exocytosis
14
作者 Matias A. Bustos Carlos M. Roggero +2 位作者 Paola X. De la Iglesia Luis S. Mayorga Claudia N. Tomes 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2014年第4期286-298,共13页
Exocytosis of mam maUan sperm dense-core secretory granule relies on the same fusion molecules as all other secretory cells; one such molecule is the small GTPase Rab3A. Here, we report an in-depth biochemical charact... Exocytosis of mam maUan sperm dense-core secretory granule relies on the same fusion molecules as all other secretory cells; one such molecule is the small GTPase Rab3A. Here, we report an in-depth biochemical characterization of the role of Rab3A in secretion by scrutinizingthe exocytotic response of streptolysin O-permeabiUzed human sperm to the acute application of a number of Rab3A-containing constructs and correlating the findings with those gathered with the endogenous protein. Full length, geranyigeranyiated, and active Rab3A elicited human sperm exocytosis perse. With Rab3A/Rab22A chimeric proteins, we demonstrated that the carboxy-terminal domain of the Rab3A molecule was necessary and sufficient to promote exocytosis, whereas its amino.terminus prevented calcium-triggered secretion. Interestingly, full length Rab3A halted secretion when added after the docking of the acrosome to the plasma membrane. This effect depended on the inability of Rab3A to hydrolyze GTP. We combined modified immunofluorescence and acrosomal staining protocols to detect membrane fusion and the activation status of endogenous Rab3 simultaneously in individual cells, and found that GTP hydrolysis on endogenous Rab3 was mandatory for fusion pores to open. Our findings contribute to establishing that Rab3 modulates regulated exocytosis differently depending on the nucleotide bound and the exocytosis stage under study. 展开更多
关键词 Rab3 cycle GTP hydrolysis EXOCYTOSIS ACROSOME calcium sperm
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综合分析RAB3B在肝细胞癌中的表达及其与糖酵解的关系
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作者 刘旭昇 吴瑞敏 《湖北医药学院学报》 2025年第3期272-279,共8页
目的:本研究旨在通过生物信息学和免疫组化染色(IHC)分析RAB3B基因在肝细胞癌(LIHC)中的表达模式及其与诊断、预后和肿瘤细胞糖酵解的相关性。方法:利用TCGA和GEO数据库中的数据,通过差异基因筛选、相关性分析、诊断效能评估、预后分析... 目的:本研究旨在通过生物信息学和免疫组化染色(IHC)分析RAB3B基因在肝细胞癌(LIHC)中的表达模式及其与诊断、预后和肿瘤细胞糖酵解的相关性。方法:利用TCGA和GEO数据库中的数据,通过差异基因筛选、相关性分析、诊断效能评估、预后分析、功能富集分析和糖酵解相关性分析等步骤,探讨RAB3B在LIHC中的作用。通过IHC染色验证RAB3B的表达差异。结果:RAB3B在LIHC肿瘤样本中的表达显著高于正常样本(P<005),并展现出较高的诊断效能(TCGA LIHC;AUC:0.878,95%CI=0.841~0.916)。RAB3B表达水平与患者的总体生存(OS)和无复发存活率(RFS)密切相关(P<0.05)。IHC结果证实肿瘤样本中RAB3B表达显著高于癌旁样本(P<0.05)。功能富集分析表明RAB3B与329个基因相关,涉及糖蛋白生物合成及内质网蛋白质加工等过程。此外,RAB3B表达与糖酵解关键基因GPI的mRNA表达水平呈正相关(P<0.05)。结论:RAB3B的高表达与LIHC患者的进展、预后和糖酵解密切相关,它可能成为LIHC预测预后的生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 RAB3B 肝细胞癌 肿瘤标志物 糖酵解 预后分析
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Galectin-3及P27蛋白表达在胃癌进展中的意义
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作者 吕芳 刘言厚 杨树林 《中国误诊学杂志》 CAS 2009年第25期6080-6081,共2页
目的:主要是探讨Galectin-3蛋白及P27蛋白在正常胃黏膜、不典型增生、早期胃癌进展期胃癌中的表达与临床病理特征的相关性。方法:采用免疫组织化学S-P法检测正常胃黏膜组(40例)、不典型增生组(45例)、早期胃癌组(35例)、进展期胃癌(50例... 目的:主要是探讨Galectin-3蛋白及P27蛋白在正常胃黏膜、不典型增生、早期胃癌进展期胃癌中的表达与临床病理特征的相关性。方法:采用免疫组织化学S-P法检测正常胃黏膜组(40例)、不典型增生组(45例)、早期胃癌组(35例)、进展期胃癌(50例)的Galectin-3、P27蛋白表达情况。结果:Galectin-3蛋白胃癌组织中阳性表达率为71.8%,在分化较高与分化较低的胃癌中的阳性率分别为72.6%和69.8%。结论:Galectin-3蛋白及P27蛋白在胃癌组织中的表达没有明显相关性,但能通过检测两者会大大提高早期胃癌早诊率,进一步提高患者生存率。 展开更多
关键词 胃肿瘤/病理学/代谢 半乳糖凝集素3/代谢 rab3aGTP结合蛋白质/代谢 人类
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三角帆蚌Rab3 cDNA全长克隆及其与三角帆蚌瘟病相关性鉴定 被引量:2
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作者 许宝红 肖调义 +4 位作者 刘巧林 苏建明 陈开健 刘敏 周伟 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第29期64-71,共8页
根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列,运用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得三角帆蚌Rab3基因的全长cDNA序列(GenBank登录号为HQ190954)。序列全长1707bp,开放阅读框666bp,编码221个氨基酸,5’... 根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列,运用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得三角帆蚌Rab3基因的全长cDNA序列(GenBank登录号为HQ190954)。序列全长1707bp,开放阅读框666bp,编码221个氨基酸,5’端非编码区为158bp,3’端非编码区为883bp。NCBI Blastp进行氨基酸序列相似性分析表明,与居蟹皮海绵(Suberites domuncula)的Rab-3like(SdRab3)氨基酸相似性最高,为64%。以氨基酸序列构建进化树,首先与居蟹皮海绵的Rab3-like(SdRab3)聚为一支。原核表达结果表明,在30℃,5h,1mmol/LIPTG的诱导条件下,Rab3蛋白得到高效表达,重组菌体经裂解和SDS-PAGE电泳分析,发现一条26kD左右特异的蛋白表达条带,其表达量约占菌体总蛋白30%。用嗜水气单孢菌感染三角帆蚌后,Western-blot检测表明,在健康组和病变三角帆蚌肝脏中,Rab3蛋白与β-actin的表达量比值分别为0.438和0.580,说明Rab3基因在三角帆蚌经病原菌侵染后,表达量上调。初步推测三角帆蚌Rab3蛋白可能与三角帆蚌瘟病有关。 展开更多
关键词 三角帆蚌 Rab3 原核表达 WESTERN-BLOT
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Rab3D对食管鳞状细胞癌细胞系增殖及细胞周期素D1表达的影响
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作者 袁东方 武莉萍 +2 位作者 吴冬梅 杨留勤 杨万才 《新乡医学院学报》 CAS 2016年第5期369-372,共4页
目的探讨Rab3D对人食管鳞状细胞癌细胞系增殖及细胞周期素D1(Cyclin D1)表达的影响。方法采用Western blot法从8株人食管鳞状细胞癌细胞系KYSE410、KYSE450、TE-1、TE-7、KYSE510、KYSE150、EC9706、EC109中筛选出Rab3D表达较低的2株食... 目的探讨Rab3D对人食管鳞状细胞癌细胞系增殖及细胞周期素D1(Cyclin D1)表达的影响。方法采用Western blot法从8株人食管鳞状细胞癌细胞系KYSE410、KYSE450、TE-1、TE-7、KYSE510、KYSE150、EC9706、EC109中筛选出Rab3D表达较低的2株食管鳞状细胞癌细胞株KYSE410、KYSE450及Rab3D表达较高的2株食管鳞状细胞癌细胞株EC109、EC9706,将KYSE410、KYSE450细胞株分别分为转染Rab3D质粒的Rab3D组和转染空载体的对照组,将EC109、EC9706细胞株分别分为转染Rab3D小干扰RNA(siRNA)的Rab3D siRNA组和转染阴性对照的阴性对照组,MTT法检测Rab3D对食管鳞状细胞癌细胞的增殖及Cyclin D1表达的影响,Western blot检测Cyclin D1蛋白的表达。结果 KYSE410、KYSE450食管鳞状细胞癌细胞株转染Rab3D组细胞的吸光度与本细胞株对照组比较,在转染后12 h差异无统计学意义(P>0.05),转染后24、48、72 h均高于本细胞株对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。EC109、EC9706食管鳞状细胞癌细胞株转染siRNA组细胞的吸光度在转染后12、24 h与本细胞株阴性对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),转染后48、72 h均低于本细胞株阴性对照组(P<0.05)。KYSE410、KYSE450细胞转染Rab3D组Cyclin D1蛋白表达水平较本细胞株对照组增高(P<0.05);EC109、EC9706细胞转染siRNA组的Cyclin D1蛋白表达水平较本细胞株阴性对照组降低(P<0.05)。结论 Rab3D促进食管鳞状细胞癌细胞的增殖,机制可能与促进Cyclin D1的表达有关。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌细胞株 Rab3D 增殖
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一种免疫诱导型鲤启动子的克隆与功能分析
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作者 赵紫霞 张研 +3 位作者 曹顶臣 孙昭宁 许建 徐鹏 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1829-1837,共9页
为发掘适用于基因工程抗病育种的鱼类启动子,通过实时荧光定量PCR实验对鲤Rab GTP酶(Ras-associated binding-GTPases 1a3,Rab1a3)基因的表达模式进行了分析,证实该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录水平较高,且... 为发掘适用于基因工程抗病育种的鱼类启动子,通过实时荧光定量PCR实验对鲤Rab GTP酶(Ras-associated binding-GTPases 1a3,Rab1a3)基因的表达模式进行了分析,证实该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录水平较高,且免疫激活后转录显著增强,符合基因工程抗病育种所需的外源免疫基因转录模式。从鲤细菌人工染色体文库中,使用Rab1a3基因特异引物筛选获得包含该基因区域的文库克隆,测序获得该基因完整序列,以及上下游调控序列。通过生物信息学手段,预测到长度为1014 bp的鲤Rab1a3基因启动子序列,该启动子不具有典型的TATA盒或CpG岛特征,存在多个免疫相关转录因子结合位点。在草鱼肾组织细胞系内验证该启动子活性,结果显示,绿色荧光蛋白基因和萤火虫荧光素酶基因都能够在该启动子驱动下表达,证实该片段具有启动子活性,且启动子活性在受到免疫诱导后增强,双荧光素酶报告基因检测结果显示,该启动子活性在免疫刺激后增强至免疫刺激前的8.67倍。研究表明,鲤Rab1a3基因启动子有望被开发成为免疫诱导型的基因工程元件,驱动外源免疫基因在鱼体内适时表达,抵御外界病原感染,同时避免非必要条件下的过度表达形成生长负担。 展开更多
关键词 Rab1a3基因 启动子 免疫诱导
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miR-125b-5p通过负调控RAB3D基因表达抑制骨肉瘤细胞增殖与迁移 被引量:4
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作者 谈秋瑜 吴旭 +2 位作者 纪方 吴少云 颜亮 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期68-75,共8页
目的 探讨miR-125b-5p调控RAB3D在骨肉瘤增殖与迁移中的作用机制。方法 通过qRT-PCR检测正常骨细胞hFOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达水平。骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过EDU和Tra... 目的 探讨miR-125b-5p调控RAB3D在骨肉瘤增殖与迁移中的作用机制。方法 通过qRT-PCR检测正常骨细胞hFOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达水平。骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤细胞增殖和迁移的变化;通过生物信息学软件预测miR-125b-5p可能调控的靶基因为RAB3D;通过Western blot检测正常骨细胞h FOB1.19、骨肉瘤细胞系(MG63、HOS)中RAB3D的表达水平;骨肉瘤细胞系中通过脂质体转染升高或降低miR-125b-5p的表达,通过Western blot及qRT-PCR实验检测骨肉瘤细胞中RAB3D mRNA及蛋白表达水平;并在骨肉瘤细胞中通过脂质体转染升高或降低RAB3D的表达,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤增殖和迁移的变化;随后在骨肉瘤细胞中通过脂质体转染同时升高miR-125b-5p和RAB3D的表达量,通过EDU和Transwell实验检测骨肉瘤细胞增殖和迁移的变化。结果 qRT-PCR结果表明在骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中miR-125b-5p的表达明显下调(P<0.05)。3种生物信息学软件预测RAB3D是miR-125b-5p可能调控的靶基因。qRT-PCR、Western blot结果显示,miR-125b-5p表达量升高,骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中RAB3D的蛋白表达量下降(P<0.05);miR-125b-5p表达量降低,骨肉瘤细胞(MG63、HOS)中RAB3D的蛋白表达量下降(P<0.05),而RAB3D的mRNA水平没有发生变化。细胞增殖及迁移实验结果显示,miR-125b-5p与RAB3D对细胞增殖及迁移的影响相反,而同时在骨肉瘤细胞内升高miR-125b-5p与RAB3D的表达量,RAB3D对骨肉瘤细胞增殖及迁移的影响在重新升高miR-125b-5p表达量时被阻断(P<0.05)。结论 miR-125b-5p在转录后水平通过调控RAB3D的表达抑制了骨肉瘤细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 miR-125b-5p RAB3D 骨肉瘤细胞 细胞增殖 细胞迁移
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