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题名杂交石斑鱼亲本种源鉴定方法的建立与应用
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作者
程梦薇
王焕
丁少雄
柳淑芳
庄志猛
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机构
浙江海洋大学
海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
厦门大学海洋与地球学院
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出处
《渔业科学进展》
北大核心
2025年第5期23-33,共11页
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基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-47)
基本科研业务费渔业科学数据基础性长期性监测项目(20603022024023)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费(2024JC0101)共同资助。
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文摘
石斑鱼(Epinephelus)养殖是我国海水养殖的重要产业之一,近年来规模化的种间杂交已成为石斑鱼繁育采用的普遍方法。石斑鱼种间杂交选育虽然有力促进了石斑鱼养殖业发展,但也为石斑鱼的种类鉴定和种质保存带来了困扰,且杂交斑逃逸也会对物种基因库造成污染。杂交斑兼具双亲的形态特征,仅根据形态鉴定比较困难。因此,迫切需要对杂交石斑鱼及其亲本进行精准判别和鉴定,以保障石斑鱼产业健康可持续发展。本研究在比较杂交石斑鱼F1代及其亲本形态学特征差异的基础上,使用线粒体基因COⅠ和核基因RYR3双重分子标记对云龙石斑鱼(E.moara♀×E.lanceolatus♂)、虎龙杂交斑(E.fuscoguttatus♀×E.lanceolatus♂)、金虎杂交斑(E.fuscoguttatus♀×E.tukula♂)、杉虎斑(E.fuscoguttatus♀×E.polyphekadion♂)、龙鼠斑(C.altivelis♀×E.lanceolatus♂)等5种常见杂交斑进行亲本种源鉴定。结果显示,杂交斑体型与母本相似,例如,云龙石斑鱼、虎龙杂交斑、金虎杂交斑和杉虎斑均为椭圆形,而龙鼠斑头部尖突、背部隆起。杂交斑的体色和花纹兼具双亲特征,其中,金虎杂交斑和杉虎斑均与其双亲体色及花纹相似性较高,难以通过体色区分杂交后代与父母本;云龙石斑鱼、虎龙杂交斑、龙鼠斑则融合双亲颜色,表现出新的体色模式;5种杂交斑与各自母本的COⅠ基因遗传距离为0.000~0.002,均小于0.020;其系统发育树中,杂交斑均与各自母本聚为一支。可见,COⅠ基因能够准确甄别杂交斑的母本;鉴于杂交斑核基因携带双亲遗传信息,通过计算杂交斑的亲本间RYR3基因遗传距离范围(0.006~0.023)和构建系统发育树,可以有效区分每个纯种的石斑鱼,说明RYR3适合作为分子标记辅助COⅠ基因用于杂交石斑鱼的父母本判别;基于上述结果,建立了COⅠ与RYR3双重分子标记的杂交石斑鱼亲本种源鉴定方法。首先,根据待测样品的RYR3基因序列的杂合度判定是否为杂交斑;同时,经序列比对确认其亲本信息;如果为杂交斑,再结合COⅠ鉴定结果甄别父母本;应用该方法对16份杂交石斑鱼样品的父母本进行种源鉴定,鉴定结果均与其记录双亲信息一致,表明杂交斑亲本种源鉴定方法可行有效。以上结果表明,COⅠ与RYR3双重分子标记技术可实现杂交石斑鱼亲本的准确判别,可为石斑鱼种质资源保护及其遗传育种提供重要参考。
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关键词
杂交石斑鱼
亲本种源鉴定
分子标记
COⅠ
ryr3
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Keywords
Hybrid groupers
Parental origin identification
Molecular markers
COⅠ
ryr3
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分类号
S937
[农业科学—渔业资源]
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