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猪RXRB基因SNPs检测及其与生长育肥和繁殖性状的关联分析 被引量：8
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作者 彭雅鑫 刘军 +2 位作者 赵诗瑜 徐在言 左波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期596-609,共14页
旨在研究猪RXRB基因多态性位点,并筛选与猪生长育肥和繁殖性状显著相关的SNPs,为种猪的遗传改良提供新的遗传标记位点。本研究通过采集962头健康大白猪(美系大白459头,法系大白503头)的血液DNA,利用直接测序法和PCR-RFLP技术分别检测两... 旨在研究猪RXRB基因多态性位点,并筛选与猪生长育肥和繁殖性状显著相关的SNPs,为种猪的遗传改良提供新的遗传标记位点。本研究通过采集962头健康大白猪(美系大白459头,法系大白503头)的血液DNA,利用直接测序法和PCR-RFLP技术分别检测两个品系大白猪RXRB基因SNP位点,并进行遗传多态性分析。利用SAS 8.0软件中的混合线性模型(Mixed)对RXRB基因SNP位点与表型性状值进行关联分析。利用Haploview 4.2软件对RXRB基因SNP位点进行连锁不平衡分析。结果显示,在两个品系大白猪群中共检测到10个SNPs,其中,美系大白有5个SNPs,法系大白有5个SNPs。经X^(2)适合性检验,该10个SNPs在大白猪群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,rs340542491、rs330162688和rs326226767与达100 kg体重日龄达到显著相关(P<0.05);rs340542491、rs330162688、rs336609453和rs332169586与活体背膘厚达到显著相关(P<0.05);rs340542491、rs325538588、rs691889709和rs323107853与初生重达到显著相关(P<0.05);在体长中,仅rs324141460的GA基因型个体显著大于GG基因型(P<0.05);rs325538588和rs80789331与眼肌面积达到显著相关(P<0.05);在乳头数中,rs340542491和rs330162688与左乳头数达到极显著相关(P<0.01),rs324141460与左、右乳头数达到极显著相关(P<0.01),rs336609453和rs332169586与右乳头数达到显著相关(P<0.05)。连锁不平衡分析结果显示,在美系大白中,rs326226767-rs325538588处于强连锁不平衡状态(D’=0.96,r^(2)=0.91>0.33),rs330162688-rs324141460处于完全连锁状态(D’=1),rs324141460-rs340542491处于完全连锁状态(D’=1),单倍型组合关联分析结果与单个SNP关联分析结果一致,单倍型组合与达100 kg体重日龄、活体背膘厚、初生重和乳头数等性状存在极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)相关;在法系大白中,rs691889709-rs323107853处于完美连锁状态(D’=1,r^(2)=1),单倍型组合关联分析结果显示,单倍型组合与体长和乳头数达到极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)相关。以上结果提示,RXRB基因内的10个SNPs可以作为猪育种改良的分子标记,同时对深入研究该基因功能具有一定的参考意义。 展开更多
关键词 rxrb 关联分析 连锁不平衡 单倍型 生长育肥 繁殖性状 猪
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RXRB基因rs2076310位点多态性与广东省汉族人群2型糖尿病的相关性研究
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作者 于海兵 胡维 +6 位作者 王姝 何小艺 闫妍 潘海燕 孔丹莉 林子牛 丁元林 《国际医药卫生导报》 2019年第2期173-177,共5页
目的 探讨类视黄醇X受体β(RXRB)基因rs2076310位点多态性与广东省汉族人群2型糖尿病(T2DM)易感性的相关性。方法 采用病例对照研究设计纳入1 092例T2DM患者和1 092名健康对照,运用SNPscanTM技术对RXRB基因rs2076310位点的单核苷酸多态... 目的 探讨类视黄醇X受体β(RXRB)基因rs2076310位点多态性与广东省汉族人群2型糖尿病(T2DM)易感性的相关性。方法 采用病例对照研究设计纳入1 092例T2DM患者和1 092名健康对照,运用SNPscanTM技术对RXRB基因rs2076310位点的单核苷酸多态性(SNP)进行分型检测,并对两组间分型结果进行统计分析。结果 RXRB基因rs2076310位点的等位基因频率和基因型频率在T2DM患者和对照间分布差异均无统计学意义(均P >0.05),并且在不同遗传模型中两组间基因型分布比较差异均无统计学意义(均P >0.05)。结论 广东省汉族人群T2DM患者易感性与RXRB基因rs2076310位点多态性不具有相关性。 展开更多
关键词 2型糖尿病 单核苷酸多态性 rxrb基因
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