目的基于网络药理学及分子对接技术研究葛根素(puerarin)治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的关键靶点和作用机制。方法利用葛根素的化学结构信息通过SwissTargetPrediction数据库和SuperPred数据库检索葛根素的作用靶点,通过GeneCards数据库和O...目的基于网络药理学及分子对接技术研究葛根素(puerarin)治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的关键靶点和作用机制。方法利用葛根素的化学结构信息通过SwissTargetPrediction数据库和SuperPred数据库检索葛根素的作用靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取RVO相关靶点。将葛根素作用靶点和RVO相关靶点取交集,得到葛根素治疗RVO的潜在作用靶点。在STRING平台上进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape 3.10.3软件对结果进行可视化及计算,得到葛根素治疗RVO的潜在关键靶点。使用Metascape Version 3.5在线分析平台进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析葛根素治疗RVO的潜在作用机制。采用分子对接技术验证葛根素与关键靶点的结合活性。结果经筛选得到葛根素治疗RVO潜在作用靶点130个,其中潜在关键靶点20个。GO功能富集分析表明这些靶点主要与氧化应激反应、细胞迁移等生物过程,细胞外基质、质膜脂筏等细胞组分,激酶结合、氧化还原酶活性等分子功能有关。KEGG信号通路富集分析显示,葛根素治疗RVO的主要通路有HIF-1信号通路、MAPK通路和糖尿病并发症的AGE-RAGE等。分子对接显示葛根素与6个靶点有强烈的结合活性。结论葛根素可能作用于PTGS2、AKT1、MAPK3、CASP3、TNF、IL-6等靶点,通过调控HIF-1、MAPK、糖尿病并发症的AGE-RAGE等信号通路起到治疗RVO的作用。展开更多
文摘目的基于网络药理学及分子对接技术研究葛根素(puerarin)治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的关键靶点和作用机制。方法利用葛根素的化学结构信息通过SwissTargetPrediction数据库和SuperPred数据库检索葛根素的作用靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取RVO相关靶点。将葛根素作用靶点和RVO相关靶点取交集,得到葛根素治疗RVO的潜在作用靶点。在STRING平台上进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape 3.10.3软件对结果进行可视化及计算,得到葛根素治疗RVO的潜在关键靶点。使用Metascape Version 3.5在线分析平台进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析葛根素治疗RVO的潜在作用机制。采用分子对接技术验证葛根素与关键靶点的结合活性。结果经筛选得到葛根素治疗RVO潜在作用靶点130个,其中潜在关键靶点20个。GO功能富集分析表明这些靶点主要与氧化应激反应、细胞迁移等生物过程,细胞外基质、质膜脂筏等细胞组分,激酶结合、氧化还原酶活性等分子功能有关。KEGG信号通路富集分析显示,葛根素治疗RVO的主要通路有HIF-1信号通路、MAPK通路和糖尿病并发症的AGE-RAGE等。分子对接显示葛根素与6个靶点有强烈的结合活性。结论葛根素可能作用于PTGS2、AKT1、MAPK3、CASP3、TNF、IL-6等靶点,通过调控HIF-1、MAPK、糖尿病并发症的AGE-RAGE等信号通路起到治疗RVO的作用。
