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题名结核分枝杆菌TrpC蛋白生物信息学分析
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作者
高岩
彭英杰
牟莹莹
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机构
潍坊市妇幼保健院
潍坊市人民医院
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出处
《现代诊断与治疗》
2025年第9期1265-1268,1289,共5页
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基金
潍坊市科学技术发展计划(项目编号2024YX065)
潍坊市科学技术发展计划(项目编号2024YX061)。
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文摘
目的 应用生物信息学的方法 预测结核分枝杆菌TrpC蛋白结构和功能。方法 从GenBank数据库中获取TrpC全部基因信息,利用Prot Param、ExPASy、ABCpred、NetNGlyc 1.0、SignalP、NetOGlyc 4.0等软件分析TrpC蛋白理化性质、信号肽、磷酸化位点,利用SOPMA、SWISS-MODEL等软件分析TrpC蛋白二级结构并建立三级结构模型,利用MEGA7.0和STRING对TrpC蛋白进行系统进化树分析和蛋白相互作用预测。结果 Rv1611基因全长819 bp,其编码的TrpC蛋白含有272个氨基酸,稳定性指数为33.40,定义其为稳定蛋白位,无信号肽含有大量潜在磷酸化位点;TrpC蛋白二级结构以α-螺旋为主;TrpC可以与TrpD、TrpG、TrpA、TrpB等蛋白相互作用。结论 生物信息学分析表明,TrpC蛋白是一种具有多种潜在表位的亲水性蛋白,可作为开发结核病疫苗的候选蛋白。
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关键词
结核分枝杆菌
rv1611
TRPC
生物信息学分析
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Keywords
Mycobacterium tuberculosis
rv1611
TrpC
Bioinformatics analysis
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分类号
R373.1
[医药卫生—病原生物学]
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