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番木瓜环斑病毒株系的分子生物学方法鉴定 被引量：8
1
作者 贺国安 肖火根 +2 位作者 张曙光 李华平 范怀忠 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期21-25,共5页
以 PRSV株系特异性引物对 PRSV的 PRSV12 6 (PRSV日本分离物 )、Ys、Vb和 Sm等株系进行 RT- PCR方法鉴定 ,引物 PR2 1/ PR2 2能把 Ys从 Vb和 Sm中鉴定出来 ,PR30 0 / PR30 1则能把 Vb从 Ys、Sm和 PRSV12 6中鉴定出来 ;用限制性内切酶 Ha... 以 PRSV株系特异性引物对 PRSV的 PRSV12 6 (PRSV日本分离物 )、Ys、Vb和 Sm等株系进行 RT- PCR方法鉴定 ,引物 PR2 1/ PR2 2能把 Ys从 Vb和 Sm中鉴定出来 ,PR30 0 / PR30 1则能把 Vb从 Ys、Sm和 PRSV12 6中鉴定出来 ;用限制性内切酶 Hae II、Sau3A I和 Hinf I对 PRSV的PRSV12 6、Ys、Vb和 Sm等株系进行单酶切 RT- PCR- RFLP分析 ,Hinf I能把 PRSV12 6与 Ys、Vb和Sm鉴别开来 ,Sau3A I能把 Ys与 Vb和 Sm鉴别开来 ,Hae II则能把 Ys与 PRSV12 6、Vb和 Sm鉴别开来 ;以 P1/ P2为引物 ,对 Vb、Ys和 Sm株系进行 RT- PCR- RFLP- SSCP分析 ,结果能一次把三者较好地区别开来。 展开更多
关键词 分子生物学方法 番木瓜环斑病毒 株系鉴定 RT-PCR RT-PCR-RFLP rt-pcr-rflp-sscp
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番木瓜环斑病毒株系的分子生物学方法鉴定
2
作者 贺国安 《中山大学研究生学刊（自然科学与医学版）》 2002年第3期96-102,共7页
以 PRSV 株系特异性引物对 PRSV 的 PRSV126(PRSV 日本分离物)、Ys、Vb 和 Sm 等株系进行 RT-PCR 方法鉴定,引物 PR21/PR22 能把Ys 从 Vb 和 Sm 中鉴定出来,PR300/PR301则能把 Vb 从 Ys、Sm 和 PRSV126中鉴定出来;用限制性内切酶 Hae Ⅱ... 以 PRSV 株系特异性引物对 PRSV 的 PRSV126(PRSV 日本分离物)、Ys、Vb 和 Sm 等株系进行 RT-PCR 方法鉴定,引物 PR21/PR22 能把Ys 从 Vb 和 Sm 中鉴定出来,PR300/PR301则能把 Vb 从 Ys、Sm 和 PRSV126中鉴定出来;用限制性内切酶 Hae Ⅱ、Sau3A Ⅰ和 Hinf Ⅰ对 PRSV 的PRSV126、Ys、Vb 和 Sm 等株系进行单酶切 RT-PCR-RFLP 分析,Hinf Ⅰ能把 PRSV126与 Ys、Vb 和 Sm 鉴别开来,Sau3A Ⅰ能把 Ys 与 Vb 和 Sm 鉴别开来,Hae Ⅱ则能把 Ys 与 PRSV126、Vb 和 Sm 鉴别开来;以 P1/P2为引物,对 Vb、Ys 和 Sm 株系进行 RT-PCR-RFLP-SSCP 分析,结果能一次把三者较好地区别开来。 展开更多
关键词 番木瓜环斑病毒 株系鉴定 rt-pcr-rflp-sscp 分子生物学 植物病毒病 病害防治
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应用巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP对山东肾综合征出血热病人血清中HV基因检测和分型研究 被引量：4
3
作者 刘运喜 赵仲堂 +6 位作者 许晓群 李健 高媛 江佳富 张景兰 杨占清 曹务春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期624-628,共5页
目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中... 目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中的HV进行基因扩增,采用RFLP、SSCP分型,并进行序列测定与分析。结果48份临床和ELISA检测确诊的HFRS病人血清经巢式RT-PCR扩增后,41份阳性,阳性率85.42%。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经HindIII、HinfI酶切后,呈现2种不同的RFLP图谱:33份显示与R22株相似的酶切图谱,应属SEOV型;另外8份显示出与HTN76-118株相似的图谱,属HTNV型,这8份HTNV型标本均为10-12月间收集的病人血清。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经SSCP分析,亦呈现2种不同的图谱:33份具有与R22株相似的SSCP图谱,应属SEOV型;而另8份则与HTN76-118株具有相似的SSCP图谱,属HTNV型。对部分扩增产物序列采用系统进化树分析也得出类似的结果:sdp1、sdp2、sdp3与HTN型76-118株亲缘关系相近,属同一簇,而sdp22、sdp37与SEOV型Z37、R22株亲缘关系相近,属另外一簇,这与RFLP和SSCP获得的结果相一致。结论山东肾综合征出血热重疫区病人基因型以SEOV型为主,但在秋冬季节也存在HTNV型。巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP法可对HV准确分型,而且简便、迅速,适合于大规模流行病学调查。 展开更多
关键词 HV 巢式RT-PCR RFLP SSCP 序列分析 基因型
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