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RT-PCR Array技术筛选膀胱癌癌症相关信号通路基因的表达变化 被引量:3
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作者 杨珂 傅斌 +5 位作者 王义兵 王共先 李军华 刘仁升 齐雪亮 黄亮 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期505-510,共6页
背景与目的:膀胱癌是泌尿外科最常见肿瘤疾病,其发病机制至今尚未完全明了。本研究旨在观察正常膀胱组织与膀胱癌组织众多肿瘤相关信号通路关键基因的表达情况,为后续进一步深入研究膀胱癌复发与转移提供证据。方法:收集27例膀胱癌患者... 背景与目的:膀胱癌是泌尿外科最常见肿瘤疾病,其发病机制至今尚未完全明了。本研究旨在观察正常膀胱组织与膀胱癌组织众多肿瘤相关信号通路关键基因的表达情况,为后续进一步深入研究膀胱癌复发与转移提供证据。方法:收集27例膀胱癌患者标本,液氮保存,冰冻切片法分离膀胱癌组织与正常膀胱组织,用德国QIAGEN公司Cancer Pathway Finder PCR Array板筛选与癌症相关信号通路中的84个基因在膀胱癌组织和正常膀胱组织中的表达情况。结果:与正常膀胱组织相比,膀胱癌组织中上调基因8个,下调基因19个。本研究选择影响上皮细胞间质化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的信号通路作为研究方向,其中GSC、KRT14和DSP上调,SNAI2和SNAI3下调。因此,选定GSC、KRT14、DSP、SNAI2和SNAI3作为兴趣基因,并对其进行多样本荧光定量q RT-PCR验证。结果表明:GSC在膀胱癌组织中上调,但与正常膀胱组织表达相比,差异无统计学意义(P>0.05)。KRT14和DSP在膀胱癌中表达高于正常组织(P<0.05),SNAI2和SNAI3在膀胱癌中表达低于正常膀胱组织(P<0.05),且SNAI3表达差异最为明显。结论:基因KRT14、DSP及SNAI3可能与膀胱癌发生、发展及转移有密切关系,可能成为基因治疗膀胱癌的重要靶点。 展开更多
关键词 RT—PCR array 膀胱癌 信号通路
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牛星状病毒和诺如病毒双重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用
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作者 姜玲玲 罗文菊 +4 位作者 艾蓉 周景瑞 张琴 冯明祥 余波 《贵州农业科学》 2026年第3期116-123,共8页
【目的】建立一种同时快速检测牛星状病毒(BAstV)和诺如病毒(BNoV)的方法,为及时制定相关疫情防控方案提供技术指导。【方法】根据BAstV中ORF2基因和BNoV中RdRp基因的保守区域分别设计特异性引物,建立能同时检测BAstV和BNoV的双重TaqMa... 【目的】建立一种同时快速检测牛星状病毒(BAstV)和诺如病毒(BNoV)的方法,为及时制定相关疫情防控方案提供技术指导。【方法】根据BAstV中ORF2基因和BNoV中RdRp基因的保守区域分别设计特异性引物,建立能同时检测BAstV和BNoV的双重TaqMan探针荧光定量RT-PCR方法,对该方法的敏感性、特异性、重复性及临床样品进行试验检测。【结果】建立的双重TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法可扩增BAstV和BNoV核酸,未能扩增牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛环曲病毒(BToV)、牛冠状病毒(BCoV)核酸,特异性强;对BAstV和BNoV的最低检测量分别为1.19 pg/μL和0.82 pg/μL,敏感性高;重复性试验检测中,变异系数均小于1%,重复性好;临床检测213份样品,BAstV和BNoV的阳性检出率分别为23.94%和7.98%,明显高于单一SYBR Green染料法。【结论】牛星状病毒和诺如病毒双重荧光PCR方法敏感性高、特异性强,用便携式荧光定量PCR仪可在60 min内完成检测,适用于养殖场BAstV和BNoV感染的快速检测。 展开更多
关键词 牛星状病毒 牛诺如病毒 犊牛腹泻 双重感染 实时荧光定量rt-pcr
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苹果软枝病毒1巢式RT-PCR检测方法的建立及应用
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作者 刘成龙 范旭东 +2 位作者 任芳 胡国君 董雅凤 《植物病理学报》 北大核心 2026年第1期181-184,共4页
苹果软枝病(apple rubbery wood disease, ARWD)是一种重要的苹果病毒病害,最早于1935年在英国苹果‘Lord Lambourne’上被发现[1-2]。主要影响木质素合成,进而使苹果的茎和枝条异常柔软,容易弯曲折断;还可以引起节间缩短,发育延迟,使... 苹果软枝病(apple rubbery wood disease, ARWD)是一种重要的苹果病毒病害,最早于1935年在英国苹果‘Lord Lambourne’上被发现[1-2]。主要影响木质素合成,进而使苹果的茎和枝条异常柔软,容易弯曲折断;还可以引起节间缩短,发育延迟,使树体对冷胁迫的敏感性增加[3-5]。在种植‘金冠’、‘嘎啦’等感病品种的地区或国家,可导致苹果减产30%[6-7]。 展开更多
关键词 木质素合成 苹果软枝病 rt-pcr检测
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基于TaqMan探针的A群轮状病毒荧光RT-PCR检测方法的建立及应用
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作者 侯雪艳 周霞 +3 位作者 刘建奎 康桦华 翟少伦 郭庆勇 《微生物学通报》 北大核心 2026年第2期1096-1108,共13页
背景A群轮状病毒(group A rotavirus,RVA)是导致婴幼儿及幼龄动物发生腹泻的主要人兽共患病病原之一,具有较强的传染性。目的建立一种快速、特异检测猪、牛、羊、人等物种RVA的实时荧光定量RT-PCR检测方法。方法基于GenBank中的猪、牛... 背景A群轮状病毒(group A rotavirus,RVA)是导致婴幼儿及幼龄动物发生腹泻的主要人兽共患病病原之一,具有较强的传染性。目的建立一种快速、特异检测猪、牛、羊、人等物种RVA的实时荧光定量RT-PCR检测方法。方法基于GenBank中的猪、牛、羊和人源RVA NSP5基因保守序列,设计1对特异性引物、1条探针,该探针带有TaqMan-MGB发光基团,优化最适退火温度(Tm)、最适引物和探针浓度,建立一种可以检测猪、牛、羊和人等物种RVA的实时荧光定量RT-PCR检测方法。结果建立的RVA荧光定量RT-PCR方法最佳退火温度为51℃;最适引物和探针浓度均为0.4μmol/L;敏感性高,最低检测限可达3.24 copies/μL;特异性强,与猪、牛、羊等常见病原无检测交叉反应;重复性好,其批内和批间试验变异系数分别为0.063%-0.812%和0.612%-1.016%,可以快速、特异检测猪、牛、羊样品和人轮状病毒,有很好的临床适用性。结论本实验建立了一种检测多物种RVA的实时荧光定量RT-PCR方法,为猪、牛、羊和人等多物种的RVA流行病学调查和早期诊断提供了良好的技术支撑。 展开更多
关键词 A群轮状病毒 NSP5基因 TAQMAN-MGB探针 荧光rt-pcr
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猪繁殖与呼吸综合征病毒基因2型实时荧光RT-PCR盔甲RNA阳性质控品的构建
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作者 朱向东 孙伟珊 +5 位作者 曹琪 尹春博 杨丹 李硕 邓钰蓱 李文钢 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第3期1759-1765,共7页
本研究旨在利用MS2噬菌体外壳蛋白自组装并包封外源核酸的特性,制备用于猪繁殖与呼吸综合征病毒基因2型(porcine reproductive and respiratory syndrome virus genotype 2,PRRSV-2)RT-qPCR检测阳性质控品,并探究其稳定性及耐RNase特性... 本研究旨在利用MS2噬菌体外壳蛋白自组装并包封外源核酸的特性,制备用于猪繁殖与呼吸综合征病毒基因2型(porcine reproductive and respiratory syndrome virus genotype 2,PRRSV-2)RT-qPCR检测阳性质控品,并探究其稳定性及耐RNase特性。选取PRRSV-2的特异性靶基因(ORF7保守区),插入pET28a(+)/CP-A重组质粒PAC位点下游构建重组载体,经原核表达、硫酸铵沉淀及凝胶过滤层析纯化,获得20~28 nm均一的MS2病毒样颗粒;通过全能核酸酶消化及RT-qPCR,验证其热稳定性和抗RNase能力。结果显示:成功构建含MS2噬菌体外壳蛋白、PAC位点和PRRSV-2靶基因的重组载体,纯化后形成包封靶基因的盔甲RNA,可耐受RNase降解,37℃无菌条件下稳定存在7 d。该盔甲RNA可作为PRRSV-2 RT-qPCR阳性质控品,相比传统合成核酸,优势在于:1)模拟真实病毒核酸状态,监控全检测流程;2)耐RNase能力强;3)3批次批内及批间变异系数均<2%;4)37℃稳定保存7 d,为PRRSV-2检测提供可靠质控工具。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 基因2型 盔甲RNA 实时荧光rt-pcr 质控品 病毒样颗粒 MS2噬菌体
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Noninvasive interception of circulating leukocyte in vivo by optical tweezer array 被引量:1
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作者 Sisi Ge Jinhua Zhou Xunbin Wei 《Journal of Innovative Optical Health Sciences》 2026年第1期56-69,共14页
The ability to noninvasively manipulate and isolate specific cell populations in vivo is critical for advancing real-time diagnostics,precision medicine,and immunological research.Here,we present a novel and broadly a... The ability to noninvasively manipulate and isolate specific cell populations in vivo is critical for advancing real-time diagnostics,precision medicine,and immunological research.Here,we present a novel and broadly applicable optical trapping system based on a custom-designed 2×3 optical tweezer array,which enables the real-time interception and manipulation of circulating leukocytes in live animals.By utilizing intrinsic velocity differences between leukocytes and red blood cells,the system achieves stable trapping of individual leukocytes in vessels 15-20μm in diameter and decelerates multiple cells in vessels greater than 20μm.Notably,it also enables the optical blockage of lymphatic vessels exceeding 50μm,a previously unreported capability.This label-free,noninvasive approach operates without repeated blood draws and is compatible with diverse vessel geometries and flow dynamics.The system offers a generalizable solution for in vivo cell extraction and analysis,paving the way for high-precision single-cell technologies in biomedical research and clinical translation. 展开更多
关键词 Leukocytes optical tweezer array in vivo interception
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南非2型口蹄疫病毒特异性RT-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 王轶男 谢佳芮 +2 位作者 寇美玲 苏晓航 苗海生 《上海畜牧兽医通讯》 2026年第1期6-10,18,共6页
为了实现对存在传入风险的南非2型(South African type 2, SAT2)口蹄疫病毒的早期发现、精准鉴定和有效预警,本研究基于SAT2型口蹄疫病毒毒株IRAN/2024和ETH/2022完整VP1基因序列,构建了pUC57-IRAN-VP1、pUC57-ETH-VP1质粒;参考SAT2型... 为了实现对存在传入风险的南非2型(South African type 2, SAT2)口蹄疫病毒的早期发现、精准鉴定和有效预警,本研究基于SAT2型口蹄疫病毒毒株IRAN/2024和ETH/2022完整VP1基因序列,构建了pUC57-IRAN-VP1、pUC57-ETH-VP1质粒;参考SAT2型口蹄疫病毒VP1基因序列设计并筛选特异性引物,以所构建的质粒为模板,建立了SAT2型口蹄疫病毒特异性RT-PCR检测方法,并开展敏感性试验、特异性试验。敏感性试验结果显示,该方法可以检测质量浓度低至1 pg/mL的质粒DNA。特异性试验结果显示,该方法对伪狂犬病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、乙型脑炎病毒、猪瘟病毒、1型蓝舌病病毒、牛病毒性腹泻病毒、山羊痘病毒、阿卡斑病毒、流行性出血热病毒等常见病毒的核酸,以及参试的O型和A型口蹄疫病毒(PanAsia、Cathay、Mya98、Ind2001-1、Ind2001-2、AKT-Ⅲ、Sea-97毒株)核酸均无交叉反应。应用该方法对2023年云南边境地区50份牛食道-咽部分泌物样品进行核酸检测,检测结果与RT-qPCR检测结果一致。本研究建立的SAT2型口蹄疫病毒特异性RT-PCR检测方法具有一定的实用性,为口蹄疫疫情防控提供技术支撑。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 SAT2型 rt-pcr 特异性
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Deep learning-based number of sources estimation under colored noise and imperfect array
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作者 Linqiang JIANG Tao TANG +2 位作者 Zhidong WU Ding WANG Paihang ZHAO 《Chinese Journal of Aeronautics》 2026年第2期414-428,共15页
The estimation of the Number of Sources(NoS)is a significant challenge in signal processing,particularly due to the impact of colored noise on the performance of NoS estimation.This paper proposes a Multidimensional F... The estimation of the Number of Sources(NoS)is a significant challenge in signal processing,particularly due to the impact of colored noise on the performance of NoS estimation.This paper proposes a Multidimensional Feature Network(MFNet)which is designed for NoS estimation by extracting features of the sampled received signals and Sampled Covariance Matrix(SCM).The MFNet treats the raw signal and the SCM as two different types of data,and is able to achieve NoS estimation under colored noise and imperfect array.MFNet employs the Gated Recurrent Unit(GRU)to capture sequential information from the original signal data and to construct the Pseudo Covariance Matrix(PCM).Subsequently,various dimensional features,including eigenvalues and the Gerschgorin disk radius,are extracted from both the PCM and SCM,which are then jointly input into the subsequent network.An overall accuracy of 82%can be achieved after network training.The ablation experimental results demonstrate the effectiveness of multiple inputs.And simulation results demonstrate that the proposed MFNet achieves higher estimation accuracy compared to existing algorithms and exhibits greater robustness against colored noise. 展开更多
关键词 Number of source estimation Deep learning Colored noise Imperfect array array signal processing
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日本黄瓜绿斑驳花叶病毒常规和实时荧光RT-PCR检测
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作者 陈红运 叶明辉 +3 位作者 陈青 廖富荣 于子翔 沈建国 《植物检疫》 2026年第1期53-57,共5页
本研究以日本黄瓜绿斑驳花叶病毒(kyuri green mottle mosaic virus,KGMMV)为材料,设计1对常规RT-PCR检测引物KGCPN-F/KGCPN-R和1组引物/探针KGM-F/KGM-R/KGM-P,分析测试了2对已发表KGMMV常规RT-PCR检测引物KGCP-F/KGCP-R和KGMP-F/KGMP... 本研究以日本黄瓜绿斑驳花叶病毒(kyuri green mottle mosaic virus,KGMMV)为材料,设计1对常规RT-PCR检测引物KGCPN-F/KGCPN-R和1组引物/探针KGM-F/KGM-R/KGM-P,分析测试了2对已发表KGMMV常规RT-PCR检测引物KGCP-F/KGCP-R和KGMP-F/KGMP-R,建立了KGMMV的常规和实时荧光RT-PCR检测方法。结果表明,引物KGCP-F/KGCP-R扩增KGMMV时出现预期大小的条带,扩增黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)时出现非常微弱的条带;引物KGCPN-F/KGCPN-R扩增KGMMV时出现预期大小的条带,扩增小西葫芦绿斑驳花叶病毒(zucchini green mottle mosaic virus,ZGMMV)时出现比预期稍大的条带,通过对PCR产物进行序列测定和分析比对可准确鉴定KGMMV。KGCP-F/KGCP-R和KGCPN-F/KGCPN-R的相对灵敏度分别为10^(-6)和10^(-5)稀释度,适用于KGMMV的常规RT-PCR检测。基于引物探针KGM-F/KGM-R/KGM-P建立的KGMMV实时荧光RT-PCR检测方法能特异性检出KGMMV,相对灵敏度达10^(-7)稀释度,分别比2对常规RT-PCR检测引物高10倍和100倍,适用于瓜类种子中KGMMV的快速检测。 展开更多
关键词 日本黄瓜绿斑驳花叶病毒 常规rt-pcr 实时荧光rt-pcr 检测
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A new 10K liquid SNP genotyping array for wax gourd and its application in heterosis utilization and cultivars identification
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作者 Dan Liu Lingling Xie +4 位作者 Yuting Lei Bingchuan Tian Daolong Liao Fangfang Wu Baobin Mi 《Journal of Integrative Agriculture》 2026年第2期734-743,共10页
High-throughput single nucleotide polymorphism(SNP) arrays have emerged as essential genotyping tools,significantly accelerating breeding programs and advancing basic research.In this study,a high-throughput 10K SNP g... High-throughput single nucleotide polymorphism(SNP) arrays have emerged as essential genotyping tools,significantly accelerating breeding programs and advancing basic research.In this study,a high-throughput 10K SNP genotyping array for wax gourd was developed using genotyping by target sequencing(GBTS),featuring 10,722 SNPs evenly distributed across all 12 chromosomes,including 278 functional loci associated with key economic traits.To demonstrate its utility,genetic distances among 19 elite inbred lines were calculated from SNP data and correlated with heterosis for single fruit weight.The results revealed that greater genetic distance was associated with higher middle parent heterosis(MPH) for single fruit weight.Furthermore,56 commercial wax gourd cultivars collected from eight regions were selected and genotyped.Population structure analysis,phylogenetic analysis,and principal component analysis(PCA) collectively indicated that these cultivars fall into two major groups.Group I,comprising black or dark green skinned wax gourds,exhibited lower genetic diversity than Group II,which includes green or light green skinned varieties,reflecting shorter genetic distances within Group I.Finally,60 polymorphic SNPs were used to construct DNA fingerprints for distinguishing the 56 cultivars.As the first high-throughput genotyping platform for wax gourd,this SNP array provides an effective and powerful tool for genetic analysis. 展开更多
关键词 wax gourd SNP genotyping array HETEROSIS cultivar identification DNA fingerprint
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A Reconfigurable Omnidirectional Triboelectric Whisker Sensor Array for Versatile Human–Machine–Environment Interaction
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作者 Weichen Wang Jiaqi Zhu +9 位作者 Hongfa Zhao Fei Yao Yuzhu Zhang Xiankuan Qian Mingrui Shu Zhigang Wu Minyi Xu Hongya Geng Wenbo Ding Juntian Qu 《Nano-Micro Letters》 2026年第3期121-140,共20页
Developing effective,versatile,and high-precision sensing interfaces remains a crucial challenge in human-machine-environment interaction applications.Despite progress in interaction-oriented sensing skins,limitations... Developing effective,versatile,and high-precision sensing interfaces remains a crucial challenge in human-machine-environment interaction applications.Despite progress in interaction-oriented sensing skins,limitations remain in unit-level reconfiguration,multiaxial force and motion sensing,and robust operation across dynamically changing or irregular surfaces.Herein,we develop a reconfigurable omnidirectional triboelectric whisker sensor array(RO-TWSA)comprising multiple sensing units that integrate a triboelectric whisker structure(TWS)with an untethered hydro-sealing vacuum sucker(UHSVS),enabling reversibly portable deployment and omnidirectional perception across diverse surfaces.Using a simple dual-triangular electrode layout paired with MXene/silicone nanocomposite dielectric layer,the sensor unit achieves precise omnidirectional force and motion sensing with a detection threshold as low as 0.024 N and an angular resolution of 5°,while the UHSVS provides reliable and reversible multi-surface anchoring for the sensor units by involving a newly designed hydrogel combining high mechanical robustness and superior water absorption.Extensive experiments demonstrate the effectiveness of RO-TWSA across various interactive scenarios,including teleoperation,tactile diagnostics,and robotic autonomous exploration.Overall,RO-TWSA presents a versatile and high-resolution tactile interface,offering new avenues for intelligent perception and interaction in complex real-world environments. 展开更多
关键词 Reconfigurable sensor array Interaction interface Tactile perception Omnidirectional sensor Reversible anchoring
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Bio-inspired offset array design for enhanced range in underwater active electrosensing with neural network-based localization
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作者 Meijiang Hou Jiegang Peng +2 位作者 Minan Yang Taoyu Jiang Yang Chen 《Defence Technology(防务技术)》 2026年第3期217-245,共29页
Addressing the critical detection range limitation in active electrosensing(AES)for underwater sensing,this study proposes an enhanced AES system via novel array optimization.While AES offers advantages like interfere... Addressing the critical detection range limitation in active electrosensing(AES)for underwater sensing,this study proposes an enhanced AES system via novel array optimization.While AES offers advantages like interference immunity,acoustic stealth detection,and low cost,its short range restricts applicability.A target perturbation model under differential signal acquisition reveals that signal strength increases with local electric field intensity,target size,differential channel spacing,and conductivity contrast,but decreases with target-electrode distance.To extend detection,novel array configurations were explored.Simulations demonstrate that both rectangular and offset arrays significantly outperform the traditional collinear layout.Specifically,an offset array(with 8 m transmitting–receiving spacing)achieved an effective detection range enhancement exceeding 83%under the same distortion threshold while maintaining simplified electrode structure.Experimental validation confirmed a 100%increase in maximum detection distance to 5 m under identical noise thresholds compared to the collinear array.Furthermore,a fully connected neural network-based localization model achieved a mean positioning error of 14.12 cm at 3.15 m in static scenarios.In dynamic scenarios within 1–3 m,mean errors were controlled between 13.19 cm and 27.56 cm.Mechanistic analysis indicates that increasing the array baseline enhances the signal-to-noise ratio by simultaneously suppressing near-field environmental noise and amplifying far-field signal reception.Structural innovations in array design enabled this study to significantly expand the detection range of AES systems without compromising cost efficiency.These advancements directly promote the engineering application of AES technology,offering critical technical support for underwater defense security monitoring,long-range early warning systems,and maritime rights protection. 展开更多
关键词 Active electrical sensing Target perturbation model array optimization Detection range Fuly connected neural network
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3D printed high-temperature ceramic conformal array antenna:Design,analysis,manufacturing,and testing
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作者 Peng Li Ruibo Li +5 位作者 Zijiao Fan Jiujiu Han Guangda Ding Qunbiao Wang Wanye Xu Paolo Rocca 《Defence Technology(防务技术)》 2026年第1期340-353,共14页
In this study,the design,analysis,manufacturing,and testing of a 3D-printed conformal microstrip array antenna for high-temperature environments is presented.3D printing technology is used to fabricate a curved cerami... In this study,the design,analysis,manufacturing,and testing of a 3D-printed conformal microstrip array antenna for high-temperature environments is presented.3D printing technology is used to fabricate a curved ceramic substrate,and laser sintering and microdroplet spraying processes are used to add the conductive metal on the curved substrate.The problems of gain loss,bandwidth reduction,and frequency shift caused by high temperatures are addressed by using a proper antenna design,with parasitic patches,slots,and metal resonant cavities.The antenna prototype is characterized by the curved substrates and the conductive metals for the power dividers,the patch,and the ground plane;its performance is examined up to a temperature of 600℃in a muffle furnace and compared with the results from the numerical analysis.The results show that the antenna can effectively function at 600℃and even higher temperatures. 展开更多
关键词 Ceramic antenna Conformal array High-temperature environment 3D printing High gain and wide band
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Short-period dense linear array ambient noise tomography of shallow crustal structure across the Haichenghe fault zone,China
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作者 Mingruo Jiao Liang Wang +9 位作者 Hongyu Ni Haiyan Wang Lanshu Bai Shuo Liu Zhihong Zhang Zhenpeng Yang Zhengdong Cui Qingshan Sun Rui Qian Mengying Li 《Earthquake Science》 2026年第2期220-234,共15页
The Haicheng region,Liaoning,China,likely hosts a conjugate fault system comprising the NW-trending Haichenghe fault and NE-trending secondary faults.On February 4,1975,at 19:36 CST,an earthquake of M_(S)7.3 and inten... The Haicheng region,Liaoning,China,likely hosts a conjugate fault system comprising the NW-trending Haichenghe fault and NE-trending secondary faults.On February 4,1975,at 19:36 CST,an earthquake of M_(S)7.3 and intensity(MMI)IX hit the city of Haicheng,Liaoning,China.Although deep seismic profiling was previously conducted along the Haichenghe fault,the limited horizontal resolution in the shallow part prevented the recognition of kilometer-scale anomalies.The velocity structure characteristics of the Haichenghe fault and its NE-trending conjugate faults remain unclear.Using the extended range phase shift method,the high-resolution S-wave velocity structures are obtained by deploying a long,dense linear array of 55 short-period seismometers across the fault and NE-trending conjugate faults.The array length was 32 km and inter-station spacing was approximately 600 m,facilitating the collection of approximately 22 days of continuous waveform data.Employing the Extended Range Phase Shift(ERPS)method enabled the extraction of broadband 0.2–5 s Rayleigh wave phase velocity dispersion curves.The broadband dispersion data were used for inversion of the high-resolution S-wave velocity structure to a depth of 8 km from the surface.The velocity structure characteristics and seismicity of the Haichenghe fault and NE-trending conjugate faults were analyzed and compared with nearby fault gas measurements.Results show(1)shallow S-wave velocities show a low-high-low horizontal distribution,corresponding to basin-uplift-basin topography;(2)significant velocity contrasts occur across the Haichenghe fault:its SW segment(0–17 km)exhibits high velocities consistent with Paleoproterozoic crystalline basement(Pt_(1)),while the NE segment(17–32 km)shows low velocities related to Yanshanian intrusions(γ_(5))and Quaternary sediments.NE-trending conjugate faults display sharp velocity gradients marking fracture locations,with all faults being near-vertical to~8 km depth;(3)seismicity at 1–6 km depth mainly clusters in high-velocity zones;at 6–8 km depth,it concentrates beneath the Haichenghe fault in low-velocity areas and along NE-trending faults;(4)the seismic activity characteristics and fault zone width of the Haicheng he fault reflected by velocity imaging results are basically consistent with those obtained by the fault gas measurement method. 展开更多
关键词 dense linear array ambient noise tomography extended range phase shift method S-wave velocity structure Haichenghe fault
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H5N1禽流感病毒双重荧光定量RT-PCR方法的建立
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作者 高洁 党志浩 +2 位作者 张勤 李静 张芳 《中国动物保健》 2026年第2期149-151,共3页
本研究针对H5N1禽流感病毒HA与NA基因的保守区域设计特异性引物和探针,成功建立了一种双重荧光定量RT-PCR检测方法,可在同一反应管中同时检测上述两个基因。经评估,该方法灵敏度达10~2 copies/mL,且与甲型流感病毒H3N2、乙型流感病毒及... 本研究针对H5N1禽流感病毒HA与NA基因的保守区域设计特异性引物和探针,成功建立了一种双重荧光定量RT-PCR检测方法,可在同一反应管中同时检测上述两个基因。经评估,该方法灵敏度达10~2 copies/mL,且与甲型流感病毒H3N2、乙型流感病毒及呼吸道合胞病毒无交叉反应,重复性良好(变异系数<2%),是一种适用于H5N1禽流感病毒快速、灵敏、特异的分子检测技术。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H5N1 双重荧光定量rt-pcr
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鹅星状病毒通用型TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 陈立功 穆英丽 +5 位作者 张诚 潘保革 范乐乐 魏忠华 王学静 刘聚祥 《中国家禽》 北大核心 2025年第2期53-59,共7页
为建立用于鹅星状病毒1(GAstV 1)和鹅星状病毒2(GAstV 2)感染快速检测的实时荧光定量RT-PCR方法,试验根据部分GAstV ORF2基因和部分3′非编码区序列设计合成特异性引物和探针,采用矩阵法获得引物和探针的最优浓度,在优化退火温度的基础... 为建立用于鹅星状病毒1(GAstV 1)和鹅星状病毒2(GAstV 2)感染快速检测的实时荧光定量RT-PCR方法,试验根据部分GAstV ORF2基因和部分3′非编码区序列设计合成特异性引物和探针,采用矩阵法获得引物和探针的最优浓度,在优化退火温度的基础上,分别建立扩增GAstV 1和GAstV 2的标准曲线,进一步验证该方法的特异性、敏感性和重复性,建立的方法用于临床样品的检测,并与文献报道的常规RT-PCR方法进行比较。结果显示:优化后的反应体系中最优上、下游引物浓度均为0.40(或0.50)μmol/L,探针浓度均为0.50μmol/L,扩增线性范围分别为3.26×10^(3)~3.26×10^(8)拷贝/μL和7.09×10^(3)~7.09×10^(8)拷贝/μL,相关系数均为0.998;该方法可特异性检出两种GAstV,但对新城疫病毒、H9亚型禽流感病毒、鸭坦布苏病毒、新型鸭呼肠孤病毒、鹅细小病毒和血清4型禽腺病毒6种鹅病相关病毒的核酸均无扩增信号;其检测限分别为3.26×10^(2)拷贝/μL和7.09×10^(1)拷贝/μL;组内变异系数和组间变异系数均低于3%。建立的实时荧光定量RT-PCR方法对临床样品的检测结果显示,GAstV阳性率为90.57%(96/106);而文献报道的常规RT-PCR方法对GAstV 1和GAstV 2的混合阳性率为62.26%。研究表明,建立的TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法为同时检测GAstV 1和GAstV 2提供了快速、敏感、特异且能满足临床样本需求的检测方法。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 荧光定量rt-pcr TAQMAN探针
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兔出血症病毒RHDV1和RHDV2一步法双重TaqMan探针荧光定量RT-PCR体系的建立和应用
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作者 陈萌萌 王冠萱 +8 位作者 仇汝龙 范志宇 胡波 宋艳华 魏后军 徐为中 葛雷 李一鸣 王芳 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第5期937-942,共6页
兔出血症病毒(RHDV)引起的兔出血症是一种急性、高度致死性传染病,对养兔业造成严重危害。本研究基于RHDV衣壳蛋白(VP60)基因序列设计引物和TaqMan探针,建立可同时检测RHDV1和RHDV2两种毒株的双重TaqMan荧光定量RT-PCR检测体系。反应体... 兔出血症病毒(RHDV)引起的兔出血症是一种急性、高度致死性传染病,对养兔业造成严重危害。本研究基于RHDV衣壳蛋白(VP60)基因序列设计引物和TaqMan探针,建立可同时检测RHDV1和RHDV2两种毒株的双重TaqMan荧光定量RT-PCR检测体系。反应体系:2×One Step RT-PCR BufferⅢ10.0μL,上下游引物(10μmol/L)各0.6μL,ROX Reference DyeⅡ(50×)0.4μL,两种荧光探针(10μmol/L)各0.8μL,待测样本2.0μL,ddH_(2)O 4.8μL。反应程序:42℃5 min,95℃10 s,95℃5 s,60℃30 s,40个循环。试验结果表明,该体系特异性强,与轮状病毒、兔多杀性巴氏杆菌、兔支气管败血波氏菌、绿脓杆菌、沙门氏菌无交叉反应;灵敏度高,最低检测限为1μL 100拷贝。通过组内重复和组间重复进行重复性分析,Ct值变异系数为0.2%~2.9%,表明该体系稳定性较好。使用该体系对112份临床样本(60份肝脏组织、52份鼻肛拭子)进行检测,RHDV总检出率为69%,而常规RT-PCR体系的检出率仅为51%。本研究建立的双重荧光定量RT-PCR方法具有高灵敏度、强特异性和良好的重复性,可为RHDV的临床快速诊断及定量分析提供可靠技术支持。 展开更多
关键词 兔出血症病毒 荧光定量rt-pcr TAQMAN探针
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羊肠道病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 马雪青 张雨星 +6 位作者 李平花 王松泰 魏达礼 赵志荀 朵红 卢曾军 孙普 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第6期757-763,共7页
为建立一种灵敏、特异、准确的羊肠道病毒(CEV)实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究基于CEV基因序列的保守区设计特异性引物和探针,并制备标准品,通过优化反应体系和反应条件,建立了TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,同时对其敏感性、... 为建立一种灵敏、特异、准确的羊肠道病毒(CEV)实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究基于CEV基因序列的保守区设计特异性引物和探针,并制备标准品,通过优化反应体系和反应条件,建立了TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,同时对其敏感性、特异性和重复性进行评估,并与常规RT-PCR比较检测临床样品。结果显示,所建方法的标准曲线R2为0.995,拷贝数与Ct值有良好的线性关系;该方法特异性强,与口蹄疫病毒(FMDV)、小反刍兽疫病毒(PPRV)、羊痘病毒(SPV)、羊口疮病毒(ORFV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)无交叉反应;敏感性最低检测限为23 copies/μL;组内与组间变异系数均小于2.5%,重复性好。使用本方法检测了598份羊的临床样品,阳性检出率(83/598)高于常规RT-PCR (30/598)。上述结果表明,本研究建立了一种灵敏、特异的CEV TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,并建议采用羊的粪便或肛拭子即可进行CEV的流调工作,这为CEV的诊断、流行病学调查提供了重要的技术支持。 展开更多
关键词 羊肠道病毒 TaqMan实时荧光定量rt-pcr 诊断
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口蹄疫病毒O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 王翠 赵雪丽 +7 位作者 王东方 王淑娟 马震原 杨海波 刘影 柴茂 谢彩华 闫若潜 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期61-69,共9页
为建立口蹄疫病毒(FMDV)O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究在比对多条FMDV基因的基础上,根据2B基因的最优保守区,设计O型、A型和Asia I型FMDV通用的反转录引物;再根据VP1基因的比对结果,以变异区为扩增靶区域,设... 为建立口蹄疫病毒(FMDV)O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究在比对多条FMDV基因的基础上,根据2B基因的最优保守区,设计O型、A型和Asia I型FMDV通用的反转录引物;再根据VP1基因的比对结果,以变异区为扩增靶区域,设计3对分别针对O型、A型和AsiaⅠ型FMDV的特异性引物和TaqMan MGB探针。经优化反应体系和扩增程序等反应条件,建立基于探针技术的FDMV三重实时荧光定量RT-PCR检测方法。验证该方法的特异性、敏感性和重复性,对15份临床疑似FMDV感染样品进行检测,并与基因测序方法及RT-PCR方法进行比较分析。结果显示:本研究成功建立了FMDV三重FQ-PCR方法,实现了一步法对FMDV O型、A型和AsiaⅠ型病原样品的鉴别检测。该方法可特异性扩增FMDV O型、A型和AsiaⅠ型标准株细胞培养物,但对猪水疱性口炎病毒(VSV)等7种病原及阴性对照未出现扩增,特异性较强;对FMDV O型、A型和AsiaⅠ型阳性重组质粒标准品的最低检出限均可达到10拷贝/μL,敏感性较高;批内/批间试验变异系数为0.48%~1.55%,重复性较好;利用建立的三重FQ-PCR方法对15份临床疑似FMDV感染样品进行检测,检测结果与基因测序结果完全一致,优于RT-PCR方法。本研究建立的三重FQ-PCR方法具有敏感性高、特异性强,在同一反应体系中能同时鉴别检测出FMDV O型、A型和AsiaⅠ型等优点,能满足临床鉴别检测的需求。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 三重实时荧光定量rt-pcr 应用
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国标中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT-PCR方法的优化与应用
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作者 刘朔 彭程 +3 位作者 毛秋艳 杨吉喆 蒋文明 刘华雷 《病毒学报》 北大核心 2025年第5期1522-1530,共9页
当前H5N1亚型禽流感疫情在全球范围内肆虐,且病毒不断变异,因此需要持续对检测方法的有效性进行评估。近年来,我们在临床样品检测过程中发现,国家标准《高致病性禽流感诊断技术》(GB/T 18936-2020)中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT... 当前H5N1亚型禽流感疫情在全球范围内肆虐,且病毒不断变异,因此需要持续对检测方法的有效性进行评估。近年来,我们在临床样品检测过程中发现,国家标准《高致病性禽流感诊断技术》(GB/T 18936-2020)中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT-PCR方法存在扩增曲线荧光值偏低的现象,对结果判定产生一定干扰。基于国标引物和探针序列与当前流行毒株的匹配性评估分析,我们设计和优化了上游引物和探针序列,并对优化方法的特异性、灵敏度和临床样品检测效果与国标方法进行了对比。结果显示,该优化方法特异性强,与其他亚型AIV和常见禽类病原体均无交叉反应;针对2.3.4.4b分支H5亚型病毒的检测灵敏度较国标方法提高了10倍,针对2.3.4.4h分支H5亚型病毒的检测灵敏度与国标方法类似;组内和组间试验Ct值变异系数介于0.17%~1.58%,具有良好的重复性;对48份家禽和野禽咽肛拭子样品检测,本优化方法检出阳性样本38份(国标方法检出37份),其中64.9%(24/37)阳性样品的Ct值较国标方法低2以上。结果表明,本研究优化的荧光RT-PCR方法可为H5亚型高致病性禽流感病毒的流行病学调查监测及快速诊断提供技术支持。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H5亚型 实时荧光rt-pcr 检测方法
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