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基于改进RT-DETR的有遮挡交通标志检测算法
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作者 于天河 杨壮壮 +2 位作者 胡金帅 常梦瑶 王文龙 《工程科学学报》 北大核心 2026年第2期393-408,共16页
针对交通标志检测中目标尺寸小、检测精度低等问题,尤其是在远距离拍摄、遮挡严重的情况下,传统检测算法往往难以准确识别交通标志.本文提出了一种基于改进RT-DETR的交通标志检测算法.首先,考虑到当前交通标志被遮挡情况下数据集的匮乏... 针对交通标志检测中目标尺寸小、检测精度低等问题,尤其是在远距离拍摄、遮挡严重的情况下,传统检测算法往往难以准确识别交通标志.本文提出了一种基于改进RT-DETR的交通标志检测算法.首先,考虑到当前交通标志被遮挡情况下数据集的匮乏,自建一个遮挡条件下的交通标志数据集.然后,在反向残差移动块中引入膨胀重参数块,构建了一个轻量级的复合膨胀残差块来替换原始主干提取网络中的BasicBlock,增强了模型的特征提取能力.最后,对RT-DETR模型的损失函数进行了优化,提出了DS-IoU联合损失函数加快收模型敛速度.实验结果表明,改进后的算法在自制数据集上的m AP为94.2%,相比于原始算法增加量为4.7%,在公开数据集TT100K和CCTSDB2021的m AP分别为92.8%和91.7%,相比于原始算法增加量分别为3.1%和2.4%,Params和GFLOPs相比于原始的算法分别降低了26.0%和12.5%.本文提出的改进方法极大地减少了计算量和参数数量,有效提升了遮挡情况下的交通标志的检测精度. 展开更多
关键词 交通标志检测 rt-DETR 遮挡数据集 轻量化 联合损失函数
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基于RT-GLV的变电站电力人员绝缘手套穿戴检测方法
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作者 袁杰 万忠原 +3 位作者 加尔肯别克 杨怡程 祁鹏程 陈治润 《郑州大学学报(工学版)》 北大核心 2026年第1期25-32,共8页
变电站电力人员作业穿戴的绝缘手套有目标小、易遮挡的特点,而一般的特征融合网络往往会丢失小目标信息。针对此问题,构建一种多尺度小目标特征融合网络STPFM,对RT-DETR-R18模型进行改进,设计了电力人员绝缘手套穿戴模型RT-GLV。首先,用... 变电站电力人员作业穿戴的绝缘手套有目标小、易遮挡的特点,而一般的特征融合网络往往会丢失小目标信息。针对此问题,构建一种多尺度小目标特征融合网络STPFM,对RT-DETR-R18模型进行改进,设计了电力人员绝缘手套穿戴模型RT-GLV。首先,用STPFM网络代替CCFM网络,利用STPFM网络的SSFF模块、TFE模块融合多尺度特征信息,此外,增加一个以SSFF模块为核心的小目标检测层,增强模型对小目标信息的学习能力;其次,为解决替换的STPFM网络模型参数量过大的问题,构建一种轻量化PB_Block模块,只替换主干网络中包含小目标信息较少的P4、P5层的模块,在轻量化模型的同时,又降低小目标信息的损失;最后,采用PIoUv2损失函数增强模型对难易样本的学习能力。实验结果表明:RT-GLV模型在电力人员绝缘手套穿戴检测中表现优异,与RT-DETR-R18相比,mAP@0.5提高2.1百分点,F 1分数提高1.6百分点,参数量减少21.5%;在小目标检测方面,穿戴绝缘手套的AP@0.5提高1.4百分点,未穿戴绝缘手套的AP@0.5提高6.4百分点,且模型检测速度达到91.3帧/s,满足电力人员绝缘手套穿戴检测的准确性、实时性要求。 展开更多
关键词 绝缘手套 rt-DETR 多尺度融合 轻量化 Powerful-IoU
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鉴别犬瘟热病毒疫苗株和野毒株RT-PCR-RFLP方法的建立及应用 被引量:3
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作者 张洪亮 张传美 +3 位作者 王聪 黄娟 任颖超 单虎 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1647-1656,共10页
根据Onderstepoort株H基因序列,设计1对引物建立RT-PCR-RFLP检测方法,对不同宿主来源的疑似犬瘟热临床样品进行检测,并对检出的犬瘟热病毒野毒山东株PCR产物进行克隆和序列分析,验证RT-PCR-RFLP检测方法。结果RT-PCR扩增片段为1 921bp,... 根据Onderstepoort株H基因序列,设计1对引物建立RT-PCR-RFLP检测方法,对不同宿主来源的疑似犬瘟热临床样品进行检测,并对检出的犬瘟热病毒野毒山东株PCR产物进行克隆和序列分析,验证RT-PCR-RFLP检测方法。结果RT-PCR扩增片段为1 921bp,产物经RFLP分析,野毒株的PCR产物能被NdeⅠ酶切为1 282、345和294bp 3个片段,弱毒疫苗株则不能被切开;病毒RNA的最小检出量为2.15ng。临床检测共检出19份样品为犬瘟热阳性,其中15份为野毒株感染,其H基因编码区全长为1 824bp,均在1 279和1 543处有NdeⅠ酶切位点,推导氨基酸与野毒株的同源性在92.9%~96.9%,与疫苗株的同源性在89.0%~90.8%,进化树分析显示这些毒株在基因型上属于Asia-1型,为野毒株谱系。该方法的建立为临床上犬瘟热病毒的鉴别检测和诊断提供了依据。 展开更多
关键词 犬瘟热病毒 鉴别方法 rt—pcr-rflp 血凝素蛋白(H)
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猪繁殖与呼吸综合征病毒华东地区分离株RT-PCR-RFLP分析 被引量:12
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作者 邓雨修 姜平 +3 位作者 李玉峰 王先炜 蒋文明 汤景元 《中国病毒学》 CSCD 2004年第4期398-400,共3页
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) isolates identified in samples from 50 field cases originated from eastern China herds were studied. ORF5 gene of PRRSV isolates was amplified by reverse tran... Porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) isolates identified in samples from 50 field cases originated from eastern China herds were studied. ORF5 gene of PRRSV isolates was amplified by reverse transcript polymerase chain reaction(RT-PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns for enzymes MluⅠ, HincⅡand SacⅡwere determined on these ORF5 genes. The RFLP pattern obtained from 39 isolates was 2-2-1(78%), 3 isolates was 1-1-1(6%) and 8 isolates identified in 2003 was 1-3-1 (16%). The results showed PRRSV strains have variations and existed no less than 3 gene subtypes in the area. 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 华东地区 限制性片段长度多态性 rt-PCR PRRSV 抗原性 毒力
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RT-PCR-RFLP在大麦黄矮病毒检测中的应用 被引量:4
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作者 杜志强 周广和 +3 位作者 马占鸿 李莉 王锡锋 常胜军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期83-85,共3页
The universal primer of Luteovirus was designed and synthesized.An experimental system of RT PCR RFLP was developed in barley yellow dwarf virus (BYDVs).BYDVs can be distinguished qualitatively by RT PCR method.It was... The universal primer of Luteovirus was designed and synthesized.An experimental system of RT PCR RFLP was developed in barley yellow dwarf virus (BYDVs).BYDVs can be distinguished qualitatively by RT PCR method.It was seen that different serotypes of BYDVs have critical different RFLP patters when the PCR producs were digested by restriction enzyme HinfI.The RFLP patterns of 7 isolates of PAV serotype were greatly different.These results indicate there existed sequence variations among different serotypes of BYDVs and vector phenotypes of PAV serotype.There is no difference between MAV serotypes in RFLP analysis.The slight distinction in the segment of coat protein gene of BYDVs can be revealed by RT PCR RFLP system. 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒 BYDVs 通用引物 rt-pcr-rflp
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RT-PCR-RFLP方法鉴别基因Ⅰ型和基因Ⅲ型日本脑炎病毒 被引量:3
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作者 张亮 田耕 +7 位作者 石双艳 袁磊 刘澣扬 黄小波 伍锐 文心田 文翼平 曹三杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1555-1560,共6页
建立一种可检测及鉴别基因Ⅰ型和基因Ⅲ型日本脑炎病毒(JEV)的RT-PCR-RFLP方法。通过对JEV基因Ⅰ型(GⅠ)和基因Ⅲ型(GⅢ)核酸序列的比对分析,设计1对特异性引物对JEV C-PrM-E区域部分基因进行RT-PCR扩增,扩增产物经限制性内切酶SpeⅠ消... 建立一种可检测及鉴别基因Ⅰ型和基因Ⅲ型日本脑炎病毒(JEV)的RT-PCR-RFLP方法。通过对JEV基因Ⅰ型(GⅠ)和基因Ⅲ型(GⅢ)核酸序列的比对分析,设计1对特异性引物对JEV C-PrM-E区域部分基因进行RT-PCR扩增,扩增产物经限制性内切酶SpeⅠ消化后于15g·L-1琼脂糖凝胶电泳进行RFLP分析,并利用建立的RT-PCR-RFLP方法对78份临床样品进行了JEV的检测及基因型鉴定。结果显示,特异性引物可扩增出长为819bp的片段,而对猪瘟病毒、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒及猪伪狂犬病毒的核酸扩增结果均为阴性。经SpeⅠ酶切,基因Ⅰ型JEV RT-PCR产物被切为568和251bp 2个条带,基因Ⅲ型JEV RT-PCR产物被切为446、251和122bp 3个条带,基因Ⅰ型和基因Ⅲ型JEV混合RT-PCR产物被切为568、446、251和122bp 4个条带,该方法最低可检出1.5pg·μL-1的JEV RNA。RT-PCR-RFLP结果显示78份临床样品中有14份为JEV阳性,其中6份为基因Ⅰ型,8份为基因Ⅲ型,与核苷酸测序分析结果一致。本研究为日本脑炎病毒的实验室诊断及基因Ⅰ型和基因Ⅲ型的鉴别提供了一种快速有效的分子生物学方法。 展开更多
关键词 日本脑炎病毒 反转录-聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 基因Ⅰ型 基因Ⅲ型 鉴别
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One-step RT-PCR-RFLP方法筛查新型甲型H1N1流感病毒Oseltamivir耐药株 被引量:2
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作者 熊英 施勇 +3 位作者 李健雄 龚甜 周珺 徐刚 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第23期3409-3411,共3页
目的分析2013年江西省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性,为甲型H1N1流感临床治疗和疾病控制提供参考。方法收集江西省流感监测哨点医院采集的流感样病例的鼻咽拭子标本,采用狗肾... 目的分析2013年江西省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性,为甲型H1N1流感临床治疗和疾病控制提供参考。方法收集江西省流感监测哨点医院采集的流感样病例的鼻咽拭子标本,采用狗肾传代细胞(MDCK)对标本进行病毒分离,对分离的31株新型甲型H1N1流感病毒进行核酸提取,采用一步法逆转录-聚合酶链反应(One-step RT-PCR)扩增病毒NA基因部分片段,采用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法,分析扩增的部分NA基因第275位是否发生组氨酸(H)到酪氨酸(Y)的突变。结果2013年江西省31株甲型H1N1流感病毒NA基因第275位氨基酸均为组氨酸,未发生变异。结论 2013年31株毒株均对Oseltamivir敏感,One-step RT-PCR-RFLP方法筛查新型甲型H1N1流感病毒Oseltamivir耐药株简便可行。 展开更多
关键词 新型甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶基因 耐药性 一步法逆转录聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析方法
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应用RT-PCR-RFLP鉴别2014年新余市麻疹病毒感染病例 被引量:1
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作者 文奇 廖秀海 +3 位作者 潘虹 胡传琛 龚甜 李健雄 《实验与检验医学》 CAS 2019年第2期202-204,共3页
目的引进一种区别麻疹病毒疫苗株与野生株的简单方法,用以检测新余市麻疹病毒感染病例标本。方法新余市8份麻疹病毒感染病例标本和1株S191麻疹疫苗株经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒H基因部分片段,应用限制性内切酶片段长度多态... 目的引进一种区别麻疹病毒疫苗株与野生株的简单方法,用以检测新余市麻疹病毒感染病例标本。方法新余市8份麻疹病毒感染病例标本和1株S191麻疹疫苗株经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒H基因部分片段,应用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法进行酶切分析。结果 S191麻疹疫苗株被AflII限制性酶酶切成2个片段,8份麻疹病毒感染病例标本均未酶切消化。结论新余8例麻疹病例全部为麻疹野病毒所感染;RT-PCR-RFLP方法简单、有效,非常适合条件受限的实验室使用。 展开更多
关键词 麻疹病毒 疫苗株 野生株 逆转录聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析方法
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猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法的建立 被引量:2
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作者 胡继明 杨培培 +7 位作者 王颖 孙海芳 黄娟 陈俏俏 杨瑞梅 张传美 秦晓冰 单虎 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期943-949,共7页
本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒RT-PCR-RFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆... 本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒RT-PCR-RFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆与序列分析,验证上述方法。结果RT-PCR扩增片段为825bp,产物经RFLP分析,野毒株的PCR产物能被ApaⅠ酶切为322bp和503bp 2个片段,兔化弱毒疫苗株则不能被酶切,检测出RNA的最低浓度为0.028 6μg.mL-1;8株流行野毒株都含GGGCCC序列(ApaⅠ酶切位点),2株疫苗株相应序列为GAGCCC,不能被ApaⅠ酶切;8株流行野毒株属于基因2群,2株疫苗株与HCLV遗传关系近,为基因1群。建立了可鉴别猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP检测方法,为猪瘟的防控提供有效手段。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 野毒株 兔化弱毒疫苗株 rt-pcr-rflp
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RT-PCR-RFLP方法用于脊髓灰质炎病毒型内鉴定
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作者 田宏 刘杨 +1 位作者 高志刚 万丽霞 《天津医药》 CAS 北大核心 2004年第8期485-486,F005,共3页
目的 :采用逆转录 -聚合酶链反应 -限制性酶切片段长度多态性分析 (RT_PCR_RFLP)方法对脊髓灰质炎(脊灰)病毒 (PV)进行型内鉴定。方法 :采用RT_PCR方法对PV的VP1区进行扩增 ,PCR产物分别用DdeⅠ、HpaⅡ、HaeⅢ3种限制性内切酶做RFLP分... 目的 :采用逆转录 -聚合酶链反应 -限制性酶切片段长度多态性分析 (RT_PCR_RFLP)方法对脊髓灰质炎(脊灰)病毒 (PV)进行型内鉴定。方法 :采用RT_PCR方法对PV的VP1区进行扩增 ,PCR产物分别用DdeⅠ、HpaⅡ、HaeⅢ3种限制性内切酶做RFLP分析 ,并与PVSabinⅠ、Ⅱ、Ⅲ3个型别疫苗株相对照判定其是否为疫苗相关株。结果 :对天津市2001年—2002年分离到的9株PV阳性株进行RT_PCR_RFLP试验 ,全部为疫苗相关株。结论 :该方法应用于PV检测 ,可以尽早发现脊灰野病毒、疫苗衍生株及疫苗重组株等 ,便于尽快采取措施阻断其传播。 展开更多
关键词 rt—PCR—RFLP法 脊髓灰质炎病毒 疫苗衍生株 疫苗重组株
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鹅星状病毒通用型TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 陈立功 穆英丽 +5 位作者 张诚 潘保革 范乐乐 魏忠华 王学静 刘聚祥 《中国家禽》 北大核心 2025年第2期53-59,共7页
为建立用于鹅星状病毒1(GAstV 1)和鹅星状病毒2(GAstV 2)感染快速检测的实时荧光定量RT-PCR方法,试验根据部分GAstV ORF2基因和部分3′非编码区序列设计合成特异性引物和探针,采用矩阵法获得引物和探针的最优浓度,在优化退火温度的基础... 为建立用于鹅星状病毒1(GAstV 1)和鹅星状病毒2(GAstV 2)感染快速检测的实时荧光定量RT-PCR方法,试验根据部分GAstV ORF2基因和部分3′非编码区序列设计合成特异性引物和探针,采用矩阵法获得引物和探针的最优浓度,在优化退火温度的基础上,分别建立扩增GAstV 1和GAstV 2的标准曲线,进一步验证该方法的特异性、敏感性和重复性,建立的方法用于临床样品的检测,并与文献报道的常规RT-PCR方法进行比较。结果显示:优化后的反应体系中最优上、下游引物浓度均为0.40(或0.50)μmol/L,探针浓度均为0.50μmol/L,扩增线性范围分别为3.26×10^(3)~3.26×10^(8)拷贝/μL和7.09×10^(3)~7.09×10^(8)拷贝/μL,相关系数均为0.998;该方法可特异性检出两种GAstV,但对新城疫病毒、H9亚型禽流感病毒、鸭坦布苏病毒、新型鸭呼肠孤病毒、鹅细小病毒和血清4型禽腺病毒6种鹅病相关病毒的核酸均无扩增信号;其检测限分别为3.26×10^(2)拷贝/μL和7.09×10^(1)拷贝/μL;组内变异系数和组间变异系数均低于3%。建立的实时荧光定量RT-PCR方法对临床样品的检测结果显示,GAstV阳性率为90.57%(96/106);而文献报道的常规RT-PCR方法对GAstV 1和GAstV 2的混合阳性率为62.26%。研究表明,建立的TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法为同时检测GAstV 1和GAstV 2提供了快速、敏感、特异且能满足临床样本需求的检测方法。 展开更多
关键词 鹅星状病毒 荧光定量rt-PCR TAQMAN探针
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基于轻量级改进RT-DETR边缘部署算法的绝缘子缺陷检测 被引量:9
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作者 姜香菊 王瑞彤 马彦鸿 《电工技术学报》 北大核心 2025年第3期842-854,共13页
随着新型电力系统的不断发展建设,输电线路绝缘子状态智能化巡检成为必然趋势。为方便“云-边-端协同架构”进行边缘部署,该文提出一种轻量级RT-DETR目标检测算法。首先,采用RT-DETR作为基线算法降低优化难度,提高鲁棒性;其次,选择轻量... 随着新型电力系统的不断发展建设,输电线路绝缘子状态智能化巡检成为必然趋势。为方便“云-边-端协同架构”进行边缘部署,该文提出一种轻量级RT-DETR目标检测算法。首先,采用RT-DETR作为基线算法降低优化难度,提高鲁棒性;其次,选择轻量级EMO作为算法特征提取主干,充分学习绝缘子目标的长距离特征交互及缺陷小目标的局部特征交互,并提出基于轻量级注意力的尺度内特征交互模块和轻量级跨尺度特征融合模块设计轻量级高效混合编码器;再次,在轻量级高效混合编码器中引入定位信息补充分支、使用DIoU损失函数结合迁移学习训练技巧,缓解轻量化造成的算法精度下降问题;最后,构建多天气条件绝缘子数据集进行训练验证。实验结果表明,相较于基线算法,所提算法检测精度达到97.2%,只损失0.7个百分点,而参数量和计算量分别下降67.8%和71.2%,检测速度提升2.5倍,满足多天气条件下的输电线路绝缘子状态巡检准确率及边缘部署轻量化要求。 展开更多
关键词 绝缘子缺陷检测 rt-DETR算法 轻量化 边缘部署 目标检测算法
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改进RT-DETR的煤矿刮板输送机链条故障智能识别方法 被引量:1
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作者 毛清华 郭文瑾 +2 位作者 苏毅楠 司马俊雷 薛旭升 《煤炭科学技术》 北大核心 2025年第9期469-479,共11页
针对目前煤矿刮板输送机链条多故障识别中的主要问题,提出一种基于改进RT-DETR(Real-Time DEtection TRansformer)的煤矿刮板输送机链条故障智能识别方法。该方法在数据集构建时,运用基于HSV三通道的图像预处理方法对煤矿刮板输送机链... 针对目前煤矿刮板输送机链条多故障识别中的主要问题,提出一种基于改进RT-DETR(Real-Time DEtection TRansformer)的煤矿刮板输送机链条故障智能识别方法。该方法在数据集构建时,运用基于HSV三通道的图像预处理方法对煤矿刮板输送机链条图像进行数据降噪与增强处理,提升图像质量。在改进的RT-DETR算法中,通过采用MobileNetV4作为主干特征网络,提升主干网络特征提取效率;通过将混合编码器中的普通卷积替换为效果更佳的Ghost卷积,降低算法参数量,提升识别速度;通过运用CSPStage特征融合模块和Inner-GIoU损失函数,增强特征利用和融合的能力,提高识别准确率。为了验证算法改进模块的效果,通过消融实验结果表明:改进RT-DETR算法与原RT-DETR算法相比,识别准确度提升1.6%,每秒处理的帧数提升15.5 frames/s,模型大小降低36%,参数量减少35.9%。运用改进RT-DETR算法与YOLOv8m-ghost、YOLOv8m-RT-DETR和YOLOv10s算法进行多故障识别对比实验,对比实验结果表明:改进RT-DETR识别算法在各指标上均效果最优,能够实现刮板输送机链条断链故障和磨损故障的高效准确识别,识别准确率达到97.6%,每秒处理的FPS值达到67.2 frames/s,能够在空载和未满载状态下,满足煤矿刮板输送机链条故障在线高效准确识别的需求。 展开更多
关键词 煤矿刮板输送机 链条故障 rt-DETR 智能识别 MobileNetV4 HSV三通道
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准噶尔盆地大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3多态性分析
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作者 麦迪娜·肖开提 牟文婷 +5 位作者 古丽阿依·包开西 罗勇军 肖吾开提·塞麦提 阿布力克木·阿布都热西提 王信惠 王启果 《热带医学杂志》 2025年第7期905-909,共5页
目的分析准噶尔盆地鼠疫疫源地内大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3的多态性,探索其鼠疫抗性差异的遗传基础。方法在准噶尔盆地东部的奇台县、阜康市和木垒哈萨克自治县捕获大沙鼠和子午沙鼠,经鼠疫菌分离培养和血清鼠疫F1抗体检测证实阴... 目的分析准噶尔盆地鼠疫疫源地内大沙鼠与子午沙鼠RT1-DMb*exon3的多态性,探索其鼠疫抗性差异的遗传基础。方法在准噶尔盆地东部的奇台县、阜康市和木垒哈萨克自治县捕获大沙鼠和子午沙鼠,经鼠疫菌分离培养和血清鼠疫F1抗体检测证实阴性后提取其脾脏组织DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增RT1-DMb*exon3并测序。使用ClustalW 1.83软件进行序列的多重比对分析,使用Mega 4.0软件分析不同序列的核苷酸和氨基酸组成,采用Kimura双参数模型计算遗传距离;使用DnaSP 6.0软件计算遗传多样性参数;使用Arlequin 3.0软件中的分子变异分析(AMOVA)对遗传分化指数(FST)进行检验。使用SPSS 22.0统计学软件,以t检验或MannWhitney U检验分析大沙鼠与子午沙鼠在碱基含量和氨基酸组成方面的差异。结果大沙鼠与子午沙鼠在核苷酸组成(G%:t=-2.810,P=0.010;T%:Z=4.235,P<0.001;C%:t=-2.525,P=0.020)、单核苷酸多态性位点数量和分布(大沙鼠检出4个核苷酸多态性位点,分别位于第7、202、299、313位碱基上;子午沙鼠检出10个核苷酸多态性位点,分别位于第93、138、204、298、384、411、435、126、165、329位碱基上)、单倍型数量(大沙鼠6个,子午沙鼠10个)方面存在显著差异。大沙鼠核苷酸多样性指数(π)为(0.0040±0.0004)、单倍型多样性指数(h)为(0.8330±0.0710)、平均核苷酸差异数(K)为1.7440,子午沙鼠的π、h、K分别为(0.0090±0.0010)、(1.0000±0.0450)、3.9780。大沙鼠与子午沙鼠的FST为0.920,二者存在很大的遗传分化,且大沙鼠的FST显著小于子午沙鼠(0.027 vs.0.202),提示子午沙鼠相较于大沙鼠具有更大的遗传分化。结论准噶尔盆地鼠疫疫源地内子午沙鼠相较于大沙鼠具有更高的基因多态性和更大的遗传分化,这可能与子午沙鼠较低的鼠疫感染率有关。 展开更多
关键词 大沙鼠 子午沙鼠 鼠疫抗性 rt1-DMb*exon3
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基于织物疵点检测的改进RT-DETR模型
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作者 李敏 李珠婷 +2 位作者 朱萍 崔树芹 颜小运 《毛纺科技》 北大核心 2025年第11期130-138,共9页
为提升织物疵点检测的效率与准确性,提出一种基于改进RT-DETR模型的方法。首先,针对RT-DETR模型全局和局部特征捕捉能力不足的问题,在骨干网络引入RADBlock模块,提高模型识别不同尺度织物疵点的精度;其次,考虑到在网络较深的部分容易对... 为提升织物疵点检测的效率与准确性,提出一种基于改进RT-DETR模型的方法。首先,针对RT-DETR模型全局和局部特征捕捉能力不足的问题,在骨干网络引入RADBlock模块,提高模型识别不同尺度织物疵点的精度;其次,考虑到在网络较深的部分容易对织物疵点特征造成遗失的问题,设计结合扩张卷积的跨尺度特征注意力融合模块CAFBlock,有效保留织物疵点细节;最后使用SIoU代替GIoU函数帮助模型提高检测精度。在天池平台织物疵点数据集测试结果显示,与原RT-DETR模型相比较,改进后RT-DETR模型的精确率、召回率和mAP@0.5分别提高了4.6%,5.1%和7.1%,同时参数量、计算量分别减少了约16%和8%。 展开更多
关键词 织物疵点检测 rt-DETR模型 RADBlock CAFBlock SIoU
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羊肠道病毒TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 马雪青 张雨星 +6 位作者 李平花 王松泰 魏达礼 赵志荀 朵红 卢曾军 孙普 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第6期757-763,共7页
为建立一种灵敏、特异、准确的羊肠道病毒(CEV)实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究基于CEV基因序列的保守区设计特异性引物和探针,并制备标准品,通过优化反应体系和反应条件,建立了TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,同时对其敏感性、... 为建立一种灵敏、特异、准确的羊肠道病毒(CEV)实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究基于CEV基因序列的保守区设计特异性引物和探针,并制备标准品,通过优化反应体系和反应条件,建立了TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,同时对其敏感性、特异性和重复性进行评估,并与常规RT-PCR比较检测临床样品。结果显示,所建方法的标准曲线R2为0.995,拷贝数与Ct值有良好的线性关系;该方法特异性强,与口蹄疫病毒(FMDV)、小反刍兽疫病毒(PPRV)、羊痘病毒(SPV)、羊口疮病毒(ORFV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)无交叉反应;敏感性最低检测限为23 copies/μL;组内与组间变异系数均小于2.5%,重复性好。使用本方法检测了598份羊的临床样品,阳性检出率(83/598)高于常规RT-PCR (30/598)。上述结果表明,本研究建立了一种灵敏、特异的CEV TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测方法,并建议采用羊的粪便或肛拭子即可进行CEV的流调工作,这为CEV的诊断、流行病学调查提供了重要的技术支持。 展开更多
关键词 羊肠道病毒 TaqMan实时荧光定量rt-PCR 诊断
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兔出血症病毒RHDV1和RHDV2一步法双重TaqMan探针荧光定量RT-PCR体系的建立和应用
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作者 陈萌萌 王冠萱 +8 位作者 仇汝龙 范志宇 胡波 宋艳华 魏后军 徐为中 葛雷 李一鸣 王芳 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第5期937-942,共6页
兔出血症病毒(RHDV)引起的兔出血症是一种急性、高度致死性传染病,对养兔业造成严重危害。本研究基于RHDV衣壳蛋白(VP60)基因序列设计引物和TaqMan探针,建立可同时检测RHDV1和RHDV2两种毒株的双重TaqMan荧光定量RT-PCR检测体系。反应体... 兔出血症病毒(RHDV)引起的兔出血症是一种急性、高度致死性传染病,对养兔业造成严重危害。本研究基于RHDV衣壳蛋白(VP60)基因序列设计引物和TaqMan探针,建立可同时检测RHDV1和RHDV2两种毒株的双重TaqMan荧光定量RT-PCR检测体系。反应体系:2×One Step RT-PCR BufferⅢ10.0μL,上下游引物(10μmol/L)各0.6μL,ROX Reference DyeⅡ(50×)0.4μL,两种荧光探针(10μmol/L)各0.8μL,待测样本2.0μL,ddH_(2)O 4.8μL。反应程序:42℃5 min,95℃10 s,95℃5 s,60℃30 s,40个循环。试验结果表明,该体系特异性强,与轮状病毒、兔多杀性巴氏杆菌、兔支气管败血波氏菌、绿脓杆菌、沙门氏菌无交叉反应;灵敏度高,最低检测限为1μL 100拷贝。通过组内重复和组间重复进行重复性分析,Ct值变异系数为0.2%~2.9%,表明该体系稳定性较好。使用该体系对112份临床样本(60份肝脏组织、52份鼻肛拭子)进行检测,RHDV总检出率为69%,而常规RT-PCR体系的检出率仅为51%。本研究建立的双重荧光定量RT-PCR方法具有高灵敏度、强特异性和良好的重复性,可为RHDV的临床快速诊断及定量分析提供可靠技术支持。 展开更多
关键词 兔出血症病毒 荧光定量rt-PCR TAQMAN探针
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烟草轻型绿花叶病毒RT-LAMP快速检测方法的建立与应用
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作者 秦艳红 鲁书豪 +8 位作者 陈须琨 文艺 高素霞 李绍建 杨瑾 李雪梦 郝学政 王飞 鲁传涛 《植物病理学报》 北大核心 2025年第6期1325-1334,共10页
为快速检测烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV),本文根据TMGMV外壳蛋白(coat protein,CP)基因的保守序列设计了3组RT-LAMP引物进行筛选确定最佳引物组合;采用单一变量法对反应温度和反应时间进行优化,并将RT-PC... 为快速检测烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV),本文根据TMGMV外壳蛋白(coat protein,CP)基因的保守序列设计了3组RT-LAMP引物进行筛选确定最佳引物组合;采用单一变量法对反应温度和反应时间进行优化,并将RT-PCR和RT-LAMP进行对比实验,验证优化后特异性检测、灵敏度比较及田间应用的实际性,建立了TMGMV RT-LAMP快速检测技术体系。结果表明:RT-LAMP最适反应条件为在65℃恒温扩增60 min,优化后的RT-LAMP灵敏度是常规RT-PCR的1000倍,可检测到模板的最低浓度为1.65×10-2拷贝·μL-1,检测过程中与其他相关病毒无交叉反应。对60份地黄样品的检测结果表明,RT-LAMP方法的检出率(100%)高于RT-PCR检出率(83.3%)。因此本研究建立的RT-LAMP检测技术可用于TMGMV的快速检测。 展开更多
关键词 烟草轻型绿花叶病毒 地黄 rt-LAMP恒温扩增 可视化检测
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福建蝴蝶兰病毒小RNA测序及RT-PCR检测
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作者 樊荣辉 吴建设 +2 位作者 冯子楠 钟声远 钟淮钦 《园艺学报》 北大核心 2025年第2期503-512,共10页
从福建省福州、厦门、漳州、泉州采集56个蝴蝶兰(Phalaenopsis)疑似病毒样品,按侵染症状分为褪绿、黄化褐斑、黄化皱缩等3类样品,采用小RNA测序技术和RT-PCR进行检测,共发现8种病毒,按照检出率从高到低分别为建兰花叶病毒(Cymbidium mos... 从福建省福州、厦门、漳州、泉州采集56个蝴蝶兰(Phalaenopsis)疑似病毒样品,按侵染症状分为褪绿、黄化褐斑、黄化皱缩等3类样品,采用小RNA测序技术和RT-PCR进行检测,共发现8种病毒,按照检出率从高到低分别为建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,Cy MV)85.71%,齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)35.71%,白三叶草花叶病毒(white clover mosaic virus,WCMV)32.14%,淮山药X病毒(yam virus X,Ya VX)21.43%,水仙花叶病毒(Narcissus mosaic virus,Na MV)10.71%,凤果花叶病毒(pepino mosaic virus,Pe MV)8.93%,马铃薯X病毒(potato virus X,Po VX)7.14%和仙人指X病毒(Schlumbergera virus X,Sc VX)7.14%。其中,Cy MV、ORSV和WCMV的检出率在30%以上,多为复合侵染,侵染率达75.51%。以小RNA测序序列为模板,设计出特异引物,建立了同时检测5种病毒的多重RT-PCR体系;ORSV、Cy MV、WCMV、Ya VX和Po VX的引物对浓度分别为0.30,0.06,0.20,0.50和0.40μmol·L^(-1),退火温度56℃时,可同时扩增出片段大小分别为1156、908、561、292和162 bp的目的条带,特异性良好。灵敏度检测结果显示,可从≥0.0001 mg的感病植物组织中检测到这5种病毒。 展开更多
关键词 蝴蝶兰 小RNA深度测序 多重rt-PCR 病毒
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国标中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT-PCR方法的优化与应用
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作者 刘朔 彭程 +3 位作者 毛秋艳 杨吉喆 蒋文明 刘华雷 《病毒学报》 北大核心 2025年第5期1522-1530,共9页
当前H5N1亚型禽流感疫情在全球范围内肆虐,且病毒不断变异,因此需要持续对检测方法的有效性进行评估。近年来,我们在临床样品检测过程中发现,国家标准《高致病性禽流感诊断技术》(GB/T 18936-2020)中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT... 当前H5N1亚型禽流感疫情在全球范围内肆虐,且病毒不断变异,因此需要持续对检测方法的有效性进行评估。近年来,我们在临床样品检测过程中发现,国家标准《高致病性禽流感诊断技术》(GB/T 18936-2020)中H5亚型高致病性禽流感病毒实时荧光RT-PCR方法存在扩增曲线荧光值偏低的现象,对结果判定产生一定干扰。基于国标引物和探针序列与当前流行毒株的匹配性评估分析,我们设计和优化了上游引物和探针序列,并对优化方法的特异性、灵敏度和临床样品检测效果与国标方法进行了对比。结果显示,该优化方法特异性强,与其他亚型AIV和常见禽类病原体均无交叉反应;针对2.3.4.4b分支H5亚型病毒的检测灵敏度较国标方法提高了10倍,针对2.3.4.4h分支H5亚型病毒的检测灵敏度与国标方法类似;组内和组间试验Ct值变异系数介于0.17%~1.58%,具有良好的重复性;对48份家禽和野禽咽肛拭子样品检测,本优化方法检出阳性样本38份(国标方法检出37份),其中64.9%(24/37)阳性样品的Ct值较国标方法低2以上。结果表明,本研究优化的荧光RT-PCR方法可为H5亚型高致病性禽流感病毒的流行病学调查监测及快速诊断提供技术支持。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H5亚型 实时荧光rt-PCR 检测方法
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