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肺炎支原体耐药性与23S rRNA耐药基因位点突变研究 被引量：5
1
作者 孙晓旭 董玉琼 +3 位作者 赵永旺 袁业红 吕晶晶 侯伦 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2025年第1期52-56,共5页
目的探析肺炎支原体肺炎(Mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)患儿肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)耐药性及23S rRNA耐药基因位点突变情况,以期为临床治疗提供依据。方法对比分析本院2022年1月~2023年12月收治的MPP患儿临床资料... 目的探析肺炎支原体肺炎(Mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)患儿肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)耐药性及23S rRNA耐药基因位点突变情况,以期为临床治疗提供依据。方法对比分析本院2022年1月~2023年12月收治的MPP患儿临床资料,采用PCR技术检测23S rRNA耐药基因位点突变情况,结合药敏试验结果,探讨耐药性与基因突变间的关联。结果共分离出78株MP菌株。这些菌株对乙酰螺旋霉素、红霉素、克拉霉素和罗红霉素的耐药性超过50%,耐药率分别为75.64%、73.08%、51.28%和76.92%;对左氧氟沙星、环丙沙星和莫西沙星的耐药率低于10%,分别为3.85%、3.85%和1.28%。对78株MP菌株进行测序分析显示,23S rRNA耐药基因位点突变率为76.92%(60/78)。其中,47株为A2063G位点发生突变(78.33%,47/60),9株为A2064G位点发生突变(15%,9/60),4株为A2063C位点发生突变(6.67%,4/60)。47株A2063G位点突变MP菌株对罗红霉素、乙酰螺旋霉素完全耐药,对红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、交沙霉素、左氧氟沙星、环丙沙星和莫西沙星的耐药率分别为95.74%、63.83%、44.68%、17.02%、6.38%、6.38%和2.13%。9株A2064G位点突变MP菌株对罗红霉素完全耐药,对乙酰螺旋霉素、红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、交沙霉素的耐药率分别为88.89%、88.89%、77.78%、33.33%和22.22%,未对左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星产生耐药性。4株A2063C位点突变MP菌株对罗红霉素、乙酰螺旋霉素、红霉素完全耐药,对克拉霉素耐药率为75%,对阿奇霉素、交沙霉素耐药率为25%,未对左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星产生耐药性。不同突变位点MP菌株对常用抗菌药物耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。在基因突变组患者中,咳嗽、发热、气促、寒战、呼吸音减弱、肺外感染和重症肺炎的发生率分别为100%、88.33%、66.67%、31.67%、71.67%、40%和63.33%。而在基因未突变组中,这些症状的发生率分别为94.44%、77.78%、44.44%、22.22%、27.78%、5.56%和33.33%。两组患者在咳嗽、发热、气促、寒战方面的差异无统计学意义(P<0.05),但在呼吸音减弱、肺外感染、重症肺炎方面的差异有统计学意义(P>0.05)。在基因突变组中,14例合并混合感染,感染率为23.34%,其中4例合并细菌感染,包括铜绿假单胞菌2例,肺炎克雷伯菌1例,鲍曼不动杆菌1例;10例合并病毒感染,包括腺病毒5例,流感病毒4例,合胞病毒1例。基因未突变组中,6例合并混合感染,感染率为33.34%,其中3例合并细菌感染,包括铜绿假单胞菌1例,肺炎克雷伯菌1例,肺炎链球菌1例;3例合并病毒感染,包括腺病毒2例,呼吸道合胞病毒1例。两组混合感染率差异无统计学意义。结论本院MP菌株对大环内酯类抗生素的耐药率较高,而对氟喹诺酮类抗生素的耐药率较低。23S rRNA耐药基因位点突变与MP菌株的耐药性密切相关,其中A2063G位点突变与高耐药率显著相关。 展开更多
关键词 肺炎支原体 耐药性 23S rrna 耐药基因位点突变
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基于16S rRNA高通量测序的驻岛人员肠道菌群分析
2
作者 吴浩 谢沛 +4 位作者 张菂 黄文 李兆申 薛芊 鞠金涛 《海军军医大学学报》 北大核心 2025年第3期400-405,共6页
目的分析驻岛人员肠道菌群特征,为维护驻岛人员的肠道微生态平衡及提供精准的医疗保障奠定基础。方法采用随机抽样的方法纳入驻岛人员若干,同时纳入沿海地区人员若干作为对照,对人员粪便标本进行16S rRNA高通量测序。比较两组人员肠道... 目的分析驻岛人员肠道菌群特征,为维护驻岛人员的肠道微生态平衡及提供精准的医疗保障奠定基础。方法采用随机抽样的方法纳入驻岛人员若干,同时纳入沿海地区人员若干作为对照,对人员粪便标本进行16S rRNA高通量测序。比较两组人员肠道菌群多样性及菌群组成差异。结果肠道菌群alpha多样性分析显示驻岛人员肠道菌群丰度较沿海地区人员升高,beta多样性分析提示驻岛人员肠道微生物群落构成与沿海地区人员相比差异有统计学意义(P=0.001)。驻岛人员肠道内拟杆菌门丰度低于沿海地区人员(30.8%vs 48.3%,P<0.001),而肠道内变形菌门丰度高于沿海地区人员(28.3%vs 10.2%,P<0.001)。经多重假设检验校正后发现,驻岛人员肠道内拟杆菌属、罗斯氏菌属、另枝菌属、副拟杆菌属丰度显著下降,普雷沃氏菌属、大肠埃希菌-志贺菌属、柠檬酸杆菌属、产粪甾醇真杆菌属丰度显著提升。结论海岛特殊环境影响驻岛人员肠道菌群特征,肠道微生态健康亟需精准保障。 展开更多
关键词 驻岛人员 海岛 肠道菌群 16S rrna 高通量测序
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基于16S rRNA测序的上海市某三甲医院集中空调通风系统细菌群落的分布特征
3
作者 倪骏 张海云 +5 位作者 陈健 张莉君 刘永萍 李晓静 郑毅鸣 张莉萍 《环境与职业医学》 北大核心 2025年第6期732-739,共8页
[背景]医院是各类患者与易感人群聚集的场所,呼吸道传染病的病原微生物是造成医疗机构呼吸道传染病交叉感染的重要原因。集中空调通风系统在改善室内环境的同时,更加剧了呼吸道传染病的传播风险。[目的]了解医院集中空调通风系统(后称... [背景]医院是各类患者与易感人群聚集的场所,呼吸道传染病的病原微生物是造成医疗机构呼吸道传染病交叉感染的重要原因。集中空调通风系统在改善室内环境的同时,更加剧了呼吸道传染病的传播风险。[目的]了解医院集中空调通风系统(后称“集中空调”)微生物分布特征,为医院集中空调卫生标准中微生物指标的选择和医院的风险预警提供科学依据。[方法]2023年10月,选取上海市某三甲医院2套集中空调通风系统,其中一套集中空调为全空气空调系统,服务于一层候诊区,另一套集中空调为风机盘管加新风系统,服务于三层门诊区。对通风系统中风口、过滤网、表冷器和冷凝水盘4个不同部位的样本进行细菌群落的16S rRNA测序,采用α多样性分析和β多样性分析,了解医院集中空调通风系统微生物群落组成及多样性特征。通过功能分析,了解集中空调通风系统细菌功能相对丰度。[结果]共检测到操作分类单元(OTUs)528个,涵盖了20个细菌门、37个纲、79个目、123个科和240个属。分析结果显示,细菌群落的组成以变形菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门和放线菌门为主要优势门。多样性分析结果显示,冷凝水盘中的细菌群落丰富度和多样性最高,而风口、过滤网和表冷器3组样本之间的细菌群落组成差异无统计学意义(P>0.05)。功能分析结果显示,空调通风系统中的细菌群落主要表现出化能异养型、需氧化能异养型和尿解型等功能特征。[结论]变形菌门的优势地位表明该门类细菌在空调系统中的适应性较强,可能与其能够在不同环境条件下存活和繁殖有关。多样性分析结果表明冷凝水盘是空调系统中细菌繁殖的一个关键区域。风口、过滤网、表冷器这些部位的环境条件相似,导致细菌群落结构的相似性。功能分析结果表明细菌群落具有较强的能量转化和物质代谢能力,可能在空调系统中参与有机物的分解及氮循环等过程。 展开更多
关键词 16S rrna测序 医院 集中空调 微生物分布 风险预警
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基于16S rRNA高通量测序的腹吸鳅科鱼类消化道微生物群落
4
作者 杨柳 陈敬琛 唐文乔 《上海海洋大学学报》 北大核心 2025年第6期1226-1239,共14页
腹吸鳅科(Gastromyzontidae)鱼类主要栖息于亚洲东南部山区溪流,该科鱼类体型扁平,偶鳍宽大,部分种类偶鳍特化为吸盘状。为了解腹吸鳅科鱼类肠道微生物群落的多样性和结构,本文对保亭近腹吸鳅(Plesiomyzon baotingensis)、秉氏爬岩鳅(Be... 腹吸鳅科(Gastromyzontidae)鱼类主要栖息于亚洲东南部山区溪流,该科鱼类体型扁平,偶鳍宽大,部分种类偶鳍特化为吸盘状。为了解腹吸鳅科鱼类肠道微生物群落的多样性和结构,本文对保亭近腹吸鳅(Plesiomyzon baotingensis)、秉氏爬岩鳅(Beaufortia pingi)、贵州爬岩鳅(Beaufortia kweichowensis)、拟平鳅(Liniparhomaloptera disparis)、中华近原吸鳅(Erromyzon sinensis)、似原吸鳅(Paraprotomyzon multifasciatus)、方氏品唇鳅(Labidogastromyzon fangi)、长汀品唇鳅(Labidogastromyzon changtingensis)、平舟原缨口鳅(Vanmanenia pingchowensis)、原缨口鳅(Vanmanenia stenosoma)、扁头原缨口鳅(Vanmanenia homalocephala)、斑纹缨口鳅(Formosania stigmata)等8个属12个物种的肠道样本进行了MiSeq 16S rRNA高通量测序,分析了操作分类单元(OTU)数量、微生物群落组成、Alpha多样性以及功能预测。共鉴定出1029个OTU,涵盖31门75纲173目278科465属689种,每种平均OTU数175个,共有OTU数3个。在群落组成上,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteriota)、放线菌门(Actinobacteriota)和疣微菌门(Verrucomicrobiota),优势菌属为无色杆菌属(Achromobacter)、鲸杆菌属(Cetobacterium)、邻单胞菌属(Plesiomonas)和分枝杆菌属(Mycobacterium)等。共有菌属为红球菌属(Rhodococcus)、分枝杆菌属(Mycobacterium)和赖氏菌属(Leifsonia)。Alpha多样性分析表明,不同物种的微生物群落在物种丰富度和多样性方面存在显著差异。秉氏爬岩鳅的多样性最高,而原缨口鳅的多样性最低。利用KEGG通路分析发现,肠道微生物编码的大多数基因与代谢过程相关,其中与氨基酸转运和代谢相关的功能通路相对丰度最高,为11.40%。从OTU数和OTU水平的PCoA分析角度看,很难预测其与系统发育之间的关联性。相比生活在平原和河湖系统的鱼类,腹吸鳅科鱼类的优势群属中包含诸如分枝杆菌属(Mycobacterium)的专性需氧菌(占9.47%),以及一些偏好有氧环境的兼性厌氧菌,如无色杆菌属(Achromobacter)(占比24.91%)等。 展开更多
关键词 16S rrna 肠道微生物 优势菌群 物种多样性
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应用16S rRNA基因测序技术比较不同品系2型糖尿病大鼠肠道菌群的异同
5
作者 刘军 齐晏永 +2 位作者 郭超 高伟 牛苗苗 《实验动物科学》 2025年第2期44-51,共8页
目的比较SD和GK两个品系大鼠建立的2型糖尿病(T2DM)模型肠道菌群组成和多样性的异同,为探索两模型在T2DM相关肠道菌群研究中的进一步应用提供背景数据。方法采用8周龄SPF级雄性SD和GK大鼠各20只,SD组大鼠高脂饲料饲喂6周后,单次腹腔注射... 目的比较SD和GK两个品系大鼠建立的2型糖尿病(T2DM)模型肠道菌群组成和多样性的异同,为探索两模型在T2DM相关肠道菌群研究中的进一步应用提供背景数据。方法采用8周龄SPF级雄性SD和GK大鼠各20只,SD组大鼠高脂饲料饲喂6周后,单次腹腔注射30 mg/kg的链脲佐菌素(STZ),GK组大鼠高脂饲料诱导4周后出现糖尿病症状,两组大鼠空腹血糖≥11.1 mmol/L为T2DM建模成功,分别收集每组10只大鼠建模成功6周后的洁净粪便各10份,进行16S rRNA基因V3-V4区测序,分析粪便中肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性、优势菌属及肠道菌群相关的功能通路。结果SD组与GK组大鼠肠道菌群的Alpha多样性和丰富度没有显著差异,两组大鼠肠道菌群Beta多样性指数显著不同(均P<0.05)。GK组T2DM大鼠肠道的优势菌属为乳酸杆菌属、未分类梭菌属_UCG_014、未分类鼠杆菌科、阿克曼菌和瘤胃球菌属;SD组T2DM大鼠的优势菌属为异杆菌属、乳酸杆菌属、毛螺菌科_NK4A136组、链球菌属、瘤胃球菌属、UCG-005和联合乳酸杆菌属;两组的优势菌属在组成和比例上差异很大。两组T2DM大鼠肠道菌群的功能通路主要集中在氨基酸代谢、糖代谢、核苷酸代谢和脂代谢为主的代谢途径中。结论两组T2DM大鼠肠道菌群Alpha多样性无差异,但肠道菌群的组成及比例差异较大,优势菌群在不同T2DM模型中的组成比例发生了改变。 展开更多
关键词 大鼠 2型糖尿病 肠道菌群 16S rrna基因测序
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基于16S rRNA基因测序的脓毒症患者肠道菌群特征及其与预后的关联性研究
6
作者 罗建宇 吕光宇 刘美琼 《内科》 2025年第4期350-357,共8页
目的基于16S rRNA基因测序技术,探讨脓毒症患者肠道菌群的结构与多样性特征,并初步探索其与患者院内预后的关联性。方法采用前瞻性研究方法,收集50例脓毒症患者(脓毒症组)入院2 d内的粪便样本及10例健康志愿者(健康组)的粪便样本。对粪... 目的基于16S rRNA基因测序技术,探讨脓毒症患者肠道菌群的结构与多样性特征,并初步探索其与患者院内预后的关联性。方法采用前瞻性研究方法,收集50例脓毒症患者(脓毒症组)入院2 d内的粪便样本及10例健康志愿者(健康组)的粪便样本。对粪便菌群16S rRNA基因V3~V4区进行测序,进行生物信息学分析(包括操作分类单元、α多样性、β多样性及物种组成分析)。根据院内预后将脓毒症患者分为生存组(n=40)与死亡组(n=10),比较两组间菌属占比的差异,并采用受试者操作特征(ROC)曲线分析菌属占比与预后的关联。结果α多样性分析显示,脓毒症组Shannon、Simpson多样性指数均显著低于健康组(均P<0.05)。β多样性分析表明两组菌群结构存在差异。物种组成上,脓毒症组厚壁菌门相对丰度低于健康组,而变形菌门丰度升高。在属水平,脓毒症组肠球菌属、拟杆菌属、乳杆菌属为主要菌属。预后分析显示,死亡组肠杆菌属占比高于生存组(P<0.05),其占比与死亡结局关联的ROC曲线下面积为0.744。结论脓毒症患者肠道菌群发生紊乱,表现为多样性下降、益生菌减少及机会致病菌增多。本研究初步发现肠杆菌属相对丰度与患者死亡结局存在关联,但其作为独立预后标志物的价值仍需在前瞻性大样本研究中控制关键临床混杂因素后进一步验证。 展开更多
关键词 16S rrna基因 脓毒症 肠道菌群 预后 关联分析
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Cytb和12S rRNA基因在法医学野生动物种属鉴定中的应用
7
作者 姜德志 张雅欣 +9 位作者 臧钰 安茂蕾 张赞 邱程程 姜曜恒 宋伟 赵宏 解坤 陈佳艺 乌日嘎 《中国法医学杂志》 2025年第3期308-311,322,共5页
目的分析比较DNA条形码细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)与12S rRNA(ribosomal RNA,rRNA)基因序列用于野生动物种属鉴定的效能。方法对10份野生动物检材进行DNA提取、定量、Cytb与12S rRNA基因序列扩增、Sanger测序以及序列比对分析。结果... 目的分析比较DNA条形码细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)与12S rRNA(ribosomal RNA,rRNA)基因序列用于野生动物种属鉴定的效能。方法对10份野生动物检材进行DNA提取、定量、Cytb与12S rRNA基因序列扩增、Sanger测序以及序列比对分析。结果6份检材的两个基因片段均扩增成功,1份检材仅Cytb扩增成功,3份检材仅12S rRNA扩增成功。DNA序列分析显示,单独采用Cytb时,6份检材可鉴定至物种水平(黑水鸡、山斑鸠、雉鸡、黄爪隼、和尚鹦鹉、猞猁),1份检材仅能鉴定至属水平(兔属);单独采用12S rRNA时,8份检材可鉴定至物种水平(黑水鸡、华南兔、雉鸡、和尚鹦鹉、小麂、猕猴、猞猁),隶属于七个物种,而1份检材仅能鉴定至属水平(隼属);而联合采用Cytb和12S rRNA时,所有检材均可鉴定至物种水平。结论在应用DNA条形码技术鉴定野生动物时,本研究选取的Cytb与12S rRNA基因区域可鉴定黑水鸡、山斑鸠等常见物种,但难以区分同属近缘物种。故在野生动物种属鉴定实践中,对疑为此类者推荐选用2个或更多的DNA条形码标记。 展开更多
关键词 种属鉴定 DNA条形码 CYTB 12S rrna 野生动物
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基于16S rRNA测序和粪菌移植法探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响 被引量：3
8
作者 高澳 王晓菲 +5 位作者 卢意 卢柠霞 王天雨 卢芳 于栋华 刘树民 《中成药》 北大核心 2025年第2期634-641,共8页
目的基于16S rRNA测序和粪菌移植法(FMT)探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响。方法大鼠随机分为空白组、模型组、穿山龙总皂苷组及别嘌醇组,除空白组外,其他3组灌胃给予5%氧嗪酸钾混悬液,连续5周,并给予10%酵母饲料;第3周... 目的基于16S rRNA测序和粪菌移植法(FMT)探讨穿山龙总皂苷对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响。方法大鼠随机分为空白组、模型组、穿山龙总皂苷组及别嘌醇组,除空白组外,其他3组灌胃给予5%氧嗪酸钾混悬液,连续5周,并给予10%酵母饲料;第3周,穿山龙总皂苷组及别嘌醇组分别灌胃给予480 mg/kg穿山龙总皂苷及25 mg/kg别嘌醇,第5周采用全自动生化分析仪检测血清尿酸、尿素氮水平。建立伪无菌小鼠模型,分为空白对照组、正常粪便移植组、模型粪便移植组、穿山龙总皂苷粪便移植组,后三者分别灌胃给予空白组、模型组、穿山龙总皂苷组大鼠粪菌悬液,连续5周,对新鲜粪便进行16S rRNA测序,全自动生化分析仪检测血清尿酸、尿素氮水平。结果经过粪菌移植给药穿山龙总皂苷后,与模型粪便移植组比较,穿山龙总皂苷粪便移植组尿酸水平及拟杆菌属、毛螺菌属丰度降低(P<0.05),弯曲菌门、螺杆菌属、梭菌属丰度升高(P<0.05)。结论穿山龙总皂苷可通过调控高尿酸血症小鼠的肠道菌群动态平衡,影响其组成与功能,从而降低血尿酸。 展开更多
关键词 穿山龙总皂苷 高尿酸血症 粪菌移植 16S rrna测序 肠道菌群
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基于16S rRNA测序分析淫羊藿苷对衰老雌性与雄性小鼠肠道菌群调节作用的研究 被引量：1
9
作者 李晓盎 段丽萍 《中国药学杂志》 北大核心 2025年第9期915-922,共8页
目的探讨淫羊藿苷对老年雌性与雄性小鼠肠道菌群的调节作用,评估其对菌群多样性、结构及代谢功能的影响,并分析性别差异在干预效果中的作用。方法选取年轻(2月龄)与老年(24月龄)雌雄C57BL/6J小鼠,分别灌胃淫羊藿苷(100 mg·kg·... 目的探讨淫羊藿苷对老年雌性与雄性小鼠肠道菌群的调节作用,评估其对菌群多样性、结构及代谢功能的影响,并分析性别差异在干预效果中的作用。方法选取年轻(2月龄)与老年(24月龄)雌雄C57BL/6J小鼠,分别灌胃淫羊藿苷(100 mg·kg·d^(-1))或生理盐水,持续14 d。采用16S rRNA基因测序分析肠道菌群多样性及物种组成,结合京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析功能预测评估代谢通路变化。结果淫羊藿苷显著提高老年雌雄小鼠肠道菌群的α多样性(Chao1指数提升25%,P<0.05),并重塑菌群结构(β多样性PCoA分析显示老年组向年轻组趋近)。门水平上,老年小鼠拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度降低,厚壁菌门(Firmicutes)丰度升高(F/B比值回调至年轻水平);科水平上,阿克曼氏菌科(Akkermansiaceae)在雌性老年小鼠中显著富集(4.1倍)。KEGG预测显示,淫羊藿苷改善老年小鼠糖代谢与鞘脂代谢(雌性组鞘脂通路活性上调3.2倍)。结论淫羊藿苷通过调节肠道菌群多样性及代谢功能延缓衰老,且作用具有性别二态性,为中药抗衰老的性别差异化干预提供了理论依据。 展开更多
关键词 淫羊藿苷 性别差异 衰老 肠道菌群 16s rrna高通量测序
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不同16S rRNA引物在溺死组织气单胞菌检测中的性能评估 被引量：1
10
作者 宁浩冉 代昌海 +6 位作者 种法国 王建鑫 王雅萱 胡洋洋 王业全 张磊磊 张国安 《济宁医学院学报》 2025年第1期8-11,共4页
目的 分析16S rRNA V3区引物、V4区引物和V3-V4区引物检测溺死组织中气单胞菌的差异。方法 采用PCR-扩增子测序方法,评估3种16S rRNA引物在5例溺死者的11个脏器中检测细菌DNA的能力,特别是气单胞菌DNA的检测效果。结果 相比于其他2个引... 目的 分析16S rRNA V3区引物、V4区引物和V3-V4区引物检测溺死组织中气单胞菌的差异。方法 采用PCR-扩增子测序方法,评估3种16S rRNA引物在5例溺死者的11个脏器中检测细菌DNA的能力,特别是气单胞菌DNA的检测效果。结果 相比于其他2个引物,V3引物在检测细菌分类操作单元(Operational Taxonomic Unit, OTU)方面更具优势,检测到的细菌OTU数量更多。测序结果分析表明,V3引物能够检测更丰富的细菌门(Phylum)和科(Family),以及更多的气单胞菌。结论 16S rRNA V3引物在检测溺死脏器中的气单胞菌可能更具优势,对溺死诊断具有潜在应用价值。 展开更多
关键词 溺死 16S rrna测序 气单胞菌
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23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎大环内酯类耐药中的应用关联研究 被引量：3
11
作者 李文博 张帆 +1 位作者 程云 张子轩 《儿科药学杂志》 2025年第2期32-36,共5页
目的:探究23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎(MPP)大环内酯类药物耐药中的作用。方法:回顾性分析2022年10月至2023年11月于六安市人民医院住院治疗的104例肺炎支原体(MP)感染患儿,采集所有患儿的咽拭子样本,应用药敏试验检测常用抗... 目的:探究23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎(MPP)大环内酯类药物耐药中的作用。方法:回顾性分析2022年10月至2023年11月于六安市人民医院住院治疗的104例肺炎支原体(MP)感染患儿,采集所有患儿的咽拭子样本,应用药敏试验检测常用抗菌药物对MP的敏感性,观察并分析MPP患儿的耐药情况,根据药敏试验结果将患儿分为耐药组与非耐药组,同时采用实时荧光定量PCR法(RT-qPCR)检测MP-DNA载量,并对其与抗菌药物耐药性的关系进行分析,应用PCR基因测序对23S rRNAⅤ区2063位点基因进行检测,并对2063位点基因型与抗菌药物耐药性的关系进行分析,同时对23S rRNAⅤ区2063位点基因型与MP-DNA载量的关系进行对比分析。结果:检测结果显示,MP在大环内酯类抗菌药物中的耐药性较高,其中在红霉素与罗红霉素药物中的耐药性最高,分别为71.15%、73.08%,阿奇霉素、克拉霉素、乙酰螺旋霉素、克林霉素、耐药率分别为25.00%、34.62%、52.88%、55.77%,在喹诺酮类抗菌药物中的耐药性较低,分别为3.85%、2.88%、0.00%;阿奇霉素、红霉素、克拉霉素以及克林霉素耐药组患儿MP-DNA载量指数明显较该抗菌药物非耐药组患儿更低(P<0.05);通过分析得出,23S rRNA基因2063位点基因突变对大环内酯类抗菌药物耐药产生了显著影响,通过对大环内酯类抗菌药物耐药的病例分析得出,2063位点基因G型突变率>60%;突变型基因组患儿MP-DNA的载量指数较野生型基因组更低(P<0.05)。结论:大环内酯类抗菌药物在治疗MP感染患儿中表现出较高的耐药性,其中23S rRNAⅤ区2063基因位点突变与MP耐药具有密切关联,因此,MP 23S rRNA基因测序能够作为临床治疗MPP患儿时进行耐药检测的有效手段,并为其合理使用抗菌药物提供参考。 展开更多
关键词 23S rrna基因 儿童 肺炎支原体 大环内酯类 抗菌药物 耐药性
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鸭源大肠杆菌中16S rRNA甲基化酶rmtB基因的分布、耐药性及传播特性分析
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作者 孙凡 苏宇航 +8 位作者 董洪燕 吴植 谢军 周庆康 郭长明 封琦 王琦 朱善元 于圣青 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第10期76-83,共8页
通过对江苏省养殖场鸭源大肠杆菌氨基糖苷类抗生素的耐药基因携带以及耐药谱现状进行研究,旨在为鸭大肠杆菌病的防治、耐药菌株的快速监测和合理用药提供指导。选取2020—2024年分离自江苏部分地区水禽养殖场的60株鸭源大肠杆菌,PCR检... 通过对江苏省养殖场鸭源大肠杆菌氨基糖苷类抗生素的耐药基因携带以及耐药谱现状进行研究,旨在为鸭大肠杆菌病的防治、耐药菌株的快速监测和合理用药提供指导。选取2020—2024年分离自江苏部分地区水禽养殖场的60株鸭源大肠杆菌,PCR检测革兰阴性菌中介导高水平氨基糖苷类抗生素耐药的16S rRNA甲基化酶基因的流行情况,并进行药物敏感性试验;对16S rRNA甲基化酶阳性基因菌株进行接合试验和稳定性试验,研究其是否具有水平传播的能力。PCR鉴定结果显示,从泰州鸭的肝脏中分离的大肠杆菌TZ23YGE60携带rmtB基因(1/60,1.67%),其他16S rRNA甲基化酶基因未检测到;药物敏感性试验结果表明,分离菌株TZ23YGE60呈现严重的多重耐药性,耐药谱为氨苄西林-阿莫西林-甲氧苄氨嘧啶-头孢拉定-头孢噻吩-头孢曲松-庆大霉素-阿米卡星-链霉素-卡那霉素-四环素-磺胺异噁唑-复方新诺明-环丙沙星-诺氟沙星-利福平-洛美沙星-红霉素-克林霉素-新霉素-氯霉素-氟苯尼考;接合试验结果表明,受体菌接合频率为2.34×10^(-5)~1.58×10^(-1),37℃时接合效率最高;稳定性试验结果显示质粒稳定存在。综上,鸭源大肠杆菌TZ23YGE60具有水平传播的能力;16S rRNA甲基化酶耐药菌株的出现,严重影响了氨基糖苷类药物作为治疗革兰阴性菌的常用药物抗感染治疗的效果,限制了临床细菌感染治疗的药物选择,且江苏地区鸭场耐药现象严重,临床需要合理使用抗菌药物。 展开更多
关键词 鸭源 大肠杆菌 16S rrna甲基化酶基因 耐药性
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基于16S rRNA技术分析桔梗超微粉对小鼠肠道菌群多样性的影响
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作者 李芷珊 周照月 +2 位作者 刘天龙 王帅玉 江海洋 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第7期3372-3385,共14页
【目的】观察桔梗超微粉对小鼠肠道菌群多样性的影响,为桔梗超微粉的临床应用及其安全性提供依据。【方法】将24只雄性昆明小鼠随机分为对照组、桔梗超微粉高(3.0 g/kg)、中(1.5 g/kg)、低(0.3 g/kg)剂量组,每组6只。桔梗超微粉各剂量... 【目的】观察桔梗超微粉对小鼠肠道菌群多样性的影响,为桔梗超微粉的临床应用及其安全性提供依据。【方法】将24只雄性昆明小鼠随机分为对照组、桔梗超微粉高(3.0 g/kg)、中(1.5 g/kg)、低(0.3 g/kg)剂量组,每组6只。桔梗超微粉各剂量组小鼠灌胃相应剂量溶于水后的桔梗超微粉,对照组灌胃等体积纯化水,连续给药14 d,每日记录体重和耗料量。在试验第15天处死各组小鼠进行剖检及组织病理学观察,同时无菌取小鼠粪便,扩增粪便菌群16S rRNA基因的V3-V4区,采用高通量测序分析菌群Alpha和Beta多样性及门和属水平的物种组成并进行微生物功能预测分析。【结果】(1)桔梗超微粉中、高剂量组小鼠平均体增重均显著降低于对照组(P<0.05),桔梗超微粉中剂量组小鼠平均耗料量明显低于对照组。(2)与对照组相比,桔梗超微粉各剂量组小鼠胃、十二指肠、空肠和回肠组织均未见病理学异常。(3)桔梗超微粉各剂量组小鼠肠道菌群Alpha多样性指数均高于对照组(P>0.05),且随着桔梗超微粉使用剂量增多呈上升趋势。肠道菌群Beta多样性分析结果显示,与对照组相比,低、高剂量桔梗超微粉对小鼠肠道菌群结构影响不显著(P>0.05),中剂量桔梗超微粉可显著改变小鼠肠道菌群结构(P<0.05)。(4)与对照组相比,在门水平上,桔梗超微粉中剂量组小鼠肠道内厚壁菌门和蓝藻门丰度显著增加(P<0.05),拟杆菌门、变形菌门和浮霉菌门丰度显著下降(P<0.05);在属水平上,中剂量组小鼠肠道内普雷沃菌属、副拟杆菌属和rc4_4丰度显著增加(P<0.05),Kaistobacter属和假单胞菌属等丰度显著下降(P<0.05)。(5)微生物功能预测分析发现,桔梗超微粉中剂量组小鼠肠道微生物基因组功能均主要富集在氨基酸生物合成及辅因子、假体基团、电子载体与维生素生物合成和核苷酸生物合成等方面。与对照组相比,桔梗超微粉中剂量组存在11条显著下调的差异代谢通路,主要涉及有氟苯甲酸酯降解、多环芳烃降解和酵母减数分裂等。【结论】桔梗超微粉可增加小鼠肠道菌群多样性,其中1.5 g/kg桔梗超微粉可显著改变肠道菌群结构。本试验结果为桔梗超微粉临床使用的科学用量及安全性提供数据支持,同时为今后桔梗超微粉与肠道菌群相关的药效学研究提供了数据支持。 展开更多
关键词 桔梗超微粉 16S rrna 小鼠 肠道菌群 微生物多样性
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基于线粒体12S rRNA的南极鱼亚目鱼类物种鉴定研究
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作者 王晓谕 彭祖焜 +3 位作者 朱久阳 黄开 朱国平 王丛丛 《海洋渔业》 北大核心 2025年第4期543-555,共13页
南极鱼亚目鱼类种类繁多,且同科鱼类在外形特征上相似,为对其进行准确的物种鉴定,于2021-2023年在CCLAMR48.1亚区和48.2亚区收集了101尾南极鱼类,利用DNA条形码技术,从分子水平分析南极鱼亚目鱼类间的系统进化关系,并验证了12SrRNA基因... 南极鱼亚目鱼类种类繁多,且同科鱼类在外形特征上相似,为对其进行准确的物种鉴定,于2021-2023年在CCLAMR48.1亚区和48.2亚区收集了101尾南极鱼类,利用DNA条形码技术,从分子水平分析南极鱼亚目鱼类间的系统进化关系,并验证了12SrRNA基因作为DNA条形码对南极鱼亚目鱼类物种鉴定的适用性。结果表明,采集的101尾鱼类包括3科13属13种,13种南极鱼类的种间平均遗传距离为0.039 1,是种内平均遗传距离的11.7倍,符合作为DNA条形码的基本要求。NJ进化树拓扑结构显示,除了头带冰鱼(Chaenocephalus aceratus)和眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus),其余序列均能形成独立的单支,同科物种聚类在一支上,具有较高的节点支持率。综上所述,基于线粒体12SrRNA基因的DNA条形码能够对南极鱼亚目鱼类进行准确的物种鉴定,在科的水平上展现出清晰的系统进化关系。 展开更多
关键词 南极鱼亚目 12S rrna DNA条形码 物种鉴定
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16s rRNA测序技术检测复方地黄颗粒作用下肺炎链球菌诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的变化及其意义
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作者 张雨涵 孔令娟 +1 位作者 柳金英 郭建恩 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第6期1551-1560,共10页
目的:通过16s rRNA测序技术探讨复方地黄颗粒对肺炎链球菌(Spn)诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的影响,并阐明其潜在机制。方法:将30只大鼠随机分为对照组(正常大鼠)、模型组(Spn诱导肺炎大鼠模型)、低剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃1.7... 目的:通过16s rRNA测序技术探讨复方地黄颗粒对肺炎链球菌(Spn)诱导肺炎模型大鼠肠道菌群的影响,并阐明其潜在机制。方法:将30只大鼠随机分为对照组(正常大鼠)、模型组(Spn诱导肺炎大鼠模型)、低剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃1.75 g·kg^(-1)复方地黄颗粒)、中剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃3.50 g·kg^(-1)复方地黄颗粒)和高剂量复方地黄颗粒组(肺炎大鼠模型灌胃7.00 g·kg^(-1)复方地黄颗粒),每组6只。测定大鼠肺组织湿/干重(W/D)比值并分析血气指标,HE染色观察各组大鼠肺组织病理形态表现并评估肺组织损伤程度,试剂盒检测各组大鼠肺泡灌洗液(BALF)中细菌负荷水平和白细胞介素(IL)-6、IL-8及IL-10水平,进行16s rRNA肠道菌群测序分析。结果:与对照组比较,模型组大鼠动脉血二氧化碳分压(PaCO_(2))明显升高(P<0.05),动脉血氧分压(PaO_(2))和血氧饱和度(SaO_(2))明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠PaCO_(2)明显降低(P<0.05),PaO_(2)和SaO_(2)明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。HE染色,对照组大鼠肺组织未见明显损伤;模型组大鼠肺组织细胞排列紊乱,大量炎性细胞浸润,肺泡壁毛细血管明显扩张;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠肺组织形态损伤均有所改善。与对照组比较,模型组大鼠肺组织W/D比值和病理评分明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠肺组织W/D比值和病理评分明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠BALF中细菌负荷水平明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠BALF中细菌负荷水平明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠BALF中IL-6和IL-8水平明显升高(P<0.05),IL-10水平明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠BALF中IL-6和IL-8水平明显降低(P<0.05),IL-10水平明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠菌群丰度指标(Chao1)、菌群多样性和均匀性指标(Shannon)、菌群优势度指标(Simpson)及实际检测物种数指标(Observed_species)均明显降低(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Chao1、Shannon、Simpson和Observed_species均明显升高(P<0.05),并呈剂量依赖性。与对照组比较,模型组大鼠拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度降低,厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度升高,Firmicutes/Bacteroidetes比值明显升高(P<0.05);与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Bacteroidetes相对丰度升高,Firmicutes相对丰度降低,Firmicutes/Bacteroidetes比值明显降低(P<0.05),并呈剂量依赖性。在科水平上,与对照组比较,模型组大鼠棒状杆菌科(Corynebacteriaceae)、葡萄球菌科(Staphylococcaceae)和莫拉氏菌科(Moraxellaceae)相对丰度明显升高,而乳酸杆菌科(Lactobacillaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)和嗜黏蛋白阿克曼菌科(Akkermansiaceae)相对丰度明显降低;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Corynebacteriaceae、Staphylococcaceae和Moraxellaceae相对丰度明显降低,Lactobacillaceae、Lachnospiraceae和Akkermansiaceae相对丰度明显升高。在属水平上,与对照组比较,模型组大鼠脱硫弧菌属(Desulfovibrio)和费克蓝姆氏菌属(Facklamia)相对丰度明显升高,双歧杆菌(Bifidobacterium)和瘤胃球菌属(Ruminococcaceae)相对丰度明显降低;与模型组比较,低、中和高剂量复方地黄颗粒组大鼠Desulfovibrio和Facklamia相对丰度明显降低,Bifidobacterium和Ruminococcaceae相对丰度明显升高。结论:复方地黄颗粒可以改善Spn诱导的肺炎大鼠的炎症和肺损伤,这可能与肠道菌群丰度和多样性的增加有关。 展开更多
关键词 肺炎 16s rrna测序技术 复方地黄颗粒 肺炎链球菌 肠道菌群
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华南地区耳聋人群线粒体基因12S rRNA的突变频谱筛查
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作者 黄露莎 岑晓晴 +5 位作者 梁悦 王月莹 王娟 方淑斌 姜鸿彦 陈垲钿 《中华耳科学杂志》 北大核心 2025年第3期431-437,共7页
目的 研究华南地区耳聋人群线粒体12S rRNA基因在非综合征型耳聋和药物性耳聋中的突变谱特点,对发现的候选突变位点进行初步功能探讨。方法 选取2010年5月至2020年11月中山大学附属第一医院收治的来自广东、广西、海南、福建、江西等省... 目的 研究华南地区耳聋人群线粒体12S rRNA基因在非综合征型耳聋和药物性耳聋中的突变谱特点,对发现的候选突变位点进行初步功能探讨。方法 选取2010年5月至2020年11月中山大学附属第一医院收治的来自广东、广西、海南、福建、江西等省份的散发性或家族性听力障碍患者312例,另选取同期年龄匹配的听力正常者180例。对312例非综合征型耳聋和药物性耳聋患者进行病史、临床表型分析,采用Sanger测序对患者线粒体12S rRNA基因进行检测,采用焦磷酸测序方法对TRMU基因m.7445A>G,m.7444G>A和线粒体突变阈值进行定量。采用线粒体结构比较和系统发育分析方法对潜在的致病位点进行功能分析。结果 线粒体12S rRNA基因检测共发现28个突变,包括5种已知和可能的致病突变(m.827A>G、m.961insC、m.1005T>C、m.1027A>G和m.1555A>G)和1个新的替换突变m.1236C>T。可能的致病突变比例为5.77%(18/312)。未发现TRMU基因m.7445A>G和m.7444G>A突变。线粒体突变阈值对表型的修饰作用不明确。线粒体结构比较和系统发育分析支持m.1555A>G,m.827A>G和m.1005T>C为药物性耳聋的致病性突变,m.1027A>G,m.961insC和新发现的m.1236C>T可能与耳聋相关。此外,m.750A>G,m.1438A>G的致病性有待研究。结论 线粒体12S rRNA突变在非综合征型耳聋和药物性耳聋中突变率较高,m.1555A>G,m.827A>G和m.1005T>C为药物性耳聋的致病性突变可能性大。 展开更多
关键词 线粒体12S rrna GJB2 TRMU 非综合征型耳聋 药物性耳聋
暂未订购
基于16S rRNA基因测序和Source Tracker模型分析生驼乳安全风险关键点
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作者 薛宇飞 冀承昊 +1 位作者 何静 吉日木图 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第23期235-243,共9页
驼乳是人类各类营养元素摄入的良好来源之一,富含的营养价值更易被吸收利用,对人体健康、疾病预防及治疗具有重要作用。但由于驼乳受到不卫生的环境条件、生产过程不规范或处理方法不当等影响,极易遭受微生物的污染,这不仅威胁到驼乳产... 驼乳是人类各类营养元素摄入的良好来源之一,富含的营养价值更易被吸收利用,对人体健康、疾病预防及治疗具有重要作用。但由于驼乳受到不卫生的环境条件、生产过程不规范或处理方法不当等影响,极易遭受微生物的污染,这不仅威胁到驼乳产品的品质与安全,也成为了制约驼乳产业持续健康发展的关键因素之一。因此,该研究通过16S rRNA扩增子测序技术对挤奶瓶、乳头夹、储奶罐、乳头、饮用水、饲料、粪便和驼舍空气样品中微生物多样性比较分析。采用Source Tracker分析模型对3个牧场中的微生物风险关键点分析。研究表明,A驼场生乳中乳球菌和金黄杆菌在属水平上的相对丰度较高,占比分别为52.37%和15.76%;而在B驼场生乳在属水平上主要优势菌属为罗思氏菌,相对丰度占比高达83.64%;C驼场生乳微生物属占比较高的为罗思氏菌和不动杆菌,分别为64.85%和17.58%。利用Source Tracker模型对A、B和C三个驼场的挤奶瓶、乳头夹、储奶罐、乳头、饮用水、饲料、粪便和驼舍空气样品8个风险关键点进行分析,确定造成原料乳微生物污染的风险关键点为乳头、乳头夹、挤奶瓶和储奶罐。该研究结果可为生驼乳安全性的提高提供参考依据。 展开更多
关键词 生驼乳 微生物风险分析 关键点控制 16S rrna测序 Source Tracker模型
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基于16S rRNA基因测序探究ApoE基因敲除兔肠道微生物特征
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作者 黎桂玲 萨楚拉 +6 位作者 陈傍柱 刘月姝 刘科 谭巧燕 郑佳琳 朱叶萌 王刚 《广东农业科学》 2025年第7期72-83,共12页
【目的】探究ApoE基因敲除兔与新西兰兔的肠道微生物群落特征及其差异,揭示ApoE基因在调控肠道菌群方面的潜在作用。【方法】利用CRISPR/Cas9技术成功构建ApoE基因敲除兔,采用NovaSeq测序平台对ApoE基因敲除兔和新西兰兔的粪便进行16S r... 【目的】探究ApoE基因敲除兔与新西兰兔的肠道微生物群落特征及其差异,揭示ApoE基因在调控肠道菌群方面的潜在作用。【方法】利用CRISPR/Cas9技术成功构建ApoE基因敲除兔,采用NovaSeq测序平台对ApoE基因敲除兔和新西兰兔的粪便进行16S rRNA基因序列高通量测序。通过生物信息学方法对序列数据进行质量控制、ASV(扩增子序列变体)聚类、物种注释及多样性分析等,系统评估其肠道微生物的多样性、群落结构和功能调控的差异。【结果】在正常饮食条件下,ApoE基因敲除兔血清中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)含量均高于新西兰兔,其中TC、LDL-C差异极显著(P<0.01),符合高脂血症的特征。与新西兰兔相比,ApoE基因敲除兔的肠道微生物ASV丰度显著提高(P<0.01);在α多样性比较中,Observed_species、Chao1、Shannon、Simpson、PD_whole_tree指数显著性增加(P<0.05),物种丰富度和多样性增加;β多样性比较中,主成分、主坐标分析分别出现28.84%、38.20%的差异,肠道微生物群落结构发生明显变化。ApoE基因敲除兔的厚壁菌门/拟杆菌门比值(F/B)显著升高(P<0.05),肠道中产脂多糖(LPS)细菌和损伤黏膜细菌(如阿克曼菌、另枝菌属、梭状芽孢杆菌等)丰度增加。同时,在基础转录因子调控、药物代谢及Atrazine降解相关通路的丰度表现出显著性差异(P<0.05)。【结论】ApoE基因敲除兔的肠道微生物多样性及代谢通路发生改变,表明ApoE基因影响兔肠道微生物生态和代谢功能,在调控肠道微生态平衡中发挥重要作用。 展开更多
关键词 兔 高脂血症 APOE基因敲除 CRISPR/Cas9 16S rrna 肠道微生物
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基于16S rRNA高通量测序技术分析西杂牛瘤胃微生物多样性和功能预测的研究
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作者 曲磊 关诗宇 +3 位作者 谷兴亮 谷月 赵玉民 秦立红 《饲料工业》 北大核心 2025年第23期89-95,共7页
试验旨在探究西杂牛(西门塔尔牛×本地黄牛)瘤胃内微生物多样性及其功能。利用16S rRNA高通量测序技术分析西杂牛瘤胃液样品菌群结构并用PICRUSt2进行功能预测。结果表明:通过Illumina NovaSeq测序平台共获得平均原始序列数量为7049... 试验旨在探究西杂牛(西门塔尔牛×本地黄牛)瘤胃内微生物多样性及其功能。利用16S rRNA高通量测序技术分析西杂牛瘤胃液样品菌群结构并用PICRUSt2进行功能预测。结果表明:通过Illumina NovaSeq测序平台共获得平均原始序列数量为70492条,平均有效序列数量为59428条,平均优质序列数量为58383条,平均序列长度为420 bp,覆盖度均在99.71%以上,经Alpha多样性得到Simpson、Shannon、Chao1、Observed species和Pielou’s evenness(Pielou_e)指数,分别为0.99、9.96、3241.80、3220.65和0.86;经分类学鉴定分析,西杂牛瘤胃微生物优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidota,57.89%)和厚壁菌门(Firmicutes,33.07%),优势菌目为拟杆菌目(Bacteroidales,57.58%),优势菌属为普雷沃氏菌属(Prevotella,24.15%);在功能预测分析中,与KEGG数据库对比,西杂牛瘤胃菌群主要集中在新陈代谢一级水平代谢通路;与COG数据库对比,功能类别主要集中在翻译,核糖体结构和生物转化、氨基酸转运和代谢、细胞壁/膜/被膜生物合成、一般功能预测、碳水化合物运输和代谢。 展开更多
关键词 西杂牛 瘤胃微生物 16S rrna 功能预测 优势菌
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基于16S rRNA高通量测序的伪无菌肥胖小鼠模型肠道菌群动态特征构建与验证
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作者 贺语希 刘若楠 +4 位作者 龚凯 胡拉来·依玛那力 李莉 马依拉·买买提 赵效国 《新疆医科大学学报》 2025年第8期1067-1074,1084,共9页
目的 采用抗生素鸡尾酒法对肥胖小鼠连续灌胃7 d,评估构建伪无菌肥胖小鼠模型的可行性。方法 将60只健康雄性C57BL/6小鼠随机分为对照组(n=10)与造模组(n=50),利用高脂饮食诱导造模组形成肥胖小鼠模型。从肥胖小鼠模型中随机选取10只肥... 目的 采用抗生素鸡尾酒法对肥胖小鼠连续灌胃7 d,评估构建伪无菌肥胖小鼠模型的可行性。方法 将60只健康雄性C57BL/6小鼠随机分为对照组(n=10)与造模组(n=50),利用高脂饮食诱导造模组形成肥胖小鼠模型。从肥胖小鼠模型中随机选取10只肥胖小鼠纳入抗生素组,其余肥胖小鼠剔除。抗生素组采用生理盐水配制成含20 mg/mL氨苄西林、20 mg/mL甲硝唑、20 mg/mL新霉素和10 mg/mL万古霉素的混悬液,对照组使用生理盐水,按0.1 mL/10 g体积灌胃。收集干预前后小鼠粪菌进行16S rRNA测序。结果 高脂饮食成功诱导小鼠肥胖,11周末造模组体重较对照组增加20%以上(P<0.05)。抗生素干预对小鼠摄食饮水无明显影响(P>0.05),但使肝脏脏器系数增加(P<0.05)。16S rRNA测序结果显示,抗生素组Shannon多样性指数较干预前降低(P<0.001),而对照组无明显变化(P=0.148)。主坐标分析显示抗生素组菌群结构呈离散趋势,与对照组紧密聚集形成鲜明对比。差异分析发现,抗生素干预前主要优势菌群为毛螺菌科和拟杆菌属,干预后转变为肠杆菌科和支原体科。结论 抗生素鸡尾酒法可有效清除肥胖小鼠肠道内的大部分肠道菌群,能够构建伪无菌肥胖小鼠模型。 展开更多
关键词 肥胖 伪无菌小鼠 抗生素鸡尾酒法 16S rrna
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