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大熊猫核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)cDNA的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 孙冰 侯怡铃 +5 位作者 李俊 苏秀兰 吴光富 宋嫣 张田 侯万儒 《四川动物》 CSCD 北大核心 2010年第5期613-617,共5页
RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,由RPS11基因所编码,属于核糖体蛋白S17p家族,主要存在于真核生物中。为了解大熊猫核糖体蛋白亚基RPS11基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS11基因的异同,本研究根据已报... RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,由RPS11基因所编码,属于核糖体蛋白S17p家族,主要存在于真核生物中。为了解大熊猫核糖体蛋白亚基RPS11基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS11基因的异同,本研究根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基RPS11基因,并进行了测序和序列分析。结果表明:大熊猫RPS11亚基基因的开放阅读框(ORF)长为477bp,编码158个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子量为18.4275kDa,pI为10.96。拓扑预测显示该蛋白含有14个功能位点:即2个N-糖基化位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个核糖体蛋白S17 signature位点。进一步分析发现,大熊猫RPS11基因与已报道的部分哺乳动物的表达序列及其编码的氨基酸序列都具有很高的相似性。本研究结果为丰富和完善哺乳动物RPS11基因资源库提供了基础资料。 展开更多
关键词 大熊猫 RT-PCR rps11 克隆 序列分析
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绵羊肺炎支原体核糖体蛋白30S RPS11基因的克隆、表达及重组蛋白免疫原性研究 被引量:2
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作者 田路路 孟庆玲 +2 位作者 乔军 才学鹏 陈创夫 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第5期64-69,共6页
本研究以绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,MO)新疆流行株基因组DNA为模板,通过PCR扩增30S RPS11基因,对其进行分子特征性分析,并将其抗原表位集中区进行原核表达,分析重组蛋白免疫原性。结果表明,30S RPS11基因全长405bp,编码... 本研究以绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,MO)新疆流行株基因组DNA为模板,通过PCR扩增30S RPS11基因,对其进行分子特征性分析,并将其抗原表位集中区进行原核表达,分析重组蛋白免疫原性。结果表明,30S RPS11基因全长405bp,编码134个氨基酸,该蛋白是一种受磷酸化调控的蛋白,含有一个核糖体蛋白S11信号。SDSPAGE结果显示,筛选的抗原表位集中区重组蛋白分子质量为29kDa;Western blot分析显示,该重组蛋白可被MO阳性血清特异性识别,说明其具有良好的反应原性;小鼠免疫试验表明,重组蛋白诱导机体产生的间接血凝抗体效价可达1∶32~1∶64,表明其具有较强的免疫原性。本试验首次证实MO核糖体蛋白(30SRPS11)具有良好的免疫原性和反应原性,为MO血清学诊断及亚单位疫苗研发提供了科学依据。 展开更多
关键词 MO 30Srps11 克隆 原核表达 免疫原性 反应原性
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人核糖体40S亚基RPS11蛋白的原核表达和纯化 被引量:1
3
作者 傅艳琨 郭亮 +1 位作者 华修国 崔立 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2014年第2期31-35,共5页
RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,属于核糖体蛋白S17p家族,由RPS11基因所编码,主要存在于真核生物中。本研究通过PCR扩增RPS11基因,构建pET43a-RPS11和pGEX-4T-1-RPS11原核表达载体。将重组质粒转入E.coli DH5α,序列测定正确后,将其... RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,属于核糖体蛋白S17p家族,由RPS11基因所编码,主要存在于真核生物中。本研究通过PCR扩增RPS11基因,构建pET43a-RPS11和pGEX-4T-1-RPS11原核表达载体。将重组质粒转入E.coli DH5α,序列测定正确后,将其转入E.coli BL21(DE3),加入IPTG诱导表达。表达蛋白经SDS-PAGE分析后,利用亲和层析法纯化蛋白。结果成功克隆RPS11基因,构建了原核表达载体pET43a-RPS11和pGEX-4T-1-RPS11,转化宿主菌E.coli BL21(DE3)中进行了表达。SDS-PAGE分析证实表达目的蛋白正确。通过Ni-TNA和GSH-Sepharose层析柱获得纯化蛋白,为进一步研究该蛋白的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 人核糖体蛋白 rps11 原核表达 蛋白纯化
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羊传染性胸膜肺炎支原体RPS11基因的原核表达及间接ELISA检测方法的建立 被引量:5
4
作者 王璇 吴玙彤 +3 位作者 潘淑惠 黄波 高明琴 文正常 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第1期39-44,共6页
本研究以贵州羊传染性胸膜肺炎支原体分离株(GM01株)基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增目的基因RPS11,并克隆到pET28a(+)载体,成功构建了重组质粒pET28a-RPS11,将其转化至大肠杆菌Rosetta感受态细胞中诱导表达重组RPS11蛋白并建立了羊传... 本研究以贵州羊传染性胸膜肺炎支原体分离株(GM01株)基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增目的基因RPS11,并克隆到pET28a(+)载体,成功构建了重组质粒pET28a-RPS11,将其转化至大肠杆菌Rosetta感受态细胞中诱导表达重组RPS11蛋白并建立了羊传染性胸膜肺炎间接ELISA检测方法。SDS-PAGE分析表明,重组蛋白分子量为19 kDa,纯度为85%,具有良好的抗原性及特异性;检测方法经条件优化,确定了抗原包被浓度为1μg/mL,血清稀释度为1∶400,酶标二抗工作浓度为1∶4000,底物显色时间为10min。用建立的间接ELISA检测方法与羊传染性胸膜肺炎间接血凝检测试剂分别对临床180份血清进行检测,阳性率分别为35.0%和29.44%,总符合率达91.11%。本研究成功完成了RPS11蛋白的重组表达,制备出特异性较好的抗体,建立的间接ELISA检测方法为羊传染性胸膜肺炎的血清学检测诊断及流行病学调查提供了有效的技术手段。 展开更多
关键词 羊传染性胸膜肺炎 rps11 原核表达 间接ELISA
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RP11-Derived Long Non-Coding RNAs in Hepatocellular Carcinoma:Hidden Treasures in Plain Sight
5
作者 Se Ha Jang Hyung Seok Kim Jung Woo Eun 《Oncology Research》 2026年第1期89-104,共16页
Hepatocellular carcinoma(HCC)remains one of the most prevalent and lethal malignancies worldwide.Long non-coding RNAs(lncRNAs)have emerged as crucial regulators of gene expression and cancer progression,yet the functi... Hepatocellular carcinoma(HCC)remains one of the most prevalent and lethal malignancies worldwide.Long non-coding RNAs(lncRNAs)have emerged as crucial regulators of gene expression and cancer progression,yet the functional diversity of RP11-derived lncRNAs—originally mapped to bacterial artificial chromosome(BAC)clones from the Roswell Park Cancer Institute—has only recently begun to be appreciated.This mini-review aims to systematically synthesize current findings on RP11-derived lncRNAs in HCC,outlining their genomic origins,molecular mechanisms,and biological significance.We highlight their roles in metabolic reprogramming,microRNA network modulation,and tumor progression,as well as their diagnostic and prognostic value in tissue and serum-based analyses.Finally,we discuss therapeutic opportunities and propose future directions to translate RP11-derived lncRNAs into clinically actionable biomarkers and targets for precision liver cancer therapy. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma long non-coding RNA RP11-derived lncRNA BIOMARKER therapeutic target
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LncRNA RP11-499E18.1对卵巢癌细胞恶性生物学行为的影响 被引量:1
6
作者 李瑛花 杨娟 《中南大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期1-10,共10页
目的:卵巢癌是常见的妇科恶性肿瘤,晚期患者的预后较差。本研究筛选卵巢癌预后相关的差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNA),并探究其对卵巢癌细胞恶性生物学行为的影响。方法:从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO... 目的:卵巢癌是常见的妇科恶性肿瘤,晚期患者的预后较差。本研究筛选卵巢癌预后相关的差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNA),并探究其对卵巢癌细胞恶性生物学行为的影响。方法:从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中获取卵巢癌相关lncRNAs数据集,并采用lncRNA测序结合GEO数据库中相关临床信息筛选潜在的肿瘤抑制lncRNA。采用反转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)检测lncRNA RP11-499E18.1在卵巢组织及相应的癌旁组织、卵巢正常上皮细胞系IOSE80及卵巢癌细胞系中的表达情况;采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术检测lncRNA RP11-499E18.1在卵巢癌细胞中的定位。将卵巢癌细胞系CaOV3和SKOV3分为3组:阴性对照(negative control,NC)组、敲减(si-RP11-499E18.1)组和过表达(pcDNA-RP11-499E18.1)组。采用四甲基偶氮唑盐(methyl thiazolyl tetrazolium,MTT)实验和Transwell实验分别检测lncRNA RP11-499E18.1对卵巢癌细胞增殖和迁移的影响;采用蛋白质印迹法检测lncRNA RP11-499E18.1对卵巢癌细胞上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关分子表达的影响。将BALB/c裸鼠小鼠分为实验组(注射转染pcDNA-RP11-499E18.1的CaOV3细胞)和对照组(注射转染空载体pcDNA的CaOV3细胞)。采用免疫组织化学法检测实验组和对照组卵巢癌组织中Caspase 3和Ki67的表达情况。结果:LncRNA测序结果显示lncRNA RP11-499E18.1为与卵巢癌预后相关的差异表达lncRNA。对GEO数据库中相关临床数据进行分析,结果显示:与lncRNA RP11-499E18.1高表达的卵巢癌患者相比,lncRNA RP11-499E18.1低表达的卵巢癌患者的总生存期、无进展生存期更短(均P<0.05)。LncRNA RP11-499E18.1为潜在的肿瘤抑制lncRNA。LncRNA RP11-499E18.1在卵巢癌组织的表达明显低于癌旁组织(P<0.001),在卵巢癌细胞系CaOV3、OVCAR3、SKOV3、A2780中的表达显著低于IOSE80(均P<0.001),且lncRNA RP11-499E18.1在细胞核和细胞质中并存。在CaOV3和SKOV3细胞中,si-RP11-499E18.1组的细胞增殖率均显著高于NC组(均P<0.05),pcDNA-RP11-499E18.1组的细胞增殖率均显著低于NC组(均P<0.001);si-RP11-499E18.1组迁移的细胞多于NC组,pcDNA-RP11-499E18.1组迁移的细胞少于NC组;与NC组相比,pcDNARP11-499E18.1组细胞中EMT相关分子E-cadherin的蛋白质表达水平升高、vimentin表达降低,而si-RP11-499E18.1组E-cadherin表达降低、vimentin表达升高。实验组荷瘤小鼠的成瘤体积显著小于对照组(P<0.001)。实验组肿瘤组织中的细胞凋亡相关分子Caspase 3表达显著升高(P<0.05),细胞增殖相关分子Ki67表达显著降低(P<0.05)。结论:LncRNA RP11-499E18.1可抑制卵巢癌细胞增殖、迁移和EMT,且其低表达和卵巢癌不良预后相关。 展开更多
关键词 卵巢癌 长链非编码RNA RP11-499E18.1 上皮-间充质转化 恶性生物学行为
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LncRNARP11-89在肾癌组织中的表达及其对肾癌细胞恶性生物学行为的调控机制
7
作者 叶志华 王小英 +1 位作者 雷晓琴 付金伦 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2025年第5期320-325,共6页
目的探讨lncRNA RP11-89在肾癌组织中的表达及对肾癌细胞增殖和迁移的作用机制。方法使用Lnc2Cancer v2.0数据库分析RP11-89在肾癌组织中的表达水平。实时定量荧光聚合酶链反应(qRT-PCR)检测RP11-89在肾癌细胞株786-P、ACHN、OS-RC-2、A... 目的探讨lncRNA RP11-89在肾癌组织中的表达及对肾癌细胞增殖和迁移的作用机制。方法使用Lnc2Cancer v2.0数据库分析RP11-89在肾癌组织中的表达水平。实时定量荧光聚合酶链反应(qRT-PCR)检测RP11-89在肾癌细胞株786-P、ACHN、OS-RC-2、A498中的表达水平。向肾癌A498细胞中转染RP11-89小干扰RNA(si-RP11-89组)或阴性对照NC siRNA(siNC组)。采用CCK-8法和细胞划痕实验检测沉默RP11-89对A498细胞增殖和迁移的影响。Western blot检测沉默RP11-89对G3BP1蛋白、细胞迁移蛋白(FOXC2、TGF-β)和细胞增殖蛋白(CDK3、cyclin C)表达的调节作用。双荧光素酶报告实验检测RP11-89与miR-589-5p的靶向结合。qRT-PCR检测沉默RP11-89对miR-589-5p表达的影响。Lnc2Cancer v2.0数据库分析RP11-89与miR-589-5p在肾癌组织中表达的相关性。结果与癌旁组织相比,肾癌组织中RP11-89呈高表达(P<0.01)。与人肾小管上皮HK-2细胞相比,肾癌786-P、ACHN、OS-RC-2、A498细胞中RP11-89均呈高表达(均P<0.01)。与si-NC组相比,si-RP11-89组A498细胞中RP11-89表达降低(P<0.01),沉默RP11-89可抑制A498细胞增殖能力(P<0.05),si-RP11-89组A498细胞迁移率降低(P<0.01);si-RP11-89组A498细胞中G3BP1、FOXC2、TGF-β、CDK3、cyclin C蛋白表达均降低,RP11-89能够靶向吸附miR-589-5p(P<0.01);si-RP11-89组A498细胞中miR-589-5p表达升高(P<0.01)。RP11-89与miR-589-5p在肾癌组织中的表达呈负相关(P<0.01)。结论RP11-89在肾癌中高表达,RP11-89通过调控miR-589-5p/G3BP1轴影响肾癌细胞的增殖和迁移能力。 展开更多
关键词 肾癌 RP11-89 miR-589-5p 细胞增殖 细胞迁移
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RP11-131N11.4在乳腺癌中的表达及对乳腺癌细胞恶性行为的作用机制
8
作者 黄建棋 郭文利 +1 位作者 陆建菊 陆凯 《中国药物与临床》 2025年第14期890-894,I0001,共6页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)RP11-131N11.4在乳腺癌中的表达及其调控miR-500a-5p对乳腺癌细胞恶性行为的作用机制。方法采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析RP11-131N11.4在乳腺癌组织中的表达以及RP11-131N11.4表达与乳腺癌患者总... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)RP11-131N11.4在乳腺癌中的表达及其调控miR-500a-5p对乳腺癌细胞恶性行为的作用机制。方法采用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析RP11-131N11.4在乳腺癌组织中的表达以及RP11-131N11.4表达与乳腺癌患者总生存率和无病生存率的关系。采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测RP11-131N11.4在乳腺癌细胞系(MCF-7、SKBR3、MDA-MB-231、MB-MDA-468、T-47D)和正常乳腺细胞MCF-10A中的表达。将MCF-7细胞分为NC组(转染pcDNA-NC质粒)和RP11-131N11.4组(转染pcDNA-RP11-131N11.4质粒)。qRT-PCR检测2组细胞中RP11-131N11.4表达。采用细胞计数盒(cell counting kit-8,CCK-8)和Transwell实验检测各组细胞增殖和侵袭能力。采用双荧光素酶实验验证RP11-131N11.4与miR-500a-5p的靶向结合。qRT-PCR检测2组细胞中miR-500a-5p表达。蛋白质免疫印迹试验检测2组细胞中泛素特异性肽酶(USP28)/Snail1信号通路蛋白的表达。结果与正常乳腺组织相比,乳腺癌组织RP11-131N11.4表达下降(P<0.01)。RP11-131N11.4表达较高的乳腺癌患者总生存率和无病生存率均高于RP11-131N11.4表达较低的乳腺癌患者(P均<0.01)。与MCF-10A细胞相比,乳腺癌细胞系中RP11-131N11.4表达均下降(P均<0.05),MCF-7细胞中RP11-131N11.4表达最低(P<0.01)。NC组和RP11-131N11.4组MCF-7细胞中RP11-131N11.4表达分别为(1.03±0.28)和(9.30±1.14),RP11-131N11.4组高于NC组(P<0.01)。与NC组相比,RP11-131N11.4组MCF-7细胞增殖能力降低(P<0.05)。NC组和RP11-131N11.4组细胞侵袭数目分别为(68±5)个和(30±5)个,RP11-131N11.4组侵袭细胞数目低于NC组(P<0.01)。与miR-NC相比,miR-500a-5p与野生型RP11-131N11.4共转染的细胞荧光素酶相对活性更低(P<0.01)。RP11-131N11.4组miR-500a-5p表达低于NC组(P<0.01)。与NC组相比,RP11-131N11.4组MCF-7细胞中USP28/Snail1信号通路蛋白USP28、Snail1、Vimentin、Fibronectin表达均下降(均P<0.01)。结论RP11-131N11.4在乳腺癌中低表达,上调RP11-131N11.4通过调节miR-500a-5p表达,抑制乳腺癌细胞的增殖和侵袭。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 RP11-131N11.4 miR-500a-5p 细胞增殖 细胞侵袭
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RP11-757G1.5对胃癌细胞生物学行为及顺铂敏感性的影响
9
作者 商颖 赵荣坤 +3 位作者 尹乐 孙佳兴 徐飞 苗丽丽 《临床肿瘤学杂志》 2025年第10期950-955,共6页
目的探讨长链非编码RNA RP11-757G1.5对胃癌细胞生物学行为及顺铂敏感性的影响。方法实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测胃上皮细胞GES-1和人胃癌细胞(MKN-45、NCI-N87、AGS和HGC-27)的RP11-757G1.5水平;设计并合成两条针对RP11-757G1.5的小... 目的探讨长链非编码RNA RP11-757G1.5对胃癌细胞生物学行为及顺铂敏感性的影响。方法实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测胃上皮细胞GES-1和人胃癌细胞(MKN-45、NCI-N87、AGS和HGC-27)的RP11-757G1.5水平;设计并合成两条针对RP11-757G1.5的小干扰RNA(si RNA)序列(si-757G1.5#1与si-757G1.5#2)及阴性对照序列(si-NC),将其分别转染至MKN-45和HGC-27细胞,设立Control组、si-NC组及两个干扰组(si-757G1.5#1和si-757G1.5#2)。为探究RP11-757G1.5对细胞生物学行为及药物敏感性的影响,分别采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法检测细胞活力与顺铂的半数抑制浓度(IC_(50))、划痕实验评估细胞迁移能力、Transwell实验分析细胞侵袭能力,并通过蛋白质印迹(Western blot)检测基质金属蛋白酶2和9(MMP-2和MMP-9)的蛋白表达水平。结果RT-q PCR检测结果显示,与正常胃上皮细胞GES-1相比,RP11-757G1.5在多种胃癌细胞系中表达均显著上调(P<0.05)。选取其中表达水平最高的MKN-45和HGC-27细胞用于后续功能研究。在成功构建RP11-757G1.5敲低模型的基础上,CCK-8实验显示,与Control组和si-NC组相比,两个干扰组(si-757G1.5#1和si-757G1.5#2)的细胞增殖活力显著下降(P<0.05);同时,基于CCK-8法的药物敏感性检测表明,干扰组对顺铂的化疗敏感性明显增强,IC_(50)值降低约2.3~2.7倍(P<0.05)。此外,划痕实验与Transwell实验结果显示,干扰组的细胞迁移与侵袭能力亦受到显著抑制,具体表现为划痕愈合率与穿膜细胞数均明显减少(P<0.05)。在机制层面,Western blot检测发现干扰组中MMP-2和MMP-9的蛋白表达水平均显著下调(P<0.05)。结论RP11-757G1.5在胃癌中高表达,并通过调控MMP-2/9表达来促进肿瘤细胞的恶性表型,同时影响化疗敏感性,提示其可能成为胃癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码RNA RP11-757G1.5 细胞生物学行为 顺铂敏感性
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LncRNA RP11-259P1.1在小细胞肺癌组织中的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 李晓华 代斌 +2 位作者 周婷 周菁 肖贞良 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1042-1047,共6页
目的:探讨长链非编码RNA RP11-259P1.1(lncRNA RP11-259P1.1)在小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者组织中的表达与患者临床病理特征的关系及其在化疗耐药中的作用。方法:收集2012年1月至2016年12月在成都市第六人民医院和成... 目的:探讨长链非编码RNA RP11-259P1.1(lncRNA RP11-259P1.1)在小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者组织中的表达与患者临床病理特征的关系及其在化疗耐药中的作用。方法:收集2012年1月至2016年12月在成都市第六人民医院和成都军区总医院158例行支气管镜活检、穿刺活检和手术切除的SCLC患者的癌组织、42例SCLC患者手术切除的癌旁组织标本及40例正常肺组织,采用qPCR法检测癌及癌旁组织标本中lncRNA RP11-259P1.1的表达,χ2检验分析lncRNA RP11-259P1.1表达与SCLC患者临床病理特征及化疗耐药的关系。单因素及多因素Cox回归分析lncRNA RP11-259P1.1表达与SCLC患者预后的关系。结果:lncRNA RP11-259P1.1在SCLC组织中的表达水平显著高于癌旁组织及正常肺组织(均P<0.01)。化疗敏感者癌组织中lncRNA RP11-259P1.1的表达水平明显低于化疗耐药者(P<0.05)。lncRNA RP11-259P1.1表达与SCLC患者的性别、年龄无关,与肿瘤分期、转移及化疗敏感性显著相关(均P<0.05);高表达lncRNA RP11-259P1.1患者的PFS及OS均显著短于低表达患者[(12.25±1.83)vs(22.29±1.58)个月和(23.55±1.35)vs(31.75±2.43)个月,均P<0.01]。lncRNA RP11-259P1.1表达、肿瘤分期及远处转移是SCLC患者独立的预后因素(均P<0.05)。结论:lncRNA RP11-259P1.1在SCLC组织中高表达,与SCLC患者的化疗敏感性及预后相关,可能是SCLC患者潜在的预后评估的生物标志物。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 长链非编码RNA RP11-259P1.1 化疗耐药 预后
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lncRNA RP11-86H7.1在川崎病诊断中的临床意义 被引量:4
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作者 潘璐璐 卢孔场 +2 位作者 褚茂平 曾静静 荣星 《温州医科大学学报》 CAS 2020年第8期628-631,636,共5页
目的:探讨lncRNA RP11-86H7.1在川崎病(KD)患者血清中的表达及其与临床病理特征及预后的关系。方法:筛选KD特异相关的循环lncRNA,分KD治疗前患儿组、KD治疗后患儿组、普通发热患儿组及健康儿童组,采用qPCR检测各组血清lncRNA RP11-86H7.... 目的:探讨lncRNA RP11-86H7.1在川崎病(KD)患者血清中的表达及其与临床病理特征及预后的关系。方法:筛选KD特异相关的循环lncRNA,分KD治疗前患儿组、KD治疗后患儿组、普通发热患儿组及健康儿童组,采用qPCR检测各组血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达。分析血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达与KD临床病理特征间关系;绘制ROC曲线,分析血清lncRNA RP11-86H7.1表达水平对KD的诊断效能。结果:KD急性患儿组血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达量高于各对照组(P<0.05);年龄和性别比例与低表达组比较差异无统计学意义(P>0.05);qPCR发现lncRNA RP11-86H7.1在KD急性期患儿血清中表达水平明显高于KD恢复期、健康儿童及发热儿童组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:血清lncRNA RP11-86H7.1在KD患者中表达上调,其可作为KD早期诊断和评估预后的潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 川崎病 lncRNA RP11-86H7.1 诊断
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长链非编码RNA RP11-110G21.1在结肠癌中的表达及其机制研究 被引量:6
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作者 曹晖 张申 +1 位作者 刘琦 顾越雷 《疑难病杂志》 CAS 2019年第12期1236-1240,1309,共5页
目的分析结肠癌组织与癌旁组织中长链非编码RNA RP11-110G21.1(lncRNA RP11-110G21.1)差异表达及其作用机制。方法收集2011年8月-2015年12月上海市松江区中心医院消化外科诊治结肠癌患者120例临床资料,采用qRT-PCR法检测结肠癌及其癌旁... 目的分析结肠癌组织与癌旁组织中长链非编码RNA RP11-110G21.1(lncRNA RP11-110G21.1)差异表达及其作用机制。方法收集2011年8月-2015年12月上海市松江区中心医院消化外科诊治结肠癌患者120例临床资料,采用qRT-PCR法检测结肠癌及其癌旁组织中lncRNA RP11-110G21.1表达水平,观察lncRNA RP11-110G21.1表达与临床病理特征的关系,分析lncRNA RP11-110G21.1表达对患者预后的影响。采用脂质体Lipofectamin 2000介导的方法将lncRNA RP11-110G21.1 inhibitor转染结肠癌细胞系LoVo,通过CCK-8法检测下调lncRNA RP11-110G21.1表达对LoVo细胞增殖能力的影响,Transwell小室法检测下调lncRNA RP11-110G21.1表达对LoVo细胞迁移、侵袭能力的影响。通过Logistic回归分析影响结肠癌预后危险因素。结果与癌旁组织组比较,结肠癌组lncRNA RP11-110G21.1表达水平显著升高(t=27.868,P=0.000);LoVo细胞转染lncRNA RP11-110G21.1 inhibitor后,细胞增殖、迁移、侵袭能力降低(F=85.177,491.168,372.789,P<0.01);lnc RNA RP11-110G21.1在分化程度低、TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期患者中表达量高于分化程度中高、TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期患者(χ^2/P=4.360/0.035、26.407/0.000);Kaplan-Meier结果显示lncRNA RP11-110G21.1高表达亚组3年内存活率低于低表达亚组(27.6%vs.61.4%,χ^2=13.212,P=0.000);多因素Logistic回归分析显示,TNM分期高、分化程度低、lncRNA RP11-110G21.1高表达是影响结肠癌患者不良预后的危险因素(OR=2.726,2.492,1.576,P均<0.01)。结论结肠癌组织中lncRNA RP11-110G21.1高表达,与患者分化程度、TNM分期及预后有关,降低lncRNA RP11-110G21.1表达可抑制结肠癌增殖、侵袭、迁移能力。 展开更多
关键词 长链非编码RNA RP11-110G21.1 结肠癌 增殖 侵袭 迁移 预后
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长链非编码RNA RP11-191L9.4促进前列腺癌PC-3细胞的迁移和侵袭 被引量:2
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作者 王京 黄烨清 +1 位作者 许斌 陈明 《东南大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2016年第3期305-310,共6页
目的:探讨长链非编码RNA RP11-191L9.4对前列腺癌PC-3细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法:荧光定量PCR检测RP11-191L9.4 siRNA在PC-3细胞中的敲除效率;通过MTT实验和克隆形成实验观察在PC-3细胞中低表达RP11-191L9.4对其增殖的影响;... 目的:探讨长链非编码RNA RP11-191L9.4对前列腺癌PC-3细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法:荧光定量PCR检测RP11-191L9.4 siRNA在PC-3细胞中的敲除效率;通过MTT实验和克隆形成实验观察在PC-3细胞中低表达RP11-191L9.4对其增殖的影响;通过transwell细胞迁移实验检测敲低RP11-191L9.4的表达对PC-3细胞的迁移能力影响;通过Matrigel侵袭实验检测敲低RP11-191L9.4的表达对PC-3细胞侵袭能力的影响。结果:向前列腺癌细胞系PC-3中转染RP11-191L9.4 siRNA 48 h后,q PCR检测PC-3细胞中RP11-191L9.4明显低表达;MTT及克隆形成实验结果显示,敲低RP11-191L9.4的表达能显著抑制PC-3细胞的增殖;transwell迁移实验结果显示,敲低RP11-191L9.4的表达能减弱PC-3细胞的迁移能力;Matrigel胶细胞侵袭实验结果显示,敲低RP11-191L9.4的表达能减弱PC-3细胞的侵袭能力。结论:转染RP11-191L9.4 siRNA能显著抑制PC-3细胞中RP11-191L9.4的表达,而敲低RP11-191L9.4的表达可显著抑制前列腺癌细胞PC-3增殖、迁移及侵袭能力。 展开更多
关键词 lncRNA RP11-191L9.4 前列腺癌 细胞增殖 细胞迁移 肿瘤侵袭
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长链非编码RNA RP11-367F23.2在脂多糖诱导炎症反应中的表达 被引量:2
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作者 张轩 王淏 +1 位作者 罗燕芬 李有强 《热带医学杂志》 CAS 2018年第7期842-845,共4页
目的研究长链非编码RNA RP11-367F23.2是否与脂多糖(LPS)诱导的炎症反应相关,揭示RP11-367F23.2在炎症应答反应中的作用。方法采用密度梯度离心法分离单核细胞源性树突状细胞(Mo-DCs);LPS组加入0.1μg/m L的LPS,磷酸缓冲盐溶液(PBS)组... 目的研究长链非编码RNA RP11-367F23.2是否与脂多糖(LPS)诱导的炎症反应相关,揭示RP11-367F23.2在炎症应答反应中的作用。方法采用密度梯度离心法分离单核细胞源性树突状细胞(Mo-DCs);LPS组加入0.1μg/m L的LPS,磷酸缓冲盐溶液(PBS)组加入等体积的含有0.1%二甲基亚砜(DMSO)的PBS;18 h后收集上清和细胞,上清用于检测细胞因子白细胞介素-6(IL-6),细胞用于在m RNA水平检测RP11-367F23.2以及白细胞介素-10(IL-10)、白细胞介素-12(IL-12)、CD40和CD80。结果 LPS处理细胞18 h后,LPS组中长链非编码RNA RP11-367F23.2及各细胞因子IL-6、IL-10、IL-12、CD40和CD80表达量较PBS组均显著升高(P<0.05)。结论 RP11-367F23.2可能参与了LPS诱导的炎症反应。 展开更多
关键词 长链非编码RNA RP11-367F23.2 白细胞介素-6
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长链非编码RNA RP11在膝关节骨性关节炎软骨细胞损伤的作用及机制 被引量:2
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作者 陈学武 徐宏光 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期4847-4851,共5页
为了探讨长链非编码RNA(lncRNA)RP11对膝关节骨性关节炎(OA)软骨细胞的影响,本研究选取膝关节OA软骨组织和正常软骨组织,分离软骨细胞;同时将OA软骨组织细胞随机分为对照组、空白转染组和RP11 shRNA组,其中空白转染组转染空载质粒脂质体... 为了探讨长链非编码RNA(lncRNA)RP11对膝关节骨性关节炎(OA)软骨细胞的影响,本研究选取膝关节OA软骨组织和正常软骨组织,分离软骨细胞;同时将OA软骨组织细胞随机分为对照组、空白转染组和RP11 shRNA组,其中空白转染组转染空载质粒脂质体,RP-11 shRNA组转染RP-11 shRNA。采用PCR检测RP11 mRNA表达,CCK8细胞增殖活力实验检测细胞活力,流式细胞仪检测细胞凋亡,Western blotting检测MMP-3、MMP-9和MMP-13蛋白表达。结果表明,OA软骨细胞RP11mRNA相对表达量为(0.683±0.095),明显高于正常软骨细胞(p<0.05);OA软骨细胞增殖活力为(42.01±10.30)%,明显低于正常软骨细胞(p<0.05),而细胞凋亡率为(59.82±8.78)%,明显高于正常软骨细胞(p<0.05);RP11-shRNA组RP11 mRNA相对表达量和细胞凋亡率分别为(0.322±0.100)和(44.82±9.23)%,明显低于对照组和空白转染组(p<0.05),而细胞增殖活力为(52.11±8.34)%,明显高于对照组和空白转染组(p<0.05);RP11-shRNA组MMP-3、MMP-9和MMP-13蛋白相对表达量分别为(0.503±0.098)、(0.202±0.082)和(0.335±0.098),明显低于对照组和空白转染组(p<0.05)。lncRNA RP11可影响膝关节OA软骨细胞增殖及凋亡,可能与调控MMP-3、MMP-9和MMP-13蛋白有关。 展开更多
关键词 长链非编码RNA RP11 膝关节 骨性关节炎 软骨细胞
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长链非编码RNA RP11-554D14.7对非小细胞肺癌细胞增殖和凋亡能力的影响 被引量:2
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作者 刘志利 茅卫东 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第18期2869-2873,共5页
目的:研究lncRNA RP11-554D14.7在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况,及其对NSCLC细胞功能的影响和分子机制。方法:实时定量PCR用于检测lncRNA RP11-554D14.7在NSCLC组织及细胞中的表达水平;CCK8、集落形成... 目的:研究lncRNA RP11-554D14.7在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况,及其对NSCLC细胞功能的影响和分子机制。方法:实时定量PCR用于检测lncRNA RP11-554D14.7在NSCLC组织及细胞中的表达水平;CCK8、集落形成实验检测RP11-554D14.7对NSCLC细胞增殖能力的影响;流式细胞技术检测RP11-554D14.7对NSCLC细胞凋亡能力的影响;生物信息学分析和荧光素酶报告基因技术研究RP11-554D14.7对miR-21的调控。结果:RP11-554D14.7在NSCLC组织及细胞中表达下调,上调RP11-554D14.7的表达抑制NSCLC细胞增殖并诱导细胞凋亡;miR-21可直接结合到RP11-554D14.7的序列中。结论:下调的RP11-554D14.7在NSCLC的发生发展过程中可能是一个抑癌基因,可作为NSCLC一个候选的治疗靶点。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 长非编码RNA RP11-554D14.7 细胞增殖 凋亡 MIR-21
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粘虫核糖体蛋白S11基因cDNA的克隆和序列分析 被引量:1
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作者 李柯 阴环 +1 位作者 廉振民 奚耕思 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2010年第4期171-175,182,共6页
【目的】克隆和鉴定粘虫核糖体蛋白S11(Ribosomal Protein S11,RPS11)基因,为昆虫核糖体蛋白功能的研究提供基础资料。【方法】运用RT-PCR和RACE技术,以粘虫cDNA为模板,对RPS11基因进行克隆,获得其全长cDNA序列,并利用生物信息学方法,对... 【目的】克隆和鉴定粘虫核糖体蛋白S11(Ribosomal Protein S11,RPS11)基因,为昆虫核糖体蛋白功能的研究提供基础资料。【方法】运用RT-PCR和RACE技术,以粘虫cDNA为模板,对RPS11基因进行克隆,获得其全长cDNA序列,并利用生物信息学方法,对RPS11基因全长cDNA序列及推测得到的RPS11蛋白氨基酸序列进行分析,构建其系统进化树。【结果】获得的粘虫核糖体蛋白S11基因(RPS11)cDNA序列长度为521 bp,其中包括26 bp的5′非编码区、36 bp的3′非编码区和459 bp的开放阅读框,编码一个由152个氨基酸组成的蛋白,其具有核糖蛋白S17蛋白家族典型特征。推测得到的粘虫RPS11蛋白的理论分子质量为17.737 9 ku,等电点为10.63,富含6种类型的特定功能位点,与同属夜蛾科的烟芽夜蛾(Heliothis virescens)的RPS11蛋白相似性高达97%。用Neigh-bor-joining(NJ)法构建基于RPS11氨基酸序列的系统发育树,结果显示,粘虫RPS11与烟芽夜蛾(H.virescens)、草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)和家蚕(Bombyx mori)等3种鳞翅目昆虫的亲缘关系较近。【结论】成功获得了粘虫RPS11基因全长序列(GenBank登录号为GQ222274),由其编码的核糖体蛋白RPS11属于核糖蛋白S17蛋白家族。 展开更多
关键词 粘虫 核糖体蛋白S11基因 克隆
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用API推荐作法设计抽油钢丝绳绳杆柱 被引量:5
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作者 彭勇 《石油矿场机械》 2000年第6期30-33,共4页
提出用 API RP 11L推荐作法设计钢丝绳连续抽油杆采油系统中的抽油钢丝绳绳杆柱 ,推导了与钢抽油杆柱类似的振动系统模型和边界条件 ,给出了用 API设计方法设计钢丝绳采油系统绳杆柱的设计步骤 ,特别给出了设计参数 :绳杆柱的等效弹性... 提出用 API RP 11L推荐作法设计钢丝绳连续抽油杆采油系统中的抽油钢丝绳绳杆柱 ,推导了与钢抽油杆柱类似的振动系统模型和边界条件 ,给出了用 API设计方法设计钢丝绳采油系统绳杆柱的设计步骤 ,特别给出了设计参数 :绳杆柱的等效弹性模量、等效密度、等效刚度以及固有频率的计算公式 ,并以一种国产抽油钢丝绳的基本参数为依据 ,给出了钢丝绳采油系统绳杆柱的频率系数表 ,利用现文的方法和数据 ,可以参照 API RP 展开更多
关键词 API RP 11L推荐作法 钢丝绳 连续抽油杆 设计
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RP11-366L20.3通过NF-κB通路调控E-cadherin表达 被引量:1
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作者 刘绪 朱杰 罗洪斌 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期562-567,共6页
目的研究长链非编码RNA RP11-366L20.3在调控炎症因子表达中的作用。方法运用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激THP-1细胞6 h,然后收集细胞提取RNA并通过RT-qPCR筛选上调表达的长链非编码RNA,RACE(c DNA末端快速扩增)获取其基因全长,N... 目的研究长链非编码RNA RP11-366L20.3在调控炎症因子表达中的作用。方法运用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激THP-1细胞6 h,然后收集细胞提取RNA并通过RT-qPCR筛选上调表达的长链非编码RNA,RACE(c DNA末端快速扩增)获取其基因全长,Northern blot验证基因的真实长度和LPS刺激效果,细胞通路抑制剂分析其转录调控通路和胞内分布,过表达和siRNA处理细胞分析RP11-366L20.3调控的下游炎症因子及机理。结果筛选出一个长链非编码RNA RP11-366L20.3,LPS刺激能上调该基因的表达,RACE扩增全长为833 bp,Northern blot也验证了RACE的实验结果,RP11-366L20.3主要分布于细胞核,其基因的转录受到NF-κB信号通路调控;同时RP11-366L20.3是一个TLR4通路的非编码RNA,过表达RP11-366L20.3能降低E-cadherin的基因表达,而siRNA敲低RP11-366L20.3则能上调E-cadherin的基因表达,RIP实验表明RP11-366L20.3能与P50蛋白直接结合,LPS刺激能增强RP11-366L20.3与p50的结合,从而抑制E-cadherin的基因表达。结论长链非编码RNA RP11-366L20.3通过NF-κB通路因子P50调控E-cadherin的基因表达。 展开更多
关键词 长链非编码RNA RP11-366L20.3 NF-ΚB通路 P50 E-CADHERIN
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喉癌患者血浆及组织中长链非编码RNA的检测及临床意义 被引量:5
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作者 王剑 崔翔 +3 位作者 李群 陈声灿 沈志森 郭俊明 《宁波大学学报(理工版)》 CAS 2016年第3期123-127,共5页
为研究长链非编码RNA(Long non-coding RNA,Lnc RNA)RP11-552E20.1-001在喉鳞状细胞癌患者血浆和组织中的表达水平及临床价值,采用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)方法,检测67例喉癌患者手术前后一周的血浆,以声带息肉患者血浆作对... 为研究长链非编码RNA(Long non-coding RNA,Lnc RNA)RP11-552E20.1-001在喉鳞状细胞癌患者血浆和组织中的表达水平及临床价值,采用实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)方法,检测67例喉癌患者手术前后一周的血浆,以声带息肉患者血浆作对照,观察喉癌组织、转移的淋巴结和癌旁正常黏膜组织的表达情况,分析其与喉癌临床病理学特征的联系,构建受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC),探讨其诊断价值.研究发现,喉癌患者血浆Lnc RNA表达水平高于声带息肉患者,且术后较术前显著降低;喉癌组织中该链表达较癌旁组织上调,转移的淋巴结比原发病灶表达水平更高;术前血浆及喉癌组织中该链表达与肿瘤分化程度、淋巴结转移和TNM分期显著相关.ROC曲线下面积为0.734,其敏感性为80.6%,特异性为67.2%.提示该Lnc RNA可能是喉癌诊断的潜在标记物,并在喉癌的侵袭、转移过程中起重要作用. 展开更多
关键词 长链非编码RNA RP11-552E20.1-001 喉鳞状细胞癌 血浆 组织
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