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苏姜猪RPL10a假基因第2外显子多态性与产仔数的相关性 被引量：2
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作者 张伟 陈章言 +1 位作者 王利红 仝蒙 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第10期62-66,共5页
为深入探讨猪核糖体蛋白L10a假基因(RPL10a pseudogene)的多态性及其与产仔数性状间的相关性,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)检测方法,分析苏姜猪RPL10a假基因第2个外显子区的多态性。检测结果显示:引物P1扩增区存在AA和A... 为深入探讨猪核糖体蛋白L10a假基因(RPL10a pseudogene)的多态性及其与产仔数性状间的相关性,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)检测方法,分析苏姜猪RPL10a假基因第2个外显子区的多态性。检测结果显示:引物P1扩增区存在AA和AB等2种基因型,引物P4扩增区存在4种SSCP型;经核酸序列比对分析发现,在27 389 415、27 389 835、27 389 946位分别存在C→G、G→A、A→G的突变,27 389 851位为碱基A的插入突变。经群体遗传学分析,各基因分布符合哈迪-温伯格定律,处于群体平衡状态。将各基因型与苏姜猪5个胎次的平均产仔数进行相关性统计分析,结果表明,RPL10a假基因引物P1和P4各扩增区不同SSCP类型与苏姜猪平均产仔数性状间无显著差异(P>0.05)。将2个扩增区不同SSCP型综合分析,结果显示,同时存在AB型与SSCP-1型苏姜猪的第1胎平均产仔数显著高于同时具有AA型与SSCP-1、SSCP-2型的苏姜猪(P<0.05)。 展开更多
关键词 苏姜猪 rpl10a假基因 PCR-SSCP 产仔数
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大熊猫核糖体蛋白L10亚基基因的cDNA克隆及序列分析 被引量：1
2
作者 苏秀兰 侯怡铃 +5 位作者 李俊 孙冰 吴光富 宋嫣 张田 侯万儒 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第15期1617-1620,共4页
目的了解大熊猫(ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白L10亚基基因(RPL10)的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPL10基因的异同。方法根据已报道的部分哺乳动物RPL10基因的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从大熊猫... 目的了解大熊猫(ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白L10亚基基因(RPL10)的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPL10基因的异同。方法根据已报道的部分哺乳动物RPL10基因的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPL10基因的进行克隆、测序;采用Genescan软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA序列的开放阅读框查找;采用DNAMANVersion 6软件,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server软件,进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析;采用http://www.imtech.res.in/raghava/apssp2/对蛋白质二级结构进行模拟分析。结果大熊猫RPL10基因的表达序列长为685 bp,开放阅读框(ORF)为645 bp,编码214个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为24.599 7×103,等电点为10.74,含有4个功能位点,分别为:2个蛋白激酶C磷酸化位点,2个N化位点,2个酰胺化位点,1个核糖体蛋白L10e信号位点。进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的人、牛、家犬、褐家鼠、小家鼠有很高的相似性,其表达序列同源性分别为92.4%、92.4%、97.21%、88.84%与89.61%;其编码的氨基酸序列除与牛的同源性为99.07%外,与其他哺乳动物同源性为100%。而且,其蛋白质的高级结构除牛外其他物种也具有一致性。结论无论是从RPL10基因的序列、结构、功能位点,还是从其编码的氨基酸的序列和二级结构进行分析,都表明大熊猫的RPL10基因和已报道的哺乳动物的RPL10基因具有高度的遗传稳定性和功能一致性。 展开更多
关键词 大熊猫 RT-PCR rpl10 克隆 序列分析
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