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鲸偶蹄目RNase11和RNase12的分子进化研究
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作者 郎大田 李高银 +1 位作者 张毅 刘松菊 《安徽大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第1期72-84,共13页
脊椎动物特有的RNaseA超家族因频繁发生基因重复和功能分化,一直被认为是分子进化研究的经典模型.过去研究主要聚焦于RNaseA超家族中与食性相关的典型成员RNase1,而非典型成员的研究非常有限.笔者以鲸偶蹄目4个亚目21科92个物种为研究对... 脊椎动物特有的RNaseA超家族因频繁发生基因重复和功能分化,一直被认为是分子进化研究的经典模型.过去研究主要聚焦于RNaseA超家族中与食性相关的典型成员RNase1,而非典型成员的研究非常有限.笔者以鲸偶蹄目4个亚目21科92个物种为研究对象,基于系统发育树、等电点、选择压力分析、蛋白质结构等方法深入开展RNaseA超家族非典型成员RNase11和RNase12的分子进化研究,共获得69条RNase11和88条RNase12序列,其中RNase11在水生的河马形亚目27个物种中发生假基因化或基因丢失.RNase11和RNase12的平均等电点分别为8.58,8.25,揭示RNase11和RNase12在鲸偶蹄目中可能拥有与生殖相关的抗菌功能.系统发育树显示鲸偶蹄目的胼足亚目和猪形亚目形成姐妹群最先发生分歧,其次是河马形亚目,最后是反刍亚目.此外,选择压力分析揭示RNase11和RNase12在进化过程中分别有7个和9个位点受到正选择,揭示RNase11和RNase12生物学功能可能发生了改变.总之,通过系统开展鲸偶蹄目RNase11和RNase12的分子进化研究,为进一步认识RNaseA超家族非典型成员和鲸偶蹄目的进化奠定了一定的基础,丰富了RNaseA超家族分子进化研究的多样性. 展开更多
关键词 鲸偶蹄目 rnase11 RNase12 正选择 分子进化
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