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RNF149在原发性肝细胞肝癌中的表达及其临床意义
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作者 徐旭 袁建辉 +1 位作者 董可帅 余佳 《武汉大学学报(医学版)》 2025年第5期625-629,共5页
目的:研究RNF149在原发性肝癌组织和癌旁组织中的表达差异以及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)技术来分析RNF149在肝癌组织和癌旁组织的mRNA含量差异。采用免疫组织化学芯片染色来检测肝癌组织和癌旁组织的RNF14... 目的:研究RNF149在原发性肝癌组织和癌旁组织中的表达差异以及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)技术来分析RNF149在肝癌组织和癌旁组织的mRNA含量差异。采用免疫组织化学芯片染色来检测肝癌组织和癌旁组织的RNF149蛋白表达差异。同时利用X-tile软件和组织芯片85例肝癌数据得到RNF149的最佳截断值0.128,并将组织芯片的肝癌患者分成RNF149高表达组(n=53)和RNF149低表达组(n=32),然后分析其对临床预后的影响以及与临床病理特征的关系。结果:RNF149在肝癌组织的mRNA和蛋白表达水平均低于癌旁组织(P<0.05和P<0.01);相比于RNF149低表达的肝癌患者,RNF149高表达的患者有更长的总生存期(P=0.045)和无病生存期(P=0.001)。RNF149的高或低表达与患者血清甲胎蛋白(AFP)水平相关(P=0.035),与其他临床病理特征无关(P>0.05)。结论:RNF149在肝细胞肝癌中低表达,高表达的RNF149对肝癌预后具有保护意义。 展开更多
关键词 rnf149 原发性肝癌 临床预后
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鲤RNF181基因的克隆、表达分析及其对病毒刺激的响应规律
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作者 洪佳乐 职毓杰 +9 位作者 吴成甲 张美娜 郭国军 杨振江 董鹏生 黄小城 于光晴 李明 武国兆 刘变枝 《淡水渔业》 北大核心 2025年第5期12-22,共11页
为探究鲤RNF181(ring finger protein181,RNF181)的生物学功能,本实验克隆并鉴定了鲤RNF181基因编码区(coding sequence,CDS)全长,使用生物信息学软件对其蛋白性质和功能进行分析。并通过RT-qPCR检测其在各组织和早期发育阶段的基因表... 为探究鲤RNF181(ring finger protein181,RNF181)的生物学功能,本实验克隆并鉴定了鲤RNF181基因编码区(coding sequence,CDS)全长,使用生物信息学软件对其蛋白性质和功能进行分析。并通过RT-qPCR检测其在各组织和早期发育阶段的基因表达。同时,利用鲤春病毒血症病毒(spring viremia of carp virus,SVCV)和Poly(I:C)[polyriboinosinic-polyribocytidylic acid,Poly(I:C)]进行在体和离体刺激实验,研究其对SVCV和Poly(I:C)刺激的响应规律。结果显示,鲤RNF181基因CDS区序列全长471 bp,编码157个氨基酸,其氨基酸序列与鱼类遗传距离较近,与哺乳动物则相对较远。该蛋白分子质量为18.09 kDa,等电点为4.86,主要定位于细胞核和细胞质中,具典型RING-H2-RNF181结构域。二级结构和三级结构显示其以无规卷曲和α螺旋为主。底物蛋白分析结果表明RNF181与NUGGC.1、TRIM36等相互作用的置信度高。组织表达谱分析表明,RNF181的mRNA表达水平在鳃中表达最高,肝脏中最低。早期发育阶段,在卵裂期、囊胚期和原肠胚期表达最高,孵化出膜期和孵化出膜后1 d表达水平最低。SVCV感染和Poly(I:C)刺激,RNF181的mRNA表达水平在脾脏、头肾、心脏和肌肉中显著上调。离体实验中,无论是SVCV感染还是Poly(I:C)刺激,RNF181的mRNA表达水平均呈现先下降后上升的趋势,而且鲤RNF181能够响应病毒的侵染,且这种响应受刺激时间和刺激剂量影响。上述结果提示,鲤RNF181可能在鲤抗病毒免疫中发挥重要调控作用。 展开更多
关键词 rnf181基因 鲤(Cyprinus carpio) 表达模式 病毒刺激 鲤春病毒血症病毒 Poly(I:C)
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RNF8调控肝细胞癌增殖和迁移的作用及机制
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作者 牛小行 蒋立柱 +1 位作者 罗胜勇 刘文斌 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第7期1305-1311,共7页
目的探讨RNF8对肝细胞癌增殖、侵袭和迁移及促进上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)过程中的作用,明确RNF8对肝癌细胞的调控机制。方法采用免疫组织化学法检测人肝癌组织和癌旁组织中RNF8及RhoA中的表达;Western b... 目的探讨RNF8对肝细胞癌增殖、侵袭和迁移及促进上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)过程中的作用,明确RNF8对肝癌细胞的调控机制。方法采用免疫组织化学法检测人肝癌组织和癌旁组织中RNF8及RhoA中的表达;Western blot法和RT-PCR法检测人正常肝细胞和肝癌细胞中RNF8及RhoA中的表达水平。在HepG2细胞中过表达RNF8和siRNA干扰下调RNF8的表达,细胞实验分组如下:对照组(Control,正常HepG2细胞)、RNF8过表达组、RNF8低表达组(siRNA RNF8)、RNF8过表达+Rhosin(20μmol·L^(-1),RhoA阻断剂)组。通过CCK-8法检测细胞增殖能力;划痕实验检测细胞迁移能力;Transwell实验检测细胞侵袭能力;最后通过Western blot法和RT-PCR法检测RNF8、RhoA、PCNA、CyclinD1、N-cadherin、vimentin、Slug、E-cadherin蛋白和mRNA的表达水平。结果肝癌组织及肝癌细胞中RNF8及RhoA表达明显增加;RNF8敲低后肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭和EMT发生明显受到抑制,而过表达RNF8明显升高肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭能力和促进EMT发生。RhoA随着RNF8的敲低和过表达呈现正相关,过表达RNF8同时给与RhoA阻断剂时明显逆转过表达RNF8升高肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭能力和促进EMT的现象。结论RNF8可促进肝癌细胞增殖、迁移、侵袭能力和促进EMT,并同时促进RhoA的表达,RNF8通过调控RhoA促进EMT发生促进肝细胞癌的进展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 rnf8 Ras同源物家族成员A 上皮间质转化 侵袭 Rhosin
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慢性胃炎中医证型与RNF180/Septin9基因甲基化相关性研究
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作者 白欣 郭宵飞 +4 位作者 许爱丽 张奕萌 王源 白建琦 张平 《中国中医药信息杂志》 2025年第7期148-154,共7页
目的探讨慢性胃炎患者不同中医证型与RNF180/Septin9基因甲基化的相关性。方法通过中国中医科学院望京医院信息系统检索2022年3月-2024年7月确诊为慢性胃炎的住院病例,收集患者的一般情况、病理结果、RNF180/Septin9基因甲基化检测结果... 目的探讨慢性胃炎患者不同中医证型与RNF180/Septin9基因甲基化的相关性。方法通过中国中医科学院望京医院信息系统检索2022年3月-2024年7月确诊为慢性胃炎的住院病例,收集患者的一般情况、病理结果、RNF180/Septin9基因甲基化检测结果等信息。根据病例筛选标准最终收集慢性胃炎患者441例,分为肝胃不和证、脾胃湿热证、脾胃虚弱证、胃络瘀阻证、胃阴不足证5种证型,通过SPSS25.0分析慢性胃炎中医证型与RNF180/Septin9基因甲基化的相关性。结果441例慢性胃炎患者以脾胃湿热证居多;不同中医证型患者的性别、烟酒史及年龄分布差异有统计学意义(P<0.05)。胃络瘀阻证的RNF180/Septin9基因甲基化阳性率显著高于其他证型(P<0.01)。相关性分析显示,脾胃湿热证、胃络瘀阻证与RNF180/Septin9基因甲基化呈正相关(P<0.05),其中胃络瘀阻证的相关性尤为显著(P<0.01)。结论慢性胃炎患者脾胃湿热证及胃络瘀阻证与RNF180/Septin9基因甲基化呈正相关关系,瘀血、湿邪等病理产物可提高“炎-癌”转变风险,其预后较其他证型差,应及时干预,定期检查,实现早诊早治。 展开更多
关键词 慢性胃炎 中医证型 rnf180/Septin9基因甲基化 相关性
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敲低RNF145表达对SK-HEP-1细胞生物学行为的影响
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作者 杨志钊 陈家兴 +2 位作者 崔永强 赵志磊 张晓 《中华实用诊断与治疗杂志》 2025年第7期597-610,共14页
目的 基于生物信息数据库分析肝细胞癌(HCC)组织RNF145表达与HCC患者预后、基因突变、临床特征、免疫细胞和免疫检查点间的关系,采用细胞实验验证RNF145对SK-HEP-1细胞增殖、迁移和侵袭的影响,探讨其作用机制。方法 (1)采用TIMER数据库... 目的 基于生物信息数据库分析肝细胞癌(HCC)组织RNF145表达与HCC患者预后、基因突变、临床特征、免疫细胞和免疫检查点间的关系,采用细胞实验验证RNF145对SK-HEP-1细胞增殖、迁移和侵袭的影响,探讨其作用机制。方法 (1)采用TIMER数据库分析33种恶性肿瘤组织中RNF145的表达情况。比较TCGA数据库357例HCC患者癌组织及50份正常组织RNF145 mRNA相对表达量;比较357例HCC患者不同T分期、病理分级、临床分期者癌组织RNF145 mRNA相对表达量。以癌组织RNF145 mRNA相对表达量均数(3.86)为界,将357例HCC患者分为高表达组178例(RNF145 mRNA相对表达量≥3.86)和低表达组179例(RNF145 mRNA相对表达量<3.86),绘制Kaplan-Meier生存曲线,比较RNF145高表达组与低表达组总生存率、无疾病生存率和无进展生存率;采用单因素和多因素Cox回归分析357例HCC患者死亡的影响因素。根据TCGA数据库357例HCC患者癌组织DNA甲基化情况,分析癌组织RNF145表达与DNA甲基化的相关性,鉴定潜在的CpG位点,分析甲基化位点与RNF145表达的相关性。以与RNF145表达具有相关性的特异性甲基化位点(cg02298193、cg06030535、cg11495854、cg01657408)表达的中位数(0.077、0.590、0.075、0.050)为界,以大于等于中位数为高表达、小于中位数为低表达,通过Kaplan-Meier生存曲线比较特异性甲基化位点高、低表者总生存率。应用cBioPortal数据库分析HCC组织RNF145突变频率。应用COSMIC数据库分析RNF145在HCC中常见的突变类型及碱基改变。应用TCGA数据库分析357例HCC患者RNF145高、低表达组癌组织的基因突变情况。应用TCGA数据库分析HCC组织中与RNF145表达呈正、负相关的前5个基因,对其进行KEGG通路富集分析,采用TCGA、ICGC数据库验证与RNF145表达相关的信号通路。应用TIMER数据库分析RNF145表达与免疫细胞和免疫检查点的关系。(2)取2017年3月—2019年1月河南省人民医院3例HCC患者手术切除的癌组织及癌旁组织,采用免疫组织化学法检测RNF145表达。(3)取对数生长期SK-HEP-1细胞,分为敲低组(转染RNF145 siRNA)、空载组(转染RNF145 siRNA-NC)、甲基化组(采用S-腺苷基甲硫氨酸诱导甲基化)和对照组(正常培养不做处理),采用实时荧光定量PCR法检测4组RNF145 mRNA相对表达量。检测敲低组和空载组细胞划痕愈合率、侵袭细胞数和细胞增殖率。结果 (1)TIMER数据库分析结果显示,RNF145在胆管癌、食管癌、头颈鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌、HCC、胃癌、子宫内膜癌组织中表达均升高。TCGA数据库分析结果显示,HCC患者癌组织RNF145 mRNA相对表达量(2.34±0.70)高于正常组织(1.91±0.50)(t=4.125,P<0.001)。T1~T2期、病理分级G1~G2级、临床分期Ⅰ~Ⅱ期的HCC患者癌组织RNF145 mRNA相对表达量分别低于T3~T4期、G3~G4级、Ⅲ~Ⅴ期者(t=3.879~4.174,P均<0.001)。RNF145高表达组总生存率(42.9%)、无疾病生存率(37.5%)、无进展生存率(48.2%)均低于RNF145低表达组(61.4%、54.4%、65.8%)(χ^(2)=5.914~13.390,P均<0.05)。多因素Cox回归分析结果显示,RNF145表达(HR=1.040,95%CI:1.006~1.074,P=0.020)、T分期(HR=1.675,95%CI:1.288~2.177,P<0.001)是HCC患者死亡的影响因素。HCC患者癌组织RNF145表达与RNF145甲基化程度呈负相关(r=-0.260,P<0.001)。RNF145的启动子区域鉴定出10个潜在的CpG位点,特异性CpG位点cg06030535(r=-0.170,P=0.0014)、cg02298193(r=-0.110,P=0.032)、cg11495854(r=-0.210,P<0.001)、cg01657408(r=-0.270,P<0.001)的甲基化程度与RNF145表达均呈负相关。甲基化位点cg06030535、cg02298193、cg11495854低表达者总生存率(50.88%、55.56%、55.00%)分别高于高表达者(48.49%、38.10%、46.67%)(χ^(2)=5.907~15.870,P均<0.05)。cBioPortal数据库分析结果显示,RNF145体细胞突变总体频率为0.7%,且大多数为错义突变,显著低于TP53和CTNNB1等核心驱动基因。COSMIC数据库分析结果显示,RNF145突变类型主要为错义突变(35.00%),其次为同义突变(12.70%),多数碱基改变替换涉及C>T(23.43%)、A>G(16.86%)、G>A(21.43%)。TCGA数据库分析结果显示,RNF145高、低表达组均有TP53、CTNNB1、TTN和MUC16突变发生,高表达组TP53突变频率(31%)较高。TCGA数据库基因的相关性分析结果显示,与RNF145表达呈正相关的前5个基因为SLC38A1、ACTR3、STK17A、TMEM87B、CDC42SE2,呈负相关的前5个基因为CYP27A1、AGXT、RBP4、SERPINC1、PIPOX,均富集于WNT信号通路;进一步验证结果显示,高表达RNF145可激活WNT信号通路,RNF145表达与WNT信号通路相关。RNF145表达与免疫细胞B细胞(r=0.323,P<0.001)、CD8+T细胞(r=0.249,P<0.001)、CD4+T细胞(r=0.491,P<0.001)、巨噬细胞(r=0.561,P<0.001)、中性粒细胞(r=0.499,P<0.001)、树突状细胞(r=0.431,P<0.001)、CD163(r=0.310,P<0.001)、MS4A4A(r=0.300,P<0.001)、VSIG4(r=0.330,P<0.001)、CD96(r=0.280,P<0.001)、IDO1(r=0.180,P<0.001)、PDCD1(r=0.320,P<0.001)、CD276(r=0.510,P<0.001)、CTLA4(r=0.340,P<0.001)、HAVCR2(r=0.470,P<0.001)、CD274(r=0.270,P<0.001)表达均呈正相关。(2)HCC组织RNF145表达(0.052±0.001)高于癌旁组织(0.030±0.003)(t=8.857,P<0.001)。(3)RNF145mRNA相对表达量在敲低组细胞(0.603±0.056)低于空载组(1.004±0.066)(t=7.997,P<0.001)、甲基化组细胞(0.293±0.183)低于对照组(1.058±0.415)(t=3.378,P=0.015)。敲低组细胞划痕愈合率、侵袭细胞数和细胞增殖率[(46.743±4.911)%、(175.57±62.70)个、(0.882±0.053)%]均低于空载组[(71.680±6.062)%、(322.50±139.70)个、(1.376±0.044)%](t=6.584、10.880、18.710,P均<0.001)。结论 RNF145在HCC组织中呈高表达,其表达与肿瘤恶性程度及不良预后相关;敲低RNF145表达可抑制SK-HEP-1细胞增殖、迁移及侵袭,其机制可能与WNT信号通路激活及肿瘤免疫微环境调控有关。 展开更多
关键词 肝细胞癌 rnf145 细胞增殖 迁移 侵袭 WNT信号通路
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RNF125泛素化MYH9抑制肝癌侵袭、转移机制研究
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作者 王顺意 唐浩 +1 位作者 缪阳杨 柏斗胜 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 北大核心 2025年第3期53-64,共12页
为分析E3泛素连接酶环指蛋白125(ring finger protein 125,RNF125)在肝癌中的表达及临床预后意义,并探究RNF125对肝癌侵袭和转移的影响及其作用机制,通过ENCORI数据库和临床组织样本分析RNF125在肝癌和癌旁组织中的表达量,使用ENCORI数... 为分析E3泛素连接酶环指蛋白125(ring finger protein 125,RNF125)在肝癌中的表达及临床预后意义,并探究RNF125对肝癌侵袭和转移的影响及其作用机制,通过ENCORI数据库和临床组织样本分析RNF125在肝癌和癌旁组织中的表达量,使用ENCORI数据库分析RNF125与肝癌预后的关系。构建敲低和过表达RNF125的肝癌细胞系,通过Transwell试验和细胞划痕试验检验RNF125表达水平对肝癌细胞迁移、侵袭能力的影响。通过动物试验验证调控RNF125对体内肿瘤生长情况及对肿瘤免疫微环境的影响,质谱分析寻找RNF125的靶蛋白,qPCR、蛋白质免疫印迹技术、泛素化试验验证RNF125与MYH9之间的关系,通过蛋白质免疫印迹和细胞免疫荧光技术确定调控RNF125与MYH9对EMT标志蛋白的影响。结果表明:RNF125在肝癌组织中表达较低,RNF125的高表达提示良好的预后。RNF125的表达水平与肝癌细胞迁移和侵袭能力呈负相关。过表达RNF125使肿瘤生长延迟并增加免疫细胞的浸润水平。RNF125特异性结合MYH9并促进其泛素化降解。RNF125与上皮细胞标志物的表达水平呈正相关,与间充质细胞标志物呈负相关。过表达MYH9可逆转RNF125对EMT标志蛋白的影响。综上,RNF125在肝癌中表达下调,RNF125的高表达与肝癌患者的良好预后相关,RNF125通过泛素化MYH9来抑制肝癌的EMT过程,从而抑制肝癌的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 肝癌 rnf125 MYH9 泛素化 EMT 迁移 侵袭
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RNF125介导的RIG-I泛素化降解减少促进肾脏炎症和纤维化进展
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作者 李露新 姬婷婷 +3 位作者 陆丽 李肖瑛 陆利民 白寿军 《生理学报》 北大核心 2025年第3期385-394,共10页
持续的炎症反应是肾脏纤维化发生和进展的关键因素。模式识别受体维甲酸诱导基因I(retinoic acid-inducible geneI,RIG-I)激活引起的炎症因子生成参与肾脏纤维化进展,本研究旨在探讨调控RIG-I的上游机制。选用8周龄雄性C57BL/6小鼠,用... 持续的炎症反应是肾脏纤维化发生和进展的关键因素。模式识别受体维甲酸诱导基因I(retinoic acid-inducible geneI,RIG-I)激活引起的炎症因子生成参与肾脏纤维化进展,本研究旨在探讨调控RIG-I的上游机制。选用8周龄雄性C57BL/6小鼠,用单侧输尿管梗阻(unilateral ureteral obstruction,UUO)建立肾纤维化模型,14天后收集组织样本进行分析。离体实验在转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)刺激的小鼠肾小管上皮细胞中进行。结果显示,与对照组相比,UUO小鼠肾脏出现明显的纤维化改变,RIG-I、磷酸化NF-κB p65和炎症因子水平升高,同时E3泛素连接酶RNF125的蛋白水平明显下调,并且主要定位在肾小管上皮细胞;在离体培养的肾小管上皮细胞中给予TGF-β刺激同样引起RIG-I、磷酸化NF-κB p65和炎症因子水平升高,并伴有RNF125水平下降;RIG-I能够发生泛素化修饰,免疫共沉淀结果验证了RNF125与RIG-I存在直接相互作用,且过表达RNF125能够促进RIG-I的泛素化,加速RIG-I通过泛素蛋白酶体途径降解。在肾组织和离体肾小管上皮细胞中过表达RNF125可以有效缓解炎症反应和肾脏纤维化。综上所述,本研究结果证实,在病理情况下RNF125水平下降,导致RIG-I的泛素化降解减少,下游NF-κB信号通路激活,炎症因子产生增加,最终促进肾脏纤维化的进展。 展开更多
关键词 肾纤维化 炎症 泛素化 rnf125 RIG-I
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E3泛素连接酶RNF5调控口蹄疫病毒粒子组装抑制病毒复制的分子机制
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作者 《中国兽医科学》编辑部 郑海学 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第5期705-706,共2页
口蹄疫病毒(FMDV)编码四种结构蛋白,其中VP1蛋白是病毒表面的主要衣壳蛋白,在病毒入侵和抗原性方面发挥关键作用,决定病毒的致病力和组织嗜性。2025年1月17日,中国农业科学院兰州兽医研究所郑海学研究员带领的科研团队在PLoS Pathogens... 口蹄疫病毒(FMDV)编码四种结构蛋白,其中VP1蛋白是病毒表面的主要衣壳蛋白,在病毒入侵和抗原性方面发挥关键作用,决定病毒的致病力和组织嗜性。2025年1月17日,中国农业科学院兰州兽医研究所郑海学研究员带领的科研团队在PLoS Pathogens期刊上发表了题为“RING finger protein 5 is a key anti-FMDV host factor through inhibition of virion assembly”的研究论文,该研究揭示了环指蛋白5(RNF5)依赖其E3泛素酶活性介导FMDV VP1蛋白降解并限制病毒组装的功能机制,为广谱抗小RNA病毒药物的研发提供了理论依据,为抗病育种提供新思路。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 VP1 rnf5 病毒组装
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干扰lncRNARNF5-AS1对奶牛乳腺上皮细胞炎症反应的影响
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作者 虎喜敏 周冉 +3 位作者 王正兴 李宇航 罗仍卓么 王兴平 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期333-342,共10页
【目的】长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)能够通过直接调控下游分子或竞争性结合微小RNA(microRNA,miRNA)参与奶牛乳房炎症过程。lncRNA RNF5-AS1是新发现的lncRNA,旨在分析lncRNA RNF5-AS1在奶牛乳腺上皮细胞(bovine mammar... 【目的】长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)能够通过直接调控下游分子或竞争性结合微小RNA(microRNA,miRNA)参与奶牛乳房炎症过程。lncRNA RNF5-AS1是新发现的lncRNA,旨在分析lncRNA RNF5-AS1在奶牛乳腺上皮细胞(bovine mammary epithelial cells,bMECs)炎症反应中的作用。【方法】利用RT-PCR技术进行lncRNA RNF5-AS1的克隆,采用核质分离法探究其在bMECs中的亚细胞定位情况。采用脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)诱导bMECs建立炎症模型,并利用RTqPCR检测lncRNA RNF5-AS1在炎性bMECs中的表达水平;干扰lncRNA RNF5-AS1后,检测促炎细胞因子表达水平,并利用CCK-8法和EdU法分别评估细胞活力和增殖能力;通过流式细胞术分析细胞凋亡情况。进一步通过在线工具预测lncRNA RNF5-AS1的潜在靶基因。【结果】lncRNA RNF5-AS1长度为1125 bp,主要分布于细胞质中。在LPS诱导的bMECs炎症模型中,lncRNA RNF5-AS1表达水平显著上调;干扰lncRNA RNF5-AS1后,促炎因子IL-6和IL-8的表达水平显著下调,细胞活力和增殖能力显著增加,细胞凋亡水平极显著降低。KEGG结果表明,lncRNA RNF5-AS1可能通过靶向bta-miR-375、bta-miR-615、bta-miR-193a-5p、btamiR-1291和bta-miR-1468而调控细胞炎症反应。【结论】lncRNA RNF5-AS1在bMECs炎症反应中表达上调,干扰后会抑制促炎因子的表达和细胞凋亡,提升细胞活力和增殖能力,提示其参与奶牛乳房炎的调控。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 lncRNA rnf5-AS1 乳腺上皮细胞 炎症因子
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长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及临床意义
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作者 姚羽 林敏杰 +1 位作者 金文芳 吕艳玲 《医学研究与战创伤救治》 北大核心 2025年第6期582-586,共5页
目的探讨长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达及其临床意义,以期为肺腺癌的早期诊断提供潜在靶标。方法以生物信息学方法分析RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌患者分期、性别、年龄、吸烟状态情况之间的关系。收集40... 目的探讨长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达及其临床意义,以期为肺腺癌的早期诊断提供潜在靶标。方法以生物信息学方法分析RNF157-AS1在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌患者分期、性别、年龄、吸烟状态情况之间的关系。收集40对肺腺癌及其配对癌旁组织,根据RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达,以中位表达值为界,分为RNF157-AS1高表达组和低表达组;根据肿瘤大小,按T分期进行分组(T1,肿瘤最大径≤3 cm;T2,肿瘤最大径>3 cm,≤5 cm;T3,肿瘤最大径>5 cm);根据淋巴结转移情况,按N分期进行分组(N0,无淋巴结转移;N1,肺内淋巴结转移;N2,纵膈淋巴结转移);根据肿瘤整体情况,按TNM分期进行分组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期)。比较肺腺癌组织及癌旁组织中RNF157-AS1的表达差异;结合患者的临床信息,分析RNF157-AS1表达与临床病理特征的关系。结果GEPIA数据库中,RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达高于正常组织(P<0.01);UALCAN数据分析表明,RNF157-AS1在肺腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.01),且在女性患者及有吸烟史的患者中表达更高(P<0.01)。在收集的40对肺腺癌及癌旁组织中,RNF157-AS1在肿瘤中的表达明显上调(P<0.01),结合患者的临床病理信息进一步分析表明,RNF157-AS1的表达与患者的年龄无明显相关性(P>0.05),而与患者的性别、吸烟史、肿瘤大小、有无淋巴结转移以及TNM分期均存在相关性(P<0.05)。结论长链非编码RNA RNF157-AS1在肺腺癌组织中高表达并且与患者的临床病理特征相关,有望成为肺腺癌潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 肺腺癌 长链非编码RNA rnf157-AS1
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RNF122 targets STING for ubiquitination at residues K95,K117,and K155 to regulate antiviral responses in a teleost fish
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作者 Xiao-Wei Qin Chuan-Rui Li +5 位作者 Min-Cong Liang Tian-Hao Li Yan-Lin You Shao-Ping Weng Chang-Jun Guo Jian-Guo He 《Zoological Research》 2025年第4期750-760,共11页
Ring finger protein 122(RNF122),an E3 ubiquitin ligase,orchestrates antiviral immune responses in mammals by targeting retinoic acid-inducible gene 1 and melanoma differentiation-associated gene 5 for ubiquitination.H... Ring finger protein 122(RNF122),an E3 ubiquitin ligase,orchestrates antiviral immune responses in mammals by targeting retinoic acid-inducible gene 1 and melanoma differentiation-associated gene 5 for ubiquitination.However,its functional relevance in teleosts has yet to be clearly defined,particularly regarding the identification of substrate-specific regulatory sites.This study characterized RNF122 from mandarin fish(Siniperca chuatsi),termed scRNF122,and investigated its regulatory impact on stimulator of interferon genes(STING)-mediated antiviral signaling.Results showed that scRNF122 expression was up-regulated in response to mandarin fish ranavirus(MRV)infection,and its overexpression suppressed scSTING-mediated interferon(IFN)production and enhanced MRV replication.Co-immunoprecipitation confirmed a direct interaction between scRNF122 and scSTING.Functional assays demonstrated that scRNF122 facilitated scSTING degradation through the ubiquitin-proteasome pathway,a process impeded by MG132 treatment.Ubiquitination analyses of various scSTING mutants revealed that scRNF122 catalyzed scSTING ubiquitination at K95,K117,and K155 residues.Moreover,scRNF122 significantly impaired scSTING-dependent antiviral responses by engaging negative regulatory elements within the signaling cascade.Overall,scRNF122 was identified as a negative modulator of STING-mediated IFN signaling in mandarin fish,diminishing STING-dependent antiviral activity and promoting its degradation via the ubiquitin-proteasome pathway at lysine residues K95,K117,and K155.These findings provide mechanistic insight into the post-translational control of STING in teleosts and establish a foundation for future investigations into antiviral immune regulation. 展开更多
关键词 rnf122 STING UBIQUITINATION INTERFERON Innate immunity
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RNF31调控肝癌细胞顺铂耐药的作用及潜在机制
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作者 翟鹏涛 程媛 +3 位作者 穆旭东 刘群轶 李梅 韩丕华 《国际医药卫生导报》 2025年第16期2702-2709,共8页
目的探究环指蛋白31(ringfinger protein 31,RNF31)调控肝癌细胞顺铂耐药的作用及潜在机制。方法收集2020年7月至2023年12月在陕西省肿瘤医院接受手术治疗的40例肝癌患者癌灶组织及癌旁正常组织样本,及人正常肝细胞IHHA-1、人肝癌细胞系... 目的探究环指蛋白31(ringfinger protein 31,RNF31)调控肝癌细胞顺铂耐药的作用及潜在机制。方法收集2020年7月至2023年12月在陕西省肿瘤医院接受手术治疗的40例肝癌患者癌灶组织及癌旁正常组织样本,及人正常肝细胞IHHA-1、人肝癌细胞系HepG2和人肝癌顺铂耐药细胞系HepG2/DDP进行研究。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)检测RNF31在肝癌组织、肝癌细胞及顺铂耐药细胞中的表达水平。构建过表达RNF31细胞系,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)及流式细胞术分别检测其对HepG2/DDP细胞增殖、半抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)及凋亡的影响。Western blot检测E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)以及单磷酸腺苷依赖的蛋白激酶[adenosine 5’-monophosphate(AMP)-activated protein kinase,AMPK]/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信号通路相关蛋白表达水平。采用t检验进行统计分析。结果肝癌组织RNF31 mRNA和蛋白表达水平均低于癌旁组织(0.45±0.03比1.01±0.02、0.36±0.03比1.00±0.02;均P<0.05)。RNF31 mRNA和蛋白表达水平在HepG2细胞(0.49±0.06、0.46±0.05)和HepG2/DDP细胞(0.30±0.05、0.28±0.05)中明显低于IHHA-1细胞(1.00±0.02、1.01±0.02)(均P<0.05)。与对照组比较,RNF31过表达显著抑制HepG2/DDP细胞增殖(1.74±0.23比1.21±0.15)和IC50值(8.01±0.52比3.53±0.25),提高细胞凋亡率(5.11±1.34比23.99±2.06)(均P<0.05)。与对照组比较,RNF31过表达增加HepG2/DDP细胞中E-cadherin(1.02±0.03比2.36±0.18,P<0.05)蛋白表达水平,降低N-cadherin(1.01±0.02比0.43±0.05,P<0.05)和Vimentin(1.01±0.03比0.32±0.05,P<0.05)蛋白表达水平。过表达RNF31降低AMPK(1.02±0.02比0.42±0.05,P<0.05)和mTOR(1.01±0.02比0.50±0.06,P<0.05)蛋白表达水平。过表达AMPK降低HepG2/DDP细胞凋亡率,提高IC50值,且其调控作用可被RNF31过表达所抑制。结论RNF31可能通过调控AMPK-mTOR信号通路介导的上皮间质转化,进而降低肝癌细胞顺铂耐药。 展开更多
关键词 肝癌 顺铂耐药 rnf31 上皮间质转化 AMPK/mTOR
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RNF180是食管癌的潜在诊断和预后标志物
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作者 马梓粼 高嫒嫒 +5 位作者 朱城 蔚晓远 张美英 苏小茉 刘迎娣 郭明洲 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年第3期313-317,共5页
目的探讨RNF180基因甲基化在食管癌患者中作为诊断与预后标志物的可能性。方法应用甲基化特异性PCR、TCGA数据库及633例食管癌患者组织对RNF180基因启动子区的甲基化状态进行分析。最后通过χ2检验、Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析... 目的探讨RNF180基因甲基化在食管癌患者中作为诊断与预后标志物的可能性。方法应用甲基化特异性PCR、TCGA数据库及633例食管癌患者组织对RNF180基因启动子区的甲基化状态进行分析。最后通过χ2检验、Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析,深入探讨RNF180甲基化与临床病理因素之间的关系。结果通过TCGA数据库分析发现RNF180转录起始位点上下游CpG位点的甲基化密度与mRNA的表达水平呈负相关(P<0.01)。应用甲基化特异性PCR检测,发现66.51%(421/633)的食管癌组织中发生甲基化,甲基化与肿瘤分期、分化程度、淋巴结及脉管癌栓或远处转移具有显著相关性(P<0.001)。RNF180甲基化患者的总生存期明显较非甲基化患者的总生存期短,是食管癌不良预后的独立危险因素(P<0.001)。结论TCGA数据分析提示RNF180在食管癌中的表达受启动子区甲基化的调控。RNF180在食管癌组织中的甲基化率为66.51%,与肿瘤的恶性程度、转移和生存期缩短相关,是食管癌潜在的诊断和预后标志物。 展开更多
关键词 rnf180 食管癌 DNA甲基化 甲基化特异性PCR
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RNF183蛋白家族在肿瘤中的作用
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作者 汪洋 石浩 +1 位作者 唐景峰 吕浩 《生物技术》 CAS 2024年第6期797-804,共8页
泛素化是所有真核生物中的一种重要表观遗传修饰方式。RNF183蛋白家族是一类泛素连接酶,在泛素化介导不同肿瘤类型的发生发展中发挥着重要作用。该文重点对RNF183蛋白家族的种类、结构、功能以及在不同类型肿瘤中的调节作用机制和最新... 泛素化是所有真核生物中的一种重要表观遗传修饰方式。RNF183蛋白家族是一类泛素连接酶,在泛素化介导不同肿瘤类型的发生发展中发挥着重要作用。该文重点对RNF183蛋白家族的种类、结构、功能以及在不同类型肿瘤中的调节作用机制和最新研究进展进行综述,为肿瘤诊断标志物开发、治疗药物研发等提供新的发展方向和理论依据。 展开更多
关键词 rnf183蛋白家族 肿瘤 泛素化 机制 疾病 凋亡 增殖 治疗
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FoxA1及RNF6在宫颈鳞状细胞癌的表达及意义
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作者 常畅 高静 +1 位作者 李志强 张帅 《河北北方学院学报(自然科学版)》 2024年第2期6-9,共4页
目的探讨FoxA1及RNF6在宫颈鳞状细胞癌的表达及意义。方法回顾性分析164例宫颈鳞状细胞癌患者(PE组)及164例慢性宫颈炎患者(对照组)的临床资料及保存良好的病理组织标本。采用实时定量PCR技术及免疫组织化学方法检测2组患者病理组织FoxA... 目的探讨FoxA1及RNF6在宫颈鳞状细胞癌的表达及意义。方法回顾性分析164例宫颈鳞状细胞癌患者(PE组)及164例慢性宫颈炎患者(对照组)的临床资料及保存良好的病理组织标本。采用实时定量PCR技术及免疫组织化学方法检测2组患者病理组织FoxA1及RNF6蛋白、mRNA的表达情况。结果PE组FoxA1及RNF6蛋白、mRNA表达水平明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01)。结论FoxA1及RNF6可能通过调节基因表达及蛋白酶作用增强肿瘤细胞增殖、分化,在宫颈鳞状细胞癌生长中发挥重要作用。 展开更多
关键词 FoxA1 rnf6 宫颈鳞状细胞癌
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RNF213基因多态性参与烟雾病发病机制的研究进展 被引量:1
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作者 曾超凡 薛艺萌 +6 位作者 鲍有园 孙旭东 孟凡博 陈颢元 葛培聪 张谦 赵继宗 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 2024年第3期181-186,共6页
烟雾病是一种慢性进展性脑血管疾病,其特征为双侧颈内动脉末端及其主要分支的渐进性闭塞以及颅底异常血管网的形成。烟雾病是青年卒中的主要病因之一,但其发病机制尚未明确,可能与遗传、免疫、炎症等多种因素有关。作为烟雾病的主要易... 烟雾病是一种慢性进展性脑血管疾病,其特征为双侧颈内动脉末端及其主要分支的渐进性闭塞以及颅底异常血管网的形成。烟雾病是青年卒中的主要病因之一,但其发病机制尚未明确,可能与遗传、免疫、炎症等多种因素有关。作为烟雾病的主要易感基因,环指蛋白213(ring finger protein 213,RNF213)基因在疾病的进展和预后中起着关键作用。尽管目前的RNF213基因编辑动物模型未能完全模拟出烟雾病的典型病理改变,但现有研究揭示了RNF213在血管生成、炎症反应及免疫调节中的重要作用。RNF213基因突变影响内皮细胞和平滑肌细胞的功能,可能与烟雾病中的血管重构密切相关。此外,RNF213还参与包括抗感染反应在内的多种细胞生物学过程,这些过程可能与烟雾病的发病机制关联。综上所述:RNF213基因不仅在烟雾病的发生发展中发挥多重作用,也是未来治疗策略研究的关键靶点。本文旨在综述RNF213基因的多功能性及其在烟雾病发病机制中的作用,以期为深入理解该疾病提供新的视角。 展开更多
关键词 烟雾病 rnf213 基因多态性 发病机制
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抗病毒免疫调节因子RNF2蛋白的生物信息学分析及原核表达纯化
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作者 王琦 张俊梅 +7 位作者 朱文菊 谢环环 解晓曼 赵桂华 徐超 尹昆 孙航 董宏杰 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第10期1129-1135,共7页
目的RNF2是一种转录抑制因子,其N端保守的RING结构域使其能够发挥E3泛素连接酶的功能。本研究采用生物信息学工具对人源RNF2蛋白进行序列和结构分析,同时在大肠埃希菌表达系统中进行高效表达与纯化,为后续探索其生物学功能和潜在的药物... 目的RNF2是一种转录抑制因子,其N端保守的RING结构域使其能够发挥E3泛素连接酶的功能。本研究采用生物信息学工具对人源RNF2蛋白进行序列和结构分析,同时在大肠埃希菌表达系统中进行高效表达与纯化,为后续探索其生物学功能和潜在的药物靶点奠定基础。方法利用ClustalX、Expasy、TMHMM及SignalP等软件对RNF2进行多序列比对、理化性质分析、跨膜区、信号肽及疏水性分析。通过分子克隆构建pGEX-4T-RNF2重组质粒,随后转入大肠埃希菌BL21(DE3)中进行目的蛋白的诱导表达。收集菌体后通过高压破碎释放重组蛋白,进一步使用GST亲和层析柱纯化。结果RNF2全长共336个氨基酸,带负电,无跨膜区,无信号肽,属于亲水蛋白,且在不同物种中较为保守。成功构建了pGEX-4T-RNF2重组菌株,经IPTG诱导表达后,发现RNF2能够在BL21(DE3)中大量表达。GST层析柱纯化结果显示RNF2的挂柱效果较差,但仍能得到少量高纯度蛋白。结论使用大肠埃希菌原核表达系统成功获得性状较好的RNF2重组蛋白,为后续功能实验和药物开发奠定了基础。 展开更多
关键词 rnf2 泛素化 异源表达 GST亲和层析 重组蛋白
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长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响 被引量:3
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作者 姚羽 林敏杰 +1 位作者 金文芳 吕艳玲 《医学研究与战创伤救治》 CAS 北大核心 2024年第9期904-908,共5页
目的通过细胞实验探究长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测RNF157-AS1在肺腺癌细胞株(H1299、A549、PC9和Calu3)和正常肺上皮细胞(HBE)中的表达;构建小干扰RNA转染至肺腺... 目的通过细胞实验探究长链非编码RNA RNF157-AS1对肺腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测RNF157-AS1在肺腺癌细胞株(H1299、A549、PC9和Calu3)和正常肺上皮细胞(HBE)中的表达;构建小干扰RNA转染至肺腺癌细胞中敲降RNF157-AS1的表达,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证干扰效率;在筛选的两种肺腺癌细胞株中成功干扰RNF157-AS1后,分为对照组(NC组)及实验组(si1组,si2组),分别利用CCK8实验、Transwell迁移实验和Matrigel侵袭实验探究RNF157-AS1对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。结果相较于HBE,RNF157-AS1在4种肺腺癌细胞株中的表达显著上调(均P<0.01),将其中表达量最高H1299和PC9细胞株为后续试验细胞株;经qRT-PCR证实,2种小干扰RNA均能有效敲降RNF157-AS1的表达,干扰效率在70%以上(均P<0.01);CCK8实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1的表达后,细胞的增殖能力明显下降(均P<0.01);Transwell实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1的表达后,细胞的迁移能力明显下降(P<0.01);Matrigel实验表明,与对照组相比,干扰RNF157-AS1后,细胞的侵袭能力明显下降(均P<0.01)。结论RNF157-AS1在肺腺癌细胞中高表达,并且影响肺腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭能力。 展开更多
关键词 肺腺癌 长链非编码RNA rnf157-AS1 迁移 侵袭
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RNF213基因对急性髓系白血病THP-1细胞增殖及凋亡的影响 被引量:1
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作者 施晓琦 张平平 +4 位作者 官亚宁 杜作晨 陈艳 黄佩 何志旭 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1365-1371,共7页
目的:发掘RNF213基因与急性髓系白血病(AML)的关联,并探究RNF213对AML细胞系THP-1细胞增殖及凋亡的影响。方法:通过GEPIA数据库分析RNF213基因在AML中的表达与预后的关系。收集2017年1月至2022年1月于合肥医科大学附属医院就诊的AML患... 目的:发掘RNF213基因与急性髓系白血病(AML)的关联,并探究RNF213对AML细胞系THP-1细胞增殖及凋亡的影响。方法:通过GEPIA数据库分析RNF213基因在AML中的表达与预后的关系。收集2017年1月至2022年1月于合肥医科大学附属医院就诊的AML患者30例以及血液系统非肿瘤患者21例,采用RT-qPCR和Western blot法分别检测RNF213 mRNA及蛋白表达水平,Kaplan-Meier法对AML患者进行生存分析,同时检测AML细胞株(THP-1、OCI-AML_(2))中RNF213 mRNA及蛋白表达水平。采用CRISPR-Cas9技术敲减THP-1细胞中RNF213基因,流式细胞术检测细胞凋亡率,CCK-8和集落形成实验检测细胞增殖情况,Western blot检测凋亡相关蛋白Cleaved-Caspase 3的表达水平。结果:AML患者的RNF213基因表达水平明显高于对照组,且RNF213高表达患者的预后更差,THP-1细胞中RNF213蛋白表达水平也高于对照组。敲减THP-1细胞RNF213基因后,细胞增殖明显降低,细胞凋亡率及凋亡相关蛋白Cleaved-Caspase3的表达较对照组明显增加。结论:在AML患者中RNF213高表达,且高表达患者预后更差。RNF213基因影响AML细胞增殖及凋亡,可能是AML预后相关的标志物和潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 rnf213基因 急性髓系白血病 预后 增殖 凋亡
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高表达RNF7增强非小细胞肺癌细胞的PD-1耐药:基于活化NF-kB通路促进CXCL1表达和髓源性抑制细胞的募集 被引量:1
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作者 钟娜 王会杰 +2 位作者 赵文英 孙珍贵 耿彪 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1704-1711,共8页
目的探讨RNF7在非小细胞肺癌(NSCLC)中调控髓源性抑制细胞(MDSCs)的作用机制。方法采用TIMER2.0数据库和免疫组织化学染色分析(IHC)分析RNF7在NSCLC中表达水平。Kaplan-Meier曲线分析RNF7对肺癌患者预后的影响。通过TIMER2.0数据库和多... 目的探讨RNF7在非小细胞肺癌(NSCLC)中调控髓源性抑制细胞(MDSCs)的作用机制。方法采用TIMER2.0数据库和免疫组织化学染色分析(IHC)分析RNF7在NSCLC中表达水平。Kaplan-Meier曲线分析RNF7对肺癌患者预后的影响。通过TIMER2.0数据库和多重免疫荧光分析评估RNF7的表达与肿瘤免疫细胞浸润水平之间的相关性。通过C57BL/6小鼠建立皮下移植瘤模型,将RNF7过表达对照组(lenti-GFP,n=10)和RNF7过表达组(lenti-RNF7,n=10),RNF7敲低对照组(Ctrl,n=12)和RNF7敲低组(shRNF7,n=12)的CMT-167细胞分别种植到小鼠皮下,对于RNF7敲低对照组和RNF7敲低组的小鼠7 d后给予anti-PD-1治疗或同型IgG治疗,30 d后获取肿瘤组织,观察皮下瘤体积。通过IHC检测肿瘤组织中S100A8+A9、Gr-1的表达水平,流式细胞术检测肿瘤组织中MDSCs的浸润程度。基因集富集分析(GSEA)RNF7在非小细胞肺癌中可能的调控通路。Western blotting和荧光素酶检测RNF7对NF-κB信号通路的影响。ELISA和RT-qPCR观察趋化因子(C-X-C基序)配体1的表达情况。结果TCGA数据库分析显示RNF7在NSCLC中的表达水平显著上调,生存分析显示,肺癌患者中RNF7的表达水平越高,患者的预后越差(P<0.001),TIMER2.0数据库显示RNF7的表达与MDSCs的浸润程度呈正相关(P<0.001)。GESA分析提示,在NSCLC中,RNF7高表达富集于NF-κB信号通路。Western blotting实验显示,RNF7低表达能够抑制NF-κB信号通路激活。通过ELISA和RT-qPCR结果显示,敲除RNF7可显著降低CXCL1的转录和翻译(P<0.01)。小鼠皮下移植瘤实验显示,与对照组相比,过表达RNF7可增加MDSCs的浸润程度,敲除RNF7减少MDSCs的浸润程度(P<0.001)。并减轻MDSCs对效应细胞的免疫抑制功能,从而增强了抗PD-1的功效。结论RNF7通过激活NF-κB信号通路,促进CXCL1的表达,从而使MDSCs趋化募集,使肿瘤产生抗PD-1耐药。 展开更多
关键词 rnf7 非小细胞肺癌 NF-ΚB通路 MDSCS 抗PD-1治疗
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