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水稻条纹病毒RNA4基因间隔区的分子变异 被引量:9
1
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期144-149,共6页
应用反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)和单链构象多态性 (single strandconformationpolymorphism ,SSCP)技术快速检测我国水稻条纹病毒 (RSV)RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)的分子变异 ,结果表明 ,我国RSVRNA4IR存在分子变异... 应用反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)和单链构象多态性 (single strandconformationpolymorphism ,SSCP)技术快速检测我国水稻条纹病毒 (RSV)RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)的分子变异 ,结果表明 ,我国RSVRNA4IR存在分子变异。供试的 7个分离物共有 4种泳动带型 ,其中YL、BS、JD、LY分离物完全一致 ,而SQ、PJ、JN各不相同。序列测定证实了PCR SSCP结果。各分离物RNA4IR序列均由 6 5 4个核苷酸组成 ,其中YL、BS、YL及JD 4个分离物序列完全一致 ;JN、PJ、SQ 3个分离物各不一样 ,序列之间的同源性均在 92 %~ 94%之间。IR序列内部具有两个重要的结构特征 :(1)有两处反向重复序列 ,可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大 ;(2 )具有插入序列 ,相对于日本M分离物 ,我国 7个分离物都有一段长 19bp的插入序列 ,这段插入序列比较保守 ,各分离物之间仅有 1~ 2个碱基的差异。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因间隔区 PCR-SSCP 序列分析
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水稻条纹病毒RNA4基因间隔区序列分析——混合侵染及基因组变异证据 被引量:7
2
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期577-585,共9页
克隆和测定了我国水稻条纹病毒 (RSV) 2 2个分离物RNA4基因间隔区 (Intergenicre gion,IR)序列 ,序列比较结果表明 ,我国RSVRNA4IR在长度上存在 63 4bp、65 4bp及 73 2bp 3种不同的类型 ,其中 3种不同类型的序列在云南省均有存在 ,而在... 克隆和测定了我国水稻条纹病毒 (RSV) 2 2个分离物RNA4基因间隔区 (Intergenicre gion,IR)序列 ,序列比较结果表明 ,我国RSVRNA4IR在长度上存在 63 4bp、65 4bp及 73 2bp 3种不同的类型 ,其中 3种不同类型的序列在云南省均有存在 ,而在其它省份仅存在 65 4bp类型的序列 ,云南省还存在不同片段类型序列在同一分离物中混合侵染的现象。序列内部具有两个重要的结构特征 ,一是具有插入序列 ;二是有两处反向重复序列 ,可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大。本论文还讨论了插入片段特性。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因 间隔区 序列分析 混合侵染 基因组变异
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甜菜坏死黄脉病毒RNA4 cDNA克隆、序列分析及其编码蛋白基因在大肠杆菌中的表达 被引量:5
3
作者 于嘉林 韩成贵 +2 位作者 杨莉莉 李大伟 刘仪 《微生物学报》 CSCD 北大核心 1997年第1期7-14,共8页
以甜菜坏死黄脉病毒(Beet Necrotic Yellow Vein Virus,简称BNYVV)内蒙分离物(NM)RNA为模板,通过反转录和PCR扩增得到了BNYVV RNA4基因组的cDNA克隆pGBF6。序列分析结果表明,pGBF6含有全长RNA4 cDNA插入片段,大小为1465个核苷酸,含有一... 以甜菜坏死黄脉病毒(Beet Necrotic Yellow Vein Virus,简称BNYVV)内蒙分离物(NM)RNA为模板,通过反转录和PCR扩增得到了BNYVV RNA4基因组的cDNA克隆pGBF6。序列分析结果表明,pGBF6含有全长RNA4 cDNA插入片段,大小为1465个核苷酸,含有一个849个核苷酸的开放阅读框架,编码产生由282个氨基酸组成的分子量为31kDa的蛋白。与法国F2分离物RNA4相比,其核苷酸序列和由此推导的氨基酸序列同源性分别为97.1%和96.4%,并在5'端非编码区比F2分离物缺失了3个核苷酸。将RNA4编码区cDNA克隆到原核表达载体pFLAG·MAC上,获得融合蛋白表达质粒pFMBF87。所构建的融合蛋白由载体序列编码的14个氨基酸和31kDa蛋白C端的233个氨基酸组成。经IPTG诱导,Westem blotting分析表明,该融合蛋白在大肠杆菌中得到高效表达。本文还对内蒙分离物的株系划分进行了讨论。 展开更多
关键词 甜菜 坏死黄脉病毒 rna4 CDNA 克隆 序列分析
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水稻条纹病毒两个分离物RNA4基因间隔区的序列比较 被引量:4
4
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《中国病毒学》 CSCD 2000年第2期156-162,共7页
通过RT PCR扩增了我国水稻条纹病毒 (RSV)山东济宁 (JN)、云南宜良 (YL)两个分离物RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)序列 ,并克隆于 pGEM Teasy载体上。序列分析结果表明 :JN、YL两分离物RNA4IR均由 6 5 4个核苷酸组成 ,两者之间... 通过RT PCR扩增了我国水稻条纹病毒 (RSV)山东济宁 (JN)、云南宜良 (YL)两个分离物RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)序列 ,并克隆于 pGEM Teasy载体上。序列分析结果表明 :JN、YL两分离物RNA4IR均由 6 5 4个核苷酸组成 ,两者之间的同源率为 92 %。JN、YL两个分离物RNA4IR在AU碱基富集处可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个由于碱基变异导致所形成的发夹结构的稳定性在各个分离物中差异较大。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因间隔区 序列
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鸡流感病毒H9N2亚型毒株RNA4节段基因序列测定及分析
5
作者 王占菊 温迎春 黄芳 《医学动物防制》 2001年第1期20-22,共3页
目的 弄清新分离到的鸡H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸全序列及它与禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)之间的内在关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸... 目的 弄清新分离到的鸡H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸全序列及它与禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)之间的内在关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 香港鸡流感病毒(ckHK997)禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)的H9N2亚型RNA4节段长度分别是1951和1683个核苷酸,编码血凝素(HA)蛋白。与禽H9N2代表株的同源性在89.0%。结论 新分离到的鸡H9N2亚型毒株与代表株的同源性差异较大。 展开更多
关键词 流感病毒H9N2亚型 rna4 序列分析
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甜菜坏死黄脉病毒RNA4的菌传功能分析 被引量:4
6
作者 韩成贵 李大伟 +4 位作者 王东勇 杨莉莉 于嘉林 蔡祝南 刘仪 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第10期772-774,共3页
构建了甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA4全长核苷酸序列以及5种编码区突变体的侵染性cDNA克隆.不同结构的RNA4体外转录物与只含有RNA1,2和3的BNYVV分离物总RNAs混合后分别接种寄主植物番杏(Tetragonia expansa)作为毒源,繁殖后接种甜菜... 构建了甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA4全长核苷酸序列以及5种编码区突变体的侵染性cDNA克隆.不同结构的RNA4体外转录物与只含有RNA1,2和3的BNYVV分离物总RNAs混合后分别接种寄主植物番杏(Tetragonia expansa)作为毒源,繁殖后接种甜菜,利用无毒甜菜多黏菌(Polymyxa betae)进行传毒实验.结果表明,RNA4编码区内各种缺失突变均能显著地抑制多黏菌的传播,但插入4个碱基的移码突变体对传毒没有影响,说明BNYVV RNA4中的部分核苷酸序列对于被真菌介体高效传播是必需的,并且可能是在RNA水平上具有功能. 展开更多
关键词 甜菜坏死黄脉病毒 rna4 BNYVV RNA突变 功能分析 介体传毒 多黏菌 核苷酸序列分析
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Functional analysis of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) RNA4 in fungal transmission 被引量:2
7
作者 HAN Chenggui LI Dawei +4 位作者 WANG Dongyong YANG Lili YU Jialin CAI Zhunan LIU Yi 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第15期1281-1284,共4页
Full-length RNA4 of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) and its mutants, including a frame-shift and deletions within the coding region, were inserted into a transcription plasmid. Transcripts derived from these p... Full-length RNA4 of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) and its mutants, including a frame-shift and deletions within the coding region, were inserted into a transcription plasmid. Transcripts derived from these plasmids and RNAs extracted from a BNYVV isolate containing only RNAs 1, 2 and 3 were coinoculated to Tetragona expansa. Then these recombinant isolates were inoculated to sugar beet plants grown in a sand culture system containing Po-lymyxa betae that had been freed of virus particles to test efficiency of BNYVV transmission. The result showed that the efficiency of BNYVV transmission among the plants by Polymyxa betae was highly decreased by different deletions in the coding region of RNA4, but not affected by the frame-shift mutant with four nucleotides insertion. The observations suggest that at least some of the RNA4 sequence encompassing the deleted region of 580 nucleotide acids (525 -1105 nt) are necessary for high efficient transmission of the virus by the fungus. 展开更多
关键词 BNYVV MUTATION of rna4 FUNCTIONAL analysis trans-mission by Polymyxa betae.
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lncRNA DHRS4-AS1调节miR-221-3p/SOCS3信号轴对甲状腺癌细胞增殖、侵袭、迁移及凋亡的影响
8
作者 王辉 郭宇 +3 位作者 张培培 杨皓宇 田春桃 金明明 《细胞与分子免疫学杂志》 北大核心 2025年第9期798-805,共8页
目的探究长链非编码RNA DHRS4-AS1(lncRNA DHRS4-AS1)调节微小RNA-221-3p(miR-221-3p)/细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3)信号轴对甲状腺癌(TC)细胞增殖、侵袭、迁移及凋亡的影响。方法采用实时定量PCR检测TC细胞系中lncRNA DHRS4-AS1、... 目的探究长链非编码RNA DHRS4-AS1(lncRNA DHRS4-AS1)调节微小RNA-221-3p(miR-221-3p)/细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3)信号轴对甲状腺癌(TC)细胞增殖、侵袭、迁移及凋亡的影响。方法采用实时定量PCR检测TC细胞系中lncRNA DHRS4-AS1、miR-221-3p和SOCS3 mRNA的表达,筛选出最佳细胞系用于后续实验;将FTC-133细胞分为Control组、pcDNA-NC组、DHRS4-AS1组、DHRS4-AS1联合agomir-NC组和DHRS4-AS1联合miR-221-3p-agomir组。采用实时定量PCR检测转染效率;双荧光素酶报告基因法验证lncRNA DHRS4-AS1、SOCS3和miR-221-3p的靶向关系;采用Western blot法检测SOCS3在FTC-133细胞中的表达;EdU法检测细胞增殖情况;流式细胞术检测FTC-133细胞凋亡情况;通过划痕实验检测FTC-133细胞迁移情况;Transwell^(TM)小室检测FTC-133细胞侵袭情况;通过裸鼠移植瘤实验观察lncRNA DHRS4-AS1对TC移植瘤生长的影响。结果本研究利用双荧光素酶报告基因法验证,结果显示lncRNA DHRS4-AS1、miR-221-3p、SOCS3三者之间具有靶向关系;lncRNA DHRS4-AS1和SOCS3在FTC-133细胞中表达下调、miR-221-3p表达上调;过表达lncRNA DHRS4-AS1可以抑制FTC-133细胞的增殖、侵袭和迁移,诱导凋亡;miR-221-3p过表达可逆转过表达lncRNA DHRS4-AS1对FTC-133细胞的增殖、侵袭和迁移的抑制作用,并抑制FTC-133细胞凋亡;裸鼠移植瘤实验观察到,过表达lncRNA DHRS4-AS1使裸鼠瘤组织质量降低和体积减小,同时miR-221-3p表达量下降,SOCS3表达量升高。结论lncRNA DHRS4-AS1在FTC-133细胞中低表达,过表达lncRNA DHRS4-AS1可以通过调节miR-221-3p/SOCS3信号轴,从而抑制TC细胞的增殖、侵袭和迁移,诱导凋亡。 展开更多
关键词 长链非编码RNA DHRS4-AS1 微小RNA-221-3p 细胞因子信号传导抑制因子3(SOCS3) 甲状腺癌(TC) 增殖 侵袭 迁移
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结肠癌合并2型糖尿病患者血清lncRNA ANRIL、miR-181b-5p的表达及其与淋巴结转移的相关性
9
作者 潘勇娜 康金旺 常月锋 《实用临床医药杂志》 2025年第2期32-37,共6页
目的探讨结肠癌合并2型糖尿病(T2DM)患者血清长链非编码RNA INK4基因座中反义非编码RNA(lncRNA ANRIL)、微小RNA-181b-5p(miR-181b-5p)的表达及其与淋巴结转移的相关性。方法选取2019年5月—2022年8月本院收治的117例结肠癌合并T2DM患... 目的探讨结肠癌合并2型糖尿病(T2DM)患者血清长链非编码RNA INK4基因座中反义非编码RNA(lncRNA ANRIL)、微小RNA-181b-5p(miR-181b-5p)的表达及其与淋巴结转移的相关性。方法选取2019年5月—2022年8月本院收治的117例结肠癌合并T2DM患者为结肠癌合并T2DM组,并根据患者淋巴结转移情况将其分为淋巴结转移组56例和淋巴结未转移组61例。另选取同期体检的健康志愿者117例为对照组。采用反转录实时定量PCR检测血清lncRNA ANRIL、miR-181b-5p的相对表达水平。采用Logistic回归分析探讨影响结肠癌合并T2DM患者淋巴结转移的因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA ANRIL、miR-181b-5p水平对结肠癌合并T2DM患者淋巴结转移的诊断价值。采用Pearson相关分析探讨结肠癌合并T2DM患者血清lncRNA ANRIL与miR-181b-5p表达的相关性。结果与对照组比较,结肠癌合并T2DM组患者血清lncRNA ANRIL水平升高,miR-181b-5p水平降低,差异均有统计学意义(P<0.01)。与淋巴结未转移组比较,淋巴结转移组患者血清lncRNA ANRIL水平升高,miR-181b-5p水平降低,差异均有统计学意义(P<0.01)。淋巴结转移组与淋巴结未转移组患者TNM分期、分化程度以及糖化血红蛋白(HbA1C)比较,差异有统计学意义(P<0.05)。糖尿病史、TNM分期、分化程度、HbA1C以及lncRNA ANRIL均是淋巴结转移的影响因素(P<0.05),miR-181b-5p是影响淋巴结转移的保护因素(P<0.05)。血清lncRNA ANRIL与miR-181b-5p水平呈负相关(r=-0.440,P<0.001)。ROC曲线结果显示,血清lncRNA ANRIL、miR-181b-5p以及二者联合诊断淋巴结转移的曲线下面积(AUC)分别为0.800、0.837、0.930,联合诊断价值显著高于lncRNA ANRIL(Z=2.956,P=0.003)、miR-181b-5p(Z=2.117,P=0.034)单独诊断价值。结论结肠癌合并T2DM患者血清lncRNA ANRIL水平升高,miR-181b-5p水平降低,且二者与淋巴结转移具有一定相关性。 展开更多
关键词 结肠癌 2型糖尿病 长链非编码RNA INK4基因座中反义非编码RNA 微小RNA-181b-5p
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血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平与AIS患者脑梗死体积和神经功能缺损程度的关系
10
作者 朱云飞 袁川 +4 位作者 何绍坤 苏松 杨云川 孙碧文 高锋 《国际检验医学杂志》 2025年第12期1437-1443,共7页
目的探讨急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清环状RNA蛋白酪氨酸磷酸酶4A2(circ_PTP4A2)、环状RNA姐妹染色单体早期成熟分离蛋白5同源物B(circ_PDS5B)水平与脑梗死体积和神经功能缺损程度的关系。方法选取2021年1月至2023年12月在该院就诊的... 目的探讨急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清环状RNA蛋白酪氨酸磷酸酶4A2(circ_PTP4A2)、环状RNA姐妹染色单体早期成熟分离蛋白5同源物B(circ_PDS5B)水平与脑梗死体积和神经功能缺损程度的关系。方法选取2021年1月至2023年12月在该院就诊的AIS患者90例作为AIS组,同期90例体检健康者作为对照组。采用实时荧光定量PCR检测血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平,磁共振扩散张量成像测量脑梗死体积,美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分评估神经功能缺损程度。根据脑梗死体积分为大体积组(脑梗死体积≥20 cm^(3),29例)、中体积组(1 cm^(3)<脑梗死体积<20 cm^(3),34例)、小体积组(脑梗死体积≤1 cm^(3),27例),根据NIHSS评分将AIS患者分为重度组(NIHSS评分≥21分,27例)、中度组(NIHSS评分5~20分,32例)、轻度组(NIHSS评分≤4分,31例)。通过有序多分类Logistic回归分析AIS患者脑梗死体积增大和神经功能缺损程度加重的影响因素。结果与对照组比较,AIS组血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平升高(P<0.05)。小体积组、中体积组、大体积组血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平依次升高(P<0.05)。轻度组、中度组、重度组血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平依次升高(P<0.05)。有序多分类Logistic回归分析显示,NIHSS评分高、circ_PTP4A2高、circ_PDS5B高为AIS患者脑梗死体积增大的独立危险因素(P<0.05),脑梗死体积大、circ_PTP4A2高、circ_PDS5B高为AIS患者神经功能缺损程度加重的独立危险因素(P<0.05)。结论AIS患者血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平升高与脑梗死体积增加和神经功能缺损程度加重有关,早期检测血清circ_PTP4A2、circ_PDS5B水平有助于AIS患者的风险分层。 展开更多
关键词 急性缺血性脑卒中 环状RNA蛋白酪氨酸磷酸酶4A2 环状RNA姐妹染色单体早期成熟分离蛋白5同源物B 脑梗死体积 神经功能缺损程度
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lncRNA SNHG4 enhanced gastric cancer progression by modulating miR-409-3p/CREB1 axis 被引量:1
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作者 ZHOUYANG CHENG YUCHEN HUA +1 位作者 YANG CAO JUN QIN 《Oncology Research》 SCIE 2025年第1期185-198,共14页
Objective:Gastric cancer(GC)is a globally common cancer characterized by high incidence and mortality worldwide.Advances in the molecular understanding of GC provide promising targets for GC diagnosis and therapy.Long... Objective:Gastric cancer(GC)is a globally common cancer characterized by high incidence and mortality worldwide.Advances in the molecular understanding of GC provide promising targets for GC diagnosis and therapy.Long non-coding RNAs(lncRNAs)and their downstream regulators are regarded to be implicated in the progression of multiple types of malignancies.Studies have shown that the lncRNA small nucleolar RNA host gene 4(SNHG4)serves as a tumor promoter in various malignancies,while its function in GC has yet to be characterized.Therefore,our study aimed to explore the role and underlying mechanism of SNHG4 in GC.Methods:We used qRT-PCR to analyze SNHG4 expression in GC tissues and cells.Kaplan-Meier analysis was used to assess the correlation between SNHG4 expression and the survival rate of GC patients.Cellular function experiments such as CCK-8,BrdU,colony formation,flow cytometry analysis,and transwell were performed to explore the effects of SNHG4 on GC cell proliferation,apoptosis,cell cycle,migration,and invasion.We also established xenograft mouse models to explore the effect of SNHG4 on GC tumor growth.Mechanically,dual luciferase reporter assay was used to verify the interaction between SNHG4 and miR-409-3p and between miR-409-3p and cAMP responsive element binding protein 1(CREB1).Results:The results indicated that SNHG4 was overexpressed in GC tissues and cell lines,and was linked with poor survival rate of GC patients.SNHG4 promoted GC cell proliferation,migration,and invasion while inhibiting cell apoptosis and cell cycle arrest in vitro.The in vivo experiment indicated that SNHG4 facilitated GC tumor growth.Furthermore,SNHG4 was demonstrated to bind to miR-409-3p.Moreover,CREB1 was directly targeted by miR-409-3p.Rescue assays demonstrated that miR-409-3p deficiency reversed the suppressive impact of SNHG4 knockdown on GC cell malignancy.Additionally,miR-409-3p was also revealed to inhibit GC cell proliferation,migration,and invasion by targeting CREB1.Conclusion:In conclusion,we verified that the SNHG4 promoted GC growth and metastasis by binding to miR-409-3p to upregulate CREB1,which may deepen the understanding of the underlying mechanism in GC development. 展开更多
关键词 Gastric cancer Small nucleolar RNA host gene 4(SNHG4) MicroRNA-409-3p(miR-409-3p) cAMP responsive element binding protein 1(CREB1)
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益气解毒方下调ANRIL抑制鼻咽癌细胞增殖、迁移与侵袭
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作者 许红淼 周芳亮 +5 位作者 何兰 左涵蓉 邹芳 唐乐 江志超 何迎春 《中国中西医结合杂志》 北大核心 2025年第11期1386-1392,共7页
目的研究益气解毒方(YQJDF)是否通过下调INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)干预鼻咽癌细胞的生物学效应。方法运用慢病毒转染技术构建ANRIL过表达和敲低的鼻咽癌稳定转染细胞株,再采用0.5 g/L YQJDF干预,将细胞分为过表达ANRIL(oe-ANRIL... 目的研究益气解毒方(YQJDF)是否通过下调INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)干预鼻咽癌细胞的生物学效应。方法运用慢病毒转染技术构建ANRIL过表达和敲低的鼻咽癌稳定转染细胞株,再采用0.5 g/L YQJDF干预,将细胞分为过表达ANRIL(oe-ANRIL)+YQJDF组、过表达空载体(oe-NC)+YQJDF组、干扰ANRIL(sh-ANRIL)+YQJDF组、干扰空载体(sh-NC)+YQJDF组,每组设3个重复。实时细胞分析技术(RTCA)检测细胞增殖能力,划痕实验检测细胞迁移能力,Matrigel侵袭小室法检测细胞侵袭能力RT-PCR检测ANRIL的表达水平。结果RTCA检测显示,与空载体(oe-NC)组比较,oe-ANRIL组细胞的增殖速度增高(P<0.01),相对增殖率提高35%。划痕与侵袭实验进一步证实,oe-ANRIL细胞迁移和侵袭能力增强(P<0.01)。与oe-NC+YQJDF组比较,过表达ANRIL后,益气解毒方抑制细胞增殖、迁移和侵袭的效应均降低(P<0.05);沉默ANRIL后,YQJDF抑制细胞增殖、迁移效应均增强(P<0.05)。结论ANRIL促进鼻咽癌细胞的增殖、迁移与侵袭,YQJDF通过靶向抑制ANRIL的表达发挥抗鼻咽癌的作用。 展开更多
关键词 益气解毒方 鼻咽癌 INK4基因座中反义非编码RNA 侵袭 迁移 中药复方 中西医结合
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rAAV介导的HIF-1α—RNAi载体的构建 被引量:3
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作者 陈传贵 陈剑秋 +1 位作者 孙晋津 王丰 《世界肿瘤杂志》 2006年第2期83-85,94,共4页
目的构建以rAAV为载体、GFP为报告基因和HIF-1α为靶基因的RNA干扰。方法提取人基因组DNA,PCR扩增人H1启动子,插入载体质粒pAAV-hrGFP的CMV启动子前方Mlu Ⅰ单克隆位点,构建成pH1—hrGFP;根据HIF-1α的有效干扰位点,合成两条分别为... 目的构建以rAAV为载体、GFP为报告基因和HIF-1α为靶基因的RNA干扰。方法提取人基因组DNA,PCR扩增人H1启动子,插入载体质粒pAAV-hrGFP的CMV启动子前方Mlu Ⅰ单克隆位点,构建成pH1—hrGFP;根据HIF-1α的有效干扰位点,合成两条分别为58bp互补的寡核苷酸链,通过体外退火形成双链,然后插入pH1-hrGFP的H1启动子尾部Xba Ⅰ和MunⅠ位点,构建成pH1—siRNA;将载体质粒pH1-siRNA和辅助质粒pRC、pHelper共转染HEK293细胞,反复冻溶后收集上清,浓缩纯化,电镜观察病毒形态和ELISA法测定病毒滴度。结果构建的pH1-hrGFP质粒,通过酶切、PCR检测以及测序鉴定均正确;构建的pH1—siRNA,通过酶切及测序鉴定也正确;包装的rAAV经电镜检测形态正常,滴度达1.2×10^12 v.p/mL。结论成功构建了rAAV介导的HIF-1α—RNAi表达载体,为今后的体内外试验奠定了基础。 展开更多
关键词 重组腺相关病毒 缺氧诱导因子 小干扰rna4
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细菌性脑膜炎患者血清lncRNA DDIT4-AS1,lncRNA RSPH9-4表达水平及诊断价值研究
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作者 傅长虹 陈雪儿 +1 位作者 向冬梅 黄月 《现代检验医学杂志》 2025年第5期62-66,共5页
目的探究细菌性脑膜炎患者血清长链非编码RNA(lncRNA)DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)反义RNA1(DDIT4-AS1),长链非编码RNA(lncRNA)径向辐头蛋白9同源物-4(RSPH9-4)表达水平及诊断价值分析。方法选取2022年5月~2024年5月德阳第五医院确诊细... 目的探究细菌性脑膜炎患者血清长链非编码RNA(lncRNA)DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)反义RNA1(DDIT4-AS1),长链非编码RNA(lncRNA)径向辐头蛋白9同源物-4(RSPH9-4)表达水平及诊断价值分析。方法选取2022年5月~2024年5月德阳第五医院确诊细菌性脑膜炎的患者94例作为细菌性脑膜炎组,根据其中枢神经系统受损的严重程度进一步划分为轻症组(n=63)和重症组(n=31);选取入院时疑似脑膜炎,但检查后排除脑膜炎的患者94例为非细菌性脑膜炎组;另选取体检健康志愿者94例为对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法对所有人员血清样本中lncRNA DDIT4-AS1,lncRNARSPH9-4表达水平进行检测;Spearman相关分析血清lncRNADDIT4-AS1,lncRNARSPH9-4水平与细菌性脑膜炎病情程度的相关性;多因素Logistic分析患细菌性脑膜炎的影响因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA DDIT4-AS1,lncRNA RSPH9-4水平对细菌性脑膜炎的诊断价值。结果与对照组相比,非细菌性脑膜炎组和细菌性脑膜炎组患者血清lncRNA DDIT4-AS1(1.35±0.27,1.67±0.35 vs 1.01±0.18)和lncRNA RSPH9-4(1.30±0.25,1.56±0.32 vs 1.00±0.19)表达水平升高(t=10.159,16.259;9.263,14.589);且与非细菌性脑膜炎组相比,细菌性脑膜炎组患者血清lncRNA DDIT4-AS1和lncRNA RSPH9-4表达水平升高(t=7.019,6.208),差异具有统计学意义(均P<0.05)。与轻症组相比,重症组患者血清lncRNADDIT4-AS1(1.88±0.38 vs 1.56±0.31)和lncRNARSPH9-4(1.79±0.35 vs 1.45±0.28)表达水平升高,差异具有统计学意义(t=4.361,5.088,均P<0.05);Spearman相关性分析结果表明血清lncRNA DDIT4-AS1,lncRNARSPH9-4水平与细菌性脑膜炎病情程度呈正相关(r=0.524,0.548,均P<0.05);细菌性脑膜炎患者血清降钙素原(PCT)、乳酸脱氢酶(LDH)和C反应蛋白(CRP)表达水平较非细菌性脑膜炎组患者升高,差异具有统计学意义(t=7.459,4.234,8.565,均P<0.05)。多因素Logistic分析结果PCT,LDH,CRP,lncRNA DDIT4-AS1和lncRNA RSPH9-4是患细菌性脑膜炎的影响因素(Waldχ^(2)=4.768~12.035,均P<0.05);受试者工作特征(ROC)曲线结果显示血清lncRNA DDIT4-AS1,lncRNARSPH9-4水平联合诊断细菌性脑膜炎曲线下面积(AUC)显著大于lncRNADDIT4-AS1,lncRNARSPH9-4单独诊断,差异具有统计学意义(Z=2.426,2.545,均P<0.05)。结论细菌性脑膜炎患者血清lncRNA DDIT4-AS1,lncRNA RSPH9-4表达水平升高,二者联合具有较高的疾病诊断价值。 展开更多
关键词 细菌性脑膜炎 长链非编码RNADNA损伤诱导转录因子4反义RNA1 长链非编码RNA径向辐头蛋白9同源物-4
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胆管癌患者血清circRNAMBOAT2,circRNAACTN4水平表达与临床病理特征及预后的关系研究
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作者 李红磊 谢亚玎 +2 位作者 伍杰 谭诚 张会娟 《现代检验医学杂志》 2025年第5期35-39,共5页
目的探究胆管癌患者血清环状RNA膜结合O-酰基转移酶2(circRNA MBOAT2)和环状RNA辅肌动蛋白α4(circRNAACTN4)的表达变化及其与预后的关系。方法选择2021年1月~2024年1月在邯郸市第一医院诊治的96例胆管癌患者作为胆管癌组,另选85例胆管... 目的探究胆管癌患者血清环状RNA膜结合O-酰基转移酶2(circRNA MBOAT2)和环状RNA辅肌动蛋白α4(circRNAACTN4)的表达变化及其与预后的关系。方法选择2021年1月~2024年1月在邯郸市第一医院诊治的96例胆管癌患者作为胆管癌组,另选85例胆管内结石患者和90例健康志愿者分别作为结石组和对照组。定量实时反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清circRNAMBOAT2,circRNAACTN4水平,分析circRNAMBOAT2,circRNAACTN4与临床病理特征的关系;Pearson分析胆管癌患者circRNAMBOAT2,circRNAACTN4的相关性;ROC分析circRNAMBOAT2,circRNAACTN4对胆管癌发生的诊断价值;COX分析胆管癌患者预后不良的影响因素;Kaplan-Meier生存曲线法进行生存分析。结果胆管癌组血清circRNA MBOAT2(1.24±0.38),circRNAACTN4(1.27±0.42)高于结石组(1.02±0.31,1.05±0.34)和对照组(0.83±0.24,0.78±0.21),结石组高于对照组,差异具有统计学意义(t=5.016~14.025,均P<0.05)。胆管癌组患者circRNA MBOAT2与circRNAACTN4呈正相关(r=0.428,P<0.05);circRNA MBOAT2,circRNAACTN4联合诊断胆管癌发生优于单独诊断(Z=4.063,4.004,均P<0.05);circRNA MBOAT2,circRNAACTN4与临床分期、淋巴结状态相关(t=5.091~5.984,均P<0.05);淋巴结状态阳性、circRNA MBOAT2,circRNAACTN4升高为患者死亡的独立危险因素(HR=1.527,1.582,1.727,均P<0.05)。高表达circRNA MBOAT2(23.40%),circRNAACTN4(24.00%)的患者累积生存率均低于低表达(46.94%,47.83%)患者,差异具有统计学意义(χ^(2)=5.809,5.946,均P<0.05)。结论circRNA MBOAT2,circRNAACTN4水平随着疾病进展升高,联合检测对诊断胆管癌发生具有一定价值,是患者死亡的独立危险因素。 展开更多
关键词 胆管癌 环状RNA膜结合O-酰基转移酶2 环状RNA辅肌动蛋白α4 诊断价值 病理特征
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INK4基因座中反义非编码RNA对乳腺癌细胞增殖能力及顺铂敏感性的影响
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作者 韩一菲 张芳芳 +4 位作者 王靖楠 邹炎 应莉 谢依天 李娜 《新乡医学院学报》 2025年第2期93-98,106,共7页
目的探讨INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)对乳腺癌细胞增殖能力及顺铂敏感性的影响及其作用机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测乳腺癌组织标本及配对的癌旁组织、人乳腺癌细胞株MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3以及... 目的探讨INK4基因座中反义非编码RNA(ANRIL)对乳腺癌细胞增殖能力及顺铂敏感性的影响及其作用机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测乳腺癌组织标本及配对的癌旁组织、人乳腺癌细胞株MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3以及人正常乳腺上皮细胞株MCF-10A中ANRIL的表达;将对数生长期的MDA-MB-231细胞随机分为si-NC组(转染对照的空载siRNA)、si-ANRIL组(转染ANRIL干扰片段)、si-ANRIL-anti-NC组(共转染ANRIL的干扰片段和miR-7-5p的空载体)、si-ANRIL-anti-miR-7-5p组(转染ANRIL的干扰片段和miR-7-5p的干扰片段)、miR-NC组(转染对照miRNA的空载体)、miR-7-5p mimic组(转染miR-7-5p的过表达载体)、miR-7-5p+ANRIL-WT转染组(共转染miR-7-5p mimics和ANRIL-WT)、miR-NC+ANRIL-WT转染组(共转染mimics Control和ANRIL-WT)、miR-7-5p+ANRIL-MUT转染组(共转染miR-7-5p mimics和ANRIL-MUT)和miR-NC+ANRIL-WUT转染组(共转染mimics Control和ANRIL-MUT)。采用细胞计数试剂盒-8法检测乳腺癌细胞的体外增殖能力,克隆形成实验检测细胞对顺铂的敏感性,双荧光素酶报告实验和RNA免疫沉淀(RIP)实验检测ANRIL和miR-7-5p的靶向结合关系。结果乳腺癌组织中ANRIL mRNA相对表达量显著高于癌旁组织(P<0.05);MDA-MB-231、MCF-7和SKBR3细胞中ANRIL mRNA的相对表达量显著高于正常乳腺上皮细胞(P<0.05);MDA-MB-231细胞中ANRIL mRNA的表达量显著高于MCF-7和SKBR3细胞(P<0.05)。培养24、48、72 h时,si-ANRIL组细胞存活率显著低于si-NC组(P<0.05)。与si-NC组相比,si-ANRIL组细胞克隆形成数目显著降低(P<0.05)。与miR-NC+ANRIL-WT转染组相比,miR-7-5p+ANRIL-WT转染组细胞荧光素酶活性显著降低(P<0.05);miR-NC+ANRIL-MUT转染组与miR-7-5p+ANRIL-MUT转染组细胞荧光素酶活性比较差异无统计学意义(P>0.05)。miR-7-5p mimic组细胞中ANRIL富集量显著高于miR-NC组(P<0.05)。在培养24、48、72 h时,si-ANRIL-anti-miR-7-5p组MDA-MB-231细胞存活率显著高于si-ANRIL-anti-NC组(P<0.05)。si-ANRIL-anti-miR-7-5p组MDA-MB-231细胞克隆形成数目显著高于si-ANRIL-anti-NC组(P<0.05)。与si-ANRIL-anti-NC组相比,si-ANRIL-anti-miR-7-5p组的MDA-MB-231细胞对顺铂的敏感性降低了4.04倍。结论ANRIL在乳腺癌组织和乳腺癌细胞中呈高表达,并通过下调miR-7-5p的表达来促进乳腺癌细胞的增殖,降低乳腺癌细胞对顺铂的敏感性。 展开更多
关键词 INK4基因座中反义非编码RNA 微RNA-7-5p 乳腺癌 生物学行为 顺铂敏感性
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lnc-Eif4a2/miR-142a-5p/Vmp1通路抵抗缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤的机制研究
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作者 黄正义 刘淑云 赵增霞 《中国实验诊断学》 2025年第4期449-455,共7页
目的研究长链非编码RNA真核翻译起始因子4A2(lnc-Eif4a2)、微小RNA 142a-5p(miR-142a-5p)以及液泡膜蛋白1(Vmp1)在缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤中的作用及其调控关系。方法建立缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤模型,采用实时荧光定量... 目的研究长链非编码RNA真核翻译起始因子4A2(lnc-Eif4a2)、微小RNA 142a-5p(miR-142a-5p)以及液泡膜蛋白1(Vmp1)在缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤中的作用及其调控关系。方法建立缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤模型,采用实时荧光定量PCR检测lnc-Eif4a2、miR-142a-5p以及Vmp1 mRNA表达。实验设为nc组(转染对照载体)、lnc-Eif4a2组(转染lnc-Eif4a2载体)、miR-142a-5p组(转染miR-142a-5p模拟物)以及Vmp1组(转染Vmp1载体)。采用流式细胞术检测各组细胞凋亡率,CCK-8法检测各组细胞存活率,ELISA法检测各组促炎因子(TNF-α、IL-1β及IL-6)和抗炎因子IL-10表达,试剂盒检测各组丙二醛(MDA)和乳酸脱氢酶(LDH)水平以及超氧化物歧化酶(SOD)活性。采用双荧光素酶报告基因试验和蛋白质印迹验证lnc-Eif4a2/miR-142a-5p/Vmp1通路。结果与正常细胞相比,模型细胞中lnc-Eif4a2和Vmp1 mRNA表达降低,而miR-142a-5p表达升高。与nc组相比,lnc-Eif4a2和Vmp1组细胞凋亡率减少,细胞存活率增加,TNF-α、IL-1β、IL-6浓度降低,IL-10浓度升高,MDA和LDH水平降低,SOD活性升高。与nc组相比,miR-142a-5p组细胞凋亡率增加,细胞存活率减少,TNF-α、IL-1β、IL-6浓度升高,IL-10浓度降低,MDA和LDH水平升高,SOD活性降低。Vmp1是miR-142a-5p靶基因,lnc-Eif4a2海绵吸附miR-142a-5p上调Vmp1表达。结论lnc-Eif4a2/miR-142a-5p/Vmp1通路具有对抗缺氧诱导小鼠海马神经元细胞损伤的作用,表明该通路可能作为缺血性卒中的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 长链非编码RNA真核翻译起始因子4A2 微小RNA 142a-5p 液泡膜蛋白1 缺氧诱导 海马神经元细胞损伤
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单引物法扩增马尾松毛虫CPV基因组第8片段及其序列分析 被引量:11
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作者 胡建芳 张珈敏 +3 位作者 杨娟 邓晓军 汪洋 胡远扬 《中国病毒学》 CSCD 2003年第1期39-43,共5页
本文利用T4 RNA连接酶将5’-磷酸、3’-氨基修饰的引物1连接到马尾松毛虫质型多角体病毒第8片段dsRNA的3’-OH端。经逆转录、退火、补齐形成全长双链cDNA。使用单一的互补引物2进行PCR扩增。扩增产物克隆在pMDl8-T载体上。对重组子进行... 本文利用T4 RNA连接酶将5’-磷酸、3’-氨基修饰的引物1连接到马尾松毛虫质型多角体病毒第8片段dsRNA的3’-OH端。经逆转录、退火、补齐形成全长双链cDNA。使用单一的互补引物2进行PCR扩增。扩增产物克隆在pMDl8-T载体上。对重组子进行限制性内切酶分析及序列测定,结果表明,克隆片段全长330bp,S’端具有CPV-1型末端保守序列AGTAAA’端具有保守序列GTTAGCC。起始密码子从ATG位于38-40残基,终止密码子TAA位于1208~1210残基。推测S8片段编码390个氨基酸多肽。分子量为44kDa。与舞毒蛾质型多角体病(LdCPV)第8片段相比较,核苷酸和氨基酸同源性分别为97%和98%。与家蚕质型多角体病毒(BmCPV)第8片段相比较,核苷酸和氨基酸的同源性分别为83%和85%。与人的呼肠孤病毒第8片段比较没有明显的同源性。 展开更多
关键词 T4RNA连接酶 马尾松毛虫 质型多角体病毒
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Kir2ds4基因RNAi慢病毒载体的构建与鉴定 被引量:5
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作者 窦立萍 达万明 +7 位作者 王畅 康慧媛 赵瑜 孙敬芬 靳海杰 王全顺 高春记 于力 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第3期663-666,共4页
本研究旨在构建kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。针对已经筛选确定的kir2ds4基因RNAi有效靶序列,合成靶序列的OligoDNA,退火形成双链DNA,与经HpaI和XhoI酶切后的pSicoR-GFP载体[含U6启动子和绿色荧光蛋白(GFP)]连接产生LV-shkir2ds4慢病毒载... 本研究旨在构建kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。针对已经筛选确定的kir2ds4基因RNAi有效靶序列,合成靶序列的OligoDNA,退火形成双链DNA,与经HpaI和XhoI酶切后的pSicoR-GFP载体[含U6启动子和绿色荧光蛋白(GFP)]连接产生LV-shkir2ds4慢病毒载体,应用PCR筛选阳性克隆并进行测序鉴定。用LV-shkir2ds4,包装系统质粒共转染包装细胞293T细胞,产生慢病毒颗粒,以293T细胞GFP蛋白的表达水平测定病毒滴度。结果表明,PCR和测序结果证实成功地构建了kir2ds4shRNA的慢病毒载体LV-shkir2ds4。293T细胞测定病毒滴度为6×108TU/ml。结论:成功地构建了人kir2ds4基因RNAi慢病毒载体。 展开更多
关键词 RNA干扰kir2ds4基因 慢病毒载体
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趋化因子受体CXCR4反义RNA重组表达载体的构建及其在真核细胞中的表达 被引量:2
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作者 邢卉春 徐小元 +4 位作者 王勤环 于敏 公伟波 斯崇文 邵一鸣 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期155-158,共4页
目的 :构建趋化因子受体CXCR4反义RNA真核表达载体并获取重组假病毒颗粒以用于抗HIV 1研究。方法 :用RT PCR法从健康人外周血单个核细胞 (peripheralbloodmononuclearcells ,PBMCs)中获得目的基因 ,并以正、反两个方向定向插入到逆转录... 目的 :构建趋化因子受体CXCR4反义RNA真核表达载体并获取重组假病毒颗粒以用于抗HIV 1研究。方法 :用RT PCR法从健康人外周血单个核细胞 (peripheralbloodmononuclearcells ,PBMCs)中获得目的基因 ,并以正、反两个方向定向插入到逆转录病毒载体 pLXSN。重组载体用脂质体转染剂 (lipofectAMINE)转染PA317包装细胞 ,抗G418克隆的细胞上清经逆转录后用荧光定量PCR(fluorogenic quantitativePCR ,FQ PCR)测定假病毒滴度 ,进一步感染NIH 3T3细胞。结果 :CXCR4正、反义RNA的真核表达载体 ,经PA317细胞包装形成的假病毒颗粒已成功地感染NIH 3T3细胞 ,目的基因在该细胞中得到整合与表达。结论 :从PBMCs中获得的目的基因通过逆转录病毒载体可转移至真核细胞中并得到表达 ,为进一步研究CXCR4反义RNA的抗HIV 1作用奠定了基础。 展开更多
关键词 趋化因子受体 CXCR4反义RNA重组表达载体 构建 真核细胞 表达
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