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黄瓜花叶病毒CB7株系引起心叶烟坏死反应与RNA2相关 被引量:3
1
作者 廖乾生 杜志游 +3 位作者 张华荣 朱丽萍 吴鹏 陈集双 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第8期824-829,共6页
采用RT-PCR获得黄瓜花叶病毒CMV-CB7株系全长基因组cDNA,经克隆测序发现该CMV的RNA1、2和3分别为3356nt、3045nt和2218nt(序列登录号为:EF216866、DQ785470和EF216867).CMV-CB7基因组cDNA克隆体外转录RNA接种心叶烟引起坏死症状,而CMV-... 采用RT-PCR获得黄瓜花叶病毒CMV-CB7株系全长基因组cDNA,经克隆测序发现该CMV的RNA1、2和3分别为3356nt、3045nt和2218nt(序列登录号为:EF216866、DQ785470和EF216867).CMV-CB7基因组cDNA克隆体外转录RNA接种心叶烟引起坏死症状,而CMV-Fny则产生典型花叶.由CMV-CB7和CMV-Fny基因组RNA相互交换而构建6个假重组型病毒(C1C2F3、C1F2C3、F1C2C3、F1F2C3、F1C2F3和C1F2C3)活性分析表明:CMV-CB7基因组RNA2决定其在寄主上的症状反应.嵌合型RNA2(RNA2F5C3和RNA2C3F5)的寄主侵染活性测定表明:2b基因或RNA23′端非编码序列决定CMV-CB7在心叶烟坏死症状.RNA印迹分析结果显示:CMV-CB7和CMV-FnyF5C3引起寄主坏死与基因组RNA积累没有直接关系. 展开更多
关键词 黄瓜花叶病毒 心叶烟 坏死 rna2
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小麦黄色花叶病毒RNA2自然缺失突变体的筛选和定位分析 被引量:4
2
作者 张卫华 杨军 +2 位作者 韩成贵 李大伟 于嘉林 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第1期80-85,共6页
许多真菌介体传播的病毒在机械接种过程中易于发生自然缺失。利用在小麦上连续机械接种WYMV的方法,自第27代起,利用RT-PCR和Northern blot方法在感病小麦中检测到一个WYMV RNA2的缺失突变株,序列分析发现缺失区域位于RNA2的214~280... 许多真菌介体传播的病毒在机械接种过程中易于发生自然缺失。利用在小麦上连续机械接种WYMV的方法,自第27代起,利用RT-PCR和Northern blot方法在感病小麦中检测到一个WYMV RNA2的缺失突变株,序列分析发现缺失区域位于RNA2的214~2808nt,共计2595nt,并在缺失区域的两端存在7个碱基的反向互补序列。缺失区域上游紧邻这7个碱基双链区存在一富含AU的短序列,并据此对此D-RNA2的缺失机制进行了讨论。 展开更多
关键词 WYMV 机械接种 rna2缺失突变株
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长链非编码RNA HOXA簇反义RNA2在重度子痫前期患者胎盘组织中的表达及其作用 被引量:3
3
作者 盛莹 钟黎黎 +2 位作者 杨春芬 郭江虹 阳双健 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2021年第2期171-176,共6页
目的长链非编码RNA HOXA簇反义RNA2(HOXA-AS2)在子痫前期患者胎盘组织中的表达水平及其对子痫前期病理机制的影响,目前还尚不清楚。文中旨在探讨重度子痫前期(SPE)患者胎盘组织中HOXA-AS2的表达水平及其对滋养细胞上皮-间质转化(EMT)的... 目的长链非编码RNA HOXA簇反义RNA2(HOXA-AS2)在子痫前期患者胎盘组织中的表达水平及其对子痫前期病理机制的影响,目前还尚不清楚。文中旨在探讨重度子痫前期(SPE)患者胎盘组织中HOXA-AS2的表达水平及其对滋养细胞上皮-间质转化(EMT)的影响。方法选取2017年2月至2019年4月在南华大学附属第一医院妇产科42例住院行剖宫产分娩的SPE患者。根据发病孕龄不同,将孕龄≤34孕周的SPE孕妇纳入早发型SPE组(n=19),将孕龄>34孕周的SPE孕妇纳入晚发型SPE组(n=23)。同时,选择同期行剖宫产分娩的30例正常妊娠晚期孕妇作为对照,其中14例因宫颈机能不全、胎膜早破、前置胎盘等病因而终止妊娠者作为早发型对照组,16例因胎儿窘迫、胎位异常、脐带绕颈等而终止妊娠者作为晚发型对照组。采用qRT-PCR检测各组胎盘组织中HOXA-AS2表达水平。将HOXA-AS2过表达质粒(pcDNA3.1-HOXA-AS2)及其空载质粒(Vector)转染至滋养细胞HTR-8/SVneo中,设置空白对照组(不做任何处理)、空载质粒组(转染空载质粒)和过表达组(转染pcDNA3.1-HOXA-AS2质粒)。qRT-PCR检测细胞中HOXA-AS2表达水平,CCK-8检测细胞增殖活性,Transwell检测细胞侵袭和迁移能力,Western blot检测EMT及Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白表达水平。结果与早发型SPE组胎盘组织中HOXA-AS2表达水平比较,早发型对照组、晚发型SPE组及晚发型对照组明显增高(P<0.001)。过表达组细胞中HOXA-AS2表达水平(41.28±4.01)显著高于空白对照组(1.00±0.03)、空载质粒组(1.04±0.04),差异有统计学意义(P<0.01)。过表达组HTR-8/SVneo细胞侵袭和迁移能力较空白对照组、空载质粒组显著增强(P<0.05),Vimentin、N-cadherin、β-catenin、Snail1蛋白表达水平显著增加(P<0.05),而E-cadherin和p-GSK3β等蛋白表达水平显著降低(P<0.05)。结论HOXA-AS2在早发型SPE胎盘组织中低表达,HOXA-AS2过表达可增强HTR-8/SVneo细胞侵袭和迁移能力,促进细胞EMT过程,其机制可能与Wnt/β-catenin信号通路激活有关。 展开更多
关键词 HOXA簇反义rna2 子痫前期 滋养细胞 上皮-间质转化
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利用PCR-SSCP对新疆甜菜坏死黄脉病毒RNA2变异的研究 被引量:10
4
作者 刘升学 向本春 +2 位作者 黄家风 岳海涛 席德慧 《中国糖料》 2003年第1期6-9,共4页
应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)分析技术,对新疆不同地区的甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA2的区间进行分析,12个BNYVV分离物和美国的BN-TX及我国黑龙江的He分离物通过RT-PCR扩增后都能得到一段590bp左右大小的片... 应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)分析技术,对新疆不同地区的甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA2的区间进行分析,12个BNYVV分离物和美国的BN-TX及我国黑龙江的He分离物通过RT-PCR扩增后都能得到一段590bp左右大小的片段;通过SSCP分析,12个分离物既不同于美国的BN-TX分离物,也不同于黑龙江的He分离物,可分为4个变异类型,S1和S2归为Ⅰ类,T3、T6、T7和T8归为Ⅱ类,K1、K2、K4和K5归为Ⅲ类,Q1和Q2归为Ⅳ类,初步明确了新疆BNYVV分离物存在着分化,而且有明显的地域分布性。 展开更多
关键词 PCR—SSCP 新疆 甜菜 坏死黄脉病毒 rna2变异
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蚕豆染色病毒RNA2全序列测定 被引量:1
5
作者 黄峰 陈青 +3 位作者 谢毅璇 陈细红 陈红运 林石明 《植物检疫》 北大核心 2013年第5期41-44,共4页
采用RT-PCR扩增并测定蚕豆染色病毒(Broad bean stain virus,BBSV)RNA2的基因组序列。BBSV RNA2基因组全长3478 nt,5'非编码区和3'非编码区分别为268 nt和237 nt。RNA2编码的多聚蛋白经切割后产生辅助蛋白(CR)、移动蛋白(MP)、... 采用RT-PCR扩增并测定蚕豆染色病毒(Broad bean stain virus,BBSV)RNA2的基因组序列。BBSV RNA2基因组全长3478 nt,5'非编码区和3'非编码区分别为268 nt和237 nt。RNA2编码的多聚蛋白经切割后产生辅助蛋白(CR)、移动蛋白(MP)、大外壳蛋白(CP-L)和小外壳蛋白(CP-S)。基于多聚蛋白P2氨基酸序列构建的系统树显示:侵染豆科作物的Comovirus病毒构成1个分支,表明Comovirus病毒之间的亲缘关系具有寄主相关性。 展开更多
关键词 蚕豆染色病毒 豇豆花叶病毒属 rna2
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蚕豆萎蔫病毒中国分离物RNA2全序列及多聚蛋白切割位点 被引量:2
6
作者 戚益军 周雪平 +1 位作者 薛朝阳 李德葆 《自然科学进展(国家重点实验室通讯)》 2000年第9期805-811,共7页
对蚕豆萎蔫病毒2(BBWV2)分离物B935 RNA2全序列进行了测定,全长由3601个核苷酸组成(不包括3′端Poly(A))。RNA2包含一个长的开读框,该开读框起始于231位,终止于3428位,编码一个分子量为119 ku的多聚蛋白。对外壳蛋白亚基N端氨基酸序列... 对蚕豆萎蔫病毒2(BBWV2)分离物B935 RNA2全序列进行了测定,全长由3601个核苷酸组成(不包括3′端Poly(A))。RNA2包含一个长的开读框,该开读框起始于231位,终止于3428位,编码一个分子量为119 ku的多聚蛋白。对外壳蛋白亚基N端氨基酸序列测定表明外壳蛋白大亚基(LCP)和小亚基(SCP)是由119 ku多聚蛋白中谷酰胺与甘氨酸及谷酰胺与丙氨酸之间的切割产生的,LCP含有402个氨基酸,SCP含有197个氨基酸。与蚕豆病毒属(Fabavirus)病毒基因组核苷酸及编码的蛋白质氨基酸序列比较表明,B935与BBWV2分离物及广藿香轻花叶病毒具有很高的同源性,而与BBWV1分离物的同源性较低。B935与豇豆花叶病毒属(Comovirus)和线虫传多面体病毒属(Nepovirus)的基因组结构相似,但序列同源性很低。B935与豇豆病毒属病毒的LCP和SCP氨基酸具有共同的保守序列。用4株单克隆抗体进行TAS-ELISA测定表明B935与BBWV1分离物(NRS和PH3)抗原上有差异。 展开更多
关键词 蚕豆萎蔫病毒2 rna2 多聚蛋白切割位点 BBWV
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土传小麦花叶病毒基因组结构和RNA2自发缺失的研究
7
作者 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 2000年第5期241-250,共10页
描述了土传小麦花叶病毒 (soil bornewheatmosaicvirus,SBWMV)的基因组结构 ,并将之与一些植物病毒作比较。发现重复摩擦接种或在高温下 (2 5~ 30℃ )培养引起SBWMV部分RNA2序列迅速缺失。在最初几次重复摩擦接种后 ,小麦病株存在野生... 描述了土传小麦花叶病毒 (soil bornewheatmosaicvirus,SBWMV)的基因组结构 ,并将之与一些植物病毒作比较。发现重复摩擦接种或在高温下 (2 5~ 30℃ )培养引起SBWMV部分RNA2序列迅速缺失。在最初几次重复摩擦接种后 ,小麦病株存在野生型SBWMVRNA2和几个不同大小的外壳蛋白通读 (CP RT)基因的缺失突变体。在以后的几次重复摩擦接种后 ,一个缺失突变体成为占优势的形式。这个自发的稳定突变体在RNA2第 14 2 0~ 2 180碱基间发生缺失 ,引起CP RT基因上759个碱基 (2 53个氨基酸 )的缺失 ,且接种到健康小麦幼苗上能引起更为严重的症状。在最初几次接种后出现的较小的缺失并不是较大的缺失发生过程的中间产物。禾谷多粘菌 (Polymyxagrami nis)仅传播野生型SBWMV ,而不传播缺失突变体。SBWMVRNA2缺失突变体在植物叶。 展开更多
关键词 土传小麦花叶病毒 基因组结构 缺失突变体 rna2
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宫颈癌细胞中HPVE6调控穹窿体RNA2-1-5p的表达 被引量:5
8
作者 王营 宋海岩 +1 位作者 孔璐 张玉祥 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2016年第6期566-570,共5页
目的 HPV E6/E7是宫颈癌发病过程中起主要作用的2种蛋白,文中旨在研究宫颈癌细胞中高表达的穹窿体RNA2-1-5p与HPV E6/E7的相关性。方法实验分为空白对照组、对照组(空载体/阴性对照siRNA)以及实验组(过表达质粒/敲减siRNA),在Si Ha和He... 目的 HPV E6/E7是宫颈癌发病过程中起主要作用的2种蛋白,文中旨在研究宫颈癌细胞中高表达的穹窿体RNA2-1-5p与HPV E6/E7的相关性。方法实验分为空白对照组、对照组(空载体/阴性对照siRNA)以及实验组(过表达质粒/敲减siRNA),在Si Ha和He La细胞中分别敲减HPV E6/E7,在Ha Ca T细胞中过表达HPV E6,用Western blot检测HPV E6/E7的表达水平,用Real-time PCR检测VTRNA2-1-5p及其前体VTRNA2-1的表达水平。结果在Si Ha和He La细胞,敲减HPV E6后实验组中VTRNA2-1表达[(0.65±0.02)、(0.81±0.11)]较对照组[(1.18±0.10)、(1.07±0.13)]降低(P<0.05),VTRNA2-1-5p表达[(1.54±0.22)、(1.98±0.06)]较对照组[(0.83±0.03)、(1.02±0.06)]升高(P<0.01);敲减HPV E7后VTRNA2-1和VTRNA2-1-5p表达的差异均无统计学意义(P>0.05)。在Ha Ca T细胞,过表达HPV E6后实验组中VTRNA2-1表达较对照组升高[(1.35±0.46)vs(0.98±0.35),P<0.05],VTRNA2-1-5p表达较对照组降低[(1.33±0.21)vs(1.80±0.27),P<0.01]。结论在宫颈癌细胞中,HPV E6可负性调控VTRNA2-1-5p的表达,而HPV E7与VTRNA2-1-5p无作用关系。 展开更多
关键词 穹窿体rna2-1-5p 宫颈癌 人类乳头瘤病毒
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基于黄瓜花叶病毒基因组RNA2的外源基因表达载体研究 被引量:1
9
作者 朱品 常发光 +1 位作者 杜志游 廖乾生 《浙江理工大学学报(自然科学版)》 2017年第2期265-269,共5页
为了确定黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)基因组RNA2能否作为构建表达外源蛋白的载体,实验构建CMV的Fny株系(CMV-Fny)RNA2中2b基因缺失载体pCB301-F209Δ2b和携带绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)基因载体pCB301-F... 为了确定黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)基因组RNA2能否作为构建表达外源蛋白的载体,实验构建CMV的Fny株系(CMV-Fny)RNA2中2b基因缺失载体pCB301-F209Δ2b和携带绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)基因载体pCB301-F209Δ2b-gfp,并分别将含有质粒CMV-FnyΔ2b和CMVFnyΔ2b-gfp农杆菌混和物浸润接种寄主植物。结果表明:CMV-FnyΔ2b在本氏烟产生轻微花叶症状并且病毒基因组含量降低;在CMV-FnyΔ2b-gfp侵染植株叶片中有绿色荧光的产生;番茄丛矮病毒沉默抑制子p19加入有助于CMV-FnyΔ2b表达GFP;在RDR6含量减少的本氏烟RDR6i中,与对照接种植株相比,CMV-FnyΔ2b-gfp所产生的GFP增加。研究获得基于CMV基因组RNA2所构建的外源蛋白表达载体CMV-CMV-FnyΔ2b,并发现加入其它病毒基因沉默抑制子有利于GFP的表达。 展开更多
关键词 黄瓜花叶病毒 基因组rna2 表达载体 绿色荧光蛋白
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黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析
10
作者 张国华 许燕 +1 位作者 蔡文启 方荣祥 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期8-14,共7页
分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA... 分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA2全长cDNA克隆pC2F。通过对pC25和pC23进行序列测定,得到了RNA2的全序列。序列分析结果表明CMVSDRNA2由3048nt组成,其中存在2个部分重叠的阅读框ORF1(79~2652nt)和ORF2(2414~2746nt),分别编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白,并在2a蛋白的序列中发现了动植物病毒复制酶所特有的两个保守序列。该株系RNA2核苷酸序列与分属CMVI亚组的Fny株系和II亚组的Q株系RNA2的核苷酸序列同源性分别为917%和756%;2a蛋白的氨基酸序列同源性分别为938%和677%,2b蛋白的氨基酸序列同源性分别为830%和513%。同源性比较的结果表明SD株系属于CMVI亚组。 展开更多
关键词 黄瓜花叶病毒山东株 rna2 全长CDNA克隆 序列分析
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在未编辑的谷氨酸受体2Q/R部位促使RNA2的次黄嘌呤腺苷脱氨酶丢失引起运动神经元的缓慢死亡 被引量:5
11
作者 潘卫东 Shin Kwak +4 位作者 Akuto Hideyama 李俊燕 周里钢 王骏 蔡定芳 《中国临床神经科学》 2013年第1期1-11,共11页
目的研究小鼠未编辑的谷氨酸受体2(GluR2)Q/R部位缺失RNA2的次黄嘌呤腺苷脱氨酶(ADAR2)是否引起缓慢的运动神经元死亡。方法利用Cre/loxP重组系统制作一个条件性基因敲除ADAR2小鼠品系(AR2),利用基因组PCR和反转录PCR技术,将AR2小鼠的... 目的研究小鼠未编辑的谷氨酸受体2(GluR2)Q/R部位缺失RNA2的次黄嘌呤腺苷脱氨酶(ADAR2)是否引起缓慢的运动神经元死亡。方法利用Cre/loxP重组系统制作一个条件性基因敲除ADAR2小鼠品系(AR2),利用基因组PCR和反转录PCR技术,将AR2小鼠的运动神经元ADAR2基因条件性定位,观察及检测AR2小鼠、携带内源性GluR2等位基因的未编辑GluR2 Q/R小鼠(AR2res)和对照组小鼠的GluR2 Q/R部位编辑率、行为特征、电生理以及组织形态。结果 AR2小鼠GluR2 Q/R部位编辑率降低,脊髓与脑运动神经核细胞显示因ADAR2缺乏引起的运动神经元死亡,并且出现运动神经功能衰退症状,而GluR2 Q/R部位的编辑率在动眼神经核无明显减少。当失去ADAR2活性的AR2小鼠携带内源性的GluR2等位基因时,细胞和表型的变化可以被阻止。结论 ADAR2失活可以引起运动神经元α-氨基-3-羟基-5甲基-4异恶唑-丙酸受体介导的死亡,而在未编辑的GluR2 Q/R部位缺乏ADAR2可以引起运动神经元缓慢死亡。 展开更多
关键词 rna2 次黄嘌呤腺苷脱氨酶 RNA编辑 Q R部位 肌萎缩侧索硬化症 神经元 谷氨酸受体
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环状RNA EPB41L2通过调控微小RNA-1270/GNAI3轴抑制口腔鳞状细胞癌细胞的增殖和迁移及侵袭 被引量:2
12
作者 杨凤 缪克红 +2 位作者 兰玉燕 林方梁 孙黎波 《中华老年口腔医学杂志》 2025年第1期4-11,共8页
目的环状RNA(circular RNA,circRNA)与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的进展密切相关,现探讨circRNA EPB41L2调控OSCC细胞增殖、迁移和侵袭的作用机制。方法将细胞分为7组:HOK组(正常培养的口腔上皮细胞)、SCC-9组... 目的环状RNA(circular RNA,circRNA)与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的进展密切相关,现探讨circRNA EPB41L2调控OSCC细胞增殖、迁移和侵袭的作用机制。方法将细胞分为7组:HOK组(正常培养的口腔上皮细胞)、SCC-9组(正常培养的SCC-9细胞)、CAL-27组(正常培养的CAL-27细胞)、oe NC组(转染空载pcDNA3.4至CAL-27细胞)、oe EPB41L2组(转染pcDNA3.4-EPB41L2至CAL-27细胞)、oe EPB41L2+mimics NC组(转染pcDNA3.4-EPB41L2及mimics NC至CAL-27细胞)、oe EPB41L2+miR mimics组(转染pcDNA3.4-EPB41L2及miR-1270 mimics至CAL-27细胞)。通过实时荧光定量聚合酶链式反应检测circRNA EPB41L2、miR-1270及GNAI3 mRNA在各组细胞中的表达,通过CCK-8检测各组细胞活力,通过流式细胞术检测各组细胞凋亡率,通过集落形成实验检测各组细胞增殖能力,通过细胞划痕实验检测各组细胞划痕愈合率,通过Transwell实验检测各组细胞侵袭数量,通过Western blot检测GNAI3蛋白在各组细胞中的表达,通过RNA pull-down实验、RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)实验、双荧光素酶报告实验验证miR-1270与circRNA EPB41L2的靶向结合关系,通过双荧光素酶报告实验验证miR-1270与GNAI3的靶向结合关系。结果与HOK组比较,SCC-9组、CAL-27组中circRNA EPB41L2表达显著下降(P<0.01),且在CAL-27组中表达水平最低,因此选取CAL-27细胞作为后续研究对象。与oe NC组比较,oe-circRNA EPB41L2组CAL-27细胞活力、增殖能力、划痕愈合率、侵袭数量显著下降,细胞凋亡率显著上升(P<0.001)。与oe EPB41L2+mimics NC组比较,oe EPB41L2+miR mimics组CAL-27细胞增殖能力、划痕愈合率、侵袭数量显著上升,细胞凋亡率显著下降(P<0.001)。与HOK组比较,CAL-27组细胞miR-1270表达显著升高(P<0.001);与oe NC组比较,oe EPB41L2组细胞miR-1270表达显著下降(P<0.001)。与HOK组比较,CAL-27组细胞GNAI3 mRNA和蛋白表达显著下降(P<0.001);与oe NC组比较,oe EPB41L2组细胞GNAI3 mRNA和蛋白表达显著上升(P<0.001);与oe EPB41L2+mimics NC组比较,oe EPB41L2+miR mimics组GNAI3 mRNA和蛋白表达显著下降(P<0.05)。RNA pull-down实验、RIP实验、双荧光素酶报告实验共同证实miR-1270与circRNA EPB41L2靶向结合。双荧光素酶报告实验证实miR-1270与GNAI3靶向结合。结论circ RNA EPB41L2通过调控miR-1270/GNAI3轴抑制OSCC细胞的增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 环状RNA EPB41L2 微小RNA-1270 GNAI3 增殖 迁移
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lncRNA-BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1促进胃癌的发生和发展
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作者 孙颖 顾玮 +1 位作者 王吉 郑雄 《安徽医药》 CAS 2025年第1期57-62,I0002,共7页
目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)对胃癌的发生发展机制的影响。方法回顾性选取2017年4月至2019年1月于上海交通大学医学院附属... 目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)BBOX1-2通过调控成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)对胃癌的发生发展机制的影响。方法回顾性选取2017年4月至2019年1月于上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院接受胃癌根治术30例病人肿瘤组织及癌旁相应正常组织作为研究对象,采用实时定量PCT(real-time PCR,RT-PCR)检测lncRNA-BBOX1-2和FGFR1表达;si-linc-BBOX1-2转染SGC-7901细胞后,通过蛋白质印迹法/细胞存活率分析(MTT)、细胞迁移和侵袭(Transwell)实验、细胞划痕、平板克隆一系列生物学功能实验,检测肿瘤细胞生物学功能及FGFR1表达的变化。结果胃癌组织中的lncRNA-BBOX1-2(3.68±0.58比1.15±0.11)和FGFR1(4.26±0.71比1.19±0.18)表达显著高于癌旁正常组织(P<0.05);si-linc-BBOX1-2转染SGC-7901细胞后,FGFR1表达下调,细胞活力、迁移、侵袭和生存能力明显下降。结论LincRNA-BBOX1-2可通过调控FGFR1的表达介导胃癌细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭,可能为胃癌的治疗提供了新的靶点和潜在的生物学标志物。 展开更多
关键词 胃肿瘤 长链非编码RNA BBOX1-2 成纤维细胞生长因子受体1 调控 增殖 凋亡
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基于TCGA数据库资料评估头颈鳞状细胞癌患者Klotho基因表达与临床预后的关系
14
作者 张学聪 陈秉辉 +2 位作者 徐常艳 常方远 曹华 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 2025年第1期48-50,共3页
目的探讨基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库资料评估头颈鳞状细胞癌(head neck squamous cell carcinoma,HNSCC)患者Klotho基因表达对临床预后的影响。方法研究通过检索TCGA数据库收集HNSCC患者Klotho基因、微管相关蛋白轻链3(Microtubule... 目的探讨基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库资料评估头颈鳞状细胞癌(head neck squamous cell carcinoma,HNSCC)患者Klotho基因表达对临床预后的影响。方法研究通过检索TCGA数据库收集HNSCC患者Klotho基因、微管相关蛋白轻链3(Microtubule-associated protein light chain 3,MAPLC3)、NOP2/Sun RNA甲基转移酶2(NOP2/Sun RNA methyltransferase 2,NSUN2)的表达及随访预后资料,根据Klotho基因表达水平分为低表达组(n=87例)、中表达组(n=87例)和高表达组(n=88例)。描绘Kaplan-Meier曲线分析Klotho基因表达对临床预后的影响,同时评价Klotho基因表达与MAPLC3及NSUN2的相关性。结果不同组别患者一般临床特征资料比较差异无统计学意义(P>0.05)。高表达组患者中位总生存率(overall survival,OS)显著高于低表达组(P<0.05)。与高表达组相比,低表达组风险比为0.62(95%CI:0.44~0.87,P<0.05)。HNSCC患者中Klotho基因与MAPLC3表达水平呈正相关(r=0.19,P=0.00),而与NSUN2表达水平呈负相关(r=-0.17,P=0.00)。结论Klotho基因表达与HNSCC患者临床预后有关,同时该基因可能影响下游MAPLC3及NSUN2的表达。 展开更多
关键词 头颈鳞状细胞癌(Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck) 预后(Prognosis) Klotho基因(Klotho Gene) 微管相关蛋白轻链3(Microtubule-associated protein light chain 3) NOP2/Sun RNA甲基转移酶2(NOP2/Sun RNA methyltransferase 2)
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血清环状RNA CDYL、环状RNA ACAP2水平预测急性心肌梗死患者发生主要不良心血管事件的价值
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作者 郭晓亮 袁宇 +4 位作者 李俊艳 段长恩 刘贞 孟令龙 刘辉 《实用临床医药杂志》 2025年第5期76-81,共6页
目的探讨血清环状RNA(circRNA)CDYL、circRNA ACAP2表达水平对急性心肌梗死(AMI)患者主要不良心血管事件(MACE)的预测价值。方法选取98例AMI患者纳入观察组,并根据是否发生MACE将患者分为MACE组(n=45)和无MACE组(n=53)。另选取同期体检... 目的探讨血清环状RNA(circRNA)CDYL、circRNA ACAP2表达水平对急性心肌梗死(AMI)患者主要不良心血管事件(MACE)的预测价值。方法选取98例AMI患者纳入观察组,并根据是否发生MACE将患者分为MACE组(n=45)和无MACE组(n=53)。另选取同期体检的健康者98例纳入对照组。比较各组患者血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2的表达水平。采用多因素Logistic回归分析法筛选AMI患者发生MACE的影响因素。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2水平对AMI患者发生MACE的预测价值。结果观察组血清circRNA CDYL水平低于对照组,circRNA ACAP2水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。MACE组血清circRNA CDYL水平低于无MACE组,circRNA ACAP2水平高于无MACE组,差异有统计学意义(P<0.05)。心率、circRNA ACAP2为AMI患者发生MACE的独立危险因素,circRNA CDYL为独立保护因素(P<0.05)。血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2及其联合预测AMI患者发生MACE的曲线下面积(AUC)分别为0.814、0.821、0.921。血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2联合预测的敏感度为91.11%,特异度为79.25%。血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2联合预测的效能优于其单独预测(Z二者联合-circRNA CDYL=1.975、Z二者联合-circRNA ACAP2=2.064,P=0.048、0.039)。结论AMI患者血清circRNA CDYL水平下调,circRNA ACAP2水平上调,且circRNA ACAP2为患者发生MACE的独立危险因素,circRNA CDYL为独立保护因素。血清circRNA CDYL、circRNA ACAP2联合预测患者发生MACE的价值较高。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 环状RNA CDYL 环状RNA ACAP2 主要不良心血管事件 预测价值
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CircACTR2调节miR-101-3p/NFAT5轴对高糖诱导的肾小管上皮细胞增殖、凋亡和上皮间质转化的影响
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作者 王晶 黄斌芳 周光全 《蚌埠医科大学学报》 2025年第3期281-287,共7页
目的:探讨环状非编码RNA(circRNA)ACTR2调节微小RNA-101-3p(miR-101-3p)/活化T细胞核因子5(NFAT5)轴对高糖诱导的肾小管上皮细胞增殖、凋亡和上皮间质转化的影响。方法:体外培养人肾小管上皮细胞HK-2,分为对照组、高糖组(30 mmol/L葡萄... 目的:探讨环状非编码RNA(circRNA)ACTR2调节微小RNA-101-3p(miR-101-3p)/活化T细胞核因子5(NFAT5)轴对高糖诱导的肾小管上皮细胞增殖、凋亡和上皮间质转化的影响。方法:体外培养人肾小管上皮细胞HK-2,分为对照组、高糖组(30 mmol/L葡萄糖),同时在高糖组的基础上对HK-2细胞进行转染,设置为小干扰RNA阴性对照(si NC)组、circACTR2特异性小干扰RNA(si circACTR2)组、si circACTR2+抑制物阴性对照(inhibitor NC)组、si circACTR2+miR-101-3p抑制物(miR-101-3p inhibitor)组。流式细胞术、CCK-8分别检测细胞凋亡和增殖;qRT-PCR检测细胞中circACTR2、miR-101-3p及NFAT5 mRNA表达;Western blotting检测各组细胞中增殖蛋白Ki-67、抗凋亡蛋白Bcl-2、E-钙黏附蛋白(E-cadherin)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、NFAT5表达水平;ELISA检测细胞中白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平;双荧光素酶实验验证circACTR2、NFAT5分别与miR-101-3p的靶向关系。结果:miR-101-3p分别与circACTR2、NFAT5存在靶向关系。与对照组相比,高糖组细胞凋亡率、TNF-α、IL-6、circACTR2、NFAT5、α-SMA水平增加(P<0.05),细胞光密度(OD_(450))值(24、48 h)、miR-101-3p、Bcl-2、Ki-67、E-cadherin水平降低(P<0.05);与si NC组相比,si circACTR2组细胞凋亡率、TNF-α、IL-6、circACTR2、NFAT5、α-SMA水平下降(P<0.05),细胞OD_(450)值(24、48 h)、miR-101-3p、Bcl-2、Ki-67、E-cadherin水平增加(P<0.05);与si circACTR2+inhibitor NC组相比,si circACTR2+miR-101-3p inhibitor组细胞凋亡率、TNF-α、IL-6、circACTR2、NFAT5、α-SMA水平增加(P<0.05),细胞OD_(450)值(24、48 h)、miR-101-3p、Bcl-2、Ki-67、E-cadherin水平降低(P<0.05)。结论:干扰circACTR2表达可以促进高糖诱导HK-2细胞增殖、抑制其凋亡及上皮间质转化,可能与调控miR-101-3p/NFAT5轴有关。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 环状非编码RNA ACTR2 微小RNA-101-3p/活化T细胞核因子5轴 肾小管上皮细胞
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中国小麦花叶病毒RNA2外壳蛋白通读区及19ku富半胱氨酸基因的克隆、表达及其编码蛋白定位 被引量:2
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作者 徐磊 叶荣 +2 位作者 赵秀云 于善谦 陈剑平 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第6期439-443,共5页
应用RT-PCR扩增中国小麦花叶病毒(CWMV)外壳蛋白通读区(readthrough,RT)5’端(RTn)和3’端(RTc)及19ku的富含半胱氨酸蛋白基因,分别克隆并在E.coli中表达,表达蛋白粗提纯后免疫小鼠,制备相应的抗血清和单克隆抗体.用各种抗体检... 应用RT-PCR扩增中国小麦花叶病毒(CWMV)外壳蛋白通读区(readthrough,RT)5’端(RTn)和3’端(RTc)及19ku的富含半胱氨酸蛋白基因,分别克隆并在E.coli中表达,表达蛋白粗提纯后免疫小鼠,制备相应的抗血清和单克隆抗体.用各种抗体检测小麦病叶汁液中RTn,RTc和19ku蛋白.结果表明,RTn和RTc分布在病叶细胞中的CWMV病毒粒子表面,而19ku蛋白则均匀分布于细胞质中. 展开更多
关键词 rna2 编码蛋白 中国小麦花叶病毒 外壳蛋白通读区 富含半胱氨酸蛋白基因 原核表达 基因定位 基因克隆 基因表达
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miR-516b-5p靶向NSUN2对乳腺癌细胞增殖和侵袭的影响
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作者 程欣然 范亚楠 +1 位作者 刘俊 皮亚平 《河北医学》 2025年第10期1585-1592,共8页
目的:探讨微小非编码RNA-516b-5p(miR-516b-5p)靶向RNA甲基转移酶家族成员2(NSUN2)对乳腺癌(BC)细胞增殖和侵袭的影响。方法:qRT-PCR实验检测BC癌组织、癌旁组织(n=45)及正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)、BC细胞(MCF-7、MDA-MB-231、HCC1937)... 目的:探讨微小非编码RNA-516b-5p(miR-516b-5p)靶向RNA甲基转移酶家族成员2(NSUN2)对乳腺癌(BC)细胞增殖和侵袭的影响。方法:qRT-PCR实验检测BC癌组织、癌旁组织(n=45)及正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)、BC细胞(MCF-7、MDA-MB-231、HCC1937)中miR-516b-5p、NSUN2 mRNA表达量。将MCF-7细胞分为NC组、miR-NC组、miR-516b-5p mimic组、sh-NC组、sh-NSUN2组、miR-516b-5p mimic+pcDNA-NC组、miR-516b-5p mimic+pcDNA-NSUN2组,通过克隆形成和Transwell侵袭实验分别检测各组MCF-7细胞增殖和侵袭能力;Western blot实验检测各组细胞中NSUN2、细胞周期蛋白1(CCND1)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、基质金属蛋白酶2(MMP2)、基质金属蛋白酶9(MMP9)蛋白表达量;构建裸鼠BC移植瘤模型,并分为Model组、miR-516b-5p mimics组、miR-516b-5p mimic+pcDNA-NSUN2组,测量各组肿瘤质量和体积。结果:与癌旁组织相比,癌组织中miR-516b-5p表达量明显下降,NSUN2 mRNA表达量明显上升(P<0.05)。与MCF-10A细胞相比,MCF-7、MDA-MB-231、HCC1937细胞中miR-516b-5p表达量明显下降,NSUN2 mRNA表达量明显上升(P<0.05),其中MCF-7细胞以上指标变化趋势最为明显。与NC组相比,miR-NC组和sh-NC组细胞各指标无明显变化(P>0.05);与miR-NC组相比,miR-516b-5p mimic组细胞集落形成数量、侵袭细胞数减少,NSUN2 mRNA和NSUN2、CCND1、CDK1、MMP2、MMP9蛋白表达量均明显下降,miR-516b-5p表达量明显上升(P<0.05);与sh-NC组相比,sh-NSUN2组各指标变化趋势与miR-516b-5p mimic组一致(P<0.05);而在miR-516b-5p mimic+pcDNA-NSUN2组中各指标变化趋势与miR-516b-5p mimic组相反(P<0.05)。双荧光素酶实验证实miR-516b-5p与NSUN2存在靶向关系(P<0.05)。裸鼠成瘤实验中,与Model组相比,miR-516b-5p mimics组肿瘤组织质量和体积明显缩小(P<0.05);与miR-516b-5p mimics组相比,miR-516b-5p mimic+pcDNA-NSUN2组肿瘤组织质量和体积明显增大(P<0.05)。结论:miR-516b-5p可通过靶向下调NSUN2表达,抑制BC细胞增殖和侵袭。 展开更多
关键词 微小非编码RNA-516b-5p RNA甲基转移酶家族成员2 乳腺癌 增殖 侵袭
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2型糖尿病肾病患者血清lncRNA MEG3,lncRNA SOX2OT水平表达与肾功能及预后的相关性研究
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作者 鲍楠 张蓬杰 +1 位作者 朱燕亭 闻苗苗 《现代检验医学杂志》 2025年第3期84-90,共7页
目的探讨2型糖尿病肾病(T2DN)患者血清长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3),长链非编码RNA SRY盒转录因子2重叠转录本(lncRNA SOX2OT)水平表达与肾功能及预后的相关性。方法选取2019年1月~2021年1月陕西省人民医院收治的T2DN患者20... 目的探讨2型糖尿病肾病(T2DN)患者血清长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3),长链非编码RNA SRY盒转录因子2重叠转录本(lncRNA SOX2OT)水平表达与肾功能及预后的相关性。方法选取2019年1月~2021年1月陕西省人民医院收治的T2DN患者205例(T2DN组),单纯2型糖尿病(T2DM)患者150例(T2DM组)和体检健康者150例(对照组),根据三年预后将T2DN患者分为不良预后组(n=73)和良好预后组(n=132)。检测血清lncRNA MEG3和lncRNA SOX2OT水平;相关性分析采用Pearson分析法;影响因素采用Logistic回归分析;受试者工作特征(ROC)曲线评价预测价值。结果T2DN组血清lncRNA MEG3(2.20±0.32)高于T2DM组(1.49±0.20)和对照组(1.00±0.06),lncRNA SOX2OT(0.50±0.11)低于T2DM组(0.73±0.15)和对照组(1.05±0.16),差异具有统计学意义(t=23.960,45.332;28.745,16.670,均P<0.01)。T2DN患者血清lncRNA MEG3水平与估计肾小球滤过率(eGFR)呈负相关,与尿清蛋白/肌酐比值(UACR)水平呈正相关(r=-0.532,0.485,均P<0.01);血清lncRNA SOX2OT水平与eGFR呈正相关,与UACR呈负相关(r=0.421,-0.517,均P<0.01)。T2DN患者不良预后的危险因素为慢性肾脏病分期4期、UACR和lncRNA MEG3(Waldχ^(2)=6.360,6.678,16.652,均P<0.05),保护因素为eGFR,lncRNA SOX2OT(Waldχ^(2)=5.463,11.797,均P<0.05)。血清lncRNA MEG3联合lncRNA SOX2OT预测的曲线下面积高于lncRNA MEG3,lncRNA SOX2OT单独预测,差异具有统计学意义(Z=3.841,3.337,均P<0.05)。结论血清lncRNA MEG3水平升高和lncRNA SOX2OT水平降低与T2DN患者肾功能降低及不良预后有关,两者联合检测对T2DN患者不良预后有较高预测价值。 展开更多
关键词 2型糖尿病肾病 长链非编码RNA母系表达基因3 长链非编码RNA SRY盒转录因子2重叠转录本 肾功能
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