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柱花草响应炭疽菌和低磷胁迫的LysM-RLKs成员鉴定及表达模式分析
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作者 龙云飘 张建禹 +2 位作者 罗丽娟 刘攀道 蒋凌雁 《草地学报》 北大核心 2025年第4期1058-1071,共14页
为挖掘柱花草(Stylosanthes guianensis)的LysM-RLKs家族成员,本研究利用接种胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)和低磷处理的转录组数据,通过生物信息学方法鉴定和命名LysM-RLKs家族成员,预测其亚细胞定位和蛋白序列;通过柱... 为挖掘柱花草(Stylosanthes guianensis)的LysM-RLKs家族成员,本研究利用接种胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)和低磷处理的转录组数据,通过生物信息学方法鉴定和命名LysM-RLKs家族成员,预测其亚细胞定位和蛋白序列;通过柱花草植株相关试验,进行组织表达特异性及响应几丁质、炭疽菌和低磷处理的表达模式分析。结果表明,共鉴定到11个SgLysM-RLKs成员,命名为SgLYK1,SgLYK2a,SgLYK2b,SgLYK3a,SgLYK3b,SgLYK4a,SgLYK4b,SgLYK5,SgLYK7,SgLYK8和SgNFR5;其蛋白大多定位于质膜,含有典型的胞外LysM、跨膜和胞内激酶结构域,蛋白二级结构以α螺旋和无规卷曲为主,蛋白三维结构存在差异;该家族成员均存在组织特异性,其中SgLYK1,SgLYK4a,SgLYK5,SgLYK7和SgLYK8可能在炭疽菌侵染和几丁质诱导的免疫反应中发挥重要功能,SgLYK3a则可能参与响应低磷胁迫。本研究为SgLysM-RLKs家族成员的功能研究提供参考,并为柱花草抗炭疽菌和低磷胁迫育种提供候选基因。 展开更多
关键词 柱花草 LysM-rlk家族 炭疽病 低磷胁迫 表达模式
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玉米LRR-RLK基因家族鉴定和SIF亚家族表达模式分析
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作者 孙泽丹 曾世荣 +3 位作者 孙小孟 王亚鹏 王哲 杨琴 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期19-30,共12页
富含亮氨酸重复的类受体激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase,LRR-RLK)能够调节植物的生长发育、参与激素信号传导、抵御各种逆境胁迫,它是植物中已知最大的跨膜类受体蛋白激酶(receptor-like kinase,RLK)家族。SIF是LRR-RL... 富含亮氨酸重复的类受体激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase,LRR-RLK)能够调节植物的生长发育、参与激素信号传导、抵御各种逆境胁迫,它是植物中已知最大的跨膜类受体蛋白激酶(receptor-like kinase,RLK)家族。SIF是LRR-RLK家族中的一个亚家族,该亚家族在拟南芥和棉花中被证明参与逆境胁迫。利用生物信息学方法对玉米B73基因组的LRR-RLK家族进行全基因组鉴定、系统进化、染色体定位和基因结构分析,基于LRR-RLK家族的分类结果,选择第Ⅰ亚家族SIF作为研究对象,分析该亚家族成员组织特异性表达以及对逆境胁迫的响应模式。结果表明,玉米LRR-RLK基因家族包含249个成员,这些LRR-RLK基因非均等地分布于玉米10条染色体上。系统进化分析可将其分为15类,各亚家族基因数量分布由1~51个不等。基于转录组数据的表达模式分析表明,玉米SIF亚家族基因在不同组织及逆境胁迫下的表达量不同,发现了多个可响应非生物胁迫(干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫和盐胁迫)和生物胁迫(玉蜀黍平脐蠕孢、禾谷镰孢、瘤黑粉菌和蚜虫)的SIF基因。 展开更多
关键词 玉米 LRR-rlk 全基因组鉴定 基因表达模式
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基于加权基因共表达网络分析法挖掘谷子LRR-RLK类抗白发病相关基因
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作者 韩彦卿 武晓雄 +3 位作者 蒋思铭 卫安琪 田娜娜 王鹤 《植物病理学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1114-1128,共15页
富含亮氨酸重复序列类受体蛋白激酶(leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, LRR-RLK)在植物抵抗病原菌侵染过程中发挥着重要作用。为了明确谷子LRR-RLK基因家族的基本特征,以及该家族成员在谷子对抗白发病菌(Sclerospora g... 富含亮氨酸重复序列类受体蛋白激酶(leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, LRR-RLK)在植物抵抗病原菌侵染过程中发挥着重要作用。为了明确谷子LRR-RLK基因家族的基本特征,以及该家族成员在谷子对抗白发病菌(Sclerospora graminicola)中的作用,本研究利用生物信息学方法对谷子LRR-RLK基因家族进行了鉴定和分类,对其进化模式、序列特征、基因结构、启动子序列和表达模式进行了分析。进一步利用谷子抗病和感病品种受S.graminicola侵染后3个不同生育期的转录组数据,采用加权基因共表达网络分析(the weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)方法,对抗病基因共表达模块和核心基因进行鉴定。结果表明,LRR-RLK家族基因在谷子9条染色体上呈现不均匀分布;对谷子和拟南芥LRR-RLK类基因进行系统进化分析,发现这些基因主要分为4类;多数基因编码的激酶蛋白的结构域相对保守,其启动子区包含防御和应激反应、分生组织表达相关的多种顺式作用元件,表明这些基因可能受多种因子调控;利用WGCNA构建与抗病相关的基因共表达网络,共鉴定到44个基因共表达模块,其中3个为抗病相关的特异性模块(Turquoise、Blue和Yellow),从中发掘到12个核心基因,功能注释结果表明这些基因参与植物抗病调控;从中选取6个基因(Seita.9G413000、Seita.9G296000、Seita.9G557200、Seita.9G493600、Seita.3G241700和Seita.9G163200),利用RT-qPCR分析其表达量,证实了这些基因在S.graminicola侵染的不同时期被诱导表达,推测这些基因可能在谷子抵抗谷子白发病的过程中起着重要作用。研究结果为揭示谷子抗白发病的分子机制提供了参考。 展开更多
关键词 谷子 富含亮氨酸重复序列类受体蛋白激酶 加权基因共表达网络分析 核心基因 表达分析 抗病基因
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苹果LRR-RLK基因家族鉴定和表达分析 被引量:5
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作者 黄金凤 吕天星 +4 位作者 王寻 王颖达 王冬梅 闫忠业 刘志 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第14期3097-3112,共16页
【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、C... 【目的】从苹果全基因组中鉴定LRR-RLK家族蛋白成员,并进行生物信息学和表达模式分析,为研究苹果LRR-RLK的潜在功能提供理论基础。【方法】利用BLASTp基于GDR数据库鉴定苹果LRR-RLK家族成员,通过ExPASy Proteomics Server、Cell-PLoc、CD-Search Tool、MEGAX、MG2C等软件分析LRR-RLK蛋白序列基本信息、亚细胞定位情况、结构域组成、系统进化关系以及染色体定位情况。利用实时荧光定量PCR技术检测苹果12个LRR-RLK的组织表达和诱导表达特性。【结果】苹果LRR-RLK基因家族包含378个成员,这些LRR-RLK蛋白包括318—1 827个不等的氨基酸残基,等电点分布在5.16—9.75。亚细胞定位结果显示LRR-RLK蛋白均定位在细胞膜。系统进化分析可将其分为15类,各亚家族基因数量分布在1—111。染色体定位结果显示,LRR-RLK在苹果17条染色体上均有分布,其中第7条染色体数量最多,为40个。LRR-RLK家族基因具有2个特定的保守结构域,分别是LRR结构和蛋白激酶结构。蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次是α-螺旋,β-转角所占比例最小。通过定量检测发现筛选的12个家族成员在各组织中均有表达(除MD00G1105400外),且多数基因在茎中表达水平相对较高。低温条件下,7个基因上调表达,其中MD09G1153800上调最明显,最高为对照的6.8倍,而MD06G1170200和MD05G1061600均下调表达;在干旱条件下,8个基因上调表达,其中MD00G1105400上调最明显,最高为对照的9.6倍;在盐胁迫条件下,MD04G1150400、MD13G1108000和MD02G1071800始终处于上调表达状态,其中MD02G1071800上调最明显,最高为对照的14.9倍。苹果新梢接种轮纹病菌后,12个LRR-RLK家族基因表达基本上呈先上升后下降的趋势。并且在‘望山红’中,1 d时表达水平较高,而在‘鸡冠’中,3 d时表达水平较高。MD09G1153800和MD05G1065800在‘鸡冠’响应轮纹病菌侵染过程中显著上调表达,而在‘望山红’中无响应,可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。【结论】苹果LRR-RLK基因家族包含378个成员,进化上可分为15组,在17条染色体上均有分布,多数基因具有在茎中高表达的组织表达特征,多数基因受逆境和轮纹病菌调控。 展开更多
关键词 苹果 LRR-rlk 基因家族 鉴定 表达分析
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LRR-RLKs亚家族基因RLK6在拟南芥开花过程中的作用 被引量:3
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作者 杨敏 韩玉珍 +1 位作者 阿依江.哈拜克 王翠玲 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期654-662,共9页
为研究LRR-RLKs亚家族基因RLK6(AT2G26730)在拟南芥生长发育过程中的作用,本研究构建了植物过表达载体p Super1300-RLK6,获得5个过表达突变体,其中2个独立株系(OE8,OE9)用于表型分析。通过对野生型(WT)、RLK6基因缺失突变体(rlk6-2、rlk... 为研究LRR-RLKs亚家族基因RLK6(AT2G26730)在拟南芥生长发育过程中的作用,本研究构建了植物过表达载体p Super1300-RLK6,获得5个过表达突变体,其中2个独立株系(OE8,OE9)用于表型分析。通过对野生型(WT)、RLK6基因缺失突变体(rlk6-2、rlk6-3和rlk6-6)、过表达株系OE8和OE9生长发育过程的详细观察和分析发现,RLK6基因缺失突变体在整个生长发育过程中的表型与WT差异不明显,而过表达株系OE8和OE9比WT开花早。此外,利用实时定量PCR(qRT-PCR)检测各基因型植株中开花相关基因的表达情况,结果表明,相对于WT,OE8和OE9中的开花促进基因CO、SOC1和LFY的表达量显著升高,而开花抑制基因FLC的表达量显著下降。研究结果说明RLK6过表达促进了拟南芥的开花,这为后续深入研究RLK6的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 拟南芥 LRR-rlks 过量表达 开花
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拟南芥LRR-RLK亚家族基因At1g09970突变体鉴定及表型观察 被引量:2
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作者 郭立琳 邓沛怡 +2 位作者 陈奇辉 栾升 李东屏 《晓庄学院自然科学学报》 EI CAS 北大核心 2006年第2期80-83,共4页
LRR-RLK是植物类受体蛋白激酶家族(RLK)中最大的亚家族.该亚家族基因在调控植物体生长发育和抗逆性方面发挥重要作用.At1g09970是LRR-RLK亚家族成员.通过PCR和RT-PCR在DNA和RNA水平上筛选鉴定At1g09970对应的T-DNA插入失活的突变体.对... LRR-RLK是植物类受体蛋白激酶家族(RLK)中最大的亚家族.该亚家族基因在调控植物体生长发育和抗逆性方面发挥重要作用.At1g09970是LRR-RLK亚家族成员.通过PCR和RT-PCR在DNA和RNA水平上筛选鉴定At1g09970对应的T-DNA插入失活的突变体.对萌发和萌发后阶段进行突变体的表型分析结果表明,At1g09970突变体在萌发后对NaCl敏感,暗示该基因与植物的抗盐胁迫有关. 展开更多
关键词 AT1 g09970 LRR-rlk NACL胁迫
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拟南芥LRR-RLKs亚家族蛋白RLK6的亚细胞定位及RLK6的组织表达 被引量:2
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作者 阿依江.哈拜克 杨敏 韩玉珍 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-6,共6页
以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,运用RT-PCR技术扩增得到了富含亮氨酸的类受体蛋白激酶(LRR-RLKs)亚家族基因RLK6,构建了RLK6与绿色荧光蛋白基因(GFP)融合表达载体并转化拟南芥,用激光共聚焦扫描显微镜观察转基因植物细胞表明:R... 以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,运用RT-PCR技术扩增得到了富含亮氨酸的类受体蛋白激酶(LRR-RLKs)亚家族基因RLK6,构建了RLK6与绿色荧光蛋白基因(GFP)融合表达载体并转化拟南芥,用激光共聚焦扫描显微镜观察转基因植物细胞表明:RLK6蛋白定位于细胞膜上;将RLK6-GFP在原生质体中进行瞬时表达,进一步证实了RLK6蛋白定位于细胞膜上。构建了RLK6启动子(2 063bp)融合GUS报告基因的载体并转化拟南芥,对转基因植株进行组织化学染色分析表明:RLK6在拟南芥的幼苗、根、花、角果等组织中都有表达,花中表达量较高,尤其是在雄蕊中特异高表达,而在茎、莲座叶和干种子中几乎没有表达。RT-PCR分析结果与GUS组织化学染色的结果一致。研究推测,RLK6可能在花器官生长发育或相关生理过程的信号转导中发挥作用。 展开更多
关键词 拟南芥 LRR—rlks 亚细胞定位 启动子 组织表达
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番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析 被引量:2
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作者 郭盼 孔华 +6 位作者 王雨 戴云素 贾瑞宗 周瑶 郭安平 纪长绵 马春花 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期867-879,共13页
本研究采用生物信息学方法在番木瓜全基因组范围系统鉴定了7个LysM-RLK家族基因,并解析了其染色体分布特征、基因结构特征、蛋白理化性质和亚细胞定位信息。基因家族进化分析表明番木瓜的7个LysM-RLK基因可划分为3个亚组(Lym-II,Lym-III... 本研究采用生物信息学方法在番木瓜全基因组范围系统鉴定了7个LysM-RLK家族基因,并解析了其染色体分布特征、基因结构特征、蛋白理化性质和亚细胞定位信息。基因家族进化分析表明番木瓜的7个LysM-RLK基因可划分为3个亚组(Lym-II,Lym-III,Lym-IV),并分布于4条染色体上。基因复制是番木瓜LysM-RLK家族进化的主要驱动力,基因复制分析鉴定得到7对复制基因。启动子序列调控元件分析发现其包含多个光响应元件及参与低温应答和逆境相关激素信号应答的元件。大规模比较转录组分析系统地解析了LysM-RLK在番木瓜生物胁迫、非生物胁迫条件下及不同组织中的基因表达模式,揭示其特异性的表达模式及潜在的生物学功能。复制基因对的表达分化、结构域组成差异和蛋白质三级结构的变化,暗示其在进化过程中的亚功能化现象。生物和非生物胁迫条件下的核心共表达网络分析鉴定了27个与LysM-RLK3强关联的核心基因,揭示了LysM-RLK3潜在的转录调控模式。相关结果为番木瓜LysM-RLK家族起源演化、功能分化及其在逆境响应和生长发育过程中的角色提供重要依据。 展开更多
关键词 番木瓜 LysM-rlk家族 生物信息分析 基因表达 蛋白三维结构
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苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析 被引量:6
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作者 田丹 朵虎 +2 位作者 刘河 吕前前 左存武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期421-432,共12页
以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性... 以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性状、进化特征、亚细胞定位、染色体位置和表达模式进行分析。通过鉴定,共获得41个成员,其氨基酸序列大小介于423~1 291 aa,分子量介于47.12~143.27 kD,等电点介于5.50~8.91,其中28个成员位于质膜。根据进化分析将拟南芥、水稻、马铃薯、杨树和苹果等5个物种的L-LEC-RLKs分为8个亚组,苹果L-LEC-RLKs分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅷ。染色体位置分析表明苹果L-LEC-RLKs存在多个串联重复。该家族成员在不同组织中存在多样化的表达模式。27个成员在苹果接种腐烂病菌(Valsa mali,Vm)或斑点落叶病菌(Alternaria alternata apple pathotype,AAAP)后存在差异表达。其中,MD15G1226500和MD14G1055200的表达量在两种病害发生后都发生了显著的差异。以上差异基因可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。 展开更多
关键词 苹果 L-LEC-rlk 生物信息学分析 苹果腐烂病 苹果斑点落叶病
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苹果和梨LysM-RLK响应腐烂病信号成员鉴定 被引量:3
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作者 王东东 温有福 +3 位作者 赵丹 朵虎 王超 左存武 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期381-392,共12页
以LysM(Pfam:PF01476)和Pkinase(Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果属(Malus spp.)及梨属(Pyrus spp.)植物基因组范围内鉴定了4个物种[苹果(M.pumila)‘嘎啦’、山荆子(M.baccata)、杜梨(P.betulifolia)、白梨(Pyrus bret... 以LysM(Pfam:PF01476)和Pkinase(Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果属(Malus spp.)及梨属(Pyrus spp.)植物基因组范围内鉴定了4个物种[苹果(M.pumila)‘嘎啦’、山荆子(M.baccata)、杜梨(P.betulifolia)、白梨(Pyrus bretschneideri)‘玉露香’]的LysM-RLK家族成员,并对该家族成员的生物信息学和响应腐烂病菌(Valsa canker)信号的表达模式进行了分析。共获得37个LysM-RLK家族成员,主要定位于质膜;进化分析发现以上4个物种及拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的LysM-RLK分为2个亚组;基因重复分析发现苹果和梨中都存在全基因组重复或片段重复现象,但仅苹果‘嘎啦’中存在基因串联重复现象;该基因家族成员的启动子区域存在多个响应植物激素或逆境胁迫信号的元件;在腐烂病菌侵染后31个LysM-RLK成员存在差异表达,其中成员MD04G1238900、MD04G1238700、Chr9.g46389和Chr4.g40822(GDR数据库)表达量显著上调,可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。 展开更多
关键词 LysM-rlk 生物信息学 腐烂病菌 基因表达
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植物Gly-RLK基因家族鉴定及其在苹果中的表达分析 被引量:2
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作者 朵虎 赵兴刚 +5 位作者 吕前前 王东东 冒霞 刘河 赵丹 左存武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1883-1894,共12页
类受体激酶(receptor like kinase,RLK)在植物生长发育和环境适应中起重要作用。前期研究发现苹果(Malus′domestica)中存在一类具有Glyco18胞外结构域(SM000636或SM000704)的RLK,命名为Glyco_18-RLK(Gly-RLK)。本试验中以Glyco18和Pkin... 类受体激酶(receptor like kinase,RLK)在植物生长发育和环境适应中起重要作用。前期研究发现苹果(Malus′domestica)中存在一类具有Glyco18胞外结构域(SM000636或SM000704)的RLK,命名为Glyco_18-RLK(Gly-RLK)。本试验中以Glyco18和Pkinase(SM000220)保守域全蛋白序列为种子序列,对53种被子植物基因组中的Gly-RLK进行鉴定,并分析其进化特征;明确苹果Gly-RLK(MdGly-RLK)的理化性状、亚细胞定位,基因在染色体上的分布、启动子区域的顺式作用元件和表达模式。结果表明,仅19种植物中存在Gly-RLK,家族成员数介于1~20,单子叶植物中均未发现该家族成员。根据进化分析将其分为8个亚组,亚组Ⅲ、Ⅶ和Ⅷ分布基因数较多。共发现6个MdGly-RLK,其编码的氨基酸序列大小、分子量和等电点分别介于451~776、50.99~87.33 kD和5.95~8.21,主要位于质膜,4个为串联重复。MdGly-RLK在苹果各组织和品种间存在不同的表达模式;接种苹果腐烂病菌(Valsa mali)后,6个MdGly-RLK均差异表达,MdGly-RLK6(MD15G1156900)可上调至对照的16.33倍。综上,Gly-RLK仅在部分双子叶植物中存在,家族成员的扩增速度较快。MdGly-RLK响应苹果生长发育和黑腐皮壳菌信号,MdGly-RLK6可作为苹果抗腐烂病研究的候选基因。 展开更多
关键词 苹果 Glyco_18-rlk(Gly-rlk) 进化特征 表达模式 腐烂病
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开发与柑桔抗溃疡病基因连锁的由RLK-RGC衍生的分子标记(英文) 被引量:5
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作者 向旭 郑启发 +3 位作者 黄舒 陈存贤 Frederick G.GmitterJr 邓占鳌 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第6期821-828,共8页
本文是在先期研究工作的基础上,利用从柑桔与枳属间杂种的基因组DNA所获得的类受体激酶(RLK)的候选抗病基因序列,重新设计引物,对柑桔抗溃疡病材料和感病材料开展以PCR扩增为基础的对比分析,其中一对引物‘19h16/DdeI’的扩增产物经限... 本文是在先期研究工作的基础上,利用从柑桔与枳属间杂种的基因组DNA所获得的类受体激酶(RLK)的候选抗病基因序列,重新设计引物,对柑桔抗溃疡病材料和感病材料开展以PCR扩增为基础的对比分析,其中一对引物‘19h16/DdeI’的扩增产物经限制性内切酶DdeI酶切,揭示了抗性材料(IchangPape-da,Meiwakumquat,MaruhikumquatandNagamikumquat)和感病材料(FlyingDragon,ValenciaorangeandPalestinesweetlime)之间的多态性差异,同时,在C.Ichangensis的自交F1代和Palestinesweetlime×IchangPapeda的杂交F1代群体中也见明显的多态性差异;对这些F1代个体进行溃疡病病原[Xanthomonasax-onopodispv.Citri(Xac)]接种作抗病性表型鉴定,结果表明,该分子标记‘19h16/DdeI’与柑桔溃疡病抗性密切相关;经纯化测序的结果进一步证明,抗性材料PCR扩增产物具有完全一致的序列和DdeI酶切位点,但感病材料缺少这一DdeI酶切位点;染色体步行(primerwalking)在BAC文库的对应单克隆中获得了一个完整的抗病基因序列,与以前获得的2个抗病基因序列‘17o6RLKP’和‘26m19RLKP’相比,‘19h16RLKP’也具有Xa21抗病基因蛋白的所有特征,包括含有一个信号肽、同样数目的亮氨酸重复序列、跨膜域和激酶域等。基于该序列的开放读码框,发展了特异性更强可靠性更高的另一分子标记,在今后的研究工作中具有较大的应用潜力。 展开更多
关键词 柑桔 溃疡病 抗性基因 类受体激酶 分子标记
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Analysis of expressed receptor-like kinases (RLKs) in soybean 被引量:2
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作者 Peng Liu Wei Wei +3 位作者 Shouqiang Ouyang Jin-Song Zhang Shou-Yi Chen Wan-Ke Zhang 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2009年第10期611-619,共9页
Receptor-like kinases (RLKs) play crucial roles in cellular signal perception and propagation. To study the evolutionary relationships among RLKs in soybean, a large-scale expressed sequence tags (ESTs) survey for... Receptor-like kinases (RLKs) play crucial roles in cellular signal perception and propagation. To study the evolutionary relationships among RLKs in soybean, a large-scale expressed sequence tags (ESTs) survey for RLKs-related sequences was conducted. By doing BLAST analysis using our database and The Gene Index Database, 605 putative RLK genes were identified. Based on the phylogeny of the kinase domain, these soybean RLKs were classified into 58 different small subfamilies. The phylogenetic analysis of RLKs in soybean, rice and Arabidopsis showed that different subfamilies of RLKs had different functions and could have experienced different selective pressures. 展开更多
关键词 SOYBEAN rlks PHYLOGENETIC ARABIDOPSIS RICE
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基于ITS和RLKs序列的苦荞种质资源遗传多样性分析 被引量:1
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作者 张久盘 常克勤 +2 位作者 杨崇庆 穆兰海 杜燕萍 《南方农业》 2020年第3期149-152,共4页
为明确苦荞资源的遗传多样性水平及遗传关系,对45份苦荞地方品种的ITS和RLKs序列进行基因测序和序列比较分析。结果显示,苦荞ITS和RLKs扩增序列较为保守,基因多态位点数分别占10.6%和7.7%。云贵川地区苦荞材料的遗传多样性最丰富,陕西... 为明确苦荞资源的遗传多样性水平及遗传关系,对45份苦荞地方品种的ITS和RLKs序列进行基因测序和序列比较分析。结果显示,苦荞ITS和RLKs扩增序列较为保守,基因多态位点数分别占10.6%和7.7%。云贵川地区苦荞材料的遗传多样性最丰富,陕西、山西及宁夏地区次之,甘肃及内蒙古地区最低。四川和贵州地区的苦荞品种均能够单独聚为一类,基于ITS序列构建的NJ树中,陕西地区以北的苦荞品种未形成明显的分支,而云南地区的苦荞穿插在不同的分支中;基于RLKs基因构建的NJ树中,同一地区的苦荞材料较为明显地形成地域聚类,但自展值均较低。 展开更多
关键词 苦荞 遗传多样性 ITS rlks
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甘蔗割手密种LRRII-RLK基因家族演化和表达分析
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作者 丁洪艳 冯晓溪 +1 位作者 汪柏宇 张积森 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1769-1784,共16页
LRRII-RLK是一种类受体激酶(receptor-likekinase,RLK),该基因家族在植物中广泛存在,在植物的生长发育和生物胁迫中发挥着重要的作用,但目前在甘蔗中未见对该基因家族的系统鉴定和分析。本研究对甘蔗的LRRII-RLK基因进行分类,并研究了... LRRII-RLK是一种类受体激酶(receptor-likekinase,RLK),该基因家族在植物中广泛存在,在植物的生长发育和生物胁迫中发挥着重要的作用,但目前在甘蔗中未见对该基因家族的系统鉴定和分析。本研究对甘蔗的LRRII-RLK基因进行分类,并研究了其结构和功能。结合割手密种基因组和发育组织、叶片发育梯度、昼夜节律和生物胁迫反应转录组数据,在甘蔗割手密种中共鉴定到27个LRRII-RLK基因,分布在17条染色体上。系统进化分析发现,它们分别属NIK、SERK和LRRII-C分支,其中处于LRRII-C分支的SsLRRII-RLK基因出现了显著扩增。顺式元件分析显示,它们的启动子共包含32类顺式元件,其主要参与植物光反应、响应胁迫反应、调控植物激素和植物生长发育。这些基因共有35对共线性基因对,具有多个保守基序,主要通过片段复制的方式进行扩增,且根据Ka/Ks比率发现,它们在演化过程中经历了严格的纯化选择作用。此外,SsLRRII-RLK基因表达分析显示,它们在甘蔗不同组织中表达量不同,其中部分基因在昼夜不同时期表达量呈现差异,这表明它们参与了植物生长和光合作用的调节。值得注意的是,SsLRRII-RLK基因的表达模式在不同病害(甘蔗梢腐病和花叶病)胁迫下呈现差异,因此,我们认为这些基因在病毒复制和发病机制过程中发挥作用。本研究结果有助于深入了解甘蔗LRRII-RLK基因的演化过程,且为LRRII-RLK基因在甘蔗生长发育、光合作用以及在病害胁迫中的功能研究提供初步的理论基础。 展开更多
关键词 割手密种 LRRII-rlk基因 转录组学 基因表达分析 演化分析
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铁皮石斛类受体激酶DoRLK的基因克隆和分子特征 被引量:1
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作者 高静 王楠 +5 位作者 刘阿萍 张明英 陈莹 关思静 彭亮 张岗 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第21期5307-5312,共6页
目的克隆铁皮石斛Dendrobium officinale类受体激酶(receptor-like kinase,RLK)基因,命名为DoRLK(GenBank注册号ANC68272.1)。方法采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和RACE技术获取基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域... 目的克隆铁皮石斛Dendrobium officinale类受体激酶(receptor-like kinase,RLK)基因,命名为DoRLK(GenBank注册号ANC68272.1)。方法采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和RACE技术获取基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用软件DNASTAR 6.0和MEGA 7.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果 DoR LK基因cD NA全长1 715 bp,编码1条由423个氨基酸组成的多肽,相对分子质量47 800.88,等电点为9.47。DoR LK蛋白包含RLK蛋白家族的1个蛋白激酶结构域(85~370)和一个跨膜基序(250~270)。DoR LK基因与多种植物RLK基因相似性很高(43.62%~63.35%),与小兰屿蝴蝶兰、海枣、芦笋等植物亲缘关系较近。DoR LK基因具有组织表达特异性,其转录本在石斛根中表达量较高,分别为叶和茎中的2.22、2.75倍。结论 DoR LK基因的分子鉴定为进一步揭示RLK在铁皮石斛与环境互作中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 类受体激酶 基因表达 定量PCR 抗逆
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普通菜豆FWR1基因克隆及功能验证
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作者 赵莉莉 常玉洁 +2 位作者 王绪敏 曲江勇 武晶 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第5期1005-1016,共12页
目前普通菜豆中克隆到的枯萎病抗性基因较少,因此,从种质资源中鉴定挖掘枯萎病抗性基因对于普通菜豆的分子育种具有重要的意义。课题组前期通过全基因组关联分析定位到PvFWR1(Fusarium Wilt Resistance 1),并且通过单倍型分析推断其可... 目前普通菜豆中克隆到的枯萎病抗性基因较少,因此,从种质资源中鉴定挖掘枯萎病抗性基因对于普通菜豆的分子育种具有重要的意义。课题组前期通过全基因组关联分析定位到PvFWR1(Fusarium Wilt Resistance 1),并且通过单倍型分析推断其可能与普通菜豆枯萎病抗性相关,在此基础上对该基因进行深入研究。在抗病材料土褐腰子豆、感病材料龙芸豆3号中克隆PvFWR1基因序列,经序列比对分析发现,PvFWR1是一个无内含子基因,CDS全长1104 bp,编码367个氨基酸,属于LRR-RLKs家族蛋白。RT-qPCR发现PvFWR1在抗性材料根组织中表达量为感病材料的2.1倍,且在接种枯萎病病原菌后,根组织中表达量明显上升。利用VIGS技术在抗病材料中对PvFWR1沉默,接种病原菌后,植株抗性减弱;同时,基于普通菜豆毛状根转化法在感病材料中对PvFWR1过表达,接种病原菌后,过表达植株抗性显著增强。综合以上分析,认为PvFWR1基因是枯萎病抗性基因。研究结果为普通菜豆枯萎病抗性机制解析及该基因的育种利用奠定了基础。 展开更多
关键词 普通菜豆 镰孢菌枯萎病 PvFWR1 LRR-rlks家族
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RLKs orchestrate the signaling in plant male-female interaction 被引量:10
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作者 Hongju Li Wei-Cai Yang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2016年第9期867-877,共11页
Different from animals, sessile plants are equipped with a large receptor-like kinase(RLK) superfamily. RLKs are a family of single trans-membrane proteins with divergent N-terminal extracellular domains capped by a s... Different from animals, sessile plants are equipped with a large receptor-like kinase(RLK) superfamily. RLKs are a family of single trans-membrane proteins with divergent N-terminal extracellular domains capped by a signal peptide and C-terminal intracellular kinase. Researches in the last two decades have uncovered an increasing number of RLKs that regulate plant development, stress response and sexual reproduction, highlighting a dominant role of RLK signaling in cell-to-cell communications. Sexual reproduction in flowering plants is featured by interactions between the male gametophyte and the female tissues to facilitate sperm delivery and fertilization. Emerging evidences suggest that RLKs regulate almost every aspect of plant reproductive process, especially during pollination. Therefore, in this review we will focus mainly on the function and signaling of RLKs in plant male-female interaction and discuss the future prospects on these topics. 展开更多
关键词 rlk SIGNALING plant reproduction pollen tube female gametophyte male-female interaction pollen tube growth and guidance pollen tube reception
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拟南芥类受体蛋白激酶AtORPK1的原核表达与多克隆抗体制备
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作者 盛卓然 周厚君 张洪霞 《鲁东大学学报(自然科学版)》 2025年第4期361-370,共10页
富含亮氨酸重复序列的受体样激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase, LRR-RLK)是一类富含亮氨酸的单跨膜类受体蛋白激酶,也是植物类受体蛋白激酶家族中最大的亚家族。本研究通过分段克隆LRR-RLK家族的氧化应激相关蛋白基因(oxi... 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶(leucine-rich repeat receptor-like kinase, LRR-RLK)是一类富含亮氨酸的单跨膜类受体蛋白激酶,也是植物类受体蛋白激酶家族中最大的亚家族。本研究通过分段克隆LRR-RLK家族的氧化应激相关蛋白基因(oxidative-stress related protein kinase 1,AtORPK1)编码序列构建原核表达载体,转化至大肠杆菌BL21,经IPTG诱导获得重组蛋白,并纯化出可溶性的AtORPK1蛋白C端。经免疫兔子获得了多克隆抗体,通过免疫荧光和western blot实验验证多克隆抗体与目的蛋白识别的特异性。本研究成功利用大肠杆菌表达了AtORPK1蛋白C端,并获得特异性良好的多克隆抗体,为快速制备植物富含亮氨酸单跨膜类受体蛋白的抗体提供了有效方法;获得的多克隆抗体可用于检测并鉴定目的蛋白在植物中的表达水平,还可用于免疫荧光分析,快速定位目的蛋白在植物细胞和组织中的分布,为研究植物类受体蛋白激酶信号通路的分子机理奠定基础,也为黄河流域盐碱地抗逆植物的分子育种提供参考依据。 展开更多
关键词 类受体蛋白激酶 AtORPK1 拟南芥 原核表达 多克隆抗体
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粳稻云引稻瘟病抗性近等基因系与免疫应答相关的LRR-RLKs差异基因分析 被引量:1
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作者 林悦龙 王昱澎 +8 位作者 朱永生 郑燕梅 蔡秋华 何炜 陈丽萍 谢鸿光 魏毅东 谢华安 张建福 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第30期3873-3885,共13页
在广谱抗稻瘟病品种云引与普感稻瘟病品种丽江新团黑谷(Lijiangxintuanheigu,LTH)构建的近等基因系抗、感病子代基因组重测序的差异基因中,从与免疫应答(immune response)相关的分类单元里得到8个基因序列有差异的基因.它们都为编码富... 在广谱抗稻瘟病品种云引与普感稻瘟病品种丽江新团黑谷(Lijiangxintuanheigu,LTH)构建的近等基因系抗、感病子代基因组重测序的差异基因中,从与免疫应答(immune response)相关的分类单元里得到8个基因序列有差异的基因.它们都为编码富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶基因,并聚集于11号染色体的邻近位置,且与已知的白叶枯病抗性基因Xa21具有一定同源性.为进一步探究这些类受体蛋白激酶类基因在稻瘟病抗性中可能发挥的功能,我们分析了这些基因的结构、进化及抗感子代间的序列差异类型,同时还分别采用离体和喷雾接菌的方式对云引和LTH进行稻瘟病接种并取样.通过实时荧光定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,q RT-PCR)发现,部分基因能受到稻瘟病菌的诱导,推测它们可能在水稻对抗稻瘟病病菌中发挥一定作用,为进一步挖掘稻瘟病相关抗性基因奠定基础. 展开更多
关键词 近等基因系 免疫应答 富含亮氨酸重复序列的类受体蛋白激酶 稻瘟病
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