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血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2的生物学信息预测 被引量：2
1
作者 赵珍 阿孜尔古丽·阿布都克日木 +3 位作者 屈艳琳 戴军 丁剑冰 于涛 《寄生虫病与感染性疾病》 CAS 2018年第4期182-185,191,共5页
目的应用在线软件分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2抗原蛋白的生物学信息,为研制新型血吸虫病基因疫苗提供理论基础。方法采用蛋白质分析系统Protparam(http:∥expasy.org/tools/protparam.html)分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶R... 目的应用在线软件分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2抗原蛋白的生物学信息,为研制新型血吸虫病基因疫苗提供理论基础。方法采用蛋白质分析系统Protparam(http:∥expasy.org/tools/protparam.html)分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2蛋白的理化性质;利用软件Protscale(http:∥www.espasy.org/cgibin/protscale.p1)蛋白质在线分析RIO2蛋白的亲(疏)水性;在线软件预测血吸虫RIO2丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶蛋白的二级结构,利用PyMOLviewer软件作图构建三级结构模型。结果利用在线软件预测血吸虫RIO2抗原蛋白的二级结构中α螺旋结构占41.01%,β-折叠占11.63%,无规则卷曲占34.25%。负电荷残基(Asp+Glu)数为55,正电荷残基(Arg+Lys)数为77,不稳定系数为50.41,预测为不稳定蛋白;总平均亲水性系数为-0.633,可能为亲水性蛋白质;预测RIO2蛋白糖基化位点在31、96、176、260、330和369氨基酸处,且存在在1个丝氨酸、1个苏氨酸、2个酪氨酸磷酸化。结论生物信息学分析血吸虫RIO2含有磷酸化位点和糖基化位点。因此推测其可能具有免疫原性,可为血吸虫高效表位疫苗的研发提供参考,为血吸虫病的临床诊断与治疗提供新的靶标。 展开更多
关键词 日本血吸虫 rio2蛋白 抗原表位 生物信息学
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