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苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
麻楠
刘静
+4 位作者
陈琦
郝素晓
卜芋芬
卢艳芬
姚允聪
《北京农学院学报》
2018年第2期1-6,共6页
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的...
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的编码序列,利用生物学工具分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR方法分析其基因表达水平。【结果】序列分析表明,苹果砧木‘SH6’的3种RGLs序列具有较高相似性,均存在DELLA蛋白和GRAS家族的结构特征。但序列也存在部分差异,预测其编码的蛋白都具有亲水性能,RGL1b,RGL2a蛋白大部分定位在细胞质,而RGL2b主要分布在细胞核。用实时荧光定量PCR方法,检测了‘SH6’及其亲本‘国光’中这3种RGLs基因的相对表达水平,结果显示,RGL1b,RGL2a,RGL2b在‘SH6’中的表达量均明显高于‘国光’中的表达。【结论】苹果砧木‘SH6’中RGL1b,RGL2a,RGL2b基因可能在果树矮化中发挥重要作用。
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关键词
SH6
DELLA蛋白
rgl1b
RGL2a
RGL2b
株高
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职称材料
题名
苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
麻楠
刘静
陈琦
郝素晓
卜芋芬
卢艳芬
姚允聪
机构
北京农学院植物科学技术学院/北京林果业生态环境功能提升协同创新中心
出处
《北京农学院学报》
2018年第2期1-6,共6页
基金
农业应用新技术北京市重点实验室开放课题(kf2016024)
文摘
【目的】从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL2a,RGL2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析。【方法】通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL2a,RGL2b的编码序列,利用生物学工具分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR方法分析其基因表达水平。【结果】序列分析表明,苹果砧木‘SH6’的3种RGLs序列具有较高相似性,均存在DELLA蛋白和GRAS家族的结构特征。但序列也存在部分差异,预测其编码的蛋白都具有亲水性能,RGL1b,RGL2a蛋白大部分定位在细胞质,而RGL2b主要分布在细胞核。用实时荧光定量PCR方法,检测了‘SH6’及其亲本‘国光’中这3种RGLs基因的相对表达水平,结果显示,RGL1b,RGL2a,RGL2b在‘SH6’中的表达量均明显高于‘国光’中的表达。【结论】苹果砧木‘SH6’中RGL1b,RGL2a,RGL2b基因可能在果树矮化中发挥重要作用。
关键词
SH6
DELLA蛋白
rgl1b
RGL2a
RGL2b
株高
Keywords
SH6
DELLA protein
rgl1b
RGL2a
RGL2b
height
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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被引量
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1
苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析
麻楠
刘静
陈琦
郝素晓
卜芋芬
卢艳芬
姚允聪
《北京农学院学报》
2018
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