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小麦抗病基因同源序列(RGAs)的克隆与分析(英文) 被引量:9
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作者 刘松青 何莎 +3 位作者 蒋芳 韦先超 周翰林 涂睿 《中国农学通报》 CSCD 2007年第3期83-88,共6页
RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏... RGA(抗性基因同源序列)法是克隆植物抗性基因的一种经济有效的方法,成为近年来的研究热点。本实验综合分析了拟南芥,西红柿,水稻,烟草等植物已克隆的抗性基因,并以这些抗性基因的NBS(核酸结合位点),LRR(富含亮氨酸重复),STK(丝氨酸/苏氨酸激酶)保守结构域设计并合成了几十对RGA引物,对小麦抗条锈病材料进行PCR扩增,获得以Xal-NBS为引物的R88RGA片段,经克隆和序列比对分析,发现该片段与逆境条件下植物抗病信号传导相关,与蛋白激酶同源性达到96%。此项研究对抗病机理的研究和基因的发掘有重要的指导意义。 展开更多
关键词 抗病基因同源序列(rgas) 克隆 小麦
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亚洲棉5号染色体RGAs克隆与分析
2
作者 彭仁海 程华 +5 位作者 刘方 王春英 黎绍惠 张香娣 王玉红 王坤波 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期120-123,共4页
棉花是最主要的天然纤维作物,深入进行棉花基因组研究具有重要意义.采用酶解、前后低渗和轻压相结合的方法制备亚洲棉染色体中期膜载片,激光法分离亚洲棉第5号单染色体,建单染色体扩增池后克隆其抗病基因同源序列(RGAs),获得P7、P12、P1... 棉花是最主要的天然纤维作物,深入进行棉花基因组研究具有重要意义.采用酶解、前后低渗和轻压相结合的方法制备亚洲棉染色体中期膜载片,激光法分离亚洲棉第5号单染色体,建单染色体扩增池后克隆其抗病基因同源序列(RGAs),获得P7、P12、P19和P23等4个序列.序列比对和聚类分析表明,这4条序列均为NBS-LRR类RGAs,P7、P12、P19聚成一类,它们之间的同源性很高,P23聚成另一类,与黑松的RPS2和油菜的RGA30同源性较高.为该染色体分子标记开发、基因克隆乃至全序列测定奠定基础. 展开更多
关键词 亚洲棉 LA-PCR rgas
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水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析 被引量:1
3
作者 张颖 王长春 +3 位作者 胡海涛 张维林 严成其 杨玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期51-57,共7页
旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与... 旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与LRR结构域,具备CC-NBS-LRR类植物抗病基因的结构特征。BLASTn和BLASTp比对显示SHNLR是单拷贝基因,未发现同源性较高且功能已知的基因,仅NBS保守域序列与番茄Prf基因的相似度最高。对SHNLR基因电子定位,发现其位于水稻第11号染色体的长臂末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗性基因具有不同序列或处于不同的位置。半定量RT-PCR分析表明,SHNLR在抗病新种质叶片中的表达明显受到白叶枯病菌Zhe173的诱导。因此推测SHNLR可能是1个与抗白叶枯病相关的R基因。 展开更多
关键词 rgas 水稻 白叶枯病抗性基因 克隆 表达分析
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香蕉抗病种质NBS类RGAs的克隆及相关序列差异分析
4
作者 徐金刚 向旭 +2 位作者 蔡礼鸿 孟祥春 黄秉智 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第S1期200-209,共10页
根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料GCTCV-119的基因组DNA及cDNA中扩增获得9个DNA片段和10条cDNA片段,均编码为通读的氨基酸序列,命名为"BR-1&quo... 根据植物NBS类抗病基因保守氨基酸序列P-loop和疏水氨基酸GLPL保守序列设计简并引物,从香蕉抗镰刀菌枯萎病(4号小种)材料GCTCV-119的基因组DNA及cDNA中扩增获得9个DNA片段和10条cDNA片段,均编码为通读的氨基酸序列,命名为"BR-1"-"BR-19",GenBank登录号依次为EF515833-EF515836, EU123871-EU123885。同源性分析表明,均与已报道的植物抗病基因有不同程度的同源性,具有P-loop(Kinase-1a)、Kinase-2、RNBS-B(Kinase-3a)以及GLPL等保守氨基酸序列,属于non-TIR-NBS类候选抗病基因。其中,BR-5和BR-6与番茄抗镰刀菌枯萎病番茄专化型I2、I2-1和I2-2基因聚为一类,可能与香蕉镰刀菌枯萎病的抗性相关。 展开更多
关键词 香蕉 抗病种质 抗病基因类似物(RGA) 核苷酸结合位点(NBS)
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Cloning and characterization of gene-resistant analogs(RGAs)involved in rust(Puccinia psidii) resistance in Eucalyptus grandis
5
作者 Marcelo Luiz Laia Acelino Couto Alfenas +5 位作者 Sergio Hermínio Brommonschenkel Shinitiro Oda Eduardo José de Melo Inaê Mariêde Araú jo Silva Janaína Fernandes Gonalves Ariadne Marques 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2015年第3期711-718,共8页
Disease-resistant genes play an important role in defending against a variety of pathogens and insect pests in plants. Most of the disease-resistant genes encode pro- teins with conserved leucine rich repeat and nucle... Disease-resistant genes play an important role in defending against a variety of pathogens and insect pests in plants. Most of the disease-resistant genes encode pro- teins with conserved leucine rich repeat and nucleotide binding site domains. In this study, we cloned and char- acterized gene-resistant analogs (RGAs) from Eucalyptus grandis using degenerate PCR, with primers specifically targeting these two domains. The amplified fragments were cloned into the pGEM-T vector and transformed into Escherichia coli. Among the 90 clones obtained, 13 were sequenced and compared with each other and with previ- ously identified gene-resistant diseases. A BLASTX search in GenBank revealed high similarities among the con- served domains of these cloned genes with RGA genes. Some clones, however, showed no significant similarity with DNA sequences in GenBank. Southern blotting ana- lysis identified several polymorphic RFLP loci between distinct genotypes. However, none of them co-segregated with the Puccinia psidii Winter resistance gene 1 (Ppr1) in a population study. 展开更多
关键词 CLONING Conserved domains rgas RUST EUCALYPTUS
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Identification and Cloning of Resistance Gene Analogues (RGAs) Encoding NBS-LRR Proteins from Gossypium arboreum L.
6
作者 AZHAR Muhammad Tehseen BASHIR Aftab BRIDDON Rob W MANSOOR Shahid 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期42-,共1页
Plants have developed a complicated defense mechanism during evolution to resist the harmful pathogens they encountered.The mechanism involves the interaction of the plant resistance(R)
关键词 NBS Encoding NBS-LRR Proteins from Gossypium arboreum L Identification and Cloning of Resistance Gene Analogues LRR rgas
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花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis)黑腐病抗性基因同源序列分离及克隆的研究 被引量:3
7
作者 古瑜 赵前程 +3 位作者 刘松 王春国 孙德岭 宋文芹 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期62-66,共5页
通过从 NBS 保守序列设计简并引物 PCR 的方法,以花椰菜(Brassica oleracea vat.botrytis)抗、感黑腐病的近等基因系为材料,分离得到 NBS-LRR 型抗性基因同源序列,并获得1个克隆,命名为 RGA330-7.Southern 杂交表明,该片段在近等基因系... 通过从 NBS 保守序列设计简并引物 PCR 的方法,以花椰菜(Brassica oleracea vat.botrytis)抗、感黑腐病的近等基因系为材料,分离得到 NBS-LRR 型抗性基因同源序列,并获得1个克隆,命名为 RGA330-7.Southern 杂交表明,该片段在近等基因系中存在明显的多态性,且该片段在抗黑腐病基因位点至少存在3个以上类似 RGA330-7的同源拷贝.序列分析结果认为该克隆与 NBS-LRR 型抗性基因的部分 CDSs 有很高的同源性,说明该片段属于 NBS-LRR 型.系统进化分析该序列与甘蓝型油菜的2个抗病同源序列归为一类,很可能这3个不同来源的抗性基因同源序列同属于一种抗性基因家族.因此推测该序列与花椰菜抗黑腐病基因紧密相关,为进一步克隆花椰菜抗黑腐病基因提供了可靠的候选基因,对分子标记辅助抗性育种具有重要意义。 展开更多
关键词 黑腐病 花椰菜(Brassica OLERACEA var.botrytis) rgas(resistance gene analogs rgas)
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小麦NBS-LRR类抗病基因同源cDNA序列的克隆与表达分析 被引量:8
8
作者 任晓娣 刘彦慧 +4 位作者 李建嫄 张娜 彭巧慧 杨文香 刘大群 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期69-74,79,共7页
为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物... 为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物的CC-NBS-LRR结构模式,命名为TaNLR。该基因包含一个完整的2 739bp的开放阅读框(ORF),具有连续的Poly A尾和典型的加尾信号AATTAA。ProtParam程序预测表明该基因编码912个氨基酸。发育树分析显示该氨基酸序列与大麦的NBS-LRR类抗病基因蛋白同源性最高达89%。荧光定量PCR分析表明,在小麦与叶锈菌互作中,TaNLR基因受叶锈菌诱导下调表达。本研究在TcLr19小麦中成功获得了抗病同源基因,这为明确NBS-LRR在小麦抗叶锈病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 核苷酸结合位点(NBS) 富含亮氨酸重复(LRR) 抗病基因同源序列(rgas) cDNA末端快速扩增技术(RACE) 实时定量PCR(real-time PCR)
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抗香蕉枯萎病的野生蕉抗病基因类似序列的克隆与表达(英文) 被引量:6
9
作者 陈雅平 陈云风 +2 位作者 赵杰堂 黄霞 黄学林 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期567-573,共7页
野生蕉是香蕉遗传改良的天然基因库。为了分离野生蕉中的抗病基因类似序列,根据核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶域设计简并性引物,以经过鉴定的抗香蕉枯萎病4号生理小种的野生蕉(Musa acuminata)叶... 野生蕉是香蕉遗传改良的天然基因库。为了分离野生蕉中的抗病基因类似序列,根据核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶域设计简并性引物,以经过鉴定的抗香蕉枯萎病4号生理小种的野生蕉(Musa acuminata)叶片cDNA为模板进行PCR扩增。经过对扩增产物进行克隆和测序,获得了6个500 bp左右的RGAs片段。其中有2个RGA(WNB1和WNB2)具有NB-ARC保守结构域特征,并且WNB1具有连续的ORF。其余4个RGAs(WST1、WST2、WST3和WST4)均具有丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶域特征,且WST3编码的氨基酸序列与水稻抗叶斑病基因Xa21同源性很高。用半定量PCR分析枯萎病菌诱导后野生蕉叶片中RGAs的表达情况,结果表明WNB1和WST3受枯萎病菌诱导后表达量增强,这表明WNB1和WST3的表达可能与香蕉枯萎病抗性相关。 展开更多
关键词 野生蕉(Musa acuminata) 枯萎病 抗病基因类似序列(rgas) 克隆 表达
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小麦NBS类抗病基因同源cDNA序列的克隆与特征分析 被引量:9
10
作者 张楠 王海燕 刘大群 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期605-610,615,共7页
根据已克隆植物抗病(R)基因NBS保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),在小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr19中进行抗病同源基因cDNA全长的扩增。获得了1个通读的NBS类抗病同源基因S11A11cDNA序列,该序列全长29... 根据已克隆植物抗病(R)基因NBS保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),在小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr19中进行抗病同源基因cDNA全长的扩增。获得了1个通读的NBS类抗病同源基因S11A11cDNA序列,该序列全长2923bp,编码878个氨基酸序列。生物信息学分析结果表明,该片段含有NB-ARC保守结构域和多个LRR结构域。聚类分析表明,S11A11编码的蛋白与小麦抗叶锈病基因Lr1编码的蛋白亲缘关系较近,而与Lr10亲缘关系较远。半定量RT-PCR分析表明,该基因在小麦叶片中为低丰度组成型表达。本研究在TcLr19小麦中成功获得了抗病基因同源序列,为最终克隆小麦抗叶锈病目的基因奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 核苷酸结合位点(NBS) 抗病基因同源序列(rgas) cDNA末端快速扩增技术(RACE) 半定量RT-PCR
原文传递
小麦STK类抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:6
11
作者 张楠 王海燕 刘大群 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第5期20-24,共5页
根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类催化结构域Ⅰ和Ⅷ氨基酸保守序列设计简并引物,以TcLr19、TcLr35和感病对照Thatcher的cDNA为模板进行抗病基因同源序列的PCR扩增,得到了6条通读的抗病基因同源序列(RGAs)Lr19-RGA1、Lr19-RGA2、Lr19-RGA3、L... 根据丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类催化结构域Ⅰ和Ⅷ氨基酸保守序列设计简并引物,以TcLr19、TcLr35和感病对照Thatcher的cDNA为模板进行抗病基因同源序列的PCR扩增,得到了6条通读的抗病基因同源序列(RGAs)Lr19-RGA1、Lr19-RGA2、Lr19-RGA3、Lr35-RGA1、Lr35-RGA2和TC-RGA。在NCBI中用BLASTp比对发现,Lr19-RGA1、Lr19-RGA2、Lr19-RGA3、Lr35-RGA1和Lr35-RGA2编码的氨基酸序列具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine-thre-onine kinase,STK)的催化结构域Ⅱ-Ⅷ。对序列分析还发现,它们与已克隆的STK类抗病基因有不同程度的相似性,为进一步克隆小麦抗叶锈病相关基因提供了依据。 展开更多
关键词 小麦 叶锈 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STK) 抗病基因同源序列(rgas)
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DNA分子标记的研究进展及几种新型分子标记技术 被引量:36
12
作者 关强 张月学 +5 位作者 徐香玲 孙德全 李绥艳 林红 潘丽艳 马延华 《黑龙江农业科学》 2008年第1期102-104,共3页
分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种比较理想的遗传标记技术。综述了DNA分子标记的类型,基本原理和特点,同时还对几种最新出现的分子标记技术作了简要的介绍。
关键词 新型DNA分子标记 rgas标记 RMAPD SRAP TRAP
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黄瓜抗病基因同源序列的表达分析 被引量:4
13
作者 许春梅 秦智伟 +1 位作者 丁国华 周秀艳 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期24-28,共5页
对黄瓜抗霜霉病品种东农129进行霜霉菌诱导,以稳定表达的18S RNA基因做对照,用RT-PCR半定量的方法分析黄瓜抗病基因同源序列(RGAs)的表达情况。结果表明,霜霉菌能诱导RGA基因的表达,经霜霉菌诱导后多数RGA基因相对表达量增强。说明了RG... 对黄瓜抗霜霉病品种东农129进行霜霉菌诱导,以稳定表达的18S RNA基因做对照,用RT-PCR半定量的方法分析黄瓜抗病基因同源序列(RGAs)的表达情况。结果表明,霜霉菌能诱导RGA基因的表达,经霜霉菌诱导后多数RGA基因相对表达量增强。说明了RGA基因的表达情况和霜霉菌密切相关。用半定量RT-PCR研究RGA基因的表达具有操作简单,特异性高,可靠性强的优点。 展开更多
关键词 黄瓜 rgas CDNA 表达
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巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析 被引量:1
14
作者 游启孙 莫廷辉 +3 位作者 曾丽星 张影波 解辉 欧阳超 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期371-376,共6页
【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的... 【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的巴西橡胶叶片,进行cDNA同源序列克隆。【结果】序列分析结果表明,克隆获得的RGAs经系统进化分析分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR 两种类型和9个基因家族;多重比较发现,克隆获得的RGAs具有典型的NBS类抗病基因保守结构域,在与已知植物NBS类序列相似性比较中,与I2c-2基因相似性最高,为46.2%,而巴西橡胶NBS类RGAs之间氨基酸相似性为22.1%~100.0%。进一步研究发现,核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于1,有低水平的重组,表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量。【结论】通过SA诱导作用和NBS类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBS类RGAs具有广泛的遗传多样性,并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性,这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系。 展开更多
关键词 巴西橡胶 水杨酸 NBS—LRR 抗病基因同源序列(rgas) 核苷酸结合位点(NBS)
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黄瓜NBS类型抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:35
15
作者 丁国华 秦智伟 +3 位作者 刘宏宇 周秀艳 池春玉 王志坤 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期638-642,共5页
简要报道利用简并引物从黄瓜基因组DNA中分离得到15条NBS类型RGA,登录GenBank获得登录编号分别为AY555482-AY555495和AY545993。其中10条为可通读序列,与已报道的甜瓜RGA有较高的同源性。
关键词 黄瓜 RGA NBS
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HPLC测定RGA胶囊中红景天苷的含量 被引量:12
16
作者 罗秀珍 钟忠 +2 位作者 谢忱 徐丽珍 杨世林 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期228-229,共2页
关键词 RGA胶囊 红景天苷 含量 测定 高效液相色谱法
暂未订购
基于相对增益矩阵原理的柔性交流输电系统控制器交互影响分析 被引量:42
17
作者 江全元 邹振宇 +2 位作者 吴昊 曹一家 王海风 《中国电机工程学报》 EI CSCD 北大核心 2005年第11期23-28,78,共7页
随着柔性交流输电(FACTS)控制器在电力系统中的广泛应用,FATCS控制器之间可能存在交互影响作用,从而给电力系统的运行和控制带来负面影响。该文介绍了相对增益(RGA)方法的基本原理,并用RGA原理分别研究了含SVC和STATCOM的单机无穷大系... 随着柔性交流输电(FACTS)控制器在电力系统中的广泛应用,FATCS控制器之间可能存在交互影响作用,从而给电力系统的运行和控制带来负面影响。该文介绍了相对增益(RGA)方法的基本原理,并用RGA原理分别研究了含SVC和STATCOM的单机无穷大系统和含2个SVC的两区域四机电力系统中FACTS控制器之间交互影响的强弱,时域仿真结果与RGA原理的分析结果一致,表明了RGA原理分析FACTS控制器之间交互影响作用的可行性和有效性。 展开更多
关键词 柔性交流输电 交互影响 系统控制器 增益矩阵 FACTS控制器 单机无穷大系统 STATCOM 电力系统 影响作用 RGA 基本原理 分析结果 仿真结果 原理分析 SVC
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百合品种抗病基因同源序列分析及抗枯萎病的鉴定 被引量:11
18
作者 杨秀梅 王继华 +3 位作者 王丽花 张艺萍 张丽芳 瞿素萍 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2404-2412,共9页
采用鳞片接种法对36个百合品种及5个野生种进行枯萎病(Fusarium oxysporumf.sp.lilii)接种鉴定,筛选抗性优异资源。结果表明:百合品种及野生种中蕴藏丰富的抗枯萎病种质资源。利用RGA-PCR方法对百合遗传多样性进行分析,10对RGA引物在41... 采用鳞片接种法对36个百合品种及5个野生种进行枯萎病(Fusarium oxysporumf.sp.lilii)接种鉴定,筛选抗性优异资源。结果表明:百合品种及野生种中蕴藏丰富的抗枯萎病种质资源。利用RGA-PCR方法对百合遗传多样性进行分析,10对RGA引物在41个品种及野生种中共扩增条带159条,其中多态带156条,占总带数的98.1%。以相似系数0.71聚类,41个百合品种及野生种划分为7类。抗性表型与RGA相似性聚类结果表明,利用品种的抗性表型聚类,趋于抗病性相近的聚为一类;利用RGA相似性聚类,趋于遗传背景相近的聚为一类。百合品种RGA的DNA指纹多态性与枯萎病抗性遗传表型多样性无明显的对应关系。对亲本材料进行抗性鉴定和抗病基因同源序列多态性分析,能更准确地反映亲本的遗传背景,为百合枯萎病抗性基因鉴定及品种培育提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 百合 抗病基因同源序列(RGA) 枯萎病 抗性鉴定
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云南抗白叶枯病稻种的RGA初析 被引量:9
19
作者 姬广海 张世光 +2 位作者 魏兰芳 崔汝强 徐绍忠 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期969-974,共6页
根据水稻抗白叶枯病Xa2 1基因的富含亮氨酸重复区域 (LRR)和番茄抗细菌性斑点病 (Pseudomonassyringaepv tomato)的Pto基因编码蛋白质激酶的DNA序列 ,设计 2对引物用于扩增抗水稻白叶枯病品种中的抗病基因同源序列。经聚丙烯酰胺凝胶电... 根据水稻抗白叶枯病Xa2 1基因的富含亮氨酸重复区域 (LRR)和番茄抗细菌性斑点病 (Pseudomonassyringaepv tomato)的Pto基因编码蛋白质激酶的DNA序列 ,设计 2对引物用于扩增抗水稻白叶枯病品种中的抗病基因同源序列。经聚丙烯酰胺凝胶电泳和聚类分析 ,结果表明供试抗病品种间具有丰富的RGA多态性 ,用同一引物测定的属于同一簇的品种显示相似的抗性和抗谱。从XLRRfor/XLRRrev引物的聚类图中可知 ,在遗传距离为 0 2 5时 ,测试的 4 7个抗白叶枯病水稻品种可分为 9个簇。其中 3、4、7组为主要组群 ,第 3组包括 2 3个水稻品种 ,在遗传距离为 0 2时 ,可进一步分为 5个亚群。RGA分析结果为水稻抗病育种选择亲本和利用品种布局进行白叶枯病生态控制提供了依据。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病抗性 抗病基因同源序列 RGA指纹
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簇毛麦6V染色体短臂特异分子标记的开发和应用 被引量:12
20
作者 王春梅 别同德 +2 位作者 陈全战 曹爱忠 陈佩度 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1595-1600,共6页
为开发簇毛麦6V染色体短臂特异的分子标记,并利用这些标记对缺失系进行鉴定,选用11个RGA和17对STS引物进行多态性分析,其中1个RGA引物和1对STS引物在对普通小麦扬麦5号、簇毛麦及普通小麦-簇毛麦6VS/6AL易位系进行多态性分析时,分别检... 为开发簇毛麦6V染色体短臂特异的分子标记,并利用这些标记对缺失系进行鉴定,选用11个RGA和17对STS引物进行多态性分析,其中1个RGA引物和1对STS引物在对普通小麦扬麦5号、簇毛麦及普通小麦-簇毛麦6VS/6AL易位系进行多态性分析时,分别检测到一条约1000bp和约800bp的多态性片段,将这两个标记转化为稳定的特异性分子标记,分别命名为CINAU17-1086和CINAU18-723。运用这两对引物对一系列材料进行扩增,只有含6V染色体短臂的材料才能扩增出相应的特异条带,表明这两个标记均位于簇毛麦6VS上。进一步利用簇毛麦6VS缺失添加系、易位系将CINAU17-1086标记定位在簇毛麦6VSFL0.58与FL0.70之间,将CINAU18-723标记定位在簇毛麦6VSFL0.45与着丝粒之间。利用这两个特异标记对通过花粉辐射获得的部分簇毛麦6VS结构变异材料进行PCR鉴定,其结果与细胞学鉴定结果一致。CINAU17-1086和CINAU18-723标记可用来快速检测和追踪导入普通小麦背景中的簇毛麦6VS染色体片段,并对缺失系的断点进行了初步界定。 展开更多
关键词 簇毛麦 抗病基因类似物(RGA) 位点标签序列(STS) 染色体特异分子标记 缺失系
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