-
题名RAD54L 在口腔鳞状细胞癌中的表达及功能研究
被引量：3
- 1
-
-
作者
曹显
陈佳琳
张锐
过新民
-
机构
暨南大学附属广州红十字会医院口腔科
暨南大学附属广州红十字会医院超声医学科
暨南大学附属广州红十字会医院急诊医学科
-
出处
《口腔疾病防治》
2024年第11期853-862,共10页
-
基金
广东省自然科学基金项目(2020A1515010816)
广州市市校(院)企联合资助基础与应用基础研究项目(2024A03J0676)。
-
文摘
目的探讨DNA修复重组RAD54样蛋白(RAD54-like protein,RAD54L)在口腔鳞状细胞癌(oral squa-mous cell carcinoma,OSCC)中的表达及功能作用。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TC-GA)数据库中OSCC相关数据,通过Mann-Whitney U检验分析RAD54L在OSCC与对照样本中的表达差异,并采用受试者工作特征曲线评估RAD54L在OSCC诊断中的潜在价值。通过卡方检验分析RAD54L mRNA表达水平与OSCC患者临床病理数据之间的关系。将OSCC样本根据RAD54L mRNA表达中位值分为高低表达两组后,采用Cox回归分析比较两组的预后差异;采用DESeq2软件包筛选组间的差异表达基因,并利用cluster-Profiler包进行KEGG通路富集分析。采用Spearman相关性分析展示RAD54L与同源重组修复途径中基因表达的相关性。在明确RAD54L的生物信息学意义后,在人OSCC细胞株HSC-3中进行RAD54L基因敲低实验,并通过qRT-PCR验证敲低效率。转染后,通过CCK-8、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-ethynyl-2'-deoxyuridine,EdU)染色、细胞划痕、细胞凋亡及细胞周期实验,评估HSC-3细胞增殖、迁移、凋亡及周期的变化。结果生物信息学分析结果显示,RAD54L mRNA在OSCC中的表达高于正常对照组(P<0.001),且对预后不良的预测具有较高价值(AUC=0.927)。RAD54L高表达组男性患者比例增加(P=0.032),具有更高的T分期(P=0.040)、临床分期(P=0.027)及病理学分级(P=0.013)。以RAD54L mRNA表达中位值将OSCC样本分为高低表达两组后,RAD54L高表达组的预后较低表达组差(P=0.049);RAD54L高低表达两组间的差异表达基因主要富集于神经活性配体与受体的相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、钙信号通路、细胞周期、胃癌、细胞外基质受体相互作用、化学致癌-DNA加合物、DNA复制、同源重组和错配修复途径(P<0.05),在同源重组修复途径中RAD54L的表达与BRCA1、BLM、EME1、XRCC2、POLD1、TOPBP1、RAD51、BRIP1、RAD54B、BRCA2和SYCP3的表达呈正相关(P<0.05),其中与BRCA1、BLM和EME1的表达呈强正相关(R>0.8,P<0.05)。体外实验结果表明,RAD54L在HSC-3细胞中的表达被敲低至约25%(P<0.001),与对照组相比,RAD54L敲低组的增殖率降低(P<0.05),EdU阳性细胞比例下降(P<0.001),划痕闭合比例降低(P<0.001),G1期细胞比例增加(P<0.001),S期细胞比例降低(P<0.001),细胞凋亡比例增加(P<0.001)。结论RAD54L在OSCC中高表达且与不良预后相关。下调RAD54L表达可抑制HSC-3细胞的增殖和迁移,促进细胞凋亡,并阻碍细胞周期进程。
-
关键词
同源重组修复基因
rad54l
口腔鳞状细胞癌
预后
细胞增殖
细胞凋亡
细胞周期
生物信息学分析
-
Keywords
homologous recombination repair gene
rad54l
oral squamous cell carcinoma
prognosis
cell proliferation
cell apoptosis
cell cycle
bioinformatics analysis J Prev Treat Stomatol Dis,2024,32(11):853-862.
-
分类号
R78
[医药卫生—口腔医学]
-
-
题名RAD54L在肝细胞癌中的表达及临床意义
被引量：1
- 2
-
-
作者
虞豪骋
张嘉凯
张水军
郭文治
-
机构
郑州大学第一附属医院肝胆胰外科
河南省消化器官移植重点实验室
-
出处
《河南医学研究》
CAS
2022年第5期773-777,共5页
-
基金
河南省医学科技攻关计划省部共建项目(SBGJ2018002)。
-
文摘
目的探讨RAD54L基因在肝细胞癌(HCC)中的诊断及预后价值。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的HCC数据,分析RAD54L对HCC的诊断价值以及与临床特征的关系。采用生存分析、单因素Cox回归、多因素Cox回归分析RAD54L在HCC患者中的预后价值。利用TIMER数据库分析RAD54L与免疫浸润细胞丰度的关系。利用基因集富集分析(GSEA)预测RAD54L高表达的相关通路。结果RAD54L基因在HCC中表达水平高于癌旁组织,且具有诊断价值,表达水平与性别、病理学分级等相关(P<0.05)。RAD54L表达水平是HCC独立的预后因素,高表达的患者预后较差。RAD54L表达水平与免疫浸润细胞的丰度相关。RAD54L高表达富集于细胞周期、同源重组等通路。结论RAD54L可能是HCC潜在的诊断和预后标志物。
-
关键词
rad54l
肝细胞癌
癌症基因组图谱
预后
-
Keywords
rad54l
hepatocellular carcinoma
The Cancer Genome Atlas
prognosis
-
分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
-
-
题名RAD54L在肝硬化中的表达及临床意义
- 3
-
-
作者
李宏达
凌翔宇
孙东跃
周庆
-
机构
江苏大学附属医院普外科
-
出处
《医学研究杂志》
2024年第4期35-39,51,共6页
-
基金
国家重点研发计划项目(2018YFA0107500)。
-
文摘
目的 探讨RAD54样蛋白(RAD54-like protein, RAD54L)在肝硬化中的表达情况以及临床意义。方法 通过生物信息学分析RAD54L的表达情况,并通过临床标本和小鼠肝硬化模型验证了RAD54L的表达,与血清标本的肝功能指标进行相关性分析,探究RAD54L的临床意义。结果 RAD54L作为同源重组修复的关键基因,通过肝硬化的数据库中验证其存在表达差异(P<0.05)。RAD54L在临床标本(P<0.01)和小鼠模型标本(P<0.01)中表达均升高,与肝功能指标(谷丙转氨酶、谷草转氨酶)呈正相关,在一定程度上反映了肝损伤的程度。结论 RAD54L可以作为判断肝损伤以及了解进展情况的分子标志物。
-
关键词
rad54l
肝硬化
同源重组修复
肝损伤
-
Keywords
rad54l
Cirrhosis
Homologous recombination repair
Liver injury
-
分类号
R575.2
[医药卫生—消化系统]
-
