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基于PCR-CRSIPR/Cas12a的DNMT3A R882H/C可视化检测方法
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作者 蒋清杨 孙如美 +5 位作者 缪夏萍 范喜杰 张浩名 夏银骁 李凯敏 陈涛 《分子影像学杂志》 2025年第5期589-596,共8页
目的开发一种基于聚合酶链式反应(PCR)和成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关蛋白(Cas12a)系统的DNMT3A R882H(c.2645G>A)/C(c.2644C>T)可视化检测系统。方法选取2023年9月~2024年9月于烟台毓璜顶医院收集的34例疑似急... 目的开发一种基于聚合酶链式反应(PCR)和成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关蛋白(Cas12a)系统的DNMT3A R882H(c.2645G>A)/C(c.2644C>T)可视化检测系统。方法选取2023年9月~2024年9月于烟台毓璜顶医院收集的34例疑似急性髓系白血病患者的骨髓样本。针对DNMT3A R882H/C突变位点序列,首先设计PCR-Cas12a核酸检测系统所需的特异性扩增引物和CRISPR RNA(crRNA)。通过琼脂糖凝胶电泳筛选出扩增性能较好的引物对,并利用Cas12a蛋白切割邻近荧光探针产生的荧光强度,基于突变型和野生型信号的差异筛选出切割效果最好的crRNA,构建PCR⁃Cas12a核酸检测系统。随后将野生型人基因组DNA和DNMT3A R882H/C突变质粒按不同比例混合,模拟不同突变率,评价PCR-Cas12a的最低检测限。最后,使用PCR-Cas12a检测已通过高通量测序技术验证DNMT3A R882H/C突变率的临床样本,评估方法学的一致性和抗干扰能力。结果本研究建立的PCR⁃Cas12a核酸可视化检测系统,能够有效检出突变率为1%的DNMT3A R882H/C临床样本。结论本研究结合PCR与CRISPR-Cas12a技术,建立了一种检测DNMT3A R882H/C突变位点的可视化方法,具有快速以及特异度、敏感度高的特点,为急性髓系白血病的预后评估提供有力支持。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas12a DNMT3A r882H DNMT3A r882C 急性髓系白血病 可视化检测
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转位蛋白基因在FLT3-ITD/DNMT3A R882双突变急性髓系白血病疗效评估中的价值 被引量:1
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作者 唐善浩 陆滢 +11 位作者 张丕胜 陈冬 刘旭辉 杜小红 曹俊杰 李双月 沙科娅 陈列光 庄贤栩 叶佩佩 林丽 裴仁治 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期45-49,共5页
目的:观察转位蛋白(TSPO)基因在FLT3-ITD/DNMT3A R882双突变急性髓系白血病(AML)疗效评估中的价值。方法:纳入2018年6月至2020年6月在宁波大学附属人民医院血液科住院治疗的初发AML患者76例,其中伴有FLT3-ITD突变34例,伴有DNMT3A R882突... 目的:观察转位蛋白(TSPO)基因在FLT3-ITD/DNMT3A R882双突变急性髓系白血病(AML)疗效评估中的价值。方法:纳入2018年6月至2020年6月在宁波大学附属人民医院血液科住院治疗的初发AML患者76例,其中伴有FLT3-ITD突变34例,伴有DNMT3A R882突变27例,伴有FLT3-ITD/DNMT3A R882双突变15例,对照组为同期住院治疗的免疫性血小板减少症(ITP)患者19例。骨髓穿刺留取骨髓3 ml,常规提取RNA,通过转录组测序方法检测TSPO基因的表达量(使用2^(-ΔΔCT)法计算)。结果:FLT3-ITD单突变组和DNMT3A R882单突变组初诊时TSPO基因表达量分别为2.02±1.04、1.85±0.76,均高于对照组的1.00±0.06,但比较差异无统计学意义(P=0.671,P=0.821);双突变组初诊时TSPO基因表达量为3.98±1.07,明显高于FLT3-ITD单突变组和DNMT3A R882单突变组(P=0.032,P=0.021);双突变组化疗后达到完全缓解的患者,达到完全缓解时的TSPO基因表达量为1.19±0.87,明显低于其初诊时的水平(P=0.011)。结论:TSPO基因或许可以作为评估FLT3-ITD/DNMT3A R882双突变AML治疗疗效的一个指标。 展开更多
关键词 转位蛋白基因 急性髓系白血病 FLT3-ITD DNMT3A r882
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DNMT3A R882位点突变急性髓系白血病临床分析 被引量:4
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作者 高展 刘延方 +13 位作者 王冲 周阳 朱颖超 徐衍 董丽 侯杰 仝佳音 刘若阳 侯降雪 李涛 张秋堂 孙慧 孙玲 万鼎铭 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2017年第3期300-303,共4页
目的:分析DNMT3A R882位点突变急性髓系白血病(AML)患者的临床特征。方法:选取接受DNMT3A R882位点突变检测的168例初治AML患者,采用PCR联合基因测序法检测DNMT3A R882位点突变以及CEBPA、NPM1和FLT3-ITD突变,采用4色多参数流式细胞仪分... 目的:分析DNMT3A R882位点突变急性髓系白血病(AML)患者的临床特征。方法:选取接受DNMT3A R882位点突变检测的168例初治AML患者,采用PCR联合基因测序法检测DNMT3A R882位点突变以及CEBPA、NPM1和FLT3-ITD突变,采用4色多参数流式细胞仪分析18种抗原在白血病细胞上的表达,K-M法绘制生存曲线用于预后分析。结果:共检出24例(14.29%)DNMT3A R882位点突变的AML患者。DNMT3A R882位点突变与未突变者比较,患者表现为高龄,发病时白细胞、血小板计数高,CD33和CD11b阳性率较高,CD34阳性率较低,易合并NPM1及FLT3-ITD基因突变;第一疗程诱导化疗后完全缓解率与未突变组比较差异无统计学意义,但中位无事件生存时间缩短(62 d vs 277 d)。结论:DNMT3A R882位点突变的AML具有较显著的临床特征,预后差。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 DNMT3A r882位点突变 临床特征
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FLT3-ITD和DNMT3A R882基因联合突变在急性髓系白血病中的研究进展 被引量:1
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作者 杨槟荧 《中国当代医药》 2018年第15期26-29,共4页
FLT3基因内部串联重复序列(FLT3-ITD)突变是急性髓系白血病(AML)中常见的突变类型,与AML的发生发展及不良预后密切相关。DNA甲基化转移酶3A(DNMT3A)突变在AML中发生频率较高,其中60%的突变发生在R882位点。DNMT3A R882突变在AML的发生... FLT3基因内部串联重复序列(FLT3-ITD)突变是急性髓系白血病(AML)中常见的突变类型,与AML的发生发展及不良预后密切相关。DNA甲基化转移酶3A(DNMT3A)突变在AML中发生频率较高,其中60%的突变发生在R882位点。DNMT3A R882突变在AML的发生发展过程中起重要作用,并提示预后不良。近几年研究发现FLT3-ITD合并DNMT3A R882基因突变的AML患者预后极差。本文结合目前研究成果,就FLT3-ITD和DNMT3A R882联合突变在AML中的发病机制、协同作用、临床特征、治疗以及预后进行综述。 展开更多
关键词 FLT3基因内部串联重复序列 DNMT3A r882 急性髓系白血病 预后 造血干细胞移植
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FLT3-ITD与DNMT3A R882双突变对急性髓系白血病异基因造血干细胞移植预后的影响 被引量:6
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作者 唐善浩 陆滢 +10 位作者 张丕胜 刘旭辉 杜小红 陈冬 沙科娅 李双月 曹俊杰 陈列光 庄贤栩 裴仁治 唐晓文 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期552-557,共6页
目的探讨FLT3-ITD和DNMT3AR882双突变对急性髓系白血病(AML)患者allo-HSCT预后的影响。方法使用直接测序法检测206例接受allo-HSCT的AML患者(M3和使用分子靶向药物索拉菲尼的病例除外)初诊时骨髓中常见的基因突变组套(包括FLT3.IT... 目的探讨FLT3-ITD和DNMT3AR882双突变对急性髓系白血病(AML)患者allo-HSCT预后的影响。方法使用直接测序法检测206例接受allo-HSCT的AML患者(M3和使用分子靶向药物索拉菲尼的病例除外)初诊时骨髓中常见的基因突变组套(包括FLT3.ITD、DNMT3A、c-kit、CEBPA、FLT3-TKD、NPMI),回顾性分析患者的临床资料,比较各基凶突变组的移植预后。结果①206例AML患者中男104例,女102例,中位年龄38(3-63)岁。FAB分型:M0 6例,M1 24例,M2 56例,M4 39例,M5 63例,M6 6例,不能分类12例。②全部206例患者根据初诊时的突变基因情况分为4组:FLT3-ITD^+ DNMT3A R882^+组(A组)19例,FLT3-ITD^+ DNMT3A R882^-组(B组)38例,FLT3-ITD^- DNMT3A R882^+组(C组)21例,FLT3-ITD^-DNMT3A R882^-组(D组)128例。四组间性别、年龄、初诊时白细胞计数、FAB分型、移植前疾病状态、染色体核型、供者类型、预处理方案及GVHD发生率比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。③A组和B、C、D组比较,2年累积复发率较高[分别为(72.2±2.6)%、(38.6±0.6)%、(36.8±1.6)%、(27.8±0.1)%,P值均〈0.05],总生存率较低[分别为(30.9±13.3)%、(67.5±7.8)%、(61.4±12.4)%、(80.1±3.7)%,P值均〈0.05],无白血病生存率较低[分别为(11.3±10.2)%、(47.9±8.4)%、(56.8±12.5)%、(79.7±3.6)%,P值均〈0.05]。结论伴有FLT3-ITD与DNMT3A R882双突变的AML患者移植后累积复发率较高,总生存率和无白血病生存率较差。 展开更多
关键词 造血干细胞移植 白血病 髓样 急性 FLT3-ITD突变 DNMT3A r882突变
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雷帕霉素抑制DNMT3A突变相关急性髓系白血病的发展 被引量:4
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作者 杨莹 石晓东 +1 位作者 戴钰俊 王月英 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1039-1044,1039,共6页
目的·应用小鼠模型,探索雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,m TOR)抑制剂雷帕霉素治疗DNA甲基转移酶3A(DNA methyltransferase 3A,DNMT3A)R882突变相关急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)的效果。方法·... 目的·应用小鼠模型,探索雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,m TOR)抑制剂雷帕霉素治疗DNA甲基转移酶3A(DNA methyltransferase 3A,DNMT3A)R882突变相关急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)的效果。方法·将携带DNMT3A R882突变的人AML细胞株OCI-AML3在体外培养,分别给予雷帕霉素或者二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)处理后,由尾静脉注射给半数致死量辐照后的NOD/SCID免疫缺陷小鼠,观察2组小鼠的疾病进展情况。监测小鼠的血常规,通过流式细胞术检测人CD45+细胞即OCI-AML3细胞比例变化,记录小鼠生存时间,取小鼠骨髓、脾脏、肝脏进行病理和流式等分析。结果·雷帕霉素组小鼠外周血白细胞与DMSO组相比升高趋势明显减缓,外周血CD45+细胞比例为(4.44±2.58)%(移植后1周)和(34.42±13.64)%(移植后2周),均低于同时期DMSO组的(16.71±8.96)%和(51.55±5.36)%;雷帕霉素组小鼠中位生存期27 d,相较DMSO组中位生存期23 d明显延长。雷帕霉素组骨髓、脾脏和肝脏中CD45+细胞浸润比例均小于5%,明显低于DMSO组脾脏([51.32±27.81)%]和肝脏[(50.03±28.74)%]中的比例;雷帕霉素组小鼠脾脏大小明显小于DMSO组,脾脏浸润和结构破坏明显减轻。结论·在携带DNMT3A R882突变的AML免疫缺陷小鼠模型中,雷帕霉素可有效抑制DNMT3A R882突变的AML的进展。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 DNA甲基转移酶3Ar882突变 雷帕霉素 MTOR抑制剂
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Aging-elevated inflammation promotes DNMT3A R878H-driven clonal hematopoiesis 被引量:1
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作者 Min Liao Ruiqing Chen +7 位作者 Yang Yang Hanqing He Liqian Xu Yuxuan Jiang Zhenxing Guo Wei He Hong Jiang Jianwei Wang 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期678-691,共14页
Aging-elevated DNMT3A R882H-driven clonal hematopoiesis(CH)is a risk factor for myeloid malignancies remission and overall survival.Although some studies were conducted to investigate this phenomenon,the exact mechani... Aging-elevated DNMT3A R882H-driven clonal hematopoiesis(CH)is a risk factor for myeloid malignancies remission and overall survival.Although some studies were conducted to investigate this phenomenon,the exact mechanism is still under debate.In this study,we observed that DNMT3 A R878 H bone marrow cells(human allele:DNMT3 A R882 H)displayed enhanced reconstitution capacity in aged bone marrow milieu and upon inflammatory insult.DNMT3 A R878 H protects hematopoietic stem and progenitor cells from the damage induced by chronic inflammation,especially TNFa insults.Mechanistically,we identified that RIPK1-RIPK3-MLKL-mediated necroptosis signaling was compromised in R878 H cells in response to proliferation stress and TNFa insults.Briefly,we elucidated the molecular mechanism driving DNMT3 A R878 H-based clonal hematopoiesis,which raises clinical value for treating DNMT3 A R882 H-driven clonal hematopoiesis and myeloid malignancies with aging. 展开更多
关键词 Aging INFLAMMATION DNMT3A r882H Clonal hematopoiesis Hematopoietic stem cells NECROPTOSIS TNFΑ
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