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LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的RNA-Seq分析
被引量:
4
1
作者
朱兰玉
覃霞
+2 位作者
方玲
舒伟
林有坤
《广西医科大学学报》
CAS
2019年第5期803-808,共6页
目的:分析LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的转录组测序(RNA-seq)结果。方法:将3例LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿作为病例组,1例正常儿童为对照组,应用RNA-seq技术对两组外周血单个核细胞进行全转录组测...
目的:分析LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的转录组测序(RNA-seq)结果。方法:将3例LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿作为病例组,1例正常儿童为对照组,应用RNA-seq技术对两组外周血单个核细胞进行全转录组测序,分析差异表达基因,并对这些差异基因进行GO功能和Pathway显著性富集分析。结果:病例组与对照组差异表达基因共有135个,其中下调91个,上调44个。差异基因功能涉及DNA复制、能量代谢、信号转导、炎症等方面,其中MCM、GINS2、CDC45与DNA复制有关;IL-8、FOS、CXCR2等与炎症有关;TOP2A、ABCG1、KIF4A、KIF2C、KIF20A、KIF14、KIF11、KIF18B、KIFC1、KIF15等与细胞能量代谢有关;BUB1、AURKB、BUB1B、PKMYT1、MELK与蛋白激酶活性有关。GO功能显著性富集分析结果显示:差异基因的功能主要包括生物学行为调控、细胞组分形成及分子功能,集中表现在生物学过程部分行为的调控。Pathway显著性富集分析10条具有显著性差异的通路,其中细胞周期及细胞衰老通路明显富集。结论:调控细胞周期的相关基因的表达量改变可能参与LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿疾病的发生和发展。
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关键词
儿童早老症
RNA-SEQ
r527c
LMNA
暂未订购
LMNAR527C基因突变纯合型小鼠表型及其组织、细胞衰老相关蛋白表达观察
被引量:
1
2
作者
李东明
刘恒
+5 位作者
朱兰玉
方玲
吴华裕
潘尚领
林有坤
舒伟
《山东医药》
CAS
2019年第33期5-9,共5页
目的观察LMNAR527C基因突变纯合型小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期等表型,其组织、细胞衰老相关蛋白的表达情况,以探讨LMNAR527C基因突变对衰老的影响。方法LMNA基因杂合型小鼠6只,通过杂交方式得到LMNAR527C基因突变纯合型小鼠,比...
目的观察LMNAR527C基因突变纯合型小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期等表型,其组织、细胞衰老相关蛋白的表达情况,以探讨LMNAR527C基因突变对衰老的影响。方法LMNA基因杂合型小鼠6只,通过杂交方式得到LMNAR527C基因突变纯合型小鼠,比较野生型(基因型LMNAWT/WT)、杂合型(基因型LMNAWT/R527C)、纯合型(基因型LMNAR527C/R527C)小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期,采用Western blotting法检测不同基因型小鼠尾组织γH2Ax蛋白、免疫组化法检测皮肤组织γH2Ax蛋白。采用TRIzol提取正常和LMNA基因突变小鼠尾组织总RNA,PCR扩增小鼠LMNA和LMNAR527C突变基因,并与pEGFP-N1质粒重组获得pEGFP-N1-LMNA和pEGFP-N1-LMNA R527C重组质粒,然后转染293T LMNA敲除细胞(转染pEGFP-N1空质粒为空白组,转染pEGFP-N1-LMNA质粒为对照组,转染pEGFP-N1-LMNA R527C质粒为实验组),Western blotting法检测各组γH2Ax蛋白。将293T细胞设为正常组,免疫荧光法观察实验组LaminA蛋白的分布和定位。体外培养野生型和纯合型小鼠肺原代成纤维细胞,进行衰老相关β-半乳糖苷酶活性染色实验。结果三种不同基因型小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期比较,P均>0.05。设野生型小鼠γH2Ax蛋白相对表达量为1,纯合突变、杂合突变、野生型小鼠γH2Ax蛋白相对表达量分别为2.40±0.0432、1.72±0.0353,纯合突变、杂合突变型小鼠高于野生型小鼠(P均<0.05)。纯合突变型小鼠、野生型小鼠γH2Ax阳性细胞百分比分别为38%±2.25%、17%±1.68%,二者比较,P<0.05。与空白组比较,对照组和实验组γH2Ax蛋白水平升高(P均<0.05)。实验组细胞Lamin A蛋白容易在核膜处形成点状聚集,部分蛋白从核纤层转移至核内。纯合型、野生型小鼠肺原代成纤维细胞中β-半乳糖苷酶活性染色阳性细胞率分别为11.0%±1.96%、2.5%±0.78%,二者比较,P<0.05。结论LMNAR527C基因纯合突变小鼠未发现明显衰老表型。LMNAR527C基因纯合突变小鼠组织及细胞中衰老标志物γH2Ax表达升高;Lamin A蛋白在转染LMNAR527C突变基因后的293T LMNA敲除细胞的核膜处形成点状聚集,部分蛋白从核纤层转移至核内;LMNAR527C基因纯合突变小鼠肺成纤维细胞中β-半乳糖苷酶活性增强。
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关键词
LMNA基因
LMNA
r527c
突变基因
细胞衰老蛋白
γH2Ax
Β-半乳糖苷酶
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职称材料
题名
LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的RNA-Seq分析
被引量:
4
1
作者
朱兰玉
覃霞
方玲
舒伟
林有坤
机构
广西医科大学第一附属医院皮肤性病科
广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2019年第5期803-808,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.31660311
No.81760561)
广西自然科学基金资助项目(No.2014GXNSFAA118138)
文摘
目的:分析LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的转录组测序(RNA-seq)结果。方法:将3例LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿作为病例组,1例正常儿童为对照组,应用RNA-seq技术对两组外周血单个核细胞进行全转录组测序,分析差异表达基因,并对这些差异基因进行GO功能和Pathway显著性富集分析。结果:病例组与对照组差异表达基因共有135个,其中下调91个,上调44个。差异基因功能涉及DNA复制、能量代谢、信号转导、炎症等方面,其中MCM、GINS2、CDC45与DNA复制有关;IL-8、FOS、CXCR2等与炎症有关;TOP2A、ABCG1、KIF4A、KIF2C、KIF20A、KIF14、KIF11、KIF18B、KIFC1、KIF15等与细胞能量代谢有关;BUB1、AURKB、BUB1B、PKMYT1、MELK与蛋白激酶活性有关。GO功能显著性富集分析结果显示:差异基因的功能主要包括生物学行为调控、细胞组分形成及分子功能,集中表现在生物学过程部分行为的调控。Pathway显著性富集分析10条具有显著性差异的通路,其中细胞周期及细胞衰老通路明显富集。结论:调控细胞周期的相关基因的表达量改变可能参与LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿疾病的发生和发展。
关键词
儿童早老症
RNA-SEQ
r527c
LMNA
Keywords
premature aging
RNA-Seq
r527c
LMNA
分类号
R729 [医药卫生—儿科]
暂未订购
题名
LMNAR527C基因突变纯合型小鼠表型及其组织、细胞衰老相关蛋白表达观察
被引量:
1
2
作者
李东明
刘恒
朱兰玉
方玲
吴华裕
潘尚领
林有坤
舒伟
机构
广西医科大学基础医学院
广西医科大学第一附属医院
出处
《山东医药》
CAS
2019年第33期5-9,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(31660311)
广西研究生教育创新计划项目(YCSW2019103)
文摘
目的观察LMNAR527C基因突变纯合型小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期等表型,其组织、细胞衰老相关蛋白的表达情况,以探讨LMNAR527C基因突变对衰老的影响。方法LMNA基因杂合型小鼠6只,通过杂交方式得到LMNAR527C基因突变纯合型小鼠,比较野生型(基因型LMNAWT/WT)、杂合型(基因型LMNAWT/R527C)、纯合型(基因型LMNAR527C/R527C)小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期,采用Western blotting法检测不同基因型小鼠尾组织γH2Ax蛋白、免疫组化法检测皮肤组织γH2Ax蛋白。采用TRIzol提取正常和LMNA基因突变小鼠尾组织总RNA,PCR扩增小鼠LMNA和LMNAR527C突变基因,并与pEGFP-N1质粒重组获得pEGFP-N1-LMNA和pEGFP-N1-LMNA R527C重组质粒,然后转染293T LMNA敲除细胞(转染pEGFP-N1空质粒为空白组,转染pEGFP-N1-LMNA质粒为对照组,转染pEGFP-N1-LMNA R527C质粒为实验组),Western blotting法检测各组γH2Ax蛋白。将293T细胞设为正常组,免疫荧光法观察实验组LaminA蛋白的分布和定位。体外培养野生型和纯合型小鼠肺原代成纤维细胞,进行衰老相关β-半乳糖苷酶活性染色实验。结果三种不同基因型小鼠体型、体质量、繁殖能力和生存期比较,P均>0.05。设野生型小鼠γH2Ax蛋白相对表达量为1,纯合突变、杂合突变、野生型小鼠γH2Ax蛋白相对表达量分别为2.40±0.0432、1.72±0.0353,纯合突变、杂合突变型小鼠高于野生型小鼠(P均<0.05)。纯合突变型小鼠、野生型小鼠γH2Ax阳性细胞百分比分别为38%±2.25%、17%±1.68%,二者比较,P<0.05。与空白组比较,对照组和实验组γH2Ax蛋白水平升高(P均<0.05)。实验组细胞Lamin A蛋白容易在核膜处形成点状聚集,部分蛋白从核纤层转移至核内。纯合型、野生型小鼠肺原代成纤维细胞中β-半乳糖苷酶活性染色阳性细胞率分别为11.0%±1.96%、2.5%±0.78%,二者比较,P<0.05。结论LMNAR527C基因纯合突变小鼠未发现明显衰老表型。LMNAR527C基因纯合突变小鼠组织及细胞中衰老标志物γH2Ax表达升高;Lamin A蛋白在转染LMNAR527C突变基因后的293T LMNA敲除细胞的核膜处形成点状聚集,部分蛋白从核纤层转移至核内;LMNAR527C基因纯合突变小鼠肺成纤维细胞中β-半乳糖苷酶活性增强。
关键词
LMNA基因
LMNA
r527c
突变基因
细胞衰老蛋白
γH2Ax
Β-半乳糖苷酶
Keywords
LMNA gene
LMNA
r527c
mutation gene
cellular senescence protein
γH2Ax
β-galactosylase
分类号
Q419 [生物学—生理学]
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作者
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1
LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的RNA-Seq分析
朱兰玉
覃霞
方玲
舒伟
林有坤
《广西医科大学学报》
CAS
2019
4
暂未订购
2
LMNAR527C基因突变纯合型小鼠表型及其组织、细胞衰老相关蛋白表达观察
李东明
刘恒
朱兰玉
方玲
吴华裕
潘尚领
林有坤
舒伟
《山东医药》
CAS
2019
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