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磁共振R2*mapping示踪功能型纳米药物载体在NSCLC裸鼠模型的显像研究 被引量:1
1
作者 高鹏 刘于宝 +2 位作者 刘灶松 史长征 罗良平 《中国CT和MRI杂志》 2021年第1期4-7,共4页
目的通过磁共振R2*mapping技术示踪及动态监测NSCLC裸鼠模型给药后不同时间点R2*值的变化趋势,阐明R2*mapping在评价F/A-PLGA@DOX/SPIO纳米载药体系在肿瘤成像中的应用价值及影像学基础。方法成功构建NSCLC裸鼠移植瘤模型24只,随机分为G... 目的通过磁共振R2*mapping技术示踪及动态监测NSCLC裸鼠模型给药后不同时间点R2*值的变化趋势,阐明R2*mapping在评价F/A-PLGA@DOX/SPIO纳米载药体系在肿瘤成像中的应用价值及影像学基础。方法成功构建NSCLC裸鼠移植瘤模型24只,随机分为G1、G2两组,每组12只。分别尾静脉注射单纯SPIO以及F/A-PLGA@DOX/SPIO纳米载药体系,并采用1.5 T MR和动物专用小鼠线圈对建模成功荷瘤裸鼠皮下移植瘤模型进行R2*扫描获得肿瘤区域R2*值。实验结束后全部肿瘤组织及肝脏、脾脏普鲁士蓝染色。结果G2组每个时间点的R2*值均高于G1组(P<0.05)。相对于G1组,G2组肿瘤R2*值在早期上升趋势明显,且在给药后60h时明显高于G1组(P<0.05)。G1组排泄期较G2组明显提前。普鲁士蓝染色结果显示,G2组肿瘤的蓝色铁沉积高于SPIO组,而肝脏、脾脏组织的蓝色铁沉积低于G1。结论R2*值与肿瘤组织内的SPIO含量存在较高敏感性,R2*mapping技术提供了一种SPIO的肿瘤示踪成像方法。 展开更多
关键词 r2*mapping 动态示踪 超顺磁性氧化铁 磁共振成像
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R2*值在阿尔茨海默病中的初步研究 被引量:1
2
作者 郑兴友 邓利猛 +1 位作者 廖伟华 周高峰 《临床心身疾病杂志》 CAS 2016年第S1期115-116,共2页
目的:对比研究阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)患者与健康中老年人对照组(Normal Control,NC)脑内多部位R2★值的差异,探讨R2★值与简易精神状态量表(mini-mental state examination,MMSE)评分的相关性.方法:使用3.0T磁共振... 目的:对比研究阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)患者与健康中老年人对照组(Normal Control,NC)脑内多部位R2★值的差异,探讨R2★值与简易精神状态量表(mini-mental state examination,MMSE)评分的相关性.方法:使用3.0T磁共振多回波采集重度T2★WI三维梯度回波序列(Enhanced 3D multi-echo GRE T2★-weighted angiography,ESWAN)对30例AD与30例NC进行扫描,利用ESWAN软件包进行图像后处理,在R2★图上测得双侧齿状核、海马、红核、黑质、苍白球、壳核、丘脑、尾状核头及延髓、脑桥、胼胝体膝部、胼胝体压部的数值.应用统计学软件对各脑区R2★值进行组间分析,分析R2★值与MMSE评分的相关性.结果:1、AD组与NC组双侧苍白球、壳核、尾状核头及左侧海马、左侧丘脑R2★值的差异性具有统计学意义(P<0.05).2、AD组左侧海马的R2★值与MMSE评分具有统计学意义的中度负相关性(r=0.510,P<0.05).结论:1、AD患者脑内多部位的R2★值出现改变.2、左侧海马的R2★值与MMSE评分存在相关性,可以用来评估AD患者病程变化. 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 铁沉积 MMSE r2★值
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磁共振DWI及R2*成像对小肝癌与硬化结节的鉴别诊断价值 被引量:18
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作者 丁芳 顾红梅 葛涌钱 《临床放射学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第11期1844-1847,共4页
目的探讨小肝癌与肝硬化结节之间表观扩散系数(ADC)值与R2*值的差异,评估其鉴别诊断效能。方法对经临床、病理确诊的49例小肝癌(55枚病灶,最大直径≤2.0cm)及20例硬化结节(20枚病灶)行扩散加权成像(DWI)及R2*成像,比较两组病灶ADC值与R2... 目的探讨小肝癌与肝硬化结节之间表观扩散系数(ADC)值与R2*值的差异,评估其鉴别诊断效能。方法对经临床、病理确诊的49例小肝癌(55枚病灶,最大直径≤2.0cm)及20例硬化结节(20枚病灶)行扩散加权成像(DWI)及R2*成像,比较两组病灶ADC值与R2*值的差异,并绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析二者对小肝癌与硬化结节的鉴别诊断效能。结果小肝癌组及硬化结节组平均ADC值分别为(1.2368±0.2671)×10^-3mm2/s和(1.6495±0.2909)×10^-3mm2/s,小肝癌组及硬化结节组平均R2*值分别为(49.6316±15.3536)Hz和(69.9684±11.1181)Hz,小肝癌组及硬化结节组间的ADC值与R2*值差异均有统计学意义(P值均为0.000);ADC值的ROC曲线下面积为0.876,当截断点取1.365×10^-3mm2/s时,诊断肝癌的敏感度和特异度分别为80%和90%;R2*值的ROC曲线下面积为0.906,当截断点取53.946Hz时,诊断肝癌的敏感度和特异度分别为94.3%和75%。结论ADC值与R2*值有助于鉴别小肝癌与硬化结节,硬化结节中R2*值降低预示结节可能发生癌变。 展开更多
关键词 表观扩散系数 横向弛豫率 小肝癌 硬化结节
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ADC与R2*值对小肝癌病理分级的预测价值及其相关性分析 被引量:9
4
作者 丁芳 顾红梅 葛涌钱 《临床放射学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第9期1480-1483,共4页
目的探讨小肝癌(SHCC)表观扩散系数(ADC)值、横向弛豫率(R2^*)值与病理等级间的相关性以及SHCC ADC值与R2^*值之间的相关性。方法搜集33例拟诊SHCC(36枚病灶,最大直径≤2.0 cm)后经病理确诊的患者,行肝脏扩散加权成像(DWI)... 目的探讨小肝癌(SHCC)表观扩散系数(ADC)值、横向弛豫率(R2^*)值与病理等级间的相关性以及SHCC ADC值与R2^*值之间的相关性。方法搜集33例拟诊SHCC(36枚病灶,最大直径≤2.0 cm)后经病理确诊的患者,行肝脏扩散加权成像(DWI)及R2^*成像,分别测量病灶内的ADC值及R2^*值,比较不同病理等级间SHCC的ADC值和R2^*值的差异,分别探讨ADC值、R2^*值与SHCC病理等级间的相关性以及SHCC的ADC值和R2^*值之间的相关性。结果不同级别SHCC组间及组内ADC值差异均有统计学意义(P〈0.05),ADC值与病理分化等级间呈高度正相关(r=0.887,P=0.000)。不同级别SHCC组间R2^*值差异有统计学意义(P=0.005),组内两两比较除中分化与中低分化、中低分化与低分化间差异无统计学意义(P值分别为0.232、0.641)外,其余各组间差异均有统计学意义(P〈0.05),R2^*值与病理分化等级间呈中度负相关(r=-0.677,P=0.000)。SHCC ADC值与R2^*值间呈中度负相关(r=-0.663,P=0.000)。结论 ADC值及R2^*值有助于预测SHCC的病理分化程度,对手术及治疗方案的选择具有一定的指导作用。 展开更多
关键词 小肝癌 表观扩散系数 横向弛豫率 相关性
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IP3R2/GRP75/VDAC1轴调节线粒体钙转运促进低氧诱导的肺动脉平滑肌细胞凋亡的作用机制
5
作者 郭雪 王瑞 +4 位作者 刘凤倩 程洋 刘文焘 王连志 武云 《中国比较医学杂志》 北大核心 2026年第4期52-62,共11页
目的在低氧诱导的体外肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)模型上,观察1,4,5-三磷酸肌醇2型受体(IP3R2)/葡萄糖调节蛋白75(GRP75)/电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)轴调节线粒体钙(Ca^(2+))转运在细胞凋亡中的作用。方法将体外培养的大鼠PASMCs随机... 目的在低氧诱导的体外肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)模型上,观察1,4,5-三磷酸肌醇2型受体(IP3R2)/葡萄糖调节蛋白75(GRP75)/电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)轴调节线粒体钙(Ca^(2+))转运在细胞凋亡中的作用。方法将体外培养的大鼠PASMCs随机分为正常对照(NC)组、低氧组、四苯基丁酸(4-PBA)组。采用Ca^(2+)免疫荧光探针测定PASMCs中内质网(ER)、细胞质及线粒体的Ca^(2+)浓度;透射电镜观察线粒体结构和形态变化;流式细胞术检测细胞凋亡;实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)和免疫蛋白印迹法(Western blot)测定Ca^(2+)通路关键因子及线粒体分裂、融合蛋白的信使RNA(mRNA)、蛋白表达水平。结果与NC组相比,低氧组PASMCs中ER和细胞质Ca^(2+)浓度增高,而线粒体Ca^(2+)浓度降低(P<0.01),线粒体体积缩小,呈现肿胀状态,线粒体嵴结构紊乱,破裂增多,PASMCs凋亡减少(P<0.01),Ca^(2+)转运通路关键因子IP3R2、GRP75、VDAC1和线粒体分裂蛋白1(DRP1)mRNA及蛋白表达水平上调(P<0.01),而线粒体融合蛋白2(MFN2)mRNA及蛋白表达水平下调(P<0.01)。与低氧组相比,4-PBA组PASMCs中ER和细胞质Ca^(2+)浓度降低,而线粒体Ca^(2+)浓度升高(P<0.01),线粒体结构恢复,IP3R2、GRP75、VDAC1及DRP1 mRNA、蛋白表达下降(P<0.01),MFN2 mRNA、蛋白表达升高(P<0.05或P<0.01),PASMCs凋亡增加(P<0.01)。结论IP3R2/GRP75/VDAC1轴调节低氧诱导的PASMCs线粒体Ca^(2+)转运,促进PASMCs细胞凋亡,为低氧性肺动脉高压的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 低氧性肺动脉高压 肺动脉平滑肌细胞 IP3r2/GRP75/VDAC1 钙转运 线粒体
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转录因子MpR2R3-MYB17调控地钱胞芽发育的功能研究
6
作者 曾厅 张兰 罗睿 《生物技术通报》 北大核心 2026年第1期208-217,共10页
【目的】探究MpR2R3-MYB17基因在地钱胞芽发育调控中的功能及分子机制,为进一步揭示地钱胞芽发育调控机制提供新的依据。【方法】基于地钱基因组信息克隆MpR2R3-MYB17的全长CDS序列,对其编码蛋白质进行生物信息学分析并瞬时转化烟草检测... 【目的】探究MpR2R3-MYB17基因在地钱胞芽发育调控中的功能及分子机制,为进一步揭示地钱胞芽发育调控机制提供新的依据。【方法】基于地钱基因组信息克隆MpR2R3-MYB17的全长CDS序列,对其编码蛋白质进行生物信息学分析并瞬时转化烟草检测MpR2R3-MYB17亚细胞定位。构建过表达载体和CRISPR/Cas9基因编辑载体,利用农杆菌介导的非组培依赖的地钱转化方法获得MpR2R3-MYB17过表达株系和突变体株系以评估表型变化。【结果】生物信息学分析表明,MpR2R3-MYB17的开放阅读框的长度为1277 bp,编码421个氨基酸,具有2个保守的SANT序列,是R2R3型MYB转录因子。系统发育树揭示MpR2R3-MYB17与拟南芥R2R3-MYB第9亚家族聚为一支,其中与AtMYB17同源性最高。亚细胞定位分析表明,MpR2R3-MYB17蛋白定位于细胞核内,提示其可能直接参与转录调控过程。表型分析表明,与野生型相比,过表达株系的叶状体上胞芽杯密度和胞芽数量显著增加,或在高表达状态下形成未分化细胞团,且叶状体的生长受到抑制。突变体株系的胞芽杯密度及单个胞芽杯内胞芽数量均较野生型显著降低。【结论】MpR2R3-MYB17作为细胞核定位的转录因子参与调控地钱胞芽杯和胞芽的发育过程。 展开更多
关键词 地钱 Mpr2R3-MYB17 转录因子 胞芽发育 亚细胞定位 过表达 CRISPR/Cas9 无性繁殖
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GiMYB76,a MeJA-inducible R2R3-type transcription factor,regulates licochalcone A biosynthesis in licorice(Glycyrrhiza inflata) 被引量:1
7
作者 Yuping Li Zhigeng Wu +6 位作者 Jixiang Zhu Jiangyi Zeng Yongliang Liu Jihua Wang Ling Yuan Ying Wang Yongqing Li 《The Crop Journal》 2026年第1期235-246,共12页
Licochalcone A(LCA)is a characteristic compound in licorice Glycyrrhiza inflata and is widely utilized in pharmaceutical and cosmetic industries.However,the biosynthetic pathway and regulatory mechanisms of LCA remain... Licochalcone A(LCA)is a characteristic compound in licorice Glycyrrhiza inflata and is widely utilized in pharmaceutical and cosmetic industries.However,the biosynthetic pathway and regulatory mechanisms of LCA remain poorly understood.In this study,we first found the accumulation of LCA is induced by methyl jasmonate(MeJA).Given that MYB transcriptional factors are well-documented as key regulators of flavonoid biosynthesis,we identified a total of 147 GiR2R3-MYB genes in G.inflata,which were classified into 28 subgroups.The chromosome distributions,sequence characteristics,gene structures,duplication events and cis-acting elements were also investigated.Through integrated analysis of GiR2R3-MYBs expression patterns across different tissues and under MeJA treatment,along with phylogenetic relationship,we identified GiMYB76—a MeJA-inducible MYB transcription factor—as a potential regulator of LCA accumulation.Functional validation showed that transgenic hairy roots overexpressing GiMYB76 exhibited a significant increase in LCA content.DAP-seq analysis of GiMYB76 revealed potential target genes involved in flavonoid biosynthesis regulation.Subsequent promoter activity assay verified that GiMYB76 can bind to the promoter and activate the expression of GiCHS4.Consistently,overexpression of GiCHS4 in G.inflata hairy roots also significantly enhanced LCA production.This study not only clarifies that GiMYB76 transcriptionally activated GiCHS4 to promote LCA biosynthesis but also provides valuable insights for basic research on licorice and the development of related industries. 展开更多
关键词 r2R3-MYB Licochalcone A DAP-Seq Methyl JA Glycyrrhiza inflata
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基于IP3R2/GRP75/VDAC1复合体介导线粒体凋亡途径探讨化浊解毒消痈方对溃疡性结肠炎小鼠的保护作用
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作者 高梦琪 梁诗悦 +4 位作者 白米楠 刘岩生 信淑亚 王振晖 娄莹莹 《中成药》 北大核心 2026年第1期244-249,共6页
目的探讨化浊解毒消痈方对溃疡性结肠炎(UC)小鼠的保护作用。方法60只小鼠随机分正常组,模型组,化浊解毒消痈方低、中、高剂量组(7.17、14.34、28.68 g/kg),美沙拉嗪组(0.45 g/kg)。采用葡聚糖硫酸钠(DSS)制备UC小鼠模型,造模成功后分... 目的探讨化浊解毒消痈方对溃疡性结肠炎(UC)小鼠的保护作用。方法60只小鼠随机分正常组,模型组,化浊解毒消痈方低、中、高剂量组(7.17、14.34、28.68 g/kg),美沙拉嗪组(0.45 g/kg)。采用葡聚糖硫酸钠(DSS)制备UC小鼠模型,造模成功后分别灌胃给予相应药物,连续7 d。记录各组小鼠一般情况,计算DAI评分,HE染色观察结肠组织病理学变化,透射电镜观察结肠组织线粒体超微结构,ELISA法检测血清IL-1β、IL-18水平,RT-qPCR法和Western blot法检测结肠组织IP3R2、GRP75、VDAC1、Bcl-2、Bax、Caspase-9 mRNA及蛋白表达。结果化浊解毒消痈方可缓解DSS诱导的UC小鼠症状,有效改善结肠组织病理形态。与模型组比较,各给药组小鼠DAI评分降低(P<0.05),血清IL-1β、IL-18水平,结肠组织IP3R2、GRP75、VDAC1、Bax、Caspase-9 mRNA、蛋白表达降低(P<0.05),Bcl-2 mRNA、蛋白表达升高(P<0.05)。结论化浊解毒消痈方可能通过调节IP3R2/GRP75/VDAC1复合体所介导的线粒体凋亡途径,从而缓解UC炎症反应,促进结肠黏膜修复。 展开更多
关键词 化浊解毒消痈方 溃疡性结肠炎 IP3r2/GRP75/VDAC1复合体 线粒体凋亡
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Analysis of R2R3-MYB repressor subfamily identifies FcMYB57 as a negative regulator of anthocyanin biosynthesis in Ficus carica L.fruit
9
作者 Zhe Wang Hantang Huang +4 位作者 Miaoyu Song Yanlei Zhai Huaying He Alexander Vainstein Huiqin Ma 《Horticultural Plant Journal》 2026年第3期639-652,共14页
Dry fig is a traditional healthy snack and has important economic value in a number of Mediterranean and Middle Eastern countries.Cultivars with no anthocyanin accumulation in the fruit peel are preferred for dry fig ... Dry fig is a traditional healthy snack and has important economic value in a number of Mediterranean and Middle Eastern countries.Cultivars with no anthocyanin accumulation in the fruit peel are preferred for dry fig production.R2R3-MYB transcription factors have promotive or repressive regulatory roles in plant anthocyanin biosynthesis.In this study,113 R2R3-MYB genes were identified in Ficus carica,3 of which were assigned to the S4 subfamily of flavonoid-biosynthesis repressors.FcMYB57 was further recruited as a candidate anthocyaninbiosynthesis repressor based on its sequence features and expression,which was significantly negatively correlated with that of anthocyanin-biosynthesis structural genes.Transient overexpression of FcMYB57 in strawberry totally inhibited fruit pigmentation and significantly increased fruit firmness.The metabolomic analysis confirmed a significant reduction in the contents of cyanidin-3-O-glucoside and pelargonidin-3-O-glucoside,as well as other flavonoids,and transmission electron microscopy revealed an increment in cell-wall thickness.Transcriptome analysis showed downregulation of anthocyanin-biosynthesis structural genes and upregulation of genes related to xylan synthesis.Yeast one-hybrid and dual luciferase assays demonstrated a negative regulatory effect of FcMYB57 on the promoter of FcUFGT3(UDP glucose-flavonoid 3-O-glcosyl-transferase).Yeast two-hybrid assay showed that FcMYB57 does not interact with FcbHLH42,3,14,MYC2,or FcTTG1,all of which have a previously identified or predicted role in flavonoid biosynthesis,however,interaction was detected with FcTPL(Topless),suggesting that FcMYB57 serves as an active repressor of anthocyanin biosynthesis.This is the first identification of an anthocyaninbiosynthesis repressor in fig,with a possible role in fig fruit quality. 展开更多
关键词 Ficus carica L. PIGMENTATION r2R3-MYB repressor Fruit firmness
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优质香型杂交粳稻新品种‘申优R2’的选育及栽培技术
10
作者 程灿 孙滨 +5 位作者 张安鹏 代雨婷 况思梦 厉高中 张克红 曹黎明 《上海农业学报》 2025年第4期21-25,共5页
针对目前上海市主栽水稻品种存在的食味好但稻瘟病抗性差、高产但适口性一般等问题,利用花药离体培养、分子标记选择等技术快速创制具有爆米花香味、低直链淀粉含量、抗稻瘟病的亲本材料,并结合高密度SNP芯片检测、显性基因互补聚合育... 针对目前上海市主栽水稻品种存在的食味好但稻瘟病抗性差、高产但适口性一般等问题,利用花药离体培养、分子标记选择等技术快速创制具有爆米花香味、低直链淀粉含量、抗稻瘟病的亲本材料,并结合高密度SNP芯片检测、显性基因互补聚合育种技术,培育出米质优、香味浓、食味好、抗稻瘟病的杂交粳稻新品种‘申优R2’(沪审稻2022003),并从‘申优R2’的测交配组培育历程、产量、品质、抗病的特征特性以及配套的机插秧(或机直播)栽培技术要点等维度进行了全面分析。‘申优R2’适合在上海市及苏南、皖南、浙北作为单季晚稻或早茬口双季晚稻种植。 展开更多
关键词 杂交粳稻 ‘申优r2 分子标记 直链淀粉含量
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IP3R2及RYR2介导Ca^(2+)信号在急性一氧化碳中毒迟发性脑病小鼠模型中的表达 被引量:3
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作者 赵吉利 孟天予 +5 位作者 岳雅蓉 张鑫 杜文倩 张鑫宇 薛慧 项文平 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第2期254-261,共8页
背景:研究发现星形胶质细胞中Ca^(2+)的表达与认知功能密切相关,目前由1,4,5-三磷酸肌醇受体(Inositol 1,4,5-trisphosphate receptors,IP3Rs)2、兰尼碱受体(ryanodine receptors,RYRs)2受体及其调控的Ca^(2+)信号通路已经成为认知障碍... 背景:研究发现星形胶质细胞中Ca^(2+)的表达与认知功能密切相关,目前由1,4,5-三磷酸肌醇受体(Inositol 1,4,5-trisphosphate receptors,IP3Rs)2、兰尼碱受体(ryanodine receptors,RYRs)2受体及其调控的Ca^(2+)信号通路已经成为认知障碍相关疾病研究的热点。目的:研究急性一氧化碳中毒迟发性脑病动物模型中,海马组织内星形胶质细胞和IP3R2、RYR2介导的Ca^(2+)信号的表达情况,探索急性一氧化碳中毒迟发性脑病可能的发病机制。方法:Morris水迷宫实验筛选认知功能合格的C57BL小鼠随机分为对照组、实验组,实验组小鼠采用静态吸入一氧化碳建立急性一氧化碳中毒迟发性脑病模型,对照组小鼠吸入等量空气。造模后第21天,利用Morris水迷宫、苏木精-伊红染色、Western blot、免疫荧光双标法、Ca^(2+)荧光探针检测中毒小鼠行为学及神经元改变、星形胶质细胞特异性标记物胶质纤维酸性蛋白及IP3R2、RYR2受体、星形胶质细胞内Ca^(2+)浓度变化。结果与结论:①Morris水迷宫实验发现与对照组相比,实验组小鼠逃避潜伏期明显延长(P<0.05);②苏木精-伊红染色表明实验组小鼠海马锥体细胞数减少、细胞结构紊乱、细胞核碎裂伴溶解;③免疫荧光检测表明海马区IP3R2、RYR2分别和胶质纤维酸性蛋白存在共表达,且实验组海马区IP3R2、RYR2和胶质纤维酸性蛋白表达均上调(P<0.05);④Western blot检测显示实验组海马区IP3R2、RYR2及胶质纤维酸性蛋白的蛋白表达均增多(P<0.05);⑤Ca^(2+)荧光探针法检测表明实验组小鼠海马区星形胶质细胞内Ca^(2+)浓度明显升高(P<0.05);⑥结果说明,星形胶质细胞可能通过介导IP3R2、RYR2受体影响Ca^(2+)信号,进而使一氧化碳中毒的小鼠认知功能受损,最终导致急性一氧化碳中毒迟发性脑病发生。 展开更多
关键词 急性一氧化碳中毒迟发性脑病 星形胶质细胞 IP3r2受体 RYr2受体 钙信号 认知功能
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牡丹R2R3-MYB基因家族鉴定及花色形成相关基因筛选 被引量:1
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作者 闫庚洋 高文 +2 位作者 李航 尚烨 张菊平 《河南农业科学》 北大核心 2025年第12期121-137,共17页
基于牡丹全基因组数据对R2R3-MYB基因家族进行鉴定,研究其在牡丹花色形成中的作用,确定关键调控基因。利用生物信息学方法进行理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、顺式作用元件、表达相关性及蛋白质互作分析,并通过qRT-PCR验证... 基于牡丹全基因组数据对R2R3-MYB基因家族进行鉴定,研究其在牡丹花色形成中的作用,确定关键调控基因。利用生物信息学方法进行理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、顺式作用元件、表达相关性及蛋白质互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在牡丹样品中的表达模式。结果表明,共鉴定出78个牡丹R2R3-MYB转录因子,均位于细胞核,多为亲水性的不稳定蛋白,具有丰富的顺式作用元件以及N端高度保守的R2、R3结构域。系统进化将78个成员分为26个亚族(P1—P26),其中牡丹Ps2RMYB21、Ps2RMYB38和Ps2RMYB33分别与已知调控花色苷合成的拟南芥S4、S7同亚族,具有对应亚族特有的保守基序。Ps2RMYB33、Ps2RMYB38在正常萼片、彩色萼片、正常花瓣中的表达量依次升高,与结构基因PsCHS、PsCHI3、PsF3H1、PsDFR1、PsANS、PsUFGT4表达模式相同,表现为极显著的正相关性,与花色苷积累趋势一致。Ps2RMYB21与上述结构基因的表达模式相反,呈极显著负相关性,与花色苷积累趋势相反。qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致。综上,Ps2RMYB21、Ps2RMYB33、Ps2RMYB38是调控牡丹花色形成的3个关键基因。 展开更多
关键词 牡丹 花色 r2R3-MYB基因家族 生物信息学分析 花色苷合成调控基因
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香椿R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1克隆、表达与功能分析 被引量:2
13
作者 唐彩群 雷秀锦 +3 位作者 赵艳 吴嫦琴 杨安妮 徐启江 《北方园艺》 北大核心 2025年第13期8-17,共10页
以‘红香椿’嫩叶为试材,采用RT-PCR技术克隆了R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1,利用生物信息学方法分析该基因的序列结构、保守结构域、进化关系和蛋白质三维结构、理化性质,采用RT-qPCR技术分析该基因组织特异性表达模式,构建过表达载体,... 以‘红香椿’嫩叶为试材,采用RT-PCR技术克隆了R2R3-MYB转录因子基因TsMYB1,利用生物信息学方法分析该基因的序列结构、保守结构域、进化关系和蛋白质三维结构、理化性质,采用RT-qPCR技术分析该基因组织特异性表达模式,构建过表达载体,利用农杆菌介导的浸花法转化拟南芥,验证功能,以期为深入解析该基因在香椿花青素合成中的功能提供参考依据。结果表明:TsMYB1基因开放阅读框为831 bp,编码1个由276个氨基酸组成、相对分子量为31.427 kDa、理论等电点为8.24的稳定亲水碱性蛋白。TsMYB1蛋白含有R2R3-MYB蛋白家族保守的R2和R3结构域。二级结构预测其α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规则卷曲所占比例分别为28.99%、5.43%、9.42%和56.16%。该基因编码的氨基酸序列与MaMYB序列相似度达69.93%,进化关系较为密切。TsMYB1在香椿各组织中有特异性表达,在叶中表达量最高,其次是茎,在根中表达量最低。过表达TsMYB1的拟南芥植株叶片花青素积累增加,叶色由绿变紫。TsMYB1基因编码1个R2R3-MYB转录因子,其表达具有组织特异性,具有促进植物花青素合成功能。 展开更多
关键词 香椿 r2R3-MYB转录因子 花青素
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宫颈癌患者血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1表达水平与预后的关系 被引量:3
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作者 肖献花 郭丽娜 +4 位作者 呼慧军 张伟伟 冀娜娜 段敬梅 高翔 《安徽医学》 2025年第1期22-27,共6页
目的探究宫颈癌(CC)患者血清中长链非编码RNA(LncRNA)表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)和UBE2R2-AS1表达水平及其与预后的关系。方法选取2018年4月至2021年4月邯郸市妇幼保健院收治的108例CC患者为CC组,100例同期健康体检者为健康组。用... 目的探究宫颈癌(CC)患者血清中长链非编码RNA(LncRNA)表面活性剂相关1假基因(SFTA1P)和UBE2R2-AS1表达水平及其与预后的关系。方法选取2018年4月至2021年4月邯郸市妇幼保健院收治的108例CC患者为CC组,100例同期健康体检者为健康组。用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1水平;绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1对CC的诊断价值;Kaplan-Meier法分析血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1表达水平与CC患者预后的关系;Cox回归分析CC患者预后的影响因素。结果与健康组相比,CC患者血清LncRNA SFTA1P表达水平升高(P<0.05),LncRNA UBE2R2-AS1表达水平降低(P<0.05),且其水平与FIGO分期、淋巴结转移、肌层浸润深度有关(P<0.05);血清LncRNA SFTA1P和LncRNA UBE2R2-AS1单独及联合诊断CC发生的曲线下面积分别为0.863、0.817和0.915,联合优于单独诊断(Z_(二者联合-LncRNA SFTA1P)=3.057、P=0.002,Z_(二者联合-LncRNA UBE2R2-AS1)=3.564、P<0.001);血清LncRNA SFTA1P高表达组患者3年生存率低于低表达组患者(64.91%比80.39%,χ^(2)=4.443,P=0.035),LncRNA UBE2R2-AS1高表达组患者3年生存率高于低表达组患者(82.00%比63.79%,χ^(2)=5.938,P=0.015);FIGO分期Ⅱb~Ⅲc期、淋巴结转移、肌层浸润深度≥1/2、LncRNA SFTA1P表达水平升高及LncRNA UBE2R2-AS1表达水平降低均为CC患者预后的危险因素(P<0.05)。结论CC患者血清中LncRNA SFTA1P表达上调,LncRNA UBE2R2-AS1表达下调,其表达水平与肿瘤FIGO分期、淋巴结转移、肌层浸润深度有关,且与患者预后生存密切相关。 展开更多
关键词 宫颈癌 长链非编码RNA SFTA1P 长链非编码RNA UBE2r2-AS1 临床病理特征 预后
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基于T2T基因组鉴定大豆R2R3-MYB基因家族及干旱和盐胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 李志强 罗正乾 +4 位作者 徐琳黎 周国慧 屈丝雨 刘恩良 顼东婷 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期141-152,共12页
【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系... 【目的】R2R3-MYB转录因子在植物响应逆境胁迫过程中发挥着重要作用,旨在对大豆R2R3-MYB转录因子进行完整鉴定以及研究大豆R2R3-MYB基因在逆境胁迫中的作用。【方法】利用大豆无gap端粒到端粒(T2T)基因组对大豆R2R3-MYB家族基因进行系统鉴定和进化分析,并使用RT-qPCR对该家族的基因在干旱和盐胁迫下进行表达分析。【结果】大豆基因组中包含324个R2R3-MYB基因,新鉴定到77个,分布在20条染色体上。进化分析结果显示大豆R2R3-MYB家族基因可分为4个亚组,共线性基因对在进化树的分支上距离更近。通过启动子分析发现,与ABA和抗旱相关的顺式作用元件最多。通过表达分析,推测10个基因参与了大豆耐盐过程,其中GmMYB19和GmMYB76已被报道,GmMYB89和GmMYB214是首次鉴定并发现可能与大豆抗旱耐盐性有关。【结论】在大豆中鉴定到321个R2R3-MYB家族基因,通过干旱和盐胁迫诱导的表达模式分析确定了10个抗旱耐盐的候选基因。 展开更多
关键词 大豆 r2R3-MYB基因家族 生物信息学分析 干旱和盐胁迫 表达分析 T2T
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原发性头面部多汗症患者R2干预手术预后的回顾性队列研究
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作者 陈洪 冯志 +4 位作者 涂远荣 林敏 王子杰 杜泉 陈剑锋 《中国胸心血管外科临床杂志》 北大核心 2025年第7期1013-1021,共9页
目的探究R2干预术式的预后及满意度,并构建相关预测模型。方法回顾性分析2018年11月—2022年10月于福建医科大学附属第一医院接受R2干预手术治疗原发性头面部多汗症64例患者的临床资料。通过统计分析代偿性多汗(compensatory hyperhidro... 目的探究R2干预术式的预后及满意度,并构建相关预测模型。方法回顾性分析2018年11月—2022年10月于福建医科大学附属第一医院接受R2干预手术治疗原发性头面部多汗症64例患者的临床资料。通过统计分析代偿性多汗(compensatory hyperhidrosis,CH)、满意度的危险因素,并进行特征筛选,建立相关的预测模型。结果最终纳入患者51例,其中男43例(84.3%)、女8例(15.7%),平均年龄为(30.27±7.22)岁。术后总体满意度较高,仅5.9%的患者对手术表示后悔。而92.2%的患者出现CH。CH主要发生在术后3个月内,之后发生率趋于稳定。术前心率和R2交感神经夹闭术被确认为是极重度CH的独立危险因素。术前体重指数、胸腹部出汗程度与术后满意度显著相关。结论R2干预手术有效缓解原发性头面部多汗症的症状,患者满意度较高。 展开更多
关键词 原发性头面部多汗症 r2干预手术 代偿性多汗 复发 满意度 预测模型
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绿豆R2R3-MYB转录因子家族鉴定及其类黄酮合成调控基因的筛选 被引量:3
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作者 郭飞翔 李春霞 +3 位作者 周爽 郭彬彬 张均 马超 《作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期117-133,共17页
R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺... R2R3-MYB转录因子家族在植物次生代谢物合成、胁迫应答和生长发育等生命过程起着重要的调控作用。本研究基于生物信息学鉴定了绿豆(Vigna radiata L.)全基因组水平的R2R3-MYB转录因子,并对其理化性质、系统进化、染色体定位、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析;此外,转录组数据和实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-timePCR,RT-PCR)分析该转录因子在不同组织、逆境胁迫下的表达模式;并基于相关分析及蛋白互作网络,筛选到可能参与调控绿豆类黄酮生物合成的R2R3-MYB成员。结果表明,共鉴定到168个R2R3-MYB成员,其中145个分布于11条染色体, 23个成员染色体信息未知;大多数R2R3-MYB含有3个外显子,编码99~1645个氨基酸,均为亲水性蛋白;系统进化将绿豆R2R3-MYB基因家族分为30个亚组(V1~V30),不同亚组成员的基因结构存在差异;共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆R2R3-MYB基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应及少量的类黄酮合成响应等元件;基因表达分析表明,在叶片、叶柄、下胚轴和籽粒种皮中表达量较高的成员分别占15.5%、16.1%、16.1%和10.7%。RT-PCR分析发现,几乎所有的R2R3-MYB家族成员在低温胁迫下的相对表达量显著下调,不同成员对逆境胁迫有不同的响应模式。蛋白互作与相关性分析可知,VrMYB6、VrMYB77、VrMYB93这3个基因可能参与了绿豆类黄酮生物合成的调控。 展开更多
关键词 绿豆 r2R3-MYB转录因子 转录因子家族分析 类黄酮合成调控基因
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美人蕉R2R3-MYB基因家族的鉴定及与花青素相关成员的表达分析
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作者 杨晨欣 李梦秀 +2 位作者 姜唐 张文娥 潘学军 《生物技术通报》 北大核心 2025年第12期201-213,共13页
【目的】鉴定美人蕉(Canna indica)R2R3-MYB基因家族,分析其在不同花色中的表达模式,为美人蕉花色分子调控机制及新品种培育提供理论参考。【方法】以模式植物拟南芥R2R3-MYB蛋白序列为参考,结合HMM模型和BLAST检索从美人蕉基因组中鉴定... 【目的】鉴定美人蕉(Canna indica)R2R3-MYB基因家族,分析其在不同花色中的表达模式,为美人蕉花色分子调控机制及新品种培育提供理论参考。【方法】以模式植物拟南芥R2R3-MYB蛋白序列为参考,结合HMM模型和BLAST检索从美人蕉基因组中鉴定R2R3-MYB基因家族成员,分析其理化性质、亚细胞定位、系统发育树、染色体分布、保守基序及启动子顺式作用元件;基于课题组前期8个美人蕉品种转录组数据,通过TBtools可视化分析获得其在盛花期花瓣中的表达模式。选取4个不同花色品种(橙色‘印丽’、粉色‘Grand Due’、红色‘安旺’、黄色‘洒金’)的花瓣,通过实时荧光定量PCR检测11个候选CiMYBs基因的表达模式,分析基因表达与花瓣花青素、类黄酮含量的关系;以拟南芥蛋白预测美人蕉中的蛋白互作。【结果】共鉴定出185个美人蕉R2R3-MYB基因,编码蛋白均为亲水性核定位蛋白,分布于9条染色体上。约94%的成员含有核心保守基序(Motif1、Motif2、Motif3),启动子区富含光响应元件。系统发育分析将其与拟南芥同源蛋白划分为30个亚组,其中11个基因与拟南芥中调控花色素合成的MYB蛋白同源;RNA-seq结果显示11个候选基因在不同花色美人蕉品种中差异表达;互作网络预测表明CiMYB65与花青素合成关键基因DFRA显著共表达,直接调控花青素合成。RT-qPCR分析发现CiMYB21、CiMYB39、CiMYB65和CiMYB20分别在‘Grand Due’‘洒金’‘安旺’‘印丽’中表达量最高,且基因表达量与花青素含量及黄酮醇含量呈显著正相关。【结论】美人蕉基因组含有185个R2R3-MYB基因,其中CiMYB20、CiMYB39、CiMYB65等基因可通过调节花青素合成参与调控美人蕉花色形成。 展开更多
关键词 美人蕉 r2R3-MYB转录因子 花色 花青素合成 系统发育分析 RT-QPCR 基因功能
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芋花青素合成相关R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析
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作者 陈玥雯 曾程红 +7 位作者 程琦 邓婵 曾鹏程 唐雨菲 李慧英 周庆红 黄英金 朱强龙 《南方农业学报》 北大核心 2025年第8期2421-2438,共18页
【目的】鉴定并分析芋R2R3-MYB基因家族成员,为揭示R2R3-MYB基因家族在芋球茎花青素生物合成途径中的分子作用机制,选育高花青素芋品种提供参考依据。【方法】以赣芋2号白肉芋和赣芋3号红肉芋为试验材料,通过p H示差法测定2种芋3个球茎... 【目的】鉴定并分析芋R2R3-MYB基因家族成员,为揭示R2R3-MYB基因家族在芋球茎花青素生物合成途径中的分子作用机制,选育高花青素芋品种提供参考依据。【方法】以赣芋2号白肉芋和赣芋3号红肉芋为试验材料,通过p H示差法测定2种芋3个球茎发育期(膨大前期、膨大中期和膨大后期)芋肉和皮层组织中的总花青苷含量。利用生物信息学方法从芋全基因组数据库中鉴定芋R2R3-MYB基因家族成员,并分析预测其蛋白理化性质、保守结构域、染色体定位、基因结构特征,使用MEGA 7.0构建R2R3-MYB家族成员系统发育树,结合芋球茎膨大后期芋R2R3-MYB家族基因的表达量筛选与花青素生物合成相关的基因,通过相关分析和实时荧光定量PCR检测进一步鉴定出重要芋花青素合成基因。【结果】在3个芋球茎发育期,同一组织赣芋3号红肉芋中总花青苷含量均显著高于赣芋2号白肉芋(P<0.05,下同)。球茎膨大后期赣芋3号红肉芋皮层组织中总花青苷含量在所有样品中最高,达6.23 mg/100 g。芋全基因组中共筛选出97个芋R2R3-MYB基因家族成员,均定位于细胞核,不均等地分布在芋13条染色体及9个重叠群上。大多数的蛋白编码200~400个氨基酸残基,蛋白呈酸性,稳定性较差。MYB结构域的R2和R3重复序列虽然表现出不同的特征氨基酸模式,但在芋和拟南芥间高度保守。芋的96个R2R3-MYB家族基因均包含Motif 1、Motif 2和Motif 3以及1~5个内含子。不同作物R2R3-MYB家族成员系统发育分析结果显示,芋R2R3-MYB蛋白划分为29个亚家族,其中有8个芋R2R3-MYB家族蛋白与参与花青素合成相关的拟南芥蛋白亲缘关系较近。转录组测序及相关分析结果表明,基因CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89在赣芋3号红肉芋球茎膨大后期表达量较高,而在赣芋2号白肉芋球茎中表达量较低;上述3个基因与总花青苷含量呈显著或极显著(P<0.01)正相关。芋花青苷合成相关基因CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89的相对表达量与转录组测序结果基本一致。【结论】在芋中共鉴定出97个R2R3-MYB基因家族成员,该家族基因在进化过程中具有一定保守性和多样性。筛选到3个与红肉芋花青素生物合成相关的重要调控基因,分别是CeMYB63、CeMYB85和CeMYB89。 展开更多
关键词 r2R3-MYB基因家族 花青素生物合成 基因表达
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