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黑果枸杞R1-MYB转录因子基因的克隆及表达分析 被引量:10
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作者 王翠平 陈建伟 +2 位作者 严莉 乔改霞 李健 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期203-210,共8页
目的对可能参与花青素代谢调控的黑果枸杞R1-MYB转录因子基因进行克隆、生物信息学分析和不同品种、同一品种不同器官及盐胁迫条件下差异表达分析。方法通过同源基因克隆和RACE方法得到黑果枸杞R1-MYB转录因子编码区全长,通过转录组数... 目的对可能参与花青素代谢调控的黑果枸杞R1-MYB转录因子基因进行克隆、生物信息学分析和不同品种、同一品种不同器官及盐胁迫条件下差异表达分析。方法通过同源基因克隆和RACE方法得到黑果枸杞R1-MYB转录因子编码区全长,通过转录组数据获得宁夏枸杞同源基因序列。通过Prot、Param、Smart、PSORT和SOPMA进行生物信息学分析,通过MEGA 5.0构建NJ系统进化树。同时采用Real-time PCR的方法进行基因表达分析。结果获得黑果枸杞Lr MYB1R1(KY568981)及宁夏枸杞Lb MYB1R1(KY568982)基因全长c DNA,c DNA编码区全长1 496 bp,编码区为927 bp,编码产物包含308个氨基酸,编码蛋白相对分子质量分别为33 400和33 490,理论等电点分别为7.80和7.78,属于R1-MYB转录因子,经预测其编码蛋白位于细胞核中;Lr MYB1R1和Lb MYB1R1与茄科植物番茄、马铃薯、烟草中的MYB1R1-like蛋白具有高度相似性。Lr MYB1R1的表达表现出器官和发育阶段中差异性,具有品种特异性,Lr MYB1R1的表达受盐胁迫抑制。结论丰富了对R1-MYB转录因子的研究,为接下来的基因功能研究及利用基因工程手段提高黑果枸杞中花青素含量奠定基础。 展开更多
关键词 枸杞 r1-myb转录因子 基因克隆 生物信息学 rEAL-TIME PCr 表达分析
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基于全长转录组测序的掌叶大黄R1-MYB基因家族鉴定分析 被引量:6
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作者 赵霞 李元敏 +6 位作者 李依民 肖光辉 张明英 程文萍 高静 彭亮 张岗 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1354-1363,共10页
作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB... 作为MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族的一大类,R1-MYB(MYBrelated)家族在植物生长发育、环境胁迫及激素信号转导等方面发挥重要的调节作用。本研究基于全长转录组测序分析,系统筛选掌叶大黄R1-MYB家族基因,分析其编码蛋白的理化、结构域及分子进化等特性,利用RNA-seq进行基因组织表达分析,并检测RpMYB24响应激素、非生物胁迫的表达模式。结果表明,共鉴定到掌叶大黄49个R1-MYB家族基因,主要编码热稳定的亲水蛋白,大部分定位于细胞核。各蛋白无规卷曲和α螺旋所占比例较大,存在MYB家族标志性的W型保守氨基酸。掌叶大黄R1-MYB家族成员分布于CCA1(circadian clock associated 1)-like、I-box(GATAAG)-like、CPC(CAPRICE)-like、TRF(telomere repeat binding factor)-like和TBP(TATA binding protein)-like 5个亚组,且CCA1-like数量居多。RNA-seq揭示49个R1-MYBs基因在掌叶大黄根、根茎及叶中差异表达,根及根茎中分别有15、23个基因表达量高于叶中。发现RpMYB24基因受脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)的诱导,且能显著应答损伤、低温或高温胁迫,但对干旱胁迫响应不显著。本研究系统鉴定了掌叶大黄R1-MYB家族基因及其分子特征,为下一步开展基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。 展开更多
关键词 掌叶大黄 r1-myb 转录因子 基因表达 胁迫
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Kiwifruit(Actinidia chinensis)R1R2R3-MYB transcription factor AcMYB3R enhances drought and salinity tolerance in Arabidopsis thaliana 被引量:8
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作者 ZHANG Ya-bin TANG Wei +3 位作者 WANG Li-huan HU Ya-wen LIU Xian-wen LIU Yong-sheng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2019年第2期417-427,共11页
Kiwifruit is an important fruit crop that is highly sensitive to environmental stresses,such as drought,heat,cold,water logging and phytopathogens.Therefore it is indispensable to identify stress-responsive candidate ... Kiwifruit is an important fruit crop that is highly sensitive to environmental stresses,such as drought,heat,cold,water logging and phytopathogens.Therefore it is indispensable to identify stress-responsive candidate genes in kiwifruit cultivars for the stress resistance improvement.Here we report the isolation and characterization of a novel kiwifruit R1R2R3-MYB homolog(AcMYB3R)whose expression was induced by drought,salinity and cold stress.In vitro assays showed that AcMYB3R is a nuclear protein with transcriptional activation activity by binding to the cis-element of the kiwifruit orthologue of G2/M phase-specific gene KNOLLE.The Arabidopsis transgenic plants overexpressing AcMYB3R showed drastically enhanced tolerance to drought and salt stress.The expressions of stress-responsive genes such as RD29A,RD29B,COR15A and RD22 were prominently up-regulated by ectopic expression of Ac MYB3R.Our study provides a valuable piece of information for functional genomics studies of kiwifruit and molecular breeding in improving stress tolerance for crop production. 展开更多
关键词 KIWIFrUIT r1r2r3-myb DrOUGHT ABIOTIC STrESS
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银杏GbR2R3-MYB1基因的克隆及非生物胁迫应答分析 被引量:1
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作者 骆鹰 谭智 +3 位作者 王帆 刘晓霞 罗小芳 何福林 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期184-194,共11页
R2R3-MYB转录因子是MYB家族中成员数量较多的亚家族成员之一,在植物生长发育、激素信号传导、次生代谢产物形成及逆境胁迫调控等方面具有重要的作用。以银杏为材料,克隆获得GbR2R3-MYB1基因,并利用生物信息学方法分析GbR2R3-MYB1蛋白理... R2R3-MYB转录因子是MYB家族中成员数量较多的亚家族成员之一,在植物生长发育、激素信号传导、次生代谢产物形成及逆境胁迫调控等方面具有重要的作用。以银杏为材料,克隆获得GbR2R3-MYB1基因,并利用生物信息学方法分析GbR2R3-MYB1蛋白理化性质、结构与功能;通过构建pCAMBIA1300-R2R3MYB1-GFP融合表达载体及农杆菌介导烟草浸染实验,观察GbR2R3-MYB1基因亚细胞定位情况;利用RT-qPCR方法检测GbR2R3-MYB1基因在非生物逆境胁迫下的表达水平。结果表明,GbR2R3-MYB1基因编码区全长为819 bp,共编码272个氨基酸;蛋白质理论等电点为6.59,相对分子量大小为30001.60 Da,此蛋白为不稳定亲水蛋白,其二级结构中含有28.31%的α-螺旋、4.78%的β-转角、61.03%的无规卷曲和5.88%的延伸链;GbR2R3-MYB1蛋白与火炬松、白云杉R2R3-MYB蛋白的氨基酸序列相似性较高,亲缘关系较近,与系统发育树进化分析结果基本相符;亚细胞定位检测发现GbR2R3-MYB1蛋白定位于细胞核。RT-qPCR分析表明,GbR2R3-MYB1基因对盐、干旱、低温及高温胁迫均有响应,其相对表达量在盐和干旱胁迫下出现先上升后下降的波动,而低温和高温胁迫下表现出先下降后上升再下降的趋势。GbR2R3-MYB1基因的克隆及功能分析可为进一步阐述银杏抗逆分子机理及其他植物的品种改良提供资源和依据。 展开更多
关键词 银杏 Gbr2r3-myb1基因 克隆 亚细胞定位 非生物胁迫 表达分析
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龙眼Myb-related-R1的克隆及生物信息学分析
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作者 李浩然 徐炯志 +6 位作者 潘介春 王颖 李琳 王金英 黄幸 谭春露 邓英毅 《安徽农学通报》 2020年第9期12-16,32,共6页
目的:以龙眼成熟叶片为试验材料,研究Myb-related基因在龙眼中的表达情况,初步推出侧该基因的功能。方法:通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼Myb-related R1基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆... 目的:以龙眼成熟叶片为试验材料,研究Myb-related基因在龙眼中的表达情况,初步推出侧该基因的功能。方法:通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼Myb-related R1基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析。结果:Myb-related-R1基因与SANT超家族基因片段有相似之处,ORF长度为879bp,编码292个氨基酸,有1个Myb结合位点。该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞核,存在35个氨基酸磷酸化位点。其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明,该基因与阿月浑子蛋白组亲缘关系最近。结论:根据其他物种该基因的功能及生物信息学软件预测结果,可初步推测该基因功能与染色体端粒结构有关,且与花青素合成有关。 展开更多
关键词 龙眼 基因克隆 Myb-related-r1 端粒
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Alternative splicing of MaMYB16L regulates starch degradation in banana fruit during ripening 被引量:4
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作者 Guoxiang Jiang Dandan Zhang +5 位作者 Zhiwei Li Hanzhi Liang Rufang Deng Xinguo Su Yueming Jiang Xuewu Duan 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2021年第7期1341-1352,共12页
The alternative splicing of select genes is an important mechanism to regulate responses to endogenous and environmental signals in plants.However,the role of alternative splicing in regulating fruit ripening remains ... The alternative splicing of select genes is an important mechanism to regulate responses to endogenous and environmental signals in plants.However,the role of alternative splicing in regulating fruit ripening remains unclear.Here,we discovered that MaMYB16L,an R1-type MYB transcription factor,undergoes alternative splicing and generates two transcripts,the full-length isoform MaMYB16L and a truncated form MaMYB16S,in banana fruit.During banana fruit ripening,the alternative splicing process intensifies with downregulated MaMYB16L and upregulated MaMYB16S.Moreover,MaMYB16L is a transcriptional repressor that directly binds with the promoters of many genes associated with starch degradation and MaDREB2,a positive ripening regulator,and represses their expression.In contrast,MaMBY16S lacks a DNA-binding domain but competitively combines and forms non-functional heterodimers with functional MaMYB16L.MaMYB16L-MaMYB16S heterodimers decrease the binding capacity and transrepression activity of MaMYB16L.The downregulation of MaMYB16L and the upregulation of MaMYB16S,that is,a decreased ratio of active to non-active isoforms,facilitates the activation of ripening-related genes and thereby promotes fruit ripening.Furthermore,the transient overexpression of MaMYB16S promotes banana fruit ripening,whereas the overexpression of MaMYB16L delays this process.Therefore,the alternative splicing of MaMYB16L might generate a self-controlled regulatory loop to regulate banana fruit ripening. 展开更多
关键词 alternative splicing fruit ripening Musa acuminata r1-myb transcriptional regulation
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